MSTRG.11702.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11702.3.p1
Unique NameMSTRG.11702.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000085_pilon:1208116..1258581-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11702.3.p1 ID=MSTRG.11702.3.p1|Name=MSTRG.11702.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=50466bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:1208116..1258581- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000085_pilon:1208116..1258581-

>MSTRG.11702.3.p1 ID=MSTRG.11702.3.p1|Name=MSTRG.11702.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3540bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:1208116..1258581- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CAAGGCTCAGATAGGGTGCAGCTCCCGCTGACGACGAAGAAAAACAACTC
CAAGAAAACACAGTGATGAATACCGAACCTACTAATATGTCAACAGACAC
AGCAGATCGCTTTACCTCTAAATTTCGACAACAACGCCAGACAGGTGCTG
GTGGTGGAACACGAGATAGGAGACGCGTCTTTGAAAGTGGAAACGATGAT
ACAACTAAGAACAGTGTAAGCTCATCTGGTGTAGCTGGTAGATATAGAAG
TACTGGTGATAGGGGTGAAAAGACTGAAACCTCATCGGTATCCTCACGAC
TTAGTAAACTAAATACAAATGATGATAAAGAGGATGATACTGAGAAAAGT
TCAACAGAAAATAAACATCAAGATGAAGAAGATGCGGAAGAACAAGCATC
TTCTCGCAAGTCACATCGAAAGGCTGGAGGTGCAAGCGCTAAATCGGGAC
AAAAACGACGAGATAGAAAAAATTTAAGGGAAAAACGACGATCAACTGGT
GTTGTTATAATGCCTGGGCAACCGGAAATCGAAGCTCTACAAAAAGATAA
CCAACGATTGAAAGACGAGAATAGCGCCCTGTTACGTGTGGTCGGCAGTC
TATCTGGACCTCGTAAATAGGACGGATAGCGACTTGACAAAGCAGATCGA
AGCATACGAATCTTCAATCGAAGAATGGAAAGACGAACTCGCCAAAGCTA
AACGAAGTCAAGGCTCAGATAGGGTGCAGCTCCCGCTGACGACGAAGAAA
AACAACTCCAAGAAAACACAGTGATGAATACCGAACCTACTAATATGTCA
ACAGACACAGCAGATCGCTTTACCTCTAAATTTCGACAACAACGCCAGAC
AGGTGCTGGTGGTGGAACACGAGATAGGAGACGCGTCTTTGAAAGTGGAA
ACGATGATACAACTAAGAACAGTGTAAGCTCATCTGGTGTAGCTGGTAGA
TATAGAAGTACTGGTGATAGGGGTGAAAAGACTGAAACCTCATCGGTATC
CTCACGACTTAGTAAACTAAATACAAATGATGATAAAGAGGATGATACTG
AGAAAAGTTCAACAGAAAATAAACATCAAGATGAAGAAGATGCGGAAGAA
CAAGCATCTTCTCGCAAGTCACATCGAAAGGCTGGAGGTGCAAGCGCTAA
ATCGGGACAAAAACGACGAGATAGAAAAAATTTAAGGGAAAAACGACGAT
CAACTGGTGTTGTTATAATGCCTGGGCAACCGGAAATCGAAGCTCTACAA
AAAGATAACCAACGATTGAAAGACGAGAATAGCGCCCTGTTACGTGTGGT
CGGCAGTCTATCTGGACCTCGTAAATAGGACGGATAGCGACTTGACAAAG
CAGATCGAAGCATACGAATCTTCAATCGAAGAATGGAAAGACGAACTCGC
CAAAGCTAAACGAAGTCAAGGCTCAGATAGGGTGCAGCTCCCGCTGACGA
CGAAGAAAAACAACTCCAAGAAAACACAGTGATGAATACCGAACCTACTA
ATATGTCAACAGACACAGCAGATCGCTTTACCTCTAAATTTCGACAACAA
CGCCAGACAGGTGCTGGTGGTGGAACACGAGATAGGAGACGCGTCTTTGA
AAGTGGAAACGATGATACAACTAAGAACAGTGTAAGCTCATCTGGTGTAG
CTGGTAGATATAGAAGTACTGGTGATAGGGGTGAAAAGACTGAAACCTCA
TCGGTATCCTCACGACTTAGTAAACTAAATACAAATGATGATAAAGAGGA
TGATACTGAGAAAAGTTCAACAGAAAATAAACATCAAGATGAAGAAGATG
CGGAAGAACAAGCATCTTCTCGCAAGTCACATCGAAAGGCTGGAGGTGCA
AGCGCTAAATCGGGACAAAAACGACGAGATAGAAAAAATTTAAGGGAAAA
ACGACGATCAACTGGTGTTGTTATAATGCCTGGGCAACCG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11702MSTRG.11702Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11702.3.p1MSTRG.11702.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11702.3.p1.exon5MSTRG.11702.3.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11702.3.p1.exon4MSTRG.11702.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11702.3.p1.exon3MSTRG.11702.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11702.3.p1.exon2MSTRG.11702.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11702.3.p1.exon1MSTRG.11702.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000085_pilongenomesc0000085_pilon:1208116..1258581 -