MSTRG.11722.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11722.1.p1
Unique NameMSTRG.11722.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000086_pilon:161879..179573-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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>MSTRG.11722.1.p1 ID=MSTRG.11722.1.p1|Name=MSTRG.11722.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17695bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:161879..179573- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000086_pilon:161879..179573-

>MSTRG.11722.1.p1 ID=MSTRG.11722.1.p1|Name=MSTRG.11722.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7077bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:161879..179573- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGATACGTCAGGTGATATGGTTATGGTTCAAGTGGTGTACGATGAAGAG
GGTACTGCACCAAGAGTCGTCTTCAGTAACTCAAGAAGGTGAACAACGAT
TATGTTCAAGAATCAATGATAAGAAAGCCAACGCCAAACGAAGCAAACGG
TTTCGAGAAAGTGTAACTTTACGACTTCAACGACAACCTAGAGCACCAGA
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TCGAATTGTATGAAGTGGTCAGAAAAGTATCAAACAAGCTGGAGTAAATT
AGCCGGACAGATGATGGTGTTTACTGTGACTTGCAACAAAAACACATATC
CAGTATTCTTTCAAATATTTGGTAGCCAAACAGATGTTTTTGATTTTTTT
GCTATTTACAATTCTGCCAACACTGGATACAACTACATTAATTGAACGTG
GTAATCAGAAAGACAATTATGTTACACGCTTTAAAAGCACTGATGAAGCT
TGTAGACATACCACATGTTACTCTTATGCAGCTGGATGTGCGATGTATGG
TTCTCTACCAGATTGCTGCTTTTGTGTTTGTACAGCAGATTTCACATTTC
TAAGCTATAGTGATGGATGTGTATCGCAAGGTTATATATACAGATCTTTC
AACATTAAAGGATTCACAGCATGGCAAATTCAATTTGTCAATCATCATGG
ACCAAGAATACCAACTCTTTTCAACCTTCAATCATTCGAACAATACATGT
TCAATATATATAATATACATAATGAAGATAGTTGTAAAGCAGGACCTATC
TATTTTGTGGATAATGAAGGAAACATGAAGTCTTATCATCAAAATTATTG
TCAAGTTTTACTCAGAGTATTGACTGTTATCAGTAATGGCAAAGAAATGT
TGTTGTTTAAGGTGATACGTCAGGTGATATGGTTATGGTTCAAGTGGTGT
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TGAACAACGATTATGTTCAAGAATCAATGATAAGAAAGCCAACGCCAAAC
GAAGCAAACGGTTTCGAGAAAGTGTAACTTTACGACTTCAACGACAACCT
AGAGCACCAGAAGCCTGTCGACAAGCAAAATATCATTGTTATCGTTCTTT
GTGTGTTCGGTGCTGTTGGCTTGCTTATATTCATCGCTAAGTTGTATTGC
TTTTTCAAGAAGAATAAAAAGTTCTCCAGCAGCCATTGATACAAGATTAG
AGGAAAAAAAATCGAATTGTATGAAGTGGTCAGAAAAGTATCAAACAAGC
TGGAGTAAATTAGCCGGACAGATGATGGTGTTTACTGTGACTTGCAACAA
AAACACATATCCAGTATTCTTTCAAATATTTGGTAGCCAAACAGATGTTT
TTGATTTTTTTGCTATTTACAATTCTGCCAACACTGGATACAACTACATT
AATTGAACGTGGTAATCAGAAAGACAATTATGTTACACGCTTTAAAAGCA
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GCGATGTATGGTTCTCTACCAGATTGCTGCTTTTGTGTTTGTACAGCAGA
TTTCACATTTCTAAGCTATAGTGATGGATGTGTATCGCAAGGTTATATAT
ACAGATCTTTCAACATTAAAGGATTCACAGCATGGCAAATTCAATTTGTC
AATCATCATGGACCAAGAATACCAACTCTTTTCAACCTTCAATCATTCGA
ACAATACATGTTCAATATATATAATATACATAATGAAGATAGTTGTAAAG
CAGGACCTATCTATTTTGTGGATAATGAAGGAAACATGAAGTCTTATCAT
CAAAATTATTGTCAAGTTTTACTCAGAGTATTGACTGTTATCAGTAATGG
CAAAGAAATGTTGTTGTTTAAGGTGATACGTCAGGTGATATGGTTATGGT
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CAACGCCAAACGAAGCAAACGGTTTCGAGAAAGTGTAACTTTACGACTTC
AACGACAACCTAGAGCACCAGAAGCCTGTCGACAAGCAAAATATCATTGT
TATCGTTCTTTGTGTGTTCGGTGCTGTTGGCTTGCTTATATTCATCGCTA
AGTTGTATTGCTTTTTCAAGAAGAATAAAAAGTTCTCCAGCAGCCATTGA
TACAAGATTAGAGGAAAAAAAATCGAATTGTATGAAGTGGTCAGAAAAGT
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ACTTGCAACAAAAACACATATCCAGTATTCTTTCAAATATTTGGTAGCCA
AACAGATGTTTTTGATTTTTTTGCTATTTACAATTCTGCCAACACTGGAT
ACAACTACATTAATTGAACGTGGTAATCAGAAAGACAATTATGTTACACG
CTTTAAAAGCACTGATGAAGCTTGTAGACATACCACATGTTACTCTTATG
CAGCTGGATGTGCGATGTATGGTTCTCTACCAGATTGCTGCTTTTGTGTT
TGTACAGCAGATTTCACATTTCTAAGCTATAGTGATGGATGTGTATCGCA
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TTCAATTTGTCAATCATCATGGACCAAGAATACCAACTCTTTTCAACCTT
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AGTCTTATCATCAAAATTATTGTCAAGTTTTACTCAGAGTATTGACTGTT
ATCAGTAATGGCAAAGAAATGTTGTTGTTTAAGGTGATACGTCAGGTGAT
ATGGTTATGGTTCAAGTGGTGTACGATGAAGAGGGTACTGCACCAAGAGT
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GATAAGAAAGCCAACGCCAAACGAAGCAAACGGTTTCGAGAAAGTGTAAC
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AATATCATTGTTATCGTTCTTTGTGTGTTCGGTGCTGTTGGCTTGCTTAT
ATTCATCGCTAAGTTGTATTGCTTTTTCAAGAAGAATAAAAAGTTCTCCA
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GTCAGAAAAGTATCAAACAAGCTGGAGTAAATTAGCCGGACAGATGATGG
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TACAATTCTGCCAACACTGGATACAACTACATTAATTGAACGTGGTAATC
AGAAAGACAATTATGTTACACGCTTTAAAAGCACTGATGAAGCTTGTAGA
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AAGAAGAATAAAAAGTTCTCCAGCAGCCATTGATACAAGATTAGAGGAAA
AAAAATCGAATTGTATGAAGTGGTCAGAAAAGTATCAAACAAGCTGGAGT
AAATTAGCCGGACAGATGATGGTGTTTACTGTGACTTGCAACAAAAACAC
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TTTTTGCTATTTACAATTCTGCCAACACTGGATACAACTACATTAATTGA
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AAGCTTGTAGACATACCACATGTTACTCTTATGCAGCTGGATGTGCGATG
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ATTTCTAAGCTATAGTGATGGATGTGTATCGCAAGGTTATATATACAGAT
CTTTCAACATTAAAGGATTCACAGCATGGCAAATTCAATTTGTCAATCAT
CATGGACCAAGAATACCAACTCTTTTCAACCTTCAATCATTCGAACAATA
CATGTTCAATATATATAATATACATAATGAAGATAGTTGTAAAGCAGGAC
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TCTTTGTGTGTTCGGTGCTGTTGGCTTGCTTATATTCATCGCTAAGTTGT
ATTGCTTTTTCAAGAAGAATAAAAAGTTCTCCAGCAGCCATTGATACAAG
ATTAGAGGAAAAAAAATCGAATTGTATGAAGTGGTCAGAAAAGTATCAAA
CAAGCTGGAGTAAATTAGCCGGACAGATGATGGTGTTTACTGTGACTTGC
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AAGCACTGATGAAGCTTGTAGACATACCACATGTTACTCTTATGCAGCTG
GATGTGCGATGTATGGTTCTCTACCAGATTGCTGCTTTTGTGTTTGTACA
GCAGATTTCACATTTCTAAGCTATAGTGATGGATGTGTATCGCAAGGTTA
TATATACAGATCTTTCAACATTAAAGGATTCACAGCATGGCAAATTCAAT
TTGTCAATCATCATGGACCAAGAATACCAACTCTTTTCAACCTTCAATCA
TTCGAACAATACATGTTCAATATATATAATATACATAATGAAGATAGTTG
TAAAGCAGGACCTATCTATTTTGTGGATAATGAAGGAAACATGAAGTCTT
ATCATCAAAATTATTGTCAAGTTTTACTCAGAGTATTGACTGTTATCAGT
AATGGCAAAGAAATGTTGTTGTTTAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11722MSTRG.11722Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11722.1.p1MSTRG.11722.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11722.1.p1.exon8MSTRG.11722.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11722.1.p1.exon7MSTRG.11722.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11722.1.p1.exon6MSTRG.11722.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11722.1.p1.exon5MSTRG.11722.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.11722.1.p1.exon3MSTRG.11722.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11722.1.p1.exon2MSTRG.11722.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11722.1.p1.exon1MSTRG.11722.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000086_pilongenomesc0000086_pilon:161879..179573 -