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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000081_pilon:996172..1029276+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11309.1.p1 ID=MSTRG.11309.1.p1|Name=MSTRG.11309.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=33105bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:996172..1029276+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATTTTGAAGATTAATAACTACCAATATTAAATTTTCATAGAAATATACAC
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ATTGATTGATATATTTATGTTACTGCTGAGCCCTTCTCACTGCTCAATTT
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AGAGTatcaaaaaattgtcgaaaattaGCTTGCTTGATATACATTGGTTT
TACTGTGAATAATCAATTTCTTGTGGCATTAAAATCAATGGTTATTTAAT
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TGGTTTGGGTAGATTATGAAGGAAACGCATTGTTCAAAAAATGTAAGTAT
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GAGTCATATTCATTTTAAGAAATTATCATTTAATAATCAAGCCTTGAATA
TTATATTCTTATCATGCAGGAATAGAATGAATTCTTCTTCATAATGTTAG
TTTTTTCGTTTGAAGAAATTTTATATCTATTCAAAAAATAATGGAAAATT
GTTAATTAACAGACGAAGCCGATTATTATTATTGAATTTTTAAAattttt
aactgtCGCATATCTTGTCGTAAAATCTTttaattcttcttcttttttta
tttcgaaattATTGGGAGAATAGAGAAAACATGAAACTACATAGAAAATT
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ATATCTAGAAACTGTAAACAGaaaaaaaGTAAGTGTCTACATCCTATTAA
TTCAATTATTTGTCTTTATTATCACTCTTTAATTTCCTTGCATACCCTAA
GTTATAGTTTTGGTATTCGTTGAATCTATTGTTGACACCTCGTATCACTT
GAACATGATTTATTAAATCTTATACATACAAATAATATATTGAAATGATT
CTTAGGTCAAAGTAAACGTTGAATTATGATCTTATAATTAATTGTGTGTT
TATCGTAAATTAATCAATGTTTGAAGGATGATATGTGCCATATGGTATGT
CAACAATTTTGGGTTGAAGTAACACCAATATTTAGTCAATGATCGCATGA
TTTTAGTGAATGAAAGAATCGATTAAAATACCTTAAATTTTATTGAGAAA
TTTGTAGTCAAGGTAAAGGAATATTCTGGaaagttaaattttctttttga
cattgaattttctttttttggcgaccatacaactttcactttttttgGAA
CTTGGTACGGAGACATCACAGTTAAAAGCAGTGTTTTAATTCAAACAACA
AACAAGAGTATGCGAACAAAAATTGTCAGCATTATTTCAAAGAAAGACAC
TTTGTTTGCTTTTTACATAGCCATAACTCTTTTCTTTCTATTCTACAAAT
GATAAATAACAAAATAAGGTTTTACTTGAAAtgttaaaaatgcaattttg
gTCGTCATGTGTACAagacaaatctcttttgaagtACGACTGTCAGTCAA
GCGACTAGACCTTCGTATAAAGCGTCTTAAAGATCATAATCTGGAGCAGA
TATTGCATAAGGTCACTTAAATCTTGTAGAAACCTGACTTTTCCTCTCAA
AATGACCCACCCACTTAGATCTACTATTTCAAGAACTTGTACTCATCCTA
AGCAGAGTTTCTCTCAacatttaatcattttttcctCTAGTAGAGAATGA
ATATAAGAAAAACCACGCAAAATCAAGGTTTCACTTGAAAGTGACTGAAA
GATATCTATCTATTTAACTGACCTCATAAGAAGCGtctcaaatgaaaaac
aagaGACCTTATATCATACACCCTCATCTTTCAATTCTTAATATATATAC
TCTCCTTTTTTCATTCCTCTGAAATTTCTTCTCCTTActtctcaaaatat
ttctacTGAACTTGCTTTTTCTATCGTTTAGTTGAGcctaaatttttgaa
acatgACTTTTAACGAAATTTACACGATGGTACTAGTTTATTGGCAATCA
TTAAATGTCTCTgaagggaattaatttttgtggGACTTAttttttttGCG
GAACGAACTTATTAATGAGAATTAGTTTCAGAATGAACCCCTTTATGTTC
TTGATTGCTCAAAGAAACAAATTTGGAGCAAagtttttgggtttcagaaa
tCAAAGTCTCAGAAATTACTCCAAAATATGAGAAAGTCATAACAAAACCA
TAATATaataaagaattttctttaaattttcagttGCTTACACCCCTGAT
CAATCCTGACATGTGAGAAAAATTATGACATGGCTGAGTACCTTCTACCT
AAGAGCGTTTGTGGTTCTTCTACAAATCACATGCATTCTATCCAATGGTA
AGAATTCATTTTTGAACCCTGTGTACACACCTCCTAACCTTCTTGTTGAT
CCCATATTTTTGTATGATATCTCTCAAAGATTGTATAACCCCGGTGTATA
ACCCGTAATATATTGCAATACGGGTATTGCTTATAGCCAGGCCTCTAGTG
TTGCGCATTCGGTTTCCTTAAGTGAAGTGAGGCTCTATACTGCCTATTTT
CAATACCACTTTGGTAAGAAAGCACATTTTCCTGGAATCTGAACTATAGC
TTCAAAATTACTAGGAAGAATATTTTCGTatatttgataaatattttaca
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CATTGCGTTTACCATAACGTTCATACCGTTATTGGAACCTAACAGGAAGT
TAAGGGGTGAAATAGCTTACTAAAACTCTAATAAAAAGATTGTTCTCTCT
CATCTTTTTTCAGATGATTATGGCCCTTTACCCGGTTTCAAACAACAGCC
AATAGACACACTTATCGAATCACACAATCAATCAGTCGTTTGCAGTATCC
GTGGTGAAAAACCGCTCACCGTTACCTGGCGTAAAGAAAATTTAGTATTA
GActcaaagaaattaaaatatttatcagTATCTAAAGAAGGTTCAATAAC
ATTATATAATACACAACGTGGAAGAGACGAGGGTAATTGGAGGTGTCAAG
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tattttttccttggaaCAGTATGTTTATGCTTAGAAGAACAATCCTGAAT
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AAATGATTGCCCCTTTGATCCTCCTTATTTTACTACAAGAATATATCtat
ctatg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000081_pilon:996172..1029276+ >MSTRG.11309.1.p1 ID=MSTRG.11309.1.p1|Name=MSTRG.11309.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=55152bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:996172..1029276+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGACATGGCTGAGTACCTTCTACCTAAGAGCGTTTGTGGTTCTTCTACA AATCACATGCATTCTATCCAATGATGATTATGGCCCTTTACCCGGTTTCA AACAACAGCCAATAGACACACTTATCGAATCACACAATCAATCAGTCGTT TGCAGTATCCGTGGTGAAAAACCGCTCACCGTTACCTGGCGTAAAGAAAA TTTAGTATTAGActcaaagaaattaaaatatttatcagTATCTAAAGAAG GTTCAATAACATTATATAATACACAACGTGGAAGAGACGAGGGTAATTGG AGGTGTCAAGTTTCCAATTCGTACGGAACAGTTTTGAGCAGGAGTGCCAA AGTTACTTTTCCATatATGAACGAGTTTTCAGAACATGACTTAAGAATCA CAATAGAAGAAGGTCAACCAGCACTACTCGCTTGTTACGCTCCAGACTCC TACCCAGATCGCTATATACATTGGTTAAAACTACGGAACCGAGGACACTT CCCTTTACAATTGGACACGAATTCACATTTCACAACTAGCTTGGACGGAG ATCTCTATTTTTCTTACACAACACGATCTGACGAAGGCGTCTACTATTGT AGCGTTGAAAATAGTAAACTGAGGAGGTTCGAACGGAGAACCGTCAGTTT 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GACATGGCTTGCTGTGGCTCCAACTGTAGATATATCAGGCTATAAGCTGT TCTATCGGAAAGAGAATGAAGCTGAGGAAAAGGCGTTGGCTCTTTGGGAA CAGAGCAACGACATTGTATCTACTGTACATAACTTGGATTCAGGAACAAC ATACTACTTTCAAATAGCTGTTGTCAACCAATATGGTACTGGACCAAAAT CAAAAGTTACCATTGCTGCGACCAAATTCAAAGAAGGTGAGCCCCCAAGA CGAGCGACAGAAGCTGGCAAACAAAGTACATCAGTCAAGTTGACGTTGAG TAGTTATCTAGTGGGAATATTAGTTTTAATTGCATTATTGGTACCAAGGT GA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000081_pilon | genome | sc0000081_pilon:996172..1029276 + |
|