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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000083_pilon:1170532..1175471- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11506.1.p1 ID=MSTRG.11506.1.p1|Name=MSTRG.11506.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4940bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:1170532..1175471- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AGGGTCAACAAAAGGCCTGGGCGAGTTCATTTTGGACAAGACCATCCAAA
CAAAATTTTTGGATGAGGCAAAGAAAGATTTGACGCCTGAGCTGAAAGTG
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TGAAATTCAAGGAATCTAAGTTTTTTAAATTTTATTTTAGAATCAAAAAT
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AATAAACTAAATCTAGGCAAATAGCTTCGCACATTTATCATTGCATTTGA
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TAACGCTTATAAGCATATGAAGGCTCAGATTTGCAGAATTCCTAAGCATA
ACATGAGCATATATGATGCCTATACATGAGCCTAAATTTTTTTCAAGTGG
TCATTTTTATCTGTTTTTGTTTCATTTTTATCTGGTTTGGTAGAGGTCAA
GTAAAAAATAAGACATTCCACGGCTCCCAAAGAAAATCTGAACAAATTTT
TTACAAAATTTCATTAAAAAACGTGCCTCGGGGTGAATCATAAGCATAAT
TCTTAAACATATAATAAGCATAAACTATGTCTGGATGCTTTGAGAACTTA
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ACGAAGGACACTCTCATTATGAGTTTTTAATAAGTTTTAAATATTGTATT
GTTATTTTTAAGTAAGTTTGCTAAGTATGTAATAAATTCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:1170532..1175471- >MSTRG.11506.1.p1 ID=MSTRG.11506.1.p1|Name=MSTRG.11506.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=10773bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:1170532..1175471- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GTTATTATAAAAATGATCGAAGTTACGAACAGAGTATCTCGAGTTACTGT AGAAAGATCTCTCTTACAATTGACGTTTGATGTATAACGGCAGCATGCGG TCACGTTCGTCACGCAACTCATATTGAACGATGGGAATTTGCAACGTGTT GTTAAAGAATTTTTTCCAGAATCGGAACTTGCAAACGTGATTGCAGATTG CCTTGTACCTGATAGCTTTATCGAGGATATTTGCCAAGGCAATATGAAAA CAAGACGATCCGTTTCTATTGGTTCCCTACCCTTAGATGTAAACAAATTT TTTACTTGTATGATGTTAAAAGAATCAAATCAAAAATGACATTCTTGACG TCAAAAGATTTGAACGAAATACCGAAAAATCAGCTCATATTGCAAGGAAA TCAGTAAACTGATTGGCATTGCTATCGAATGTGACCTTGTTATTGAATGG CATCGAGAAAATGATTGGATCAAGTTAGGACCATATTTGGCAGATAGGAC CCCTCTTCGTGTTGGTGTCATCAACAAGGAGTTCTGTTCTCTTGTGAAAA CTGAGGATTTTTCTATAGATGTTTGCGGAGAAAATCCATTTTGTATTTCC TCGCCATCATCAAACCAGATGACTTGTGGTCAATGTGGGTTGAGATACCA CATCACATGTGTCGGGGACGAGGATGAATGTGGGTGTAGGAAAATTGGAT GGTTAAAAGAAAGATGAACCACAGGGGAGATGATATGATCCCACCCATAG AGGAGGAGCCAGATAAATTTGCTGCTGCTGTCCTGGCTGATCCTTCGTTA ATGACCGGTATAGAGAAGTGCTGAATGTGGAAAATGTGGAAAGTCAGCCT GTGTGCTTTGAGAGGATCACGCAATGCTTGTCATTCTCTGTTCTTCAAAG TAAAAAATATGACGACTTTTTTGAACGTTTTGGACTGGCATCTTGTGTCA AAAACTATCATCAATTATTGACTGATTGCTTAGCAGAATACGATTTGCCT GATACCAGATCCTTTGACAAACTACTGGCTTGGTCAGCATCGTTTTTGTT AGAAGCAAAACTTGTCAAAAGCTGGTTGAAGAAGTGGACAGAGCCTTCTT CTCTAGTTGATAAAGCTCTTGTCACACTAAAATGTGTGTTGAACCACTGG ACAAGATCATTAAAACGTCAATCAAATCCAACATTACTCATTTTATGGTT ATTATAAAAATGATCGAAGTTACGAACAGAGTATCTCGAGTTACTGTAGA AAGATCTCTCTTACAATTGACGTTTGATGTATAACGGCAGCATGCGGTCA CGTTCGTCACGCAACTCATATTGAACGATGGGAATTTGCAACGTGTTGTT AAAGAATTTTTTCCAGAATCGGAACTTGCAAACGTGATTGCAGATTGCCT TGTACCTGATAGCTTTATCGAGGATATTTGCCAAGGCAATATGAAAACAA GACGATCCGTTTCTATTGGTTCCCTACCCTTAGATGTAAACAAATTTTTT ACTTGTATGATGTTAAAAGAATCAAATCAAAAATGACATTCTTGACGTCA AAAGATTTGAACGAAATACCGAAAAATCAGCTCATATTGCAAGGAAATCA GTAAACTGATTGGCATTGCTATCGAATGTGACCTTGTTATTGAATGGCAT CGAGAAAATGATTGGATCAAGTTAGGACCATATTTGGCAGATAGGACCCC TCTTCGTGTTGGTGTCATCAACAAGGAGTTCTGTTCTCTTGTGAAAACTG AGGATTTTTCTATAGATGTTTGCGGAGAAAATCCATTTTGTATTTCCTCG CCATCATCAAACCAGATGACTTGTGGTCAATGTGGGTTGAGATACCACAT CACATGTGTCGGGGACGAGGATGAATGTGGGTGTAGGAAAATTGGATGGT TAAAAGAAAGATGAACCACAGGGGAGATGATATGATCCCACCCATAGAGG AGGAGCCAGATAAATTTGCTGCTGCTGTCCTGGCTGATCCTTCGTTAATG ACCGGTATAGAGAAGTGCTGAATGTGGAAAATGTGGAAAGTCAGCCTGTG TGCTTTGAGAGGATCACGCAATGCTTGTCATTCTCTGTTCTTCAAAGTAA AAAATATGACGACTTTTTTGAACGTTTTGGACTGGCATCTTGTGTCAAAA ACTATCATCAATTATTGACTGATTGCTTAGCAGAATACGATTTGCCTGAT ACCAGATCCTTTGACAAACTACTGGCTTGGTCAGCATCGTTTTTGTTAGA AGCAAAACTTGTCAAAAGCTGGTTGAAGAAGTGGACAGAGCCTTCTTCTC TAGTTGATAAAGCTCTTGTCACACTAAAATGTGTGTTGAACCACTGGACA AGATCATTAAAACGTCAATCAAATCCAACATTACTCATTTTATGGTTATT ATAAAAATGATCGAAGTTACGAACAGAGTATCTCGAGTTACTGTAGAAAG ATCTCTCTTACAATTGACGTTTGATGTATAACGGCAGCATGCGGTCACGT TCGTCACGCAACTCATATTGAACGATGGGAATTTGCAACGTGTTGTTAAA GAATTTTTTCCAGAATCGGAACTTGCAAACGTGATTGCAGATTGCCTTGT ACCTGATAGCTTTATCGAGGATATTTGCCAAGGCAATATGAAAACAAGAC GATCCGTTTCTATTGGTTCCCTACCCTTAGATGTAAACAAATTTTTTACT TGTATGATGTTAAAAGAATCAAATCAAAAATGACATTCTTGACGTCAAAA GATTTGAACGAAATACCGAAAAATCAGCTCATATTGCAAGGAAATCAGTA AACTGATTGGCATTGCTATCGAATGTGACCTTGTTATTGAATGGCATCGA GAAAATGATTGGATCAAGTTAGGACCATATTTGGCAGATAGGACCCCTCT TCGTGTTGGTGTCATCAACAAGGAGTTCTGTTCTCTTGTGAAAACTGAGG ATTTTTCTATAGATGTTTGCGGAGAAAATCCATTTTGTATTTCCTCGCCA TCATCAAACCAGATGACTTGTGGTCAATGTGGGTTGAGATACCACATCAC ATGTGTCGGGGACGAGGATGAATGTGGGTGTAGGAAAATTGGATGGTTAA AAGAAAGATGAACCACAGGGGAGATGATATGATCCCACCCATAGAGGAGG AGCCAGATAAATTTGCTGCTGCTGTCCTGGCTGATCCTTCGTTAATGACC GGTATAGAGAAGTGCTGAATGTGGAAAATGTGGAAAGTCAGCCTGTGTGC TTTGAGAGGATCACGCAATGCTTGTCATTCTCTGTTCTTCAAAGTAAAAA ATATGACGACTTTTTTGAACGTTTTGGACTGGCATCTTGTGTCAAAAACT ATCATCAATTATTGACTGATTGCTTAGCAGAATACGATTTGCCTGATACC AGATCCTTTGACAAACTACTGGCTTGGTCAGCATCGTTTTTGTTAGAAGC 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ATAGAGAAGTGCTGAATGTGGAAAATGTGGAAAGTCAGCCTGTGTGCTTT GAGAGGATCACGCAATGCTTGTCATTCTCTGTTCTTCAAAGTAAAAAATA TGACGACTTTTTTGAACGTTTTGGACTGGCATCTTGTGTCAAAAACTATC ATCAATTATTGACTGATTGCTTAGCAGAATACGATTTGCCTGATACCAGA TCCTTTGACAAACTACTGGCTTGGTCAGCATCGTTTTTGTTAGAAGCAAA ACTTGTCAAAAGCTGGTTGAAGAAGTGGACAGAGCCTTCTTCTCTAGTTG ATAAAGCTCTTGTCACACTAAAATGTGTGTTGAACCACTGGACAAGATCA TTAAAACGTCAATCAAATCCAACATTACTCATTTTATGGTTATTATAAAA ATGATCGAAGTTACGAACAGAGTATCTCGAGTTACTGTAGAAAGATCTCT CTTACAATTGACGTTTGATGTATAACGGCAGCATGCGGTCACGTTCGTCA CGCAACTCATATTGAACGATGGGAATTTGCAACGTGTTGTTAAAGAATTT TTTCCAGAATCGGAACTTGCAAACGTGATTGCAGATTGCCTTGTACCTGA TAGCTTTATCGAGGATATTTGCCAAGGCAATATGAAAACAAGACGATCCG TTTCTATTGGTTCCCTACCCTTAGATGTAAACAAATTTTTTACTTGTATG ATGTTAAAAGAATCAAATCAAAAATGACATTCTTGACGTCAAAAGATTTG AACGAAATACCGAAAAATCAGCTCATATTGCAAGGAAATCAGTAAACTGA TTGGCATTGCTATCGAATGTGACCTTGTTATTGAATGGCATCGAGAAAAT GATTGGATCAAGTTAGGACCATATTTGGCAGATAGGACCCCTCTTCGTGT TGGTGTCATCAACAAGGAGTTCTGTTCTCTTGTGAAAACTGAGGATTTTT CTATAGATGTTTGCGGAGAAAATCCATTTTGTATTTCCTCGCCATCATCA AACCAGATGACTTGTGGTCAATGTGGGTTGAGATACCACATCACATGTGT CGGGGACGAGGATGAATGTGGGTGTAGGAAAATTGGATGGTTAAAAGAAA GATGAACCACAGGGGAGATGATATGATCCCACCCATAGAGGAGGAGCCAG ATAAATTTGCTGCTGCTGTCCTGGCTGATCCTTCGTTAATGACCGGTATA GAGAAGTGCTGAATGTGGAAAATGTGGAAAGTCAGCCTGTGTGCTTTGAG AGGATCACGCAATGCTTGTCATTCTCTGTTCTTCAAAGTAAAAAATATGA CGACTTTTTTGAACGTTTTGGACTGGCATCTTGTGTCAAAAACTATCATC AATTATTGACTGATTGCTTAGCAGAATACGATTTGCCTGATACCAGATCC TTTGACAAACTACTGGCTTGGTCAGCATCGTTTTTGTTAGAAGCAAAACT TGTCAAAAGCTGGTTGAAGAAGTGGACAGAGCCTTCTTCTCTAGTTGATA AAGCTCTTGTCACACTAAAATGTGTGTTGAACCACTGGACAAGATCATTA AAACGTCAATCAAATCCAACATTACTCATTTTATGGTTATTATAAAAATG ATCGAAGTTACGAACAGAGTATCTCGAGTTACTGTAGAAAGATCTCTCTT ACAATTGACGTTTGATGTATAACGGCAGCATGCGGTCACGTTCGTCACGC AACTCATATTGAACGATGGGAATTTGCAACGTGTTGTTAAAGAATTTTTT CCAGAATCGGAACTTGCAAACGTGATTGCAGATTGCCTTGTACCTGATAG CTTTATCGAGGATATTTGCCAAGGCAATATGAAAACAAGACGATCCGTTT CTATTGGTTCCCTACCCTTAGATGTAAACAAATTTTTTACTTGTATGATG 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AAACTACTGGCTTGGTCAGCATCGTTTTTGTTAGAAGCAAAACTTGTCAA AAGCTGGTTGAAGAAGTGGACAGAGCCTTCTTCTCTAGTTGATAAAGCTC TTGTCACACTAAAATGTGTGTTGAACCACTGGACAAGATCATTAAAACGT CAATCAAATCCAACATTACTCATTTTATGGTTATTATAAAAATGATCGAA GTTACGAACAGAGTATCTCGAGTTACTGTAGAAAGATCTCTCTTACAATT GACGTTTGATGTATAACGGCAGCATGCGGTCACGTTCGTCACGCAACTCA TATTGAACGATGGGAATTTGCAACGTGTTGTTAAAGAATTTTTTCCAGAA TCGGAACTTGCAAACGTGATTGCAGATTGCCTTGTACCTGATAGCTTTAT CGAGGATATTTGCCAAGGCAATATGAAAACAAGACGATCCGTTTCTATTG GTTCCCTACCCTTAGATGTAAACAAATTTTTTACTTGTATGATGTTAAAA GAATCAAATCAAAAATGACATTCTTGACGTCAAAAGATTTGAACGAAATA CCGAAAAATCAGCTCATATTGCAAGGAAATCAGTAAACTGATTGGCATTG CTATCGAATGTGACCTTGTTATTGAATGGCATCGAGAAAATGATTGGATC AAGTTAGGACCATATTTGGCAGATAGGACCCCTCTTCGTGTTGGTGTCAT CAACAAGGAGTTCTGTTCTCTTGTGAAAACTGAGGATTTTTCTATAGATG TTTGCGGAGAAAATCCATTTTGTATTTCCTCGCCATCATCAAACCAGATG ACTTGTGGTCAATGTGGGTTGAGATACCACATCACATGTGTCGGGGACGA GGATGAATGTGGGTGTAGGAAAATTGGATGGTTAAAAGAAAGATGAACCA CAGGGGAGATGATATGATCCCACCCATAGAGGAGGAGCCAGATAAATTTG 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000083_pilon | genome | sc0000083_pilon:1170532..1175471 - |
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