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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000083_pilon:805968..817606+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11484.1.p1 ID=MSTRG.11484.1.p1|Name=MSTRG.11484.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11639bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:805968..817606+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTGGTTGTTGTCAATGTTACCAAATCCTACTTTACTGAAACTTTGAACCA
acatctttcttttttaatatatttagaTGGATATTAATTtattaaaagaa
atcaaagcaGACCGTAAGCATAATCGTTGGCAGCCATTATGTGACGAAGC
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TCCCATCTCCTTAAAGGACTGTAGGCTTGATTAACTATCAGTTTTCGTAA
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TTATTATGGAGTCAAAATGGTCACGCGTCTATTACAATCATTGATATAAT
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ATCAAGccacagccaatcaaaatatTACCAAGACAACAAGATCGCTGTCC
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gtttacaaacaaAACCTTGGTTGTACTTCTCACACTTGCGTAGTTTAatt
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aaTTCTCCCCGCCGCCGTCCCCAGAAATACTTTCGCAGGAAAGGGATAGT
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TTCAAAATCAACAATGGTGTTCTTATTGATGATTTGAAGGGCATTTGCga
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TCATTCATCTAACCATCCTCTTAATCGAGAGAATCCGCAAAAACCAACTG
GCATCAGTCTTTATGATAATCAACAACAGTCGCCAACATCTTCCACAGCA
TATCCATACGCTTCAAATGGACAACCACATTCAAATCTACCACAAAACCA
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TTGGAAACCCAACACACCACCAATATTATCACTCTCCGTCCTATCAAAAC
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TTATGGAAACACTCACCAACAGTCAAATCCGACTGGCCATGATTTATATG
GTGACGCGAATGACGATTGGAGAGCAACTGAGGCAGAAACTGCCAGTCCG
CATTCAAGTGAAATACCTACACATCACCAAAAAGGTAATAACGTCAATCA
ACAAATGCATGGGTCCGCCGCCCAACAAATGGACCCTAACGCCCATCAAC
AAACGGGTACCCACGCCCATCAACAATGGAATAGACCTGGTGAGCAAGCA
ATGGAAAGGTCTTCCAATCAAGCGCAATCGGCAGAAGGATCTGGTCCACA
ACAACTAGCAAAACCGATACCCAGACCTAGAAAAAGCCCAGCAAATTCAG
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GAAACGCCTAGTTATGCTCTTTAGTCTCATTTTACCGCACATTTTCTCAA
TCACGTTTTAAATGAATGACTTCTcgtatgttttgaaaatttgtataaTG
GTGCACCAGTAATTCAGTGTTTATGCGACGGAGAAAGTGGTCTGAGCATA
ATTTCAAATACATACATACCACCGTATCGTTTTCTTTTAAATGATTTGCT
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TTATTTGGAAAACTTGTGTCGAATAGAAACTTATATACAAAGGTTCGAGA
GAGCTCATTGGAGTTAAGAGATGTATAGAGCGACACGAGTAATCATGACT
Gtatttaattttcttacatatagattgagttttgctttgtttttgttata
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gttttctttaattcAGGCAGTActtagtcatttaaaaaaaactcataGAA
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ATTCCAGAActttatgagaaattttatgtgtttatacacgtttttctttt
gtaagaacatccaaaattttttaagccttgggaagttcttaatttttgga
gttttaagcctaaaaatgttcttaaaataacatgttcttaacattttcgc
cattttttgaccatttttacccattttcctaagaaatcgggtgtttttga
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gtttttgagtccatagagccttaaagtgttcttaacttgttcttaacatt
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AATTGAATGAATTTTAGCACGTATACTGTATTAAATAAATAGTGTTATGA
TATTCAAATACAGCTTTCAAAAGTTGATTAACTGTATGTCTCGTTTTAAA
ACCCTGCTTAATCAACAAGCTGCCACTTTCACACGCTCGTTaaaaaaaaa
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aagcatatgcaggctcagttttcagtacctaaacaatggttctattgttt
ttaaaaacaatagaatgctaagcataatgcgagcctgatataggaacaga
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TATAAACATCCTTTCGCAGATGAACTATGcattaaatgattttcttaaCA
AAGATATTCCTTTTGCCTTCAATCATAATTTGTCAATATTAGTTATCAAA
ATATTGATTTCGATTTTAATTGGGTACACatgattttattaaaattacat
gttctaaaatttattaaaaactGCGTTCCAAAAAGATAAAGGTCTCATAC
ACGACTTTTTTATGataacatccaaaatctttaaagccttcgggtgttct
taacttttttagcttAGTTAGGtaaagttttaagcctaaaaaggtTCTTa
gcgttcttattttcaccattttgtgagtatttttgtcgatttttctaaaa
aattaggTGTTTTCGAATCTGcgaagccttaaattgttcttaacttgttt
tttaatattttggccatcgaagccttatgttcttatatagtttgttctta
tgaaaaactaTCTATGTCTCTTTTCTTCTTCTGATATGTTTTGCAAAGAA
TACTACGGTTAGAGCTGGTGTAGAATTTTGTCATGAAATTTCCCAATAAT
TAATTATTTGATGGGTCTTTATTTAGAATCAAGTACTcgttgaaaattaa
ttttttaaacatctaaTTTATTGTTATTTTACATAAGCGTAATATACTCT
ATACCAATATTGAAACAGCTGGACCCTACTGTCCTAAAAGCTGATTAATA
TTTCAAGTGGTTTTTAATAAATCTTTATTACGTTTAAAGTAATCACAAGT
gcaataaatataattttcgtttttcgaaattagTTTTGCTGAAGTTTCTT
TAATAAAACCTATACTGTATCATATATCTAAGTTTATCGTCCGCCTCTAA
GCGAAACGcactgtcgaatatttttaaaaaacaatgaaattgacatcCTT
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aaattatttagtctcgctttaatgatattcgaatatcatcaagctcgact
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AGACGTCTGTTTATGAAATAGTCAACAACTAAATAGAAGGGTCAAGGATG
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gttttggttttaaataagagtgataacaTTTGCtaactcatcaattttaa
tttaaaagctttttcacattggattgacacggatgtggagcaggattggt
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ATCCTCAATCTTTCTCTACGCAGGTTGCTATAATATTTACAgtcattttt
aaaataaaccTTTTTTGTAATTGGGGAAGGCTCCATTTGCCTCCTTCTAA
AGATAGGAGGGCTGGCACTAATGAGGTCTTGATTGGCCTGGATGTCGGAG
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ttcgatggccaaaatattaagaacatttttgaggCTTTGCAGACCATAAA
ACGCATTCTCGTacgaaaatggacaaaaatactcacaaaatagtgaaatt
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ATTGTTGGTGTAAATTGCACCTCGAAAAGTACATcaaatacacgttgttt
tttttattagaacacctagaatttggctgagcctggatgtgcttattttt
tttagcaattttcagcctaaaatgttcttaaatgcgttcttaatttttcg
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ggcgaatttcagcctaaatgttcttataaactgggttctaataaattCAT
GACGATGAAAGATAAATTTAAGACCAAAAGGACacacctgtctcacagcc
ccggtgaaactttttgcGGGGataaaattgaaatcccaatggggatagaa
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aattttaaaatattcagttTCGAAggggaatgaaatcaaagttaatttcc
cagtgggTCCGAACCCCAGTGGGTCCAAACCCTGGTGGGGCTGGGGTCTC
AGCAGTCAGTGACACAGGTGTGCAATAGGCCTTACACCTAAAAAGTTATG
AACATTTGCGGaggcttcaaaatttatgttGGCAAAAGTTCttcattggg
ctattccagaaaatggCTGTACATGGGTGtagaggatatagtgtccgggg
gtagttTTGCTCGGTTTAAGGGTTATTTTAAAAACTCATGCTTGTCTGGG
GAGTCAGACAtgctgtccgggggtcaaaattcacaatattcggggggggg
ggggtaaatttctaaacaatgttatatcctccacccccatattcattttt
ttctggaaaagcccattttgatTGAAGATTTATAACACTTCTTCTATTTT
ATCATTGTCACTTATGATTTGAAGCTCATTAATCAGAATATCAATATAGC
AAAGTAATTTAGTATCAAGTGCAGTTTTTCACatgataatattgaaattg
taaatccaaatttcaatatttctaCACGTAAATAACAGATTAGAAATTCT
TTTCACAAAATTATAACAATTGTTGAGTTAATTATAACTATCATAGTTTT
GTCTGTCTTAGAGGCAATtttatcacgccatcacgaaaaccgcttggggg
ggCTCGTCTTAGCTTTCTGTAACTAACAATTTTTGAGTTAATTATAACTA
TCATAGTTTTGTCTGTCTTAGACGCAATtttatcacgccatcacgaaaac
cgcttggggggggggctcgtcTTAGCTTTCTTAGTTTTGTCTGTCTTAGA
GGCAATtttatcacgccatcacgaaaaccgcttggggggggCTCGTCTTA
GATTTCAGTAACTAGGATTCTCGAAGACATTTTCAGTTCattttcgaagg
aaaaatgaaaaaatacccttgataagaaataaatatcatgtcagtatttt
tgaaggaaaataatttgtgtatttatttttgaaatgaaaaaggttgtttg
ttttttaatttatgaaaatgaagataaCCTCTTTGCCAGTATTCTTCATG
GAAATTCTTTATTTGCAGAAAAAAGTTCTGCATTTTTGAAGGAGAAaagt
tctgtttttttttatggaaaaaaggACCGTTGCCCTAcacattattttta
taagtacCAGTTCCAGCTCTgtaaagtaaaagttttttatataaTCTAAG
CTTtgcaaacgatagcccttgacccaataagcataaatatgttATGATAT
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AAGGAAAGCTTTTTATATTGTTATTGATGaaaatgtatttttggggaaaa
tgtttttttgaggaaaatgtatttttgagggaaatttatttttgagggaa
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aaatgtatttctgaggaaaatgtatttttgagagaaaataatAATGTTCT
GAATATCCTTTAACCTTTGAGGAAAATTTTCTCTGTATTTTATAATATTA
TCAGGCGGAATTGCTCACTATTCACTTTGTACTTTGATGATTTATAATGT
TTGTGTTTCCCATATAAGGACAGtttctgcctattgttatattatgctga
tataagcgaaaaagtgtttttcttttcctctttctgaccaatcttgctca
acatacgtgtcaatccaatgtgaaaacgcttgtgaattaaaattgatgag
taagcaaacgatatcactgttattcaaaaacaaaacctttagtTCCTCCA
TATATAGTTAAGAAAGCTGACAAGGAAAAACATCTAGAAACCTTTCAGAC
ATTTTAAATGATGAAGCAAAAGAATTCTAGGAAGATAATTTCATGTTTAC
TGTAGATTGAATCGTAATACAAACCTATTCTTTTGCAGctcatcaaaaat
aaatttatttcaaatttcttgtTTAATCAGCCATACAGTATTGACTCGTT
CAACGTCAAGAGAAGGTTGGTACTTCTGAAGTGGATGGTCATCAAATGTT
ATCAGATGGTTAAAGACCCATTTACATTTACAAATAATACGCCCACAGTA
GACAACAAAATCTTCATTACTTGTTTACATTTATTTCGATGAAATAATAA
ttgaatcattttctttttgaaagattttcttgcTCCTTTTAACTTCCTTG
TAGCTATATCCTTGTTGATGCCAAGTCAacgaaaacccg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:805968..817606+ >MSTRG.11484.1.p1 ID=MSTRG.11484.1.p1|Name=MSTRG.11484.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1836bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:805968..817606+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGGATATTAATTtattaaaagaaatcaaagcaGACCGTAAGCATAATCG
TTGGCAGCCATTATGTGACGAAGCACGACAAAATTTGATCACAGAgagaa
gaaaagataaaaagttgGAATTCAAATGTCTTTCTCCTGTAACAGACACT
GAAAGGATATTTGACAAAAACAAGGATCACCAAAACCTGGAAAATGTTCA
CCAAAGCCTCAAAAAGTTGGCCAATGTCTACCTTTGTTTACATCGGTACG
CCATCAACCTAATCAACAAAAGGAAGGAGGGAAATTTGGCAGTCATCAAA
ATTATTAAGATGTACACTGGCTACTGGGTTTCCAACTTTACTACAATGGA
AGAAATTGCAATTGACAATCTGCATTATTTAGGATACAAACCAAACGGGG
ATCAATTGATTTTAGATACCGAAGAAAAACCTTCCTATGAAGCAAAGACG
CCATACAGTATTGACTCGTTCAACGTCAAGAGAAGGTTGGTACTTCTGAA
GTGGATGGTCATCAAATGTTATCAGATGGTTAAAGACCCATTTACATTTA
CAAATAATACGCCCACAGTAGACAACAAAATCTTCATTACTTGTTTACAT
TTATTTCGATGAaTGGATATTAATTtattaaaagaaatcaaagcaGACCG
TAAGCATAATCGTTGGCAGCCATTATGTGACGAAGCACGACAAAATTTGA
TCACAGAgagaagaaaagataaaaagttgGAATTCAAATGTCTTTCTCCT
GTAACAGACACTGAAAGGATATTTGACAAAAACAAGGATCACCAAAACCT
GGAAAATGTTCACCAAAGCCTCAAAAAGTTGGCCAATGTCTACCTTTGTT
TACATCGGTACGCCATCAACCTAATCAACAAAAGGAAGGAGGGAAATTTG
GCAGTCATCAAAATTATTAAGATGTACACTGGCTACTGGGTTTCCAACTT
TACTACAATGGAAGAAATTGCAATTGACAATCTGCATTATTTAGGATACA
AACCAAACGGGGATCAATTGATTTTAGATACCGAAGAAAAACCTTCCTAT
GAAGCAAAGACGCCATACAGTATTGACTCGTTCAACGTCAAGAGAAGGTT
GGTACTTCTGAAGTGGATGGTCATCAAATGTTATCAGATGGTTAAAGACC
CATTTACATTTACAAATAATACGCCCACAGTAGACAACAAAATCTTCATT
ACTTGTTTACATTTATTTCGATGAaTGGATATTAATTtattaaaagaaat
caaagcaGACCGTAAGCATAATCGTTGGCAGCCATTATGTGACGAAGCAC
GACAAAATTTGATCACAGAgagaagaaaagataaaaagttgGAATTCAAA
TGTCTTTCTCCTGTAACAGACACTGAAAGGATATTTGACAAAAACAAGGA
TCACCAAAACCTGGAAAATGTTCACCAAAGCCTCAAAAAGTTGGCCAATG
TCTACCTTTGTTTACATCGGTACGCCATCAACCTAATCAACAAAAGGAAG
GAGGGAAATTTGGCAGTCATCAAAATTATTAAGATGTACACTGGCTACTG
GGTTTCCAACTTTACTACAATGGAAGAAATTGCAATTGACAATCTGCATT
ATTTAGGATACAAACCAAACGGGGATCAATTGATTTTAGATACCGAAGAA
AAACCTTCCTATGAAGCAAAGACGCCATACAGTATTGACTCGTTCAACGT
CAAGAGAAGGTTGGTACTTCTGAAGTGGATGGTCATCAAATGTTATCAGA
TGGTTAAAGACCCATTTACATTTACAAATAATACGCCCACAGTAGACAAC
AAAATCTTCATTACTTGTTTACATTTATTTCGATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000083_pilon | genome | sc0000083_pilon:805968..817606 + |
|
