MSTRG.11697.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11697.1.p1
Unique NameMSTRG.11697.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000085_pilon:1103356..1143407-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11697.1.p1 ID=MSTRG.11697.1.p1|Name=MSTRG.11697.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=40052bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:1103356..1143407- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATAACAGTCTAAAAAGACCATAATAGCAACTCAAACAAACAAATATATCC ATTACACTGGGATTATCGGAAATCATTAAAAAAAATGAAAATCCTAAACT AACAGTCTAGATTCGATCTTTGACCTACTAATCGTCTTATTCCCAGTATA GTACTTTTCAGTACTCGATTGCAAGACACCCCCTTCTCACAGACCCACTG GGAACCCTTCCCACTGGAAAAATTGGCAAAAATATCGTCCCCGGTGGAAA ATTTTTGTCCCCACTGAAAATAACCAGATAAGCAAATCCTTACTGCGAAA TATTGTTCTATTTATTCCATCCCCACTGAATTTTCTGGCTAGAAAACAAT AGAATTCAAATTCCCAGCCATAAAAAATATGGGAATATCAATCCTTATCT AGTTTTGGTCCGTTATTTTTATCCCCACTTGCTGAAAAAATCTGTGAGAA GGGGGTGTTACAGGATTCTTAGCAATGCATTCAGTCATTTCGCAATATTA CAATTTTATGATTATTTTTTAACCAATCAGCGTTCAACAGCTAATGTGAT TGCCAGATCCATAATCAATCTTCATCTTCACGATTTGATACCCAGATGAA ATGATCCAGGACACTTACAGCCCTAGAGCTGATCAAATTCTTCGTTCAAA GATATCAACAATCAAGGTTTGCTTGGTGATTTGAGCAGATCTTTGGGAAT TAACTCAGTTGTGAGAAACAGCTTGTGTAACAGTTTCTTACCACCATATG CATAAATCTGATAAAGGAAACAAGATTTGCTCCTCGTTCATAAACATTCT TTGACATTAAAGACATTGGATTATAAATTATTTCAATCAAAGAGCGCAGT CAACGTTAAAGTCAAAGTGAAATGGACTCGGATATGCTTAAAGTGTCTGA CAGACATATGAACAGACACGGACTGTTCCAAACATTTTTATTAGGGTTAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000085_pilon:1103356..1143407-

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ATCTACAAGTTGCCAGATGATAAACTACCTATTATATACGATGACATTTA
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AAGAAGATCCAAAATGGCCAGAAGACAGATGAATGAGAATACATCCGGCA
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AGCTAGCAAGAGAACAACAAATCCCTATTGCTATGGTAACATCCGGTGGT
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AGAGACTTTATGGGGAATGAAAAGGTTTATATCATGGACGTATATAACCG
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GACTTGGACAGGATTATGATTGTGGACTTGGACGCGCATCAAGCAGCATA
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AATAGCCATACTACCGAACTTTGTGGTGCAATCCAAACTCTTGCGTAAAT
TAAGAACGCAAACAGGAGGAACAGTACTAACGGATGTAAAGCTTTTCAAA
AATTACGTTCGATGGTTTGCAAACCTCGTGAAGCCACCGATGATATATTG
GCTGTGGTCCATACTCAAGACTATCTAGATAGCCTAAAGCAATTTACAGT
CGTTGATCTACAAGTTGCCAGATGATAAACTACCTATTATATACGATGAC
ATTTACAATATCACTTTCATGGGCCTACAAAAGCTCCATCCGTTCGATTC
AGAAAAGTGGGGACGTATTGTCGACATTTTATCAAATGAGCTCCAGATGA
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ACGAAAGAGACTTTATGGGGAATGAAAAGGTTTATATCATGGACGTATAT
AACCGTTCTATTTATCCTCAAGATGAGTACGCTAAAGATGCTGATGGAAA
AAGTGGACTTGGACAGGATTATGATTGTGGACTTGGACGCGCATCAAGCA
GCATACGCAGCGTATAGACGAGGCTGGTCGATCAACATCGGAGGGGGTTT
TCACCATTGCTACAGTACAGATGGTGGAGGCTTTTGCGCTTATGCTGATA
TCACTATGGCCATCAAATGGAGCTCCAAGGTGGCTAGAGTGACGGAGGTA
CTACCAATAGCCATACTACCGAACTTTGTGGTGCAATCCAAACTCTTGCG
TAAATTAAGAACGCAAACAGGAGGAACAGTACTAACGGATGTAAAGCTTT
TCAAAAATTACGTTCGATGGTTTGCAAACCTCGTGAAGCCACCGATGATA
TATTGGCTGTGGTCCATACTCAAGACTATCTAGATAGCCTAAAGCAATTT
ACAGTCGTTGATCTACAAGTTGCCAGATGATAAACTACCTATTATATACG
ATGACATTTACAATATCACTTTCATGGGCCTACAAAAGCTCCATCCGTTC
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GATGAAGAAGAAGAAGATCCAAAATGGCCAGAAGACAGATGAATGAGAAT
ACATCCGGCATCGTAGAAACTGTCGATCAAGAGACGATAATGGGAGATAT
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TTCATCTTCACGATTTGATACCCAGATGAGGCGTTATTCAGCGAGATGAG
TTCGTCTTCAAGCTAGCAAGAGAACAACAAATCCCTATTGCTATGGTAAC
ATCCGGTGGTTATCAGGAACTGACATTCTGGAGGGAGATCCGCTGGGAAT
GTTAAATATATCAGAAGAGCAACTATCAAAAGGCACTAGAAGAATTCAAG
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AGTACCTGGATTAAAAACAGATCCTTATATGGAGGTGGTCACTTAGGTAA
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TATATAACCGTTCTATTTATCCTCAAGATGAGTACGCTAAAGATGCTGAT
GGAAAAAGTGGACTTGGACAGGATTATGATTGTGGACTTGGACGCGCATC
AAGCAGCATACGCAGCGTATAGACGAGGCTGGTCGATCAACATCGGAGGG
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ATTTCCCGAGTACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11697MSTRG.11697Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11697.1.p1MSTRG.11697.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.11697.1.p1.exon1MSTRG.11697.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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