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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000082_pilon:303196..318959+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11361.1.p1 ID=MSTRG.11361.1.p1|Name=MSTRG.11361.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15764bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000082_pilon:303196..318959+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCATTTATAGAAACCGAAAGTTCTTtgtcaacaaaagaaaaaattcacaC
TGGACTGGTCTCCATCTCCAGCTCTACCATCTACTTGCTCATTCAGCAAA
TGAGAATAGAAAATAATGGGGTCAAGAATTCCAGAAAGGTAAGAATAACA
GTACTatgtttattttcttatttcttttgtggtcaaactttgaaatattt
atatttcagaagcgtttttttatgagaattttcaaacattcctcattttc
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ACGTCACGAAAACACTATCCAAAGGTGACATTGAGcccttacactgatgt
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AATTTAATACGGTCTCTCGATTTTCCACCTTTTTGTCTGATCTTTCCTGA
CGTGGTTTCTTAGGTGCTTCCTCTCTAGTTTTTGTCTCTCCAATAGTTTC
GCACAATGttttccgctttaatttcgccttttcttcttttgcttgtgatg
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AATTCATCCAGTTCTGTTGGGGTAGGGTCATTCATGCCACTACCTttaat
ttgcaaattttgtttaattttgaaCTCACTGAAAAGTTCATTAAAATGTT
CGCGTATAAATCGACGTTTAAGGGGCCTTCCAGTTATCACAGACATCTTG
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AATGATATTATCcttttcatctttcatttttgcaggtattttatcagcca
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CAAAGAGAGATTGATGAGCTTGTTGCAAAGGaatctaaaatcaaaaagac
tTGTCAGTCACTCGACAGTGATTTCGTCAATTTAGTCAGTGAGGCAGAAA
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cgAACTTAAACGTTATTATTCACTTTTTAAGTTAGAAATTCAACTGTTGG
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ATGAGTTGTGAATAAAATGAGTGACCAAATTAGGagctattttcttaaaa
tgaatGTAAATTGACAAAAGTAATGTTTATTATCTTGGAATGAAGAAAGG
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AggacttttttttggaaaaagtcagggaaaaatatttctcttaaGTGCTG
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GAACATTGGTACGAAATGGAACATTGAACAAGGGTTTCCTGGCagaattt
gtaaaaatttttgtcaaattgacAGGTGGCATCATGACTTTACTGTTATT
ACGTTCATGTTGTTGGGTGACTGTTTGGAATTTCTTTGATGACGTTGGTG
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gaagcagagctaaaaaagaaaaaatatataatcaaaATAATGTTTAAAGA
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gaaagtttcgaaaaaattgTCCATTTTTGTGCAAAATAAAGTAAAGTTTT
GGATCAGATCAGGACCtccacaaaaaaattttctggtttctaggaaaaat
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CAAGCTTTCCCggagaaaataaatatttttgagtttAGATCCTAACCGAA
ACAGGCAGACggtaatttgttgtttttaccGTCTGAAGCAAAGTTGACAC
CAAGTTTTCCCGATAAGTCGAATTTGCTTACCCGGGCCGTCGTGACATCA
CCAACCCCAGCACTCGCCGTAGCGCTAGAAATCGAATTTACATAATCTCg
cttgtgtgtgtgtgtgtgtggcgagaaaatttttggggcgcaaattatgg
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agtgcaagaagtgtaaccaagcctttgtaaacatttatCTTCATCAtgag
aattttttaatggctgcttgattgcacGTATGCTTTTGCCTCTTTGAAAC
TTTacctgtataaatttttatcatgttttctggtcttttgtagagtattt
agaggtttattattcgtttactactaagtattttatgtttgtgtagttag
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aattttacaCACAACAACACTTCACTCACACATAAAAACCCACTAGAACC
CTCTTCTTTACtgaaactacaaacagcacaggtatgatctttttttcctt
ttttcaccagatagttatgtgttaaatattaaccagttgtgacaaacagt
ctgGTTTAGCAAGTTTTTCCATGACCATGTATTTcctagaaatcatgtca
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AAATTAAACGATTTAGCTGTTCGATTACTGAGCCTAATTTGGTAAGACAa
ttttttgattagtttgattatataagtttgatgacagttttttatctcat
gaagtttgattgtttgattggtgttcgatgagtttggttTAAGTAAaggt
tccagcttttcctccccgatgccAGGCGATgatcaaccgaaccctatcaa
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gttcgattatcGATTATAGCAGTAATCGAACTTTGccggaaaatcttcag
tttgatgtttgattataAAGTTTGATTACTTACATTgcagttcgattaag
ttcgatcagtgtttttgtagctcaaatgaTTCCAGTTATTGTTAGCGCAA
CCAGCTCAATCAAACACATCGTACATCAATCAAACTAACCGGAATTTCTT
GGTTCGATGACTGTTGGATTTGGTTCGGTAATCacacagttcgattgaca
tcgcttggccgatgggatgatagatattggcctgctctttaagctttagc
gtTGGTGTCTACTAATAAGCCATCAGAGTGTAACAAGAATGGGCAaccaa
ggtaataaatcaaactaattgagctccaatcaaacttcatcgatcttgat
tttcattttgaatcattaaaaactccagtgtgagattcccatttccgcac
taaggttcttgatacttttctggaatctctcccctatatatatattttac
ggGATAACCAGCAAGAGATTGGGTTTGTTTTAATGGTATGCAGTTAGAGC
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tgtaaacatttattttatgattttgaaagatttacggTCAAGctagaaat
aattaattttaaaggTCTATTATAGCATCAGAAAATAATTGCATCACTTT
TAGTGAGGTTTAGTCAATTAGTATGTGGTGGGAAAATTGGAGTGACAGGT
GGTAAATAAATCCCCATATTCTATCTTGACCGAAGTCTGTATCCTTaagt
taatatatttttatatggatTTTTGTGTTGAACTTTGGGAAAAttttaat
ctcaaggagtattatttctttaaagcttaaagttggctagaTTTTATCCT
GCCATTCTCTACTTCAGAAGCTTGAGCTCAActactcaactgctttttgc
ctttaatggccTCTTTCAGAAAATGCCTATACATggggggggTGGAGAAT
ATAGtgtctaggggggggggttagtgaaaaatctacaaaatttgccttgt
ccggtgggtgggtaaacttgctctgtttggggtaattttgctctgtttta
gGGTAGTTTTGATTGTCCATggagtcaactgatgcttgtcagagggttag
acctgctgtctgtgggtcaaaagtcacagggtaaatttcaaaaaaatgtt
atatcctccaacccccctacaatattctgcaatattcaaattttttctgg
aaaagcccaataattTTGATGGTGGTGCGCTGGTgcgccatcattcatat
cagaaagcgaagatagtatacaacagatttttctgactactgtagctatt
ttctcaattttagaaaattcttttggttatagaaagaagttgatataaac
tttgcgcaagtgaaagaaTTAAGTCTTATCACAAGTGACTTGttatcaaa
gcacaaaatgaagtTTCTGGCATCAATTAAAGAATGGaaagttctttttc
ttttcttcattttcaaaaaattttaaaattatttttctcaagtatattgc
agttctctgattTATTCTGAACCCAattaaaagatcttttttacgcttat
aaaaaggaattttttagtcgcatgtttaaggaatctttttgtttttaatg
tattgagatttttcataagaaaaggGTATCTACGACCTTTGTGTACAATA
Aaatgtgtatattttgtgtaatgcttcattcaaaatccattatgctgcag
gagtcacgtttcacgcgtcttcgtcgttgatattcaaatattatgcgaaa
ttttcgactttaagtcgtcttgtttgcaTTTTTATGGGATAGCATGATTC
TTCATTCAAAGTCATTAAAGGTTTGCTTGTGAAAGTTTCGTGACAACCCA
TGGTTGCAGTCTTAACAGTTTGAGATATTGGAATGacattttcttaaaag
aaaattgtctttttttatatcaaaatctgcatcaaaaatgaaagtagtct
cttctactgatttaTACTTTGTGGCGCTCCTTTGCAGACTATTTATTCAA
TTTCTACCAATAAGATTTTCGCATTTCACATAACCCTTCTTTTGGCACCT
GTGGCCTTTTGCCcaacgggcggctgtaaaatatCACCCTCCCATAATat
aaatgggccattccagaatttgtctgtaacagggtgTGGATGACACAGGA
TTTCTGAGGGCAAAAGCtttcaccaaaatttccaaggcgagagaagaaaa
tgtatgaatctccaaggcaattgaattaaaaaaggcaaaaaagagtggaa
tttctgaTGCATtatgcaaaagtacatggatttttatctcaattttcgac
caccactggaaaaaaaaattatttccgaggctagaaaaaattaaaaaatg
cacgtcgtctgATGGGGGATACAGtaacaaaatttttctggaatggctAG
ACacctcttttatttgtttcaatttgtGATCCTAAGGTGTaaactttttc
tcatcttcaattttacTAAGAAAGCAgaaatttgatgcaagagttagatt
gtcaacaaagtgcagtaaaagaagaacttaaaatatgaaatattttcatt
ttgaagaattaatgcaaaaaagtgaaacatagaaaagttttattttttaa
tgctttaattgaaatgggggatttggaaaattatcTATGTTTAGTTATTT
TGCACTttaaacccctgtaactataggcaagcaccctgttgctaagatgc
tgacttgaaatcgaaaatgaaaccactgaaaaagaaagtaaaatcggccc
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AATTTGAACTGAAAAGCAGCAACAAAGGTGCAAGAATAATCCTTATTCAG
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tctaggctcagatatggggaaaaattaagcatatggcaagcattacttga
gcctacgaaaaatgtttttttcctaattttggcTTGTTGGCTTGTTGGAC
TTatggattttcagtatttccctaaatttatgctttagatttaagcatcc
cctcaagcatttttcagccttattaagcttttgacctaagcatctctgag
cctgttttcggatttttgtatgcttataaaaaaaacatgttatcTCCTGG
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taACTTCCTGGTATGACATCATAATTACTTCTTTCAATTTACGTGTTTTC
ACAGGTTGATGTGTGTACTCTGTctccagtttgcagagtatggcagaaat
catTGAGATCTCGGGGACAGGCGTGCTCCATTCTCAAGAACAACGGAAAA
TTAGCCAATTTCGTTAGTTTTTCTATCTCTTTCAAACAGCTTTTCTGGCA
GTTACACAAAGTTTAGGAGTAGGGTTtcaatgatataatttttcCTTGGG
GGCAGCCATGACTGAAAACTGGCTCTGTCTTTGTGTATTTTTAATGGTAT
CAAAACAGATAATGCTATTCTTTAAGAGCAgttttctaaaaggttttatg
ttttgtattttatttctttttttaattattaagtttgatcttttattgtt
ttaatgagCATAATATTTCTTCTGAAGATCCATATGGCTTTCTTATCATT
GTATAAACTTCCATatatatgttttgcatattttccaactaaattcaACC
ACAGCTTTTTCGTTTCTGTACTTTTGCATATAATCCAAGATGGTTGGTGG
AAaagcaaaaaggtctattgaaagtTTCAAGTTTCTATTTCCAGCAAAGG
AAAGAAATTAACCTGATAAAACTCTTTCTACACTATAGgaaacaaaattt
caagataTGTCTGgggctttaatgctttaaaatttcctaACGAGGAAAGT
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tattttgcacATAGACAGTATAGCCCTAACTTTTCGTATAATATAAAatt
tacgggaaacgcatattttgACTTTGTACCCAATACTACACACAAGAACT
TAAGCTAAATCTATCTATCTTTCTATATTTAAGTAGTATTAAAAATGAAT
GTTCATTATTACTACATataaaagcatttaaaaataaagataaaggttaa
aaaatagtgaaaatgtCTATgtttattcaaatatatttaATCACTGGTaa
tcaaaatctttataaaataaaaatatctttgtCAATAGAGAAATCTGCAA
AATATTAAGTCACTGGGTGTATAGTTAGGATTGCAAAGAATATTGACTCC
AAAAGGACCAGAAAAATCTGAAGTGACTCAGaaaaaaatgcaatgcaaag
cgggaaaaaagtcagtttgcaaaaaaacgccacatagaagatctttcgag
ttcagtatgtgaatagagcagtaaaaaattcaacttttctatttttcctt
tttttttgataatgatAATCGAATACTccactatccactgatgatgagcg
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acagattaaagtttttgcTAATCTAGCACcggatgtagaaattttcttcc
gacacgctaaagctctgaaggtcgggaaactttcaacatctggaaggttt
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gaaatactcaaataagtatttttccttctttaaactgatcacagaagcaa
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aaaatgaataccaaccctcaatgaacacttttgtgaagtttgctaaagat
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ttagtttctttggtctttgaatggtataaaatttgagaaagtgcagaaaa
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ggatactaaaactaatattcagggagtgataagtacagttaaactacaaa
aaatccatcaaaagaaaccaaaaacaaccatacattttttgaaaaattca
tcagccatgttgtttgtaatttttgccgacatactcatgacctggtaact
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ATTTCACTGATGATGAATGTCGTCAATGGACGACTACTATCCCTCTCCGA
TGGGATATTGGctcgctcctttagagctttagcgtgggcggccgccaata
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GTTCTGCAAGCGTTTCGGCTCAATCCTGAAACTGCGCAAAATGGGGTAGA
ACTTTGCTGCGGCAGATCATTTCGAAAAGTTATTTCGGAAGttattggaa
tgtttacaaggttcttgacagaaaatcctttgtttgattgtcaatgatga
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ACTTATAAAACTAAATATTCATGTTTAGGGCCCTTTCCTAATTTGGAAAG
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acaaatatttttttactcataaattatttttgacaatataccgggtgtgc
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TGAAAGTACGAAAGTTGAACACATGTACGACTAATTATCATTTATATGTT
TGTCAAGAAAATAAATCAAGCAATTTCATGTATATATGTCGATCATTTTG
TATCTTTCAGCGTTATAATCGTCCAGAAGATAACACAGATGAAGAAGCCa
catttgttgaaaaagataaagagtaagaaatttcttttctgACTGAAAAA
CCAGCTTTCTCGAAAATGAACTTTAATTTTAAGTTACCTATAtggaacta
ttttttttttggaaacttACAAATTAtcacaaaacaaattttgcCTTTGC
TGGGTATCTCAAAGattgagcttaaaattttattgatgaataaaaattat
tattattttcttattgaattattgatcaaataattttgCTTGGCTCCAGT
TTCACAAAAGTTACATAAAGAATTCTGTTGAGCCTAGTTGAGCATGTAAT
TTTGACCCTGTTTGatctaaataaaatataaaatacttcTTTTGGTTAGG
TTCACCCCGAGTCAACTAGTTGCAAAAGTTGAAGAGAAAGACCTCGAGCT
ATCAGTTGTTGTTGACATCACATTCACTTTCCGATATTATAATGGTGTAC
ACgtaagaattacaaaaaaacttatTACATGTTTGTTAATTACACATACA
AGTCattgaaataaataagaaactagtttaaaaaagacaaatttaCGATA
TGAGGGTACATGTTGATTGTATATAAGtttaattttcttagaaaaccTCC
TTAGAccaaataaaattttggttAAGGTCAATTTCAATTAATATGGTTAG
TTTAGAGTGTACAGCCCGAATACGTGACCTTTTTCCCTAAGCAATAacat
gcccattcacgcatttacacaaaccgctgggggcccctAATAAAGATAAA
CAGGTCCTGTTGCAGATTCACCGCTTAACAAAGCTCTGCAATATAACGTT
ATAAACTCAAAATTAGTCATATTTCGGAACTAAAAGGCTGCTCATTCTTT
AAGAGATAAAAGTTTCTTGCATCATGTTTTTCATAAACTTTTAAGGATGT
TTTAAGGGTTTTGCATCATTTTGTTTGTAACCTCAAAATGTTTAGTATTG
TGTATTTTGGTCTAATGCCGATTCAAAACCTGCTTTCTTAGGAATTTGAA
AACAAGCACAATATACAATATGATAAAATCAAATGTCCTGGACAACAAAT
ACCACCTGATGAAATTATTAACAGGTTTGTATATCCATCAACAACGGTTT
TACGGTATCACTGCACTGGCTAAAATTTGCtttcaaaacagttttttttg
tgaaaataatcCTTAAAGATCTTAGttttcaatcactttttttaatttaa
agttCTCCTTCCCaaacctaaaaaactaaatgatatatatacattttgaa
aaagcaaaggaaatgataaaaatttgcTGTCCTTTTTATGTGATTTTCAG
GTTTGCAACCATTATGAATGATTTCATATCAGAAAATGGTCTTGATGGTA
AAAGTGAGTAACTACTTCCTTAAATAGATAACGCGTAGACTTTTCTTGCT
CACACAAATCGAAGATCTAAAATTTatgcgtggacaaaatttcgctaATT
TTTAAAGAAGTTACCTTTATGTCAGCTAAAGATTTCGACGAGAATCCtac
aaactttttcttcaaatttttccaaattaatTTTTCCTCAGAATTAGTAG
GATTACATTGCACACACGGTGTGAATCGATCTGGGTATGTGTTGGCAAGA
TACTTGATAGAATGGTTGAACTTTGAACCTGAAAAAGCGATAGAAGGTAT
GTATAGTCTTGCtttatgaaatctttttagtCTAATTATGTTACTTTTAA
ACAGAATCGTATGCAGACTCCATAATTTGAGCCCTCGAGTCTTAGCAACC
TGGTTACTTAGAGAAGAAAAATGTTAACTTATCTTATTCTTTTGAGGGGT
GTCTTTAGAACCAGAATTTGAATGGTggctttttattctttatttgaTGT
AAATTTAAGCTGTTGGTAAAGCCCGTGGCTATCCAATTGAACGAGAAAAC
TATTTGCAAGATTTGAAAGAAAGGAAAGCCAGAAAGTAAGTTATTATACT
GTGTACTATCGTTCTGATTTCATTTTGGTGTGCGGTGGCATTGGCTGTAA
ATGTAGTtttgaatgattattttatgTGTACTCTTTGATTTAACCTATAT
TCATGGTATACACCACTGGAGAgccttccaagaattttcaaaaacttcca
cccaatacgtcattttttctactttttaagtgacgtattgggtaggaaat
tttaaaagttctcagaagactccccagtgatgcatatcatgaattattcg
aatatttccttATCTCGAAGTATCTCTCAAAATTATCTCCTTAATTCCAA
TCGGTCTctaattttaaagaaaacagGTCCCTTTAAAATCGTTCGAGAGG
GAGAGGTAAAAGTAACCTGTAAGATATTTATTCTTTTCACTCTGGTAAAC
AATACAACCTGCCATTTGTAGAGAGTTTTATCTTCTCCTCATAGAGTGCT
CGATAAGTAATTAGAGCGTTACTATAAAGTTATCTGCCattgaaatcttt
caaaaatatgaCCACATACTCAAGAATATGGGTAGTAAAATTTGCAACAC
GGAGAGGACCTGAAAGCAAACAAACACGATCTACCATTGGAAATCTCCAG
CGCGCCGTTTTGCTACCTACATTCATCAAATGAGACATCAGAACGAAGAA
TGTCGATCAACAAACCAATCAGATGACGATATACATACAATATTCCTATT
CCTTCCATACAAAACAATATTCCTCATTTTCTTTACTAGCGGTTACGAGG
AGTATAATGAAACCAGACCGTCTGCATTCAATGTGAGAAAAACTATCGAT
TTGAGTGCATCATGGGACGAATGGATTCACAAATTCGAAGAGTTTTCTAA
TAAGCTTCAGTATACTGGTGCTAGAAAGAAACAGTCTTTGTTTCGCTTTG
CTGGAAAGGAATTGCAAGAAATTTATCAATCCATTGATCATTCTGGAGAG
GATTACGACTCAATACTAACggatttgtttttgtatttccaTGGTGATAA
GCTTTCGACGAATGTGTCTTACCATCGGTATTTCATTTTTCGACGGACCC
TTATTCGTGCCGGTGAAGGTTTCGCAGAATACGTCGATCGGTTAAGAACG
GTAGCCGAAAAGTGTAGTTTTGTGAACACTGATGTTGAGATTGTAAATCA
CGTGATTGACAAATATGCAAGCGATGCATTACGTAATGTACTAATACGTC
AACCAGAATTAACGTTAGAGACAATGATTGAATTGGTGTCTCAAAACAAA
TATCTCCaaaaagagatgaatagaaaagaaccggtaaccgaggaaaacgt
tgaaaaacctgaagataaaaagaagaaaagtaaaaagaagaataagcgga
aaaCTGCAACAAACTCATCTACGAAAGATATGGACAAAGATACCTCTAAG
ACAAAACCAAGCAAATCGAAAGACAAAAAACTTGTATCCAAACCTTCAAA
ACGCCAGAAGCGAAAACCTTTTTCGTATTATTTTTGGCTGAACAATGCAT
TTGTATTTGTAGCTCTAGGATTTTTGTTCAAGCGATAATTCTTTATATAT
CTAGATATATGCTTATAtaaccaaagaaatataagagtaGAGATTAATCT
TtactcttatatttctttgataTAACCAATCAAACGACACTTGCACGATC
GAATTTTGTATacacacacacacCTTACAGAAATAACACAACTAGTTTCT
TACATACAATTCAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000082_pilon:303196..318959+ >MSTRG.11361.1.p1 ID=MSTRG.11361.1.p1|Name=MSTRG.11361.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=12420bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000082_pilon:303196..318959+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGGTCAAGAATTCCAGAAAGATGGTTGGATTACAATGCAATCAATGA
ACCAATCGAAGGTGCCCCAATCATTGCTTTTAAAACTCCTTTGTCAGATC
GTTATAATCGTCCAGAAGATAACACAGATGAAGAAGCCacatttgttgaa
aaagataaagaGTTCACCCCGAGTCAACTAGTTGCAAAAGTTGAAGAGAA
AGACCTCGAGCTATCAGTTGTTGTTGACATCACATTCACTTTCCGATATT
ATAATGGTGTACACGAATTTGAAAACAAGCACAATATACAATATGATAAA
ATCAAATGTCCTGGACAACAAATACCACCTGATGAAATTATTAACAGGTT
TGCAACCATTATGAATGATTTCATATCAGAAAATGGTCTTGATGGTAAAA
AATTAGTAGGATTACATTGCACACACGGTGTGAATCGATCTGGGTATGTG
TTGGCAAGATACTTGATAGAATGGTTGAACTTTGAACCTGAAAAAGCGAT
AGAAGCTGTTGGTAAAGCCCGTGGCTATCCAATTGAACGAGAAAACTATT
TGCAAGATTTGAAAGAAAGGAAAGCCAGAAACGGTTACGAGGAGTATAAT
GAAACCAGACCGTCTGCATTCAATGTGAGAAAAACTATCGATTTGAGTGC
ATCATGGGACGAATGGATTCACAAATTCGAAGAGTTTTCTAATAAGCTTC
AGTATACTGGTGCTAGAAAGAAACAGTCTTTGTTTCGCTTTGCTGGAAAG
GAATTGCAAGAAATTTATCAATCCATTGATCATTCTGGAGAGGATTACGA
CTCAATACTAACggatttgtttttgtatttccaTGGTGATAAGCTTTCGA
CGAATGTGTCTTACCATCGGTATTTCATTTTTCGACGGACCCTTATTCGT
GCCGGTGAAGGTTTCGCAGAATACGTCGATCGGTTAAGAACGGTAGCCGA
AAAGTGTAGTTTTGTGAACACTGATGTTGAGATTGTAAATCACGTGATTG
ACAAATATGCAAGCGATGCATTACGTAATGTACTAATACGTCAACCAGAA
TTAACGTTAGAGACAATGATTGAATTGGTGTCTCAAAACAAATATCTCCa
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
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The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
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|---|
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|
