MSTRG.11607.8.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11607.8.p1
Unique NameMSTRG.11607.8.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000084_pilon:1160988..1184379-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11607.8.p1 ID=MSTRG.11607.8.p1|Name=MSTRG.11607.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=23392bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:1160988..1184379- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCGTTGTGTGTATTGAATTTTTTATTCTTTGGTTTATAAATCGTGTGTAT AGAGGCGTTTGTTATGTTTTTTTATGTCTGAGTGTATGTAGAAAAAGAGA AAGTGGAAAATGTGGTGAAAAGAGCAGTTAGAAGAAGAAGTTTTAGTTTT TTGTGTTTTGTTTATCTGAAAAAGAAAATGTCTGCAGAAGATTCTATGGA AGATGAGGATAAAATGAACAGAAAAAGTATGACTGTCAGCTTTAATTATT TGGACTTTCTGCAAGTGAAAATACTGATAATACTGACTTTATTATTATGT TACCTAGAAAATTCTTTTGGTTGGAGAATTAACATTCGAGACTTGTCATC TTCGAAATATTAATTACCTTAGTTAGGTTGAATCGGGTTTCAGTGAAAGT TATTTTTGTAGGACGTACATATATATAAAGTTTAAATTGAATTTTTTAAA CTTCGCTGTAACAATAATTTCTTCTTTTTTCTTTTTCATGTTCATCTTTC ACTCAACATTACAGTCAGCAAAGAGGTATGTATTCTTTTGTTTTTCTTTC ACTCTACAATACACATTTTTTATGAGAACGTCAAAATGGCGAAACTCTTC AGGTGTTCTTCAACTTCTTGAATTTCAAGCCTGAAAATGTTATTTTAAAA AAGTGCATTGTTTTGCTTGTTTTTCATTTTCAGACTCTTCATTTCGGTAA ACAAGGAGATTTTGGTATTGAGAATTTCTAAAAAACTTCCTTGAATTTCA AGTTTTTTTTATAAGAACAAACTATATAATAAGGCCAAAATGTTAAGAGC AAGTTAAGAACATTTTAAGGCTTTGTGGACTCAAAAACACCCTATTTCTT AGGAAAATGTTCACAAAACGGTCAAAATAAGAACATGTTAAGAACATTTT TAGGCTTAAAACTCAAAAGTTAAGAACATCCGAAGCCTTTAAGAATTTTG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000084_pilon:1160988..1184379-

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CATTGCCAAAGCTGATACATTAACCAAGAAAGAAGTCAAAGAACTTAAAC
AGAGGATTCTTAGAGAAATTTATGAAAATCAAATTCAAATTTATCAATTC
CCTGAGGCGGATGAAGAAGAAGATGATGAAGAATTTATAGCCGTTAATAA
AGAATTAAAATTGGTCTCCGATAGTCAGTTATATCGATGAACAATACGAA
GCATATTTACGAGACGAATCGGGTTTAAATCGACGAAACATCATCGATAA
TCGAGTACATTGTTGTCTATATTTCATCAATCCATGCGGTCATGGGTAAA
TCGACACTGGTAGACAGTTTATTCTTAACATCATTATATTCTGAGCGTGA
AACACTAACGGCCGTCAATCGAATCAAAAGAACCGTCTCCGTCTCACAAT
CAACCGTCGAAATCGAAGAAAAAGGCGTCAAACTGAAGCTGACGGTAGTT
GATACTCCTGGATTTGGTGACTCGATCGATAATAGCGACAGGATGCTGGT
ATTTATGTTGGGTTTGCGAACCTTCCAAATCAAGTCCATCGGAAATCAGT
TAAGCGTGGTTTTGAGTTTACCCTTATGGTTGTCGGAGAATCTGGCCTTG
TCAGCAAAGAGATGTCTGCAGAAGATTCTATGGAAGATGAGGATAAAATG
AACAGAAAAATTGAGACGTATGCAAGAAATGATCGCCAAAATGCAAGCTT
CTATGCTACAACAGCAACAAAACGTTTCCTAGTGGTGGTGGTGGTCGCGC
CAGTCAAGAACTCGACAGTCGAGATGCACTTCTCATGGAAAAAGAGGCTG
AAGACGCACATGCAAGATTTGAAAGACGTCACACAAGACACACATTACGA
AAATTACAGAGCGAAGAAATTGGCTTCAGGAGAACCACTCGAAGTATCAG
AAAATCGAAAATCCAGCACATTGTGACTTCACCATGTTGAGGAATATGTT
AATCAGAATAGCGTACCATTCGCTGTAGTTGGTAGCAATACAGTTTACGA
AGTGAATGGTAAAAAAGTCCGTGGAAGAATCTATCCATGGGGCGTTGTTG
ATACCTCAAACCACAAGATGTGGCCGTTATGAAATGTTTACATGATAAAG
TCAACATCGTTCCCGTCATTGCCAAAGCTGATACATTAACCAAGAAAGAA
GTCAAAGAACTTAAACAGAGGATTCTTAGAGAAATTTATGAAAATCAAAT
TCAAATTTATCAATTCCCTGAGGCGGATGAAGAAGAAGATGATGAAGAAT
TTATAGCCGTTAATAAAGAATTAAAATTGGTCTCCGATAGTCAGTTATAT
CGATGAACAATACGAAGCATATTTACGAGACGAATCGGGTTTAAATCGAC
GAAACATCATCGATAATCGAGTACATTGTTGTCTATATTTCATCAATCCA
TGCGGTCATGGGTAAATCGACACTGGTAGACAGTTTATTCTTAACATCAT
TATATTCTGAGCGTGAAACACTAACGGCCGTCAATCGAATCAAAAGAACC
GTCTCCGTCTCACAATCAACCGTCGAAATCGAAGAAAAAGGCGTCAAACT
GAAGCTGACGGTAGTTGATACTCCTGGATTTGGTGACTCGATCGATAATA
GCGACAGGATGCTGGTATTTATGTTGGGTTTGCGAACCTTCCAAATCAAG
TCCATCGGAAATCAGTTAAGCGTGGTTTTGAGTTTACCCTTATGGTTGTC
GGAGAATCTGGCCTTGTCAGCAAAGAGATGTCTGCAGAAGATTCTATGGA
AGATGAGGATAAAATGAACAGAAAAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11607MSTRG.11607Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11607.8.p1.exon11MSTRG.11607.8.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11607.8.p1.exon10MSTRG.11607.8.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11607.8.p1.exon9MSTRG.11607.8.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11607.8.p1.exon8MSTRG.11607.8.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11607.8.p1.exon7MSTRG.11607.8.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11607.8.p1.exon6MSTRG.11607.8.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11607.8.p1.exon5MSTRG.11607.8.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11607.8.p1.exon4MSTRG.11607.8.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11607.8.p1.exon3MSTRG.11607.8.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11607.8.p1.exon2MSTRG.11607.8.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11607.8.p1.exon1MSTRG.11607.8.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11607.8.p1MSTRG.11607.8.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000084_pilongenomesc0000084_pilon:1160988..1184379 -