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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000083_pilon:1011540..1019713- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11494.1.p1 ID=MSTRG.11494.1.p1|Name=MSTRG.11494.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8174bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:1011540..1019713- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACTTTCGGACTTTGAATTCACAGTTTCTTTCCGGAGCCTCCAAAGAAGG
TCAAAGTCCGCACATGGAATTTGCATAACCTACGAAAATGTGTTCACTTC
GACAGTAAAAATTCATCTTCAGAAACTTTCCAAACATTTTAGATTATCAC
ATATTACATCTTAGACACAGAACTTTAGACAAAATGAAACTTTGGACAAA
AGAACATATATTCAGGTAAATATTTTACATTTTACACAAACTCAACAGAA
CCCTTTCGTATTGAAAAGTTTGTTTCTTTTGCCGTTTATTTTTGATTGGG
TTAAACTCTTCTGGTCTGCAAGCTATAAAATAATGCTGGCTAGAATGCAA
AAACGGGTAAATGGCTACCGGAAGTTGGTCTAATATCGACATCCCTTATC
TAATTCCGACACCCTTGACAGGAATAATATGGAAAGCTTGAATCGCTGAT
TGAAAAAGGATTATTCCTCTCTGACCACTAAGCAAAATAAAACAGTTTCA
TCCTTTATCAATTTCAGATGATAAAAAGGGTGTTGGAATTAGAGGAGGGG
TGTCGTCAACGCGACATTAGACCAAGTTACGGTATAGGGTTGTCGGGAAA
CTTGCCTCAGTGCACAGCAGTGGAGGCAAACATACATAGGCTTCAAATGA
ATGACCTGTGGGCAAAATTATTTTAAAGGGAACCAGAGACCACCTTGATT
TCAAAAGGATATCATTAGGGAGGGGACTTAGAAAAAAACAATTAGTGGCA
TATGTACAAAAGCTGCCAAATTATATAAAAAGAAGAAAAAAATCAAAAAT
TTTGACCGGGGACCCTTTTCAGGGTCCCCCCGGGCCCCATTTCTGCGGGG
TACCCAGCGCACCCCCGGACCAATAATAGCCTAACACCAACTTTCTCAAA
ACATAGTCATGTGGCATATCAAATTATCAGAAATTTTATGCTGATTCCAA
AAAACATTAGTAGTAGGGGTCAGAAATAAAGCTAAAAAAAGTTATGACCA
TATCTTGGACCAGATTTTGAGTAAATTGCGTAATTCGCAAGAAATTCGAA
TAGAATCTTGATTATGACTAACATTTCATGTAGTTAGTAGTTAAACTTTG
ACAAAATTCTGGTTTATTGAATGTAACTGTTTTCATGATATGAAGACATT
TTCAGTTTTCTTTGGAGAAAAGGATTATGAATGTAGACAAGGATGGTGAA
GCTGAGGTACTTCGAACAAGAGCAAAAGATATTTTATCAAGCCAGAAATT
GCCAAGTAAAAAATCAAAACAAACACAGAGAAATAAAAAGTTTTCAATTG
CAAAGAGCATCACAAACTGCCACATCATGAGTGGACAGATAAATGTAAAG
ATTGTAATACCTGTGTTAATTTTGAGATGTTGGAAAGATAACCTTTGGAT
GTTCTATCAAATGCCAAGAAAGCGTTGGAATATCTATTCACCACTAAGAT
GGTCAATACAGGAAAGAATAAGAATTTTGAAAAAACTGTTGCAAAGGGTG
TTGTATTGAAATGGATTTTTTGCAATGTTTATCCAAAGAACTTTTGAACA
CTGGAGCACGATATCAAAAGATTATTATTACAATTTTATAAATAATTAAA
ATAATATATAAATAGTTATGAATCATTGAAAAAAAGAAGCACTACGAAGA
ATCCAGATGATTACTGGCCTAAGTTTGAGAAATACAGCTTAAAGAATTGT
TTGACATTATTGGCAAGATTTCTTTTTGATTATTGAATAGTCAACTGCTA
GGGCAAATTCTCTTCGAACTGACAGTGATATTCAATAGCGCTTCGTCGTG
CAAACGTCACGATTATTACTTCTCTCATTTGACCGAAATTCAATCCCACA
ATCCTTTTTTGTTTTAATTCAAAAGTCGTGAAAGTTCTTACTTTTTCTTT
GTAATTGAGTGTAATTTGCGTGTAAGCATAATAAACGCAAAGGTTGACAG
GATTGAATTTCGGTCAAACAGAAAAATCAATGTCTACTTTTAGATTCGCT
ACGGTATGCTATTCAATTGTTTAGGTATACAAGTTGAGTTTAATCCATAG
ACCATGATTTATGGCACCTTTAAAGTTTACATTTGCAGGATGCAGAATGA
GGAGGCAGAATGGCAAGAGGTTGAATAATCAAGGGGGTGGGTTATCAAAA
TGGGTTAAAAATATATTTTGAAGGCACCAGATCAGCTACCAGTATCTAGT
TCTAGTTCTAGTTATGTATTTGCATAAGACAATTAAGCCTAATCTCGCAA
ATTCTACGTAAAAATTACAAAAATGAAAATATATCTATCTCAATGGCAAG
TCTTAAGAGCATCCTCAGGGAATTGGAAAGTTAAAAAAAGAGAGTCTATC
AGTGAAATTGGTACAAAACCCTTCTACTGGCATTTGTTCTTTGTTATTGT
AAAATGTCCGGTCATTTTGCCACATTTTTACATCCAGGTTGTTTCTTGTA
GCCTTACCCTTTCTTTTGAACTTTTAAATTAAATTTAGTACCAATCAATG
ACTGTACCCTACAATGCCTTTTCAAATAAAATGTAAACTTTAAAGGTGCC
ATCATGGTCTATGGATTGAACTCAACTTGTATACCTAAACAAAAATTGCA
AAGAATTGAATTGGATATCACTGTCAGTCCCAGGAGAGAATTTGCCCTAG
CAATGGACTATTCAATAATCAAAGAGAAATCTTTCCAATAATGTCATACA
ATTCATTAACCTATTTGCTTTAAAAATCATCTGTTTTTTTGAAGTGCTTC
TTTTTATTCAATAATTCATAATTATTTAATAAATAATGTTTTAATATCAC
AATTTCTGGCTTCATAAAATATATTTTGCTCTTGTTCAATACAAAGTACC
TCAGCTTCACATTCATAATCCTTCTCTCTAAAGAAAACTTAAATAAACCT
GAAAATGTCTTCATATCATGAAAACAGTTACATTCAATAAACCAGAATTT
TGTCACAGTTTAACTACTAACTACATGAAATGTTAGTCATAATGAAGATT
CTATTCGAATTTCTTGCGAATTATGCAATTTACTCAAAATCTGGTCCAAG
ATATGGTCATAACTTTTTTTAGCTTTATTTCTGACCCCTACTACTAATGT
TTTTTGGAATCAGCATAGAATTTCTGATAATTTGATATGCCACATGACTA
TGTTTTAAGAAAGTTGGTGTTAGGCTATTTTTGGTCCGAGGTCGCGCTGA
GTACCCCGCAGAAATGGGGCCGGGGGGACCCTGAAAAGGGTCCCCGGTCA
AAAATTTTGATTTTTTTCTTCTTTTTATATAATTTGGCAGCTTTTGTACA
TATGCCACTAAATTCTTTCTAATTTTCTTTTTTTAAGTCCCCTCCCTAAT
ATCATGCATAAAGTGGAGATTGTCATTGAATGATTTTAATTTCAGAGGAT
GCACAATAAAAAATGCTGAAAAATGAGAGCTCACACAAGTCTGTTGTAGC
ACAAGCGAAACTAAAGTTATGGCATTTTAAAGCTCAAAAACTGCTGATTT
TTTCCATGAAACAGAGTGTCACCCAAAATTTTGCATTGTTAAAGTGGTTA
ATAAATTGACACTGACTGATGATTATGCTATCAAAGTCATGATTTTTAGC
CATAGCAACAATAACACTTTGAGAAAATCAAAAAGATTTTTGGTAACACT
CAACCAATTTTTTAAATTTATCATGAATGCGGTACACACGATATGAAACA
GAATCGGCTGTAAAAATCTTATTCAACTTTAGAACCCTATAGAGGGTTAA
TGGAAAGGTTTTCAAGATGGATCAAATGCTTAGATTTTGATACAAAGTTA
CTGTATCAGCTTGAAAAATGTTTGAGGTGATAAGGTTAAGTGAAAATTTC
ATAATTTTTATTTCAGTAAAGTAAGATAATTTTCCGTCATTCCGTAACCA
AAAATGATTTCTCAATTAAAAACCAGTCTTCCCCCAATGGCAATTAATTT
ATGCCTGGTTTGAAAGTACTCAGTAAGAGGTAGAAACTTGCCAAATATTT
TACTCTAAAAATGTTTCCTTAAAACTTTACAGCATTTTTAATTTTTCCGT
CATTCCGTAACCAAGATTTTTAGAAAATAAAATCCTCAATCGTTCAATCC
AGGGAAGGCCAAACATGCTGTAAATGAGTTTTCTTGATCAATTGTTGGCC
TATGTTGGATTTAGAATAACTAAAACTGCAGCATTCATTGTATTTTTTGT
GATAAGGCTTTGGCTGTTTTTTAGGCTAAAAAGCTTTAATTTCAAGGCTT
TTTAGCCTGAAAAATGGCAAAATCAAGTTTCAGAAGTGCTGTAGCTCTAA
AACAACTGCAAATGAGTTTAGGATACTATGAGAAATGATATATATAAATT
TGAAAATGTTTACTGAAAAAAAATTTTCAGCTCTCAAATGCACTTTTTGG
TTCCCTTTAAAATAATTTTGCCCCTGTCAGTGTAGACCTAAAGCTCTAAA
ACAGCATCTAATAACATGAAAACCAGAATATGATTCTTCAATGGGAATCA
AAACTATAAAGTGCACTTACAAACATCAATTTGTCAGATCTAACAAAATT
AATAACCGCACTGTCATCATTGACAATAAAACAAACGATTTTCTGTCAAG
AGCCTTGTAAACATTCCAACAACTTCCATCGAAATGATTTATCACAGCTC
AGTCTACCATTTTTAGCGTGGTCCGAGGATTGAGCCGAGAACACTCCGCG
AACTCCTGCGCGGTTGAAAACTTCAATCTGTCAATCATTTTCTCAAGCGA
AGAGTACGCGAAGCGAATCTAGCTTTACGATAGTGCCGCAGGACATCAAT
GGATAGTATTCAATCATCATTATCCCTTTATTTTCATTTTTAGAACTTTT
GCAAAAAAAAGGAAAAATAGAAAAGTTGTATTTTTTACTGCTTTATTCAC
ATACTGAATTTGAAAGATCTTCTATGTGGCGTTTTTTTGCAAACTTCAAA
AAACTGATTTTTGTCCCGCCTTTGCGGGACTTTGGCTTAAGTGCTTGAGT
GCAGCATAGGGTACAAAGTCCAAACATGCGTTTCCCGTAATTTTTGTATG
AAGAGTTAGGTCTATACTGCCTGTCTGGTCATTTAAATACAAACTTTAAT
CAAAACAAAAATGATAGAGTAGATCTGTCCATTTTTTTGGAAATTTTGCT
GCTTTGATTGGCTTGGTCAGTCATTTGATGGCTATGCATGTTTGCCTCCG
CTGATGCAAGTTACCCGACTTCACGGTACGCACTTGTCAAGGTCAAGATT
TCTTTAGCCAAACAAGGAAGAATTTACAAAAATGAACTTCAATGCATTGG
GCCATTCCAGAATTTGTCTGTTACAGGGGGCGGACAACACAGGATTTCCA
AGGGCAAAAGTTTTCACCAAAATTCGAAATTTCCAAGGAGAGAGAAGTAA
ATGTATGAATTTGCAAGGCAGTTGAATTAAAAAAGGCAAAAAAGAGTGGA
ATTTCTAATGCATTTTGCCAAAGTACATAGATTTTTATCTGAATTTCCGA
CCACCACTCGAAAAGGAAAATTAGTTCCGATGCTAGAAAAAATTAAAAAA
TGAATTTTGGTAACAAAAATTTTCTGGAATGGCCCATTATTACTTACCTT
TGTTGATCAACCAAATCTGATCATTCTTTTTTTTAAATCAATCAGAAATT
TTCAGAGAAACAGGTAAAAAAAATCTTTTCTTTCCAAAATTATTGATAGG
CTCCAACATCAAGGTGAAAACACAACTTAGCGCTGAGTTACAGCACCAGA
AAATTCTTGACCCACATGGAAACAAATGACTGCCGCTAAGGCCGATGGAA
TTGGATTTCAAGTTTACTGTAAGATCCACTTTCCGAATTCGATGCGGGCG
AGTTGTCATTATTCATCATTTTAAAACACACACCTAACTTTATGTATGGA
GATTAGGCCTTTAAATGACTCCTAGACTCCAGACCTAAGCTAAAGCTATC
ATCATTATTTTTTTTTGATTTCATATCTTTTAACACTACAGTAAAACAAA
AAAAGCAAGACAGGTTTTTGAACATGCGTGCAGCTTATGGTAAACATAAC
ATTAAATTCCATCTGCCTATGAGCTGGCTCAGGGTTTGAATTATAAATTT
TAGGAGCTCTGCAATTTTTCCAAGCAAGGCACAATGTTTGGGAAGCATTT
TTAGTATTTTTTTATGTTTTTTTGGTGTTCAGATCAATGTTTTGATTTGA
AATTTACGTCATTTCACCGCAGAAGTAATTTATACTAAAGTAATTTGTTA
TCTGCATATTCAGAATTTTTCTGGAGCTTTGCCCTCTAAACCCCCACCAG
CCCCCGCCAGAGCTTTGGTGCCCTGGACCCACAGGGGGTTTAAAGAAGCA
GATACCCTTTCAGATATACTCAATCTAGATTTATGAAAATGGCCCTAGTT
CAAAGTGCTTAGAAAAATCCCTGATTTAGGGTTGATTGTGTAAACAATCA
AATTGCACACCTCTGTTGGTCCCCAAAGGCAGTGAAGATGTAGAAAACAA
AATTTAAAAAACTTCTGCAAAGTTTGGTATCATTTATCAGCATTTATTGT
ATGAATTATTTTGTTAAGCTCAAATCTCCTTGTTTAATGTTTGTAAACTT
TCTAAAAACAGGTTAACTAAAGTTTTTTTATTAATGGTTTTTATCTTAAT
TTATAATTATAGCCACCCATGGAAAAATGTAACAGAGGCAGCCTGGAAAA
AGTACCCAAATGAACACAACACCAACGTCACTGCAATCGATGTGCTGGAC
AGGAAGGTTTCTGAAGATGGAAAACTGTCAACAACTAGGATATTTGGGTC
ACATTGGAACTTCCCTGCTCTCCTAGCAACAGTTTTGGGACTGCCTGAAA
TGTGTTACGCAGTTGAACACTCAGAGGTTGACCTTAAAGAACAGAAAATG
ACATTGAAGATGGTCAATTATACATTTTTGGGAATCTTAGCTGTTGAGGA
GACACTTGTTTATCAAAAAGACAAAGAAAATCCTAATACGTAAGTATTTT
TTATTTTGTTAAATGCTTTATTTAACGTGCTAGAAAGCTCTTAATTATGT
AACCAGGAAATATGGGGTTCCTACTGTAAAGCTTGCTTGACCTATTTGCA
AACAGTAAAATTGAAGCTAGAAAGGAAGCGCTAATATTGGATTGATCAGG
AGTCATGTTTTTTTTATCCCTTATCTCTTAACTTTTTAGAACATGTTTAA
CTCAAGATGCAAAGATCAGTGTACAAGGAATTTCATTCTCTGGCTATTTC
GAAGACCTAGTCGTTTCAAACTATGATGTCAATTCTGTCAAAGGACGTAC
CGCTATTGAACAAGTCGTTAACAAAATCAAAATAGAGAACATACTTGATA
CCGTCAAAGAAGAACTTTGTGAATTGAAATTAGACGTTGATAGTGCTACC
ACTAAATTAGATAACGAATTTCACGTCACTGAAAAATTACAAGCTCTAAC
CAAGGACTTAGACAATGCTACTGATTTGATAAACACGGAACTCAGCAAAT
TTTCTAGTTATTTGAGTGAGGAATTTCACCAACTTGTAGAACGTTTATCA
ACTGAACTTGACCAGATAACTGTACGCGTTGGACATATTGATACTAATGC
TGGTGTTGTTGAATCGCAGAGGAAAATTAATTTAACTGATGCCGTTAAAA
ATGCTGGTATTGGAGTAAAATGATACTTTAAACACTTATATAATTAGGAT
ATTTTGATGGTTTGAATGAGTTGGAGAAATGGCATTGTTCCTTAGTATTC
GGTGAATAAATGGATTATTTATTAGATGTAGCTTTGATACAAAGGCTGGC
TTTACCCTTGGAGAAATCTGGGAAAATTCAAAAATACTAGCAAAGTGTGA
ACAGATAACCTTGGCACTTGGACAGTTTAATATCCCACCATGGGCATTTA
CATACAGCTATCTGTCATAAAATGTTACACAATATTTCAAATAAAAACAG
AAAAATATAAATTGTTTATCATAAATTATGCAACATAACTCTTATTAGAT
CAATTGATTCGAGTTTCACAGTGATGTTTTTTAACTTTTAATACTATTTA
TTACATAACATTTCCAAAATTATTATGTTGTAGAGTAAGCACTGTGTAAT
AAAACCCTTAGACACAGAACTAAAAAAAAAAGTAAGATCAATAATCTATC
ATGTTTAATTTTATTACCTTATTC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:1011540..1019713- >MSTRG.11494.1.p1 ID=MSTRG.11494.1.p1|Name=MSTRG.11494.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2529bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:1011540..1019713- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACATGTTTAACTCAAGATGCAAAGATCAGTGTACAAGGAATTTCATTCT
CTGGCTATTTCGAAGACCTAGTCGTTTCAAACTATGATGTCAATTCTGTC
AAAGGACGTACCGCTATTGAACAAGTCGTTAACAAAATCAAAATAGAGAA
CATACTTGATACCGTCAAAGAAGAACTTTGTGAATTGAAATTAGACGTTG
ATAGTGCTACCACTAAATTAGATAACGAATTTCACGTCACTGAAAAATTA
CAAGCTCTAACCAAGGACTTAGACAATGCTACTGATTTGATAAACACGGA
ACTCAGCAAATTTTCTAGTTATTTGAGTGAGGAATTTCACCAACTTGTAG
AACGTTTATCAACTGAACTTGACCAGATAACTGTACGCGTTGGACATATT
GATACTAATGCTGGTGTTGTTGAATCGCAGAGGAAAATTAATTTAACTGA
TGCCGTTAAAAATGCTGGTATTGGAGTAAAATGACCACCCATGGAAAAAT
GTAACAGAGGCAGCCTGGAAAAAGTACCCAAATGAACACAACACCAACGT
CACTGCAATCGATGTGCTGGACAGGAAGGTTTCTGAAGATGGAAAACTGT
CAACAACTAGGATATTTGGGTCACATTGGAACTTCCCTGCTCTCCTAGCA
ACAGTTTTGGGACTGCCTGAAATGTGTTACGCAGTTGAACACTCAGAGGT
TGACCTTAAAGAACAGAAAATGACATTGAAGATGGTCAATTATACATTTT
TGGGAATCTTAGCTGTTGAGGAGACACTTGTTTATCAAAAAGACAAAGAA
AATCCTAATACATGAAACTTTGGACAAAAGAACATATATTCAGAACATGT
TTAACTCAAGATGCAAAGATCAGTGTACAAGGAATTTCATTCTCTGGCTA
TTTCGAAGACCTAGTCGTTTCAAACTATGATGTCAATTCTGTCAAAGGAC
GTACCGCTATTGAACAAGTCGTTAACAAAATCAAAATAGAGAACATACTT
GATACCGTCAAAGAAGAACTTTGTGAATTGAAATTAGACGTTGATAGTGC
TACCACTAAATTAGATAACGAATTTCACGTCACTGAAAAATTACAAGCTC
TAACCAAGGACTTAGACAATGCTACTGATTTGATAAACACGGAACTCAGC
AAATTTTCTAGTTATTTGAGTGAGGAATTTCACCAACTTGTAGAACGTTT
ATCAACTGAACTTGACCAGATAACTGTACGCGTTGGACATATTGATACTA
ATGCTGGTGTTGTTGAATCGCAGAGGAAAATTAATTTAACTGATGCCGTT
AAAAATGCTGGTATTGGAGTAAAATGACCACCCATGGAAAAATGTAACAG
AGGCAGCCTGGAAAAAGTACCCAAATGAACACAACACCAACGTCACTGCA
ATCGATGTGCTGGACAGGAAGGTTTCTGAAGATGGAAAACTGTCAACAAC
TAGGATATTTGGGTCACATTGGAACTTCCCTGCTCTCCTAGCAACAGTTT
TGGGACTGCCTGAAATGTGTTACGCAGTTGAACACTCAGAGGTTGACCTT
AAAGAACAGAAAATGACATTGAAGATGGTCAATTATACATTTTTGGGAAT
CTTAGCTGTTGAGGAGACACTTGTTTATCAAAAAGACAAAGAAAATCCTA
ATACATGAAACTTTGGACAAAAGAACATATATTCAGAACATGTTTAACTC
AAGATGCAAAGATCAGTGTACAAGGAATTTCATTCTCTGGCTATTTCGAA
GACCTAGTCGTTTCAAACTATGATGTCAATTCTGTCAAAGGACGTACCGC
TATTGAACAAGTCGTTAACAAAATCAAAATAGAGAACATACTTGATACCG
TCAAAGAAGAACTTTGTGAATTGAAATTAGACGTTGATAGTGCTACCACT
AAATTAGATAACGAATTTCACGTCACTGAAAAATTACAAGCTCTAACCAA
GGACTTAGACAATGCTACTGATTTGATAAACACGGAACTCAGCAAATTTT
CTAGTTATTTGAGTGAGGAATTTCACCAACTTGTAGAACGTTTATCAACT
GAACTTGACCAGATAACTGTACGCGTTGGACATATTGATACTAATGCTGG
TGTTGTTGAATCGCAGAGGAAAATTAATTTAACTGATGCCGTTAAAAATG
CTGGTATTGGAGTAAAATGACCACCCATGGAAAAATGTAACAGAGGCAGC
CTGGAAAAAGTACCCAAATGAACACAACACCAACGTCACTGCAATCGATG
TGCTGGACAGGAAGGTTTCTGAAGATGGAAAACTGTCAACAACTAGGATA
TTTGGGTCACATTGGAACTTCCCTGCTCTCCTAGCAACAGTTTTGGGACT
GCCTGAAATGTGTTACGCAGTTGAACACTCAGAGGTTGACCTTAAAGAAC
AGAAAATGACATTGAAGATGGTCAATTATACATTTTTGGGAATCTTAGCT
GTTGAGGAGACACTTGTTTATCAAAAAGACAAAGAAAATCCTAATACATG
AAACTTTGGACAAAAGAACATATATTCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000083_pilon | genome | sc0000083_pilon:1011540..1019713 - |
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