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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000085_pilon:292275..307959+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11637.4.p1 ID=MSTRG.11637.4.p1|Name=MSTRG.11637.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15685bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:292275..307959+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACATGAAGTTTTGAACATCAGTGGTGCTGTGGACGATTACGGTGTCATCA
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TCTATTTTCTTTGACTTctctaaatttaaaaatcatactCCTTACACCCG
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GTGAAGAGGGCGTGGACGGGTGCAAAAGAGTGTTTATCTGGCTGAAGCTC
AAGGAAAAGACTTTGATGACCCCACTATAGCTACCGACGGTAAGCGGGCG
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GGAAAAGACTTTGATGACTCCACTATAGCTACCGACGGTAAGCGGGCGTG
AAGAGGGCGTGGATAGATATAAGAGGCTGGTTATCTGGCTGAAGCTCAAG
GAAAAGACGTTGATGGTCCTTCTTTTGCTACTAACGGTAAGTGGGCGTGA
AGTGAGCGTAAGAGGGTGTAAAAGAGTGGTTATCTAGCTGAGTTTTAAGG
GACATATGTTGATGATCCCACCATCGCCTCTGACGGTAAGTGGCGTGAGG
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TAAAATGTTGATGACCCCAAAATCGCAATTGATAGCACGAGGGTGAGAAG
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AACTCTCATCACTGATGGTAAAGGCAGGCGCAAAGTAGGCTTTGAAAAAA
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AAGTAAGTTTTATTACTTTCACTGCAATGTCggtcaaaaaaaatatatcg
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AACccaatttagagcgcttccaaattgtttgtggttgtaagaatttccct
tttttctcaaatattatgactttgattgtggtttatatatacattttttt
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TATTTAATTCGACCATCTTAGATTTGTCgctattttattagtttttgacg
GTTCGCGTCATATAAAAACCGGCTCTATCGTTCGAAGTGAATTCAGACGC
TTAAGTAAATTCGTTTTAATAAAAGTTAGTAACTTAACTTCAATAATTCG
AACGCTACAGTTGGATATGAAGACTCATATGTGTATTAGATATGTATTAA
ACAGTAAAGTGTGCTAAGCACAGGTTTTATTGTAGTTTAGaaatattata
aattttcaataaaggCCGTGTTGTTTGATCATTTTTAGCAGAAATCAGAC
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GATCGTTTGTTCATTTTTTGGACTGTCCGCTCAAAACACCTTCATCGGTT
GTTTCTATATCGGTTGTCGTTGTCGGTAGATTAGCAGAGGTTGTCGGCGG
GTTTGTGGCCGTAGTTGTTTTTGATAGATTAGTTGTCGTTGGATTCGGTG
GATTTTTCGTTGTCGTTGGATTCGGAGGATttgtcgttgtcgttggattc
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GTTGTTGGATTCGGAGGAGCTGCCGTCGCCGTTGGATTCGGTGGATTTGT
CGTTGGCTTCGGAggattggtcgttgtcgttggaggatttgtcgttgttg
ttggattcggtggatttgtcgttgtcgttggattcggaggatttgtcgtt
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GTGGAGTCGTGGATGGTTTTTCTGTTGTAGTTGTTTGGTTTGTTGCCATT
GTCGGCAGGATGCTCGTGCTCGGTGAAACAGTGTTACTTGGAACATGTTT
CGACGAAGAAGGCACTATCATGGTGGTTGAAGGGCAAGTGTGAACGGTAA
CAGTCGAAATATGAGCCGAACATGGAATACTGGATGCCGTCAATATTGGT
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GCTAGATGATAAGATTGGTGTAGTAACAGGACTTTCAGTGGTTGTGTTAC
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ACACCTACATCCGAATCTTTTATGGCTCAAAGTCATGGTGTAGGGGATAG
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GATACTGAACTACGTTGTGAGAATGATTCCGTAAAAGTGACGCTTTCTTT
AATCGACCGGGTTGTTGGCTCCGAGGGAATCTCAGAGTCACAGTTATTGA
TGGTGATAGTCGGAACATGTTTTGTTTGTGTTCGTACGACAGTACCTTTA
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TCCGGTACATCGACAAGCTCTTCTACGACAACGGCGATGGTAAAGCGATC
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TTCTCCGTCGCGTCACACAACGCGTCTATTACATCACCCCAGCTTGAACT
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ATTCGTGGACTATACTTAGGGTGCTTCTTCTTTGCCGCGATTTTATAAAC
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agaattatacattttattacaaaaaaatcTTCCTTTGAGGTTGAAGCTTA
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ATCGGCCTTTCCTTACGCCGATCCTTATTCCGCCGCTGATTAATTTTGAG
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GTTGGTTTGAAAACAGTAAAATATGGTAACAGTAGCGTGGTGACAGGGGG
CAGGGGAAGTGCTAATTGTTGTGTTAATTGTTGACAATTTCATCGGAGGT
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AAGCCCTGTCCTTTAATCCGCCAATTGGGATCCGTGGCATAAAGCTGAAA
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AACAATCTCCTACCTTTTTCCTTGCTTGGCAGTTGTGTAGCTTAAATGAT
GCTTTTCTTGATAGCTCCTTGCCCTTTATATATCGATGAAAAGATAAGTT
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GCCATGCtttcctttcatttttatagttagatgaaaattattttcttcca
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GGGGCAAGCTCAATCAAAGACACTTTTGCAAACGCGCAAAGCTCCTAGAT
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ATAAACTTTCATTGATTTGTACAAATCATAATATTATAAAGATATCTCCA
TTAATGATTGCCATCCCGTTTTGATAATAAATTGATGCATTTGTGTATAA
ttaattacacgcttttttaattccattccatcatgaatattcttacggta
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TTATGCACAAAACTTGGCATATTTGTGAAACTTTTTAGCATTGCTGGGCG
ATAATTAGCAATTTGCagctaaaaatgctctaaaaatggtatGGTGAGGT
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tggccaatttcatcatgaatatttttataaagtattcttataaaagatgc
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TTATTCCTGTTATAACGATTCAGAGAAAGGGTAGAGGAAGGGTCTGACCT
TTAGTTCTCACGATCTACATAATTGCTTACGATATTTCCATAGAAGCGGT
Gtacccatagatttataaagcccgaagggctagatgtaaagcttttgctg
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CGCTTAAAGGCCGACATCTATGGGTGTACCCTTTATCATATACTTATAAT
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ATACTCATGGAATATTCATCAAAATCTTTATCAGTCATTCAATCATAATT
TCAAATCGATAAAATCATGTTTTAAATTGATCTTATCGAGATTTCTCTAA
AACAGATTATCTCCGTTACTCAGACagtaaaaataaatgacagacattga
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ACCAATGCATACTAAGGAATAGTGCTTTACATTTTTCGGTCCTTTCGATG
ATGCTTTCCTACCTGTTACCTCCAAAActgaaattgctcaaaaaaagttt
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ACGAAAATTTACTTTGAGATGAGAAAAACATACAACAATATAAAATTGTA
CTGTTTCTGTCACAACCctcttaaaaaattttctgaacaGTTAAAGTGAA
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ccccctactatatattttgttttttaaatctatataTGTTGGCATGGCTC
ATTGattgataatatttttacttatatcagcataatataacaataggcag
acactgtcctgatatgaaatatgtgtctgatatgaaacgggaacacttct
gtaaaaataaaacctttaataggCTGCTCACGTTTCTGTAAATCATGATT
TTTTAAAGATCTGTGATccagaaaaataattattggtCTTTTTCTTTATG
TGTAGTTTGGTCAAGTAGAATTGATTTGTGCAGCCATCATTGAACAATAT
CCTGAGAAGTTAAAGAAACGAAAAGAATGGGTTGTTCTTGCAGTTTGTGT
GCTGTTGTTCTTATGTGGATTAATATGCATGACCAGAGTGAGTTTGACCA
TTATATGCCTTTGTGAAATTATTGTGACATTTGCAACTACGAATCGGTTT
TCCTACTTTGTTTCATaaagttttcgttttttttttttaatttttggaaa
caTTTTTAGCTGTTGAAGGAAATATCACTCATTTTGCTCTAATAGCCTGA
TTTTTTCAACCCCTGCTTTCATAAGCAACTAAGGGTAAGCCGATTCACTA
GTAGTCCGGGAGCTGGGGAGTCACTATTTAAGTGAGTTAAATTTGGCGTG
GATTGATTTTCGCGACTTTCGCtaattttagcccttttcgcgaaaattag
tcctcgcgaaatattcAaaatcaagattttggCcgAAGCCCCtaggaaaa
tgaaataaattggGTATAAAAGTGTCAGATTCGCGAAatttgtccacgcg
aaaattttagattctcaattcgcgaaaaaaaggccacgcgaaaatttatc
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CTTGAGGacgattttctcgagttaattATTTAACTTTCGAACTATTTTCA
GGCACAAAATGTTGCAGAAAAACGGGGGTTTCTTCATGAAAAGCCCAACA
ACGAATTTattattcttcaaattttagagTGGGATGTATTGGTTCAACTT
GATCGATAATTTTTCTGCTGGTATATCTCTTCTCTTCTTGGGACTTTGCG
AGTTAATCACCGTTGGATGGATATTTGGTAAGATA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000085_pilon:292275..307959+ >MSTRG.11637.4.p1 ID=MSTRG.11637.4.p1|Name=MSTRG.11637.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2610bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085_pilon:292275..307959+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CATGAAGTTTTGAACATCAGTGGTGCTGTGGACGATTACGGTGTCATCAA
TTGGAAAGTGACCCTATGTCTATTGCTAGCATGGACGCTTGTTTACTTTT
GTATCTTCAAAGGAATTCGAACCACCGGGAAAgTGGTGTATATTACAGCG
ACCTTACCTTACGTCATGCTTCTCATTTTCTTCATACACGGCGTTCAATT
ACCTGGTGCAACAAAAGGCATAATGTATTACATCACACCTGTGTGGAGTA
TGTTGGCAAAGCCTCAGGTTTGGGTAGATGCAGCCTCGCAAGTTTTTTAT
TCGTTAACTTTGGGATTTGGTGTAATGCTAACGTTCGCTAGTTACAACAA
ACAAGATAATAATCTTGTCAGGACCTGGCTTAGTGTTTATCGTTTATCCG
GCTGCCTTGGCAACGCTACCACAACCACAAATATGGTCTGTAGTATTCTT
CTTGATGTTAATCACACTGGGTTTGGACAGTCAATTTGGTCAAGTAGAAT
TGATTTGTGCAGCCATCATTGACATGAAGTTTTGAACATCAGTGGTGCTG
TGGACGATTACGGTGTCATCAATTGGAAAGTGACCCTATGTCTATTGCTA
GCATGGACGCTTGTTTACTTTTGTATCTTCAAAGGAATTCGAACCACCGG
GAAAgTGGTGTATATTACAGCGACCTTACCTTACGTCATGCTTCTCATTT
TCTTCATACACGGCGTTCAATTACCTGGTGCAACAAAAGGCATAATGTAT
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TAACGTTCGCTAGTTACAACAAACAAGATAATAATCTTGTCAGGACCTGG
CTTAGTGTTTATCGTTTATCCGGCTGCCTTGGCAACGCTACCACAACCAC
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GTTTTGAACATCAGTGGTGCTGTGGACGATTACGGTGTCATCAATTGGAA
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ACGCTACCACAACCACAAATATGGTCTGTAGTATTCTTCTTGATGTTAAT
CACACTGGGTTTGGACAGTCAATTTGGTCAAGTAGAATTGATTTGTGCAG
CCATCATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000085_pilon | genome | sc0000085_pilon:292275..307959 + |
|
