MSTRG.11298.3.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11298.3.p2
Unique NameMSTRG.11298.3.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000081_pilon:851069..861702+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11298.3.p2 ID=MSTRG.11298.3.p2|Name=MSTRG.11298.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10634bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:851069..861702+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aagaagatgaaatttttctcagcTTTATTGCAACCAAACAGAACTTCAAT AGTCTGGATGATAATTTTAATCCAAATAGCTCGATAGATGATGTTATTCA ATCAGAAATCCATTGTGTAGAAAATGGAGAATATGCTGTTGAGAAGATGA TTATTGATGATGACGAACATGCCACTCAAGGTCAAGACCAAAACTTTAGT TTCTCTACAACTACTATAAATGACACTCAAGGGGCTGCTGAGGAGGAACA TAATGATGCATTTGCAAGTGTCCGTGACCAACTACAACCACAAAATAATG TAGGTTTAATACAATTAGATTATAAAGGGATAGAACTCCTAGACTATATG TATCACAAGTGttttttttCAACCGGTATATATTTCCAACtgtccaacga agccatattttggtttgtacagaaattttgcccgctcaaatctaaataac aaaatggtcaatctcactaaagcaaaacattgcggccacggcatttccgC CAATAAGACGATATTGGTGAAATTGGATGATTTACGACCCTGCCGGCGCA CCGTACGTACAGTCCGGTGTTTTTTGTCCGGTgtcaaaaagtatcctttc gctacaccggatgTGCGGTAAGActggtgtcagtccggtgttaaATGCAG GGAGCTCTAGGCACCGAACATgcgtttgaaaaaaattaatgtgTAATTAC ACAGCCTTTCTAATTCAGATTTATTTGCGTTGGCAAAAATTCTGGGTCCT ATAGTACAGTAAGCACTTTTACGTCAGCATAGCCAAATTAGAATGGCTGT TACACCTTTGCACCTTTGCACCTTATTCTAAATTCATGTATAATATTTTC CAATTCATTgaatttttatctctttttatAGGACTCTTCACAAGAGGACA GTCCTTTAACGTCAAATTGGGGCGAtttttttGATGTCAAGCTTGAAGAC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000081_pilon:851069..861702+

>MSTRG.11298.3.p2 ID=MSTRG.11298.3.p2|Name=MSTRG.11298.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=11280bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:851069..861702+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11298MSTRG.11298Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11298.3.p2.exon1MSTRG.11298.3.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon2MSTRG.11298.3.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon3MSTRG.11298.3.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon4MSTRG.11298.3.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon5MSTRG.11298.3.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon6MSTRG.11298.3.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon7MSTRG.11298.3.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon8MSTRG.11298.3.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon9MSTRG.11298.3.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon10MSTRG.11298.3.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon11MSTRG.11298.3.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon12MSTRG.11298.3.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon13MSTRG.11298.3.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon14MSTRG.11298.3.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11298.3.p2.exon15MSTRG.11298.3.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11298.3.p2MSTRG.11298.3.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000081_pilongenomesc0000081_pilon:851069..861702 +