MSTRG.11279.1.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.11279.1.p1
Unique Name	MSTRG.11279.1.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000081_pilon:472214..531678+
coding sequence from alignment at sc0000081_pilon:472214..531678+

mRNA from alignment at sc0000081_pilon:472214..531678+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.11279.1.p1 ID=MSTRG.11279.1.p1|Name=MSTRG.11279.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=59465bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:472214..531678+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGATTTCAGTATGcccataaatttttttcaaattggtcaaaatcaaaatt
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TGTTAAGGAAAATCGAGCATGAGATAAGTAGGTTTCCACAAGGATAAGTC
ACACATATAAAATATTGGATTGTAAAACTTTTGTAATATTGATATTCCAT
AAGTAGTGAAAAAGAAATGAATATGTATATAGAGAAAGAAATGTGAGAAA
TAAACTACCTTATCGGTAGGAAATTGGTCGATAAAAAGTGATGATAAATC
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catgacatttatttt

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000081_pilon:472214..531678+

>MSTRG.11279.1.p1 ID=MSTRG.11279.1.p1|Name=MSTRG.11279.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=24378bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:472214..531678+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCAAGAAccaaCGTGCCAACATGTTTCGTCATGGTTGGTCTACCAGC
ACGCGGAAAGACTTTCATGTCTAAAAAGCTGACCAGATATTTGAATTGGA
TCGGCGTCAATACGAAAGTATTCAATGCTGGTGAATATAGAAGACGTATC
TATGGTACGGTCAACTGCAAACATGACTTCTTTAACCCAAACAACCCCAG
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tttatcaaaatattttggaaGTGAAACTATCTTCTCCGGATTACAAAGAT
TGTGGCGAGGAAGAAGCAGTTAAGGATTTCATCGCTCGCATTCGTCATTA
CGAAGAATTGTATGAAACTATAGACATCGATAAAGAAGGACAATTGGCCT
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GAACGCCAACACAACGTTCTAGTCGTATGCCATCAAGCTGTGATGCGATG
TCTATTGTCTTATTTTCTTGACACTCCTGCTTCTGAAATGCCATACATGG
AAGTTCCCTTGCATACAATTTATAAACTCACACCAATCGCATACGGTTGT
CGCGTAGAAATGTTCAAACAAGATATACCATGCGTCAATACACATCGACA
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CAGTACCTGAACACGAaatgggTGATTATGATGCATCGTGGAACCGAAAC
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GCTCGAACCCATACAACCACAATACCAAATGTAAATGCCAAGAAccaaCG
TGCCAACATGTTTCGTCATGGTTGGTCTACCAGCACGCGGAAAGACTTTC
ATGTCTAAAAAGCTGACCAGATATTTGAATTGGATCGGCGTCAATACGAA
AGTATTCAATGCTGGTGAATATAGAAGACGTATCTATGGTACGGTCAACT
GCAAACATGACTTCTTTAACCCAAACAACCCCAGCGGACAAGAAGCTCGA
ATGAAATGTGTCGATTTGGCATTGGAAGATGTTGCTAATTTCTTACACAA
AGAAGGTGGCCAAGTTTCGatCCTTGATGCCACTAATACTACGAAAGATA
GAAGGAAGTACGTGTATGAACAGTGCCAAAAACACGGAATCAAGACATTT
TTCATCGAATCAATCTGTGACGATCCAGAcattatttatcaaaatatttt
ggaaGTGAAACTATCTTCTCCGGATTACAAAGATTGTGGCGAGGAAGAAG
CAGTTAAGGATTTCATCGCTCGCATTCGTCATTACGAAGAATTGTATGAA
ACTATAGACATCGATAAAGAAGGACAATTGGCCTTCTTGAAACTGATCAA
TGTTGGACAGAAGTTTTTGGTCAATCTCATTTCAGGTTATTTGCAGACAA
GAGCTGTTTATTTCTTGATGAATATACACATTACACCTCGATCCATCTAT
TTGACAAGGCACGGTGAAAGCATGTTGAATCTAAAAGGACGAATTGGTGG
TGATTCTGGCCTGTCACCAAGAGGCGTTAAAtatCAACAAAAATTAAGTG
ACTTCATTAAAGAACAAAATATACCAGATCTCAAGGTTTGGACGAGTACG
TTGAAGCGCACCATACAGACGGCCTCCGACGTACCTGCTATTAGCAAAGA
GCAATGGCATGCTATCGATGAATTAGATGCGGGGATTTGTGATAACATGA
CTTATGAAGAGATACAAGAGAAATATCCTGAAGAATTTGCAAGACGTGAT
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GGTAACGCGATTAGAACCAGTCATTATGGAGCTTGAACGCCAACACAACG
TTCTAGTCGTATGCCATCAAGCTGTGATGCGATGTCTATTGTCTTATTTT
CTTGACACTCCTGCTTCTGAAATGCCATACATGGAAGTTCCCTTGCATAC
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CGTTTGGATCGATCTCCGGACGCCGCTTTGAGCACAGTACCTGAACACGA
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GATCGGCGTCAATACGAAAGTATTCAATGCTGGTGAATATAGAAGACGTA
TCTATGGTACGGTCAACTGCAAACATGACTTCTTTAACCCAAACAACCCC
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GGAAGTTCCCTTGCATACAATTTATAAACTCACACCAATCGCATACGGTT
GTCGCGTAGAAATGTTCAAACAAGATATACCATGCGTCAATACACATCGA
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CACAGTACCTGAACACGAaatgggTGATTATGATGCATCGTGGAACCGAA
ACTcgcctttaaaaactgaacgCGCCATGAATTCAAAGGATGGTTTACCA
ACGCTCGAACCCATACAACCACAATACCAAATGTAAATGCCAAGAAccaa
CGTGCCAACATGTTTCGTCATGGTTGGTCTACCAGCACGCGGAAAGACTT
TCATGTCTAAAAAGCTGACCAGATATTTGAATTGGATCGGCGTCAATACG
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CTGCAAACATGACTTCTTTAACCCAAACAACCCCAGCGGACAAGAAGCTC
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TAGAAGGAAGTACGTGTATGAACAGTGCCAAAAACACGGAATCAAGACAT
TTTTCATCGAATCAATCTGTGACGATCCAGAcattatttatcaaaatatt
ttggaaGTGAAACTATCTTCTCCGGATTACAAAGATTGTGGCGAGGAAGA
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AAACTATAGACATCGATAAAGAAGGACAATTGGCCTTCTTGAAACTGATC
AATGTTGGACAGAAGTTTTTGGTCAATCTCATTTCAGGTTATTTGCAGAC
AAGAGCTGTTTATTTCTTGATGAATATACACATTACACCTCGATCCATCT
ATTTGACAAGGCACGGTGAAAGCATGTTGAATCTAAAAGGACGAATTGGT
GGTGATTCTGGCCTGTCACCAAGAGGCGTTAAAtatCAACAAAAATTAAG
TGACTTCATTAAAGAACAAAATATACCAGATCTCAAGGTTTGGACGAGTA
CGTTGAAGCGCACCATACAGACGGCCTCCGACGTACCTGCTATTAGCAAA
GAGCAATGGCATGCTATCGATGAATTAGATGCGGGGATTTGTGATAACAT
GACTTATGAAGAGATACAAGAGAAATATCCTGAAGAATTTGCAAGACGTG
ATCAAGACAAATACCACTACAGATATCCAAGGGGAGAgtcTTACGAAGAC
CTGGTAACGCGATTAGAACCAGTCATTATGGAGCTTGAACGCCAACACAA
CGTTCTAGTCGTATGCCATCAAGCTGTGATGCGATGTCTATTGTCTTATT
TTCTTGACACTCCTGCTTCTGAAATGCCATACATGGAAGTTCCCTTGCAT
ACAATTTATAAACTCACACCAATCGCATACGGTTGTCGCGTAGAAATGTT
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TTCGTTTGGATCGATCTCCGGACGCCGCTTTGAGCACAGTACCTGAACAC
GAaatgggTGATTATGATGCATCGTGGAACCGAAACTcgcctttaaaaac
tgaacgCGCCATGAATTCAAAGGATGGTTTACCAACGCTCGAACCCATAC
AACCACAATACCAAATGTAAATGCCAAGAAccaaCGTGCCAACATGTTTC
GTCATGGTTGGTCTACCAGCACGCGGAAAGACTTTCATGTCTAAAAAGCT
GACCAGATATTTGAATTGGATCGGCGTCAATACGAAAGTATTCAATGCTG
GTGAATATAGAAGACGTATCTATGGTACGGTCAACTGCAAACATGACTTC
TTTAACCCAAACAACCCCAGCGGACAAGAAGCTCGAATGAAATGTGTCGA
TTTGGCATTGGAAGATGTTGCTAATTTCTTACACAAAGAAGGTGGCCAAG
TTTCGatCCTTGATGCCACTAATACTACGAAAGATAGAAGGAAGTACGTG
TATGAACAGTGCCAAAAACACGGAATCAAGACATTTTTCATCGAATCAAT
CTGTGACGATCCAGAcattatttatcaaaatattttggaaGTGAAACTAT
CTTCTCCGGATTACAAAGATTGTGGCGAGGAAGAAGCAGTTAAGGATTTC
ATCGCTCGCATTCGTCATTACGAAGAATTGTATGAAACTATAGACATCGA
TAAAGAAGGACAATTGGCCTTCTTGAAACTGATCAATGTTGGACAGAAGT
TTTTGGTCAATCTCATTTCAGGTTATTTGCAGACAAGAGCTGTTTATTTC
TTGATGAATATACACATTACACCTCGATCCATCTATTTGACAAGGCACGG
TGAAAGCATGTTGAATCTAAAAGGACGAATTGGTGGTGATTCTGGCCTGT
CACCAAGAGGCGTTAAAtatCAACAAAAATTAAGTGACTTCATTAAAGAA
CAAAATATACCAGATCTCAAGGTTTGGACGAGTACGTTGAAGCGCACCAT
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TCGATGAATTAGATGCGGGGATTTGTGATAACATGACTTATGAAGAGATA
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CTACAGATATCCAAGGGGAGAgtcTTACGAAGACCTGGTAACGCGATTAG
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CATCAAGCTGTGATGCGATGTCTATTGTCTTATTTTCTTGACACTCCTGC
TTCTGAAATGCCATACATGGAAGTTCCCTTGCATACAATTTATAAACTCA
CACCAATCGCATACGGTTGTCGCGTAGAAATGTTCAAACAAGATATACCA
TGCGTCAATACACATCGACAAAAACCTACGGACGTTCGTTTGGATCGATC
TCCGGACGCCGCTTTGAGCACAGTACCTGAACACGAaatgggTGATTATG
ATGCATCGTGGAACCGAAACTcgcctttaaaaactgaacgCGCCATGAAT
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CAGCACGCGGAAAGACTTTCATGTCTAAAAAGCTGACCAGATATTTGAAT
TGGATCGGCGTCAATACGAAAGTATTCAATGCTGGTGAATATAGAAGACG
TATCTATGGTACGGTCAACTGCAAACATGACTTCTTTAACCCAAACAACC
CCAGCGGACAAGAAGCTCGAATGAAATGTGTCGATTTGGCATTGGAAGAT
GTTGCTAATTTCTTACACAAAGAAGGTGGCCAAGTTTCGatCCTTGATGC
CACTAATACTACGAAAGATAGAAGGAAGTACGTGTATGAACAGTGCCAAA
AACACGGAATCAAGACATTTTTCATCGAATCAATCTGTGACGATCCAGAc
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ATTACGAAGAATTGTATGAAACTATAGACATCGATAAAGAAGGACAATTG
GCCTTCTTGAAACTGATCAATGTTGGACAGAAGTTTTTGGTCAATCTCAT
TTCAGGTTATTTGCAGACAAGAGCTGTTTATTTCTTGATGAATATACACA
TTACACCTCGATCCATCTATTTGACAAGGCACGGTGAAAGCATGTTGAAT
CTAAAAGGACGAATTGGTGGTGATTCTGGCCTGTCACCAAGAGGCGTTAA
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GTACCTGCTATTAGCAAAGAGCAATGGCATGCTATCGATGAATTAGATGC
GGGGATTTGTGATAACATGACTTATGAAGAGATACAAGAGAAATATCCTG
AAGAATTTGCAAGACGTGATCAAGACAAATACCACTACAGATATCCAAGG
GGAGAgtcTTACGAAGACCTGGTAACGCGATTAGAACCAGTCATTATGGA
GCTTGAACGCCAACACAACGTTCTAGTCGTATGCCATCAAGCTGTGATGC
GATGTCTATTGTCTTATTTTCTTGACACTCCTGCTTCTGAAATGCCATAC
ATGGAAGTTCCCTTGCATACAATTTATAAACTCACACCAATCGCATACGG
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CTTATTTTCTTGACACTCCTGCTTCTGAAATGCCATACATGGAAGTTCCC
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GAAATGTTCAAACAAGATATACCATGCGTCAATACACATCGACAAAAACC
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ttaaaaactgaacgCGCCATGAATTCAAAGGATGGTTTACCAACGCTCGA
ACCCATACAACCACAATACCAAATGTAA

Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.11279	MSTRG.11279	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.11279.1.p1	MSTRG.11279.1.p1-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000081_pilon	genome	sc0000081_pilon:472214..531678 +

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MSTRG.11279.1.p1 (mRNA) -