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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000087_pilon:275010..281424- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11822.1.p1 ID=MSTRG.11822.1.p1|Name=MSTRG.11822.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6415bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:275010..281424- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTGACTTATGGACTTTCACTGTTAGCGCGCCCTTTTTATTTTTATTTTA
TTTTTATTCCGACACCGATTGAGAACTAGAGAGCGCCCGTTGCCTAACGC
CCACCGCCCGATGGAACACGATATTTTGAGCGTCCTGATTGGTCAGAACA
TCGGTAAAATTCTGCAGAAAATTATGATGTCTCTCATAAAAACATTCTTT
TCTCTCACGCTGCCAAAGTGAACAGTACTTGCTTTCTTACTTTAATTTTG
GTTTTTACAATATCTTGCCATAAGCATGAGTAAACCACTTTCTGAGTCTG
AGGTCAACCTTCTAGAGCAAAGTTTGGGCTGGAAAGATGAGTGGTTGGAT
GATCACGAGAAGATTGTAAGTCTGAGTGATGAACGTGTTCCCATGTTTAC
CATTCAGATATTATTTCTTCTTAGGAAAATCTTACCCTCCACCACTGCTT
TGTTTAAGATTCTTTGTCTCCTGGTTCCCCAACAAGGTTTCTGTCTACCT
ACTGATGCGAGAGCGTTAGCACGAAAAATGAAAAAGCTCAATACAGAAAG
GACATCTTTGTTGAAGAGCAAAGGTGGCAAGGAAAAGTTGGAGGTAATTC
ATAGTGGTTCTTTCTTTGAATGGCTCAAAAAACATAAAGCCCCAACTGTT
TCAAGTACTTGCCCATCAAAAACAAGCGAGCAACTCCAAAGAGAGGAGGA
CTTTCAAAATCAAAAACAAAAATTGGAGCTTCTTTTAGAGGAGGAAAAGT
CCAAATCCAGACGTTTAGGTGACCTCATAAAAGAAGAAAAGTCAACCTCT
GAATTGTCAGCTAAGACAATTGACAATTTGAAGGGTGACAAAGTTCACCT
GAACAAGGTTATTGGTGGTTTAAAATCTTCGATTGCAAAATATCAATCTG
TAATTGCTGCACAAAAGCTCAACTCAGCACAACAGTCTTTCAAGGGCTGT
AATCATGACACTGGCCTTGGATTTATCACCATCACACGCTTTTGTGAAGG
GGAGCCCCGAATATTTGAGGGAATTAAATACACTAAGGATCTTGCATCCA
TGACTTTCAAATCAAATAATCAGCCAGCAATTTTTACTGCTATTTCAAGC
AAGCACTCTAACTCCACATTATGTGATAAACAATTGAACAACCGTGTTTC
TTTTTTGTTTAAGTTGCTTTGTCTGTTGTCTGGTTGTGCGCCTAATGTTT
TTTTAGGTAGAGAATGTGATGTGCAGGAGTTAAGTGTTCTTTTTGCTAAG
TTTTTGAAGAAGTATGGCAATCTTTTTTTTTCAGATTTTGTTCTCCCAAG
TGATTTTTTCCCAAAGTTGTCCCCTGCTCAGGCAGTTGATGTTAAGTCTC
TTCTCCGGTTGTCAATGGATGCCTTTCGTAAGCTTAGAATTGTGTTGAAG
AAGTGTCTTGGTTTTAACATCTTTCCATCTGAGGGTAAAATGCGAGACAT
GCAATCCCAACTTTTAACTTATTTAAAGAAAGCTGATGTTAATGTCTCTA
CCCAGACACTAGTGAAAGTTGGTCAAGAAAAAAAGCATGGGAACGTATAT
GTCCTCAGGTGTAGAGACCTTTCTGGGTATATGGAAAATGTTTTAAAGGA
ATATAAACTGAAAGCTGGGTTTGGACCAGATGATGCTCAAAAGAGAGTTG
ATCTGCTTTTCTCTGGTGACAAGGGAGGAGGGCTGGTTAAGTTTTATTTT
GAGGTAATCTGTGGCCAAACAAAGCTTTCTGTTTATGATGTCCATGTCTT
CAGCATGTATGAAGGGTCTGATTGTTATGAGAATTTGCATACTGTTTTTG
AACCTTTTCAGGTCGAAATTCGAAGGATTCAGGAAGATGATTTCAGGCTA
GATGGGCATCCTGTGAAGGTGTTACTAGGGGGAGACTTTCACTTTTTAGA
TGCAGTCCTTGGTCATCAAGGCTCATCTGCTACTTTCCCCAGTAGTAAGT
GGGATGTTAGTCTGAGTCATCTCAGAGAGCATGGGTCACGCCCACACACA
CCGGAAAACTGTGTTGACATCCAATTTAGAAATGTTGATGATGTAAATGC
CAATTATAGTGCAAATCTGGCTTTAAATGGTCAAAGTTGTGAGTTGAGAA
AGACTGGGAAGTTCCATTGTTGTTTTTTTGGTCCAATGATTTTTCCGATT
AAAACTCTTGAAAATGTTGTTCCGCCTGTTTTGCACATTATGTTGGGAAT
AGTGTTGAAATTGTTCAATCTTTTATTAGATCGTAGTCGTGACTTAGATA
GCTCAAAAGTAGGTAGCCCAGCCCACATAGAGAATATGCGACAGAAAGAA
AAGGCTGAGGAAGAGGCTCGCGTTACAATGGAAGCACTTGATAAAAAGAG
ACGTGAGTTGGGCAAAGAATTAGTTGACCTGTACAGTTGGAGAGAGCGTT
TTGATGCGGTTCTTGCTGGCAACATTAAGGAACTCCATTCTATTGCAAAA
GCTTTTGATAATTCTTGCAGCACCAAGAATCCAAAGTTTGAGAAATGTAC
AGGAATCAAGTGCTTCCTTTCTTGTTATGATAGTGATGTTTTTTGGGTTG
CGTGTGACGTGTGTAAGTGTTGGAAACACTGTATGTGCGAGCTGATTCCA
TCTTCAGAACAAGCTTACTATTCCAATGAAGTAGATTCTAAATACACTTG
CTTGACCTGTAGAGGCAAAGATGTTGATGACATCAGTGATTTATTCAAAG
ATGTCATCAATAAAATTGTCTGCAGACAGGAAAGCGCAGAGGCTTCATTT
CAAAGGTCAAGTCATACCTTAGCTATGCTTGAGGAAGAAACTGTCAAAAC
CATGGGTCCCATTGAAATTGACCTTCATCGGCGGCTAAATGAGATAAACG
TTGATCGTCAAGCTTTCCATGGTGAGGTCTTTGTCGGGAATCACTGCAAA
ATTGTACTTGCCAAACACAAGTACCTTTGTGAGTGTCTCGATGGAGATAA
AGTGGGGACACAGATTGAAGCAGTCCTTGAAATCTTTGCTAAACTCGTTC
CTCTTATTTTCACCAAAAAAGATCTTGATGAGGAAGAGATCACTGAATTA
ACAAATCTTTGTAATGAGTATGGTCGTGTCTTTCCTAAAAGTTTTCCTGC
CGAAAATCTCACAGTCAAAATGCATTCGTTGATTTTTAGTGTGCCACGTT
TCGTTTCTATTCATAAAACTATCGGCAGGTATAGTGAAGAGGAAGGGGAA
AGCTTACACAATCTGATTAACCAAGAATTGAGGCGTGTCTGTAGTATAAG
GTGTAAACCTCTTAAGCTGAAACTGGTTTTGGAAGGCGCAGCCTTACGTG
CAAAGGCTGACAGAACTCTACTAAAGCCTATTTCCCGGAAGTGTCAATCC
TGTCATAAGGGTTTTTATTTGCAAGGGGTTTGCCAATCATGTAATGCAAA
AAGATAGTAAATTGTAATTTGATCATTTTTTCATTTTGTTTCAGGCTACT
CCTTACGGAACATGTTGCTGTCAATGAATGTAAGATCTTTTAAACCACGT
ACAGTTGACATGGTGCTATTTTCATCAATTCTTGTTATCGTACCAAAGGT
GATGCAGGAGATATAATGGAATATGATAAAGCGATTGTGCAATAGCTATT
TTTCTGTCATGGGACTCTGTTTAAAGGTGAGATTAATATTTTTGTTTAAA
ACACGAGTACTTTGTATACAACACATGTAACATACATATAACCAGATATA
ACATCAAAAGGCACAGAATGCGAAAGCACGTGGTAAGTACGTGGATATAT
TTTGACCTTTAAAAATTTTGATATTTTTGACAACAACAAGTTTTTTTCAA
ACATTTTCTTTCGTACTTTACAGTAATTATGTGAACATGGTCTTAGAGCT
GACCTGTGTCAATGACCTGTGAACCTCCGTTTCGAACTAGCCGTTTGTGT
AGTGATGTAATATCTTTTATCAGATTTTCATTCTGATTCTATAATTGAAT
TTTTTTTGCATTGCTTTCACTTTTCTTTACCAAAATCTTCAAATTGGAGA
AAAATTAATGTTTGAAACTGTTCGACTTTGAATGAACTTTAAAAGAAAAA
TTTAATGATAACAACTCTTGTTTTTGAACAATTTTCATGCTGAATCCAAA
ATTTCAAACCAATATAGCTAAAAGGTGTCAAAATTAATATTTTCAAAGAA
GATTACTGAGCTAAAAACCCTCAATGAGTCAAAGTTTCCAATTATTACGT
TCAAAACAAATATTTTTTATATATACTTTTATCAGACACGCCATATTTTA
GAAAGGCAAGGCAGCGTCCGTTGGTGGCCAAAAAGGGCACTTTTCCAGTG
TTTTTCCACTAAAAAGGCTCTTTTTACCAATATTTTAATAGCTTCAAGAG
GGGCAGCGTCCGACAAGCGGACGCTTAAAGGGCATGAAAAATGGCCTGTC
AGATTTTCATTCTGATTCTATAATTGAATTTTTTTTTGCATTGCTTTCAC
TTTTTTTTACCAAAATCTTCAAATTGGAGAAAAATTAATGTTTGAAATTG
TTTGACTTTGAATGAACTTTAAAAGAAAAATTTAATGATAACAACGCTTG
TTTTTGAACAATTTTCATGCTGAATCCAAAATTTCAAACCAATATAGCTA
AAAGGTTTCAAAATTAATATTTTCAAAGAAGATTACTGAGCTAAAAACCC
TCAATGAGTCAAAGTTTCCAATTATTACGTTCAAAACAAATATAAAATTT
TCAGCAGTTTGTTAGGCAGTGTTGGATATTTTGGTTGATTTTCTATTTTT
TATCGTTTTTACTATTATTTTCTAGTTTTTGCTATTCATTTGTTTGTTTA
CTCAAACATTAAAAAGACTCAAAGCACTAAAAACAACAGACAATATGAAA
AAGCGTGTAAGAATATTACTAGTTGGTTAACCTGAGATAAATACATTTTG
ATAAGGATAACACTTGGGAATAGTCACTTGGATTGTTATGTACTTCTATT
TTGGAACAGTACAACATTATGTATTAAATTGGGAATAGTCACTTGGATTA
TTATGTACTTCTATTTTGGAACGGTACAACATTATGTATTAAATCGGGAA
TAGTCACTTGGATTGTTATGTACTTCTATTTTGGAACGGTACAACATTAT
GTATTAAATTGGGAACAGTCACTTGGATTGTTATGTACTTCTATTTTGGA
ACGGTACAACAATATGTATTAAATTGGGAATAGTCACTTGGATTGTTATG
TACTTCTATTTTGGAACAGTACAACATTATGTATCAAATTGGGAATAGTC
ACTTGGATTGTTATGTACTTCTATTTTGGAACAGTACAACATTATGTATT
AAATTGGGAATAGTCACTTGGATTGTTATGTACTTCTATTTTGGAACGGT
ACAACATTATATATTAAATTGGGAAAAGTCACTTGGATTGTTATGTACTT
CAATTTTGGAAGGGTACAACATTATGTATTAAATTGGGAGAAGTCACTTG
GATTGTTATGTACTTCTATTTTGGAACAGTACAACATTATGTATTAAATT
GGGAAAAGTCACTTGGATTGTTATGTACTTCTATTTTGGAACGGTACAAC
ATAATGTATTAAATTGGGAATAGTCACTTGGATTGTTATGTACTTCTATT
TTGGAATTATACAACATTATGTATTAAATTTGGAAGAGACTTGGATTGTT
ACGTACTTCTATTTTGGAATTGTTACTGGTAATCTTGAATCAATAATCAT
ATTGTCGTCACCTTCAGTCTTATTTAAAAAGAAACGAATGGCTTTGAACT
TTTTCATCGAAACATCCAACATTCGATACTGTTTTACACACTAGTAATTC
AGTAATTATATCGTTATCGTTTCATGCGACCTTACCATGGGCTGTATTTG
TTCATTGCAAGCATTGTCATCGTTATTCGATTATATTCATCCATTTTCGT
TATGGATTTGAGACGTACTTTTACAACACATTAAAATATCAATTTGTATC
GATTGCGATTTTAACGACATCTAAGAATCCGCTGTGACTGCTTCCACGTA
CATTTCCCAGCTCAAAAATGTGGTTTGGTTATATGACTTTTATGGAAACG
AAAATACTTGAAAATAGTTTTTATTATCTTGAAAGCCGGAAATTTGCCGG
ATATGAAAAAAGCCAAATTTGCACACATTAGTTGTAGTTTTGTACATTAT
AATCATTTTTTTTGAAATAGTTATCGAAATTTTGGAATTACAAATTACGT
ATGTTTGGAAATATCATTTTTAATTTCACAATACTGTATAAAGACTCGAG
TTTCTGATTTTTCCAATATACCTAATAATACGTTTACTGATTTTCGGCAA
GGATCAAATGAAAACTTTTTCTCTACTGGAGAAATGATACTTAATAGTTA
TCGCACAATCCAGAGTATAGTAGAATAAGGAATATATTCTTGAGTTCTAA
TTCTTCGTCATATCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000087_pilon:275010..281424- >MSTRG.11822.1.p1 ID=MSTRG.11822.1.p1|Name=MSTRG.11822.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3132bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:275010..281424- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTAAACCACTTTCTGAGTCTGAGGTCAACCTTCTAGAGCAAAGTTT
GGGCTGGAAAGATGAGTGGTTGGATGATCACGAGAAGATTGTAAGTCTGA
GTGATGAACGTGTTCCCATGTTTACCATTCAGATATTATTTCTTCTTAGG
AAAATCTTACCCTCCACCACTGCTTTGTTTAAGATTCTTTGTCTCCTGGT
TCCCCAACAAGGTTTCTGTCTACCTACTGATGCGAGAGCGTTAGCACGAA
AAATGAAAAAGCTCAATACAGAAAGGACATCTTTGTTGAAGAGCAAAGGT
GGCAAGGAAAAGTTGGAGGTAATTCATAGTGGTTCTTTCTTTGAATGGCT
CAAAAAACATAAAGCCCCAACTGTTTCAAGTACTTGCCCATCAAAAACAA
GCGAGCAACTCCAAAGAGAGGAGGACTTTCAAAATCAAAAACAAAAATTG
GAGCTTCTTTTAGAGGAGGAAAAGTCCAAATCCAGACGTTTAGGTGACCT
CATAAAAGAAGAAAAGTCAACCTCTGAATTGTCAGCTAAGACAATTGACA
ATTTGAAGGGTGACAAAGTTCACCTGAACAAGGTTATTGGTGGTTTAAAA
TCTTCGATTGCAAAATATCAATCTGTAATTGCTGCACAAAAGCTCAACTC
AGCACAACAGTCTTTCAAGGGCTGTAATCATGACACTGGCCTTGGATTTA
TCACCATCACACGCTTTTGTGAAGGGGAGCCCCGAATATTTGAGGGAATT
AAATACACTAAGGATCTTGCATCCATGACTTTCAAATCAAATAATCAGCC
AGCAATTTTTACTGCTATTTCAAGCAAGCACTCTAACTCCACATTATGTG
ATAAACAATTGAACAACCGTGTTTCTTTTTTGTTTAAGTTGCTTTGTCTG
TTGTCTGGTTGTGCGCCTAATGTTTTTTTAGGTAGAGAATGTGATGTGCA
GGAGTTAAGTGTTCTTTTTGCTAAGTTTTTGAAGAAGTATGGCAATCTTT
TTTTTTCAGATTTTGTTCTCCCAAGTGATTTTTTCCCAAAGTTGTCCCCT
GCTCAGGCAGTTGATGTTAAGTCTCTTCTCCGGTTGTCAATGGATGCCTT
TCGTAAGCTTAGAATTGTGTTGAAGAAGTGTCTTGGTTTTAACATCTTTC
CATCTGAGGGTAAAATGCGAGACATGCAATCCCAACTTTTAACTTATTTA
AAGAAAGCTGATGTTAATGTCTCTACCCAGACACTAGTGAAAGTTGGTCA
AGAAAAAAAGCATGGGAACGTATATGTCCTCAGGTGTAGAGACCTTTCTG
GGTATATGGAAAATGTTTTAAAGGAATATAAACTGAAAGCTGGGTTTGGA
CCAGATGATGCTCAAAAGAGAGTTGATCTGCTTTTCTCTGGTGACAAGGG
AGGAGGGCTGGTTAAGTTTTATTTTGAGGTAATCTGTGGCCAAACAAAGC
TTTCTGTTTATGATGTCCATGTCTTCAGCATGTATGAAGGGTCTGATTGT
TATGAGAATTTGCATACTGTTTTTGAACCTTTTCAGGTCGAAATTCGAAG
GATTCAGGAAGATGATTTCAGGCTAGATGGGCATCCTGTGAAGGTGTTAC
TAGGGGGAGACTTTCACTTTTTAGATGCAGTCCTTGGTCATCAAGGCTCA
TCTGCTACTTTCCCCAGTAGTAAGTGGGATGTTAGTCTGAGTCATCTCAG
AGAGCATGGGTCACGCCCACACACACCGGAAAACTGTGTTGACATCCAAT
TTAGAAATGTTGATGATGTAAATGCCAATTATAGTGCAAATCTGGCTTTA
AATGGTCAAAGTTGTGAGTTGAGAAAGACTGGGAAGTTCCATTGTTGTTT
TTTTGGTCCAATGATTTTTCCGATTAAAACTCTTGAAAATGTTGTTCCGC
CTGTTTTGCACATTATGTTGGGAATAGTGTTGAAATTGTTCAATCTTTTA
TTAGATCGTAGTCGTGACTTAGATAGCTCAAAAGTAGGTAGCCCAGCCCA
CATAGAGAATATGCGACAGAAAGAAAAGGCTGAGGAAGAGGCTCGCGTTA
CAATGGAAGCACTTGATAAAAAGAGACGTGAGTTGGGCAAAGAATTAGTT
GACCTGTACAGTTGGAGAGAGCGTTTTGATGCGGTTCTTGCTGGCAACAT
TAAGGAACTCCATTCTATTGCAAAAGCTTTTGATAATTCTTGCAGCACCA
AGAATCCAAAGTTTGAGAAATGTACAGGAATCAAGTGCTTCCTTTCTTGT
TATGATAGTGATGTTTTTTGGGTTGCGTGTGACGTGTGTAAGTGTTGGAA
ACACTGTATGTGCGAGCTGATTCCATCTTCAGAACAAGCTTACTATTCCA
ATGAAGTAGATTCTAAATACACTTGCTTGACCTGTAGAGGCAAAGATGTT
GATGACATCAGTGATTTATTCAAAGATGTCATCAATAAAATTGTCTGCAG
ACAGGAAAGCGCAGAGGCTTCATTTCAAAGGTCAAGTCATACCTTAGCTA
TGCTTGAGGAAGAAACTGTCAAAACCATGGGTCCCATTGAAATTGACCTT
CATCGGCGGCTAAATGAGATAAACGTTGATCGTCAAGCTTTCCATGGTGA
GGTCTTTGTCGGGAATCACTGCAAAATTGTACTTGCCAAACACAAGTACC
TTTGTGAGTGTCTCGATGGAGATAAAGTGGGGACACAGATTGAAGCAGTC
CTTGAAATCTTTGCTAAACTCGTTCCTCTTATTTTCACCAAAAAAGATCT
TGATGAGGAAGAGATCACTGAATTAACAAATCTTTGTAATGAGTATGGTC
GTGTCTTTCCTAAAAGTTTTCCTGCCGAAAATCTCACAGTCAAAATGCAT
TCGTTGATTTTTAGTGTGCCACGTTTCGTTTCTATTCATAAAACTATCGG
CAGGTATAGTGAAGAGGAAGGGGAAAGCTTACACAATCTGATTAACCAAG
AATTGAGGCGTGTCTGTAGTATAAGGTGTAAACCTCTTAAGCTGAAACTG
GTTTTGGAAGGCGCAGCCTTACGTGCAAAGGCTGACAGAACTCTACTAAA
GCCTATTTCCCGGAAGTGTCAATCCTGTCATAAGGGTTTTTATTTGCAAG
GGGTTTGCCAATCATGTAATGCAAAAAGATAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000087_pilon | genome | sc0000087_pilon:275010..281424 - |
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