MSTRG.11687.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11687.1.p1
Unique NameMSTRG.11687.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000085_pilon:913844..930305+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11687.1.p1 ID=MSTRG.11687.1.p1|Name=MSTRG.11687.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16462bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:913844..930305+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CAATCACTACGGCGTAAAATATCCGGCATAGGATCAAAACTTGTAGGCTC TGGTCAGAGCAATAGGTGACCTCTTTAAGACGTTActacagtttttattt ttaatattttcttttttttgtaaataattcgAGGACAGGGTTTAACTTAA AACTAagcaatttttttattagagaATTTTGAGCCCCTTAAATTTACTGT AAATAATCCAAAGTGTGAATATGACAGATTAACAAATATAAATGCTTAAA ACATTTATCTTCTTCATACCATGTCCCCTGATAACACCCCGACCCTACTA TGCTCAACCAGC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000085_pilon:913844..930305+

>MSTRG.11687.1.p1 ID=MSTRG.11687.1.p1|Name=MSTRG.11687.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6375bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:913844..930305+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCATCACAACCGAAAGTCATCGCAAGTATCAAAAACCATTATAACAG
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CCGATTCTCACAGCACGGTGGTGGATTTCCATCTTCACACCAGAAGGGGC
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GGAAAGTAGAAATAACCACCAACAACAAAGCAGCAATACAACCGACTCAC
CGGCAAACAATACTTCCACAACCTCCTCAGCCAATAACAATAAAGCCACC
ATGAAGATGAAAGAGCACAaagattttgataatattcacATTGCATTGGC
TGGTGCAAAGAATTGTGGGAAATCAGCACTGGCGGTTCGTTATTTGACCA
AACGTTTCATTGGAGAGTACGATTCACACAAAGATGACATATGGCATCGA
AGTATGACAGTTGCTGACAGAGAAGTTCGTGTATCACTCAAAGATACCAC
TGGAACGAGCTGGTTAAAAACACCCGCACCTTTAATCAGTTGGACCACAG
CAATCGTAGTTGTCTACTCCATCACAGATCGAAACAGTTTCGCATTGGCA
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TACTCTTTTAATCGGAAATAAATGCGATCTAATGCATCTCAGACAGGTCC
CTAAAAGTGATGCTAAAAAACTAGCCGATGATTTCGGCGTACACTTCTTA
GAGTGTTCAGCGGCAGAAAATTATGATGATATATTCAGCTCATTTACAAG
ACTCTTAGTGGAAGCTATGATTGCACAAAGTGCTAAGAAACATTCATGGG
ACGATCAGAACGCTGATGATGTTAAACAGAACGAGAATCGATTACGTAAA
CGTTCCCTTTCGACGGGACAAGCACCTAGTAAAGACAGTAACAACAATAC
GTCATTCCTTGGCGGATTACGTGAAAAGAAAGACTCTATGATTAAAATTG
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CGTAAGCAATCACTACGGCGTAAAATATCCGGCATAGGATCAAAACTTGT
AGGCTCTGGTCAGAGCAATAGGTGAATGCCATCACAACCGAAAGTCATCG
CAAGTATCAAAAACCATTATAACAGTTATCACTTACACCGTCATTCGCTG
AACATCGACCGTCCGAAAAGCCCGCGAGACGATGGCGGACATAGCCCGAA
ATCAGCAAGTCCGAGTCGTTCACCAACTTTCTTCCATCATCGGCGATTGC
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GTGGCGAAAGTGGGGAAAGCGATGAGGAAAGTAGAAATAACCACCAACAA
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CTCAGCCAATAACAATAAAGCCACCATGAAGATGAAAGAGCACAaagatt
ttgataatattcacATTGCATTGGCTGGTGCAAAGAATTGTGGGAAATCA
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11687MSTRG.11687Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11687.1.p1MSTRG.11687.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11687.1.p1.exon1MSTRG.11687.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11687.1.p1.exon2MSTRG.11687.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11687.1.p1.exon3MSTRG.11687.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11687.1.p1.exon4MSTRG.11687.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11687.1.p1.exon5MSTRG.11687.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000085_pilongenomesc0000085_pilon:913844..930305 +