MSTRG.11615.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11615.3.p1
Unique NameMSTRG.11615.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000084_pilon:1277599..1294734+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11615.3.p1 ID=MSTRG.11615.3.p1|Name=MSTRG.11615.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17136bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:1277599..1294734+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aatcaaacatAGTAAGCAGTCAAAGCATACCTACATAAACGCAAAGGGAA GCACAAAGAAGTTACAagtaaatcataaaatatgGACAAGTATGGATCAG AGAGCATTGACTTCTATCCAACGAacaacaaattcaacaaaggGATGAAC CAGCAATATCAAGAAACATTTCTGGAGAATCAACAACTCAAACAAACTGT AGACATATTGAACAAGAGACTGCAAGCTGTCGAAGAACAGTCTAGACTAC AGTATAATGACCTGTTGGAAGCAATGGCGCAGTTATCCAAGAAGATCAAC GGAGCTGACAATAATGGGAATGTCCAAGAAGGTGCGGTTGAGCAGATACA AAACAACACTGAAAACCTTGCAGATCTTGACTTGAAATTCCAACTCCATG AGAACTCGGTCAATGACGGCCATCTTGTTTGGAAGATCAACAATTTTCAG CAACGAACAACTGATGCAATTATTGGCAAGACAAGAGCATTACATTCCGC CCCTTGCTTTACGAGCAAGTATGGATACAAGTTCTGTTTAAGGCTGTATC TACACGGTGACGGGATGGGAAAAGGAACACACTTGTCACTTTTCTTGGTT CTTATGAAATCAGAATATGACAACATTTTGGAATGgcctttccaaaagaa aatcaaattcactTTGATCAATCAAGAAGACAGAAGTAAAGATCATGTGG AGAAAATGTTTCCAAACAAAGATtcatcaagctttcagaaaccAAAGAAA GATATGAACATTGCTTCAGGTTGTCCAATGTTTATGAATTTGAACAGATT GCAACCTGAAGGATTTTTAAAGGACGACTCTTTATTTGTCGAAGTTAAGA TAGattaattttttatacgatatttagtactttttaagtaatagttaatt tattgatttatttctgtAGATAATTTTAGTATCATGATATCAAGTTCCTT GATCATACCttgtaaattttgttatttatttctattCATTGCTATTTATT TGTATACGATAACCGtgacataaaaatgaaaatataaagtaATAAATTAG ATTCCTGGAATaattttctatttgtttttacCTTCTATCGTATGCCTTTA GAAAATTTGCATTATTTTATTAGGGATAAATTAGCTCGTTTCTTTTAGAA GATTCAATTTTGACAATTCCCTATaatgtatttgaaaattcaagaagATC CTCCACAATCAGACATCGTAGGGTCATTGTCAATTGTTTGTCGATAGACT ATTTCGAAACACTCTCTAACATTGCTATGCATTTTCTTGCTTATTTTGCA ATGCAGATTGATGTCTGAGATTAACTCTGAGCATCTCATCTTACTTGTTA TTTGATCTTACATACTGAATTTTTCCAGTGTATGAAATATGAGTCTTATT TCtatcatgaaggtaataaagatatagatggagagaaaacgtctcggtga CCTATATGGTCGttcaaatcttttataaatctaatcaaagcggcttttct ttgatgtaccatcattggaagcaaaaaaatccgaaatgtaaatttataag aacagaaaaaggctggtccgttgattttgaaaaacttaattttgcgagaa atcttagttaaaatgcgattcgaaatagtttcaactgatttaaggataaa agaatatattaatttcataaggatatatttctgggctggcattttgtaaa cattgagagtcgcatcacattatcattgaaattttcttatcttaaaatct tcacgtctaagtgagcagcggttttcatactttcaaaattaatcatctta ttcccaaagcaaccaaacagctgtttgcttccgatgataaatcagaatag aacaaaaggcattgactctccatctatctttattaccttcatttTTCTAT CTTTTGAATATGAAATAGTTACATTGaacacccttgtgtcacagacccgc tgggaccccagttccactggaaaatttggcaaaaatgttgtccccactgg gaaaataccctggaactTCCGCCCTAATGAGAAATTGACtctgattttat ccccatttgaaattcaatgtctaAAAACTTACTCCAAACCACCCCCGCTG gattttttaaacttgaaataatagaatttctatccacaTTGAGAtttaaa tagaaatttttatctagggaagaaagttccaccggggctgtgagacataC AGGGTGGCATTGAAGTATCAGAAGCACATCTAAAGGGAATTAAATGATTA GATTCAGATAATGTCAAAAGACAGcaaatatcttcatttggaAAACATCG ATAGTGCCTAAACTACTCTAACTTGCCCGGAATGTATTCGAACTTTCTCG CACTTACTACGAACACACTTGGACTTATGCAAAAGTTCTTGAGCTCACTC GACgttttcgaacattttcttaactttctcGAACAAATACTCGAACTTAC ttgactttttcaaatttcctcgAAAAGTCACCTGAGATTACTCAAACTTT TCTCgaactttttcgaattttcaaaaaatgctcaaaattatttattgaaa tttctcGACTCTTTCGATCTTTCTGAACTTTAGAACTcgctcaatttttt ttgaaacacacCCGAACTTTCTCGAATTTACTCAAAGTTTCTCGAACTTA ATTGAAATCACTTGACTTTATCGAACTTACtcgaactttttttattttaa tcgaACATATACTACAAGCCCGAGTGAAGAAACTACAGTACAGTGAGGGT TGATCATTTCTGCTTACGAACATTATCTAGTATTTAGTTaaaaaaaTCAG GGAAACAGGAGACATTTGTGAATTCaggttatttttattttgaaatcttt tttttttggaaattcgatttttctttCCTCAAACATACTCCACGATGAGT CGTGTTAAAAGTATTTTGTCTTTGATCGTGAATTttgcccttatgtatta caatgaagtgaatacagtcaaTTTCATGTTGTATTCTGACCAGCCACtaa aaccgttggaaaaccaacggatctgGTGACACTCGAACTCATAACCATGC CATTGCGGGTATATGCTCTATCATTGAGCTACGTTCCCTATGTGGAACCC GAGGACTCAATTGACATTCGGTAAAGCTTTTGTCTTTAAACTTAGCGAGT TAAGAGGAATTAAAAAGCTCCGatttttctctgaaaatgtAAAGTAAAAG TCTTGTAAATCATCTAAGATTCTGTTTTCATTGATAATCAAGTGGTTGTC AGATTGCGTAATTAATGCTATTTATAGAACAGTTACTGTatcaaaataca tatttttattttttatacaatttGTTACTTAAGTTATCCTGATGGCTTGG TCGATTTTCAAGTTGCTATATAAAGTCATCATCTGCACAGTCGATTATAC AACAAATATGCATCATCTACTTGTAACTTTGAGCTTGTTTGCAAAACTGA GATCTAAAAATCTCGAATCTTTGATTTGCACAACTTATGATATAACATAT AAATTCTTTTTATGCATAACTAGACTCATACTGTGATGAATGAAATTGCc cctggtcagggtacctttctttacctccacgagtcccagaaaggctcgca aaaacaccaaaatagaaaaaatcttgccttttttggaaaacttgggggga aagtagaaaattggagaaaattttggaatttcagtcccattcagggtcac tctttcgcaaattttggcaaaattaaaaaaaaaaaaagtcccactcaggg tccatttttcgaacctcaggggagcaccccgtcggtcggcaagggtagta ccccccccccagggaGACGAATCAAtcctgaaaatttgagctctttTCGA TCACTGTATATAGCTTTGTTTATCCATGTTAAAATGtctcataaaaatca aaacgtaTAGCCCGGCCTCGTTTTCAtttaattctattgtttaaaataaa agttaggctacgtcatatcttccttcgtttcgatcGTGAAACTCCTATtt ttcgggatatgagcactgctcttgttttgaatattgaaatttctccggat aaatcgcatgcgcacttaggtcttaatgaaacaatagagagtttcgaaat cTAAGCctatcagctgtgttttaaacattcctTTATTTGAAATCTTCATT GCTCATTCATCgtttgtgaaagttgtctattatgtttaaaccttttaata agcaattcccggtggaggttactagtggccgctatagcagtgcctataga ccaagagtaagacCTAaataaaagcctggagctgctctattgtgtagact aaatAAAAGTTTAATTCAAAATAGCTCAAAAACTGGAagagctttttaga taatcctttttttatttgtttcgtattttttttacagagttttatttgac caaaatgaaacactcaaacattgtaacaaaaaagtcgaaaacatctcggg aaaggtgtattgcctTTAGGcgtgaaaaaaagactgggacggtttttaGG GttgtaaaacggacaaaaagaTGCCCGTGTGTCAATtgacggctacggtc gaaaaggtgtattgcattttttaaaagaatcatcaaaacataaaagcACC CGTTTTGTCTGATTGTCAGTATGACAGAAGAATGTCTTCTGATGGGTAAA AAATTGCATTGCTCACATGTAGGTATATAGACTGGCTTTAAATACATTGG ACGATGAAAGGAATTGGAGGCCTTCTATGTATATggtgttgtttttttgt atatttcctaaaaatctagtttttttgtatgagttttttttttcgatgtt GTGTTGCTTCCAAGAATAAATCAATGAGCGTGGTAAGCGTTTTTAACGGC ACTGTAGGGAACTACCACTATCAACCTCGTGTGTTGTCTTTTTGATGGTG TTTTTGCAActgatgttttttctttaataGATATCGAGAaatcataattt atttatttttgcgaTTTCCAGATACTTTCTATTCTGGCCTGCAAAATACA CCAGTGttcgaaattcgaaaaaaaattagcacCCATATAATTCGGGCTCC TTTATTGATATACTCACTAAAAATGTattaacaagtgctttgactaaaaa aatcgagtgaTCTCAAAATCCCCCTAACTAGGATGTTGCACCGTGTCacg tagacgatgttatcgtccgttacagtgatagtaaaggcggcggaaaaatg gcggtatgacGTTATGGCgatatacggaaaaaaatcggcgggagagtttc gaagaaacggacgataactctttggcataaatttttttttgcggttttgc ttgGACTAACCAGTGAGACTGGTTAGTCGCTCCGTGGTGAAAACCGCCTA AGTTTAAAGGCCGAGCTTGGTTCAAACGATCAAAAACACGCTGGTCTCAG GGAAGAAGACACAAGGACAAGATGCAAGATGGATCTattatggatttttt cttcttggttcatttgttttattgagactACAAGATAACTTAGCTGAAGG GAGTACTTATTCCTCAAGTATGCTTCTGTAGAAGCTGTTTTCAACTGAAG TCTACATACTGACATTCAGCAAAAAGACACAGAGAAACAAAGTAGGTAAG TCAGtttgtatatttcttatgaATCCTATGAATCACAGGCAGTGTTTCAT TAGATATGTGAATACCCTCATATCTCCActcttaaaaagttattttcatc tggtgttagcagttctttgactactttgaaaaatgtcaaacaaagtACTT ATTGTCAATTGTGGACTTTAAAAGACTGCTTTTAATATACTTCTTGTTCG aaaactttcacattttctcattttgatttgaattgtcgAGAAGTTCAGTT ACCTAGTCGTACCtgtaaaaattatcagattattattctaaattttctag gtaAGAATCAGAAATTCAGAAATGGGATGCATGGGAAAATAATGAGAATA TGTGTGGCAGTAATTTGCAGAGAGCACAaccgaaatgaaatatttggcac agtATCCTGATGGTTTATTATTGAGATTAAGACTTGCCATCACGACGTCC TATGGTATTATTTGAGAAAATGCCTTGCAACGTCCtggtataatttgaga ttataacttggaatatttcacttcacgtcctggtttaatttgggattata acttggaatatttcacttcacgccctggtttaatttgggattataacttg gaatatttcacttgacgtcctggtacaatttgagattataacttgcaata tttcacttgacgtcctggtttaatttgAAACTATAACTTATTTCACCAAC GCCCTGGTATAAATTGAGACTGTTACTGAAATATGTTATCATGATATGCA atttttcacttgacgtcctgatataatttgagattatgacttggaaaaat TTACATCAGCCTTCTGGAATTAGTCGCGACTGTAATACAGTATTGTCGGA AGACAGTTTAGAATCATTTTTTATCATGATTGAATTACCTATTTAtcagt ttttgtaaataagaaatTTATTGTCATTTAAATCTGCCTCAAGCTTTTTA CTAATTGGTACttttccattttaagctaatttctggggatttcttaactt ttcttctatttcatcctcattttttAACGTCTCTTTTTGGGTAGAATCAA AGCAAGATCAACATACTGCAAAGCTTACAAGCtggaacttttttactttt tccctgcaaaagttatcataagatttttcatccactactgtaaatttttt tatcaaagaaaacaGGAAACATTGTGGTCACACtagagattttaattttt ataaaatcggATAACAATAGGTAGAAGCAAAATTCTTTTCAGTTACGATC TCAAATCAATTCCGGTCTGAaaagttttgagttttttcttctcttgctcA AGCCAGACACAAAAGACTTCattgtttaaattttaaaacattttcgagGT GCCCCCGAGCTCCTcttttctgttttgaattttaaaacaatggaCCTCtc agaaaaatgcaaaatgcTATCTGGTTGATAATCGTTTCCATAAAAGAAGT AGTGTATCATTCATACAGAATATAATGGGGTGGGTGTGGTGATATAAATA AACGTGAGAAGATTTCTCACACACAAATCATTTCAAAGAAAGCTGTGCAC TGTTTCTGTGTGCAAAGTGTTGAGTTTGTGAAGCGAAGCAAAATGAATTA TAACAATTATTGTGGTCCAGGTTACAAACCTACGTATTATCCTGTACCAA GTCACCTTAACGAAATGCCACCaatgcccggggggggtactacccttgtc gaccgacgggggtgctccgccgaagttcgaaaaatggaccctacgtggga ctcgaaatttgcgaaaaaagtgaccctgaatgggactgaaattccaaaat tttctcaaattttctacttttcaaattttctactttttccccaaattttc caaaaaaggcaccctacgagggactgatttttctgttttggtgtttttgc gaccctacctgggactcatggaggttaaaaaaggtaccctgaccagcgga gcatccccgtaacccatcttgccttagtacccccccccccccccccccgg gcaccAATGGCATTACAACAAATGGTATCTTCACAAATACCGCCGATGCA ACCCTTTCCACCTCAGCAAATGGTACCTCCAATGTTTCCACAACAAGTCG TTCCACACCAAGCTCCTCAAACACAACCTCAACCAAAGAAAATTCGTTTc accaaaacacaaaaacatatACTAATCACGCAATGGTGCGAAAATTTCAA CGAAATTCAATCAAGTCGCTGTAACCAGGTTTGGCCGGACATcgtgaaaa aagtttcaaagcatGGACAAccgaaaaatctaaatcaatgCAAGCAAAAG ATATGGGGAATGAAAGACAAATATCATAAATGCAAAAAGCTCATGAACGA ATCAACTAGTGGAGCCGCTGTTAAAAAGTGtgaatattttgatgatattG ACAAAGTGTTATCCGACAGAGATGTTGAAAATCTACCTGAATTTTTTGAA GTCGGCGCAGGAAACGAGTTAGAGCCTTCTGAGAACTTTGATGTAACCAC ACCACCAGCAGTTGAGAAAGATGATGCGTCGGGCATTGAACCTTGCAGTG CAAGTTCAGCTATCAAGAGAAAACTTATCGAAGAAAACGAGACACAAGAT GACTTAGATAGTTCACTAGAATATGTGAAACAGTTAGAAACTGACGTGCG TAAACATTCCGCCAAGAAAGttccaaagaaagaaaaaccgaAAACATTCC AGGAACAGCTTATCGAAATGCAAAAGGAGcaaattaaagtttttgagaga agtgaagaaaactttcaaaaatttcaactaTCAATGCACCAAAAACAGCT TGAGGCTGAAGccaaagacaaagaaaaagaaagagagtttttcttaaaat ttggacAGATATTTGCCGGTAATAAagacaataacaacaacaacaaataa cttttttaagttcagaaaaattcttttgttaaaaacgGTATTATTACAGT AGTACGCAGTagtatcttttgaaattttacattgaCACGAATTGGCACTT GTCACTTCGATCACTTGTCACGGACAGTATTCTGGGAGCCCAGATTAGGA TTTTTAtcatagtttttcttttgacatGTCGTTTATTGATTTAAATAGTT GGTTAATGAGATACGAGAAGTATTTCCATTAGGATTTCGATCATAATTCT GCCGTCTTCTTTGTCTTGACTGTCTCTCttgtctcaaaatattttcgagA ACACCATCCTCGTCTGTATAAGTTTCATTGTTCATTTGACAAAAATTGTG TAGAGTGACGCAGGCGATTGTCACAGCAGCGACATTTTCAATCCTATTAT CAAGTCGTTTGAGTAAGATTCTCCATCGAGCTTTTAAGATCCCAAATGCT CTCTCGACATGAACCCGACCACTCGATAATTTTCGGTTAAAAACACGTTG ATCTCTTGTTAGTCCTGGTCCGAATTGGTGTGGTGTGATTAGCCATGATA ATAAGGGATAGGCACCGTCTCCGAGGACAAGGGGTCTTATTTCTGAATCA TCGATTACGTCAATAGGTTTCGtcaaaatttcttgattttcggCCCTTCT AAAGAGTGAGGAGTTTCGAAGGTTTCTAGCGTCGTGACAACTACCTGGAA ATCCCGTTGCAGCatctaaaaacattaaatttgccCCAACTAACCCTTGT ACTGATACTGTGTAGCACTGTTTCCTACTGTAATAGTCAGCTTTCGATTC AACACTGGGAGCAGATATTGGGATGTGAGTTCCATCCAAAGCGCCAACTA CCTGGGGAAATTCGGTTTGGAAGTTCATCTTAAATTCTTCTATCGCCTTA GCAGTATCTCTTCTTGTTTGAGGAAATTTGATAAACCTTTGGGAGAGTCT CGTTAGTTCTAAACAAAATTCCTTTGTTATTTGTACTGCCGTTGAGCTTC CAACGGCAAATGTTTTTGCGACAGTCCTAAAGGAGTTTCCAGTTGCCAGC CTCCATAAAGCAATCGCTACTCTTTTTTCTATGGGTATTGCTCTGCGTAA CTGTGTGTCACGTTTTTCTAATCTTGGCCGAACAAGTGCTACTAACGACA GAAAGGTCTCCCGTGACATTCGAAAATCGTTACgccaaaaatgattaaaa atctgATCTGCCTGCATACGCGAAAACCAAAACTCTTGTCTGGGGTAAGC CCATAACGAACGTGCTCTACGAACTCTTGATTGTAGCAAAGAAGTACGCA TGATGGATGACAAAAAGAATCTTCTAGTTAACGAGCGATGATGGGATATT GcgtttttgaaacaaattttgctAAAACGTCGTTTTTTATGCTTCTTTTG ATAGTGCTTGAGAAGGAGTAGAAGTAGTGCTTTTGATTCGGTGTCCATAA TGTAAAAGGTCAAAAAGTTTGAATGAGTTTGTTTATTAATTTCCTGGTAA GagaaaaacaaactgaaaacTAATAGAGAAAAGCACTATTGAGAAGCTCT ATTGTTAAAaaccattttaaaatttttaaaatttcatagtGTGACTACGA TGAAAGTCACAAATTCGAAATTACAAGTATTTATAACTGTTTATAAAACT GTCAATGATTTGTATACATATCCTTTGTCTGGTAGTAATGGTAGTGGGGA GAATATACTATAGCTTTTTATTTACACGGACTTTAATATATAAAAGGGGT AAACATAAGGATATAatcctcaggcaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaaaac aaacttacatgatttgatgttttttaagaaatttataaggtgaaagttta gatagatatccttgttgcaaagaaattactagcttattaaaaaatgactg tttataaaaattgttttctaagaaaagaaagtgTAGTTCCAAGAAACTAC AAAGGGAATGAAAGGAAGAGGGTCTCCAAAGAGAACTATAATATTTCTTG GAATCCCTCTTTTATCTCAGTTTCTCTCCcgcctctttttttttgttttg attttttcgaataccGAACACAGTTGGCCTCGCATACGGAAACTCGAATT CGTACGACTTgggctgtttttgtattttgtaccaaaatcgtatagtctaa gactggcaactctaccgactgtaaactcttttcggcaaaaagatccgttt gcgaattttcttcggctttgggcatttttcttagatagtgattcgtctta cactatagcatagtctacgtGTCACGTAGCTTTGAACCTTTTCTACATAT TTACGTTTAGAAAGTCATGTCCTGTACAAGAGCTTGCATGCGTCAAGGTA TGATAATAGTACACAGTCTCTTTAACTGGAACCTCTATAACTGGAAGATC TGAATTCGACGTTTTCTCGTTCCTTCAGTTGACAATGCCATGCTAGATGC ACACGCTGACCCTCCTACTCTAATAAACATTTCACCTAACATGTCTCATA CCCAGATCCTGCACTTGACAGAAGAGGTTTAGTTGCTTTACAAGTTTTTT ACCCTTAGATTGTTTAGGCCGAAGCTCACATGAGTCATGCTATCATCtac ccccccccaaaaaaaaaaaattctttgcatTACAGTAATACCTATAGATA TAAACCCACGGCATACCCTTTGTATACTCTCCGCGAATTGCTGACTAGGT TTCTGTTTTAATTCTAAATTCCTTGGAGTAAAGTGATATCTAAATACATT TCACAAGTCTTTATGTTTTGAAAGCCTTAGCCTACGCTAATAGATTGAGA AATGTCTTCCTTCAATTACTAGAATTACTAAATATGACCTTTTTCGTCAG CATAAATTACATGAATTGTAATGCTTGTTTAAATTGTTTAGATAGGGCTT TATTGAATATCAAATTGAGTAATAAGTTATCTTTACAGAATTTCCCTCGG ATTCGGACGATTCCTCTGAAAACAGAATAGCGTCTCcgtctgactgaaac caacacaaCCGGGGCTCATTGGAAGTTCTGAAGCCGATACCGATTCTCCA CAAACCTGCAACTCGACTCCAAGCAAAGGGTTTTTCTTAGGAGAAGAGCG CGGATTCTAAACTGTTCGAACCAGAACCGGCCTCTAAATTCATACTGCAA TCTTCCGGCGTATTTGTCTCGACAACTTAGTACGACAAGAGAAAATTCGA AGGCCTTCAGAAGCCagttgaaatttctgaaagttgagtgaacatcaaaa tttataatttgttattatggagcgaagaaagatttttgcatgctaatact ttgggaagttgcttttcatatgattatgaagtgagtgtcttgttatcatt tttaatgttcttaagatgttcttattttagccatttttaagtatttttgt caattttcctaagaaattcggtgttttagagtccacagagccgtaaaatg ttcttaacattttgacgatcgaagccttatgctcttatatagtttgttct tatcaaaaatgTGTAATGTCAATTTCTGTCAGGACGTCTTTGTGTCAAGT AAGTAAAACAAACTCTTTGTCTTTACCACTGGGAAGATTATAGGACAAGG TTGTACCATTTTCCGAGAACATAACGAATTTCTTGTTAATGAAAGTCTTC CTAGAACCGCGTCATTTCTTTGTAGTACAGTACTTTTTTAGATGTAGCAA GTTCTTCTGCGTTCAGTGTTTTCCTGTTTTGCGAAGATAGTGAATGTTCA GTTGAGATCTTCTATTTTTCTTGGATGGAAATCAACAGTGGTTGTTTTTC TCTGTCACACTGTCAACAGTTTGTTTAAGTTTTTCATCCAACTCGTGCAA ATTTTGGCCATATGTTATAGAATTTGTTTTTGATGTCGTTGGTTATAGGT TCTTTTTCTTTGTCACACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTCATCTAACT CATGCAATTTTCGGCCGTATATcatagaatttatttttgatgtcgTTGGT TATAGTTTCCTTTTCTTTGTTACACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTTC ATCTAACTCATGCAAATTTTGGTCGTATATCATAGAATTTGTTTTTGATG TCGTTGGTTATAGTTTCCTTTTCTTTGTCACACTGTCAACAGTTTGTTTG AGTTTTTCATCTAACTCCCGCAAATTTTGGCCGTATATCAtagaatttgt ttttaaagtcgTTGGTTTTAGGCTCCTTTTCTTTGTTACACTGTCAACAG TTTGTTTGAGTTTTTCATCTAACTCATGCAAATTTTGGTCGTATATCATA GAATTTGTTTTTGATGTCGTTGGTTATAGGTTCCTTTTCTTTGTTACACT GTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTTCATCTAACTCATGCAAACTTTGGCCAT ATATCATAGAATTTGTTTTTGATGTCGTGGGTTATAGTTTCCTTTTCTTT GTCACACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTTCATCTAACTCCCGCAAATT TTGGCCGTATATCATAGAAATTGTTTTTAAAGTCGTTGGTTTTAAACTCC TTTTCTTTGTTACACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTTCATCTAACTCA TGCAAATTTTGGTCGTATATCATAGAATTTGTTTTTGATGTCGTTGGTTA TAGGTTCCTTTTCTTTGTTACACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTTCAT CTAACTCATGCAAATTTTGGCCATATATCATAGAATTTGTTTTTGATGTC GTTGGATATAGGTTCCTTTTCTTTGTCACACTGTCAACAGTTTGTTTGAG TTTTTCATCTAACTCGTGCAAATTTTGGCCATATGTCATAGAATTTGTTT TTGATGTCGTTGGTTATAGTTTCCTTTTCTTTGTCACACTGTCAACAGTT TGTTTGAGTTTTTCATCTAACTCGTGCAAATTTTGGCCATATGTCATAGA ATTCGTTTTTAAAGTCGTTGGTTTTAGGCTCCTTTTCTTTGTTACACTGT CAACAGTTTGTTTGAGTTTTTCATCTAACTCATGCAAATTTTGGCCATAT ATCATAGAATTTGTTTTGATGTCGTTGGATATAGGTTTCCTTTTCTTTGT CACACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTTCATCTAACTCATGCAAATGTT GGCCATATGTCGTAGAATTTGTTTTTGATGTCGTTGGTTATAGTTTCCTT TTCTTTGTCACACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTTCATCTAACTCACG CAAATTTTGGCCGTATATcatagaatttatttttaaagtcgTTGGTTTTA GGCTCCTTTTCTTTGTTACACTGTCAACAGTTTGTTCGAGTTTTTCATCT AACTCATGCAAATTTTGGCTGTATATCATAGAATTTGTTTTTGATGTCGT TGGTTATAGGTTCCTTTTCTTTGTTACACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTT TTTCATCTAACTCATGCAAATTTTGGCCATATATCATAGAATTTGTTTTT GATGTCGTTGGATATAGGTTCCTTTTCTTTGTCACACTGTCAACAGTTTG TTTGAGTTTTTCATCTAACTCCCGCAAATTTTGGCCGTATATCATAGAAA TTGTTTTTAAAGTCGTTGGTTTTAAACTCCTTTTCTTTGTTACACTGTCA ACAGTTTGTTTGAGTTTTTCATCTAACTCATGCAAATTTTGGTCGTATAT CATAGAATTTGTTTTTGATGTCGTTGGTTATAGGTTCCTTTCCTTTGTTA CACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTTCATCTAACTCATGCAAATTTTGG CCATATATCATAGAATTTGTTTTTGATGTCGTTGGATATAGGTTCCTTTT CTTTGTCACACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTTCATCTAACTCGTGCA AATTTTGGCCATATGTCATAGAATTTGTTTTTGATGTCGTTGGTTATAGT TTCCTTTTCTTTGTCACACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTTCATCTAA CTCGTGCAAATTTTGGCCATATGTCAtagaatttgtttttaaagtcgTTG GTTTTAGGCTCCTTTTCTTTGTTACACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTT TCATCTAACTCATGCAAATTTTGGCCATATATCATAGAATTTGTTTTGAT GTCGTTGGATATAGGTTCCTTTTCTTTGTCACACTGTCAACAGTTTGTTT GAGTTTTTCATCTAACTCATGCAAATGTTGGCCATATGTCGTAGAATTTG TTTTTGATGTCGTTGGTTATAGTTTCCTTTTCTTTGTCACACTGTCAACA GTTTGTTTGAGTTTTTCATCTAACTCACGCAAATTTTGGCCGTATATcat agaatttatttttaaagtcgTTGGTTTTAGGCTCCTTTTCTTTGTTACAC TGTCAACAGTTTGTTCGAGTTTTTCATCTAACTCATGCAAATTTTGGCTG TATATCATAGAATTTGTTTTTGATGTCGTTGGTTATAGGTTCCTTTTCTT TGTTACACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTTCATCTAACTCATGCAAAT TTTGGCCATATATCATAGAATTTGTTTTTGATGTCGTTGGATATAGGTTC CTTTTCTTTGTCACACTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTTCATCTAACTC ATGCAAATTTTGGCCATATGTCATAGAATTTGTTTTTGATGTCGTTGGTT ataggttttttttctttgttacgCTGTCAACAGTTTGTTTGAGTTTTTCA TCTAACTCATGCAAATTTTGGCCATATGTCatagaatttgttttaaaagt cGCTTGGTTTtaggttcttttgtttttgaatttgaaagtaTTCTAGTGAC TTCAAAAGCATGCAATAGTAAAGAATAGTTCTACATTAGAAATACCAATT TTCAGGTAACTCTTTTGCTGTcaagttttttatgttttgtttttgcggtg tttaatgaaaattattttcgttattttggGCACGAATTGCATAGTCCTAT AAGTTTTCCCTATGAAGGGTAAATTATTCTTTATGATGTACAAACTTTCT TTATCGCTATCTAGAGAATGTACCAGAAAAAAGCGGAATGTACCAGTACA AGCTAGGtcagttttaatttcaatttatttcgGACATTACATCATCAATA GCCAATCAGGACTCGCAATATGATGAAATATTTCATCCCATGGAAACTTT TGTTTACTAAAtaaatttgtgaaaatcttAATGTGTATTCACTATATTTA CCATAGTAAATAAATTATGCCACGTCATAATATTCGATTATAGTTTCATC TCATGATTTCATTGTTTAAAAGTTCAAAGTCCGCATAAATTAACATATTT AAGTACAACATTTCTCCAAGGAACAGTCATAAATTATCGAGACTTGAAAG GAATAAGTTAAATACTAAGAAAGGAATTATTTCAGAGAACTTTTGTAATC ATGGCTAATGAATCTAAACGAGTAATTGAAAACACAGACACCACCACAca ccattatggaaatgaaCATGACTATCAAGAAATCTTATTGGATAACATTC AACTTAAACAAACTGTGGACAACTTATTGGCGAGATTAAATGCAGCTGAG AAGAGATCCAAGGAGCAATATCAAGAACTTCAAAAGGAGATTGCTGGATG CTCAAATAAAGTGACTAGTGGTACACTTGAGAAGAGCCCAATTCCTGATT TCAACATTTTAACAGAAGCAGTAGaaaaaaaTACAGAGAGTTTTAGTGAT TTGGATTTGAAATTCCAACTCCATGAGAACTCGGTCAATGACGGGCATCT TGTTTGGAAGATCAACAATTTTCAACAACGAACGACTGATGCAATTATTG GCAAGACAAGAGCATTGCATTCCGCTCCTTGCTTCACGAGCAAGTATGGG TACAAGTTTTGCCTAAGGCTGTATCTACACGGTGATGGTATGGGTAAAGG AACACACTTGTCACTTTTCTTGGTTCTTATGAAATCAGAATATGACAACA TTTTGGAATGgcctttccaaaagaaaatcaaattcactTTGATCAATCAA GAGGACAGAAGTAAAGATCATGTGGAGAAAATGTTTCCAAACAAAGATtc atcaagctttcagaaaccGAAAAAAGATATGAACATTGCTTCAGGTTGTC CAATGTTTATGAATTTGAACAGATTGCAGCCTGAAGGATTTTTAAAGGAC GACTCTTTATTTGTCGAGGTtaaaatagattaaatttttacACCGTTTTG TGATCTCAAGAAATAGTAACttattaatttaaatattttcataattatta tttattattatttttcaaaaatgaaaagtcGATACACATAAACATTTTAC CCTGatttgtaatttcgagaaattgtaatttattgatttagatatatttt ttataattaatatttattaatattttttcaaaattgaaaagtcAATACAC CAAACATTTTGCAACATATCTTATAATTCTCTCTTTTATATTCAAGTTCC ATTATTAtcacacacccccttctcatagacccacttccactggaaaaaat ggccaaaaaatccTCCCCGGTAGAAAATTTTActacaatttttgtccccg ctgaaaataatcaaataaaaccaATTCTCATTAGGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000084_pilon:1277599..1294734+

>MSTRG.11615.3.p1 ID=MSTRG.11615.3.p1|Name=MSTRG.11615.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1554bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:1277599..1294734+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgGACAAGTATGGATCAGAGAGCATTGACTTCTATCCAACGAacaacaa
attcaacaaaggGATGAACCAGCAATATCAAGAAACATTTCTGGAGAATC
AACAACTCAAACAAACTGTAGACATATTGAACAAGAGACTGCAAGCTGTC
GAAGAACAGTCTAGACTACAGTATAATGACCTGTTGGAAGCAATGGCGCA
GTTATCCAAGAAGATCAACGGAGCTGACAATAATGGGAATGTCCAAGAAG
GTGCGGTTGAGCAGATACAAAACAACACTGAAAACCTTGCAGATCTTGAC
TTGAAATTCCAACTCCATGAGAACTCGGTCAATGACGGCCATCTTGTTTG
GAAGATCAACAATTTTCAGCAACGAACAACTGATGCAATTATTGGCAAGA
CAAGAGCATTACATTCCGCCCCTTGCTTTACGAGCAAGTATGGATACAAG
TTCTGTTTAAGGCTGTATCTACACGGTGATGGTATGGGTAAAGGAACACA
CTTGTCACTTTTCTTGGTTCTTATGAAATCAGAATATGACAACATTTTGG
AATGgcctttccaaaagaaaatcaaattcactTTGATCAATCAAGAGGAC
AGAAGTAAAGATCATGTGGAGAAAATGTTTCCAAACAAAGATtcatcaag
ctttcagaaaccGAAAAAAGATATGAACATTGCTTCAGGTTGTCCAATGT
TTATGAATTTGAACAGATTGCAGCCTGAAGGATTTTTAAAGGACGACTCT
TTATTTGTCGAGGTtaaaatagattaaatgGACAAGTATGGATCAGAGAG
CATTGACTTCTATCCAACGAacaacaaattcaacaaaggGATGAACCAGC
AATATCAAGAAACATTTCTGGAGAATCAACAACTCAAACAAACTGTAGAC
ATATTGAACAAGAGACTGCAAGCTGTCGAAGAACAGTCTAGACTACAGTA
TAATGACCTGTTGGAAGCAATGGCGCAGTTATCCAAGAAGATCAACGGAG
CTGACAATAATGGGAATGTCCAAGAAGGTGCGGTTGAGCAGATACAAAAC
AACACTGAAAACCTTGCAGATCTTGACTTGAAATTCCAACTCCATGAGAA
CTCGGTCAATGACGGCCATCTTGTTTGGAAGATCAACAATTTTCAGCAAC
GAACAACTGATGCAATTATTGGCAAGACAAGAGCATTACATTCCGCCCCT
TGCTTTACGAGCAAGTATGGATACAAGTTCTGTTTAAGGCTGTATCTACA
CGGTGATGGTATGGGTAAAGGAACACACTTGTCACTTTTCTTGGTTCTTA
TGAAATCAGAATATGACAACATTTTGGAATGgcctttccaaaagaaaatc
aaattcactTTGATCAATCAAGAGGACAGAAGTAAAGATCATGTGGAGAA
AATGTTTCCAAACAAAGATtcatcaagctttcagaaaccGAAAAAAGATA
TGAACATTGCTTCAGGTTGTCCAATGTTTATGAATTTGAACAGATTGCAG
CCTGAAGGATTTTTAAAGGACGACTCTTTATTTGTCGAGGTtaaaataga
ttaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11615MSTRG.11615Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11615.3.p1.exon1MSTRG.11615.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11615.3.p1.exon2MSTRG.11615.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11615.3.p1MSTRG.11615.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000084_pilongenomesc0000084_pilon:1277599..1294734 +