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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000084_pilon:83552..88546- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11536.2.p1 ID=MSTRG.11536.2.p1|Name=MSTRG.11536.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4995bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:83552..88546- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCATTAATTCATTAATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATT
CATTCAATTTCTTGATTTCAGAGGCGTCAACGTGTGCATGCGACGAAATT
ATTTACACCAACTTCTTTGTACAACCTCCTTACACAAGCATCGATGTTAA
TTCCCAATCCTTTGAGCTTCAATACAATGGCTTATTTCCTGATCTTCTCA
AGAAAATCATCCCAGAAACATGCGGTGTTTGTCAAATGACTTCAACACAA
AATTACACAACTCAACTTTCTTTGAAAAGTAATGGTAACTCTGGGTTAGC
TTTCAAACGAAAATATCAACGTGTCTTGGACGATATCGATTCCACGTCTA
AAATCACTTTCCCAATGACGTCATCACCTAACGACCAATCAAAATTCGTT
TCCATAATCGATTATCCGGGAGCAGTTTTATTGAATCGGAAAGTGGACTC
TGAAGAATTGGTGCATCAAATTTTACAAAAATTGTCGAGTTGTTGGACGA
TTGTTTTCATTTATCTCCTGTTGTGTGTTTTATCTGCTTTGGTGTTGTGG
GGCTTGGATCATTTCTCGTTTTCCACCAATCAACAATTTTCCAAATCACT
AGCTGACGGATTGAAAGAAACGTTTTATTATGCTTTCATAACACAATCGA
CTGTAGGGTAAGATTGGCACCTTTTTTGTAAGATTTAAGGAATAAATAAT
ATTTTTGACAACTAAACACTTGTATAATTTGAGATATAGCGAGGTGCGCT
AAACCATCCAAAAATTATTTCTGGGCATGTCTTTTCTTTCGTTATTCATC
GTCACCTTTTGAACTATGTTCTCATTTGATATATTTTGTGGAATCACTCT
AGATATATTGAAGAGTTAGGTAGGAATGTAACATCCCCAAATTTACAGCT
TTTTCTCTCGGCTTGATAACACAGTACTCTTCATATGATTTTTACTTTAT
TGTTTTCTAGATATGGAGATATGGTTGTGAAGACGAAACGTGCTCGTTGT
TTTATTATGTTCTGGATGTTGGTGTGTCAAATCTTAACTTCGCTCATTGT
GGGTGCATTATCTTCAGCTTTTACAACTGTTGTCATTGAAGATGTTTCTC
TATATGGGAAAAAGGTAATAATCCAACTTCTTCAATAGCAGTTTAGTCCA
CGAGCTAGAAATCATCCCCCTAATTTTCTGAAGTTTCAATCAAGTCAATC
TTAATGACATGAATATCCTCTGGATTTTCTGATGTAAAACAATTCTTAAT
TTAAAGTGATTATTTTAAAGCATTCTTTTATTTACCTTAGGTCGGTGCCC
TAAAAGGATCATTCGAAGTGAACCTGGCCATTGTAAGGAATGCTGAAATT
GACAATGGTTAGTGGAACTTCAAAATTTCCTCTCTTAAAGGGTCAAATTT
GGACAAAAATCGAGTGAAAATCGACAAACATTTTGAGAAAAGTCTCTCTA
AGGGTCCCAAAAACGCCAATTTTTCCTCCCTCTCTAAGGGTCGATTTTCG
ATTTTTGGCTTGACATACCTGTCACCTCGCAAACCTATTCCCCCGCTGGC
GTTTCTCTATCTATGACATATTTCCTGATATTATTTGCCAAATTATTTTC
AGAACCATTAGCTGAAAGCTTTTGATTGTTTTTGAAGTTTTTAGTGAATC
TATAAAGTTCGTGGAAATTTTCAGGGAACTGAAGAGCTACCTAACAGCTC
TACCTTGATTAGGAAATTCATGATATTCATGACGTAATGTTTTCTACGGA
AAGACCCCGGTCTTTGCCAGTAGTGGCAAATTTTATACAACATTTGTCTA
TTTTAAATTTGCCACTACTGGCTAAAACCGGGGTATTTTCGTAGAAAACA
TTACTAAGCAAAGAATTTTTCAAAAGATTACAGTTTTCTCTTTAATCATC
TTAAGGCACCATTTACACGACACCAACCGAGTTGTTAACAGCTTTAACAC
AAAAAGAGGTGGACGGGGTTTTAATGGACTCTTATACAGCTTCAAGCATG
CGTAATGCTATTGATTTATCGGGAGCGCATCCAGTTAAATTAGTTGAATA
TCCACGTTACTATGGAGTTGTTTTGTCAGGTCATTTGAAATATATTGCAC
ACTCTATGGAAGCAAGTATTCATTTCCATGAAAAGGACATTGTGGAAATG
ATTGCTGGGCAGACTGACAAAATGAAGGTTAGTGACTTTCTCCCTTAACC
CTTTGTGCGCGCTGCTTTTTTGAAAAAGAAATTTTTCTAAATTATTTTTT
TGAAACTCAAAACTTTAAAGTACCATAAAAGATTGTACCTTGATGATGAT
TTTGGTACCATTAGAAAGTTAATTTTATACTCTTTCTAAAAACATTAGGT
TTATGCCCCTTTAAATCAAGTGGTCAGGGGCTATAGCCTCAAGTCTGAGA
CTCAGTATTTTGGCTTGTTTTGGACGCATATACGCGTCCGAGGGATAAGG
GTTAATAGCCCTGTCGTAAGACATAATTGACATTGTCAAAAAAAAATAAA
GAATTCCCTTTCATTCACCGTATACCTCTTGTAGCATTTGCGATCCCTGA
AAATGCATATAAAATATTTTTGTTTTAGTCTTCTTATTAATATTTGCTTT
TTGAAAATTTTAGCTTCAAATTGCAAAAGTCCGAGATCTAGGTTTCATTT
TCAATAATCGACTGTGGCGACAAACTAAAGCGTCGTAGGTAAACCAGTAA
ATGGTTGCTGACATTCTAATAAAACCATATTGCAATATTTTCAGCCACCG
AACAAGTTTGAAACATACACATTATTCGATACGAATTCACCGACATTGAT
GGACGCCATCAAAACTTTATTATGGATGCTGTTTACCGCTGTCGTTCTTG
GTTTCATTTTTTCCGCGTATCGATTTCATAAAAAACGAACCCAGATTATT
GACATCGATAATACTGTTGACACTTGTAAGTTTTCCCCAGTTTGGGAACG
GCTTTTGTTGTTCGCTCATTTCGTTTTTTTCTCAACGTTCGTTCGTTCGT
TCACTCTTTCTGCTTGTTCTTAACATAGTCATTATAAAAAACCCCGTTCT
GGCAATGTATTGTTTTAGCTTTTTGTTCAATTTTCTTTTGTTACAAACAA
AAGACAAGTTGCGATTTGCATACTTTTTTATCACGTTACCAAAATCTCCT
CTTGGGATTGGTCTAGTTTCTAATCACATATGATCAAGAAGTTTGCAAAA
TAAATGGATTTTGGTACGTAAGCTCCATCTTTTAACAATAAAAAGAGATA
AAAGCCTTCCAGACCAGTGATTTTATAATGACTATGTTCTTAGTTCGTTC
TTCCTTGCTTCGCTTCCTTAACTTTTTCATTCGTTTGTTCGTTCGCTCGT
TCCTCCTCCATTTCTTCCCTGATCCTTTCATCTCTTCTTCCTTTCCTCGC
CCCTTTCACTTATCCCTTCCTTCGACTATTCCTTTATCTCCTTGTTCGTT
TGTTTGTTTGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG
TTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTCTTTCTAACATCCATTGTTTTTCG
TTCCTCTTTTTACTTTAATGCCGGGGGGGGGTACTTAGGTTAAATGGGTG
CTGGATATGTGCAAGCCACAAGGGTCCCTTTTTCACACCCTTGAAAGTCT
CTCAAAGAGGTACAAAAACCATTAAAAAGGAAATTGAGTCTATGTAAGTG
TCCAAAAATCACGAAATTCAAAATTTCCAAAATAATCGATAAAAATGTTG
AGAAAGTCTCTCTAAGGGTCCCAAAAACGCTAATTTTTCATCTTTCTAAG
TGTCGATTTTCGATTTTTTGCTCGGACGTATCCGTCACCTCGCAAACCTA
GTACCCCCGGGCTTTAATGTGTTCCTTGCTTTAATTGTCAGCCAGTGTAG
TTGCCTTTAGATTTTATTAGGATATTCGTAGATTGTGATATTTCAATTCA
CGATTAAACTTATCGTTTGTTCACTGTTTTTTCTTCGTTCGGTTGTTTGT
TTATTTTTCGTTTCGGTGAAAAGAGTTTTGGAAGACGTAAATCAAGCTTA
AGAAATTGTATTTACGTATGTAGGATCAATATAGAGTGTTCATGTATCCG
TCTCATAAGCAAATGACTTCCGAACAAAATTTTAAATTTCAGCTCTATCT
ATTCGTCCCATATGGAGAGAAGTCATCAAATTGCATTATCTGTTTTGTCA
TCGAGTGTATAATTTACAGACCAGAATGGATCAAGAAAGAATCAAATTAT
ATCGAGACAAAGGAGCAAGTTCTTTGAGAAACAATAACCGATTTCATTTA
TATTCTCGGCAGAAATATTCTACAGTTGGCAATGAGGGCTCAGATACAAA
AATTGCTCAAGCTTTTCGAAAACTATCTCGACTTTCAATCACAAGCAACT
CATCTACGAAAAGCTATAATCGACACTACGATGATTTGGAACGAGGAGAG
TGTTCCCATAGTAACAACAATAATGACGTGTCGGAAAAAACTTTTCGTAA
GATTTCGATCTCCAAAAGAAAGAGACGTGGTAAAGAGAGCATTGCTGGAT
TTTCAAGACTTCATGATTTAGAAGAAGAACAAGAGAGAACACAAAGTGAT
TTTTCAATGCGTTCTCCCAGCCTCGCTTCCATGCGGAGCTACAATGAACG
TATCAAAGATCTTGATTCCGATTTGGATTTGTATAATCAGGGATACGACG
AATCCGATATTGAAAGTGACTTATCGGGAAATCGGGATTCGAGTGATGAG
GGTGAGAACAGAGAAACCGATTCGGATTCCTCTGACAGTAATTGAAATAT
TGATCATTCACATGAGGCTGGGAAGCTCAATACTTTAATGGTATAACATT
TCGCTGATATTGAATTTCACAGAAGTCCCAATGGAAATTTGGAAATGCCT
TATTCGCAGAATATTTCCAAACACAACTAAAGAAATGTCAAATAAATAAC
TTTTAAAATGTTTAATGACATTAAGCACTAATAATGCAAAATTCC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000084_pilon:83552..88546- >MSTRG.11536.2.p1 ID=MSTRG.11536.2.p1|Name=MSTRG.11536.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5250bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:83552..88546- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTCTATCTATTCGTCCCATATGGAGAGAAGTCATCAAATTGCATTATCTG
TTTTGTCATCGAGTGTATAATTTACAGACCAGAATGGATCAAGAAAGAAT
CAAATTATATCGAGACAAAGGAGCAAGTTCTTTGAGCACCATTTACACGA
CACCAACCGAGTTGTTAACAGCTTTAACACAAAAAGAGGTGGACGGGGTT
TTAATGGACTCTTATACAGCTTCAAGCATGCGTAATGCTATTGATTTATC
GGGAGCGCATCCAGTTAAATTAGTTGAATATCCACGTTACTATGGAGTTG
TTTTGTCAGGTCATTTGAAATATATTGCACACTCTATGGAAGCAAGTATT
CATTTCCATGAAAAGGACATTGTGGAAATGATTGCTGGGCAGACTGACAA
AATGAAGGTCGGTGCCCTAAAAGGATCATTCGAAGTGAACCTGGCCATTG
TAAGGAATGCTGAAATTGACAATGATATGGAGATATGGTTGTGAAGACGA
AACGTGCTCGTTGTTTTATTATGTTCTGGATGTTGGTGTGTCAAATCTTA
ACTTCGCTCATTGTGGGTGCATTATCTTCAGCTTTTACAACTGTTGTCAT
TGAAGATGTTTCTCTATATGGGAAAAAGATGACTTCAACACAAAATTACA
CAACTCAACTTTCTTTGAAAAGTAATGGTAACTCTGGGTTAGCTTTCAAA
CGAAAATATCAACGTGTCTTGGACGATATCGATTCCACGTCTAAAATCAC
TTTCCCAATGACGTCATCACCTAACGACCAATCAAAATTCGTTTCCATAA
TCGATTATCCGGGAGCAGTTTTATTGAATCGGAAAGTGGACTCTGAAGAA
TTGGTGCATCAAATTTTACAAAAATTGTCGAGTTGTTGGACGATTGTTTT
CATTTATCTCCTGTTGTGTGTTTTATCTGCTTTGGTGTTGTGGGGCTTGG
ATCATTTCTCGTTTTCCACCAATCAACAATTTTCCAAATCACTAGCTGAC
GGATTGAAAGAAACGTTTTATTATGCTTTCATAACACAATCGACTGTAGG
CTCTATCTATTCGTCCCATATGGAGAGAAGTCATCAAATTGCATTATCTG
TTTTGTCATCGAGTGTATAATTTACAGACCAGAATGGATCAAGAAAGAAT
CAAATTATATCGAGACAAAGGAGCAAGTTCTTTGAGCACCATTTACACGA
CACCAACCGAGTTGTTAACAGCTTTAACACAAAAAGAGGTGGACGGGGTT
TTAATGGACTCTTATACAGCTTCAAGCATGCGTAATGCTATTGATTTATC
GGGAGCGCATCCAGTTAAATTAGTTGAATATCCACGTTACTATGGAGTTG
TTTTGTCAGGTCATTTGAAATATATTGCACACTCTATGGAAGCAAGTATT
CATTTCCATGAAAAGGACATTGTGGAAATGATTGCTGGGCAGACTGACAA
AATGAAGGTCGGTGCCCTAAAAGGATCATTCGAAGTGAACCTGGCCATTG
TAAGGAATGCTGAAATTGACAATGATATGGAGATATGGTTGTGAAGACGA
AACGTGCTCGTTGTTTTATTATGTTCTGGATGTTGGTGTGTCAAATCTTA
ACTTCGCTCATTGTGGGTGCATTATCTTCAGCTTTTACAACTGTTGTCAT
TGAAGATGTTTCTCTATATGGGAAAAAGATGACTTCAACACAAAATTACA
CAACTCAACTTTCTTTGAAAAGTAATGGTAACTCTGGGTTAGCTTTCAAA
CGAAAATATCAACGTGTCTTGGACGATATCGATTCCACGTCTAAAATCAC
TTTCCCAATGACGTCATCACCTAACGACCAATCAAAATTCGTTTCCATAA
TCGATTATCCGGGAGCAGTTTTATTGAATCGGAAAGTGGACTCTGAAGAA
TTGGTGCATCAAATTTTACAAAAATTGTCGAGTTGTTGGACGATTGTTTT
CATTTATCTCCTGTTGTGTGTTTTATCTGCTTTGGTGTTGTGGGGCTTGG
ATCATTTCTCGTTTTCCACCAATCAACAATTTTCCAAATCACTAGCTGAC
GGATTGAAAGAAACGTTTTATTATGCTTTCATAACACAATCGACTGTAGG
CTCTATCTATTCGTCCCATATGGAGAGAAGTCATCAAATTGCATTATCTG
TTTTGTCATCGAGTGTATAATTTACAGACCAGAATGGATCAAGAAAGAAT
CAAATTATATCGAGACAAAGGAGCAAGTTCTTTGAGCACCATTTACACGA
CACCAACCGAGTTGTTAACAGCTTTAACACAAAAAGAGGTGGACGGGGTT
TTAATGGACTCTTATACAGCTTCAAGCATGCGTAATGCTATTGATTTATC
GGGAGCGCATCCAGTTAAATTAGTTGAATATCCACGTTACTATGGAGTTG
TTTTGTCAGGTCATTTGAAATATATTGCACACTCTATGGAAGCAAGTATT
CATTTCCATGAAAAGGACATTGTGGAAATGATTGCTGGGCAGACTGACAA
AATGAAGGTCGGTGCCCTAAAAGGATCATTCGAAGTGAACCTGGCCATTG
TAAGGAATGCTGAAATTGACAATGATATGGAGATATGGTTGTGAAGACGA
AACGTGCTCGTTGTTTTATTATGTTCTGGATGTTGGTGTGTCAAATCTTA
ACTTCGCTCATTGTGGGTGCATTATCTTCAGCTTTTACAACTGTTGTCAT
TGAAGATGTTTCTCTATATGGGAAAAAGATGACTTCAACACAAAATTACA
CAACTCAACTTTCTTTGAAAAGTAATGGTAACTCTGGGTTAGCTTTCAAA
CGAAAATATCAACGTGTCTTGGACGATATCGATTCCACGTCTAAAATCAC
TTTCCCAATGACGTCATCACCTAACGACCAATCAAAATTCGTTTCCATAA
TCGATTATCCGGGAGCAGTTTTATTGAATCGGAAAGTGGACTCTGAAGAA
TTGGTGCATCAAATTTTACAAAAATTGTCGAGTTGTTGGACGATTGTTTT
CATTTATCTCCTGTTGTGTGTTTTATCTGCTTTGGTGTTGTGGGGCTTGG
ATCATTTCTCGTTTTCCACCAATCAACAATTTTCCAAATCACTAGCTGAC
GGATTGAAAGAAACGTTTTATTATGCTTTCATAACACAATCGACTGTAGG
CTCTATCTATTCGTCCCATATGGAGAGAAGTCATCAAATTGCATTATCTG
TTTTGTCATCGAGTGTATAATTTACAGACCAGAATGGATCAAGAAAGAAT
CAAATTATATCGAGACAAAGGAGCAAGTTCTTTGAGCACCATTTACACGA
CACCAACCGAGTTGTTAACAGCTTTAACACAAAAAGAGGTGGACGGGGTT
TTAATGGACTCTTATACAGCTTCAAGCATGCGTAATGCTATTGATTTATC
GGGAGCGCATCCAGTTAAATTAGTTGAATATCCACGTTACTATGGAGTTG
TTTTGTCAGGTCATTTGAAATATATTGCACACTCTATGGAAGCAAGTATT
CATTTCCATGAAAAGGACATTGTGGAAATGATTGCTGGGCAGACTGACAA
AATGAAGGTCGGTGCCCTAAAAGGATCATTCGAAGTGAACCTGGCCATTG
TAAGGAATGCTGAAATTGACAATGATATGGAGATATGGTTGTGAAGACGA
AACGTGCTCGTTGTTTTATTATGTTCTGGATGTTGGTGTGTCAAATCTTA
ACTTCGCTCATTGTGGGTGCATTATCTTCAGCTTTTACAACTGTTGTCAT
TGAAGATGTTTCTCTATATGGGAAAAAGATGACTTCAACACAAAATTACA
CAACTCAACTTTCTTTGAAAAGTAATGGTAACTCTGGGTTAGCTTTCAAA
CGAAAATATCAACGTGTCTTGGACGATATCGATTCCACGTCTAAAATCAC
TTTCCCAATGACGTCATCACCTAACGACCAATCAAAATTCGTTTCCATAA
TCGATTATCCGGGAGCAGTTTTATTGAATCGGAAAGTGGACTCTGAAGAA
TTGGTGCATCAAATTTTACAAAAATTGTCGAGTTGTTGGACGATTGTTTT
CATTTATCTCCTGTTGTGTGTTTTATCTGCTTTGGTGTTGTGGGGCTTGG
ATCATTTCTCGTTTTCCACCAATCAACAATTTTCCAAATCACTAGCTGAC
GGATTGAAAGAAACGTTTTATTATGCTTTCATAACACAATCGACTGTAGG
CTCTATCTATTCGTCCCATATGGAGAGAAGTCATCAAATTGCATTATCTG
TTTTGTCATCGAGTGTATAATTTACAGACCAGAATGGATCAAGAAAGAAT
CAAATTATATCGAGACAAAGGAGCAAGTTCTTTGAGCACCATTTACACGA
CACCAACCGAGTTGTTAACAGCTTTAACACAAAAAGAGGTGGACGGGGTT
TTAATGGACTCTTATACAGCTTCAAGCATGCGTAATGCTATTGATTTATC
GGGAGCGCATCCAGTTAAATTAGTTGAATATCCACGTTACTATGGAGTTG
TTTTGTCAGGTCATTTGAAATATATTGCACACTCTATGGAAGCAAGTATT
CATTTCCATGAAAAGGACATTGTGGAAATGATTGCTGGGCAGACTGACAA
AATGAAGGTCGGTGCCCTAAAAGGATCATTCGAAGTGAACCTGGCCATTG
TAAGGAATGCTGAAATTGACAATGATATGGAGATATGGTTGTGAAGACGA
AACGTGCTCGTTGTTTTATTATGTTCTGGATGTTGGTGTGTCAAATCTTA
ACTTCGCTCATTGTGGGTGCATTATCTTCAGCTTTTACAACTGTTGTCAT
TGAAGATGTTTCTCTATATGGGAAAAAGATGACTTCAACACAAAATTACA
CAACTCAACTTTCTTTGAAAAGTAATGGTAACTCTGGGTTAGCTTTCAAA
CGAAAATATCAACGTGTCTTGGACGATATCGATTCCACGTCTAAAATCAC
TTTCCCAATGACGTCATCACCTAACGACCAATCAAAATTCGTTTCCATAA
TCGATTATCCGGGAGCAGTTTTATTGAATCGGAAAGTGGACTCTGAAGAA
TTGGTGCATCAAATTTTACAAAAATTGTCGAGTTGTTGGACGATTGTTTT
CATTTATCTCCTGTTGTGTGTTTTATCTGCTTTGGTGTTGTGGGGCTTGG
ATCATTTCTCGTTTTCCACCAATCAACAATTTTCCAAATCACTAGCTGAC
GGATTGAAAGAAACGTTTTATTATGCTTTCATAACACAATCGACTGTAGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000084_pilon | genome | sc0000084_pilon:83552..88546 - |
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