MSTRG.11697.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11697.1.p2
Unique NameMSTRG.11697.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000085_pilon:1103356..1143407-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11697.1.p2 ID=MSTRG.11697.1.p2|Name=MSTRG.11697.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=40052bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:1103356..1143407- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTTCAAGCTGGTTTGCTAATAGAATATTTTCCAGCAGAAAATTTCCAAT GAAACGTAACGAGATGTTGAACAGTAAAACGCAAAAGACACTAGGGTGTT ATTTATTCAATCTCGTTTGAACGTTTCTTATTTCTGTTCTTTCTCTAATT ATTATTTGCTTTCGAAGTGATCGTCTTACACGACCTCAGTTTTTGACGTC AGACTCGCGCTGGTTCAAAATACAAAAACACAGCTCTCCAATTTATTCTT ACAGTAATAAAAAGGACGATCTCGCCTTGTAGTGTTTTGGAAAATAATCA GTTTTAATTAGAAATGTTTGATAAGATTCTCTGCTCTACTCTTTTCTATT TTGATAAATCTGACTTGCTGTGTGCAAGGCGCCATTCAACATCTGACTAC CCAGTAAAACTGTTCCAACAACCTACTTCATGTTAAATATACGTGCCCGC CTTCCCTGTGAACGCATTGCTCGTTTTCTTCATTCATAATATGTACTCAC AACATGTAGAAATCCAGAATAACTTTTGGTTGTAATTAACAAACTTTTAG CAGATGCTCAAAATCAAAGTCTCCTTAAATTCTTTCAACCCCAATAGATT AGTGAAAAAATATACACGTTTTTTATAAGAAAATCCAAGATTTTTGAAGC CTTTGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTAAGCCTAAAAATTTTCTTTAT TTCACTATTTTGGTCCATTTTCATAAGAAATTGGTGTTTTAGAGTCCGCA AAGCCTTAAAATGCCCTTAACTTGTTCTTAAGATTTTGGTTATCGAAGCC CTATGTTCTTATATGGTTTGTTCTTATAAAAAACGTGTTGTAGTACAATA GCAAATTGTCGGAGTTTGAAATAACGCTAGCCATTTGCCAACCTTTTTAT AAATGTAACAAGTATTACTTTCATGAATTACAGTATATTCATATGAATAT TCACTTCCTATTCCCCAGTAACGATTTTCAAAGCCAGCTCGCCAAAGCTA AGGATTAGTATCTAAGAAGCAAATCGAATATGTCTGATCAGCTGAATTAG AGTTTTTTTATTGTGCACTTATTTTGTTTCTAGGGCGTTATTCAGCGAGA TGAGTTCGTCTTCAAGCTAGCAAGAGAACAACAAATCCCTATTGCTATGG TAACATCCGGTGGTTATCAGGTAAGTTTGACCATTTTTACTACTAAAAGG AATGGCCTAACTCACTTCAATAATTATCCATGTATAATGATGATAAAATG ATTCAGTTTAGTTCATATCAAACTTGAAATTTGAGATTAACGAACGTACT ATTAAATAAAAAAACCCGGTTCATCTAATTTGCATATATGTCACTGATTC AACTTGTTACCATGCTGAGGTATGAAATATTTCCCTGTCTAATGATACGG GAAGCGTATTCAAAAGATTATTATCCTCGATATTCTTGTTAAAATGTCAA AGTTCAATTGCTTATTTCCTAACCTCTGTTTAAGATGACATTCGCCAATT ACAACTTTATGAGTATCTCCTTATATGGTCATAATCGTTACTTTGATTGC TACTGGTTTTGATCTAACCATTTATTGATGCTATAACTCTTGGTTTTGTA TCCATGAAATTACTCATGGTTTCTTTAATTTCAAGAGACAGCTAATGAGC TATACTAATCAGGCACTCTACCTATTTTGGTAAATCCATTGAAAGTACAT TTTCCAAAAATCATTCAGTGCACGATTCTTAAAACCGCTACATCCTAAAT CTTGACGTCAAGTGTGCTTATTATTTGTTATTTTAACGCGTACTTGGAAA CAGCATGCAACGGAGCTTGCTACTTGAGATCAACTCACTTTCTCTACTCC TTCACACATTTCTATTTTTAATTCATGACACGACTTGACTGACACGAACG CGCGATAACGGATGTGTTTGATGCACGGGAAATCAAGAGGTGAATCGTCC TCCTGTGGTTTTTGCAGTAATTACGCATTTCGCGCATTTGCACTTCATGA GAGAGGTGTAGCGAGAACGGAAGAATTGATAACCTAAACATTCTCTTAAA TTCCAAATGTCAAATTACCCCCACTTTCCGGCTATATTACTTGCATTGTA GATAACTTCGAATACTTTGGCTTATTACGAATGACGTCACAAACGGCTTT ATCTTAGCATGCATCTCCCCTACTTCTGCTTGCTTGCGTAAGGAGCATTA GCTAACATAAGCTCTTTTAATTACTAATATTCTTTGATAATCACCTAATC AATTCATTAAAAGACAGCATTACAAACTAATTGGGTAAATGCCAACTTTT TCTCGGTGTAATTTCATGTGACGAATCGAAAGTTGATCAAAAGAAGTCCT GGAGTCGCGACAAAACATTATTTTTCGCGGCCTTGTTATGTACTAGGTTA TTACGTCAGCAAATGATCATCTCATTCCCAGGCTCTACTATGGAGTGTGG AATAAGTGTTATATGATGGCACACTGACTTGCAGAATGAGCTAAACCGTT AGTCAGAGTTCGTTTCCCAGAAATAGCATTAAGAACAAAACTGGAACTTA CCTCAAAACCAAGCCATTTGTTTAATTTATTTCCTCATTTGTCAAAATCT AAATGAGAAATGGAATTGGAACATTAATTTCCCCTCATTTTCTTTAGTTG TTGACCAGAATTCCTCGTGCATTATTTATCAATATGTTATCCCACTTGAT TCACAATCTGTTCTTCGTTTTATGTTTTGCACTCTAAATATCATTCTTTC TTTTTTTGCGGCTTCTTTTGAGACTTGTTCTCAATGACGAATAAATCACC ATTCAGAACACACTCTCAACAACTCACTATAAGAAATTCAAAGACTTTTT TTCAAGAAACATTTAGCACATTTTGACGTTAATTCCCTTGTGTTTTTGTT TAGTTGTTGGAGTAGGAATCTGTTGGTATTTCAGTCCAGCTAATTGTTGC TCTTTAAAAATGTCACCTTTATAAAACATAAGTAATTTCAATGTACAAGG TCTACATCATGTTCTTGCAAAATTTTGATAAATATTCAAAAAGTTTTTCG ATTGAAGAAGGATGAGTGAAATGGATTAAGGATGGTTTACAAATTCAAGC CATTCTATTCATATGGGATATTTCTATACAAAAAATATGTTTCCCTCTTT TGGGTGATGAATAAATACGCAGATTTATCCCCCCTCTTAATCCATATTTG TATATTTTTAAGGGAAACTTTTATTTTCTATTCATCCGATTTTGATATTT TATCGAATTGTTTTCATCCGTGAAACATCTTAAATGAGCACTCGAACACG TCCGCAAAAATATAGCTCTTCAGGCTGTCCCTTCCCCTTTCTATTCGCTC TATTACAGTACATATTTCCATACGCAAGATATTGTTACCTTATTCCTTCA AATTTCTCAAATTGAAGAAATTTCTTTACCATTTTTCCTGGCTTGGTTTA CCAAGAAGAGAAAATTGTTTAAAAATAACTTATAATGTTGGCTCCTTTAG TCCTTCCTCCTCAATAATGAATGGTGTTGAATTATGTAGTAGTGGGAAAT ATGACGTCACAATATGGAAAAAGGGGTGGGAAGACAAAATTTGAGAATCC CAAATGGCGTCCTATTAATTCTCAAAGAAACATGCTGTTTTGGCGCGTTT CTGTAACCATAATACTCAAGTCTGTCCCGTCTATTGCTTAATTAGCAGAA ATTCAACAATAAATATTGAAATTTCAAACCAAACTGACCAGCATTTGGAT TATCTTTTTCTATTTGTTTACCCCGTCTTCGAAAACATTTAAAACACGTG ATAACAGTCTAAAAAGACCATAATAGCAACTCAAACAAACAAATATATCC ATTACACTGGGATTATCGGAAATCATTAAAAAAAATGAAAATCCTAAACT AACAGTCTAGATTCGATCTTTGACCTACTAATCGTCTTATTCCCAGTATA GTACTTTTCAGTACTCGATTGCAAGACACCCCCTTCTCACAGACCCACTG GGAACCCTTCCCACTGGAAAAATTGGCAAAAATATCGTCCCCGGTGGAAA ATTTTTGTCCCCACTGAAAATAACCAGATAAGCAAATCCTTACTGCGAAA TATTGTTCTATTTATTCCATCCCCACTGAATTTTCTGGCTAGAAAACAAT AGAATTCAAATTCCCAGCCATAAAAAATATGGGAATATCAATCCTTATCT AGTTTTGGTCCGTTATTTTTATCCCCACTTGCTGAAAAAATCTGTGAGAA GGGGGTGTTACAGGATTCTTAGCAATGCATTCAGTCATTTCGCAATATTA CAATTTTATGATTATTTTTTAACCAATCAGCGTTCAACAGCTAATGTGAT TGCCAGATCCATAATCAATCTTCATCTTCACGATTTGATACCCAGATGAA ATGATCCAGGACACTTACAGCCCTAGAGCTGATCAAATTCTTCGTTCAAA GATATCAACAATCAAGGTTTGCTTGGTGATTTGAGCAGATCTTTGGGAAT TAACTCAGTTGTGAGAAACAGCTTGTGTAACAGTTTCTTACCACCATATG CATAAATCTGATAAAGGAAACAAGATTTGCTCCTCGTTCATAAACATTCT TTGACATTAAAGACATTGGATTATAAATTATTTCAATCAAAGAGCGCAGT CAACGTTAAAGTCAAAGTGAAATGGACTCGGATATGCTTAAAGTGTCTGA CAGACATATGAACAGACACGGACTGTTCCAAACATTTTTATTAGGGTTAT AATTTAGTGACCCACGCACCTATGGTATTTCCTGGATAATTATTTTTGTA GATTTAGAAGACATATTGAAGTCATACTTTACTTTGTAAATATATGGGAT TGTAATTTTGATACTTTTTATTTGAAAGACATGAGAATCTTTGAATGTAA AA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000085_pilon:1103356..1143407-

>MSTRG.11697.1.p2 ID=MSTRG.11697.1.p2|Name=MSTRG.11697.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4608bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:1103356..1143407- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGTCGTGCGATTGGCATCGTGATAGGTTGTATCATTGGTATGGCGCCTTT
AGCCTTCATCTCATCTAAGGAACATTGTGAGAAAGAGCATGAAAAAGATG
AGGAATGATCTTGCAGGATGGGTAGAAACGTTAGCATATCGCTTTGGATT
TGACGAGCCAGCTCTGACACCTGCACAAATGTCAATGACGCAATCAAGAG
TCGCTTGCCATTTCCCGCTGCCATTGGAAATATGATCTCTGATGTTGCTG
GTATCGGGGAGAATACATTGATTATACGGTTGGTGCAACTCTGGGTATAT
CCACCATGGCAGTTGCGTTTGCGAATTCCATTCCCTTTATTGGCTTTGGT
TTCTTTGACAATGCTATCATGATCCTGGCTATGTTATCACTTCAAATGAG
ACAAACGCTTGCCAGTTACAGAAAACGCATTCCGAGTTTGTTGGAGCGTA
CAATATGTATTGGACATACAGTTCAAAACAAACACACAAACTTGAGACAA
TATGCACCATTGAAAGACAACCAAATGAAATATATAACAAATACAATGTC
ATCACGTTATTTAACCACGACTGCATGTAAACTTGGTGTCAACATAAGAC
CACATCAATCGATACCAACTAGATTAGCAGCCGAGCAACTTGTTCGTGAC
ATGACAGAAGAAGAAAGGCAGAAAGTGATGACTGTTTTACAAGATCTTGA
GCAAGAACACTCGCTTGAGAAAGGTGGTCAACAAGAAGAACCACCAACCT
TCAATCATCTATGGCTACGGTCGTGCGATTGGCATCGTGATAGGTTGTAT
CATTGGTATGGCGCCTTTAGCCTTCATCTCATCTAAGGAACATTGTGAGA
AAGAGCATGAAAAAGATGAGGAATGATCTTGCAGGATGGGTAGAAACGTT
AGCATATCGCTTTGGATTTGACGAGCCAGCTCTGACACCTGCACAAATGT
CAATGACGCAATCAAGAGTCGCTTGCCATTTCCCGCTGCCATTGGAAATA
TGATCTCTGATGTTGCTGGTATCGGGGAGAATACATTGATTATACGGTTG
GTGCAACTCTGGGTATATCCACCATGGCAGTTGCGTTTGCGAATTCCATT
CCCTTTATTGGCTTTGGTTTCTTTGACAATGCTATCATGATCCTGGCTAT
GTTATCACTTCAAATGAGACAAACGCTTGCCAGTTACAGAAAACGCATTC
CGAGTTTGTTGGAGCGTACAATATGTATTGGACATACAGTTCAAAACAAA
CACACAAACTTGAGACAATATGCACCATTGAAAGACAACCAAATGAAATA
TATAACAAATACAATGTCATCACGTTATTTAACCACGACTGCATGTAAAC
TTGGTGTCAACATAAGACCACATCAATCGATACCAACTAGATTAGCAGCC
GAGCAACTTGTTCGTGACATGACAGAAGAAGAAAGGCAGAAAGTGATGAC
TGTTTTACAAGATCTTGAGCAAGAACACTCGCTTGAGAAAGGTGGTCAAC
AAGAAGAACCACCAACCTTCAATCATCTATGGCTACGGTCGTGCGATTGG
CATCGTGATAGGTTGTATCATTGGTATGGCGCCTTTAGCCTTCATCTCAT
CTAAGGAACATTGTGAGAAAGAGCATGAAAAAGATGAGGAATGATCTTGC
AGGATGGGTAGAAACGTTAGCATATCGCTTTGGATTTGACGAGCCAGCTC
TGACACCTGCACAAATGTCAATGACGCAATCAAGAGTCGCTTGCCATTTC
CCGCTGCCATTGGAAATATGATCTCTGATGTTGCTGGTATCGGGGAGAAT
ACATTGATTATACGGTTGGTGCAACTCTGGGTATATCCACCATGGCAGTT
GCGTTTGCGAATTCCATTCCCTTTATTGGCTTTGGTTTCTTTGACAATGC
TATCATGATCCTGGCTATGTTATCACTTCAAATGAGACAAACGCTTGCCA
GTTACAGAAAACGCATTCCGAGTTTGTTGGAGCGTACAATATGTATTGGA
CATACAGTTCAAAACAAACACACAAACTTGAGACAATATGCACCATTGAA
AGACAACCAAATGAAATATATAACAAATACAATGTCATCACGTTATTTAA
CCACGACTGCATGTAAACTTGGTGTCAACATAAGACCACATCAATCGATA
CCAACTAGATTAGCAGCCGAGCAACTTGTTCGTGACATGACAGAAGAAGA
AAGGCAGAAAGTGATGACTGTTTTACAAGATCTTGAGCAAGAACACTCGC
TTGAGAAAGGTGGTCAACAAGAAGAACCACCAACCTTCAATCATCTATGG
CTACGGTCGTGCGATTGGCATCGTGATAGGTTGTATCATTGGTATGGCGC
CTTTAGCCTTCATCTCATCTAAGGAACATTGTGAGAAAGAGCATGAAAAA
GATGAGGAATGATCTTGCAGGATGGGTAGAAACGTTAGCATATCGCTTTG
GATTTGACGAGCCAGCTCTGACACCTGCACAAATGTCAATGACGCAATCA
AGAGTCGCTTGCCATTTCCCGCTGCCATTGGAAATATGATCTCTGATGTT
GCTGGTATCGGGGAGAATACATTGATTATACGGTTGGTGCAACTCTGGGT
ATATCCACCATGGCAGTTGCGTTTGCGAATTCCATTCCCTTTATTGGCTT
TGGTTTCTTTGACAATGCTATCATGATCCTGGCTATGTTATCACTTCAAA
TGAGACAAACGCTTGCCAGTTACAGAAAACGCATTCCGAGTTTGTTGGAG
CGTACAATATGTATTGGACATACAGTTCAAAACAAACACACAAACTTGAG
ACAATATGCACCATTGAAAGACAACCAAATGAAATATATAACAAATACAA
TGTCATCACGTTATTTAACCACGACTGCATGTAAACTTGGTGTCAACATA
AGACCACATCAATCGATACCAACTAGATTAGCAGCCGAGCAACTTGTTCG
TGACATGACAGAAGAAGAAAGGCAGAAAGTGATGACTGTTTTACAAGATC
TTGAGCAAGAACACTCGCTTGAGAAAGGTGGTCAACAAGAAGAACCACCA
ACCTTCAATCATCTATGGCTACGGTCGTGCGATTGGCATCGTGATAGGTT
GTATCATTGGTATGGCGCCTTTAGCCTTCATCTCATCTAAGGAACATTGT
GAGAAAGAGCATGAAAAAGATGAGGAATGATCTTGCAGGATGGGTAGAAA
CGTTAGCATATCGCTTTGGATTTGACGAGCCAGCTCTGACACCTGCACAA
ATGTCAATGACGCAATCAAGAGTCGCTTGCCATTTCCCGCTGCCATTGGA
AATATGATCTCTGATGTTGCTGGTATCGGGGAGAATACATTGATTATACG
GTTGGTGCAACTCTGGGTATATCCACCATGGCAGTTGCGTTTGCGAATTC
CATTCCCTTTATTGGCTTTGGTTTCTTTGACAATGCTATCATGATCCTGG
CTATGTTATCACTTCAAATGAGACAAACGCTTGCCAGTTACAGAAAACGC
ATTCCGAGTTTGTTGGAGCGTACAATATGTATTGGACATACAGTTCAAAA
CAAACACACAAACTTGAGACAATATGCACCATTGAAAGACAACCAAATGA
AATATATAACAAATACAATGTCATCACGTTATTTAACCACGACTGCATGT
AAACTTGGTGTCAACATAAGACCACATCAATCGATACCAACTAGATTAGC
AGCCGAGCAACTTGTTCGTGACATGACAGAAGAAGAAAGGCAGAAAGTGA
TGACTGTTTTACAAGATCTTGAGCAAGAACACTCGCTTGAGAAAGGTGGT
CAACAAGAAGAACCACCAACCTTCAATCATCTATGGCTACGGTCGTGCGA
TTGGCATCGTGATAGGTTGTATCATTGGTATGGCGCCTTTAGCCTTCATC
TCATCTAAGGAACATTGTGAGAAAGAGCATGAAAAAGATGAGGAATGATC
TTGCAGGATGGGTAGAAACGTTAGCATATCGCTTTGGATTTGACGAGCCA
GCTCTGACACCTGCACAAATGTCAATGACGCAATCAAGAGTCGCTTGCCA
TTTCCCGCTGCCATTGGAAATATGATCTCTGATGTTGCTGGTATCGGGGA
GAATACATTGATTATACGGTTGGTGCAACTCTGGGTATATCCACCATGGC
AGTTGCGTTTGCGAATTCCATTCCCTTTATTGGCTTTGGTTTCTTTGACA
ATGCTATCATGATCCTGGCTATGTTATCACTTCAAATGAGACAAACGCTT
GCCAGTTACAGAAAACGCATTCCGAGTTTGTTGGAGCGTACAATATGTAT
TGGACATACAGTTCAAAACAAACACACAAACTTGAGACAATATGCACCAT
TGAAAGACAACCAAATGAAATATATAACAAATACAATGTCATCACGTTAT
TTAACCACGACTGCATGTAAACTTGGTGTCAACATAAGACCACATCAATC
GATACCAACTAGATTAGCAGCCGAGCAACTTGTTCGTGACATGACAGAAG
AAGAAAGGCAGAAAGTGATGACTGTTTTACAAGATCTTGAGCAAGAACAC
TCGCTTGAGAAAGGTGGTCAACAAGAAGAACCACCAACCTTCAATCATCT
ATGGCTAC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11697MSTRG.11697Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11697.1.p2.exon19MSTRG.11697.1.p2.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon18MSTRG.11697.1.p2.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon17MSTRG.11697.1.p2.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon16MSTRG.11697.1.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon15MSTRG.11697.1.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon14MSTRG.11697.1.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon13MSTRG.11697.1.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon12MSTRG.11697.1.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon11MSTRG.11697.1.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon10MSTRG.11697.1.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon9MSTRG.11697.1.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon8MSTRG.11697.1.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon7MSTRG.11697.1.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon6MSTRG.11697.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon5MSTRG.11697.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon4MSTRG.11697.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon3MSTRG.11697.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon2MSTRG.11697.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11697.1.p2.exon1MSTRG.11697.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11697.1.p2MSTRG.11697.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000085_pilongenomesc0000085_pilon:1103356..1143407 -