MSTRG.11697.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11697.2.p1
Unique NameMSTRG.11697.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000085_pilon:1103357..1136796-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11697.2.p1 ID=MSTRG.11697.2.p1|Name=MSTRG.11697.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=33440bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:1103357..1136796- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TATTCCGGGGTATTCGAAAGAGGCGTTCTATTTTGCCGCCCTTACACGCC TTACCGCCCAATTTCTTAGAATCGAATGTTTAAAACGAAAGTAATTTTTC CAAGATGGTAGACGAGTAATGGAAAAATCTTTTTCGTTCAGAACACTGCG ATTCTCAAGATTCAAAGTCATTTCTAGTTTATCTTGAATAGTATATACTC AACTTACCCTTAACACTCACAAAAGAAGGTAAGATATATTTCAAGTGTTA GTCATATCAGCTGGGATCTCTTTTTTACATCAGAAAGTTTGTTGCTTTTT ATTCCAGGGGGGATGTCAATCGATCAAAACAAACTGTTAGGGCCATTTTT ATTTTGCTGCAACCTTTGCTAAAATAGCGGAATGATTCCAGAAAAGCATC AAGGTACTACTCGAACACTTGTCAAACCACTCAAACACACATCAAACAAC ATCAAACTGTATTTTTAATCGAACTAAACGAACTAATCAAGATATTTCCA TGATATCGTCAACTGCTCTAACTTGGAGCTATCTGACAAAACATGGGACG ATAATTCGGCCACCATTTCAACAACCCACGGCATGGCCCGAACATGTTCG GGCCTGTTCGGACCATGCTCGGGCCACAAAAAAGTATTATTGAATCGGCC CGAACATTTTGTTCGGACCATGTTCGGGCCATGTATTTACAATTGATTTG AATTTTATTTACCTTTCCTGGTTTATCATCATCCATTGTTAAATAATTTC ATTAGACAAATTCAAATTCCAAATACCAGTTTGATTCACAAAGTTGTATA ACAGTACAAAAAACGATCCAGAAAAATTCTGCTTCGAATAGGAGAAGACC ATGAGAAAAGGGAACGGGATAAAGAATAAAAAGAAGACCATATTATGTAA GATTCAAATCATTCTTTTTAATAATTTTCCTAACTTAATTGGAAAATAGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000085_pilon:1103357..1136796-

>MSTRG.11697.2.p1 ID=MSTRG.11697.2.p1|Name=MSTRG.11697.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=15015bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:1103357..1136796- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGAAAAGTGGGGACGTATTGTCGACATTTTATCAAATGAGCTCCAGATGA
AGAAGAAGAAGATCCAAAATGGCCAGAAGACAGATGAATGAGAATACATC
CGGCATCGTAGAAACTGTCGATCAAGAGACGATAATGGGAGATATTGAGG
TCAAGGAGCCTGGTATTCACGATGAGGGCAAAGAAATTCCATTTCCCGAG
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CTTCAAGCTAGCAAGAGAACAACAAATCCCTATTGCTATGGTAACATCCG
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ATATATCAGAAGAGCAACTATCAAAAGGCACTAGAAGAATTCAAGCCCCA
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TCACCATTGCTACAGTACAGATGGTGGAGGCTTTTGCGCTTATGCTGATA
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TATTGGCTGTGGTCCATACTCAAGACTATCTAGATAGCCTAAAGCAATTT
ACAGTCGTTGATCTACAAGTTGCCAGATGATAAACTACCTATTATATACG
ATGACATTTACAATATCACTTTCATGGGCCTACAAAAGCTCCATCCGTTC
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GATGAAGAAGAAGAAGATCCAAAATGGCCAGAAGACAGATGAATGAGAAT
ACATCCGGCATCGTAGAAACTGTCGATCAAGAGACGATAATGGGAGATAT
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GTAAAGCTTTTCAAAAATTACGTTCGATGGTTTGCAAACCTCGTGAAGCC
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ATTATATACGATGACATTTACAATATCACTTTCATGGGCCTACAAAAGCT
CCATCCGTTCGATTCAGAAAAGTGGGGACGTATTGTCGACATTTTATCAA
ATGAGCTCCAGATGAAGAAGAAGAAGATCCAAAATGGCCAGAAGACAGAT
GAATGAGAATACATCCGGCATCGTAGAAACTGTCGATCAAGAGACGATAA
TGGGAGATATTGAGGTCAAGGAGCCTGGTATTCACGATGAGGGCAAAGAA
ATTCCATTTCCCGAGTACAGCGTTCAACAGCTAATGTGATTGCCAGATCC
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GCGAGATGAGTTCGTCTTCAAGCTAGCAAGAGAACAACAAATCCCTATTG
CTATGGTAACATCCGGTGGTTATCAGGAACTGACATTCTGGAGGGAGATC
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AGTGCCCCATAGTACCTGGATTAAAAACAGATCCTTATATGGAGGTGGTC
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ATCATGGACGTATATAACCGTTCTATTTATCCTCAAGATGAGTACGCTAA
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GACGCGCATCAAGCAGCATACGCAGCGTATAGACGAGGCTGGTCGATCAA
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GCGCTTATGCTGATATCACTATGGCCATCAAATGGAGCTCCAAGGTGGCT
AGAGTGACGGAGGTACTACCAATAGCCATACTACCGAACTTTGTGGTGCA
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AAGCCACCGATGATATATTGGCTGTGGTCCATACTCAAGACTATCTAGAT
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AAGAAATTCCATTTCCCGAGTACAGCGTTCAACAGCTAATGTGATTGCCA
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ATTCAGCGAGATGAGTTCGTCTTCAAGCTAGCAAGAGAACAACAAATCCC
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AAAGAAGTGCCCCATAGTACCTGGATTAAAAACAGATCCTTATATGGAGG
TGGTCACTTAGGTAATGGTCACGAAAGAGACTTTATGGGGAATGAAAAGG
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GCTAAAGATGCTGATGGAAAAAGTGGACTTGGACAGGATTATGATTGTGG
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ATCAAAAAGAAGTGCCCCATAGTACCTGGATTAAAAACAGATCCTTATAT
GGAGGTGGTCACTTAGGTAATGGTCACGAAAGAGACTTTATGGGGAATGA
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TGTGGACTTGGACGCGCATCAAGCAGCATACGCAGCGTATAGACGAGGCT
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GGAGGCTTTTGCGCTTATGCTGATATCACTATGGCCATCAAATGGAGCTC
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TTGTGGTGCAATCCAAACTCTTGCGTAAATTAAGAACGCAAACAGGAGGA
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AAACCTCGTGAAGCCACCGATGATATATTGGCTGTGGTCCATACTCAAGA
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GATGATAAACTACCTATTATATACGATGACATTTACAATATCACTTTCAT
GGGCCTACAAAAGCTCCATCCGTTCGATTCAGAAAAGTGGGGACGTATTG
TCGACATTTTATCAAATGAGCTCCAGATGAAGAAGAAGAAGATCCAAAAT
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ATCAAGAGACGATAATGGGAGATATTGAGGTCAAGGAGCCTGGTATTCAC
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GTGATTGCCAGATCCATAATCAATCTTCATCTTCACGATTTGATACCCAG
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TCAAAAGGCACTAGAAGAATTCAAGCCCCAATTTATACTTTACAATGCAG
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TATATGGAGGTGGTCACTTAGGTAATGGTCACGAAAGAGACTTTATGGGG
AATGAAAAGGTTTATATCATGGACGTATATAACCGTTCTATTTATCCTCA
AGATGAGTACGCTAAAGATGCTGATGGAAAAAGTGGACTTGGACAGGATT
ATGATTGTGGACTTGGACGCGCATCAAGCAGCATACGCAGCGTATAGACG
AGGCTGGTCGATCAACATCGGAGGGGGTTTTCACCATTGCTACAGTACAG
ATGGTGGAGGCTTTTGCGCTTATGCTGATATCACTATGGCCATCAAATGG
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GAGGAACAGTACTAACGGATGTAAAGCTTTTCAAAAATTACGTTCGATGG
TTTGCAAACCTCGTGAAGCCACCGATGATATATTGGCTGTGGTCCATACT
CAAGACTATCTAGATAGCCTAAAGCAATTTACAGTCGTTGATCTACAAGT
TGCCAGATGATAAACTACCTATTATATACGATGACATTTACAATATCACT
TTCATGGGCCTACAAAAGCTCCATCCGTTCGATTCAGAAAAGTGGGGACG
TATTGTCGACATTTTATCAAATGAGCTCCAGATGAAGAAGAAGAAGATCC
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AGAACAACAAATCCCTATTGCTATGGTAACATCCGGTGGTTATCAGGAAC
TGACATTCTGGAGGGAGATCCGCTGGGAATGTTAAATATATCAGAAGAGC
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GGATTATGATTGTGGACTTGGACGCGCATCAAGCAGCATACGCAGCGTAT
AGACGAGGCTGGTCGATCAACATCGGAGGGGGTTTTCACCATTGCTACAG
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AATGGAGCTCCAAGGTGGCTAGAGTGACGGAGGTACTACCAATAGCCATA
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GATGGTTTGCAAACCTCGTGAAGCCACCGATGATATATTGGCTGTGGTCC
ATACTCAAGACTATCTAGATAGCCTAAAGCAATTTACAGTCGTTGATCTA
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TCACTTTCATGGGCCTACAAAAGCTCCATCCGTTCGATTCAGAAAAGTGG
GGACGTATTGTCGACATTTTATCAAATGAGCTCCAGATGAAGAAGAAGAA
GATCCAAAATGGCCAGAAGACAGATGAATGAGAATACATCCGGCATCGTA
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TGGTATTCACGATGAGGGCAAAGAAATTCCATTTCCCGAGTACAGCGTTC
AACAGCTAATGTGATTGCCAGATCCATAATCAATCTTCATCTTCACGATT
TGATACCCAGATGAGGCGTTATTCAGCGAGATGAGTTCGTCTTCAAGCTA
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CTTTATGGGGAATGAAAAGGTTTATATCATGGACGTATATAACCGTTCTA
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CGGCATCGTAGAAACTGTCGATCAAGAGACGATAATGGGAGATATTGAGG
TCAAGGAGCCTGGTATTCACGATGAGGGCAAAGAAATTCCATTTCCCGAG
TACAGCGTTCAACAGCTAATGTGATTGCCAGATCCATAATCAATCTTCAT
CTTCACGATTTGATACCCAGATGAGGCGTTATTCAGCGAGATGAGTTCGT
CTTCAAGCTAGCAAGAGAACAACAAATCCCTATTGCTATGGTAACATCCG
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ACATCCGGCATCGTAGAAACTGTCGATCAAGAGACGATAATGGGAGATAT
TGAGGTCAAGGAGCCTGGTATTCACGATGAGGGCAAAGAAATTCCATTTC
CCGAGTACAGCGTTCAACAGCTAATGTGATTGCCAGATCCATAATCAATC
TTCATCTTCACGATTTGATACCCAGATGAGGCGTTATTCAGCGAGATGAG
TTCGTCTTCAAGCTAGCAAGAGAACAACAAATCCCTATTGCTATGGTAAC
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GGAAAAAGTGGACTTGGACAGGATTATGATTGTGGACTTGGACGCGCATC
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CGTTCGATTCAGAAAAGTGGGGACGTATTGTCGACATTTTATCAAATGAG
CTCCAGATGAAGAAGAAGAAGATCCAAAATGGCCAGAAGACAGATGAATG
AGAATACATCCGGCATCGTAGAAACTGTCGATCAAGAGACGATAATGGGA
GATATTGAGGTCAAGGAGCCTGGTATTCACGATGAGGGCAAAGAAATTCC
ATTTCCCGAGTACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11697MSTRG.11697Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11697.2.p1.exon14MSTRG.11697.2.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.11697.2.p1.exon8MSTRG.11697.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.2.p1.exon7MSTRG.11697.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.2.p1.exon6MSTRG.11697.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.2.p1.exon5MSTRG.11697.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.2.p1.exon4MSTRG.11697.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.2.p1.exon3MSTRG.11697.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.2.p1.exon2MSTRG.11697.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.2.p1.exon1MSTRG.11697.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11697.2.p1MSTRG.11697.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000085_pilongenomesc0000085_pilon:1103357..1136796 -