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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000086_pilon:670946..676997- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11760.1.p1 ID=MSTRG.11760.1.p1|Name=MSTRG.11760.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6052bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:670946..676997- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CTAACCTATATATACTATGTAATGTTCAATATAAAGTTATTCTAGTGGGC
CTTCCTTGAAAATGATTTTATTTTTCATTTTACTTTCTTCCTGTTGAGAT
TAGATTAATATTGAACCAAAACAAAAAAGTAATTTTGCAATTTAAAATGG
ATTTTCCATTGGAAGATGTCCAAGGAGGATCATCGGAAGAAGATACAGAA
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CTGAAACAGGTTCTTAAACATGTTCGATTACCATTATTAAATGCAAGATT
TCTGGTTGGTGTTGTAAGTGCTGATTTGTTAATAAAAAGTGATGAGAATT
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TACTTTATGCTGTTGGAGGACATGATGGTTCAAGCTATCTCAACTCTGTT
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GAATTGGAAACATATCTATCAAGCATAATAATAGGGTGGGGCGTCAAATG
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ATCTTATTTTTTTCACTTGCTGTACTAAATTTTATGAAGAAACAACAAAA
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TTTAAGCCAAATTTGGGTAGCAAAATGCTTTTTAAGGCCAATTTTGCAAG
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TTTTCAATAAATCATAATGGCGTCTTCAAAAATCGCTTTTTAGCAAAAAA
AAATCATATTTCTCAAAAAATAGCATTTTTTAAGGCAAGCTTCTACAAAC
TGAGTTTAAATGCTGACTGAAATTTTTTTTGTAGTGATAGTATACTGGAG
ATACTCCAGGGAAATCAAAATCATTTGCGTCTGGGATGGGTCTATGTCCG
CCATTATGGAAATAAAATTCCTGCTAAGAGCCATTTTTCAGGCAAAAACC
CAAATTTGGACTGAAAAAATCTCTAAAATGTCAATAGACATGGGTCCAAA
TTTTTTTGCAGTGATAGTATTCTGGAAATACTGCAGGAAAATCAAAGTCA
TCTGGGCTTGGGATTTGGGTATATCCACCATTTTGAAATTGAAATTCCTG
CTAAAACGCAATATTTCAATCAAAAATCCAAATTTTGACTCGAAAAATCT
TAAAAATGGCAATAGACATGAACCTAAAATCTTTTTGCAGTGATAGTCTT
CTGGAAGTACTCCAGGAAAATCAAAATCATTTGGGTTTAGGATTTGGGTA
TATCCGCCATTATCGAATTGAAATCTGTGCTAAAACTGGCTAAATTGCAA
CATTTAAAGCAAAAATCCCATATTGACTTAAAAACTGCTCTAATATGGCA
ATAGACATGAACCTAAAATCTTTTTGCAGTGATAGTATTCTGTAAATACT
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ACAAGTCTTGAAAATGGAAATGTAAGTGGGCTATAAAAGAATTGTTGAGT
GAAATGGGATTTTTTAAATAATTTATTTCAACTAGTATTTCTAAATTAAA
GGATTGTAAATTCACACTCTTTGCTTAATATAATATACAAAATATTTAGT
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AACAAATCTCAGACTGAAATGATTTTGTTTTTCCAGGAATATTCACAGAA
TACTATCACTTCATAAAAATTTGGGTCCATGTCTATTGTCATTTTAGAGC
AGTTTTTATTCAAAAACGGGGTTTTTGCTTGAAACGTTGTATTTTAGCCA
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AAAAATTGGATTTTTGATTGAAATATTGCGTTTTAACAGGAATTTCTATT
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TCCCAGACCCAAATGATTTTGATTTCCCTGGAGTATCTCCAGTATACTAT
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GCCTTAAAAAATGCTATTTTTTGAGAAATATGACTTTTTTTTGCTAAAAA
GCGATTTTTGAAGACGCCATTATGATTTTTTGAAAAAAGTGAAAAACTTG
AAATTCATTTTGCTTAAAGACTTTATTGAAGACTTCCATCTCTGAAAATT
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CTTAAAAAGCATTTTGCTACCCAAATTTGGCTTAAAACGGCTCGTATAGG
GCTCCAATGGGCACAATTTTCAAACCAATATGATTATTTTGTCGTTTCTT
CATAAAATTTAGTACAGCAAGTGAAAAAAATAAGATTTGCAATAGTTTTG
ACATATTTACAGGCCTGAAACGGCCAGAAAATGCCATTTTTTCCAATTTT
TGCCTGTAGTGCGAATCAGTACCCCCAGGGGGGTTCGGCCAATTTTGAAC
TTTTGACCTTAAAAATTGCGCAGAATGCCTCACAATAGGTTAAATTTTCA
TAAAAAAACACTACATCTTGAATTTTCTGACTTTGCCCCAAAAATGACTG
TTGACGCCCTACCCTAATAATAATTCTTATTTTATAAAGCTTAATTTCAT
TTCTTGATAGTTATTTGTATGCAGTTGGTGGGCAAGATGGTGTATCTTGT
TTGAATATTGTTGAACGCTACGATTCCAAAGCTAATTCTTGGTCACGTGT
CACTCCAATGAGCTGTAGGCGTCTAGGTATGTTTTGATGTGTAGAATTGG
TGTAGTTTTTATCGATTTCCAATCAGTAAAAATTATAATTGTTATTGATG
TTATAAGGGTATTTAAATATTTTGAATATTTTCAAATTTTTGAATTTTTA
GATATATTGAGGTATGTTAGCTATCATCCTTTTAGCTTTTCATTCACTGT
TCGATAGTTTTCAATTCAGAGAACTATTCTTCTTTTTGATTTTCAGGGGT
TGCGGTGTCAGTATTGGATGGATATCTATATGCGATTGGTGGATCAGACG
GAACATCGCCTTTAGCTTCAGTTGAAAGGTTTGATCCAGCAACTAGTACC
TGGACATCAGCCAAACAAATGGGAACCAAACGTAAACATTTAGGTGCTGC
TGTTTACCAAGGATGTATATATGCTGGTAAGAACAATCTTGAAAGTATGA
TCTTAAGATGCACCTGTCTTGTAACACTATTCGTTATTTCTAATACAAAA
TAAAGACTGTTTTCTAAGCTAATGTGTTGCTTCTTTCTAACTTAAAATCA
GTATTATATACTAGGTGGTGAATCCCTTAACTTTGTGTGCAACATGGGCT
GTCCAAAGTACTCATTAACCATGTCTGTTTGTTATTATTTTTTATGATTT
TAATTTTTTCCATTTATTCTAGTTGGTGGTAGAGATGATGCTACAGAGTT
GAGCAGTGCTGAGAAATATGACGCAAAAAGTAACACTTGGATTCCAGTTG
TGGCGCTGAACTCGAGAAGAAGTGGTGTTGGTTTATCAGTAGTTAATGGA
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CGAAATTTACGACCCTACTGGGAAACAGTGGAAATTGCAATGTGGTATGA
ATTACAGGAGGCTTGGAGGAGGTGTTGGAGTTGTGACGCTGCACCAATCT
GAAGGTTATACGTGGGGTTATTTTCAAGCAGGTTGTATACAGTAAATGCA
TCACATCCAACAGCATTTTCGGAGTTAGAAAATTTATTGTTACATTAAGA
ATTGCTTTTGTATTTAATTTTTCAGTTCAGAAAGCTCGACGACTTCATAA
AAGAAAAACCAATTTTAGGATCTTAGAATTCCAAAAAGTGTGATTTCTGT
ACTGAAGTTTCAAATTAATAAAGTTGGTATAAAACTGATACCTTGTCCTT
TC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000086_pilon:670946..676997- >MSTRG.11760.1.p1 ID=MSTRG.11760.1.p1|Name=MSTRG.11760.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=9570bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:670946..676997- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TTGGTGGTAGAGATGATGCTACAGAGTTGAGCAGTGCTGAGAAATATGAC GCAAAAAGTAACACTTGGATTCCAGTTGTGGCGCTGAACTCGAGAAGAAG TGGTGTTGGTTTATCAGTAGTTAATGGACAATTAATTGCAGTGGGTGGTT TTGATGGTACAACCTATTTGAAATCCATCGAAATTTACGACCCTACTGGG AAACAGTGGAAATTGCAATGTGGTATGAATTACAGGAGGCTTGGAGGAGG TGTTGGAGTTGTGACGCTGCACCAATCTGAAGGTTATACGTGGGGTTATT TTCAAGCAGGTTGTATACAGTAAGGGTTGCGGTGTCAGTATTGGATGGAT ATCTATATGCGATTGGTGGATCAGACGGAACATCGCCTTTAGCTTCAGTT GAAAGGTTTGATCCAGCAACTAGTACCTGGACATCAGCCAAACAAATGGG AACCAAACGTAAACATTTAGGTGCTGCTGTTTACCAAGGATGTATATATG CTGTTATTTGTATGCAGTTGGTGGGCAAGATGGTGTATCTTGTTTGAATA TTGTTGAACGCTACGATTCCAAAGCTAATTCTTGGTCACGTGTCACTCCA ATGAGCTGTAGGCGTCTAGGTATGAACCACAGAAAAATGAATGGCAAATG GTTTGCAGTATGAACAAACGTAGATGTGGCGTTGGTGTATCAGTTCTAGA TGAATTACTTTATGCTGTTGGAGGACATGATGGTTCAAGCTATCTCAACT CTGTTGAAAGATATGACCCCAAAACAAACCAGTGGAGCTCTGACGTTTCC CCAACAAGCACTTGTCGTACAAGTGTAGGCGTTGCTGTTCTTGATGGATG GATTTTCCATTGGAAGATGTCCAAGGAGGATCATCGGAAGAAGATACAGA ATCTTTGGAAAACAAATCAAGTACATCATGTGATGAGAATGAAGTTATGG ATTACTACCATCATCATAGAAGATCCAGTTCCATTATTCCTCTTAAATTA AACCAAACTAACATGGCCTTGAAGCCATACTTTCTTCATAAATCAGAAAA GTATCCAACCTCGATGCTGACCATGCTTGACAGTTTGCGTAAGAATAATG AGCTATGTGATGTTTTGATTTGTGTTGGATCGAAAGAGTTTAGATGTCAC AAAGTTGTTCTATCTGCTTGTTGCCCATATTTCAGAGCAATGTTTACCAG AGAAATGGCAGAAAGCAGGAAAAATGAGGTGACGATTAAAGATGTTGATG AAAAAGCAATGGAACAGTTAATTGATTTTGCATACACATCCATCATCAAA ATTGATGAGAATAACGTACAGACAATTCTTCCAGCAGCTTGCTTACTTCA ATTGAAAGAAATTCAAGACGCTTGTTGTGAGTTTTTGAAAAAACAATTAG ATCCTTCAAATTGTTTAGGAATAAAATCATTTGCAGATACACATGCTTGT ACAGAACTTTTGCATATTGCTGATTTATTCACATTACATAATTTCCAAGA TGTAAAAGACAGTGAAGAATTTATGCTTCTTCTGTTAGATCAACTTTGTG ATATCATCGCAAGTGATGAACTAAATGTTATTTCTGAAGAAGAGGTATTT TTATCGGTAATGAAATGGGTACGATTTAATATAAGTGACAGACGTTCAAG CCTGAAACAGGTTCTTAAACATGTTCGATTACCATTATTAAATGCAAGAT TTCTGGTTGGTGTTGTAAGTGCTGATTTGTTAATAAAAAGTGATGAGAAT TGCAGAGAACTTGTTGATGAAGCTAAGAACTACTTGCTTTTACCAGAAGA ACGACTTCTGAAGCAGGGTTCCAGGTTTAAAGCTAGACAACCCACTAAAA GAGGTGAAGTTTTGTTTGCAGTTGGTGGTTGGTGTACTGGGGATGCAATT AACAGTGTTGAAAGTTGGTGGTAGAGATGATGCTACAGAGTTGAGCAGTG CTGAGAAATATGACGCAAAAAGTAACACTTGGATTCCAGTTGTGGCGCTG AACTCGAGAAGAAGTGGTGTTGGTTTATCAGTAGTTAATGGACAATTAAT TGCAGTGGGTGGTTTTGATGGTACAACCTATTTGAAATCCATCGAAATTT ACGACCCTACTGGGAAACAGTGGAAATTGCAATGTGGTATGAATTACAGG AGGCTTGGAGGAGGTGTTGGAGTTGTGACGCTGCACCAATCTGAAGGTTA TACGTGGGGTTATTTTCAAGCAGGTTGTATACAGTAAGGGTTGCGGTGTC AGTATTGGATGGATATCTATATGCGATTGGTGGATCAGACGGAACATCGC CTTTAGCTTCAGTTGAAAGGTTTGATCCAGCAACTAGTACCTGGACATCA GCCAAACAAATGGGAACCAAACGTAAACATTTAGGTGCTGCTGTTTACCA AGGATGTATATATGCTGTTATTTGTATGCAGTTGGTGGGCAAGATGGTGT ATCTTGTTTGAATATTGTTGAACGCTACGATTCCAAAGCTAATTCTTGGT CACGTGTCACTCCAATGAGCTGTAGGCGTCTAGGTATGAACCACAGAAAA ATGAATGGCAAATGGTTTGCAGTATGAACAAACGTAGATGTGGCGTTGGT GTATCAGTTCTAGATGAATTACTTTATGCTGTTGGAGGACATGATGGTTC AAGCTATCTCAACTCTGTTGAAAGATATGACCCCAAAACAAACCAGTGGA GCTCTGACGTTTCCCCAACAAGCACTTGTCGTACAAGTGTAGGCGTTGCT GTTCTTGATGGATGGATTTTCCATTGGAAGATGTCCAAGGAGGATCATCG GAAGAAGATACAGAATCTTTGGAAAACAAATCAAGTACATCATGTGATGA GAATGAAGTTATGGATTACTACCATCATCATAGAAGATCCAGTTCCATTA TTCCTCTTAAATTAAACCAAACTAACATGGCCTTGAAGCCATACTTTCTT CATAAATCAGAAAAGTATCCAACCTCGATGCTGACCATGCTTGACAGTTT GCGTAAGAATAATGAGCTATGTGATGTTTTGATTTGTGTTGGATCGAAAG AGTTTAGATGTCACAAAGTTGTTCTATCTGCTTGTTGCCCATATTTCAGA GCAATGTTTACCAGAGAAATGGCAGAAAGCAGGAAAAATGAGGTGACGAT TAAAGATGTTGATGAAAAAGCAATGGAACAGTTAATTGATTTTGCATACA CATCCATCATCAAAATTGATGAGAATAACGTACAGACAATTCTTCCAGCA GCTTGCTTACTTCAATTGAAAGAAATTCAAGACGCTTGTTGTGAGTTTTT GAAAAAACAATTAGATCCTTCAAATTGTTTAGGAATAAAATCATTTGCAG ATACACATGCTTGTACAGAACTTTTGCATATTGCTGATTTATTCACATTA CATAATTTCCAAGATGTAAAAGACAGTGAAGAATTTATGCTTCTTCTGTT AGATCAACTTTGTGATATCATCGCAAGTGATGAACTAAATGTTATTTCTG AAGAAGAGGTATTTTTATCGGTAATGAAATGGGTACGATTTAATATAAGT GACAGACGTTCAAGCCTGAAACAGGTTCTTAAACATGTTCGATTACCATT ATTAAATGCAAGATTTCTGGTTGGTGTTGTAAGTGCTGATTTGTTAATAA AAAGTGATGAGAATTGCAGAGAACTTGTTGATGAAGCTAAGAACTACTTG CTTTTACCAGAAGAACGACTTCTGAAGCAGGGTTCCAGGTTTAAAGCTAG ACAACCCACTAAAAGAGGTGAAGTTTTGTTTGCAGTTGGTGGTTGGTGTA CTGGGGATGCAATTAACAGTGTTGAAAGTTGGTGGTAGAGATGATGCTAC AGAGTTGAGCAGTGCTGAGAAATATGACGCAAAAAGTAACACTTGGATTC CAGTTGTGGCGCTGAACTCGAGAAGAAGTGGTGTTGGTTTATCAGTAGTT AATGGACAATTAATTGCAGTGGGTGGTTTTGATGGTACAACCTATTTGAA ATCCATCGAAATTTACGACCCTACTGGGAAACAGTGGAAATTGCAATGTG GTATGAATTACAGGAGGCTTGGAGGAGGTGTTGGAGTTGTGACGCTGCAC CAATCTGAAGGTTATACGTGGGGTTATTTTCAAGCAGGTTGTATACAGTA AGGGTTGCGGTGTCAGTATTGGATGGATATCTATATGCGATTGGTGGATC AGACGGAACATCGCCTTTAGCTTCAGTTGAAAGGTTTGATCCAGCAACTA GTACCTGGACATCAGCCAAACAAATGGGAACCAAACGTAAACATTTAGGT GCTGCTGTTTACCAAGGATGTATATATGCTGTTATTTGTATGCAGTTGGT GGGCAAGATGGTGTATCTTGTTTGAATATTGTTGAACGCTACGATTCCAA AGCTAATTCTTGGTCACGTGTCACTCCAATGAGCTGTAGGCGTCTAGGTA 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TAGGCGTCTAGGTATGAACCACAGAAAAATGAATGGCAAATGGTTTGCAG TATGAACAAACGTAGATGTGGCGTTGGTGTATCAGTTCTAGATGAATTAC TTTATGCTGTTGGAGGACATGATGGTTCAAGCTATCTCAACTCTGTTGAA AGATATGACCCCAAAACAAACCAGTGGAGCTCTGACGTTTCCCCAACAAG CACTTGTCGTACAAGTGTAGGCGTTGCTGTTCTTGATGGATGGATTTTCC ATTGGAAGATGTCCAAGGAGGATCATCGGAAGAAGATACAGAATCTTTGG AAAACAAATCAAGTACATCATGTGATGAGAATGAAGTTATGGATTACTAC CATCATCATAGAAGATCCAGTTCCATTATTCCTCTTAAATTAAACCAAAC TAACATGGCCTTGAAGCCATACTTTCTTCATAAATCAGAAAAGTATCCAA CCTCGATGCTGACCATGCTTGACAGTTTGCGTAAGAATAATGAGCTATGT GATGTTTTGATTTGTGTTGGATCGAAAGAGTTTAGATGTCACAAAGTTGT TCTATCTGCTTGTTGCCCATATTTCAGAGCAATGTTTACCAGAGAAATGG CAGAAAGCAGGAAAAATGAGGTGACGATTAAAGATGTTGATGAAAAAGCA ATGGAACAGTTAATTGATTTTGCATACACATCCATCATCAAAATTGATGA GAATAACGTACAGACAATTCTTCCAGCAGCTTGCTTACTTCAATTGAAAG AAATTCAAGACGCTTGTTGTGAGTTTTTGAAAAAACAATTAGATCCTTCA AATTGTTTAGGAATAAAATCATTTGCAGATACACATGCTTGTACAGAACT TTTGCATATTGCTGATTTATTCACATTACATAATTTCCAAGATGTAAAAG ACAGTGAAGAATTTATGCTTCTTCTGTTAGATCAACTTTGTGATATCATC 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000086_pilon | genome | sc0000086_pilon:670946..676997 - |
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