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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000086_pilon:684182..696486+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11761.1.p1 ID=MSTRG.11761.1.p1|Name=MSTRG.11761.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12305bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:684182..696486+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGAGaatctactttcgttttcaaatcaTAATGGCCGCCAACCAGATACTG
AtacttttttccaatttcaacaTTCTACTAATtctgtgaagaaaattttg
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TTGTTAGTTATGtttgccgacctaaacaagctacttaggacggctttgcc
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aCTTCTGCTTGCAGAAATTGCAGggttttttttggggggaggaGGGGGCG
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AGGCAGGTCGAGGAAGTGATATCCTCagattttgctatttttgatatttt
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cagggttcaTGTTAAAATTGTCTACATTGCAGACCAGAATGTTCCgaggt
atatttttttattctgtAGACCATTTGCTAGAGTTCATGTTCTATATAAT
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TATTCCTCCTATAAAAAGAAATATGGCAAAACGCTTATCGTTTTTTGTAA
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GCtgacgaattttttttctcttttccgTAAAACCTGGCAAAActaactta
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ATTCAGCCCttgcttttttgtttgattCCCCCCACACAAAAAGAGTAAAG
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GTATTGTAGACAATTTTaacctgaactctgaaccctgaaccctggccctg
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ATGAGAGCAATTAGCTGGCTTGGCCACAAGTGtcacattgatatttttgt
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tGTGACACTTAAGAATATACCCTATAATGGCGGTTAAACATAGCTTTTCG
ctcaatttttagtattttcaatgagcttttaaagccaTGGCCCTAAGTTC
CACCactgaaacaaaccatttttagtTAGTGTTTTGGCCATATTACCCAA
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tcaaaaatctttgtaagtCATCAAGACTTAGCCAATTTTTCCCTTAGCAA
CGCAATGTTTTTCCCAAGCAACCAGATATCcagctttatcaaaattttcc
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ATCAAAGTCTAGGAcacaattttcactgaattttagggcaaattAGGGTC
TCAGGGaaaaaaaTAGCAGATCCCAACAGATAACGAGGAAGCAACTTTGG
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aatttcaccactaaGGAAAAACGGCAAGtctcttgtttttctttgttttc
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TTAGAACCATTTATGCTgggttattttaaaaagcatggtACCCCAATTGG
TGCACCAATTGGGGTACTTGTTGTGGTACTACTTTCTGTCCTTAATTTTT
GTTAAACGACACTTAATTTCATTATAATATGGTGCTACAATCTTTCATTG
ATGATTTGATAAAGTTAGATTTAAGATTGTCACAAAACTTTTGTCACAAT
TGCCGTTTTCTGACACAAAGTGAAAATCTACTGCTTTTTAATTAAATCAG
CCGCCATCTTGCCTTTCTCCTTTCCTACTacaaaaatttacagaccagaa
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CAGTAACCAACATCATATTATAGCTTAAAATCAGGAGAATTGTAAGGTAT
TGGCTAGTAACATCTTGTtaatatcttttctttttacatgtCAGAATGCT
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AATCTGTAGAGATGCTTTTAGAGCAAGAAAAGCagtgacattttcttttg
tcatttttatcactAAGTTGACACTTTCTAccaaaaattttgctgacatc
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tatatatataatataatgataatattcaaaaataaattgtgCAAAAATGG
TATTAGAGCACATGTGTTTGATTTTAGGATTGGGTAATACGACCAAAACA
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ctactaccaattcaatccaaaacataggtcaaacatcacGCGGGTGGCCA
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TGATTTCAGGCAATGATTTCTAGCCATGGCgtcagaaaaattttctcaaa
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TGGATGCGCTTAAACCTGATGCAATGAAATCGGATTTTAGAATGGCGGTG
CTCCTCTTGTCTTGAAAAACTTTGACTTATGCCGATATCTTACTTTATAT
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TATTTGGCGTACTGTGCGCCATTTCCACGCTGGCTGACCgaccaaagcag
caaaatttcaaaacaaatgaactacacagCTCCACTCggagctctactct
accattttagaatcttaTATTTGCTACCCAAGTATTTTTGGCAAGATACT
CGCCGACAGATTCGCGGGTTGATAAAACAGTGTGGTTGGATTACTGTATA
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AATTGCTGCTGGACGTGTAACCTCAAATTTGATAAtgatattaaacataa
ttatACATGACAACACTTTCATGATTAGGAAATATTCATTTTATAAActg
caaattttgtaaatcaggttttttttttattttaatgaccagtccAGTCA
GGTCATTCacttgagggctatgcatgttagcctccactgatgcaagttac
ctgatctcacggtacTTTATGGTACTACTAATCCAATTCATGGAATCCGA
TAATTGACCATTACTGATACACTGTTGGTGGTTGGAATCAGCTCTCctga
agttgaaataattaggGGTACAAACTATTGGTCACCTTCATCTGCTACAA
CATCCTATTATACTACATCCATTCCTGCAACTTTGTCCAAAGATTAGCAA
ATCTGCAGGGTTTATAGATTGAAATTTGTCGATTGCCTACATGATTTCTT
TTCTCCGTCCTTCAAACGCTGCAAACCCTTCAAATTTGGGACCAAAGATt
tgtaaatatgggttttttgTAGGGTTTGTAGGGTTTGCAGTGGCCAAAAG
TTTGTCCCCAAACAAATTCAAATTATGTCTGATACTCTTTTAACTCGTTT
TACAGGTACTAAAAAAGTATTCGCCATGGCGTCTTTGGAAGAAAGGGCTG
AGAGTAATTTGAAGATTCCATCGTGCGTTCTAATCACTGGGGCAAACAGT
GGATGCGGATTCGACTGCGCGCGACAACTGGCTTTAATTGATGGCGTCAA
CAAAATATATCTGGCATGTCGCAGCCTTGAAAAGTCTGAGAGTGCAAAGC
AACAGCTGGAAGAGCTCACGAACACAAGTAAATTTGAGGTTTTAGCTATA
GATGTTTCAAGCTTAGAGTCTGTTCGCGCTGGCGTGGAACAGTTGGAAAA
CGAGCCTGTGATTGATGGTGTTGTTTTGAATGCTGGTGGTGCCGGTGGAA
ATGTACCAAGTGAACTGATGTCAGCAGGGGTCACCGTGTCAATGGCAGCC
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GATTGCAGGGAAAGCAGCTACTGTAATTTATGCTGGTTCTGAATCTGCTA
GAGGTATCCCAGCTATGTCTCTCAAACCACCAAATCTTGAAACGGGCTCT
GTAGAAGAGTTCATAAGTATTTGCGACGGTTCGTTTTTTACTGAGAATGA
GGCTAAAAATCCCAAATATATGGGTGGTCATGCAAAGTTTGTTGGTGCTT
TATGGATATCGTCGATGGCTCGCAAGCATCCCGAGATTCGTTTCATTACC
GTCAGTCCAGGCGCAACAACTGGAACGAATGCTAGAAGAACTCTACCCTG
GTATAAACGCGCATTTGTTGGGGCTTTGGTGAATCTTCAATCTTTGGTAG
GATTGGCCCACTCTGTGGATATCGGGGCGAAACGTTACATTGATGCCTTG
CTGGATCATGAGAATTATCAGTCTGGTATCTTCTACGGCAGTAAGAAAGG
ACTCTCTGGTGAGATGGGCGACCAAGCAGTGTTTCTGGATTATTTTGCAA
ACGGGAGCTTTCAAGATAATGCTAACGAGGCTCTtcataatttcataaaa
actgCAGATTAAATTATTTGTGGACTtacctttaattttgatttatttta
ttttctagttttttacTGCCTTTGGCAGCTGTTATATTAAAACTACATTA
GAATAGATATATTCCTTTGGCACAATGATTATAAGAAATTATCTGGCCAG
CGGCAGATTCTCTCGATGATCATAACTCACCAAACACTTCTCTGGCATTT
CATTATGTAGCCTTTACACAAGGCACACTTTGCAATTCACACTCAACAGA
GAAATATAAATCATCTGTATACAGCACTGCAcacaaatattcttacagtG
GTAACCAACTAGTTTTACCAACTGCTTTATTCTTTCATGAAAATATATGA
AATCAATATAAATATTGATGTATAATAACAATCACAAAATAACTATTAGA
AAATGTCCCATGAAATCAAGAACTTTCCAATCACTTCCATGAAATGTCCA
CTTCTTTTCTCTGTTATCAAAAGATATTGATAAATATTGCTGAAATGAAt
cactaaattttcaaaatccagCTCCATATTGTATATTTAACATAGAGTTT
AGGAAGCAGACAGTCGTCTGTCAGTGTATTGAGGAATTGGTCCAGACCCA
ATTAATTGAATTTGTCGAACAAATCAACAACCGAACTAAGCGAACTCGAT
CGAACGATTTAAAGTTTAATTAGAAAATTTAATTGAACCTAATAGAACAC
TCaccatttttgaagcaataggagtttgattagtttggTCTGTaagaagt
tcgattagttcgatgatattaaatcctcatatatTCCCTCACTTGCAAAA
GCTTTACCGTGACTTGCTTTGCCATTTCAACAGTCCCGGGACTTAAGGTT
TAATGTACCCAGATATTTGTCTATCCAAAATAAATTCCTGTTGTGATTTT
GCCCC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000086_pilon:684182..696486+ >MSTRG.11761.1.p1 ID=MSTRG.11761.1.p1|Name=MSTRG.11761.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=987bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:684182..696486+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGTCTTTGGAAGAAAGGGCTGAGAGTAATTTGAAGATTCCATCGTG
CGTTCTAATCACTGGGGCAAACAGTGGATGCGGATTCGACTGCGCGCGAC
AACTGGCTTTAATTGATGGCGTCAACAAAATATATCTGGCATGTCGCAGC
CTTGAAAAGTCTGAGAGTGCAAAGCAACAGCTGGAAGAGCTCACGAACAC
AAGTAAATTTGAGGTTTTAGCTATAGATGTTTCAAGCTTAGAGTCTGTTC
GCGCTGGCGTGGAACAGTTGGAAAACGAGCCTGTGATTGATGGTGTTGTT
TTGAATGCTGGTGGTGCCGGTGGAAATGTACCAAGTGAACTGATGTCAGC
AGGGGTCACCGTGTCAATGGCAGCCAACTTATTGGGACACGTTCTGTTAA
TAGATGAATTGATTATTGCGGGAAAGATTGCAGGGAAAGCAGCTACTGTA
ATTTATGCTGGTTCTGAATCTGCTAGAGGTATCCCAGCTATGTCTCTCAA
ACCACCAAATCTTGAAACGGGCTCTGTAGAAGAGTTCATAAGTATTTGCG
ACGGTTCGTTTTTTACTGAGAATGAGGCTAAAAATCCCAAATATATGGGT
GGTCATGCAAAGTTTGTTGGTGCTTTATGGATATCGTCGATGGCTCGCAA
GCATCCCGAGATTCGTTTCATTACCGTCAGTCCAGGCGCAACAACTGGAA
CGAATGCTAGAAGAACTCTACCCTGGTATAAACGCGCATTTGTTGGGGCT
TTGGTGAATCTTCAATCTTTGGTAGGATTGGCCCACTCTGTGGATATCGG
GGCGAAACGTTACATTGATGCCTTGCTGGATCATGAGAATTATCAGTCTG
GTATCTTCTACGGCAGTAAGAAAGGACTCTCTGGTGAGATGGGCGACCAA
GCAGTGTTTCTGGATTATTTTGCAAACGGGAGCTTTCAAGATAATGCTAA
CGAGGCTCTtcataatttcataaaaactgCAGATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000086_pilon | genome | sc0000086_pilon:684182..696486 + |
|
