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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000084_pilon:1057515..1069736+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11593.1.p1 ID=MSTRG.11593.1.p1|Name=MSTRG.11593.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12222bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:1057515..1069736+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTAAGAAATACTTCGGATGTGAGTCGACGAACCCTTTGGCTTTTGCGAAA
agggacaatttttttttctcttgttgTTTTAGTAATACATGTAGCATATG
AGATAGAGAAAGATTTCATACATTCTGacttaaatgaaaattttgtatgt
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CCTTTCCTGCACTAAGATTCCTCTGCCAGAACTCCGGGTAGTTGAAAACG
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ATATTTCATATCAGGACAGTGTCTGCCTATTGTTATATTATGCTGATATT
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aaaccatggttggccctcgtggtataataataagaaaacgcttcctacgg
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CAATTGTTATCAACGATCGGccttttatcttatcttatctagaatatttc
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aaattttctttccaataATCTTTTATGCAGGTTGAGACTTTATTGTAAAA
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tCCCATCCCTACTGAACTTTCTGACtcggaattcaaatccccagcaataa
aaaaacattaGGGATATtgatccccatcgagttttactccgttattttta
cccccatgGGCTGAAacatcctaccgggtctgtgagaaggggtgtgaTAA
AACCTGACCTAATGGGTTTTATTCTTGTCCTATGAAAACGgtgtaatttt
ttagaaataaaattaCGTGATGAATCGAGTGTCCGCTGAGAGACCTCACA
AATCTGAGGATATCTCGAGATCAAAGAGACAAGTATTGTTCACGTAATTA
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GCGGCGATAAAAATCAGATAAGATCTTTTTGACTCCTCGTGTATATAATA
TACTTCGTTTTTCATTCAATATCAACATGCtattcataatattcatgacg
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aaatctaaattaaatttggaaattttttgaaattaaaatttcagcaGACA
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ATTCATTTGATAGTTTTCTCTCTAAAGTTTTACAACCTGCAAagtatacc
cctgtctcactgaccCAAAATTTCACCCCCTTTGGTAAAAATAACCCtgg
gaaattaactttgatttcatttccattcggaattattgtaaaaaattgta
cTCTAAAACCATTCCAATTGgagtttttaagatttaaacaATAGATACTG
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AATAGTATCAACTATTGATTTAAATACCACAGATTGAAATGGTTCGATCT
ATAAGATGAATCATATGGAAGGTTAGAGGTAGTCACACGGACTAAGCTCT
ACCTAAACCACTTTATAAAGACGACCAGTTTAGAGGGCCAATTGCCTCTA
TCACTGCGACTTTATAAtaacattaaaaaaacttttaaggtGTTAAGGCT
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taAACCCTAGTTAAACAAAACTGCAGGTAGTAAATGAGCACGAATCTGTT
AGTGGATGCCAACATTCTAAGTAAACTCTGTCTCAATCCCTACGCTATGT
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AATTTGCACTCCCAAACCACCCCCACTGGATATTTTAACCTTGGAATTTT
TGttcaatcaaaataatttttatccccattgagattttaaTCGTAATTTT
CATCCccgctgtaggaaaaagtttcagggctgtgagacaggggtatcaAA
GAAcaattataagaacatctaaaaactTTGCGGGCTCTAGAACATGTAAT
TAATCAAAATACTCACAGAGGGCTAAAATTAGGAACAATTATTGCTTAAA
CCCctaaaaagctaagaacatcggaaggcttcaaaaatttttgaccttgt
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CAAATGCTAAAAGACGTTAATTATGTCTAGTGGTGGTGGACCTTATCAAC
ACAATAgtttggaatctaaagtcttaAAACGTTTTTGTGCagctcgagaa
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aatttacaacaagttatttcataatttggtcaaacttaaaatttgtAATC
TTTTCCTGTTTTACTTACTCATTCAAACTTTATTATACCGTATATAATCT
TTAAATGTAATGTTATTAAAACATTGACGCATCTTTTCTACATAATTATG
ATATTGTTCTTATCTTATTAACATAAATTACTAGCCATAGATGAGTTTAA
GGACACCCTGCTACAATGGAAGCCATCTTTCCAAGTTTGATGATTTAGAT
ACCTAGCTAGCACACAACTGATGTTTTCAACatccatataatgttagatg
aacgttgaaacaactttgTGTTCTAGCTGGGTACGGTGGACCGTGTAATT
ATACCCtctaaaaggggggggggtttgtacttttacgatgtgacgggatt
ggcccttttttagtacggtattacgggatttgacgaaaaaaaagacggaa
aaacggtattttacaatcagacggtgacggtattcggccttattttttgt
cattatgccggtatttgaacctgtacaaaccggtgtgacggtgttattac
ttttttcgattttcgggattccgggattcagcgaAAAtcttgacgggaaa
acggtatttcgaacccctacaaaccccccctaAAAGTCTAACAAAAACTT
AAGCAGCAAACCCAAggggggggTACAATCAgttccaaaatacttggcac
aaaagggaaattccccatgaaattttataaccacaaacgatttggaagca
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agacttaaaaccttaggatctgaggatccaaaagttcaaaaatggtccga
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aattcgatgaaaTTAAGTtaaaggcccgaaattgacattctcgctcgaac
ttaaaatttaaatggtAGAATAGGTAAGATTTGCAATATgctatggcact
gattgtaagGTTTGTAAGATGACGGGTATGTatccgagccaaagttcgat
TGTATTAATGCATAAATGTTAATTCTACAGTATACAGTATACAGGAGTGG
TATAGAAACCTAGAGCGCGTAGTAACCTATATAAACACCAGAGTCATCCA
TTCTTTATAAAACGAGAATTCCATCAAGGTTATAACAAGATTAAAAAGCA
TTTATAGAGAACAAGATTACATGTGACATAtgatttacatttttcaaatt
gtcGTCATAAATTGGTCTTCAAAATGTCTGTTTCGATCGGTTCTAATGGC
TAATGCGCTTTATATTCCCTAAATTCATAGCTGAGAAAATTAACAACAAC
AGAGTTTGAGTTTCCGAGAGAGAGATTGACCACATTATCTGTCTTAGGTT
TAAACATCGTAGTCGAATGAGCTACATTCATGCTACAGTTGCTTACAGTC
ACAGTAACCATCTCCATCGTCTCCGTCCTTAAAAGAAAGTCATTAGAGGT
TTtttacacaagatcactaaaaaagggaatagtttaggagaggcgtgata
aattcgggtggagtaagcagtggcggagatgtttacagtgttgttccaaa
actctaccgccacttttttcccgtaaaccgccctggcGCCCGAacttttt
cccgcgtttactgacctttaaacggaCAATAGCATCGTCTAAGGTTTTTC
ATGTATAGTTTAGTTACTATAATTTCCGCTATTATGATTGAAGAAAACGT
TTGAATCTGTAGAGGGGTCCTTTACGCAAATCGCATATTTGCTACCATAA
TGGCAGCCTTCTTACGGCGATTGGtttttttaactcatttttttatatag
aATAATACAGATAGGAGAAGCTTTATTAAGCAAATTTCTACTAGTAGAAC
TCATCTTTGCTTGGTGTCTTAAGATCTTGGTTATATCAGCTCAGATAAAA
TTTACACTTATTTCCTGATCTTCCCTTATAGTATACCTAGCTTGCAAAAC
TTTAATTCTGATATTCTATTTCTTATCTTTCAGTTGATGATTCCATCATT
ATTGGCAGTGGTAGTTTTAGGGACAAGACACTACAAATCTGTAAGTCGTA
GATTGTATTCCAAATTTATTAATACTTCTTATTGTTAATACTCTCAAATT
TAAATATGCTTCTAAGCTAAAGAGACATTTCTATTACCATTTTGAGCGAA
AACCAAACCAAATGGGCTCAATTGACGccattgaatattttaaaagcagt
attttaacacatttatgattttttcaaagatattccaaggataaatattt
tcaaatttccctgAGGAAATCTGCTTAAAAATGTAACAAGTGACTGACCC
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AGCAAAGGAAGAGTTTAGTGCAGGCTATCTTGACTGAGACatacgtgttt
ttttataagaacaaccaaaaatcttaaagccttcggatattcttaacttc
tagagttttaagcctaaaaatgttcttattttcaccattttgtgagtatt
tttgtctattttggtgttttagagcctcaaaatattcttaacttgttctt
aatatggCTTCGTGTATCACGAATCTATCAATCAAGTCAGATAAGACGGa
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acaTTCTTTAgataaagtaacaaaattgttttattactggttaacgacca
accaaatcaaataagagcttgtaaaaattcCATTTCGTCCCAATCAAGtc
tacaattttatttttaattttagttaCTATGCTTCGGTGCTTCCAACTTG
GGGGTCCTGATTTTATCCATCGTTCATACCGCAATTGTGTATAATGACGA
TAGTGACTACTGGAGCAAATGGGTTGATGCTTATAACGATGGTACTAAAT
GCGCTGTAAATTTAGCCAGCGGAAGATGCGAGTGTGATATCGATGGTACA
CGGCTCAGCGTTCGTAAGTCTTCTAGACTAAATATACTACTGTCTCACAG
TCCCGATAGAACTTTTTTCTGCAGTGGAAATGGGGTTTAACACAAAGCcc
atttcccagtggggctaaatTTTGTAGGGTATTGATGGCACTCTAAACCA
GCGTTCGTAAGTCTTCTAGACTAAAATCTACTTCTGGTTAAACGTAAATA
GAAACGTTGGCAACTTTTGATAACTCTGTTACCCTCAGCCGGTAAAAACC
TTTTAACACCCTTGCCCGAACCGAGTAATGGTTCTTTAATATAACTAAGT
ATTAATTAATGGTGCATAACGCTGACGTTACGTGGTAGAGTGCgatcaaa
gaaaaatatataacaagtctccataactcaaacatctacgggaaaatgaa
atttgttTGATTTCGAGATAAGGAgattggtttataaggcattgtagGGA
CCAGAACTtgttgagttaaggagacattagagttatagaggtttgagttg
AAGAGTTTCAACTATTGTTTTATACGGTCcggcgaccgtagtgcagtggt
agagcatccggctacggtttgcaaggttgtgggttcaacccccagccgga
tcataccaaagattcccaaaatagtacttgatgcttctctgcttgatgct
cggcaattaagagaagaatcaagggtaagtggagcaattcagggagaaag
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tcgggtcgcctccgactgcgatcgcagacttacttactttattaataact
ttgatttttttagcaTATGCTTGTGAGTTGATCAGTTTTGGATCAGATGT
CAACTGGATCTTATTTGGATTTTCAATTGTTTCCATTGTTCTTACTTTGT
GTGGTGTTATCATTACTCTCATTGGTTTTTGTCAAATGCCGCCCAAGGTG
AGGTTTTCAAGATAAATGATACCTTTTTAAGCCTTCAGAGCTGCTTTGAT
TGGAGTCCCAAACAGTCGGATAGCCAACAATAAAATTCGGAAAATTCAGA
CATTGTGTCATAAGATGATATTTTGTTTAAACGTGCCTCTTCGACTGTCA
TAATTAACCTCCCCCTGCTTCCCGAccacaatagcgagtttatgtatttg
agataaatcgagggggatggtataaagcaaagctgacatggggccgaaat
caccgtccactttactcgacgacggtaaaaacaaagataccgtcgtctgt
ttaggtgagcaaaggcgatataaaGCCGTACATCAattatcgactttgtt
ttgtatcgatttcacttaccgtcgccctcgatatcctccggtACATAAAC
TcggaaattaagaatatgctaagaataccaccatcatggaatttgtcAAT
TGATTCTAAGAATACCACTTTTAAAGCTTTCCACCTGTAAATTGTCAATA
actttatcggccctttttacaccggcccttatcggcgttatttttgggct
cgtggcttaataagggccggtgttaaaagggGACGGTATTCCCCAGCGGC
GATGCTAAGAcaaaaaaaatgctaaattctTGCTTGACGTATACATTTCA
TGTTAGATTTAGGCTGGCTTTGCAGGGGCTTTGCATCCTAGCCTAAGAAT
ACTAAGAATACTGTaggaatatttcaggatgattttccatccttaatgaa
atggaaaaacactattttcattccaaaaagcgtttttattctggtatcat
acaaattcattttttcattattttttagcCCGCCAAGAAATAAAATGATG
GCTTTAGAACTGAATACTATTGTTaatcaagaatattttttgcAGACATC
ATCATTAttgaaaaagtaataacttaCAGAGAAGAAacattgttgatttt
ttttatatttcaattgTGAAAATCGATGATGGTTCTATCCCATTACTAAA
TGTATGGCTTGATATTAAAATGGACTCCTTGAAGATGAAGTGAAACTTGG
TGATTGAGTAATTATGCTTTTAAGCGTTGAATGCTAAGTTTATGAAACGA
Ctttcattttcatagaatttttcaaattttaatattttcctcttttttta
tattcataacttgtaaaaaaaacttaaaaattttaatttttttctcaaaa
aaaaattaagatgcTGTTGTGACGGAATTAGCAAAAGAATTCgaggtttt
gaaaatttgtctagcttttcacggtaattgttcttagaaaattaaaaaga
atcaaaaattaaaaacttgggtacaaaattataaatcgtattgtttttat
tttatttttcactctaaaatcttgattttatttttgttatgcttctactg
tttgtttaTTCTTAGGTAAAAAATTATCGCACttttttttttCgggtaaa
aactttttttgttcaaaaatgacCTATAATTATTTGTACTtatgatgttt
ttattttaaatctttgttttttttcgtataaaaattttattctttaaata
tatattatatacatttatttCA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000084_pilon:1057515..1069736+ >MSTRG.11593.1.p1 ID=MSTRG.11593.1.p1|Name=MSTRG.11593.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2955bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:1057515..1069736+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTCAAGCTCGAAACGACTACAATGGCCTCGTCCAGAGGAAGACAGC
TATTGCATCATGTGTTTTTGGAATGTTGGAATTGTTAACTGCTATTATTA
TAGTTATCTGTGCTTTCGTTATTTTTGGTGGATTTTGTGAGAATTTGGAC
TGTGATTCCATTTCTAAAGGCATTGGATTATGGCTTGGTTTCCCGTTGAT
GATTCCATCATTATTGGCAGTGGTAGTTTTAGGGACAAGACACTACAAAT
CTttaCTATGCTTCGGTGCTTCCAACTTGGGGGTCCTGATTTTATCCATC
GTTCATACCGCAATTGTGTATAATGACGATAGTGACTACTGGAGCAAATG
GGTTGATGCTTATAACGATGGTACTAAATGCGCTGTAAATTTAGCCAGCG
GAAGATGCGAGTGTGATATCGATGGTACACGGCTCAGCGTTCcaTATGCT
TGTGAGTTGATCAGTTTTGGATCAGATGTCAACTGGATCTTATTTGGATT
TTCAATTGTTTCCATTGTTCTTACTTTGTGTGGTGTTATCATTACTCTCA
TTGGTTTTTGTCAAATGCCGCCCAAGcCCGCCAAGAAATAAATGGTTCAA
GCTCGAAACGACTACAATGGCCTCGTCCAGAGGAAGACAGCTATTGCATC
ATGTGTTTTTGGAATGTTGGAATTGTTAACTGCTATTATTATAGTTATCT
GTGCTTTCGTTATTTTTGGTGGATTTTGTGAGAATTTGGACTGTGATTCC
ATTTCTAAAGGCATTGGATTATGGCTTGGTTTCCCGTTGATGATTCCATC
ATTATTGGCAGTGGTAGTTTTAGGGACAAGACACTACAAATCTttaCTAT
GCTTCGGTGCTTCCAACTTGGGGGTCCTGATTTTATCCATCGTTCATACC
GCAATTGTGTATAATGACGATAGTGACTACTGGAGCAAATGGGTTGATGC
TTATAACGATGGTACTAAATGCGCTGTAAATTTAGCCAGCGGAAGATGCG
AGTGTGATATCGATGGTACACGGCTCAGCGTTCcaTATGCTTGTGAGTTG
ATCAGTTTTGGATCAGATGTCAACTGGATCTTATTTGGATTTTCAATTGT
TTCCATTGTTCTTACTTTGTGTGGTGTTATCATTACTCTCATTGGTTTTT
GTCAAATGCCGCCCAAGcCCGCCAAGAAATAAATGGTTCAAGCTCGAAAC
GACTACAATGGCCTCGTCCAGAGGAAGACAGCTATTGCATCATGTGTTTT
TGGAATGTTGGAATTGTTAACTGCTATTATTATAGTTATCTGTGCTTTCG
TTATTTTTGGTGGATTTTGTGAGAATTTGGACTGTGATTCCATTTCTAAA
GGCATTGGATTATGGCTTGGTTTCCCGTTGATGATTCCATCATTATTGGC
AGTGGTAGTTTTAGGGACAAGACACTACAAATCTttaCTATGCTTCGGTG
CTTCCAACTTGGGGGTCCTGATTTTATCCATCGTTCATACCGCAATTGTG
TATAATGACGATAGTGACTACTGGAGCAAATGGGTTGATGCTTATAACGA
TGGTACTAAATGCGCTGTAAATTTAGCCAGCGGAAGATGCGAGTGTGATA
TCGATGGTACACGGCTCAGCGTTCcaTATGCTTGTGAGTTGATCAGTTTT
GGATCAGATGTCAACTGGATCTTATTTGGATTTTCAATTGTTTCCATTGT
TCTTACTTTGTGTGGTGTTATCATTACTCTCATTGGTTTTTGTCAAATGC
CGCCCAAGcCCGCCAAGAAATAAATGGTTCAAGCTCGAAACGACTACAAT
GGCCTCGTCCAGAGGAAGACAGCTATTGCATCATGTGTTTTTGGAATGTT
GGAATTGTTAACTGCTATTATTATAGTTATCTGTGCTTTCGTTATTTTTG
GTGGATTTTGTGAGAATTTGGACTGTGATTCCATTTCTAAAGGCATTGGA
TTATGGCTTGGTTTCCCGTTGATGATTCCATCATTATTGGCAGTGGTAGT
TTTAGGGACAAGACACTACAAATCTttaCTATGCTTCGGTGCTTCCAACT
TGGGGGTCCTGATTTTATCCATCGTTCATACCGCAATTGTGTATAATGAC
GATAGTGACTACTGGAGCAAATGGGTTGATGCTTATAACGATGGTACTAA
ATGCGCTGTAAATTTAGCCAGCGGAAGATGCGAGTGTGATATCGATGGTA
CACGGCTCAGCGTTCcaTATGCTTGTGAGTTGATCAGTTTTGGATCAGAT
GTCAACTGGATCTTATTTGGATTTTCAATTGTTTCCATTGTTCTTACTTT
GTGTGGTGTTATCATTACTCTCATTGGTTTTTGTCAAATGCCGCCCAAGc
CCGCCAAGAAATAAATGGTTCAAGCTCGAAACGACTACAATGGCCTCGTC
CAGAGGAAGACAGCTATTGCATCATGTGTTTTTGGAATGTTGGAATTGTT
AACTGCTATTATTATAGTTATCTGTGCTTTCGTTATTTTTGGTGGATTTT
GTGAGAATTTGGACTGTGATTCCATTTCTAAAGGCATTGGATTATGGCTT
GGTTTCCCGTTGATGATTCCATCATTATTGGCAGTGGTAGTTTTAGGGAC
AAGACACTACAAATCTttaCTATGCTTCGGTGCTTCCAACTTGGGGGTCC
TGATTTTATCCATCGTTCATACCGCAATTGTGTATAATGACGATAGTGAC
TACTGGAGCAAATGGGTTGATGCTTATAACGATGGTACTAAATGCGCTGT
AAATTTAGCCAGCGGAAGATGCGAGTGTGATATCGATGGTACACGGCTCA
GCGTTCcaTATGCTTGTGAGTTGATCAGTTTTGGATCAGATGTCAACTGG
ATCTTATTTGGATTTTCAATTGTTTCCATTGTTCTTACTTTGTGTGGTGT
TATCATTACTCTCATTGGTTTTTGTCAAATGCCGCCCAAGcCCGCCAAGA
AATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000084_pilon | genome | sc0000084_pilon:1057515..1069736 + |
|
