MSTRG.11740.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11740.1.p1
Unique NameMSTRG.11740.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000086_pilon:403524..422099+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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>MSTRG.11740.1.p1 ID=MSTRG.11740.1.p1|Name=MSTRG.11740.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18576bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:403524..422099+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAGGACTCATAGCTAGtgaatttgtttttaataatCCCAACATTAAAGGA ACTTGTGGATGTGGTGAAAGCTTTCATTTATGATGTCGTTTACAGctgat gttgtttttgtttttaaaatgaaattggcGTTTCTAAAAGGTATACATAC ATGGTGATATGTACTTCACTGATTGGTAAACTCTTTCACTCGTCTACATC ACTTTGCATCATTTGTTTTTGACAATGTTTTTGGATGATAAACATGCTAT ATTAGTGATTGGAGAATTAGTTCACAATATTGAGAACAATTACTATCTAC ATGAATATTTCGACCGTATGATTGGATTATGTTGTTTCCTTAAGACTTAA CACCAAATGCATCCTAAGGCTTAAACTCATTTAGATGCTTAAAGTATAAG GTTTGTGTTTGGCTTTAAGCTGGAGAAGCTAAattgattttggatttttg acttttaataaacACTTGCCCAATCAATAAACATACGAgctaaaaacttc ttttttaacCGACCAATAAATTTCGC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000086_pilon:403524..422099+

>MSTRG.11740.1.p1 ID=MSTRG.11740.1.p1|Name=MSTRG.11740.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1572bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:403524..422099+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGCCAGAGCTGCTGCTACTGCAACTGTTAGAGCTGTAAAACCTGG
GAAATTCAGAGCAAGACGAGCTGCAATAACACTGACGTCAAGTGCTGTTA
ACAGAGTCAAAGAATTATTATCTGAAAGTCCTGAATCGaTTGGTCTACGA
ATAGGAGTAAAAGAAAGAGGCTGTAATGGACTTTCGTACACACTAGATTA
TGTGACAGAGAAAAAGAAGTTTGACGAAATCGTCAACCAAGATGGTGTTA
AGATTCTGATTGATTCGAAAGCCCAATTATCATTGCTCGGTACAGAAATG
GACTTTATAGAAGGACTCATAGCTAGtgaatttgtttttaataatCCCAA
CATTAAAGGAACTTGTGGATGTGGTGAAAGCTTTCATTTATGAATGGCGG
CCAGAGCTGCTGCTACTGCAACTGTTAGAGCTGTAAAACCTGGGAAATTC
AGAGCAAGACGAGCTGCAATAACACTGACGTCAAGTGCTGTTAACAGAGT
CAAAGAATTATTATCTGAAAGTCCTGAATCGaTTGGTCTACGAATAGGAG
TAAAAGAAAGAGGCTGTAATGGACTTTCGTACACACTAGATTATGTGACA
GAGAAAAAGAAGTTTGACGAAATCGTCAACCAAGATGGTGTTAAGATTCT
GATTGATTCGAAAGCCCAATTATCATTGCTCGGTACAGAAATGGACTTTA
TAGAAGGACTCATAGCTAGtgaatttgtttttaataatCCCAACATTAAA
GGAACTTGTGGATGTGGTGAAAGCTTTCATTTATGAATGGCGGCCAGAGC
TGCTGCTACTGCAACTGTTAGAGCTGTAAAACCTGGGAAATTCAGAGCAA
GACGAGCTGCAATAACACTGACGTCAAGTGCTGTTAACAGAGTCAAAGAA
TTATTATCTGAAAGTCCTGAATCGaTTGGTCTACGAATAGGAGTAAAAGA
AAGAGGCTGTAATGGACTTTCGTACACACTAGATTATGTGACAGAGAAAA
AGAAGTTTGACGAAATCGTCAACCAAGATGGTGTTAAGATTCTGATTGAT
TCGAAAGCCCAATTATCATTGCTCGGTACAGAAATGGACTTTATAGAAGG
ACTCATAGCTAGtgaatttgtttttaataatCCCAACATTAAAGGAACTT
GTGGATGTGGTGAAAGCTTTCATTTATGAATGGCGGCCAGAGCTGCTGCT
ACTGCAACTGTTAGAGCTGTAAAACCTGGGAAATTCAGAGCAAGACGAGC
TGCAATAACACTGACGTCAAGTGCTGTTAACAGAGTCAAAGAATTATTAT
CTGAAAGTCCTGAATCGaTTGGTCTACGAATAGGAGTAAAAGAAAGAGGC
TGTAATGGACTTTCGTACACACTAGATTATGTGACAGAGAAAAAGAAGTT
TGACGAAATCGTCAACCAAGATGGTGTTAAGATTCTGATTGATTCGAAAG
CCCAATTATCATTGCTCGGTACAGAAATGGACTTTATAGAAGGACTCATA
GCTAGtgaatttgtttttaataatCCCAACATTAAAGGAACTTGTGGATG
TGGTGAAAGCTTTCATTTATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11740MSTRG.11740Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11740.1.p1MSTRG.11740.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11740.1.p1.exon1MSTRG.11740.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11740.1.p1.exon2MSTRG.11740.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11740.1.p1.exon3MSTRG.11740.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11740.1.p1.exon4MSTRG.11740.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000086_pilongenomesc0000086_pilon:403524..422099 +