MSTRG.11859.6.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11859.6.p1
Unique NameMSTRG.11859.6.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000087_pilon:918379..928847+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11859.6.p1 ID=MSTRG.11859.6.p1|Name=MSTRG.11859.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10469bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:918379..928847+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CATAACTTTGTGCAAATTTATgactatttttagaatcactgcGGCGTGAT TGTCGAGATTTTCTATTCTATAAGCCCTTATTTATACCATTTTCGTGCTA CATACCGTCAGCAAGTATTTACTGAATGTCATCAAATAAAAGGGTTAATT ACATGTCTTTTGTTTCTCTAATTGCTTATGTAAATGGAGTGGATTTCCTG ATAGATTTAAAACGAGAAAGAAGAGATGGTAATTTTTGTGCGGTGAATGG CAGAAAACATGTGTAAAGGTTTGTTGTTGATATGTGCTGGACCTCTTTGC TTTGAGTTACAGGGCGTAGAGTTGTTTAAGAAATACTATGTAGTTAtaag attttttcaatgaatctgttttattttgcttttatttttttagatggtta ttcattcgattttatttttttcagatgggttttcgtttgatgttatttcT TCTGATAGTTTTtctgggagtttctaaacatcgaccagaaatgacgacca caACCAGCGACCACGACTGCCAACCAGATATATTTGGGTTATCCAGCTTT TCTCTTTCTTcaacgtagagtgtctctcctGAATAtattgttttgaagag taagctcGCCCCCTGTCTCATATAATTAGAATCACGTGCAAAATGCGTAA AACAGCCCATTCGACGCTCTTGAAACTTGTATGAAAAGGGTGTCAATTCT ATCCTTTTGTCAGTATCATAATGATTAGCATCATAATGATTAGCgctgaa aactttgaaattggTCTGAGAAGCTTTGTACTTAATCATCAGATCATCAT TTCTGTTccaaattagtcattttgtcttaAAAAAGACAATAGAATTGACT ATTCTTCCCAATATTTTCCGACTGATAAATTTATCTATTCATattaaagg catctcattcagcatgATTAAAATATCCGCTGCGTACAGGCATTAAACTA ACGaccttttcaatatttttgtcaagtATTCTGAGCTGGGATAATTTTCC ATGTGCTTAATTGTTGATTTGAAAGCCATTCTAGGACTTGATTTGGAatt tctctacggtggagaaagcAAATAAACTCGATAATTCAACTTTATCTGGT TGCTGGTTGTGGTCGATGGTCATGGTcaccatttctggtcgatgtttaga aactcccagtttttctttatttttgctgttttttcaAGTTATCTTTGAAA GACTTGGTAGATTTCTCAAATGATAGTAACTAGCGGCTTTAtgtctgaaa atttaatttaaacttggagtttgatgattttgttgtgattaaaaacatga tatttagttttttaaggatttgagtgagtgagtgagtgagtgaagAAATA TTTAAGACGATTATCAGGCTCTCATTTTCTTGTTCTTCATTTATGATTTC TTTCCTATCTCATCACCTAGACAATATTTCATCGGAAAACCACCAGTAAT TAATATTGGCTATTTCAGTTTTACGAActgaatttttattaaattttttt gaatgtctAATATGTTAATAAAGggcgaaaaagctaaaaaaaaatttatg cacCCAATTTTcctgttgtttatttttcatctgTATAAAGCTATTCAAAG GGTCGGTGCAATTTCTTCATTCTGAAAGATTGCAAATAATGTCTATCCGT TGTCCGTTTAGTTTCATTAAAAGGGATGAAATATGAATGATGAcgaaata ttttgcaaagttacACGATTTTTAAACATCAGCGTTCATACTGGTTCATA TCAATTGTTGACCTACGTATTGATTCCTTATGGCGACTGTTCAGAAGTAT CTAAAATAGGGCTAATATATGAATGTGTCCACACGGGTTAAACTTTAAAT GGTTTTCGAAAGGATTTGAGAGGATGATCATGATCCTTAACCCAAACAAC CTCATCCATGTCGTTATCACTTTATATATCTATTACTTTATATATCCGAC CTGATCATCTATCTCCCTTTTTACGAGAATATTTGACTACATTCTTTTTG TTAAATGGTTTGATATATCCTGTTTAAAAGGTGTTGTTGAAAAACAGTTT AAATATCGACTGCGATTTAAAAAGATTCGTTAAAAGGCTTGATCATCCAA TTAACTTGTTCTCTTGACAAATAGCTGCTAGATGAGAACCCTCCAAAATA TCATAACACAAATTTTCTCAAGACATATATTTCGTTTTTGTACTATAGCT TTGACTGGATTTGCtttgtgtatttttttatgCGAGATGTTTCAGAGTAA AATTAGGATGTACAAAATAGTTTTGCTGATGATGTTGGTACGTTAGAAGC ATGAACATTTTCTCTCTTTGGTTGTATCATGATTCATGAACATGGTTGTA CGTAATCCAATTTAGTGAATTGGATTGATTGAGTTTGCGAAAGGcgaaaa tacatgtttttttataaggaacacgtttataaggaacttgaggctgaaaa tggtctgagaaataaggaattgttaaggaactactcaggctgagaataaa aaatcaagttaaggaACGGCAAGAGTTCAATTTGAATTTGCACACATTTA CAATAACCTAAATAAAAAGACGGAAAATATTGCTGAAACGCCTTTCAATa tgtcaaaaagacaaaaaatgctGATAAAGAAGCTACACAATTAGCAAATC CAAACTTAACAGCTAATTAactaaggaactcgataaggaactttgaagct gAAACTCTCTGGCAagataaggaactccaggctcggagccaagttaaggt tccttataaaaaaaaagtgtattacgtGAGAGTACTATAATCTAACTTTG ATGAAGTTTCGATATAGATTTTCTTTCATACAAGCTATCTTTTCATTATG TTGTGGTATTAAGGcaggaatacacgttttttttaagaacaaactatata agaacataaggcttcaatggccaaaatgttaagaacaagttttaagaaca ttttaagactttgtagactctaaaatggtcaatttcttaagaaaatggac agaaatactcacaaaatggagaaaatctgaacgttaagaacatttttagg cttaaaatcaaaaaataaagaacaacccaaggcttcaaaattttggatgt tcttataaaaagaacatgtAAGGTTTTAAATTAGATCAAGAGATTGATTT CTATCAATGTTAATATCATCATGTGATGGGGCGACCCCTTTTTTGGATAT CAGTCATTTTTAGCTGCATACTCTGAGTATGTTAGTTGTTTGGCAAAAGG AAGTTAAgcgaaatctattttttttcgtCAGTGGGTATGTCTCGCCGTCA CGATTCTCTATCCATTTGGTTTAGTTACAGCAGGCCATCCGGCCCATTCT CGCAACTGTGTTAATGCAATTATGGGTCCTGTCAGCAACCTTGGACTGAC TATCCAATCCCCCTCCCATgacagtagcgtagccaagaggggcgcaaaat ttgtgtaggagagcagatttttatgccgTTATGATTATCTTTTAATAaca tgaatagataattacagtgtcataaaaacctGCTCTccctgctctcctac acaaattttgcgcccctcttggctacgctactgcatGGCATCGGTTGACT CGGGCGAAGTTCGTTCACTTTCCAAGTAGGAATGCTCCCGTACAGGAATC AAAGTTGATGACGACTATACCAACCACGGCGTCTACTCCCATCCACAGAC TTTGAATCGGGTTTTTGAATATGAAACTTTAAAAGTTTGAAGaggaataa ttagaatttaatatTTCACATTAAAATGTTTGAACTCTCGGAAGATTCTC GCTTCCAACATTTTTGTAATACCAATATTAACAttttcgtttatctttga tagttttttgttaaaggtttttgtggttttgAGTTATGCCATTTATATGG GGCCTATATGTGTCAAActgtaaagatttttttgataatttgtttAATCT TACGATTTGGGAAATTTATAGGCTTATCATAGCTGTTCGTTAAAAAATGT CTGCACGCCGAGTTGATAGATTTCAGCTGgaaaatcaaataataaatata atttctgGTGAGGTTTCGTGCACCAGAGAGGTTAGCGTGGCAGCGTGATA TCCGTATTAGGGATTGGTTATTTAAATTGTCCTGAAATTGACATTACTTG TTACCTGCTGCGTTGCACTTAACACGCTGGTAAAAAAGTAATATCAATTC GTTTAGGGATATGTTTAATAACCTTCTTTATagtttgacgtcattttgat cACAATTCATTGCTCTCTTGCCTGTTATCCCATCTTATAATACAATAGTG AAGTCACTGATTGTATTATGATAGAACAGGGTATGCGTGGACGCACGCAT TAAGCAATTGAATAAGGATTTGTTGTAGTAATATGTCATAGGAAATGAGG GGTTGTGTTAAAATTTGAcgagagaatttttttataaatactgTAGGAAA TACTTCCAACTGTGATTAAAATGTTTCGAATTATCAATATTtctacacaa tttttttctcgattgaGTAGTAAAATGGGGGAGTTGTTTGATGTGGATAT GATATGTTGTACATTTGCACATCAATGAGTTAATCTAGCGGGAAACACTT CAGAAAAGTTGATAGAGTTAGTAGAGGAACTTTCTTCGATACGTGGTCGC GTAAAAGAATCCGATATTGAAATAAATTACAATTCAGTTTGAATACAGTT ACCAATATAGTTAACTGTTTGTTTCATCACGAATGGAAAAGACCGTGAAT TCATATTTTAATGTACTGAACTGGTTTTATCAGTACTAGTGATTTCACGA CTTTTTCTGTATTATtccatttaaaaaattaatattaacTTTAAAATAGC TTCTCTTGTTCCAATCTTAGTTTTAATTAACTTTTATAaaattctttcaa tacaaaGACCACGCCCATTTATTTTGACCCAAGTTTTCTTAGATTTGAAT GTTTTTCACTGGGTGAAAGTaaagaattttcttataaaatgttaTCTAAG TGTATCAATAATTTAAAGAATTGGTCTGCCTGTTTTAAACACAATCATAG AGGGACGATACTTTAACCTTGTAGTACTTTAACTAGTACTTATTTTTTGC CCGATTGTTGATCCTCCATCTTTTACTTTTCTCATATTTTGATTGTAAAC GAGACTAAAAGATAATttcttctctcatcttctcttcattcttcattcaG TCGTTTTCGAGTAAGGCTATTCTTTTctgtttgaaagaaaattgagGGAA GGTCCTTTTTGCTTCAGATTCTCAAAGAACTACATTTTAGGTatgttttt cactttctttatcAAAATTGCTAGATCCAAAAGTTGTTTATTAGCAGTGC CTCTAAattactttatatattttttgaaccaCACCCAATTTCTCTTTCCG GAGAAaatcttttgacattttttatttcgTTGTTATCACTTTAATAATGG TTGACAATTAGTACTTGGACATGATTCTTCTTGCTGCCCTGTTAATGATT CATTATGAACAACCTTAGCGTTTGCAAACATGTTGGATGGGCGTTCCAAT TCACCGGCAGACGAGCTCACAATCTACTCTTTGGTCGTCATGGAAACTGC TCGAAAGCCGCGCCTCGAAACGCCATAGGAGGTATTTAATCAAGGGAAGA CAGGGTGTATAAAACTCGTACCATATTAATCTGGGAATAACTCAGATAAC CTGAAAAtagcatttttcagctttttcagtTCATGTCATCGACTACATCA GTTAAATCACTAGATTTAGAAAATCTTTGTAAATTTAGTAAATCTTTGTA GTCAGACGTAGTTTGTGTCTagtgtttttatcaatttatcaATGGAGAAA ACAATAGTTAATTCTAAACAGAGTTTTGGGCAATAAATGTCAATAGGATA AAGCTTTGTGGAGTGCTCAGATTCCAGACGGTCAAGGAAGATTCATCTGA AGTTATGCAGTAAAATCTTTATTCAGAGTTGAGAAGAACAGATCCAAAGC ATACTATTTAATTCTACCTGGTTACAATATTCACtacaattaaaaaacaa aaccattatTCGCTATCTGCCATCTAAAGAAAGCCCTTGTACTTCCAGGA GAAATTTAATTGATCATCATGGCTGATTTGAATGTGGCAGGTTTGATCAG TATCATCATCTTTTATTTGGCTATCCTTGGCATCGGTCTATTTGCTGCCT GGAGAAAGAACAAACACACGAAAGAGAATGCGCAAACCACACAAGACGAA ACGAATGAAGTTATTTTAGCTGGAAGAACTATTGGAATGTTTATTGGTTG TTTCACTATGACTGGTATGTCGCCTTTCCTTTCGTCTACCGTCACACTGA ACAATCTCTATGGTGACTGAAAATGTTTGTGACAGTGTTGTCTCCAAATC AAAATGAGCGGATGAATTTTGaaaccttttcaatatatcacaaaaaaaGG AGTTCCCAACCTCTGTAGCTTTTTAGACGTCTTTCTTAAGATGTCTTCGA TTGCATTATGGAGCAAAAAAGCAGGTCCGAAAAGATTCATTCAAGCAGCA ATATTCAGAGCGACAATGGTTCTTGCATTATGAATTAAGTGAATTCTCGG AGTGAATCATTATATTccgttttatttttttggttcaTTAGCATTCAAAT CTTTGATATATTTTAGCAACATGGGTTGGTGGTGGTTACATCAATGGAAC AGCAGAGTCAGTTTACAATGATGGTCTGGTCTGGGCTCAAGCACCGTGGG GTTACGCTACCAGTTTAGCGATGGGTACGTATCttctagcctagaaatct aagccatATTGATTCCGTCACTTGGTagaatctgatggtaagttgtgact gaatatctggtaaacttaaaattctgtacatcataaaaatcattaaagca ccgataacgctatattgccGTCAGCCGTCAGCCTTGTAAAAAGTGGCTTG ATTAACCAGGTTCTTCATTGTCTCGTGTAAAGATTTCTTCTCGATAGTGT TTGTGACAAAGGGACATTTCTACAACTTTAACTTGTTTCATAATTTCTTT CAGGTGGTTTCTTTTTTGCTCGCAAAATGAGAGAAGCGGAATATATCACC ATGTTGGACCCTCTGCAAGACAAGTACGGTCGTGTGATGGGTGCTTTCCT TTACATTCCTGCTTTCCTTGGTGAAACATTTTGGTCTGCATCTATCCTGG CAGCTCTTGGTGCAACATTGACAGTTATCTTGGGGTTGAACATGAATATT TCCGTCATCGTGTCGGCGTGTATTGCTGTCGGCTACACCTTTTTTGGTGG ACTTTATTCAGGTATAGGATGAAGCAAATCTTTTACTTATGTATGATGTG AATGTTGTCACATATTTCATTTCAGGACAGTGTctcgctattgttatatt atgctgatataagcaaaaaatgttttgcttttcctctttctgaccaatct tgctctccatccgtgtcaatccaatgttaaaaagcttgtgaattaaaatt gatgagtaagcaaacgatatcactcttatttaaaaacaaaacctttaaaa gtaaAGTTAAAGTTTCCAGAAATCGAATGGActtaatatttttattgatt tttctcccgctaTCAGTTGCATACACGGACGTCGTTCAATTGATTTGCAT TGCGGTCGGATTGTGGTTGACGGTTCCTTTCTCTTTGACCAATGAAAACG TTGAATCGATTGGTGCACGTAAAGAGGAATGGCTCGGCCAATTGTATGGT GCTAAAGTCGGAAAATGGATTGATTACGCTTTCTTATTGGTACGGATAAA GTCTTATTAAAATTCAACTGATATAACTTAACTGACTTCTCTTGCGTTCG TTTACTTTCAATCCATCcttagtctagcatgctagacgattAATTCAGAA agcaaaaaattatgaaaagtgAAAGTTTTAGTTAGAAACTGATATTGTAC CGTAACAATTATcttattatcatataacacctcTGTCACTGTATTAGATG GATCATAAACGACTGTAGTCTAATCCATCCTTCAAGTTTTTGGAATTGTT TGTCATACTTTGAAAAgttgtctttttctttcttagatTTGTGGAGGTAT TCCATGGCAAGTGTATTTCCAACGTGTATTGTCTTCCAAGTCAGCTCACC GTGCTCAAATTCTCTCCTTCGTTGCTGCTTTCGGCTGTATTGTGCTGGCT ATCCCTGCAGTTCTGATCGGTGCCGCCGCCAAAAGCGCTGGTAAGAATCT TTTCTTATATTAGTATATTGGAAGGACTCTTTAGTCGTAACCAAAATATC TGTGTCGAGAAGACATTAAAGATGATACATCTCTTTACCTTCAGACTGGG GAGCAGTAAGTGGGGCAGTGGACGCCAACCTTGTGACCAACAAAACCGGA GAGTGGGTGATCACGGATACCAGACTGGTCCTCCCCATGGTTCTTCAATA CTTAGCTCCTGGATGGGTGTCTTTCATTGGTCTTGGTGCCATCTCAGCTG CTGTCATGTCTAGTGCTGACTCGTCAGTTTTGTCTGCTAGTTCCATGTTC GGACATAATATCTACAAGTTGATCATCAGAAAAAATGTAAGCGAAAAAGA GCATACCTTTGTCTCATTAACCGGTTCAGCTAAATTCcaactcgggtaac ttaatgcatgtcccagaattgcattaatttttccgccccagttccagtcc ctaaaccataacaaactatacatttttggaagcgtatttggatgtagaat accgtatttggtgtaacttaaattctttctcagtataattagagatatgt taaaaaaacctgattatgacgtcatgattgatgacgtcataaatacaaaa agttgaatatcttgagaaatataaatcaaagctttatgaaatttggacca gtgataaagtacattgagatgtttcaaaaacttttaaaagtatttcccaa aattaatgacgtcagcaaaaattgcaagaattcgaatttttgcgatagaa tgctgacatcagcaaattttcaaattttttgaaaaaaattctcctccttt tgatgagttctatcattgctcaaaatttcataaagatttgagtattagtt cttgagatattcaatttttaaaaattatgacgtcataaataatgacgtca taatcatgttttcttaaaaaaactcaaattttgctgagaaagaatttaag ttacaccaaatacggtattctacatccaaatacgcttccaaaaatgtata gtttgttatggtttagggactggaactggggcggaaaaattaatgcaatt ctgggacatgcattaagttacccgagaacAAAGCTGGAATGTTTCTAGCC CGTATGCGGTAtattaaattaataaaattttgtgcaaacttttctgtttt tttttttgtcatttgtaCTTCTTACCTTGGATAAACTTTCGAATATTATC TTTCAGGCCAGTGCCAATGAAATTATTTGGGTGATTCGTATTGGTATCAT CTTTGTTGGTATCATGGCAACGCTGGTTGGGTTGACGGTCGACAGCATCT ACGCTTTGTTCCATTTGTGCTCGGACCTGGTCTTTGTCATCCTCTTCCCA CAGCTGGTGGGTGCTGTCCACATCCAAGATGTCAACACGTATGGATCCAT CTGTGCTTACATAGTGGGATTGTTCTTACGCATCACCGGTGGAGAAGAAT TGATCGGGTTCCCGGCTACTTTTAAATATCCTTACTATGACGAGACGTAC AGTAATGGGAAAGGATCACAAAATTTCCCCTTCCGTACCCTAGCTATGAT TATTTCTTTCATCACGCTCGTCTCTGTTTCCAAATTGGCTTATTATTTGT TCGATAATGAAATCTTGGGTGAAAATTACGATTTCTTAGGCGTTTTGGAG CGCCGACGAAATCTTGCCGGCAAGAAAGGAAGACGAGGTGAGGATGATGC TTTACCGCTACAAGAAAAATACAACGGATTCGACGACCCAACTCCTCAAC AAATCTAAACGTACGTGTCAAAATGATTTGTCAGACATCGCGTGCTACCA ATATGTATCAATGTAGTTTTCGAATATCTAATGAAAGCCTTTACAAGTTT TTAGTAATAACCATGTGAAAAATAGCCAAGTGACTAGGACTGTATCCGTG ATGACCTAGTAAAATTTTGAGTGGCTTTTAAAAGACAGCTGGATAGACTG AATAATGCAAAACTGAAATAAACATGATGGAGCTCTTTTGAAACAAGACG CTGAAAAGTTATTAGGGCTGTGTTTAGCattttaattagtattttttgta taatctcaaaagatcttttactttgtatttttaatttgtaCTGTGTGTTA TCTCATTTAAATGTAGGCATTCATGAAAATATGTACGGTACTTCCTatca aattttcttcattttctttggttttcctcatttatagaaagaaagtttta TACTCTTTATTTAACGAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000087_pilon:918379..928847+

>MSTRG.11859.6.p1 ID=MSTRG.11859.6.p1|Name=MSTRG.11859.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=11781bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:918379..928847+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGATTTGAATGTGGCAGGTTTGATCAGTATCATCATCTTTTATTT
GGCTATCCTTGGCATCGGTCTATTTGCTGCCTGGAGAAAGAACAAACACA
CGAAAGAGAATGCGCAAACCACACAAGACGAAACGAATGAAGTTATTTTA
GCTGGAAGAACTATTGGAATGTTTATTGGTTGTTTCACTATGACTGCAAC
ATGGGTTGGTGGTGGTTACATCAATGGAACAGCAGAGTCAGTTTACAATG
ATGGTCTGGTCTGGGCTCAAGCACCGTGGGGTTACGCTACCAGTTTAGCG
ATGGGTGGTTTCTTTTTTGCTCGCAAAATGAGAGAAGCGGAATATATCAC
CATGTTGGACCCTCTGCAAGACAAGTACGGTCGTGTGATGGGTGCTTTCC
TTTACATTCCTGCTTTCCTTGGTGAAACATTTTGGTCTGCATCTATCCTG
GCAGCTCTTGGTGCAACATTGACAGTTATCTTGGGGTTGAACATGAATAT
TTCCGTCATCGTGTCGGCGTGTATTGCTGTCGGCTACACCTTTTTTGGTG
GACTTTATTCAGTTGCATACACGGACGTCGTTCAATTGATTTGCATTGCG
GTCGGATTGTGGTTGACGGTTCCTTTCTCTTTGACCAATGAAAACGTTGA
ATCGATTGGTGCACGTAAAGAGGAATGGCTCGGCCAATTGTATGGTGCTA
AAGTCGGAAAATGGATTGATTACGCTTTCTTATTGatTTGTGGAGGTATT
CCATGGCAAGTGTATTTCCAACGTGTATTGTCTTCCAAGTCAGCTCACCG
TGCTCAAATTCTCTCCTTCGTTGCTGCTTTCGGCTGTATTGTGCTGGCTA
TCCCTGCAGTTCTGATCGGTGCCGCCGCCAAAAGCGCTGACTGGGGAGCA
GTAAGTGGGGCAGTGGACGCCAACCTTGTGACCAACAAAACCGGAGAGTG
GGTGATCACGGATACCAGACTGGTCCTCCCCATGGTTCTTCAATACTTAG
CTCCTGGATGGGTGTCTTTCATTGGTCTTGGTGCCATCTCAGCTGCTGTC
ATGTCTAGTGCTGACTCGTCAGTTTTGTCTGCTAGTTCCATGTTCGGACA
TAATATCTACAAGTTGATCATCAGAAAAAATGCCAGTGCCAATGAAATTA
TTTGGGTGATTCGTATTGGTATCATCTTTGTTGGTATCATGGCAACGCTG
GTTGGGTTGACGGTCGACAGCATCTACGCTTTGTTCCATTTGTGCTCGGA
CCTGGTCTTTGTCATCCTCTTCCCACAGCTGGTGGGTGCTGTCCACATCC
AAGATGTCAACACGTATGGATCCATCTGTGCTTACATAGTGGGATTGTTC
TTACGCATCACCGGTGGAGAAGAATTGATCGGGTTCCCGGCTACTTTTAA
ATATCCTTACTATGACGAGACGTACAGTAATGGGAAAGGATCACAAAATT
TCCCCTTCCGTACCCTAGCTATGATTATTTCTTTCATCACGCTCGTCTCT
GTTTCCAAATTGGCTTATTATTTGTTCGATAATGAAATCTTGGGTGAAAA
TTACGATTTCTTAGGCGTTTTGGAGCGCCGACGAAATCTTGCCGGCAAGA
AAGGAAGACGAGGTGAGGATGATGCTTTACCGCTACAAGAAAAATACAAC
GGATTCGACGACCCAACTCCTCAACAAATCTAAATGGCTGATTTGAATGT
GGCAGGTTTGATCAGTATCATCATCTTTTATTTGGCTATCCTTGGCATCG
GTCTATTTGCTGCCTGGAGAAAGAACAAACACACGAAAGAGAATGCGCAA
ACCACACAAGACGAAACGAATGAAGTTATTTTAGCTGGAAGAACTATTGG
AATGTTTATTGGTTGTTTCACTATGACTGCAACATGGGTTGGTGGTGGTT
ACATCAATGGAACAGCAGAGTCAGTTTACAATGATGGTCTGGTCTGGGCT
CAAGCACCGTGGGGTTACGCTACCAGTTTAGCGATGGGTGGTTTCTTTTT
TGCTCGCAAAATGAGAGAAGCGGAATATATCACCATGTTGGACCCTCTGC
AAGACAAGTACGGTCGTGTGATGGGTGCTTTCCTTTACATTCCTGCTTTC
CTTGGTGAAACATTTTGGTCTGCATCTATCCTGGCAGCTCTTGGTGCAAC
ATTGACAGTTATCTTGGGGTTGAACATGAATATTTCCGTCATCGTGTCGG
CGTGTATTGCTGTCGGCTACACCTTTTTTGGTGGACTTTATTCAGTTGCA
TACACGGACGTCGTTCAATTGATTTGCATTGCGGTCGGATTGTGGTTGAC
GGTTCCTTTCTCTTTGACCAATGAAAACGTTGAATCGATTGGTGCACGTA
AAGAGGAATGGCTCGGCCAATTGTATGGTGCTAAAGTCGGAAAATGGATT
GATTACGCTTTCTTATTGatTTGTGGAGGTATTCCATGGCAAGTGTATTT
CCAACGTGTATTGTCTTCCAAGTCAGCTCACCGTGCTCAAATTCTCTCCT
TCGTTGCTGCTTTCGGCTGTATTGTGCTGGCTATCCCTGCAGTTCTGATC
GGTGCCGCCGCCAAAAGCGCTGACTGGGGAGCAGTAAGTGGGGCAGTGGA
CGCCAACCTTGTGACCAACAAAACCGGAGAGTGGGTGATCACGGATACCA
GACTGGTCCTCCCCATGGTTCTTCAATACTTAGCTCCTGGATGGGTGTCT
TTCATTGGTCTTGGTGCCATCTCAGCTGCTGTCATGTCTAGTGCTGACTC
GTCAGTTTTGTCTGCTAGTTCCATGTTCGGACATAATATCTACAAGTTGA
TCATCAGAAAAAATGCCAGTGCCAATGAAATTATTTGGGTGATTCGTATT
GGTATCATCTTTGTTGGTATCATGGCAACGCTGGTTGGGTTGACGGTCGA
CAGCATCTACGCTTTGTTCCATTTGTGCTCGGACCTGGTCTTTGTCATCC
TCTTCCCACAGCTGGTGGGTGCTGTCCACATCCAAGATGTCAACACGTAT
GGATCCATCTGTGCTTACATAGTGGGATTGTTCTTACGCATCACCGGTGG
AGAAGAATTGATCGGGTTCCCGGCTACTTTTAAATATCCTTACTATGACG
AGACGTACAGTAATGGGAAAGGATCACAAAATTTCCCCTTCCGTACCCTA
GCTATGATTATTTCTTTCATCACGCTCGTCTCTGTTTCCAAATTGGCTTA
TTATTTGTTCGATAATGAAATCTTGGGTGAAAATTACGATTTCTTAGGCG
TTTTGGAGCGCCGACGAAATCTTGCCGGCAAGAAAGGAAGACGAGGTGAG
GATGATGCTTTACCGCTACAAGAAAAATACAACGGATTCGACGACCCAAC
TCCTCAACAAATCTAAATGGCTGATTTGAATGTGGCAGGTTTGATCAGTA
TCATCATCTTTTATTTGGCTATCCTTGGCATCGGTCTATTTGCTGCCTGG
AGAAAGAACAAACACACGAAAGAGAATGCGCAAACCACACAAGACGAAAC
GAATGAAGTTATTTTAGCTGGAAGAACTATTGGAATGTTTATTGGTTGTT
TCACTATGACTGCAACATGGGTTGGTGGTGGTTACATCAATGGAACAGCA
GAGTCAGTTTACAATGATGGTCTGGTCTGGGCTCAAGCACCGTGGGGTTA
CGCTACCAGTTTAGCGATGGGTGGTTTCTTTTTTGCTCGCAAAATGAGAG
AAGCGGAATATATCACCATGTTGGACCCTCTGCAAGACAAGTACGGTCGT
GTGATGGGTGCTTTCCTTTACATTCCTGCTTTCCTTGGTGAAACATTTTG
GTCTGCATCTATCCTGGCAGCTCTTGGTGCAACATTGACAGTTATCTTGG
GGTTGAACATGAATATTTCCGTCATCGTGTCGGCGTGTATTGCTGTCGGC
TACACCTTTTTTGGTGGACTTTATTCAGTTGCATACACGGACGTCGTTCA
ATTGATTTGCATTGCGGTCGGATTGTGGTTGACGGTTCCTTTCTCTTTGA
CCAATGAAAACGTTGAATCGATTGGTGCACGTAAAGAGGAATGGCTCGGC
CAATTGTATGGTGCTAAAGTCGGAAAATGGATTGATTACGCTTTCTTATT
GatTTGTGGAGGTATTCCATGGCAAGTGTATTTCCAACGTGTATTGTCTT
CCAAGTCAGCTCACCGTGCTCAAATTCTCTCCTTCGTTGCTGCTTTCGGC
TGTATTGTGCTGGCTATCCCTGCAGTTCTGATCGGTGCCGCCGCCAAAAG
CGCTGACTGGGGAGCAGTAAGTGGGGCAGTGGACGCCAACCTTGTGACCA
ACAAAACCGGAGAGTGGGTGATCACGGATACCAGACTGGTCCTCCCCATG
GTTCTTCAATACTTAGCTCCTGGATGGGTGTCTTTCATTGGTCTTGGTGC
CATCTCAGCTGCTGTCATGTCTAGTGCTGACTCGTCAGTTTTGTCTGCTA
GTTCCATGTTCGGACATAATATCTACAAGTTGATCATCAGAAAAAATGCC
AGTGCCAATGAAATTATTTGGGTGATTCGTATTGGTATCATCTTTGTTGG
TATCATGGCAACGCTGGTTGGGTTGACGGTCGACAGCATCTACGCTTTGT
TCCATTTGTGCTCGGACCTGGTCTTTGTCATCCTCTTCCCACAGCTGGTG
GGTGCTGTCCACATCCAAGATGTCAACACGTATGGATCCATCTGTGCTTA
CATAGTGGGATTGTTCTTACGCATCACCGGTGGAGAAGAATTGATCGGGT
TCCCGGCTACTTTTAAATATCCTTACTATGACGAGACGTACAGTAATGGG
AAAGGATCACAAAATTTCCCCTTCCGTACCCTAGCTATGATTATTTCTTT
CATCACGCTCGTCTCTGTTTCCAAATTGGCTTATTATTTGTTCGATAATG
AAATCTTGGGTGAAAATTACGATTTCTTAGGCGTTTTGGAGCGCCGACGA
AATCTTGCCGGCAAGAAAGGAAGACGAGGTGAGGATGATGCTTTACCGCT
ACAAGAAAAATACAACGGATTCGACGACCCAACTCCTCAACAAATCTAAA
TGGCTGATTTGAATGTGGCAGGTTTGATCAGTATCATCATCTTTTATTTG
GCTATCCTTGGCATCGGTCTATTTGCTGCCTGGAGAAAGAACAAACACAC
GAAAGAGAATGCGCAAACCACACAAGACGAAACGAATGAAGTTATTTTAG
CTGGAAGAACTATTGGAATGTTTATTGGTTGTTTCACTATGACTGCAACA
TGGGTTGGTGGTGGTTACATCAATGGAACAGCAGAGTCAGTTTACAATGA
TGGTCTGGTCTGGGCTCAAGCACCGTGGGGTTACGCTACCAGTTTAGCGA
TGGGTGGTTTCTTTTTTGCTCGCAAAATGAGAGAAGCGGAATATATCACC
ATGTTGGACCCTCTGCAAGACAAGTACGGTCGTGTGATGGGTGCTTTCCT
TTACATTCCTGCTTTCCTTGGTGAAACATTTTGGTCTGCATCTATCCTGG
CAGCTCTTGGTGCAACATTGACAGTTATCTTGGGGTTGAACATGAATATT
TCCGTCATCGTGTCGGCGTGTATTGCTGTCGGCTACACCTTTTTTGGTGG
ACTTTATTCAGTTGCATACACGGACGTCGTTCAATTGATTTGCATTGCGG
TCGGATTGTGGTTGACGGTTCCTTTCTCTTTGACCAATGAAAACGTTGAA
TCGATTGGTGCACGTAAAGAGGAATGGCTCGGCCAATTGTATGGTGCTAA
AGTCGGAAAATGGATTGATTACGCTTTCTTATTGatTTGTGGAGGTATTC
CATGGCAAGTGTATTTCCAACGTGTATTGTCTTCCAAGTCAGCTCACCGT
GCTCAAATTCTCTCCTTCGTTGCTGCTTTCGGCTGTATTGTGCTGGCTAT
CCCTGCAGTTCTGATCGGTGCCGCCGCCAAAAGCGCTGACTGGGGAGCAG
TAAGTGGGGCAGTGGACGCCAACCTTGTGACCAACAAAACCGGAGAGTGG
GTGATCACGGATACCAGACTGGTCCTCCCCATGGTTCTTCAATACTTAGC
TCCTGGATGGGTGTCTTTCATTGGTCTTGGTGCCATCTCAGCTGCTGTCA
TGTCTAGTGCTGACTCGTCAGTTTTGTCTGCTAGTTCCATGTTCGGACAT
AATATCTACAAGTTGATCATCAGAAAAAATGCCAGTGCCAATGAAATTAT
TTGGGTGATTCGTATTGGTATCATCTTTGTTGGTATCATGGCAACGCTGG
TTGGGTTGACGGTCGACAGCATCTACGCTTTGTTCCATTTGTGCTCGGAC
CTGGTCTTTGTCATCCTCTTCCCACAGCTGGTGGGTGCTGTCCACATCCA
AGATGTCAACACGTATGGATCCATCTGTGCTTACATAGTGGGATTGTTCT
TACGCATCACCGGTGGAGAAGAATTGATCGGGTTCCCGGCTACTTTTAAA
TATCCTTACTATGACGAGACGTACAGTAATGGGAAAGGATCACAAAATTT
CCCCTTCCGTACCCTAGCTATGATTATTTCTTTCATCACGCTCGTCTCTG
TTTCCAAATTGGCTTATTATTTGTTCGATAATGAAATCTTGGGTGAAAAT
TACGATTTCTTAGGCGTTTTGGAGCGCCGACGAAATCTTGCCGGCAAGAA
AGGAAGACGAGGTGAGGATGATGCTTTACCGCTACAAGAAAAATACAACG
GATTCGACGACCCAACTCCTCAACAAATCTAAATGGCTGATTTGAATGTG
GCAGGTTTGATCAGTATCATCATCTTTTATTTGGCTATCCTTGGCATCGG
TCTATTTGCTGCCTGGAGAAAGAACAAACACACGAAAGAGAATGCGCAAA
CCACACAAGACGAAACGAATGAAGTTATTTTAGCTGGAAGAACTATTGGA
ATGTTTATTGGTTGTTTCACTATGACTGCAACATGGGTTGGTGGTGGTTA
CATCAATGGAACAGCAGAGTCAGTTTACAATGATGGTCTGGTCTGGGCTC
AAGCACCGTGGGGTTACGCTACCAGTTTAGCGATGGGTGGTTTCTTTTTT
GCTCGCAAAATGAGAGAAGCGGAATATATCACCATGTTGGACCCTCTGCA
AGACAAGTACGGTCGTGTGATGGGTGCTTTCCTTTACATTCCTGCTTTCC
TTGGTGAAACATTTTGGTCTGCATCTATCCTGGCAGCTCTTGGTGCAACA
TTGACAGTTATCTTGGGGTTGAACATGAATATTTCCGTCATCGTGTCGGC
GTGTATTGCTGTCGGCTACACCTTTTTTGGTGGACTTTATTCAGTTGCAT
ACACGGACGTCGTTCAATTGATTTGCATTGCGGTCGGATTGTGGTTGACG
GTTCCTTTCTCTTTGACCAATGAAAACGTTGAATCGATTGGTGCACGTAA
AGAGGAATGGCTCGGCCAATTGTATGGTGCTAAAGTCGGAAAATGGATTG
ATTACGCTTTCTTATTGatTTGTGGAGGTATTCCATGGCAAGTGTATTTC
CAACGTGTATTGTCTTCCAAGTCAGCTCACCGTGCTCAAATTCTCTCCTT
CGTTGCTGCTTTCGGCTGTATTGTGCTGGCTATCCCTGCAGTTCTGATCG
GTGCCGCCGCCAAAAGCGCTGACTGGGGAGCAGTAAGTGGGGCAGTGGAC
GCCAACCTTGTGACCAACAAAACCGGAGAGTGGGTGATCACGGATACCAG
ACTGGTCCTCCCCATGGTTCTTCAATACTTAGCTCCTGGATGGGTGTCTT
TCATTGGTCTTGGTGCCATCTCAGCTGCTGTCATGTCTAGTGCTGACTCG
TCAGTTTTGTCTGCTAGTTCCATGTTCGGACATAATATCTACAAGTTGAT
CATCAGAAAAAATGCCAGTGCCAATGAAATTATTTGGGTGATTCGTATTG
GTATCATCTTTGTTGGTATCATGGCAACGCTGGTTGGGTTGACGGTCGAC
AGCATCTACGCTTTGTTCCATTTGTGCTCGGACCTGGTCTTTGTCATCCT
CTTCCCACAGCTGGTGGGTGCTGTCCACATCCAAGATGTCAACACGTATG
GATCCATCTGTGCTTACATAGTGGGATTGTTCTTACGCATCACCGGTGGA
GAAGAATTGATCGGGTTCCCGGCTACTTTTAAATATCCTTACTATGACGA
GACGTACAGTAATGGGAAAGGATCACAAAATTTCCCCTTCCGTACCCTAG
CTATGATTATTTCTTTCATCACGCTCGTCTCTGTTTCCAAATTGGCTTAT
TATTTGTTCGATAATGAAATCTTGGGTGAAAATTACGATTTCTTAGGCGT
TTTGGAGCGCCGACGAAATCTTGCCGGCAAGAAAGGAAGACGAGGTGAGG
ATGATGCTTTACCGCTACAAGAAAAATACAACGGATTCGACGACCCAACT
CCTCAACAAATCTAAATGGCTGATTTGAATGTGGCAGGTTTGATCAGTAT
CATCATCTTTTATTTGGCTATCCTTGGCATCGGTCTATTTGCTGCCTGGA
GAAAGAACAAACACACGAAAGAGAATGCGCAAACCACACAAGACGAAACG
AATGAAGTTATTTTAGCTGGAAGAACTATTGGAATGTTTATTGGTTGTTT
CACTATGACTGCAACATGGGTTGGTGGTGGTTACATCAATGGAACAGCAG
AGTCAGTTTACAATGATGGTCTGGTCTGGGCTCAAGCACCGTGGGGTTAC
GCTACCAGTTTAGCGATGGGTGGTTTCTTTTTTGCTCGCAAAATGAGAGA
AGCGGAATATATCACCATGTTGGACCCTCTGCAAGACAAGTACGGTCGTG
TGATGGGTGCTTTCCTTTACATTCCTGCTTTCCTTGGTGAAACATTTTGG
TCTGCATCTATCCTGGCAGCTCTTGGTGCAACATTGACAGTTATCTTGGG
GTTGAACATGAATATTTCCGTCATCGTGTCGGCGTGTATTGCTGTCGGCT
ACACCTTTTTTGGTGGACTTTATTCAGTTGCATACACGGACGTCGTTCAA
TTGATTTGCATTGCGGTCGGATTGTGGTTGACGGTTCCTTTCTCTTTGAC
CAATGAAAACGTTGAATCGATTGGTGCACGTAAAGAGGAATGGCTCGGCC
AATTGTATGGTGCTAAAGTCGGAAAATGGATTGATTACGCTTTCTTATTG
atTTGTGGAGGTATTCCATGGCAAGTGTATTTCCAACGTGTATTGTCTTC
CAAGTCAGCTCACCGTGCTCAAATTCTCTCCTTCGTTGCTGCTTTCGGCT
GTATTGTGCTGGCTATCCCTGCAGTTCTGATCGGTGCCGCCGCCAAAAGC
GCTGACTGGGGAGCAGTAAGTGGGGCAGTGGACGCCAACCTTGTGACCAA
CAAAACCGGAGAGTGGGTGATCACGGATACCAGACTGGTCCTCCCCATGG
TTCTTCAATACTTAGCTCCTGGATGGGTGTCTTTCATTGGTCTTGGTGCC
ATCTCAGCTGCTGTCATGTCTAGTGCTGACTCGTCAGTTTTGTCTGCTAG
TTCCATGTTCGGACATAATATCTACAAGTTGATCATCAGAAAAAATGCCA
GTGCCAATGAAATTATTTGGGTGATTCGTATTGGTATCATCTTTGTTGGT
ATCATGGCAACGCTGGTTGGGTTGACGGTCGACAGCATCTACGCTTTGTT
CCATTTGTGCTCGGACCTGGTCTTTGTCATCCTCTTCCCACAGCTGGTGG
GTGCTGTCCACATCCAAGATGTCAACACGTATGGATCCATCTGTGCTTAC
ATAGTGGGATTGTTCTTACGCATCACCGGTGGAGAAGAATTGATCGGGTT
CCCGGCTACTTTTAAATATCCTTACTATGACGAGACGTACAGTAATGGGA
AAGGATCACAAAATTTCCCCTTCCGTACCCTAGCTATGATTATTTCTTTC
ATCACGCTCGTCTCTGTTTCCAAATTGGCTTATTATTTGTTCGATAATGA
AATCTTGGGTGAAAATTACGATTTCTTAGGCGTTTTGGAGCGCCGACGAA
ATCTTGCCGGCAAGAAAGGAAGACGAGGTGAGGATGATGCTTTACCGCTA
CAAGAAAAATACAACGGATTCGACGACCCAACTCCTCAACAAATCTAAAT
GGCTGATTTGAATGTGGCAGGTTTGATCAGTATCATCATCTTTTATTTGG
CTATCCTTGGCATCGGTCTATTTGCTGCCTGGAGAAAGAACAAACACACG
AAAGAGAATGCGCAAACCACACAAGACGAAACGAATGAAGTTATTTTAGC
TGGAAGAACTATTGGAATGTTTATTGGTTGTTTCACTATGACTGCAACAT
GGGTTGGTGGTGGTTACATCAATGGAACAGCAGAGTCAGTTTACAATGAT
GGTCTGGTCTGGGCTCAAGCACCGTGGGGTTACGCTACCAGTTTAGCGAT
GGGTGGTTTCTTTTTTGCTCGCAAAATGAGAGAAGCGGAATATATCACCA
TGTTGGACCCTCTGCAAGACAAGTACGGTCGTGTGATGGGTGCTTTCCTT
TACATTCCTGCTTTCCTTGGTGAAACATTTTGGTCTGCATCTATCCTGGC
AGCTCTTGGTGCAACATTGACAGTTATCTTGGGGTTGAACATGAATATTT
CCGTCATCGTGTCGGCGTGTATTGCTGTCGGCTACACCTTTTTTGGTGGA
CTTTATTCAGTTGCATACACGGACGTCGTTCAATTGATTTGCATTGCGGT
CGGATTGTGGTTGACGGTTCCTTTCTCTTTGACCAATGAAAACGTTGAAT
CGATTGGTGCACGTAAAGAGGAATGGCTCGGCCAATTGTATGGTGCTAAA
GTCGGAAAATGGATTGATTACGCTTTCTTATTGatTTGTGGAGGTATTCC
ATGGCAAGTGTATTTCCAACGTGTATTGTCTTCCAAGTCAGCTCACCGTG
CTCAAATTCTCTCCTTCGTTGCTGCTTTCGGCTGTATTGTGCTGGCTATC
CCTGCAGTTCTGATCGGTGCCGCCGCCAAAAGCGCTGACTGGGGAGCAGT
AAGTGGGGCAGTGGACGCCAACCTTGTGACCAACAAAACCGGAGAGTGGG
TGATCACGGATACCAGACTGGTCCTCCCCATGGTTCTTCAATACTTAGCT
CCTGGATGGGTGTCTTTCATTGGTCTTGGTGCCATCTCAGCTGCTGTCAT
GTCTAGTGCTGACTCGTCAGTTTTGTCTGCTAGTTCCATGTTCGGACATA
ATATCTACAAGTTGATCATCAGAAAAAATGCCAGTGCCAATGAAATTATT
TGGGTGATTCGTATTGGTATCATCTTTGTTGGTATCATGGCAACGCTGGT
TGGGTTGACGGTCGACAGCATCTACGCTTTGTTCCATTTGTGCTCGGACC
TGGTCTTTGTCATCCTCTTCCCACAGCTGGTGGGTGCTGTCCACATCCAA
GATGTCAACACGTATGGATCCATCTGTGCTTACATAGTGGGATTGTTCTT
ACGCATCACCGGTGGAGAAGAATTGATCGGGTTCCCGGCTACTTTTAAAT
ATCCTTACTATGACGAGACGTACAGTAATGGGAAAGGATCACAAAATTTC
CCCTTCCGTACCCTAGCTATGATTATTTCTTTCATCACGCTCGTCTCTGT
TTCCAAATTGGCTTATTATTTGTTCGATAATGAAATCTTGGGTGAAAATT
ACGATTTCTTAGGCGTTTTGGAGCGCCGACGAAATCTTGCCGGCAAGAAA
GGAAGACGAGGTGAGGATGATGCTTTACCGCTACAAGAAAAATACAACGG
ATTCGACGACCCAACTCCTCAACAAATCTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11859MSTRG.11859Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11859.6.p1MSTRG.11859.6.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11859.6.p1.exon1MSTRG.11859.6.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.6.p1.exon2MSTRG.11859.6.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.6.p1.exon3MSTRG.11859.6.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.6.p1.exon4MSTRG.11859.6.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.6.p1.exon5MSTRG.11859.6.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.6.p1.exon6MSTRG.11859.6.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.6.p1.exon7MSTRG.11859.6.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11859.6.p1.exon8MSTRG.11859.6.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000087_pilongenomesc0000087_pilon:918379..928847 +