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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000083_pilon:943513..956676+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11490.1.p2 ID=MSTRG.11490.1.p2|Name=MSTRG.11490.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13164bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:943513..956676+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
agaaaagagaaagatttaCAATAAATATGGATATTGATGAGCCAGCTGCT
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TGACCTTCTGATGCTCTTTCTTTCTAAAATAACCTTCCCAAATCaaggtt
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TTATTTATGTCTTTGAAGTTTTACTTCTGACTTATTTAGAGTGGAAAATT
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TTAGTTGCTGAAGTCTGACTAAAAAGAGCTATTACTTGATGTTTCAAAGA
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CCGTTTCACATTTTATATTCCAGCAAGGTCTGACCTCCATCTGTCACGTG
GTGTAATAGAGTCTCGCCTAAATTCTAATTCAAGTTAAATGTATTGACTT
GGCTAATATCAAATGTTACAAGATTACAGacaattttaaaatcttctGTC
CAAGGTAGCCTCACCCTCcgacaagtttcttttattttaccGTCACAGTC
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CCTACCTTATACTTAAAcagcattttttaaattaatatataaagaaaaaa
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ATATGAGATCTCTCGGTTACCGGTAGGTCTGGACGTAAGAGCACCTCGAT
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AAATCGATTCGTTTGGCGCAATGGCCTCtcccagaaaaaatccgttcatg
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TCTTGGAAAACAGGTAATTGAAAAAGTAATTAGCGCTTGTCAACAAAGTT
AAGTGtacttcaacttttttaaaccgTCACGACAGATCAAACCAATGTGA
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GGAAAACCACGAGTATAGAACAAGACTACAAATTCAGGGAGGAGAGAATG
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TGTGCTTAACAGAAACAAATGATAAaacgtttttatttctttctgtTTCT
AACTTTCGATAAAAAAGTCTTGAATACTTCGGAGGTTATAGAGGGGAAAG
ATTTTTCTTGACATTCTTTATTCTTCGAAAATTGGGTTGTTGACCTCCTA
ATAGTTTTATCATTTTATGGTATCTTATTTTTATGtatgttaaaaataat
ttttacgcatattgaataTttttattactcttaatgaaaaaagaattttt
agacTAAATATTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:943513..956676+ >MSTRG.11490.1.p2 ID=MSTRG.11490.1.p2|Name=MSTRG.11490.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1218bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:943513..956676+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATATTGATGAGCCAGCTGCTCTTTTTGAAGACCTTACTCCAAATAA
GGATGGTGGTGTCACAAAAACAATTACCAAGCAGGGCACTGGTAATGCAA
CACCCTATAAAGGAGCTAAAGTTCATGTGCATTATACGGGTAGGTTATTG
GATGGCACTGTTTTCGATTCAAGTCGTGGAAAGCcaggtttttttagttt
tcaagttGGTGTTGGACAAGTAATCAAAGGCTGGGACTTGGTCATACCAA
CAATGAAGAGAAACGAAATTTGTGAGATCAAGGTTGCACCACAATATGCT
TATGGGGAGGAAGGTTTTCCGCCAACAATTCCTGGCAATGCAACCTTGAT
CTTCCAGATTCAACTTTTTGGATGGGAAGATGAAAAGATAACTAAAGATG
GTGGCATAACAAAGCATATTGTTAAAGAAGGTGATGGCGTAATCAAACCA
AATCTAGATTCAATTGTCAAGGTTCATTTACGAGGATCATATCAAGGTCG
AGTTTTTGATGAAAGAGATGTTGAGTTTATCCTTGGTGATGGTTACGAGA
AAGAAATTATTGATGGTGTTGAAAAAGCTTTATTAAAGATGAAACGCCAT
GAAAGGGCTATAatccaaatcaaaccacaataTGGTTTTAGAGATGAAGG
CCATGAAGAGTTTAATGTGCCTCCAAATGCTGAAATTGAATACGAAATTG
TATTGTATAGTTTTGAAAAGGCTCTTGAAATTTATGAAATGGATTATGAT
CAAAAGCTAGAGAGATCTCAATCTTTAAAAGATAGAGCTTTGCCTCATTT
TAAAATTGGAAGATATAATCAAGCAATCGAGTTTTATGAGCGTATCATCA
CTttcttaaaaacaaacaaacttgaTAATGATTATCAAAGAAGCCTCCCC
ATGACAATATCTGCCATTTCTAATATTGCTCTCTGTCATTTGAAGATGAA
AGACTTTTTGAATGTTGTTACAAATTGTCAAAAGGTCCTTGAGTtggatg
ataaaaatgtaaaagcTACTTTTCGTATGGCTGAGGCGTATGCTGGGTGT
CATGATTTCAGTCAAGCAGTCATTTATTTCGAGAAGACATTAGATTTAGA
GCCATCAAATAGCTCTGCCAAAAAGCAGCTTCTAAACGCCAGAGCTATGC
AGAAGAAatcaattgaaaaagaaaagaagctaTACAGtaatatttttgct
aaaatgaGCGATAATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000083_pilon | genome | sc0000083_pilon:943513..956676 + |
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