MSTRG.11823.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11823.1.p1
Unique NameMSTRG.11823.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000087_pilon:294592..300005+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11823.1.p1 ID=MSTRG.11823.1.p1|Name=MSTRG.11823.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5414bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:294592..300005+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGGCattcatttctgttttcatttgtttgatcttatccatattttttcc
tctttttttcatcaattttgctgtttttctctttcagaACTAtgtgaaaa
tacaaaaggaagtATGTGGAGCAGACAATTAACTAGGCTATGCCGTCAAC
CCCCGATCAAGAAGGGAAGACAGCTAGTCCCTAGAAAAGAAGTTGTTATC
AGATTTCAAAGTTACactaaacaaaatttaacatacAGCTTGAAGTATAT
TTTGGGATTACTTGGAGGAACTTTGACAGGCGGTTTATctgtttatttga
tttctaaCCATAATGTGGACGTGGAAGCATCTCAACCAAAGAAAAAACTT
GTGATACTTGGCTCTGGTTGGGGTGCAGTCAGTCTCATCAAAAGTCTAAA
ACCTGATTTATATGACATCAAAGTAGTTTCGCCCACAAATTATTTTCTAT
TCACACCTTTGCTACCATCTGTTACTGTTGGCACTGTGGATGGACGTAGC
CTTACAGAACCAATCAGAAAGATTTTATCGAAGAAACAAAAGGAGGGAAA
TTATGAATATTTTGAAGCCCATTGCATTGATGTTGATACTGAGAAAAATC
AAGTTATTTGTGCTGATAAATCAGGTTGAGTTTCATGtctttatcttttt
catttgttgagTTCCCTTCACTTCGCAGACACCCTTAGATTATAAAGCCT
ACCCTGTTTTGGATTTTGTTGATCTAATTGATTTGACCACGTTATTGTTA
TTGCTGTGTAAATTGattggctgttttttttctctttgaagCGTAGCATg
atcaaaatttacattttgttAGATATTCAAAGCGACAGCCCTGAGTTCAA
GATTGACTATGACATTTTGGTAGTGGCTGTTGGATCGAAAACAAACACGT
ACAACAATCCTGATATCAAGAAATATTCTCATAAACTAAAAAATGTTCAA
CAAGCTCGAGAAGTCCGCAAACATATTGTTGATTCTTTGGAAACTGCCAT
TTTGCCAGGTCAATGtgaagaagaaatgaaaaggatgttgagttttgttg
TCGTTGGTGGTGGGCCTACAGGTTTGTTGTGGTTCTTGCCAATCAACTTT
TTCCTATTAGCGCTTTTATACTTAATATTTTAGACAGTCATCTGATTTCC
TCCTAGCTTACATTGTTCTATTCTACTTAAATTCTACTATTCTATTCTAC
TTTTCTACTTTTTCAGGAGTTGAATTTGCTGGAGAATTGCGTGATTATCt
tgatgatttgaaaaatgtttatccTCAACAAGTTATTGATAATATGTGCA
TAACTTTGGTGAATAGCCATTACAAAGTATTGAGTATGTATGACCAACAG
GTTTGTAAACATACCAATTTAAAGTTCTTGTGTCCATGACTGAATATCGT
CCCATTGAAGTATAGAAAGATGCTTctctgtctcaaaattctgcataatt
taccaaaattttataaacatgtgctaattttctttttgaaatccaTTGTC
TAAAACAAAAAACCTTGCTTTTACCATTGACATACATAAGTCTTTAGCTT
TCCAATTACGTCATAGCCATTTGGTcccaaaatcatttttcatatAATAG
CCTTTGAGTggactttttaaagaaaactgcTCATACCTGTCATTTAATCT
ATCAAAAACCTATATTGTCAGAGATTACttcattttcattcagtttAATC
TAATACTGCTCAAGTTTCTTCAAAAATGTCTTACCAACTTCTTTTCAGAT
AAGCAATTTCACTGAACAGAAATTCAAATCAGACGGTATCAACACGATTG
GTAATTCTTATGTAGTTGGAATGGATCCAAAGAATATTAAAATCCAAAAC
AAGAAGACTAAAGAGATAACAGTTTTACCGTATGGTTTATGTGTTTGGGC
TGCTGGTATTGCACCTAGAGACATAACTAAGACGCTGATCAAAAGAATGC
CTGCTCAAAACAACAGGTTAAACAATTATATTTGCTCTGTCTTTATTTAA
ACAGCCATCCTGTCATCAAATACCACTTATACTAGCATTGTTTTACTCaa
acttttttggacctaccccggtggaggtcctataaattaacctttgtccg
ttcgttcgtttgttattagctttcctcatgattggctcattagttttttc
tgattttttgcgcaaagatgcataactataaaccctcgaatgtgacggag
cccgattttcaaaaaaaaaattttttgggcaaatttgggccaaaaaacgg
ctaaaaacgggttttttggacttcgtgaaaaattaggtcgttaatttttt
ctgattttttgcatggaagtagggtaccatcgtaagtaaaagatggctta
agcagatttttgcaaaaaaaatttgttggctcaaaaaacgcatgtttatc
tataagaatcactattaataagcatacatcaatgttcttagtcaaattac
tcaatttttttatgagatagatgtttttttttgctcaggagggcttactt
ttacaaaatatgtgtgtttagacatgaaattttggttgcttggcgtgttt
ttataggaaaataggccaaattcgatattcttttataagcacattatcaa
ttacttaggtattagctcttctcgagattggctctttcattctttatgat
tttttgagcaaagatgcataactataaaccctcgaatctGACAAAAGCGA
CATACATCTTTAGTTATACTGTTTCTTATTAGAAATGCATTGGTCACAGA
TGGCTACATGAAATTGAAAGGAAGCAATAATATTTTTGGTATCGGAGACT
GTTCTACTGTCGAGTTTACTAAGCTAATGTATCAAGTTGAACAGTTATTC
AAAGAAGCTGATCTTGATGGGACTGGTCAGCTATCTCTCTCTGAATTCTC
AGGTTAGAGGGAAATATTTTGTACTGTACTAGAACACTAGAAGTACAATA
CAGTTTAGCCTTACCCAAACAATACCCTCATTTATCTATCTTATTTggtt
ttgtttggttttgttgttcAATGATTTAATGCagaaccactgacctttat
atatccctggaccaaaaaattggtaccctaatcgCGACACTACTCAAAAG
tggtgaaaatgcatcgagagcgctggatctactttccctcaaatACTTTT
TATGATAGCGCTGTTatgacgttaatttttaaaatttcaatggtttcttc
tcgggtaccaattccaaaaaaaactccaatcaaagatggtggatatagct
tggtccatgGATATTTAATGGTCAGTGTGCAGAACCTGTTATGACAAAGG
TTTTTAAACAATTCTTTAACGTTAAGCAATGTCAAGTACTAACACCTCTT
CTTTTCAGTATTTTTGGAGACAGCAAAGAAGAAATATCCTGAAATGACGC
AACATTTGACCAAGTTACAAAAATCAGTTGATAAGTATGATCTTGTAATT
TAGcctgttttgattttattgtctTTAATCTGAAAACGTTGAACTGCTGA
CCTCAATGTATTTATAATGAATTTTGGCCACCATAACGGCTCTCCTTTGA
CTAGACGCAATAACCTGCAGAAAGTTGCTATCAGAGTGAAATGGCTTAAA
GAGATCTTCTAAATGAGTCTTGGATGTTCTAAAGAATCTCACTTCTTGCT
TTTCAGGACATTCAGCTTGATGGATACTGACCATAATGAGCGATTAAGTC
TTGAAGAGTTTACTCTTTTCTTGAAGGATGTTGACAGCAAATTAAAAGCC
TACCCTGCTACAGCCCAAGTCGCTTCTCAACAAGGCAAATATCTCGGAAA
ACTTCTCTCGGCACATTCTGAGATcactgaaaatgaagatttctcGGTTT
GCAAACCCTTCGAATACAGTCATTTGGGGAGTTTTGCTTATGTTGGGGGA
GAAGCAGCTGTGTTGGAGCTCCCTATCATTGGTACTTTCACCAACTTTGC
CACCATTTGGTTATGGAGAGGTGCCTACTTAAACCAAGCTGTTAGTTGGA
GAATGCAGTGCCTTATTGGGTTTGATTGGGTTAAAGCACACGTTTTTGGT
CGAGATACTTCAGAAATTTAAATTAGACCTGatttatcttcttctttata
ttttgtcttattttatttattctttagggtatttagatatctctatatat
tGGGGCTTACAATGATAAGGGttttttaggggttttcttttgtattattt
gctaatttaagagaagaatttattttggtaaaTGGAattttatgtgcatt
gttgtgattattttattgaaatcatttgttttgttttgtagatattttgt
atatttatcatctttaACATAGCATTTATAGAtaaattatttgttttatt
gCTAGCACACTTTCGCTGTACCTATTCGAAAACATCTTACTGAAAAAATA
TTACTGATAGTTTGATAGCATTTCTAGTCTAGGGAATCTTCATTCTGAAC
ATTTTTAATCTCTAATAATATTTTGTGTGTGGAAGATCAAAGTATGATTT
ATCAGAGGTGAGTATTAGACTACCCAGGTATCCCAAGCCAATTCTTACCA
AGCTCTATACTTTTCCTGTATACGTACCCATATCATTTTAATTGTCAGCA
ATACCAATTGTAGACCCTTAGTAATCCATGCAGAAGACAAAGGGTTCGAT
TCTCACTCGGTTCTGTGGTGCATTTGGCAAGTGATTGTAGCAACGCCCGG
GTCAACCAATGTCATGTTAAGGGAACTGGGTACCAAAAGATACATCAGTG
TGGGGAATAATGCCAACTGCATCTTAGGTTGTGATGTTGCTCACTTGTTC
AAGCTTATTTGAGTTGCACAACCAATAAAGCACGACTCTAATGGTGTCTC
Aaggatacaccttttcgaccgtagccgccaattgccgcacgggcatttct
ttgtccgctttatcccactaaaaccgtccagTCCtattttcgcacctata
gaccatagaaaaatgtgtcaaaaaaaggattgaatcgagtttagggggat
aattaaataattaagtgacaCGCACCTGaatacggtcgaaaaggtgtatt
aatgGTGGCTTTTCTTTGTTAAGAACAACGGGGGTTTCGCCCGAAAATGC
CTGCAGATAATCAGCTAACCAAAAGGAAGTGTAATATATTATTGACATTT
AATTTATTATATTAAATCACAACatatccatagtattaatgtattatgtt
aaatcatatcatatatctttattataatattgtattatcttatcACGGCA
TACACTATTTACACATTTGCaaacaaatgttttgaaaacggTTCACCTTG
GTATTCCTCTAAAAACATTAACATACAAttcgctaccttaattcaaaagg
ggttAAGTTAAGACGGTTCATAACTTCATACTGAAGCTCTGATAAAAgtg
atgtttaattcaaa

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000087_pilon:294592..300005+

>MSTRG.11823.1.p1 ID=MSTRG.11823.1.p1|Name=MSTRG.11823.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=12411bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:294592..300005+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGGAGCAGACAATTAACTAGGCTATGCCGTCAACCCCCGATCAAGAA
GGGAAGACAGCTAGTCCCTAGAAAAGAAGTTGTTATCAGATTTCAAAGTT
ACactaaacaaaatttaacatacAGCTTGAAGTATATTTTGGGATTACTT
GGAGGAACTTTGACAGGCGGTTTATctgtttatttgatttctaaCCATAA
TGTGGACGTGGAAGCATCTCAACCAAAGAAAAAACTTGTGATACTTGGCT
CTGGTTGGGGTGCAGTCAGTCTCATCAAAAGTCTAAAACCTGATTTATAT
GACATCAAAGTAGTTTCGCCCACAAATTATTTTCTATTCACACCTTTGCT
ACCATCTGTTACTGTTGGCACTGTGGATGGACGTAGCCTTACAGAACCAA
TCAGAAAGATTTTATCGAAGAAACAAAAGGAGGGAAATTATGAATATTTT
GAAGCCCATTGCATTGATGTTGATACTGAGAAAAATCAAGTTATTTGTGC
TGATAAATCAGATATTCAAAGCGACAGCCCTGAGTTCAAGATTGACTATG
ACATTTTGGTAGTGGCTGTTGGATCGAAAACAAACACGTACAACAATCCT
GATATCAAGAAATATTCTCATAAACTAAAAAATGTTCAACAAGCTCGAGA
AGTCCGCAAACATATTGTTGATTCTTTGGAAACTGCCATTTTGCCAGGTC
AATGtgaagaagaaatgaaaaggatgttgagttttgttgTCGTTGGTGGT
GGGCCTACAGGAGTTGAATTTGCTGGAGAATTGCGTGATTATCttgatga
tttgaaaaatgtttatccTCAACAAGTTATTGATAATATGTGCATAACTT
TGGTGAATAGCCATTACAAAGTATTGAGTATGTATGACCAACAGATAAGC
AATTTCACTGAACAGAAATTCAAATCAGACGGTATCAACACGATTGGTAA
TTCTTATGTAGTTGGAATGGATCCAAAGAATATTAAAATCCAAAACAAGA
AGACTAAAGAGATAACAGTTTTACCGTATGGTTTATGTGTTTGGGCTGCT
GGTATTGCACCTAGAGACATAACTAAGACGCTGATCAAAAGAATGCCTGC
TCAAAACAACAGAAATGCATTGGTCACAGATGGCTACATGAAATTGAAAG
GAAGCAATAATATTTTTGGTATCGGAGACTGTTCTACTGTCGAGTTTACT
AAGCTAATGTATCAAGTTGAACAGTTATTCAAAGAAGCTGATCTTGATGG
GACTGGTCAGCTATCTCTCTCTGAATTCTCAGTATTTTTGGAGACAGCAA
AGAAGAAATATCCTGAAATGACGCAACATTTGACCAAGTTACAAAAATCA
GTTGATAAGACATTCAGCTTGATGGATACTGACCATAATGAGCGATTAAG
TCTTGAAGAGTTTACTCTTTTCTTGAAGGATGTTGACAGCAAATTAAAAG
CCTACCCTGCTACAGCCCAAGTCGCTTCTCAACAAGGCAAATATCTCGGA
AAACTTCTCTCGGCACATTCTGAGATcactgaaaatgaagatttctcGGT
TTGCAAACCCTTCGAATACAGTCATTTGGGGAGTTTTGCTTATGTTGGGG
GAGAAGCAGCTGTGTTGGAGCTCCCTATCATTGGTACTTTCACCAACTTT
GCCACCATTTGGTTATGGAGAGGTGCCTACTTAAACCAAGCTGTTAGTTG
GAGAATGCAGTGCCTTATTGGGTTTGATTGGGTTAAAGCACACGTTTTTG
GTCGAGATACTTCAGAAATTTAAATGTGGAGCAGACAATTAACTAGGCTA
TGCCGTCAACCCCCGATCAAGAAGGGAAGACAGCTAGTCCCTAGAAAAGA
AGTTGTTATCAGATTTCAAAGTTACactaaacaaaatttaacatacAGCT
TGAAGTATATTTTGGGATTACTTGGAGGAACTTTGACAGGCGGTTTATct
gtttatttgatttctaaCCATAATGTGGACGTGGAAGCATCTCAACCAAA
GAAAAAACTTGTGATACTTGGCTCTGGTTGGGGTGCAGTCAGTCTCATCA
AAAGTCTAAAACCTGATTTATATGACATCAAAGTAGTTTCGCCCACAAAT
TATTTTCTATTCACACCTTTGCTACCATCTGTTACTGTTGGCACTGTGGA
TGGACGTAGCCTTACAGAACCAATCAGAAAGATTTTATCGAAGAAACAAA
AGGAGGGAAATTATGAATATTTTGAAGCCCATTGCATTGATGTTGATACT
GAGAAAAATCAAGTTATTTGTGCTGATAAATCAGATATTCAAAGCGACAG
CCCTGAGTTCAAGATTGACTATGACATTTTGGTAGTGGCTGTTGGATCGA
AAACAAACACGTACAACAATCCTGATATCAAGAAATATTCTCATAAACTA
AAAAATGTTCAACAAGCTCGAGAAGTCCGCAAACATATTGTTGATTCTTT
GGAAACTGCCATTTTGCCAGGTCAATGtgaagaagaaatgaaaaggatgt
tgagttttgttgTCGTTGGTGGTGGGCCTACAGGAGTTGAATTTGCTGGA
GAATTGCGTGATTATCttgatgatttgaaaaatgtttatccTCAACAAGT
TATTGATAATATGTGCATAACTTTGGTGAATAGCCATTACAAAGTATTGA
GTATGTATGACCAACAGATAAGCAATTTCACTGAACAGAAATTCAAATCA
GACGGTATCAACACGATTGGTAATTCTTATGTAGTTGGAATGGATCCAAA
GAATATTAAAATCCAAAACAAGAAGACTAAAGAGATAACAGTTTTACCGT
ATGGTTTATGTGTTTGGGCTGCTGGTATTGCACCTAGAGACATAACTAAG
ACGCTGATCAAAAGAATGCCTGCTCAAAACAACAGAAATGCATTGGTCAC
AGATGGCTACATGAAATTGAAAGGAAGCAATAATATTTTTGGTATCGGAG
ACTGTTCTACTGTCGAGTTTACTAAGCTAATGTATCAAGTTGAACAGTTA
TTCAAAGAAGCTGATCTTGATGGGACTGGTCAGCTATCTCTCTCTGAATT
CTCAGTATTTTTGGAGACAGCAAAGAAGAAATATCCTGAAATGACGCAAC
ATTTGACCAAGTTACAAAAATCAGTTGATAAGACATTCAGCTTGATGGAT
ACTGACCATAATGAGCGATTAAGTCTTGAAGAGTTTACTCTTTTCTTGAA
GGATGTTGACAGCAAATTAAAAGCCTACCCTGCTACAGCCCAAGTCGCTT
CTCAACAAGGCAAATATCTCGGAAAACTTCTCTCGGCACATTCTGAGATc
actgaaaatgaagatttctcGGTTTGCAAACCCTTCGAATACAGTCATTT
GGGGAGTTTTGCTTATGTTGGGGGAGAAGCAGCTGTGTTGGAGCTCCCTA
TCATTGGTACTTTCACCAACTTTGCCACCATTTGGTTATGGAGAGGTGCC
TACTTAAACCAAGCTGTTAGTTGGAGAATGCAGTGCCTTATTGGGTTTGA
TTGGGTTAAAGCACACGTTTTTGGTCGAGATACTTCAGAAATTTAAATGT
GGAGCAGACAATTAACTAGGCTATGCCGTCAACCCCCGATCAAGAAGGGA
AGACAGCTAGTCCCTAGAAAAGAAGTTGTTATCAGATTTCAAAGTTACac
taaacaaaatttaacatacAGCTTGAAGTATATTTTGGGATTACTTGGAG
GAACTTTGACAGGCGGTTTATctgtttatttgatttctaaCCATAATGTG
GACGTGGAAGCATCTCAACCAAAGAAAAAACTTGTGATACTTGGCTCTGG
TTGGGGTGCAGTCAGTCTCATCAAAAGTCTAAAACCTGATTTATATGACA
TCAAAGTAGTTTCGCCCACAAATTATTTTCTATTCACACCTTTGCTACCA
TCTGTTACTGTTGGCACTGTGGATGGACGTAGCCTTACAGAACCAATCAG
AAAGATTTTATCGAAGAAACAAAAGGAGGGAAATTATGAATATTTTGAAG
CCCATTGCATTGATGTTGATACTGAGAAAAATCAAGTTATTTGTGCTGAT
AAATCAGATATTCAAAGCGACAGCCCTGAGTTCAAGATTGACTATGACAT
TTTGGTAGTGGCTGTTGGATCGAAAACAAACACGTACAACAATCCTGATA
TCAAGAAATATTCTCATAAACTAAAAAATGTTCAACAAGCTCGAGAAGTC
CGCAAACATATTGTTGATTCTTTGGAAACTGCCATTTTGCCAGGTCAATG
tgaagaagaaatgaaaaggatgttgagttttgttgTCGTTGGTGGTGGGC
CTACAGGAGTTGAATTTGCTGGAGAATTGCGTGATTATCttgatgatttg
aaaaatgtttatccTCAACAAGTTATTGATAATATGTGCATAACTTTGGT
GAATAGCCATTACAAAGTATTGAGTATGTATGACCAACAGATAAGCAATT
TCACTGAACAGAAATTCAAATCAGACGGTATCAACACGATTGGTAATTCT
TATGTAGTTGGAATGGATCCAAAGAATATTAAAATCCAAAACAAGAAGAC
TAAAGAGATAACAGTTTTACCGTATGGTTTATGTGTTTGGGCTGCTGGTA
TTGCACCTAGAGACATAACTAAGACGCTGATCAAAAGAATGCCTGCTCAA
AACAACAGAAATGCATTGGTCACAGATGGCTACATGAAATTGAAAGGAAG
CAATAATATTTTTGGTATCGGAGACTGTTCTACTGTCGAGTTTACTAAGC
TAATGTATCAAGTTGAACAGTTATTCAAAGAAGCTGATCTTGATGGGACT
GGTCAGCTATCTCTCTCTGAATTCTCAGTATTTTTGGAGACAGCAAAGAA
GAAATATCCTGAAATGACGCAACATTTGACCAAGTTACAAAAATCAGTTG
ATAAGACATTCAGCTTGATGGATACTGACCATAATGAGCGATTAAGTCTT
GAAGAGTTTACTCTTTTCTTGAAGGATGTTGACAGCAAATTAAAAGCCTA
CCCTGCTACAGCCCAAGTCGCTTCTCAACAAGGCAAATATCTCGGAAAAC
TTCTCTCGGCACATTCTGAGATcactgaaaatgaagatttctcGGTTTGC
AAACCCTTCGAATACAGTCATTTGGGGAGTTTTGCTTATGTTGGGGGAGA
AGCAGCTGTGTTGGAGCTCCCTATCATTGGTACTTTCACCAACTTTGCCA
CCATTTGGTTATGGAGAGGTGCCTACTTAAACCAAGCTGTTAGTTGGAGA
ATGCAGTGCCTTATTGGGTTTGATTGGGTTAAAGCACACGTTTTTGGTCG
AGATACTTCAGAAATTTAAATGTGGAGCAGACAATTAACTAGGCTATGCC
GTCAACCCCCGATCAAGAAGGGAAGACAGCTAGTCCCTAGAAAAGAAGTT
GTTATCAGATTTCAAAGTTACactaaacaaaatttaacatacAGCTTGAA
GTATATTTTGGGATTACTTGGAGGAACTTTGACAGGCGGTTTATctgttt
atttgatttctaaCCATAATGTGGACGTGGAAGCATCTCAACCAAAGAAA
AAACTTGTGATACTTGGCTCTGGTTGGGGTGCAGTCAGTCTCATCAAAAG
TCTAAAACCTGATTTATATGACATCAAAGTAGTTTCGCCCACAAATTATT
TTCTATTCACACCTTTGCTACCATCTGTTACTGTTGGCACTGTGGATGGA
CGTAGCCTTACAGAACCAATCAGAAAGATTTTATCGAAGAAACAAAAGGA
GGGAAATTATGAATATTTTGAAGCCCATTGCATTGATGTTGATACTGAGA
AAAATCAAGTTATTTGTGCTGATAAATCAGATATTCAAAGCGACAGCCCT
GAGTTCAAGATTGACTATGACATTTTGGTAGTGGCTGTTGGATCGAAAAC
AAACACGTACAACAATCCTGATATCAAGAAATATTCTCATAAACTAAAAA
ATGTTCAACAAGCTCGAGAAGTCCGCAAACATATTGTTGATTCTTTGGAA
ACTGCCATTTTGCCAGGTCAATGtgaagaagaaatgaaaaggatgttgag
ttttgttgTCGTTGGTGGTGGGCCTACAGGAGTTGAATTTGCTGGAGAAT
TGCGTGATTATCttgatgatttgaaaaatgtttatccTCAACAAGTTATT
GATAATATGTGCATAACTTTGGTGAATAGCCATTACAAAGTATTGAGTAT
GTATGACCAACAGATAAGCAATTTCACTGAACAGAAATTCAAATCAGACG
GTATCAACACGATTGGTAATTCTTATGTAGTTGGAATGGATCCAAAGAAT
ATTAAAATCCAAAACAAGAAGACTAAAGAGATAACAGTTTTACCGTATGG
TTTATGTGTTTGGGCTGCTGGTATTGCACCTAGAGACATAACTAAGACGC
TGATCAAAAGAATGCCTGCTCAAAACAACAGAAATGCATTGGTCACAGAT
GGCTACATGAAATTGAAAGGAAGCAATAATATTTTTGGTATCGGAGACTG
TTCTACTGTCGAGTTTACTAAGCTAATGTATCAAGTTGAACAGTTATTCA
AAGAAGCTGATCTTGATGGGACTGGTCAGCTATCTCTCTCTGAATTCTCA
GTATTTTTGGAGACAGCAAAGAAGAAATATCCTGAAATGACGCAACATTT
GACCAAGTTACAAAAATCAGTTGATAAGACATTCAGCTTGATGGATACTG
ACCATAATGAGCGATTAAGTCTTGAAGAGTTTACTCTTTTCTTGAAGGAT
GTTGACAGCAAATTAAAAGCCTACCCTGCTACAGCCCAAGTCGCTTCTCA
ACAAGGCAAATATCTCGGAAAACTTCTCTCGGCACATTCTGAGATcactg
aaaatgaagatttctcGGTTTGCAAACCCTTCGAATACAGTCATTTGGGG
AGTTTTGCTTATGTTGGGGGAGAAGCAGCTGTGTTGGAGCTCCCTATCAT
TGGTACTTTCACCAACTTTGCCACCATTTGGTTATGGAGAGGTGCCTACT
TAAACCAAGCTGTTAGTTGGAGAATGCAGTGCCTTATTGGGTTTGATTGG
GTTAAAGCACACGTTTTTGGTCGAGATACTTCAGAAATTTAAATGTGGAG
CAGACAATTAACTAGGCTATGCCGTCAACCCCCGATCAAGAAGGGAAGAC
AGCTAGTCCCTAGAAAAGAAGTTGTTATCAGATTTCAAAGTTACactaaa
caaaatttaacatacAGCTTGAAGTATATTTTGGGATTACTTGGAGGAAC
TTTGACAGGCGGTTTATctgtttatttgatttctaaCCATAATGTGGACG
TGGAAGCATCTCAACCAAAGAAAAAACTTGTGATACTTGGCTCTGGTTGG
GGTGCAGTCAGTCTCATCAAAAGTCTAAAACCTGATTTATATGACATCAA
AGTAGTTTCGCCCACAAATTATTTTCTATTCACACCTTTGCTACCATCTG
TTACTGTTGGCACTGTGGATGGACGTAGCCTTACAGAACCAATCAGAAAG
ATTTTATCGAAGAAACAAAAGGAGGGAAATTATGAATATTTTGAAGCCCA
TTGCATTGATGTTGATACTGAGAAAAATCAAGTTATTTGTGCTGATAAAT
CAGATATTCAAAGCGACAGCCCTGAGTTCAAGATTGACTATGACATTTTG
GTAGTGGCTGTTGGATCGAAAACAAACACGTACAACAATCCTGATATCAA
GAAATATTCTCATAAACTAAAAAATGTTCAACAAGCTCGAGAAGTCCGCA
AACATATTGTTGATTCTTTGGAAACTGCCATTTTGCCAGGTCAATGtgaa
gaagaaatgaaaaggatgttgagttttgttgTCGTTGGTGGTGGGCCTAC
AGGAGTTGAATTTGCTGGAGAATTGCGTGATTATCttgatgatttgaaaa
atgtttatccTCAACAAGTTATTGATAATATGTGCATAACTTTGGTGAAT
AGCCATTACAAAGTATTGAGTATGTATGACCAACAGATAAGCAATTTCAC
TGAACAGAAATTCAAATCAGACGGTATCAACACGATTGGTAATTCTTATG
TAGTTGGAATGGATCCAAAGAATATTAAAATCCAAAACAAGAAGACTAAA
GAGATAACAGTTTTACCGTATGGTTTATGTGTTTGGGCTGCTGGTATTGC
ACCTAGAGACATAACTAAGACGCTGATCAAAAGAATGCCTGCTCAAAACA
ACAGAAATGCATTGGTCACAGATGGCTACATGAAATTGAAAGGAAGCAAT
AATATTTTTGGTATCGGAGACTGTTCTACTGTCGAGTTTACTAAGCTAAT
GTATCAAGTTGAACAGTTATTCAAAGAAGCTGATCTTGATGGGACTGGTC
AGCTATCTCTCTCTGAATTCTCAGTATTTTTGGAGACAGCAAAGAAGAAA
TATCCTGAAATGACGCAACATTTGACCAAGTTACAAAAATCAGTTGATAA
GACATTCAGCTTGATGGATACTGACCATAATGAGCGATTAAGTCTTGAAG
AGTTTACTCTTTTCTTGAAGGATGTTGACAGCAAATTAAAAGCCTACCCT
GCTACAGCCCAAGTCGCTTCTCAACAAGGCAAATATCTCGGAAAACTTCT
CTCGGCACATTCTGAGATcactgaaaatgaagatttctcGGTTTGCAAAC
CCTTCGAATACAGTCATTTGGGGAGTTTTGCTTATGTTGGGGGAGAAGCA
GCTGTGTTGGAGCTCCCTATCATTGGTACTTTCACCAACTTTGCCACCAT
TTGGTTATGGAGAGGTGCCTACTTAAACCAAGCTGTTAGTTGGAGAATGC
AGTGCCTTATTGGGTTTGATTGGGTTAAAGCACACGTTTTTGGTCGAGAT
ACTTCAGAAATTTAAATGTGGAGCAGACAATTAACTAGGCTATGCCGTCA
ACCCCCGATCAAGAAGGGAAGACAGCTAGTCCCTAGAAAAGAAGTTGTTA
TCAGATTTCAAAGTTACactaaacaaaatttaacatacAGCTTGAAGTAT
ATTTTGGGATTACTTGGAGGAACTTTGACAGGCGGTTTATctgtttattt
gatttctaaCCATAATGTGGACGTGGAAGCATCTCAACCAAAGAAAAAAC
TTGTGATACTTGGCTCTGGTTGGGGTGCAGTCAGTCTCATCAAAAGTCTA
AAACCTGATTTATATGACATCAAAGTAGTTTCGCCCACAAATTATTTTCT
ATTCACACCTTTGCTACCATCTGTTACTGTTGGCACTGTGGATGGACGTA
GCCTTACAGAACCAATCAGAAAGATTTTATCGAAGAAACAAAAGGAGGGA
AATTATGAATATTTTGAAGCCCATTGCATTGATGTTGATACTGAGAAAAA
TCAAGTTATTTGTGCTGATAAATCAGATATTCAAAGCGACAGCCCTGAGT
TCAAGATTGACTATGACATTTTGGTAGTGGCTGTTGGATCGAAAACAAAC
ACGTACAACAATCCTGATATCAAGAAATATTCTCATAAACTAAAAAATGT
TCAACAAGCTCGAGAAGTCCGCAAACATATTGTTGATTCTTTGGAAACTG
CCATTTTGCCAGGTCAATGtgaagaagaaatgaaaaggatgttgagtttt
gttgTCGTTGGTGGTGGGCCTACAGGAGTTGAATTTGCTGGAGAATTGCG
TGATTATCttgatgatttgaaaaatgtttatccTCAACAAGTTATTGATA
ATATGTGCATAACTTTGGTGAATAGCCATTACAAAGTATTGAGTATGTAT
GACCAACAGATAAGCAATTTCACTGAACAGAAATTCAAATCAGACGGTAT
CAACACGATTGGTAATTCTTATGTAGTTGGAATGGATCCAAAGAATATTA
AAATCCAAAACAAGAAGACTAAAGAGATAACAGTTTTACCGTATGGTTTA
TGTGTTTGGGCTGCTGGTATTGCACCTAGAGACATAACTAAGACGCTGAT
CAAAAGAATGCCTGCTCAAAACAACAGAAATGCATTGGTCACAGATGGCT
ACATGAAATTGAAAGGAAGCAATAATATTTTTGGTATCGGAGACTGTTCT
ACTGTCGAGTTTACTAAGCTAATGTATCAAGTTGAACAGTTATTCAAAGA
AGCTGATCTTGATGGGACTGGTCAGCTATCTCTCTCTGAATTCTCAGTAT
TTTTGGAGACAGCAAAGAAGAAATATCCTGAAATGACGCAACATTTGACC
AAGTTACAAAAATCAGTTGATAAGACATTCAGCTTGATGGATACTGACCA
TAATGAGCGATTAAGTCTTGAAGAGTTTACTCTTTTCTTGAAGGATGTTG
ACAGCAAATTAAAAGCCTACCCTGCTACAGCCCAAGTCGCTTCTCAACAA
GGCAAATATCTCGGAAAACTTCTCTCGGCACATTCTGAGATcactgaaaa
tgaagatttctcGGTTTGCAAACCCTTCGAATACAGTCATTTGGGGAGTT
TTGCTTATGTTGGGGGAGAAGCAGCTGTGTTGGAGCTCCCTATCATTGGT
ACTTTCACCAACTTTGCCACCATTTGGTTATGGAGAGGTGCCTACTTAAA
CCAAGCTGTTAGTTGGAGAATGCAGTGCCTTATTGGGTTTGATTGGGTTA
AAGCACACGTTTTTGGTCGAGATACTTCAGAAATTTAAATGTGGAGCAGA
CAATTAACTAGGCTATGCCGTCAACCCCCGATCAAGAAGGGAAGACAGCT
AGTCCCTAGAAAAGAAGTTGTTATCAGATTTCAAAGTTACactaaacaaa
atttaacatacAGCTTGAAGTATATTTTGGGATTACTTGGAGGAACTTTG
ACAGGCGGTTTATctgtttatttgatttctaaCCATAATGTGGACGTGGA
AGCATCTCAACCAAAGAAAAAACTTGTGATACTTGGCTCTGGTTGGGGTG
CAGTCAGTCTCATCAAAAGTCTAAAACCTGATTTATATGACATCAAAGTA
GTTTCGCCCACAAATTATTTTCTATTCACACCTTTGCTACCATCTGTTAC
TGTTGGCACTGTGGATGGACGTAGCCTTACAGAACCAATCAGAAAGATTT
TATCGAAGAAACAAAAGGAGGGAAATTATGAATATTTTGAAGCCCATTGC
ATTGATGTTGATACTGAGAAAAATCAAGTTATTTGTGCTGATAAATCAGA
TATTCAAAGCGACAGCCCTGAGTTCAAGATTGACTATGACATTTTGGTAG
TGGCTGTTGGATCGAAAACAAACACGTACAACAATCCTGATATCAAGAAA
TATTCTCATAAACTAAAAAATGTTCAACAAGCTCGAGAAGTCCGCAAACA
TATTGTTGATTCTTTGGAAACTGCCATTTTGCCAGGTCAATGtgaagaag
aaatgaaaaggatgttgagttttgttgTCGTTGGTGGTGGGCCTACAGGA
GTTGAATTTGCTGGAGAATTGCGTGATTATCttgatgatttgaaaaatgt
ttatccTCAACAAGTTATTGATAATATGTGCATAACTTTGGTGAATAGCC
ATTACAAAGTATTGAGTATGTATGACCAACAGATAAGCAATTTCACTGAA
CAGAAATTCAAATCAGACGGTATCAACACGATTGGTAATTCTTATGTAGT
TGGAATGGATCCAAAGAATATTAAAATCCAAAACAAGAAGACTAAAGAGA
TAACAGTTTTACCGTATGGTTTATGTGTTTGGGCTGCTGGTATTGCACCT
AGAGACATAACTAAGACGCTGATCAAAAGAATGCCTGCTCAAAACAACAG
AAATGCATTGGTCACAGATGGCTACATGAAATTGAAAGGAAGCAATAATA
TTTTTGGTATCGGAGACTGTTCTACTGTCGAGTTTACTAAGCTAATGTAT
CAAGTTGAACAGTTATTCAAAGAAGCTGATCTTGATGGGACTGGTCAGCT
ATCTCTCTCTGAATTCTCAGTATTTTTGGAGACAGCAAAGAAGAAATATC
CTGAAATGACGCAACATTTGACCAAGTTACAAAAATCAGTTGATAAGACA
TTCAGCTTGATGGATACTGACCATAATGAGCGATTAAGTCTTGAAGAGTT
TACTCTTTTCTTGAAGGATGTTGACAGCAAATTAAAAGCCTACCCTGCTA
CAGCCCAAGTCGCTTCTCAACAAGGCAAATATCTCGGAAAACTTCTCTCG
GCACATTCTGAGATcactgaaaatgaagatttctcGGTTTGCAAACCCTT
CGAATACAGTCATTTGGGGAGTTTTGCTTATGTTGGGGGAGAAGCAGCTG
TGTTGGAGCTCCCTATCATTGGTACTTTCACCAACTTTGCCACCATTTGG
TTATGGAGAGGTGCCTACTTAAACCAAGCTGTTAGTTGGAGAATGCAGTG
CCTTATTGGGTTTGATTGGGTTAAAGCACACGTTTTTGGTCGAGATACTT
CAGAAATTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11823MSTRG.11823Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11823.1.p1MSTRG.11823.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11823.1.p1.exon1MSTRG.11823.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11823.1.p1.exon2MSTRG.11823.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11823.1.p1.exon3MSTRG.11823.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11823.1.p1.exon4MSTRG.11823.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11823.1.p1.exon5MSTRG.11823.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11823.1.p1.exon6MSTRG.11823.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11823.1.p1.exon7MSTRG.11823.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000087_pilongenomesc0000087_pilon:294592..300005 +