MSTRG.11284.7.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11284.7.p1
Unique NameMSTRG.11284.7.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000081_pilon:603585..626050-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11284.7.p1 ID=MSTRG.11284.7.p1|Name=MSTRG.11284.7.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=22466bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:603585..626050- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AACCCAAATGATTTTGATTTTCCTGGAGTATTTCCAGAATACTATCACTG CAAGAAAATTTGGGCCCATATCTATTGCCATTTTTAAGATTTTTCCAGTC CAAATTTGGATTTTTGCCTGAAAAATGGCTCTTAGCAGGGATTTTATTTC CATAATGGGGGACATAGACGCATCCCAGACCCAAATGATTTTGATTTCCC TGGAGTATCTCCAGAGTACTATCACTGCAAAAAAAATATCAATCAGCATT TAAACTCAGTTTGTAGAAGCTTGCCTTAAAAAATGCTATATTTTGATAAA TCTGATTTTTTTTGCTAAAAAGCGATTTTTGAAGACGCCATTATGATTTT TTGAAAAAAGTGAAAATCTTGAAAATCATTTTGCTTAAAGACTTTACTGA AGACTTCCATCTCTGAAAATTTCAGAGGTGTGAATCAAGTAGTTTAAAGT TTATGAACTTGCAAAATTGGCCTTAAAAAGCATTTTGCTACCCAAAATCG GCTTAAAACAGCTCGTTTAGGGCTCCAAAAGGCACAATTTTCAATCCAAT ATGATTAATTTGTTGTTTCTTCATAAAATTTAGTACAGCAAGTAAAAAAA ATAAGATTTGCAATAGTTTTGACATATTTACAGGCCTTAAAAGGCCAGAA AATGCCATTTTTTCCAATTTTTGCCTGTAGTGCGAATCAGTACCCCCAGG GGGGTTCAGCCAATTTTGGACTTCTGACCTTAAAAATTGCGCAGAATGAA TTACAATAGGTTAAATTTTCATAAAAAAGCACTACATCTTGAATTTGAGC AAGTTTTGGAAGAGATATGAAGAATAAACCTCAAAAAAGATTTTTTGGTA AAAAAGCCCCCCCGGGCAGTTTTTTGGGCTGGAATTCGTCAAAAATGCAT AAAATTAAAAAAAAAAATTTTTAAATGTCTTCTATCATTATATGGAACAG AAAAAACACCAGGCGAAGAAGATCTGAAGAAGTTACTCTACCCCCTACCC CTAACATAACCTTTGAACCAATGAAGAAAATTAAAAAGTAATACGCCAAA TTTTAAGTTAGGCTTTCCTCTGAATGATTCCGAAACAAACTTTGAAAAAT CTCTCTACAACTGCCTGCAATATCAAATTAAAGAGGGTAACTAATTTGTG GCACACCAAGTAGAAGAAAATCAACTTTGTCTGCTGAAAAGAGATAAGTT CCTATTTCCATTGCATACCATTCAGGTTCATCAGTGTTCACAGAGCTTGA GAAACGACAAGAATCACAAGCAGCCCTGCCAACAAAAGATGTGAACGACC ATGTATTAGCATTACGCTTGAATCGATGGCCCACATACGTCCATGAATGT ATTAAAGATCAACTTTCAGATGAAATTTTTCAATCTATTAAAGGTAGGTT TCAAATGGGCTTTTCCAGAAAAAAAATTGAATTTGGGGGTGAAGGATGTA ACATTTTTTGACCCCCCCCGGACAGCAGTTCTAATGTCCCCCAACAGCAG GTCTAACCCCCCGAACAGCAGGTCTAACCCCCCAGACAAGCATCAGTTGG ACCCCCCTGGACATTCAAAATCACCCTCAAACGGAGAAAAATTACGCACA AACAGAACAGGTTTACAAGGACGCAAGGCAAATTTTGTAGTTTTTCACTA CCCCCCGGACACTATATCCTCCCCCCCCATGTACGAACATTTTCTGGAAG AGCCTAATGTACACCGTGGTAATCAAAAAATGCATCGCTCTCACACTGTA AACTATTACTTCTTGACTTAACTTAACTAAGAGTCTTCTTAACTTGAACA AGCTTTATGACATCTTCAGTTAACAATATAACAATAGCGTTCAGTTTGAG GTCGTTGTTGTTATTTTCTGCCCGCGCAGTTTGATTATTCGCCCGATAGT GTCATTTGGGCCCAACGCGAAGCGGAGGGCGCAAATGGCACTAGAGGGCT AATAATCAAATTGCAAGGGCAGAATTAATGACAACAACGAACGAAAACTT TACGCTATTGTTATATTGTTAACTTAGTTTAGTCTCTTCGCTTCAATGCA ACGACTTCAATCCAATTCCGAGCGGGCCGCAAATGACGTTATTGCCCTAT ATCCGAGCGGTTAATAATATTTCAGCCCTCTGAAGCCTGGCGCTTTAGTT TCCTCAGCGCGGGTATGACAATTTGAGTCACAAAACCTTTCAATACCGCC CGCCGATTGAACCTTTAATGGCTTACTTAATGACCGCTATATGGTTAACA ATACTTTATAAACGTTACTCCATAACTCGAAATTTCCTTCACTCGAATAA ATTTTGTTGTGAAGACTCGGCTGTAGTTTGGCTGAACTTTTACCAACGAA TTGACCAAGTTAGTAGTGCTGGTATTGACTATAATGTTACACATCGTATA TCTATAGACTGGGGTTGTTTATAACATTATGCAACTCGACGCCTCTTTAC TAGGGAAAATTGTGCAAAAAAAAAACGCAAGTGAAGCAAGCCCAAAATTT TTTTGACATTTCCCCGTTTTCTAGGGCTAAAAACTGCCATTTGTGAGGTA AAACGGGGAAAGGGGCACTGAAATCAGGGGTCGGTAGTAAAATATCAGAC ATATATGAGTAGTAAAATTATTATTACGAATTTTTACATACAACCACCCT GACTCTTGGAAGAGGTATTTTACTACCCTGGTAGTAAAAGTTTTTGGGAT AATTTGTCATGGAGACCACCTATTTTTTGGCTGCTTTTCGGATTGATTTT ACAAAAAAAGCTAAAAAATGATTATTTCTGTGACACATTTTTCACTTAGT GCAATAATTAATGTTTTGCCCTTAGAATTAAAGTTTTTTTTATATTGACA AAAAATTTCGAGAATTTGCAGCAAACAACTTTCCAACAGAAAATTTTTTC AAATTATAAAAATTTTCAGATTTTTTCAGAAAAGTCATCCAAAAAATTAT AAAAGAATTACAAAAATAGCTAAAATTTGTTAATTTTACCAGTTTTAACT ACCCAGTGGTAGTAAAATCTGTTCAACTTTTAACACATAGATACCGCCTA TTTTAGTATTTAACTACCCTGGTTAGTAAATTTTTTTTCTCGCTTTTTCG TCACACCTCCACCGTAGTATAAAACGTCATTATGTCTGAGAGTTAACTAC CGACCCCCCTGCTGAAATCAGTGTTTTGAAGAGCCTTTTTGCACCCCTTT CCTTTTCGGCACCCCCCCCCAAAAAAAACCACCTGTCACCATGCTACTGG TTGTAAAGTATTGTGATAACTATTACGGGATAATTGAAGTTAATAATATT AAAATCTTTCAGTTTCCATACCTTAACAAACCATAGACCTCGTTTAAATT CACTTAGCTTCACCAAAATTTGACACGATTTTTAAATAAAATTTTCCCTC TCCTTTTCTAGAGAAACCTTTATATCTGGTCTGCAAATCACATCCGAGCA GCTCTGACGAAAACAAAGATTATGAATGGAGATTATCATTCAGTGTTTTG GAAATTGAAATCGCAAAACTAATTAATGACAATCTAAGAAGGTCATACTT GATGTGTAAACATTTATTGGCAAAGACAAAACTATTGAGATTCCCAAGAA AGGTACCCAAAATCTATCTGCAGATTTTTTAAACCAGCAATCTCAGTATA AAATTTAAAAAGAACTTGCTTACCGTCAATCGCTTTTTAAACCAAATTAA AAACAAGTGATACTTTTATGGACCTACATGGTTATGCATTTAACATATTT ATAATTGATATCTACGTGACGTGACCATTAAACAGTCATTCAGAACACAA ATAGTGACGATCTATCAAAATTAGTCGTTTGTTTCTTATAAAAAAACGTT TAGAAACCAAAATTTCATGCTCTTGAAATATTCTTTCATACTAAAGACTT CGTGAGCAAAAAAAAAACATCTATCTCATCAAAATATTGAGTAATTTGGC TTAGAACATTGATGTATGCTTATTTAATAGTGATTCTTATAGATAAAGAT GCGTTTTTTGAGCTGAAAAATTCTTTTTTTTACAAAAATCTGTTTGAGCC ATCTTTTACCTACTTTCATTCAAAAAATCAGAAAAAATTAATGATCCAAT ATTTCACATAGTCCAAAAAACTCATTTTTTTTTCTCCAAAAAACGAGCTC CGTCACATTCGAGGGTTTATAGTTATGCATCTTTGTGCAAAAAGTCATAA ACAATGAAAGAGCCAATCTCGAGAAAAGCTAATACCTAAGTAATTGATAA TGTGCTTATAAAAAAATATCGAATTTGGCCAGTTTTTCTATAAAAACACG CCAAGCAACCAAAATTTCATGTCTAAACACACATATTCTTCAAGAGTAAG CCCTCATGAACGAAAAAAAACATCTATCTCATTAAAAAATTGAGTAATTT GACTAAGAACATTGATGTATGCTTATTAATAGTGATTCTTATAGATAAAC ATGCGTTTTTTGAGCAAACATAATTTTTTTGCGAAAATCTGCTTGAGCCA TCTTTTACCTATGATGGTACCCTACTTTCATGCAAAAAATCAGAAAAAAT TAATGATCCAATTTTTCACAAAGCCAAAAAAAAACAATTCTTTAGCCGTT TTTTGGCAAAAATTTGGGCAAAAATTTTTTTTTTAGAAAATCGGGCTCCG TCACATTCGAGGGTTTATAGTTACACATCTTTGTGCAAAAAATCAGAAAA AACTAATGAACCAATCTCGAGAAAAGTTGGTAACGAACGAACGGACGAAC AGAGGTTAATTTATAGGACCTCCACCGGGGTAGGTCCAAAAATTCGCATA TACGGTTTTATATGAACTTCCAACACTTTTGAAGTCTCCGGATGTTCTTA ACTTTTTGGGTTTAAGGCTTAAAATTGTTCTGATAATGTTCTTACGTTCG CCGTTCGCGAGTATCTTTGTGCATTTTCTCACCAAATAAGGGTTTTTAGG GTCCATATAATGCCTTAGAATGTTTTTAACTTGTTCTTAAAATGTTTTTT GCCATCAAAGCCTTATGTTTCTATATAGTTTGTTCTTAACATGTTTTGAT TTGAATGATTAAGGTACCTCTTCTCTTTGCTTTAGTGCCACGTCAAATCG TACGAGCTGAAGACAGTTTTCATGTGGTTATCAAGAGAATTGGACACTTT CGAAGGACAAGAATACGATCAAGTGGAATTAACATTAAGCATATTTCAAA GATTACTTGAACATTACGAAGAAAAAAATCTTTCAAATTTCTTTCTTCCA CAACAAAACATTTTGGATACAAACAAGGAAGAAAAAATGATCGAAGGAAG GAAATTTTTGAAAAACTACTTCAGTGATGAATACCATATTGCTCAATTGA TTGAGATTCTAGGCAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000081_pilon:603585..626050-

>MSTRG.11284.7.p1 ID=MSTRG.11284.7.p1|Name=MSTRG.11284.7.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1908bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:603585..626050- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGCCACGTCAAATCGTACGAGCTGAAGACAGTTTTCATGTGGTTATCAAG
AGAATTGGACACTTTCGAAGGACAAGAATACGATCAAGTGGAATTAACAT
TAAGCATATTTCAAAGATTACTTGAACATTACGAAGAAAAAAATCTTTCA
AATTTCTTTCTTCCACAACAAAACATTTTGGATACAAACAAGGAAGAAAA
AATGATCGAAGGAAGGAAATTTTTGAAAAACTACTTCAGTGATGAATACC
ATATTGCTCAATTGATTGAGATTCTAGGCAGAAACCTTTATATCTGGTCT
GCAAATCACATCCGAGCAGCTCTGACGAAAACAAAGATTATGAATGGAGA
TTATCATTCAGTGTTTTGGAAATTGAAATCGCAAAACTAATTAATGACAA
TCTAAGAAGGTCATACTTGATGTGTAAACATTTATTGGCAAAGACAAAAC
TATTGAGATTCCCAAGAAAGTCGTCAGTGTTCACAGAGCTTGAGAAACGA
GAAGAATCACAAGCAGCCCTGCCGACAAAAGATGTGAACGACCATGTTTT
AGCTTTACGCTTGAATCGATGGCCCAAATATGTCAATGAATGTATTAAAG
ATCAACTTTCAGATGAAATTTTTCAATCTATTAAAGTGCCACGTCAAATC
GTACGAGCTGAAGACAGTTTTCATGTGGTTATCAAGAGAATTGGACACTT
TCGAAGGACAAGAATACGATCAAGTGGAATTAACATTAAGCATATTTCAA
AGATTACTTGAACATTACGAAGAAAAAAATCTTTCAAATTTCTTTCTTCC
ACAACAAAACATTTTGGATACAAACAAGGAAGAAAAAATGATCGAAGGAA
GGAAATTTTTGAAAAACTACTTCAGTGATGAATACCATATTGCTCAATTG
ATTGAGATTCTAGGCAGAAACCTTTATATCTGGTCTGCAAATCACATCCG
AGCAGCTCTGACGAAAACAAAGATTATGAATGGAGATTATCATTCAGTGT
TTTGGAAATTGAAATCGCAAAACTAATTAATGACAATCTAAGAAGGTCAT
ACTTGATGTGTAAACATTTATTGGCAAAGACAAAACTATTGAGATTCCCA
AGAAAGTCGTCAGTGTTCACAGAGCTTGAGAAACGAGAAGAATCACAAGC
AGCCCTGCCGACAAAAGATGTGAACGACCATGTTTTAGCTTTACGCTTGA
ATCGATGGCCCAAATATGTCAATGAATGTATTAAAGATCAACTTTCAGAT
GAAATTTTTCAATCTATTAAAGTGCCACGTCAAATCGTACGAGCTGAAGA
CAGTTTTCATGTGGTTATCAAGAGAATTGGACACTTTCGAAGGACAAGAA
TACGATCAAGTGGAATTAACATTAAGCATATTTCAAAGATTACTTGAACA
TTACGAAGAAAAAAATCTTTCAAATTTCTTTCTTCCACAACAAAACATTT
TGGATACAAACAAGGAAGAAAAAATGATCGAAGGAAGGAAATTTTTGAAA
AACTACTTCAGTGATGAATACCATATTGCTCAATTGATTGAGATTCTAGG
CAGAAACCTTTATATCTGGTCTGCAAATCACATCCGAGCAGCTCTGACGA
AAACAAAGATTATGAATGGAGATTATCATTCAGTGTTTTGGAAATTGAAA
TCGCAAAACTAATTAATGACAATCTAAGAAGGTCATACTTGATGTGTAAA
CATTTATTGGCAAAGACAAAACTATTGAGATTCCCAAGAAAGTCGTCAGT
GTTCACAGAGCTTGAGAAACGAGAAGAATCACAAGCAGCCCTGCCGACAA
AAGATGTGAACGACCATGTTTTAGCTTTACGCTTGAATCGATGGCCCAAA
TATGTCAATGAATGTATTAAAGATCAACTTTCAGATGAAATTTTTCAATC
TATTAAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11284MSTRG.11284Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11284.7.p1.exon3MSTRG.11284.7.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11284.7.p1.exon2MSTRG.11284.7.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11284.7.p1.exon1MSTRG.11284.7.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11284.7.p1MSTRG.11284.7.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000081_pilongenomesc0000081_pilon:603585..626050 -