MSTRG.11879.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11879.1.p1
Unique NameMSTRG.11879.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000087_pilon:1140108..1157616-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11879.1.p1 ID=MSTRG.11879.1.p1|Name=MSTRG.11879.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17509bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:1140108..1157616- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000087_pilon:1140108..1157616-

>MSTRG.11879.1.p1 ID=MSTRG.11879.1.p1|Name=MSTRG.11879.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=53340bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:1140108..1157616- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCTTGAAGTTCAGTCAAGAAGTCAGTATTATGGACGAAAACACCATCTC
ATGGGCATAAGGTAAATTCACACAAAAATTCACACGTAAGGGTTACACAC
CGGACAATCACACTTTGAAAGATTTCACTGTCCTTGGTGTCTCATCCAAA
CCATCCACCGTCACAATTAATGGGCAACAATTATCATCCTTCAATTACGA
CCAACCTAACCAGACAATGGCGTTGATGGTACAACATATATGAATTTCCA
AGTCTCAGGGTCGTAAATTACCATTCGGATTAATCATTGCTTTGGATGAG
AATGGTGCAGCTGAGGGAACGATGTATCTTGATGATGGTGACCAACTATT
AGGGAACACCAGTAGACAGCAAAGGAAGCAGCGTCAACCTGCCAGCTGAC
TGGGAGAAGATCAATCTACATTTACGAGGTGGTAAAGTCATTCCAACCCA
ACAACCTGCTCTTACAACTACTGCTAGGGAGCAGGAAACGTGAATGCGTA
CGTACCAGCTGGTCGATGGTATGAATATTACGCCATTTCCAAAAGACGCC
AATACTTATGGTGTTGATGCACAATTTATGTGGGGTGATGGCCTCATGAT
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CGTCCCATTGAACGTACCATATTGTTTCTATGGCAGAGGTTCCTTTAGTT
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GGAAACGTGAATGCGTACGTACCAGCTGGTCGATGGTATGAATATTACGC
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TCATGGTCACGCCTCTCATTGTTCTCAAGAGATATTGCAACACCTGAGAT
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CAGCTTGGTGCCTTCTATCCTTTCATGAGAAACCATAACAATATTAACCA
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TCTTCGTACCCTGGTACAGGTCACCATGCGGGACATTGGTTAGGTGATAA
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GAGTTGTATGGCCTGGGCATACCGTTTTCCCCGATTTCTTCAATCCAAAC
GCCAGCGTTTATTGGTACAACCAGATTAAAAACTTCTATGACAACACCAT
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GCTATTCCAACGCAAGGCTTTATTTTCGCTGATCAATACTTACAAATTGC
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GGAACTGTTATGTGCTTCAGAAAGCAAATGTCAAGAACGAGGCTGTTGTT
GGGTCCCAGCCTCCCAAAATAAAGATCAATATGGCGTCCCATTGAACGTA
CCATATTGTTTCTATGGCAGAGGTTCCTTTAGTTACAACAAATGCGGCGG
TGCTGACACAGATACGGGGTTCTATGTTGATTTGTGTATGAAAGGAAAAG
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GAAACTCAAACTCGATTGAGAGTAAAGATGAGATTAGCGATTATTGCTAC
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GGTCTTGAAGTTCAGTCAAGAAGTCAGTATTATGGACGAAAACACCATCT
CATGGGCATAAGGTAAATTCACACAAAAATTCACACGTAAGGGTTACACA
CCGGACAATCACACTTTGAAAGATTTCACTGTCCTTGGTGTCTCATCCAA
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ACCAACCTAACCAGACAATGGCGTTGATGGTACAACATATATGAATTTCC
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GAATGGTGCAGCTGAGGGAACGATGTATCTTGATGATGGTGACCAACTAT
TAGGGAACACCAGTAGACAGCAAAGGAAGCAGCGTCAACCTGCCAGCTGA
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ACGTACCAGCTGGTCGATGGTATGAATATTACGCCATTTCCAAAAGACGC
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CCAGACCATTATTCTTCCAGTATTTTGAATTTCAACATGTTTGGCGTTCC
ATTCGTTGGCGCCGATATCTGTGGTTTCCTTGGTGATACAAATGAAGAAT
TATGTCAACGATGGATGCAGCTTGGTGCCTTCTATCCTTTCATGAGAAAC
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GTGTTGTAATCACCCGTTCTTCGTACCCTGGTACAGGTCACCATGCGGGA
CATTGGTTAGGTGATAACCACAGTCAATTTGAAGATTTGTATCGATCAAT
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TGCCCTATGGACAACAAATTGGAAACTCCTCCTTTCGTTCCTGGAATCAT
CGGTGGAGTGTTATCTGATAAGACCATCTGTATGACTGCTAAACAATATA
CTGGTAACCATTACGACGTGCACAGTTTGTATGGACATTCTGAATCAATT
GCCACTATGGAGATCCAGCTATCAGTTCATCACAGTCTCCAGGAAGCTAT
AAACCTTATGACGATGGAATCTCAATGGATATCTTTGTCAAAGACATCAA
TGGAAAACCATTACAAGGAGTTGTATGGCCTGGGCATACCGTTTTCCCCG
ATTTCTTCAATCCAAACGCCAGCGTTTATTGGTACAACCAGATTAAAAAC
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TATGGTGGACAATCAAATTCCACAAGATACTCAATGGAATGATATTGATT
ACATGAATTCTCATCTTGATTTTACGATTGATCCAACAAACTTTGCTGAT
CTTCCATCGTTCGCTCAGAAATTGAGATCCTCAGGAATGCACTATATCTT
AATGGCTGTCGTTGGAAAGCCAGTCATGCCACCATATTGGTCTTTGGGAT
TCCATCTCTGTCGCTATGGTTACAATACAATGGATAATCTATTGAAGACA
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TTAGAATTTTATTTCCTCATGGGACCAACACCTGATAGTGTCATCCAACA
ATATACCGATGGTGGAGTCAATTTATATGGTGTGCATCCTTTTTACGTCG
GTGTTGAAAAAGATGGAAACGCTCATGGTGTATTCTTTAAAAACAGCAAT
GCTATGGCTTCAATACAGCTATTCCAACGCAAGGCTTTATTTTCGCTGAT
CAATACTTACAAATTGCATCTGTTCTTCCTTCATCAAACATCTACGGTCT
TGGTGAACACGTACTTGGGTTGAAACTGAACACTTCATGGTCACGCCTCT
CATTGTTCTCAAGAGATATTGCAACACCTGAGATTTACGATCCAGCCAAT
CAGCGTTACGAGGTTCCCATTCCAGTTCCCAAGGTTACTACCAAAGCTTC
ATCAACCGATTATGACGTCACTGTTGTCGAATCTCCTTTTGGATTCAAAG
TCACCAGAAAATCAACAGGAACTGTTATGTGCTTCAGAAAGCAAATGTCA
AGAACGAGGCTGTTGTTGGGTCCCAGCCTCCCAAAATAAAGATCAATATG
GCGTCCCATTGAACGTACCATATTGTTTCTATGGCAGAGGTTCCTTTAGT
TACAACAAATGCGGCGGTGCTGACACAGATACGGGGTTCTATGTTGATTT
GTGTATGAAAGGAAAAGGTAGTCCCTATGGAGACAGCATTGCTAAAATCA
GAGCTGAATTCTCAATGGAAACTCAAACTCGATTGAGAGTAAAGATGAGA
TTAGCGATTATTGCTACCATTTTGGCGGCTACCATATTAGTACCAGCATG
CATTGCGGTACCTTTGGACACGTGTGATGTTGATGATGTACATCGATTTG
ATTGTTTCCCTGATGAAGGTCTTGAAGTTCAGTCAAGAAGTCAGTATTAT
GGACGAAAACACCATCTCATGGGCATAAGGTAAATTCACACAAAAATTCA
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CTTGGTGTCTCATCCAAACCATCCACCGTCACAATTAATGGGCAACAATT
ATCATCCTTCAATTACGACCAACCTAACCAGACAATGGCGTTGATGGTAC
AACATATATGAATTTCCAAGTCTCAGGGTCGTAAATTACCATTCGGATTA
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TGATGGTGACCAACTATTAGGGAACACCAGTAGACAGCAAAGGAAGCAGC
GTCAACCTGCCAGCTGACTGGGAGAAGATCAATCTACATTTACGAGGTGG
TAAAGTCATTCCAACCCAACAACCTGCTCTTACAACTACTGCTAGGGAGC
AGGAAACGTGAATGCGTACGTACCAGCTGGTCGATGGTATGAATATTACG
CCATTTCCAAAAGACGCCAATACTTATGGTGTTGATGCACAATTTATGTG
GGGTGATGGCCTCATGATCAGTCCTGTTGTTTCACAGGATCAAGATCCAG
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GACTGGATCGACTGTCGCCAGACCATTATTCTTCCAGTATTTTGAATTTC
AACATGTTTGGCGTTCCATTCGTTGGCGCCGATATCTGTGGTTTCCTTGG
TGATACAAATGAAGAATTATGTCAACGATGGATGCAGCTTGGTGCCTTCT
ATCCTTTCATGAGAAACCATAACAATATTAACCAAAAGTGCAATGAAGAA
AGTGTTAGGCAAAAGAAGTGTTGTAATCACCCGTTCTTCGTACCCTGGTA
CAGGTCACCATGCGGGACATTGGTTAGGTGATAACCACAGTCAATTTGAA
GATTTGTATCGATCAATCTCAGGATATGAATGAACCATCTAACTTCGTTC
GAGGATCACTTGACGGATGCCCTATGGACAACAAATTGGAAACTCCTCCT
TTCGTTCCTGGAATCATCGGTGGAGTGTTATCTGATAAGACCATCTGTAT
GACTGCTAAACAATATACTGGTAACCATTACGACGTGCACAGTTTGTATG
GACATTCTGAATCAATTGCCACTATGGAGATCCAGCTATCAGTTCATCAC
AGTCTCCAGGAAGCTATAAACCTTATGACGATGGAATCTCAATGGATATC
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GCATACCGTTTTCCCCGATTTCTTCAATCCAAACGCCAGCGTTTATTGGT
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GGAATGCACTATATCTTAATGGCTGTCGTTGGAAAGCCAGTCATGCCACC
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ATAATCTATTGAAGACATCATTTTGCAACCAACACCAGCCATCACCTACC
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GCATCCTTTTTACGTCGGTGTTGAAAAAGATGGAAACGCTCATGGTGTAT
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GCTTTATTTTCGCTGATCAATACTTACAAATTGCATCTGTTCTTCCTTCA
TCAAACATCTACGGTCTTGGTGAACACGTACTTGGGTTGAAACTGAACAC
TTCATGGTCACGCCTCTCATTGTTCTCAAGAGATATTGCAACACCTGAGA
TTTACGATCCAGCCAATCAGCGTTACGAGGTTCCCATTCCAGTTCCCAAG
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TCCTTTTGGATTCAAAGTCACCAGAAAATCAACAGGAACTGTTATGTGCT
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GCAGAGGTTCCTTTAGTTACAACAAATGCGGCGGTGCTGACACAGATACG
GGGTTCTATGTTGATTTGTGTATGAAAGGAAAAGGTAGTCCCTATGGAGA
CAGCATTGCTAAAATCAGAGCTGAATTCTCAATGGAAACTCAAACTCGAT
TGAGAGTAAAGATGAGATTAGCGATTATTGCTACCATTTTGGCGGCTACC
ATATTAGTACCAGCATGCATTGCGGTACCTTTGGACACGTGTGATGTTGA
TGATGTACATCGATTTGATTGTTTCCCTGATGAAGGTCTTGAAGTTCAGT
CAAGAAGTCAGTATTATGGACGAAAACACCATCTCATGGGCATAAGGTAA
ATTCACACAAAAATTCACACGTAAGGGTTACACACCGGACAATCACACTT
TGAAAGATTTCACTGTCCTTGGTGTCTCATCCAAACCATCCACCGTCACA
ATTAATGGGCAACAATTATCATCCTTCAATTACGACCAACCTAACCAGAC
AATGGCGTTGATGGTACAACATATATGAATTTCCAAGTCTCAGGGTCGTA
AATTACCATTCGGATTAATCATTGCTTTGGATGAGAATGGTGCAGCTGAG
GGAACGATGTATCTTGATGATGGTGACCAACTATTAGGGAACACCAGTAG
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CTACATTTACGAGGTGGTAAAGTCATTCCAACCCAACAACCTGCTCTTAC
AACTACTGCTAGGGAGCAGGAAACGTGAATGCGTACGTACCAGCTGGTCG
ATGGTATGAATATTACGCCATTTCCAAAAGACGCCAATACTTATGGTGTT
GATGCACAATTTATGTGGGGTGATGGCCTCATGATCAGTCCTGTTGTTTC
ACAGGATCAAGATCCAGGAGCATTTGGAGATGGGTTGATCAAAACATCGA
AAGCAGCTTTGGCAACTAGATACACTTTGTTACCATACCTTTATACTTTA
CATTTTGAATCTTTCATGACTGGATCGACTGTCGCCAGACCATTATTCTT
CCAGTATTTTGAATTTCAACATGTTTGGCGTTCCATTCGTTGGCGCCGAT
ATCTGTGGTTTCCTTGGTGATACAAATGAAGAATTATGTCAACGATGGAT
GCAGCTTGGTGCCTTCTATCCTTTCATGAGAAACCATAACAATATTAACC
AAAAGTGCAATGAAGAAAGTGTTAGGCAAAAGAAGTGTTGTAATCACCCG
TTCTTCGTACCCTGGTACAGGTCACCATGCGGGACATTGGTTAGGTGATA
ACCACAGTCAATTTGAAGATTTGTATCGATCAATCTCAGGATATGAATGA
ACCATCTAACTTCGTTCGAGGATCACTTGACGGATGCCCTATGGACAACA
AATTGGAAACTCCTCCTTTCGTTCCTGGAATCATCGGTGGAGTGTTATCT
GATAAGACCATCTGTATGACTGCTAAACAATATACTGGTAACCATTACGA
CGTGCACAGTTTGTATGGACATTCTGAATCAATTGCCACTATGGAGATCC
AGCTATCAGTTCATCACAGTCTCCAGGAAGCTATAAACCTTATGACGATG
GAATCTCAATGGATATCTTTGTCAAAGACATCAATGGAAAACCATTACAA
GGAGTTGTATGGCCTGGGCATACCGTTTTCCCCGATTTCTTCAATCCAAA
CGCCAGCGTTTATTGGTACAACCAGATTAAAAACTTCTATGACAACACCA
TCAAATTTGATGGGCTATGGATTGTTCATCAACGTATGGTGGACAATCAA
ATTCCACAAGATACTCAATGGAATGATATTGATTACATGAATTCTCATCT
TGATTTTACGATTGATCCAACAAACTTTGCTGATCTTCCATCGTTCGCTC
AGAAATTGAGATCCTCAGGAATGCACTATATCTTAATGGCTGTCGTTGGA
AAGCCAGTCATGCCACCATATTGGTCTTTGGGATTCCATCTCTGTCGCTA
TGGTTACAATACAATGGATAATCTATTGAAGACATCATTTTGCAACCAAC
ACCAGCCATCACCTACCGTACTATTGGTGGAATCTTAGAATTTTATTTCC
TCATGGGACCAACACCTGATAGTGTCATCCAACAATATACCGATGGTGGA
GTCAATTTATATGGTGTGCATCCTTTTTACGTCGGTGTTGAAAAAGATGG
AAACGCTCATGGTGTATTCTTTAAAAACAGCAATGCTATGGCTTCAATAC
AGCTATTCCAACGCAAGGCTTTATTTTCGCTGATCAATACTTACAAATTG
CATCTGTTCTTCCTTCATCAAACATCTACGGTCTTGGTGAACACGTACTT
GGGTTGAAACTGAACACTTCATGGTCACGCCTCTCATTGTTCTCAAGAGA
TATTGCAACACCTGAGATTTACGATCCAGCCAATCAGCGTTACGAGGTTC
CCATTCCAGTTCCCAAGGTTACTACCAAAGCTTCATCAACCGATTATGAC
GTCACTGTTGTCGAATCTCCTTTTGGATTCAAAGTCACCAGAAAATCAAC
AGGAACTGTTATGTGCTTCAGAAAGCAAATGTCAAGAACGAGGCTGTTGT
TGGGTCCCAGCCTCCCAAAATAAAGATCAATATGGCGTCCCATTGAACGT
ACCATATTGTTTCTATGGCAGAGGTTCCTTTAGTTACAACAAATGCGGCG
GTGCTGACACAGATACGGGGTTCTATGTTGATTTGTGTATGAAAGGAAAA
GGTAGTCCCTATGGAGACAGCATTGCTAAAATCAGAGCTGAATTCTCAAT
GGAAACTCAAACTCGATTGAGAGTAAAGATGAGATTAGCGATTATTGCTA
CCATTTTGGCGGCTACCATATTAGTACCAGCATGCATTGCGGTACCTTTG
GACACGTGTGATGTTGATGATGTACATCGATTTGATTGTTTCCCTGATGA
AGGTCTTGAAGTTCAGTCAAGAAGTCAGTATTATGGACGAAAACACCATC
TCATGGGCATAAGGTAAATTCACACAAAAATTCACACGTAAGGGTTACAC
ACCGGACAATCACACTTTGAAAGATTTCACTGTCCTTGGTGTCTCATCCA
AACCATCCACCGTCACAATTAATGGGCAACAATTATCATCCTTCAATTAC
GACCAACCTAACCAGACAATGGCGTTGATGGTACAACATATATGAATTTC
CAAGTCTCAGGGTCGTAAATTACCATTCGGATTAATCATTGCTTTGGATG
AGAATGGTGCAGCTGAGGGAACGATGTATCTTGATGATGGTGACCAACTA
TTAGGGAACACCAGTAGACAGCAAAGGAAGCAGCGTCAACCTGCCAGCTG
ACTGGGAGAAGATCAATCTACATTTACGAGGTGGTAAAGTCATTCCAACC
CAACAACCTGCTCTTACAACTACTGCTAGGGAGCAGGAAACGTGAATGCG
TACGTACCAGCTGGTCGATGGTATGAATATTACGCCATTTCCAAAAGACG
CCAATACTTATGGTGTTGATGCACAATTTATGTGGGGTGATGGCCTCATG
ATCAGTCCTGTTGTTTCACAGGATCAAGATCCAGGAGCATTTGGAGATGG
GTTGATCAAAACATCGAAAGCAGCTTTGGCAACTAGATACACTTTGTTAC
CATACCTTTATACTTTACATTTTGAATCTTTCATGACTGGATCGACTGTC
GCCAGACCATTATTCTTCCAGTATTTTGAATTTCAACATGTTTGGCGTTC
CATTCGTTGGCGCCGATATCTGTGGTTTCCTTGGTGATACAAATGAAGAA
TTATGTCAACGATGGATGCAGCTTGGTGCCTTCTATCCTTTCATGAGAAA
CCATAACAATATTAACCAAAAGTGCAATGAAGAAAGTGTTAGGCAAAAGA
AGTGTTGTAATCACCCGTTCTTCGTACCCTGGTACAGGTCACCATGCGGG
ACATTGGTTAGGTGATAACCACAGTCAATTTGAAGATTTGTATCGATCAA
TCTCAGGATATGAATGAACCATCTAACTTCGTTCGAGGATCACTTGACGG
ATGCCCTATGGACAACAAATTGGAAACTCCTCCTTTCGTTCCTGGAATCA
TCGGTGGAGTGTTATCTGATAAGACCATCTGTATGACTGCTAAACAATAT
ACTGGTAACCATTACGACGTGCACAGTTTGTATGGACATTCTGAATCAAT
TGCCACTATGGAGATCCAGCTATCAGTTCATCACAGTCTCCAGGAAGCTA
TAAACCTTATGACGATGGAATCTCAATGGATATCTTTGTCAAAGACATCA
ATGGAAAACCATTACAAGGAGTTGTATGGCCTGGGCATACCGTTTTCCCC
GATTTCTTCAATCCAAACGCCAGCGTTTATTGGTACAACCAGATTAAAAA
CTTCTATGACAACACCATCAAATTTGATGGGCTATGGATTGTTCATCAAC
GTATGGTGGACAATCAAATTCCACAAGATACTCAATGGAATGATATTGAT
TACATGAATTCTCATCTTGATTTTACGATTGATCCAACAAACTTTGCTGA
TCTTCCATCGTTCGCTCAGAAATTGAGATCCTCAGGAATGCACTATATCT
TAATGGCTGTCGTTGGAAAGCCAGTCATGCCACCATATTGGTCTTTGGGA
TTCCATCTCTGTCGCTATGGTTACAATACAATGGATAATCTATTGAAGAC
ATCATTTTGCAACCAACACCAGCCATCACCTACCGTACTATTGGTGGAAT
CTTAGAATTTTATTTCCTCATGGGACCAACACCTGATAGTGTCATCCAAC
AATATACCGATGGTGGAGTCAATTTATATGGTGTGCATCCTTTTTACGTC
GGTGTTGAAAAAGATGGAAACGCTCATGGTGTATTCTTTAAAAACAGCAA
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TGGCGTCCCATTGAACGTACCATATTGTTTCTATGGCAGAGGTTCCTTTA
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TGCATTGCGGTACCTTTGGACACGTGTGATGTTGATGATGTACATCGATT
TGATTGTTTCCCTGATGAAGGTCTTGAAGTTCAGTCAAGAAGTCAGTATT
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CGCCATTTCCAAAAGACGCCAATACTTATGGTGTTGATGCACAATTTATG
TGGGGTGATGGCCTCATGATCAGTCCTGTTGTTTCACAGGATCAAGATCC
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GGTGATACAAATGAAGAATTATGTCAACGATGGATGCAGCTTGGTGCCTT
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ATGACTGCTAAACAATATACTGGTAACCATTACGACGTGCACAGTTTGTA
TGGACATTCTGAATCAATTGCCACTATGGAGATCCAGCTATCAGTTCATC
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GGGCATACCGTTTTCCCCGATTTCTTCAATCCAAACGCCAGCGTTTATTG
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CAATGGAATGATATTGATTACATGAATTCTCATCTTGATTTTACGATTGA
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CAGGAATGCACTATATCTTAATGGCTGTCGTTGGAAAGCCAGTCATGCCA
CCATATTGGTCTTTGGGATTCCATCTCTGTCGCTATGGTTACAATACAAT
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CCGTACTATTGGTGGAATCTTAGAATTTTATTTCCTCATGGGACCAACAC
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GATTTACGATCCAGCCAATCAGCGTTACGAGGTTCCCATTCCAGTTCCCA
AGGTTACTACCAAAGCTTCATCAACCGATTATGACGTCACTGTTGTCGAA
TCTCCTTTTGGATTCAAAGTCACCAGAAAATCAACAGGAACTGTTATGTG
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TGGCAGAGGTTCCTTTAGTTACAACAAATGCGGCGGTGCTGACACAGATA
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CGATGGTATGAATATTACGCCATTTCCAAAAGACGCCAATACTTATGGTG
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ACAGCTATTCCAACGCAAGGCTTTATTTTCGCTGATCAATACTTACAAAT
TGCATCTGTTCTTCCTTCATCAAACATCTACGGTCTTGGTGAACACGTAC
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GATATTGCAACACCTGAGATTTACGATCCAGCCAATCAGCGTTACGAGGT
TCCCATTCCAGTTCCCAAGGTTACTACCAAAGCTTCATCAACCGATTATG
ACGTCACTGTTGTCGAATCTCCTTTTGGATTCAAAGTCACCAGAAAATCA
ACAGGAACTGTTATGTGCTTCAGAAAGCAAATGTCAAGAACGAGGCTGTT
GTTGGGTCCCAGCCTCCCAAAATAAAGATCAATATGGCGTCCCATTGAAC
GTACCATATTGTTTCTATGGCAGAGGTTCCTTTAGTTACAACAAATGCGG
CGGTGCTGACACAGATACGGGGTTCTATGTTGATTTGTGTATGAAAGGAA
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ATGGAAACTCAAACTCGATTGAGAGTAAAGATGAGATTAGCGATTATTGC
TACCATTTTGGCGGCTACCATATTAGTACCAGCATGCATTGCGGTACCTT
TGGACACGTGTGATGTTGATGATGTACATCGATTTGATTGTTTCCCTGAT
GAAGGTCTTGAAGTTCAGTCAAGAAGTCAGTATTATGGACGAAAACACCA
TCTCATGGGCATAAGGTAAATTCACACAAAAATTCACACGTAAGGGTTAC
ACACCGGACAATCACACTTTGAAAGATTTCACTGTCCTTGGTGTCTCATC
CAAACCATCCACCGTCACAATTAATGGGCAACAATTATCATCCTTCAATT
ACGACCAACCTAACCAGACAATGGCGTTGATGGTACAACATATATGAATT
TCCAAGTCTCAGGGTCGTAAATTACCATTCGGATTAATCATTGCTTTGGA
TGAGAATGGTGCAGCTGAGGGAACGATGTATCTTGATGATGGTGACCAAC
TATTAGGGAACACCAGTAGACAGCAAAGGAAGCAGCGTCAACCTGCCAGC
TGACTGGGAGAAGATCAATCTACATTTACGAGGTGGTAAAGTCATTCCAA
CCCAACAACCTGCTCTTACAACTACTGCTAGGGAGCAGGAAACGTGAATG
CGTACGTACCAGCTGGTCGATGGTATGAATATTACGCCATTTCCAAAAGA
CGCCAATACTTATGGTGTTGATGCACAATTTATGTGGGGTGATGGCCTCA
TGATCAGTCCTGTTGTTTCACAGGATCAAGATCCAGGAGCATTTGGAGAT
GGGTTGATCAAAACATCGAAAGCAGCTTTGGCAACTAGATACACTTTGTT
ACCATACCTTTATACTTTACATTTTGAATCTTTCATGACTGGATCGACTG
TCGCCAGACCATTATTCTTCCAGTATTTTGAATTTCAACATGTTTGGCGT
TCCATTCGTTGGCGCCGATATCTGTGGTTTCCTTGGTGATACAAATGAAG
AATTATGTCAACGATGGATGCAGCTTGGTGCCTTCTATCCTTTCATGAGA
AACCATAACAATATTAACCAAAAGTGCAATGAAGAAAGTGTTAGGCAAAA
GAAGTGTTGTAATCACCCGTTCTTCGTACCCTGGTACAGGTCACCATGCG
GGACATTGGTTAGGTGATAACCACAGTCAATTTGAAGATTTGTATCGATC
AATCTCAGGATATGAATGAACCATCTAACTTCGTTCGAGGATCACTTGAC
GGATGCCCTATGGACAACAAATTGGAAACTCCTCCTTTCGTTCCTGGAAT
CATCGGTGGAGTGTTATCTGATAAGACCATCTGTATGACTGCTAAACAAT
ATACTGGTAACCATTACGACGTGCACAGTTTGTATGGACATTCTGAATCA
ATTGCCACTATGGAGATCCAGCTATCAGTTCATCACAGTCTCCAGGAAGC
TATAAACCTTATGACGATGGAATCTCAATGGATATCTTTGTCAAAGACAT
CAATGGAAAACCATTACAAGGAGTTGTATGGCCTGGGCATACCGTTTTCC
CCGATTTCTTCAATCCAAACGCCAGCGTTTATTGGTACAACCAGATTAAA
AACTTCTATGACAACACCATCAAATTTGATGGGCTATGGATTGTTCATCA
ACGTATGGTGGACAATCAAATTCCACAAGATACTCAATGGAATGATATTG
ATTACATGAATTCTCATCTTGATTTTACGATTGATCCAACAAACTTTGCT
GATCTTCCATCGTTCGCTCAGAAATTGAGATCCTCAGGAATGCACTATAT
CTTAATGGCTGTCGTTGGAAAGCCAGTCATGCCACCATATTGGTCTTTGG
GATTCCATCTCTGTCGCTATGGTTACAATACAATGGATAATCTATTGAAG
ACATCATTTTGCAACCAACACCAGCCATCACCTACCGTACTATTGGTGGA
ATCTTAGAATTTTATTTCCTCATGGGACCAACACCTGATAGTGTCATCCA
ACAATATACCGATGGTGGAGTCAATTTATATGGTGTGCATCCTTTTTACG
TCGGTGTTGAAAAAGATGGAAACGCTCATGGTGTATTCTTTAAAAACAGC
AATGCTATGGCTTCAATACAGCTATTCCAACGCAAGGCTTTATTTTCGCT
GATCAATACTTACAAATTGCATCTGTTCTTCCTTCATCAAACATCTACGG
TCTTGGTGAACACGTACTTGGGTTGAAACTGAACACTTCATGGTCACGCC
TCTCATTGTTCTCAAGAGATATTGCAACACCTGAGATTTACGATCCAGCC
AATCAGCGTTACGAGGTTCCCATTCCAGTTCCCAAGGTTACTACCAAAGC
TTCATCAACCGATTATGACGTCACTGTTGTCGAATCTCCTTTTGGATTCA
AAGTCACCAGAAAATCAACAGGAACTGTTATGTGCTTCAGAAAGCAAATG
TCAAGAACGAGGCTGTTGTTGGGTCCCAGCCTCCCAAAATAAAGATCAAT
ATGGCGTCCCATTGAACGTACCATATTGTTTCTATGGCAGAGGTTCCTTT
AGTTACAACAAATGCGGCGGTGCTGACACAGATACGGGGTTCTATGTTGA
TTTGTGTATGAAAGGAAAAGGTAGTCCCTATGGAGACAGCATTGCTAAAA
TCAGAGCTGAATTCTCAATGGAAACTCAAACTCGATTGAGAGTAAAGATG
AGATTAGCGATTATTGCTACCATTTTGGCGGCTACCATATTAGTACCAGC
ATGCATTGCGGTACCTTTGGACACGTGTGATGTTGATGATGTACATCGAT
TTGATTGTTTCCCTGATGAAGGTCTTGAAGTTCAGTCAAGAAGTCAGTAT
TATGGACGAAAACACCATCTCATGGGCATAAGGTAAATTCACACAAAAAT
TCACACGTAAGGGTTACACACCGGACAATCACACTTTGAAAGATTTCACT
GTCCTTGGTGTCTCATCCAAACCATCCACCGTCACAATTAATGGGCAACA
ATTATCATCCTTCAATTACGACCAACCTAACCAGACAATGGCGTTGATGG
TACAACATATATGAATTTCCAAGTCTCAGGGTCGTAAATTACCATTCGGA
TTAATCATTGCTTTGGATGAGAATGGTGCAGCTGAGGGAACGATGTATCT
TGATGATGGTGACCAACTATTAGGGAACACCAGTAGACAGCAAAGGAAGC
AGCGTCAACCTGCCAGCTGACTGGGAGAAGATCAATCTACATTTACGAGG
TGGTAAAGTCATTCCAACCCAACAACCTGCTCTTACAACTACTGCTAGGG
AGCAGGAAACGTGAATGCGTACGTACCAGCTGGTCGATGGTATGAATATT
ACGCCATTTCCAAAAGACGCCAATACTTATGGTGTTGATGCACAATTTAT
GTGGGGTGATGGCCTCATGATCAGTCCTGTTGTTTCACAGGATCAAGATC
CAGGAGCATTTGGAGATGGGTTGATCAAAACATCGAAAGCAGCTTTGGCA
ACTAGATACACTTTGTTACCATACCTTTATACTTTACATTTTGAATCTTT
CATGACTGGATCGACTGTCGCCAGACCATTATTCTTCCAGTATTTTGAAT
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GAGATTTACGATCCAGCCAATCAGCGTTACGAGGTTCCCATTCCAGTTCC
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CGGGACATTGGTTAGGTGATAACCACAGTCAATTTGAAGATTTGTATCGA
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CCCCGATTTCTTCAATCCAAACGCCAGCGTTTATTGGTACAACCAGATTA
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CTGATCTTCCATCGTTCGCTCAGAAATTGAGATCCTCAGGAATGCACTAT
ATCTTAATGGCTGTCGTTGGAAAGCCAGTCATGCCACCATATTGGTCTTT
GGGATTCCATCTCTGTCGCTATGGTTACAATACAATGGATAATCTATTGA
AGACATCATTTTGCAACCAACACCAGCCATCACCTACCGTACTATTGGTG
GAATCTTAGAATTTTATTTCCTCATGGGACCAACACCTGATAGTGTCATC
CAACAATATACCGATGGTGGAGTCAATTTATATGGTGTGCATCCTTTTTA
CGTCGGTGTTGAAAAAGATGGAAACGCTCATGGTGTATTCTTTAAAAACA
GCAATGCTATGGCTTCAATACAGCTATTCCAACGCAAGGCTTTATTTTCG
CTGATCAATACTTACAAATTGCATCTGTTCTTCCTTCATCAAACATCTAC
GGTCTTGGTGAACACGTACTTGGGTTGAAACTGAACACTTCATGGTCACG
CCTCTCATTGTTCTCAAGAGATATTGCAACACCTGAGATTTACGATCCAG
CCAATCAGCGTTACGAGGTTCCCATTCCAGTTCCCAAGGTTACTACCAAA
GCTTCATCAACCGATTATGACGTCACTGTTGTCGAATCTCCTTTTGGATT
CAAAGTCACCAGAAAATCAACAGGAACTGTTATGTGCTTCAGAAAGCAAA
TGTCAAGAACGAGGCTGTTGTTGGGTCCCAGCCTCCCAAAATAAAGATCA
ATATGGCGTCCCATTGAACGTACCATATTGTTTCTATGGCAGAGGTTCCT
TTAGTTACAACAAATGCGGCGGTGCTGACACAGATACGGGGTTCTATGTT
GATTTGTGTATGAAAGGAAAAGGTAGTCCCTATGGAGACAGCATTGCTAA
AATCAGAGCTGAATTCTCAATGGAAACTCAAACTCGATTGAGAGTAAAGA
TGAGATTAGCGATTATTGCTACCATTTTGGCGGCTACCATATTAGTACCA
GCATGCATTGCGGTACCTTTGGACACGTGTGATGTTGATGATGTACATCG
ATTTGATTGTTTCCCTGATGAAGGTCTTGAAGTTCAGTCAAGAAGTCAGT
ATTATGGACGAAAACACCATCTCATGGGCATAAGGTAAATTCACACAAAA
ATTCACACGTAAGGGTTACACACCGGACAATCACACTTTGAAAGATTTCA
CTGTCCTTGGTGTCTCATCCAAACCATCCACCGTCACAATTAATGGGCAA
CAATTATCATCCTTCAATTACGACCAACCTAACCAGACAATGGCGTTGAT
GGTACAACATATATGAATTTCCAAGTCTCAGGGTCGTAAATTACCATTCG
GATTAATCATTGCTTTGGATGAGAATGGTGCAGCTGAGGGAACGATGTAT
CTTGATGATGGTGACCAACTATTAGGGAACACCAGTAGACAGCAAAGGAA
GCAGCGTCAACCTGCCAGCTGACTGGGAGAAGATCAATCTACATTTACGA
GGTGGTAAAGTCATTCCAACCCAACAACCTGCTCTTACAACTACTGCTAG
GGAGCAGGAAACGTGAATGCGTACGTACCAGCTGGTCGATGGTATGAATA
TTACGCCATTTCCAAAAGACGCCAATACTTATGGTGTTGATGCACAATTT
ATGTGGGGTGATGGCCTCATGATCAGTCCTGTTGTTTCACAGGATCAAGA
TCCAGGAGCATTTGGAGATGGGTTGATCAAAACATCGAAAGCAGCTTTGG
CAACTAGATACACTTTGTTACCATACCTTTATACTTTACATTTTGAATCT
TTCATGACTGGATCGACTGTCGCCAGACCATTATTCTTCCAGTATTTTGA
ATTTCAACATGTTTGGCGTTCCATTCGTTGGCGCCGATATCTGTGGTTTC
CTTGGTGATACAAATGAAGAATTATGTCAACGATGGATGCAGCTTGGTGC
CTTCTATCCTTTCATGAGAAACCATAACAATATTAACCAAAAGTGCAATG
AAGAAAGTGTTAGGCAAAAGAAGTGTTGTAATCACCCGTTCTTCGTACCC
TGGTACAGGTCACCATGCGGGACATTGGTTAGGTGATAACCACAGTCAAT
TTGAAGATTTGTATCGATCAATCTCAGGATATGAATGAACCATCTAACTT
CGTTCGAGGATCACTTGACGGATGCCCTATGGACAACAAATTGGAAACTC
CTCCTTTCGTTCCTGGAATCATCGGTGGAGTGTTATCTGATAAGACCATC
TGTATGACTGCTAAACAATATACTGGTAACCATTACGACGTGCACAGTTT
GTATGGACATTCTGAATCAATTGCCACTATGGAGATCCAGCTATCAGTTC
ATCACAGTCTCCAGGAAGCTATAAACCTTATGACGATGGAATCTCAATGG
ATATCTTTGTCAAAGACATCAATGGAAAACCATTACAAGGAGTTGTATGG
CCTGGGCATACCGTTTTCCCCGATTTCTTCAATCCAAACGCCAGCGTTTA
TTGGTACAACCAGATTAAAAACTTCTATGACAACACCATCAAATTTGATG
GGCTATGGATTGTTCATCAACGTATGGTGGACAATCAAATTCCACAAGAT
ACTCAATGGAATGATATTGATTACATGAATTCTCATCTTGATTTTACGAT
TGATCCAACAAACTTTGCTGATCTTCCATCGTTCGCTCAGAAATTGAGAT
CCTCAGGAATGCACTATATCTTAATGGCTGTCGTTGGAAAGCCAGTCATG
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CTTCATCAAACATCTACGGTCTTGGTGAACACGTACTTGGGTTGAAACTG
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TGAGATTTACGATCCAGCCAATCAGCGTTACGAGGTTCCCATTCCAGTTC
CCAAGGTTACTACCAAAGCTTCATCAACCGATTATGACGTCACTGTTGTC
GAATCTCCTTTTGGATTCAAAGTCACCAGAAAATCAACAGGAACTGTTAT
GTGCTTCAGAAAGCAAATGTCAAGAACGAGGCTGTTGTTGGGTCCCAGCC
TCCCAAAATAAAGATCAATATGGCGTCCCATTGAACGTACCATATTGTTT
CTATGGCAGAGGTTCCTTTAGTTACAACAAATGCGGCGGTGCTGACACAG
ATACGGGGTTCTATGTTGATTTGTGTATGAAAGGAAAAGGTAGTCCCTAT
GGAGACAGCATTGCTAAAATCAGAGCTGAATTCTCAATGGAAACTCAAAC
TCGATTGAGAGTAAAGATGAGATTAGCGATTATTGCTACCATTTTGGCGG
CTACCATATTAGTACCAGCATGCATTGCGGTACCTTTGGACACGTGTGAT
GTTGATGATGTACATCGATTTGATTGTTTCCCTGATGAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11879MSTRG.11879Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11879.1.p1MSTRG.11879.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11879.1.p1.exon21MSTRG.11879.1.p1.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon20MSTRG.11879.1.p1.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon19MSTRG.11879.1.p1.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon18MSTRG.11879.1.p1.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon17MSTRG.11879.1.p1.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon16MSTRG.11879.1.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon15MSTRG.11879.1.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon14MSTRG.11879.1.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon13MSTRG.11879.1.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon12MSTRG.11879.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon11MSTRG.11879.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon10MSTRG.11879.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon9MSTRG.11879.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon8MSTRG.11879.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon7MSTRG.11879.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon6MSTRG.11879.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon5MSTRG.11879.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon4MSTRG.11879.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon3MSTRG.11879.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon2MSTRG.11879.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11879.1.p1.exon1MSTRG.11879.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000087_pilongenomesc0000087_pilon:1140108..1157616 -