MSTRG.11859.7.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11859.7.p1
Unique NameMSTRG.11859.7.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000087_pilon:922282..928847+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11859.7.p1 ID=MSTRG.11859.7.p1|Name=MSTRG.11859.7.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6566bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:922282..928847+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTATATGTGTCAAActgtaaagatttttttgataatttgtttAATCTTAC
GATTTGGGAAATTTATAGGCTTATCATAGCTGTTCGTTAAAAAATGTCTG
CACGCCGAGTTGATAGATTTCAGCTGgaaaatcaaataataaatataatt
tctgGTGAGGTTTCGTGCACCAGAGAGGTTAGCGTGGCAGCGTGATATCC
GTATTAGGGATTGGTTATTTAAATTGTCCTGAAATTGACATTACTTGTTA
CCTGCTGCGTTGCACTTAACACGCTGGTAAAAAAGTAATATCAATTCGTT
TAGGGATATGTTTAATAACCTTCTTTATagtttgacgtcattttgatcAC
AATTCATTGCTCTCTTGCCTGTTATCCCATCTTATAATACAATAGTGAAG
TCACTGATTGTATTATGATAGAACAGGGTATGCGTGGACGCACGCATTAA
GCAATTGAATAAGGATTTGTTGTAGTAATATGTCATAGGAAATGAGGGGT
TGTGTTAAAATTTGAcgagagaatttttttataaatactgTAGGAAATAC
TTCCAACTGTGATTAAAATGTTTCGAATTATCAATATTtctacacaattt
ttttctcgattgaGTAGTAAAATGGGGGAGTTGTTTGATGTGGATATGAT
ATGTTGTACATTTGCACATCAATGAGTTAATCTAGCGGGAAACACTTCAG
AAAAGTTGATAGAGTTAGTAGAGGAACTTTCTTCGATACGTGGTCGCGTA
AAAGAATCCGATATTGAAATAAATTACAATTCAGTTTGAATACAGTTACC
AATATAGTTAACTGTTTGTTTCATCACGAATGGAAAAGACCGTGAATTCA
TATTTTAATGTACTGAACTGGTTTTATCAGTACTAGTGATTTCACGACTT
TTTCTGTATTATtccatttaaaaaattaatattaacTTTAAAATAGCTTC
TCTTGTTCCAATCTTAGTTTTAATTAACTTTTATAaaattctttcaatac
aaaGACCACGCCCATTTATTTTGACCCAAGTTTTCTTAGATTTGAATGTT
TTTCACTGGGTGAAAGTaaagaattttcttataaaatgttaTCTAAGTGT
ATCAATAATTTAAAGAATTGGTCTGCCTGTTTTAAACACAATCATAGAGG
GACGATACTTTAACCTTGTAGTACTTTAACTAGTACTTATTTTTTGCCCG
ATTGTTGATCCTCCATCTTTTACTTTTCTCATATTTTGATTGTAAACGAG
ACTAAAAGATAATttcttctctcatcttctcttcattcttcattcaGTCG
TTTTCGAGTAAGGCTATTCTTTTctgtttgaaagaaaattgagGGAAGGT
CCTTTTTGCTTCAGATTCTCAAAGAACTACATTTTAGGTatgtttttcac
tttctttatcAAAATTGCTAGATCCAAAAGTTGTTTATTAGCAGTGCCTC
TAAattactttatatattttttgaaccaCACCCAATTTCTCTTTCCGGAG
AAaatcttttgacattttttatttcgTTGTTATCACTTTAATAATGGTTG
ACAATTAGTACTTGGACATGATTCTTCTTGCTGCCCTGTTAATGATTCAT
TATGAACAACCTTAGCGTTTGCAAACATGTTGGATGGGCGTTCCAATTCA
CCGGCAGACGAGCTCACAATCTACTCTTTGGTCGTCATGGAAACTGCTCG
AAAGCCGCGCCTCGAAACGCCATAGGAGGTATTTAATCAAGGGAAGACAG
GGTGTATAAAACTCGTACCATATTAATCTGGGAATAACTCAGATAACCTG
AAAAtagcatttttcagctttttcagtTCATGTCATCGACTACATCAGTT
AAATCACTAGATTTAGAAAATCTTTGTAAATTTAGTAAATCTTTGTAGTC
AGACGTAGTTTGTGTCTagtgtttttatcaatttatcaATGGAGAAAACA
ATAGTTAATTCTAAACAGAGTTTTGGGCAATAAATGTCAATAGGATAAAG
CTTTGTGGAGTGCTCAGATTCCAGACGGTCAAGGAAGATTCATCTGAAGT
TATGCAGTAAAATCTTTATTCAGAGTTGAGAAGAACAGATCCAAAGCATA
CTATTTAATTCTACCTGGTTACAATATTCACtacaattaaaaaacaaaac
cattatTCGCTATCTGCCATCTAAAGAAAGCCCTTGTACTTCCAGGAGAA
ATTTAATTGATCATCATGGCTGATTTGAATGTGGCAGGTTTGATCAGTAT
CATCATCTTTTATTTGGCTATCCTTGGCATCGGTCTATTTGCTGCCTGGA
GAAAGAACAAACACACGAAAGAGAATGCGCAAACCACACAAGACGAAACG
AATGAAGTTATTTTAGCTGGAAGAACTATTGGAATGTTTATTGGTTGTTT
CACTATGACTGGTATGTCGCCTTTCCTTTCGTCTACCGTCACACTGAACA
ATCTCTATGGTGACTGAAAATGTTTGTGACAGTGTTGTCTCCAAATCAAA
ATGAGCGGATGAATTTTGaaaccttttcaatatatcacaaaaaaaGGAGT
TCCCAACCTCTGTAGCTTTTTAGACGTCTTTCTTAAGATGTCTTCGATTG
CATTATGGAGCAAAAAAGCAGGTCCGAAAAGATTCATTCAAGCAGCAATA
TTCAGAGCGACAATGGTTCTTGCATTATGAATTAAGTGAATTCTCGGAGT
GAATCATTATATTccgttttatttttttggttcaTTAGCATTCAAATCTT
TGATATATTTTAGCAACATGGGTTGGTGGTGGTTACATCAATGGAACAGC
AGAGTCAGTTTACAATGATGGTCTGGTCTGGGCTCAAGCACCGTGGGGTT
ACGCTACCAGTTTAGCGATGGGTACGTATCttctagcctagaaatctaag
ccatATTGATTCCGTCACTTGGTagaatctgatggtaagttgtgactgaa
tatctggtaaacttaaaattctgtacatcataaaaatcattaaagcaccg
ataacgctatattgccGTCAGCCGTCAGCCTTGTAAAAAGTGGCTTGATT
AACCAGGTTCTTCATTGTCTCGTGTAAAGATTTCTTCTCGATAGTGTTTG
TGACAAAGGGACATTTCTACAACTTTAACTTGTTTCATAATTTCTTTCAG
GTGGTTTCTTTTTTGCTCGCAAAATGAGAGAAGCGGAATATATCACCATG
TTGGACCCTCTGCAAGACAAGTACGGTCGTGTGATGGGTGCTTTCCTTTA
CATTCCTGCTTTCCTTGGTGAAACATTTTGGTCTGCATCTATCCTGGCAG
CTCTTGGTGCAACATTGACAGTTATCTTGGGGTTGAACATGAATATTTCC
GTCATCGTGTCGGCGTGTATTGCTGTCGGCTACACCTTTTTTGGTGGACT
TTATTCAGGTATAGGATGAAGCAAATCTTTTACTTATGTATGATGTGAAT
GTTGTCACATATTTCATTTCAGGACAGTGTctcgctattgttatattatg
ctgatataagcaaaaaatgttttgcttttcctctttctgaccaatcttgc
tctccatccgtgtcaatccaatgttaaaaagcttgtgaattaaaattgat
gagtaagcaaacgatatcactcttatttaaaaacaaaacctttaaaagta
aAGTTAAAGTTTCCAGAAATCGAATGGActtaatatttttattgattttt
ctcccgctaTCAGTTGCATACACGGACGTCGTTCAATTGATTTGCATTGC
GGTCGGATTGTGGTTGACGGTTCCTTTCTCTTTGACCAATGAAAACGTTG
AATCGATTGGTGCACGTAAAGAGGAATGGCTCGGCCAATTGTATGGTGCT
AAAGTCGGAAAATGGATTGATTACGCTTTCTTATTGGTACGGATAAAGTC
TTATTAAAATTCAACTGATATAACTTAACTGACTTCTCTTGCGTTCGTTT
ACTTTCAATCCATCcttagtctagcatgctagacgattAATTCAGAAagc
aaaaaattatgaaaagtgAAAGTTTTAGTTAGAAACTGATATTGTACCGT
AACAATTATcttattatcatataacacctcTGTCACTGTATTAGATGGAT
CATAAACGACTGTAGTCTAATCCATCCTTCAAGTTTTTGGAATTGTTTGT
CATACTTTGAAAAgttgtctttttctttcttagatTTGTGGAGGTATTCC
ATGGCAAGTGTATTTCCAACGTGTATTGTCTTCCAAGTCAGCTCACCGTG
CTCAAATTCTCTCCTTCGTTGCTGCTTTCGGCTGTATTGTGCTGGCTATC
CCTGCAGTTCTGATCGGTGCCGCCGCCAAAAGCGCTGGTAAGAATCTTTT
CTTATATTAGTATATTGGAAGGACTCTTTAGTCGTAACCAAAATATCTGT
GTCGAGAAGACATTAAAGATGATACATCTCTTTACCTTCAGACTGGGGAG
CAGTAAGTGGGGCAGTGGACGCCAACCTTGTGACCAACAAAACCGGAGAG
TGGGTGATCACGGATACCAGACTGGTCCTCCCCATGGTTCTTCAATACTT
AGCTCCTGGATGGGTGTCTTTCATTGGTCTTGGTGCCATCTCAGCTGCTG
TCATGTCTAGTGCTGACTCGTCAGTTTTGTCTGCTAGTTCCATGTTCGGA
CATAATATCTACAAGTTGATCATCAGAAAAAATGTAAGCGAAAAAGAGCA
TACCTTTGTCTCATTAACCGGTTCAGCTAAATTCcaactcgggtaactta
atgcatgtcccagaattgcattaatttttccgccccagttccagtcccta
aaccataacaaactatacatttttggaagcgtatttggatgtagaatacc
gtatttggtgtaacttaaattctttctcagtataattagagatatgttaa
aaaaacctgattatgacgtcatgattgatgacgtcataaatacaaaaagt
tgaatatcttgagaaatataaatcaaagctttatgaaatttggaccagtg
ataaagtacattgagatgtttcaaaaacttttaaaagtatttcccaaaat
taatgacgtcagcaaaaattgcaagaattcgaatttttgcgatagaatgc
tgacatcagcaaattttcaaattttttgaaaaaaattctcctccttttga
tgagttctatcattgctcaaaatttcataaagatttgagtattagttctt
gagatattcaatttttaaaaattatgacgtcataaataatgacgtcataa
tcatgttttcttaaaaaaactcaaattttgctgagaaagaatttaagtta
caccaaatacggtattctacatccaaatacgcttccaaaaatgtatagtt
tgttatggtttagggactggaactggggcggaaaaattaatgcaattctg
ggacatgcattaagttacccgagaacAAAGCTGGAATGTTTCTAGCCCGT
ATGCGGTAtattaaattaataaaattttgtgcaaacttttctgttttttt
ttttgtcatttgtaCTTCTTACCTTGGATAAACTTTCGAATATTATCTTT
CAGGCCAGTGCCAATGAAATTATTTGGGTGATTCGTATTGGTATCATCTT
TGTTGGTATCATGGCAACGCTGGTTGGGTTGACGGTCGACAGCATCTACG
CTTTGTTCCATTTGTGCTCGGACCTGGTCTTTGTCATCCTCTTCCCACAG
CTGGTGGGTGCTGTCCACATCCAAGATGTCAACACGTATGGATCCATCTG
TGCTTACATAGTGGGATTGTTCTTACGCATCACCGGTGGAGAAGAATTGA
TCGGGTTCCCGGCTACTTTTAAATATCCTTACTATGACGAGACGTACAGT
AATGGGAAAGGATCACAAAATTTCCCCTTCCGTACCCTAGCTATGATTAT
TTCTTTCATCACGCTCGTCTCTGTTTCCAAATTGGCTTATTATTTGTTCG
ATAATGAAATCTTGGGTGAAAATTACGATTTCTTAGGCGTTTTGGAGCGC
CGACGAAATCTTGCCGGCAAGAAAGGAAGACGAGGTGAGGATGATGCTTT
ACCGCTACAAGAAAAATACAACGGATTCGACGACCCAACTCCTCAACAAA
TCTAAACGTACGTGTCAAAATGATTTGTCAGACATCGCGTGCTACCAATA
TGTATCAATGTAGTTTTCGAATATCTAATGAAAGCCTTTACAAGTTTTTA
GTAATAACCATGTGAAAAATAGCCAAGTGACTAGGACTGTATCCGTGATG
ACCTAGTAAAATTTTGAGTGGCTTTTAAAAGACAGCTGGATAGACTGAAT
AATGCAAAACTGAAATAAACATGATGGAGCTCTTTTGAAACAAGACGCTG
AAAAGTTATTAGGGCTGTGTTTAGCattttaattagtattttttgtataa
tctcaaaagatcttttactttgtatttttaatttgtaCTGTGTGTTATCT
CATTTAAATGTAGGCATTCATGAAAATATGTACGGTACTTCCTatcaaat
tttcttcattttctttggttttcctcatttatagaaagaaagttttaTAC
TCTTTATTTAACGAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000087_pilon:922282..928847+

>MSTRG.11859.7.p1 ID=MSTRG.11859.7.p1|Name=MSTRG.11859.7.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=11781bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:922282..928847+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGATTTGAATGTGGCAGGTTTGATCAGTATCATCATCTTTTATTT
GGCTATCCTTGGCATCGGTCTATTTGCTGCCTGGAGAAAGAACAAACACA
CGAAAGAGAATGCGCAAACCACACAAGACGAAACGAATGAAGTTATTTTA
GCTGGAAGAACTATTGGAATGTTTATTGGTTGTTTCACTATGACTGCAAC
ATGGGTTGGTGGTGGTTACATCAATGGAACAGCAGAGTCAGTTTACAATG
ATGGTCTGGTCTGGGCTCAAGCACCGTGGGGTTACGCTACCAGTTTAGCG
ATGGGTGGTTTCTTTTTTGCTCGCAAAATGAGAGAAGCGGAATATATCAC
CATGTTGGACCCTCTGCAAGACAAGTACGGTCGTGTGATGGGTGCTTTCC
TTTACATTCCTGCTTTCCTTGGTGAAACATTTTGGTCTGCATCTATCCTG
GCAGCTCTTGGTGCAACATTGACAGTTATCTTGGGGTTGAACATGAATAT
TTCCGTCATCGTGTCGGCGTGTATTGCTGTCGGCTACACCTTTTTTGGTG
GACTTTATTCAGTTGCATACACGGACGTCGTTCAATTGATTTGCATTGCG
GTCGGATTGTGGTTGACGGTTCCTTTCTCTTTGACCAATGAAAACGTTGA
ATCGATTGGTGCACGTAAAGAGGAATGGCTCGGCCAATTGTATGGTGCTA
AAGTCGGAAAATGGATTGATTACGCTTTCTTATTGatTTGTGGAGGTATT
CCATGGCAAGTGTATTTCCAACGTGTATTGTCTTCCAAGTCAGCTCACCG
TGCTCAAATTCTCTCCTTCGTTGCTGCTTTCGGCTGTATTGTGCTGGCTA
TCCCTGCAGTTCTGATCGGTGCCGCCGCCAAAAGCGCTGACTGGGGAGCA
GTAAGTGGGGCAGTGGACGCCAACCTTGTGACCAACAAAACCGGAGAGTG
GGTGATCACGGATACCAGACTGGTCCTCCCCATGGTTCTTCAATACTTAG
CTCCTGGATGGGTGTCTTTCATTGGTCTTGGTGCCATCTCAGCTGCTGTC
ATGTCTAGTGCTGACTCGTCAGTTTTGTCTGCTAGTTCCATGTTCGGACA
TAATATCTACAAGTTGATCATCAGAAAAAATGCCAGTGCCAATGAAATTA
TTTGGGTGATTCGTATTGGTATCATCTTTGTTGGTATCATGGCAACGCTG
GTTGGGTTGACGGTCGACAGCATCTACGCTTTGTTCCATTTGTGCTCGGA
CCTGGTCTTTGTCATCCTCTTCCCACAGCTGGTGGGTGCTGTCCACATCC
AAGATGTCAACACGTATGGATCCATCTGTGCTTACATAGTGGGATTGTTC
TTACGCATCACCGGTGGAGAAGAATTGATCGGGTTCCCGGCTACTTTTAA
ATATCCTTACTATGACGAGACGTACAGTAATGGGAAAGGATCACAAAATT
TCCCCTTCCGTACCCTAGCTATGATTATTTCTTTCATCACGCTCGTCTCT
GTTTCCAAATTGGCTTATTATTTGTTCGATAATGAAATCTTGGGTGAAAA
TTACGATTTCTTAGGCGTTTTGGAGCGCCGACGAAATCTTGCCGGCAAGA
AAGGAAGACGAGGTGAGGATGATGCTTTACCGCTACAAGAAAAATACAAC
GGATTCGACGACCCAACTCCTCAACAAATCTAAATGGCTGATTTGAATGT
GGCAGGTTTGATCAGTATCATCATCTTTTATTTGGCTATCCTTGGCATCG
GTCTATTTGCTGCCTGGAGAAAGAACAAACACACGAAAGAGAATGCGCAA
ACCACACAAGACGAAACGAATGAAGTTATTTTAGCTGGAAGAACTATTGG
AATGTTTATTGGTTGTTTCACTATGACTGCAACATGGGTTGGTGGTGGTT
ACATCAATGGAACAGCAGAGTCAGTTTACAATGATGGTCTGGTCTGGGCT
CAAGCACCGTGGGGTTACGCTACCAGTTTAGCGATGGGTGGTTTCTTTTT
TGCTCGCAAAATGAGAGAAGCGGAATATATCACCATGTTGGACCCTCTGC
AAGACAAGTACGGTCGTGTGATGGGTGCTTTCCTTTACATTCCTGCTTTC
CTTGGTGAAACATTTTGGTCTGCATCTATCCTGGCAGCTCTTGGTGCAAC
ATTGACAGTTATCTTGGGGTTGAACATGAATATTTCCGTCATCGTGTCGG
CGTGTATTGCTGTCGGCTACACCTTTTTTGGTGGACTTTATTCAGTTGCA
TACACGGACGTCGTTCAATTGATTTGCATTGCGGTCGGATTGTGGTTGAC
GGTTCCTTTCTCTTTGACCAATGAAAACGTTGAATCGATTGGTGCACGTA
AAGAGGAATGGCTCGGCCAATTGTATGGTGCTAAAGTCGGAAAATGGATT
GATTACGCTTTCTTATTGatTTGTGGAGGTATTCCATGGCAAGTGTATTT
CCAACGTGTATTGTCTTCCAAGTCAGCTCACCGTGCTCAAATTCTCTCCT
TCGTTGCTGCTTTCGGCTGTATTGTGCTGGCTATCCCTGCAGTTCTGATC
GGTGCCGCCGCCAAAAGCGCTGACTGGGGAGCAGTAAGTGGGGCAGTGGA
CGCCAACCTTGTGACCAACAAAACCGGAGAGTGGGTGATCACGGATACCA
GACTGGTCCTCCCCATGGTTCTTCAATACTTAGCTCCTGGATGGGTGTCT
TTCATTGGTCTTGGTGCCATCTCAGCTGCTGTCATGTCTAGTGCTGACTC
GTCAGTTTTGTCTGCTAGTTCCATGTTCGGACATAATATCTACAAGTTGA
TCATCAGAAAAAATGCCAGTGCCAATGAAATTATTTGGGTGATTCGTATT
GGTATCATCTTTGTTGGTATCATGGCAACGCTGGTTGGGTTGACGGTCGA
CAGCATCTACGCTTTGTTCCATTTGTGCTCGGACCTGGTCTTTGTCATCC
TCTTCCCACAGCTGGTGGGTGCTGTCCACATCCAAGATGTCAACACGTAT
GGATCCATCTGTGCTTACATAGTGGGATTGTTCTTACGCATCACCGGTGG
AGAAGAATTGATCGGGTTCCCGGCTACTTTTAAATATCCTTACTATGACG
AGACGTACAGTAATGGGAAAGGATCACAAAATTTCCCCTTCCGTACCCTA
GCTATGATTATTTCTTTCATCACGCTCGTCTCTGTTTCCAAATTGGCTTA
TTATTTGTTCGATAATGAAATCTTGGGTGAAAATTACGATTTCTTAGGCG
TTTTGGAGCGCCGACGAAATCTTGCCGGCAAGAAAGGAAGACGAGGTGAG
GATGATGCTTTACCGCTACAAGAAAAATACAACGGATTCGACGACCCAAC
TCCTCAACAAATCTAAATGGCTGATTTGAATGTGGCAGGTTTGATCAGTA
TCATCATCTTTTATTTGGCTATCCTTGGCATCGGTCTATTTGCTGCCTGG
AGAAAGAACAAACACACGAAAGAGAATGCGCAAACCACACAAGACGAAAC
GAATGAAGTTATTTTAGCTGGAAGAACTATTGGAATGTTTATTGGTTGTT
TCACTATGACTGCAACATGGGTTGGTGGTGGTTACATCAATGGAACAGCA
GAGTCAGTTTACAATGATGGTCTGGTCTGGGCTCAAGCACCGTGGGGTTA
CGCTACCAGTTTAGCGATGGGTGGTTTCTTTTTTGCTCGCAAAATGAGAG
AAGCGGAATATATCACCATGTTGGACCCTCTGCAAGACAAGTACGGTCGT
GTGATGGGTGCTTTCCTTTACATTCCTGCTTTCCTTGGTGAAACATTTTG
GTCTGCATCTATCCTGGCAGCTCTTGGTGCAACATTGACAGTTATCTTGG
GGTTGAACATGAATATTTCCGTCATCGTGTCGGCGTGTATTGCTGTCGGC
TACACCTTTTTTGGTGGACTTTATTCAGTTGCATACACGGACGTCGTTCA
ATTGATTTGCATTGCGGTCGGATTGTGGTTGACGGTTCCTTTCTCTTTGA
CCAATGAAAACGTTGAATCGATTGGTGCACGTAAAGAGGAATGGCTCGGC
CAATTGTATGGTGCTAAAGTCGGAAAATGGATTGATTACGCTTTCTTATT
GatTTGTGGAGGTATTCCATGGCAAGTGTATTTCCAACGTGTATTGTCTT
CCAAGTCAGCTCACCGTGCTCAAATTCTCTCCTTCGTTGCTGCTTTCGGC
TGTATTGTGCTGGCTATCCCTGCAGTTCTGATCGGTGCCGCCGCCAAAAG
CGCTGACTGGGGAGCAGTAAGTGGGGCAGTGGACGCCAACCTTGTGACCA
ACAAAACCGGAGAGTGGGTGATCACGGATACCAGACTGGTCCTCCCCATG
GTTCTTCAATACTTAGCTCCTGGATGGGTGTCTTTCATTGGTCTTGGTGC
CATCTCAGCTGCTGTCATGTCTAGTGCTGACTCGTCAGTTTTGTCTGCTA
GTTCCATGTTCGGACATAATATCTACAAGTTGATCATCAGAAAAAATGCC
AGTGCCAATGAAATTATTTGGGTGATTCGTATTGGTATCATCTTTGTTGG
TATCATGGCAACGCTGGTTGGGTTGACGGTCGACAGCATCTACGCTTTGT
TCCATTTGTGCTCGGACCTGGTCTTTGTCATCCTCTTCCCACAGCTGGTG
GGTGCTGTCCACATCCAAGATGTCAACACGTATGGATCCATCTGTGCTTA
CATAGTGGGATTGTTCTTACGCATCACCGGTGGAGAAGAATTGATCGGGT
TCCCGGCTACTTTTAAATATCCTTACTATGACGAGACGTACAGTAATGGG
AAAGGATCACAAAATTTCCCCTTCCGTACCCTAGCTATGATTATTTCTTT
CATCACGCTCGTCTCTGTTTCCAAATTGGCTTATTATTTGTTCGATAATG
AAATCTTGGGTGAAAATTACGATTTCTTAGGCGTTTTGGAGCGCCGACGA
AATCTTGCCGGCAAGAAAGGAAGACGAGGTGAGGATGATGCTTTACCGCT
ACAAGAAAAATACAACGGATTCGACGACCCAACTCCTCAACAAATCTAAA
TGGCTGATTTGAATGTGGCAGGTTTGATCAGTATCATCATCTTTTATTTG
GCTATCCTTGGCATCGGTCTATTTGCTGCCTGGAGAAAGAACAAACACAC
GAAAGAGAATGCGCAAACCACACAAGACGAAACGAATGAAGTTATTTTAG
CTGGAAGAACTATTGGAATGTTTATTGGTTGTTTCACTATGACTGCAACA
TGGGTTGGTGGTGGTTACATCAATGGAACAGCAGAGTCAGTTTACAATGA
TGGTCTGGTCTGGGCTCAAGCACCGTGGGGTTACGCTACCAGTTTAGCGA
TGGGTGGTTTCTTTTTTGCTCGCAAAATGAGAGAAGCGGAATATATCACC
ATGTTGGACCCTCTGCAAGACAAGTACGGTCGTGTGATGGGTGCTTTCCT
TTACATTCCTGCTTTCCTTGGTGAAACATTTTGGTCTGCATCTATCCTGG
CAGCTCTTGGTGCAACATTGACAGTTATCTTGGGGTTGAACATGAATATT
TCCGTCATCGTGTCGGCGTGTATTGCTGTCGGCTACACCTTTTTTGGTGG
ACTTTATTCAGTTGCATACACGGACGTCGTTCAATTGATTTGCATTGCGG
TCGGATTGTGGTTGACGGTTCCTTTCTCTTTGACCAATGAAAACGTTGAA
TCGATTGGTGCACGTAAAGAGGAATGGCTCGGCCAATTGTATGGTGCTAA
AGTCGGAAAATGGATTGATTACGCTTTCTTATTGatTTGTGGAGGTATTC
CATGGCAAGTGTATTTCCAACGTGTATTGTCTTCCAAGTCAGCTCACCGT
GCTCAAATTCTCTCCTTCGTTGCTGCTTTCGGCTGTATTGTGCTGGCTAT
CCCTGCAGTTCTGATCGGTGCCGCCGCCAAAAGCGCTGACTGGGGAGCAG
TAAGTGGGGCAGTGGACGCCAACCTTGTGACCAACAAAACCGGAGAGTGG
GTGATCACGGATACCAGACTGGTCCTCCCCATGGTTCTTCAATACTTAGC
TCCTGGATGGGTGTCTTTCATTGGTCTTGGTGCCATCTCAGCTGCTGTCA
TGTCTAGTGCTGACTCGTCAGTTTTGTCTGCTAGTTCCATGTTCGGACAT
AATATCTACAAGTTGATCATCAGAAAAAATGCCAGTGCCAATGAAATTAT
TTGGGTGATTCGTATTGGTATCATCTTTGTTGGTATCATGGCAACGCTGG
TTGGGTTGACGGTCGACAGCATCTACGCTTTGTTCCATTTGTGCTCGGAC
CTGGTCTTTGTCATCCTCTTCCCACAGCTGGTGGGTGCTGTCCACATCCA
AGATGTCAACACGTATGGATCCATCTGTGCTTACATAGTGGGATTGTTCT
TACGCATCACCGGTGGAGAAGAATTGATCGGGTTCCCGGCTACTTTTAAA
TATCCTTACTATGACGAGACGTACAGTAATGGGAAAGGATCACAAAATTT
CCCCTTCCGTACCCTAGCTATGATTATTTCTTTCATCACGCTCGTCTCTG
TTTCCAAATTGGCTTATTATTTGTTCGATAATGAAATCTTGGGTGAAAAT
TACGATTTCTTAGGCGTTTTGGAGCGCCGACGAAATCTTGCCGGCAAGAA
AGGAAGACGAGGTGAGGATGATGCTTTACCGCTACAAGAAAAATACAACG
GATTCGACGACCCAACTCCTCAACAAATCTAAATGGCTGATTTGAATGTG
GCAGGTTTGATCAGTATCATCATCTTTTATTTGGCTATCCTTGGCATCGG
TCTATTTGCTGCCTGGAGAAAGAACAAACACACGAAAGAGAATGCGCAAA
CCACACAAGACGAAACGAATGAAGTTATTTTAGCTGGAAGAACTATTGGA
ATGTTTATTGGTTGTTTCACTATGACTGCAACATGGGTTGGTGGTGGTTA
CATCAATGGAACAGCAGAGTCAGTTTACAATGATGGTCTGGTCTGGGCTC
AAGCACCGTGGGGTTACGCTACCAGTTTAGCGATGGGTGGTTTCTTTTTT
GCTCGCAAAATGAGAGAAGCGGAATATATCACCATGTTGGACCCTCTGCA
AGACAAGTACGGTCGTGTGATGGGTGCTTTCCTTTACATTCCTGCTTTCC
TTGGTGAAACATTTTGGTCTGCATCTATCCTGGCAGCTCTTGGTGCAACA
TTGACAGTTATCTTGGGGTTGAACATGAATATTTCCGTCATCGTGTCGGC
GTGTATTGCTGTCGGCTACACCTTTTTTGGTGGACTTTATTCAGTTGCAT
ACACGGACGTCGTTCAATTGATTTGCATTGCGGTCGGATTGTGGTTGACG
GTTCCTTTCTCTTTGACCAATGAAAACGTTGAATCGATTGGTGCACGTAA
AGAGGAATGGCTCGGCCAATTGTATGGTGCTAAAGTCGGAAAATGGATTG
ATTACGCTTTCTTATTGatTTGTGGAGGTATTCCATGGCAAGTGTATTTC
CAACGTGTATTGTCTTCCAAGTCAGCTCACCGTGCTCAAATTCTCTCCTT
CGTTGCTGCTTTCGGCTGTATTGTGCTGGCTATCCCTGCAGTTCTGATCG
GTGCCGCCGCCAAAAGCGCTGACTGGGGAGCAGTAAGTGGGGCAGTGGAC
GCCAACCTTGTGACCAACAAAACCGGAGAGTGGGTGATCACGGATACCAG
ACTGGTCCTCCCCATGGTTCTTCAATACTTAGCTCCTGGATGGGTGTCTT
TCATTGGTCTTGGTGCCATCTCAGCTGCTGTCATGTCTAGTGCTGACTCG
TCAGTTTTGTCTGCTAGTTCCATGTTCGGACATAATATCTACAAGTTGAT
CATCAGAAAAAATGCCAGTGCCAATGAAATTATTTGGGTGATTCGTATTG
GTATCATCTTTGTTGGTATCATGGCAACGCTGGTTGGGTTGACGGTCGAC
AGCATCTACGCTTTGTTCCATTTGTGCTCGGACCTGGTCTTTGTCATCCT
CTTCCCACAGCTGGTGGGTGCTGTCCACATCCAAGATGTCAACACGTATG
GATCCATCTGTGCTTACATAGTGGGATTGTTCTTACGCATCACCGGTGGA
GAAGAATTGATCGGGTTCCCGGCTACTTTTAAATATCCTTACTATGACGA
GACGTACAGTAATGGGAAAGGATCACAAAATTTCCCCTTCCGTACCCTAG
CTATGATTATTTCTTTCATCACGCTCGTCTCTGTTTCCAAATTGGCTTAT
TATTTGTTCGATAATGAAATCTTGGGTGAAAATTACGATTTCTTAGGCGT
TTTGGAGCGCCGACGAAATCTTGCCGGCAAGAAAGGAAGACGAGGTGAGG
ATGATGCTTTACCGCTACAAGAAAAATACAACGGATTCGACGACCCAACT
CCTCAACAAATCTAAATGGCTGATTTGAATGTGGCAGGTTTGATCAGTAT
CATCATCTTTTATTTGGCTATCCTTGGCATCGGTCTATTTGCTGCCTGGA
GAAAGAACAAACACACGAAAGAGAATGCGCAAACCACACAAGACGAAACG
AATGAAGTTATTTTAGCTGGAAGAACTATTGGAATGTTTATTGGTTGTTT
CACTATGACTGCAACATGGGTTGGTGGTGGTTACATCAATGGAACAGCAG
AGTCAGTTTACAATGATGGTCTGGTCTGGGCTCAAGCACCGTGGGGTTAC
GCTACCAGTTTAGCGATGGGTGGTTTCTTTTTTGCTCGCAAAATGAGAGA
AGCGGAATATATCACCATGTTGGACCCTCTGCAAGACAAGTACGGTCGTG
TGATGGGTGCTTTCCTTTACATTCCTGCTTTCCTTGGTGAAACATTTTGG
TCTGCATCTATCCTGGCAGCTCTTGGTGCAACATTGACAGTTATCTTGGG
GTTGAACATGAATATTTCCGTCATCGTGTCGGCGTGTATTGCTGTCGGCT
ACACCTTTTTTGGTGGACTTTATTCAGTTGCATACACGGACGTCGTTCAA
TTGATTTGCATTGCGGTCGGATTGTGGTTGACGGTTCCTTTCTCTTTGAC
CAATGAAAACGTTGAATCGATTGGTGCACGTAAAGAGGAATGGCTCGGCC
AATTGTATGGTGCTAAAGTCGGAAAATGGATTGATTACGCTTTCTTATTG
atTTGTGGAGGTATTCCATGGCAAGTGTATTTCCAACGTGTATTGTCTTC
CAAGTCAGCTCACCGTGCTCAAATTCTCTCCTTCGTTGCTGCTTTCGGCT
GTATTGTGCTGGCTATCCCTGCAGTTCTGATCGGTGCCGCCGCCAAAAGC
GCTGACTGGGGAGCAGTAAGTGGGGCAGTGGACGCCAACCTTGTGACCAA
CAAAACCGGAGAGTGGGTGATCACGGATACCAGACTGGTCCTCCCCATGG
TTCTTCAATACTTAGCTCCTGGATGGGTGTCTTTCATTGGTCTTGGTGCC
ATCTCAGCTGCTGTCATGTCTAGTGCTGACTCGTCAGTTTTGTCTGCTAG
TTCCATGTTCGGACATAATATCTACAAGTTGATCATCAGAAAAAATGCCA
GTGCCAATGAAATTATTTGGGTGATTCGTATTGGTATCATCTTTGTTGGT
ATCATGGCAACGCTGGTTGGGTTGACGGTCGACAGCATCTACGCTTTGTT
CCATTTGTGCTCGGACCTGGTCTTTGTCATCCTCTTCCCACAGCTGGTGG
GTGCTGTCCACATCCAAGATGTCAACACGTATGGATCCATCTGTGCTTAC
ATAGTGGGATTGTTCTTACGCATCACCGGTGGAGAAGAATTGATCGGGTT
CCCGGCTACTTTTAAATATCCTTACTATGACGAGACGTACAGTAATGGGA
AAGGATCACAAAATTTCCCCTTCCGTACCCTAGCTATGATTATTTCTTTC
ATCACGCTCGTCTCTGTTTCCAAATTGGCTTATTATTTGTTCGATAATGA
AATCTTGGGTGAAAATTACGATTTCTTAGGCGTTTTGGAGCGCCGACGAA
ATCTTGCCGGCAAGAAAGGAAGACGAGGTGAGGATGATGCTTTACCGCTA
CAAGAAAAATACAACGGATTCGACGACCCAACTCCTCAACAAATCTAAAT
GGCTGATTTGAATGTGGCAGGTTTGATCAGTATCATCATCTTTTATTTGG
CTATCCTTGGCATCGGTCTATTTGCTGCCTGGAGAAAGAACAAACACACG
AAAGAGAATGCGCAAACCACACAAGACGAAACGAATGAAGTTATTTTAGC
TGGAAGAACTATTGGAATGTTTATTGGTTGTTTCACTATGACTGCAACAT
GGGTTGGTGGTGGTTACATCAATGGAACAGCAGAGTCAGTTTACAATGAT
GGTCTGGTCTGGGCTCAAGCACCGTGGGGTTACGCTACCAGTTTAGCGAT
GGGTGGTTTCTTTTTTGCTCGCAAAATGAGAGAAGCGGAATATATCACCA
TGTTGGACCCTCTGCAAGACAAGTACGGTCGTGTGATGGGTGCTTTCCTT
TACATTCCTGCTTTCCTTGGTGAAACATTTTGGTCTGCATCTATCCTGGC
AGCTCTTGGTGCAACATTGACAGTTATCTTGGGGTTGAACATGAATATTT
CCGTCATCGTGTCGGCGTGTATTGCTGTCGGCTACACCTTTTTTGGTGGA
CTTTATTCAGTTGCATACACGGACGTCGTTCAATTGATTTGCATTGCGGT
CGGATTGTGGTTGACGGTTCCTTTCTCTTTGACCAATGAAAACGTTGAAT
CGATTGGTGCACGTAAAGAGGAATGGCTCGGCCAATTGTATGGTGCTAAA
GTCGGAAAATGGATTGATTACGCTTTCTTATTGatTTGTGGAGGTATTCC
ATGGCAAGTGTATTTCCAACGTGTATTGTCTTCCAAGTCAGCTCACCGTG
CTCAAATTCTCTCCTTCGTTGCTGCTTTCGGCTGTATTGTGCTGGCTATC
CCTGCAGTTCTGATCGGTGCCGCCGCCAAAAGCGCTGACTGGGGAGCAGT
AAGTGGGGCAGTGGACGCCAACCTTGTGACCAACAAAACCGGAGAGTGGG
TGATCACGGATACCAGACTGGTCCTCCCCATGGTTCTTCAATACTTAGCT
CCTGGATGGGTGTCTTTCATTGGTCTTGGTGCCATCTCAGCTGCTGTCAT
GTCTAGTGCTGACTCGTCAGTTTTGTCTGCTAGTTCCATGTTCGGACATA
ATATCTACAAGTTGATCATCAGAAAAAATGCCAGTGCCAATGAAATTATT
TGGGTGATTCGTATTGGTATCATCTTTGTTGGTATCATGGCAACGCTGGT
TGGGTTGACGGTCGACAGCATCTACGCTTTGTTCCATTTGTGCTCGGACC
TGGTCTTTGTCATCCTCTTCCCACAGCTGGTGGGTGCTGTCCACATCCAA
GATGTCAACACGTATGGATCCATCTGTGCTTACATAGTGGGATTGTTCTT
ACGCATCACCGGTGGAGAAGAATTGATCGGGTTCCCGGCTACTTTTAAAT
ATCCTTACTATGACGAGACGTACAGTAATGGGAAAGGATCACAAAATTTC
CCCTTCCGTACCCTAGCTATGATTATTTCTTTCATCACGCTCGTCTCTGT
TTCCAAATTGGCTTATTATTTGTTCGATAATGAAATCTTGGGTGAAAATT
ACGATTTCTTAGGCGTTTTGGAGCGCCGACGAAATCTTGCCGGCAAGAAA
GGAAGACGAGGTGAGGATGATGCTTTACCGCTACAAGAAAAATACAACGG
ATTCGACGACCCAACTCCTCAACAAATCTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11859MSTRG.11859Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11859.7.p1MSTRG.11859.7.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11859.7.p1.exon1MSTRG.11859.7.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.7.p1.exon2MSTRG.11859.7.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.7.p1.exon3MSTRG.11859.7.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.7.p1.exon4MSTRG.11859.7.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.7.p1.exon5MSTRG.11859.7.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.7.p1.exon6MSTRG.11859.7.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.7.p1.exon7MSTRG.11859.7.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.7.p1.exon8MSTRG.11859.7.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000087_pilongenomesc0000087_pilon:922282..928847 +