MSTRG.11466.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11466.3.p1
Unique NameMSTRG.11466.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000083_pilon:524213..551246-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11466.3.p1 ID=MSTRG.11466.3.p1|Name=MSTRG.11466.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=27034bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:524213..551246- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:524213..551246-

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GAGAGGTATTTTGCAGAAAGGTTCAATATACCTGTTGGAAAGTCTTGAAA
CAATAATTATTGAGCGAAATGTTAAACTTATCATTGTGGATTCAATAGCT
TCATTGGCACGTAAAGAGTTTGGTGGACACAACTTGGTAACTGAACGAAA
TAACATGTTGATGAAGGAAGCTACACTTTTGAAGCTGTTGGAAATTTCAT
CTTGTCATATTGGGGAAAACCAAACATCTCATCTTGATGTCAAAGAAATA
GCATCAAACGTGGTTGTCTTCTATGAATCTACATTTCAAGAAATGTTAAC
AAGTTGACTGGTCCTCCTGGCTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATGATGCT
GGCATCCCTAGCAATAATGAGTTTGTTATCAACAGATGATCTTGACAGTT
GTGTTATTTACATTGATACTGAAAATGCTTTTACTGCTAAAAGGTTTCTG
ATTTACTTGAAAAGAAGCAGCAATGGTTTTTATCAACTCAACTTGCAAAA
TTAGACCAATGTCTACATGGAGGATTGACATCAGGGACTATCACTGAGGA
CGTTCTCACAAAGAACATATTGGAACTCATGAGTTTTGGACTTGATTACA
ATGAATCTAAAATTGTTTTTGATTCAGTATCAAAATCAGTTGCACCAAAC
TCAAGCAAGATGGCTAACAAACGTCTAAACCGGGTTAGAGGACTCCCTCA
AGAAAATTGTGCTGAGCTGGCAAAGCATGATGTTCTACTTTGTAAATTGT
TGGTTGCCAAGTCACCTTTATGTCCACTGTCCAAGTTTCATTACAAGATA
GATGCAAGTGGTATTGTACAAGTTGATGACTTAACCATTTAAGTTTTGGT
GACCAATCAAGTAACAACAAGCACATCTTCAGAATTATCCAAAGATTCTT
GCCTGATAGCTGCACTTGGGAATACCTGGGCGCATGCTGTTAATACACGG
CTCATGATAAGACACTCAAATGAAGATCATAGTATCAGAGAGGTATTTTG
CAGAAAGGTTCAATATACCTGTTGGAAAGTCTTGAAACAATAATTATTGA
GCGAAATGTTAAACTTATCATTGTGGATTCAATAGCTTCATTGGCACGTA
AAGAGTTTGGTGGACACAACTTGGTAACTGAACGAAATAACATGTTGATG
AAGGAAGCTACACTTTTGAAGCTGTTGGAAATTTCATCTTGTCATATTGG
GGAAAACCAAACATCTCATCTTGATGTCAAAGAAATAGCATCAAACGTGG
TTGTCTTCTATGAATCTACATTTCAAGAAATGTTAACAAGTTGACTGGTC
CTCCTGGCTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATGATGCTGGCATCCCTAGCA
ATAATGAGTTTGTTATCAACAGATGATCTTGACAGTTGTGTTATTTACAT
TGATACTGAAAATGCTTTTACTGCTAAAAGGTTTCTGATTTACTTGAAAA
GAAGCAGCAATGGTTTTTATCAACTCAACTTGCAAAATTAGACCAATGTC
TACATGGAGGATTGACATCAGGGACTATCACTGAGGACGTTCTCACAAAG
AACATATTGGAACTCATGAGTTTTGGACTTGATTACAATGAATCTAAAAT
TGTTTTTGATTCAGTATCAAAATCAGTTGCACCAAACTCAAGCAAGATGG
CTAACAAACGTCTAAACCGGGTTAGAGGACTCCCTCAAGAAAATTGTGCT
GAGCTGGCAAAGCATGATGTTCTACTTTGTAAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11466MSTRG.11466Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11466.3.p1.exon10MSTRG.11466.3.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11466.3.p1.exon9MSTRG.11466.3.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11466.3.p1.exon8MSTRG.11466.3.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11466.3.p1.exon7MSTRG.11466.3.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11466.3.p1.exon6MSTRG.11466.3.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11466.3.p1.exon5MSTRG.11466.3.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11466.3.p1.exon4MSTRG.11466.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11466.3.p1.exon3MSTRG.11466.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11466.3.p1.exon2MSTRG.11466.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11466.3.p1.exon1MSTRG.11466.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11466.3.p1MSTRG.11466.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000083_pilongenomesc0000083_pilon:524213..551246 -