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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000084_pilon:388166..395882+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11557.1.p1 ID=MSTRG.11557.1.p1|Name=MSTRG.11557.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7717bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:388166..395882+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atttttgatttatattttgtttttattgaaagtagtaaaaaggataaaaa
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TTTATATCCAGTGAAACCATGCTCGTTTCTCGGGAAAGCACCTCGCCCCA
TTAGTCTAGCCTgaaattatagaaaatttgaaaattaatttgaaatttaa
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ATCCTCCCCATATGTTTGTCTTCGTAATTTCCTctgtctttattttcttc
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AAGGGTCTGAAAAAATATTCTGATAATTTATGTGAATCATGGAATTTCTT
TGCAGACTTTGCCTACATATATTAATCGACAGTATCTACATTTCCCAGAA
ATcttttattacaattttattacttttaacacaattttgtgaaaattctg
TTGGGGTTTCTGAGAATTTCtagttttttcttttggttGGCTCGCCGTGA
GaaaaaaacaatagtttttctaaGAATAAAACAGTACATCGCGCGCATAT
TTATTTCTGCTCTCCTCTGTGATCTTTGTGAACAGactttttcagctttt
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ttaaaaacgatttatttttctttcccgGATGTTTTATGTACTACAACGAA
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CAATCACCACTTCCACGATCCAGACCTTTTCCAAACTCAATCATTCCATC
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TTTCTTGCTTCAAATTGTCATAATCATTCTTCCAAATACGATTCACTTCA
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TGTAAACTTAATGTCACTTGAATTAGATGTGATAGCTTTATTCAATTTGT
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GACATTTTTGTCAGAATTGAAACACATTGTTCGAATCTTTCCGAGTCTGT
TTTAAAGTAAAACGATGCCTCAGCTTGATAaaccttcccagctggcacac
aacgttgtttcaacgtttttctaacattcacaacgtccatgaaacaacgt
tgtgtgccatctgGGTTACAAAAGGCTTCTCATAGTTCGAAGAAAACTTC
TGATCCCTTCCAggtcgaattatagagtgtgTTATACTGTATgtattaaa
ttttaattttcaatctttACCTCGTCAATCATTTCTTTACACACTGCATT
ACAACAACCGttagttttcattttctttcttacaGTATCAAAATTTCTTT
GTGACTTTTTCTCGATTATAAGCTTCTACTTTGTGATTTCTGAAACTCCT
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AGCTAACGGATAATTTATGCTAATTATTTCACAATGTTTTGAATGGATGA
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GCGTAactatttataagaatattgtCCAAACTTGACATTGGTATTTTAAT
AAGTTTTTagcttgttatttttttaatattaacaGTGCCTTTGGTTTTTA
AGAAGAAACACTAAAAATAAGTTCGTTCTCTAAAcggaatttgaaaatca
tttgcaAGTATCTACAATATTATTGACAGTGTTTCAAGATTATGTTTAAA
CtgattcttatataaaaacgtaAACGATTAAAACGAGAGTTTATTGCGTG
ACgtgttaaaatttattttgatgggATTTAGTTTCGAAAGTATTGCTTAG
TTGCGTTGTTTTAAGTGGGCCAAACCCTggaatttagaaaaaatcacaaa
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GGCACTTTGGAAATTCCATGCCACAATAATAAACCTAACTAAGGTCAcct
agaaaaatcacaaaatcttaaACTTTTGCTGAAAGATGAAAGGATTTTTC
TTTGTGAATCAAGGCGGCACTTTGGAAATTCCATGCCACAATAATAAACC
TAATTAAGGTCAcctagaaaaatcacaaaatcttaaACTTTTGCCACTTT
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GGCGGCACTTCGGAAATTCCATGCCACAATAATAAACCTAATATAAGGTC
ACCTCTTATTTCCCTTACAAAtgtattcttattttttacttgaaaatact
AATCTGTTTATTACCTTTTCTCTTTTAATAGGGTAAAAGGATGCGAAGAA
GAATacatttcaatgaaaaagagGTCGATCGAATAGCTCTGAAAGCCCTG
AAAAGTTGGAATCTCGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000084_pilon:388166..395882+ >MSTRG.11557.1.p1 ID=MSTRG.11557.1.p1|Name=MSTRG.11557.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1053bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:388166..395882+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaCAATCACAAGTGAAAATCCAACAACAACTCTAACTGGGTTTAATGA
AATTTGGTACAAGAtttttttGTATTGTTTGGGGTCCAATGTCTTCGTCC
ATGTCATTGCAGCTTTCATTGCACTTCGAGCCCtacataaaaacaaatat
ggaaGATATCTACCAGTTGCAataattttgattggttttttGTACCCTAT
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CTAATTACGCAATGGAAGTGCAAATGTGCGCCATTTATGGTGTAGGGCAA
ACGTTTTTCTTGGTAGTTGTATCCTTTGTAAGGTTGTATGGAACATTGTA
AatgaCAATCACAAGTGAAAATCCAACAACAACTCTAACTGGGTTTAATG
AAATTTGGTACAAGAtttttttGTATTGTTTGGGGTCCAATGTCTTCGTC
CATGTCATTGCAGCTTTCATTGCACTTCGAGCCCtacataaaaacaaata
tggaaGATATCTACCAGTTGCAataattttgattggttttttGTACCCTA
TTAGTGGTGGCTTTATCACAAGTTGTTGTATTGCTTGGATTTATACAGCT
GCTAATTACGCAATGGAAGTGCAAATGTGCGCCATTTATGGTGTAGGGCA
AACGTTTTTCTTGGTAGTTGTATCCTTTGTAAGGTTGTATGGAACATTGT
AAatgaCAATCACAAGTGAAAATCCAACAACAACTCTAACTGGGTTTAAT
GAAATTTGGTACAAGAtttttttGTATTGTTTGGGGTCCAATGTCTTCGT
CCATGTCATTGCAGCTTTCATTGCACTTCGAGCCCtacataaaaacaaat
atggaaGATATCTACCAGTTGCAataattttgattggttttttGTACCCT
ATTAGTGGTGGCTTTATCACAAGTTGTTGTATTGCTTGGATTTATACAGC
TGCTAATTACGCAATGGAAGTGCAAATGTGCGCCATTTATGGTGTAGGGC
AAACGTTTTTCTTGGTAGTTGTATCCTTTGTAAGGTTGTATGGAACATTG
TAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000084_pilon | genome | sc0000084_pilon:388166..395882 + |
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