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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000087_pilon:370712..389125+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11829.3.p1 ID=MSTRG.11829.3.p1|Name=MSTRG.11829.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18414bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:370712..389125+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACCACAGCCAAGCCAACAGCATGATGTGATGTTTAGCTGTTTAGCAAATG
TTTAAACAAGGATTCAAGTACTAAATCAGACTAAGATGAGTAAAGATTCA
GTCATCTGCATCATCTCTTCTGACGAGGAGGACAATTCCGAGTCTGCATC
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tcgcgaaagtaaaaattttgaataagaaaaaactatatctTGCGAAAGGC
TGCGCAGCGGCGAAGTAATTGTGCAAATCGCCGGCCCTTTGCATAAAATC
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GGACCTGCTCTAAAAGAGAGGGAGTTATTTATCTATTACATGGAATTACC
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TGTCCTGCATAAATAATCTTTTGCTATTTACGAATGAAACTATTGACACC
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TTAGATTCCAATTCTGAAAATAAAACGTTAGTCTACTTCTgacaaatcac
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AATAGAATCTCAATTAAATGGCAAAAAGTCTAGGTTACTTTTGATAATGC
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AACATAATTCGGGAAAACGACAAACATGGGCATAATTATGGGTCATTATT
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GCACCCCTCACAGCTTGTGGTTCAAGtctgtttttatctttttttcgtTA
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ctttCTATACTTATGATATGATATTTACTTCAGCTATCAACTTCTTTGTC
AAGTCCAAAGAGATAACTACAAGAAATATATTTCATTCTTATAACGTaga
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TTACACATTGACATTACTACCTAAATTTCGAAAGATCATAATCTGACCCC
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GAATGCTACTCAGAAGATTGTTGTCCCATGTCCTAAGAAATAGTCGTTTT
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GTCTGTAAAACAACCAATCACTGGACAGATACCTTCGTCTTCCAATCAAA
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TCCAATAGTTCGACCCAGGCCCCAGGATCATCTGGTGCCACAAGTAGCTT
AATCGGTACGCCTCTCTCAGGTACACCGCTCAAAGTGTCCAAGAAAGCCC
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AGCGTACATTCAAGAAGCtaaactgaaagaaaattttgtcaGATTGTGGA
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CGTAAGAAAGTTAAAGTCCGGGCATCCCCGTTTCCGGAGATTAATCGTGA
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GTAACGGTTCTCTACTTTTCTACAAGAAAGATCCCTTCTTCCTTTGAACA
GCTTTCCAAGATCCAGTTTCTATTATTTGACTCTGGTTACTCTGCTAACT
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tttttgcaTCTTTTGCTTGTGACCACAAGACCCTGTACCATCATCGACTC
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CAATCTTCTTCTCAGGAGCGGCGAACGTCGGATCAGACGATGACACAGAA
GAAAATGACGACGACGAAGAGGACGACCATTCGGAAATCGAATCACTTCG
ACGCCAAAATCTCATCACCAACAAAAAGGTACTTTCTATTCACAAAGTCC
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CCTCAGTTCTTAAAGTCATCTGCTTCACCAAAAAATCCGAACTCGACACT
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GAAACAACTTCCAAGCAAAAGACTATCCCGGATTCAATAATTCCAGAAAA
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CCCTTCAAATAACATTCAAAAACAAAGTGAAAGTCATAGGGATTCGAATC
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TCTGATGAAGATTGATTCAAATTTCTTAGCTATATTTTAACCTCTATTTC
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TATAATAGCGAGTTTGTAAACGAGTTAAATCGACGGCGGTTGTGTGGAGT
AATAATTATCGCGTGATTCTGTCTAGCAAAGTGAAAACCTCGTCGAAATG
TTTGTTTATTATTCATTAACTATGACCTTACTGCTGGACGAcagtaaaat
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atttctatattttggtttgttattttttgtcaatacacgcttcttttttt
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atatttttaaattgccaTGTAAATATTTCTATATCTTAGTAACACTGTAT
AatttaatattgtttttttttggcgaGATAAGTAGTTTTCGGACTTTATT
TCAACAactgaaatattggatcgtttTCCTTTCCAGTGAAAAAGGGCTTT
ATGAAGGGAtttttttACTAGAACTGGCTTTCTTCTGCAAAAACTATTTG
AAGAAATAAGATTTCTTAATCCTGGTTGGCTAAAAATAATAGATCAAAAT
CACAGATTACTACCGAAACTTTGAGGGACATTTTCAGGGAAAAGAATTGA
TTACGTTTTTCAATACATTCGTCACCTCGTTATTATACCTAATTTAGATC
GTTCCTTTCGAATATGGGTTGTTTTAAAAGGTGGTGCCGTACCATGGGGT
ACCCCAATGGTGTACCTTATGGTCTACCCTGAAAAAAGATTTACAGACCA
GACTGGAAAATAATACGCGAATAATACAACCTTACCTTTATGAAATAGGT
TAATTTTCACTACCCTTTTTTGCCTACCCATTCATTAACTTCCCTGGGGA
TAAAATCATGATATTGAATTTTAGTGCAGACAAAATTTCGCCACAGTAAT
TAACAAGActacaataatttcaaaatgatgGAACTCACTAGCCTGCTGTA
GTCTTTTGATGCaaaaaaatagtaaagtctgtctcaaaataatttgcagc
tggagacaaaagtggctgtaacttttgatagaattcgaatcaagttgcga
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tttcagtttcagttatataagctttttttctaaaattttcacagcttatt
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gttttcatgcagcaaaaattttcgtaaaatctcttttcctctagatttga
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TAAACTGAGCAAAATATTAATACAGTgctaaatacacgctttttttataa
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GTTTTATTGATTGAGACAAAAACACTATTTGACTAATTGCAAATTATGAT
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CtttttttatgaaagtaaaatttttgagaTACCATTGTTTATTAGGAAAg
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GGGTTTGTTTTGAAGGCTTCGAAAGTGTTTCAATTAGTGATGtttgtaaa
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GCTGTTTTGGCGAGGTAATCGAGGCAAAGGTCGTATTAGACGATGCCAAG
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GTAGCAGACGAGAGTGTAAAGATCGTGATGGCACAGGAAGCAGTCATCGA
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ACCTTGCAATGATGCTATTGCTCTTCCAACCCCGCCTCAACAAACATCTC
AACGCCCTCTCCCATCGAATAATGGTGCATTTTACTATCCACAGCAGCCA
TGGCATCAACCACTATTGTTTTTCGATCCAAATTCCGGATTTTTCTATCa
ttaaagttgtttttttatattttttgtaattttttttgtttttttacaag
gTTTGATGTAGTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000087_pilon:370712..389125+ >MSTRG.11829.3.p1 ID=MSTRG.11829.3.p1|Name=MSTRG.11829.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2628bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:370712..389125+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAATCGATATGGGCGAACACGCATCTATTCTTTACGGAACTCATTA
CCCGAACAAAATCTTTGTCGGATGCCTTCCCGCAAGAaTAACAGCTGCTT
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CTCAACGCCCTCTCCCATCGAATAATGGTGCATTTTACTATCCACAGCAG
CCATGGCATCAACCACTATTGTTTTTCGATCCAAATTCCGGATTTTTCTA
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CTCATTACCCGAACAAAATCTTTGTCGGATGCCTTCCCGCAAGAaTAACA
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TATTCTTTACGGAACTCATTACCCGAACAAAATCTTTGTCGGATGCCTTC
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GAGGTAATCGAGGCAAAGGTCGTATTAGACGATGCCAAGAAATCGAAACG
TTTTGGGTTCGTGTCTTTCTCCCGTGCTACCGATGCCAAAACTGTTTTAT
CGGCTGGAGATTTTTACATGCTGGGAAAACGCATCGTTGTTGGACCTGCT
GTAAAAAGAGAGTTCAAGGAGCGTGTAGCAGACGAGAGTGTAAAGATCGT
GATGGCACAGGAAGCAGTCATCGAACACGAAATGAGAAGGAGCAATGAAC
ACCGACAAAGCAACGTTTATAATCCGCCAAGGCGTTTTGTTTACCGCCCG
TTGAAACAAGAAAAAGATGATGATAACATGGAGACCAAAACCTTGACAGA
CTACCAGCAAGATGACGTGAAACCACCTTGCAATGATGCTATTGCTCTTC
CAACCCCGCCTCAACAAACATCTCAACGCCCTCTCCCATCGAATAATGGT
GCATTTTACTATCCACAGCAGCCATGGCATCAACCACTATTGTTTTTCGA
TCCAAATTCCGGATTTTTCTATCattaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000087_pilon | genome | sc0000087_pilon:370712..389125 + |
|
