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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000081_pilon:399166..407046+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11270.1.p1 ID=MSTRG.11270.1.p1|Name=MSTRG.11270.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7881bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:399166..407046+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAATCGTATATGGATTTGAGTTTTGTGAGAGCCACTCTTTGATAGTCTTA
CATGAGAATCTATTAATTCACGTTTGAGACGAATTTTTCAAGATCAGATT
AAACAAGAAggatttgtatttttgaaggaagaGAGTAAATTTTTCATGTC
AGAAAGATATTTTCCAGATGTATCTTGCACCAAGCCACACAGGTAATCAT
TCTGATTTGTTTCTCCTGTTCAAATATTCGGGTACGAACATGTTTCCTGG
TTATGGTACAAGGTCCTACAGGACGATGTATATCTACCGCCTGACTTTTG
AAAATCCGAAATTTTGGAGGGTCTGAAATTTAGGAAATAAGCAAATATCT
AGAAGATCTTCCTGTTATAGATATAGTCAATATCTTACGTAATAAGTTGA
CAAGAGGCGCGCTCCACCCACGACCACCCTTGTATGAAGACAATGCACTT
TGGCGAAATTGAAACCAAACCCGGAATTTAACGTTTCTTAGTTAAATAAC
AGATAGCACAGTAACTTAAGACTTTTAGACAGCCTTTCGATTATTTTCAT
TGGGTCAGCGGCAAGCCAGATTGGTTATCTTCTATGAAATGAAAGGAAAA
TTTGAGGGAGTAGGGCTTTGAGCTGAGAgtaatgaagtataagcccgaag
ggctaaaatCGAATCTTTAACGTTtcagacaagaaaaagtgaagccttaa
aatatgcgccgtattttttatgacggactgaatctagcgattcctttgtt
tttgagtgatatatttttatatatatataataggACTCAATAttgacaaa
ttcaaaatttacataCACGTCTGCCGGGTTTGAAGGGTTAAATAAAccct
tgaaaaatattttaatgctTAAAACAATTTCTAATGACCTCCAAAATTGA
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GTATCATTAAAAGTGAATAATTTCTTTACtgacaaatatttttgacaGTA
TAATATTTTTGCCGGCGATAACTTTCACCATCGATGCTTTCACtgacttt
tatttcttttcaacaCCAGATGGTTTTAATTTATTTAGGCAAATTTGATT
GGATTCAATGATCGCTatgcgacggagacggttagcttctggTTGATTCg
tccagagatttgggaaaagaggataagaatcgccgctgccgctcgctgtt
ttctcaTTGTTGACCATTGAATTCGGCGTCGTCTGAAGTCGCTAGGCTAG
GGAACAACTTGGCCAAGAAGGTACTGCGaaaaaaaTGGCGCTATGTGCAG
TATTATAACAGTTCAAGAAAAACTGTCTGAATTTACTCCTTTGGAGGGGT
TTCCTACTTGATATAAACAACTGAAAAGCAAATAACGATCTTTTGGGGTT
TCCActgacaaaaaaatctgctgttgcatgctttattttttgagaaaaag
atggcGGAAGCAGGCATGCTAAAATTGGATGTGAAATgggacctttttat
ttttagctagtTTGCCCTACTGGAAAGTCTTTCAGAGTCAAAATAAAGTG
GTTTGGGTTGGCAAAAGGTTGTAGGTGACTAGCCTAGCTTTGGTTTTTAT
TGGCACCTTCTAGATCTTTTTGGCACATCCTTCAAagatagctgaaaaat
tatattaaaaagtgtattttttgtttgttaagttgaataaaattaatttt
tttgtgttgcaaacataatttttatgggtagcaGTAAGGTTGATTAAATG
ACAACCTATAGCTTAGTTTTACATGgtaaatcttcaaactttcttagcat
tttgattgaagatgggcagatgggcaaaatcgacaaaatgttgtattttt
ttcctagtttttatatagatgaaaaaataatgttatcCTAGCAAAACTTG
CTTGATGGCAATGGATTTTAGATTTGGTAAGTACGCTAAATTATCCTTGA
TGACTTTTTAGCTCCTActgaggaaaaacatttttttggggttgaaattt
caagtttttgtatgTAACAGAAAATTGCAACCAAAGTTCTAATATTAATA
CTTatgtaattttatgaaactatgaCTCTGACCGgtttggctctgaccgg
ttagtagatttgctctgaccggttagtagattggctctgaccggttagta
gattggctctgaccggtttagattggctctgaccggttaatagattagct
ctgaccggttaatagattggctctgaccggttaatacaTTGGCTCTGACA
GGTTAATatattggctctgaccggttaatagattggctctgaccggttaa
tagattggctctgacaggttaatagattggctctgaccggttaatagatt
ttCCAGTTATATAAGATTTATTTCACCGGTTTTTGTCTGTGGTCGGTGGA
ATTAAGATTTGTTGTTTGTGTTCTGTATTTGTTCATGAGAGCTTGCTGCA
AAAATCCTAATTcccattttcattattatatCCTTTCAGGTTAGTTACCA
TCATACTGCCCCAGTAACCTAGATCCATGAATTATTTTGtaccttcacgt
ggttggtatacaatgaaaattggcttaaaatttgtctgaatttctcaCGT
ACAAGGTTCAATATCTTTGCAAACACCAACAAATTCTGCTAATAAGATGG
ACAGGTGAAAAGCATGTTTAAACTCAAAGGAAACAACAATGGAATCTGAT
GTCATGGTTTGTTTGCAGTTGGATTAAGGTCTTTTTATCCCTGTTTCACC
AGGATTTCCTGTTTGATTACGCAAATAGTCCCAAAATTTGAAACAAGACA
CCAGAATGGGGCTAGACTACAATTACAAGATAATTGATATGAACCAACCA
TAtagatataaaaaatatttaaatagaAATTCCAGTTTGGAATTGGAAGT
GGACACAGGACTATTTTCATACATCacattatataattattcatcttatg
aaatactcttttcttgagcatTGATGAACAGTCTGGTTATATTCAtactt
tttttctctaaaattttatttgaaagggtAAATTGCTTTTATCTTAGAAT
CACACCTCTATTGGAATTAGTGAGcccccccTAAATCCAAGAGTGACCGA
TTTTTCATATACTGTTTCACAATATATGTTTATTTTCCAAGGTGCTTTTA
GTGAGGAAGGAtcaagtcaaagtttttttattgtaattaattttcttgca
attatttaagtaactttttggaaacaataagacaaataaaattgacataa
caagaatcaaaaaattaatccaGAAATTTAAccagtttattattattttt
tgttattacaacaaacgcgaccaaataaagatttttatataatttttgtt
tttaatgtatgctactgttttgtattatattgctattatttttcgctttg
ttgtgtaaacttcaaaaagttcttacaaaaaaattcatgatatttttgat
ttcttgtcattgatatcatgaattgctATTGTTTTAgtcctgtttttttc
tttcccttctccttcattgttttaatattcAACCTAGCTAGCTCTTTTTA
TATGATTGTCAAAACACTTTAGCCCGAGAAGTAATGAAAAACTAtattag
ttttaccagcttcgttttgtgtttgaatgcaatgaattttaaattctttt
tcactagtaattatttctatttctacaatATAATCTGTGACATTGGTTCG
AGCATTCCTTGAATAAAGTATTTTGGCTAAAACTGAAAGTTTTTGGCTCG
ACTAACACTGTATCCGCCTTGTCCAAAatgaaaagtgcttataaaaaata
ccaaaatccccgatattagaaatatttttatttcactttcgatatcaacc
acggctgccattttttgtttgtacttctagtcttgtgcgcatagAATAAT
CAAGCGCTCCGATTGGCTCAGAactaaaacaatcgatcggtcgcagatat
ttcaatagaacaaaaggctcCCTAGCCTATATTTCTATAGCTGAATAGCg
caattcttatcctcttttcccaaatctctgattCGTCTAACAGATcttga
ctgactgaggacgatgATAAACAAGCACTTTTACCGCCCTCAATTTGACG
GCTCAGACTATGGGTTAATCCAAATCGCTTCCGCAAATCCGCTCGCTATT
ATCTTGCCAAGCACCGAAAACATCGCCGATGAAATGTGAAATAAATTCTA
TAagtaaagaaaaagatttaacTGCTGAATTTTATGACGTGAAATGTTAG
AAGTTTTTTCCAGAGCGaggataaattttttatttaaatccgAATCGGGA
AAATTCTATTTATTCAAGCTTAAAAATCCATTAGGATAGTTTTGGAGtac
gaaatcaaagtcaattttaggatattttctccaccggggacaaaattttg
gccgATTTGGGTCTATGATGGAAAGAATAAACCCTCTCCCATTgactaat
tattttttaatctgaTTTTTCTATGAAAGAATGTCTGAAAAGATGTCAAA
TAAGCATCTTACATACTTTAAGGCACAtacgaaatatttttctctattat
ttttcatatcCAATACTTTAACATTACCATACTAGTGAAATTTAAAATAT
GTGCTGTGTCATAGAGTCATTCAAACAAgactgttttctttttgttacaA
GAGTACAGAGGCCATCAAAAGGGTCATGAGTTGTAGTCAAGaactaaaaa
aataacaaacaaagcAGAAAATATAAGATTTATGATCAGTGGGTTGTGTT
AGAAAAACCACCAATCTGAAGTATTCTTGATCAAagattgttatgtttta
aatattttaagcaCATATCAACACACCTGAAATTGGTATTTCAAGTTTGG
TTTAAAGTGGTGGTTGAAGGGTTGTTAAAAGTTAAGCTCTCATAATTGTT
agtatttgatgtttttttttgtttttttatgcaGTCTAATATGTGGGGGC
GTACAGTTTTTCAGAAtcgcggaaatcgacccttttttcttcggaatttc
ggaaatcaggcaaaattccttcggtatttcggaatgtTGAAATTGTTTCG
CTATTGggaatccatgaatttttgcttcgaaatttcggtattaaaaaagt
ttttatccccctttttcggaattcatacatatgagaaatcaaaattgatg
aaaaattactcaaaacgaggaaaatcaccccaaaaatTGGTAttggaatt
gcaagtattttttttacgaaatttcggaaattttggtaaaattattcggt
attttgGAAATCACAAACCCcgtaCgcccccccccccccccctaatatgG
TAAACGCAAGTGAAACTTGGCGATTTGATAGAAAAAGTTTTATAATTGGG
CGGGTAGCTAAGCAAAATATAAcacctttctttctttttttgcgcctact
ctttaaaatgtttttgcattttgaaCCTTAAAGactatttattgttttta
aagttACTTTTGGATTAGGATACCTTCAAATACCAACTTGAAACCCCTTA
TTTATCAGCTCCTCTTCTCAACAGGGCtttttttGAATGGGAGCTATCCT
CATCAATCACGCCACTGCGTGTTAACTTATACCTGGCTCGCCCGAATCAA
ATGGGATTGACTATGCTGTTCAGGGCTGGATGGTTTTCAAGTTTAGGGCA
TCTGAATCATATGCAATAGAAAATAAGACTTACTACAAACTTTAGACctc
agatttttaaaattcttttcctTTACCCATGTATGCTGATTCCCAGATGA
AATACCGTCAGACTTTTTTATTTATGCATCGGTTTTAACACAcaagtttt
tttgacattttaatatGTCAATCTTTCCGGTCTGGCTTTTTGACACAATG
AACAAAGGTAGCCACTTGATAGTCCGAAACAGAAAGCTTAAAGTTTTAAG
TGCATATTTAACATAAGAAACAGAAACTTACGTGAAATCATCTAGCAAAG
TAATATTTTAAATGTCTTTTAGCTAAATGGAAGCGTTTTGGGTGAGTGAG
ATGTTATTTGCagggaaacatttttaattttagaaatgACTTACTATAGG
Gactattagtgaggttaagtaaatcggcaaaatcacgacgacgaacgaaa
atttaacaggctagtgagtttcaaccaatcacaTTCCTTATTttCactag
cctattacatttttcgtccgtcgtcgtgattatcctggtatgcttaacct
cagtattatCAGTGTTTCAAACAATCTGTGGCAAGCTGAAGATGGCtaag
aaaaaatcatttaagaCGGTTTTTTCATTACGGGATGAATTTCAAATTCA
ATGTCCTAGGGACATTAAGTAACATTCTATGCTCAACTCTCTTAGTCACA
CAGATGTATGGGTTTAGAAACTAAAGTAATTTTTGTAACGTCTTTATTTC
TTTACTTTCAGAAATGACTTTCAATAGAGAGCTTCAAATAAGCCTACTTT
CAATATCATGTGTCGCCATCGCTGTAGTTAACCTCGTTTGCATCATTGTC
ATCGTCAACTCAACAAAACTTCGTCGCAAACCTCCCACAATCTTAATCGG
GAATTTGATCGGAACACATATGATTCAAGGAATATGCGTACTACCTTTAT
ACATCTTACGCATCAAGAATCCTGCACTTGTTGCGATTTGTGATGGATTT
TATTTTACCTATATGTTAACATTCTATAGTGCTACTATCAGTGTTTTTCT
ACTCAGCTTGGATCGAGTTTTAGCTGTTATTTTGTTAAACTCCTATGATA
AATATGTGACAATGAATAATGTTATCAAAGTCACTGTCATTGCTTGGAGC
TATATATTTGCCTTATGTTTAATGCCATTCTTCAAACTTGAAAGATCTAA
AGCTTTGAAACATTCGATATGTACATACCTTCAACCTAGAGCATGGACTA
TATTCATGTTAACCGTAAACGCATTAATTCCTTACGTATTTATAGTTATC
GGTTACGTTTATGTACGcgttaaattgaaaaaattatcggCGTATTTCGC
AGCTGCGGAAGTAACGAAAGACGGGGACCAACGTGAACGTAAGAAACGTG
AAAGACGTACGAAGAAGTTTAAGAAACGTAGTAAAATCACTAAATTGACA
TTCCTTATAGTTTTCACGTATGGTGTAACATGGGCTCCATCTATCATTTA
CTATCTGGTACAACACATATGCACCAGTTGTATTCCCGATAAATATTACC
AGAGTGAATTAAAAGACATTCTATCGTTCTTGATGAAGTATATCAATTTC
TTTGATGCAATGATCGCACCAGTGTTATATTGTTATTTTCATGATGAATT
TCGACATGAATTTAAGAGGATTATATTACGGAAGGAGAAGACGATATCAA
CAAGTAGCTTTATATCAGACTCCAATGCTGTAAGCACAATGTCGACCAAT
ACATTCGCTTTGAAGGAAACGACGAGTATAAGATCTAATTGAGTTTGCga
ataatttttattaaaatatttttttgtgttctATTAATATTTTATTTGCT
GAAGGGGAAAGCAATAAACTTGGAACTTCGGTTTTTCACTTATTATCTCA
ATTGGTGATAAATCACCCTCCGGGTCAGTGTTGCACTGCAATCTCTTACt
aaacaaatttttgataaatcatGTCACGAACCAAGTTGATATGCTAAAAG
AGAAGAGTCTTTCGTGGATAAAGCACCATTTGGTTTTGTCTTTTTGCCAA
TATCCTAGGTGGTATCAGTCAATTAATTTCCTAAGTGGTATCAGTTTCAA
GGCCGTAAAACACCAGAAAGATCGCAGAATCGCCAGAAatgttttcccgg
gaatgagaaagttttgCCATTCTACTTAGTTGTAAACAGGTAAATGCAAA
GTGAatgtggaaaaaagaaaaaagccaGGGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000081_pilon:399166..407046+ >MSTRG.11270.1.p1 ID=MSTRG.11270.1.p1|Name=MSTRG.11270.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2112bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:399166..407046+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTATCTTGCACCAAGCCACACAGAAATGACTTTCAATAGAGAGCTTCA
AATAAGCCTACTTTCAATATCATGTGTCGCCATCGCTGTAGTTAACCTCG
TTTGCATCATTGTCATCGTCAACTCAACAAAACTTCGTCGCAAACCTCCC
ACAATCTTAATCGGGAATTTGATCGGAACACATATGATTCAAGGAATATG
CGTACTACCTTTATACATCTTACGCATCAAGAATCCTGCACTTGTTGCGA
TTTGTGATGGATTTTATTTTACCTATATGTTAACATTCTATAGTGCTACT
ATCAGTGTTTTTCTACTCAGCTTGGATCGAGTTTTAGCTGTTATTTTGTT
AAACTCCTATGATAAATATGTGACAATGAATAATGTTATCAAAGTCACTG
TCATTGCTTGGAGCTATATATTTGCCTTATGTTTAATGCCATTCTTCAAA
CTTGAAAGATCTAAAGCTTTGAAACATTCGATATGTACATACCTTCAACC
TAGAGCATGGACTATATTCATGTTAACCGTAAACGCATTAATTCCTTACG
TATTTATAGTTATCGGTTACGTTTATGTACGcgttaaattgaaaaaatta
tcggCGTATTTCGCAGCTGCGGAAGTAACGAAAGACGGGGACCAACGTGA
ACGTAAGAAACGTGAAAGACGTACGAAGAAGTTTAAGAAACGTAGTAAAA
TCACTAAATTGACATTCCTTATAGTTTTCACGTATGGTGTAACATGGGCT
CCATCTATCATTTACTATCTGGTACAACACATATGCACCAGTTGTATTCC
CGATAAATATTACCAGAGTGAATTAAAAGACATTCTATCGTTCTTGATGA
AGTATATCAATTTCTTTGATGCAATGATCGCACCAGTGTTATATTGTTAT
TTTCATGATGAATTTCGACATGAATTTAAGAGGATTATATTACGGAAGGA
GAAGACGATATCAACAAGTAGCTTTATATCAGACTCCAATGCTGTAAGCA
CAATGTCGACCAATACATTCGCTTTGAAGGAAACGACGAGTATAAGATCT
AATTGAATGTATCTTGCACCAAGCCACACAGAAATGACTTTCAATAGAGA
GCTTCAAATAAGCCTACTTTCAATATCATGTGTCGCCATCGCTGTAGTTA
ACCTCGTTTGCATCATTGTCATCGTCAACTCAACAAAACTTCGTCGCAAA
CCTCCCACAATCTTAATCGGGAATTTGATCGGAACACATATGATTCAAGG
AATATGCGTACTACCTTTATACATCTTACGCATCAAGAATCCTGCACTTG
TTGCGATTTGTGATGGATTTTATTTTACCTATATGTTAACATTCTATAGT
GCTACTATCAGTGTTTTTCTACTCAGCTTGGATCGAGTTTTAGCTGTTAT
TTTGTTAAACTCCTATGATAAATATGTGACAATGAATAATGTTATCAAAG
TCACTGTCATTGCTTGGAGCTATATATTTGCCTTATGTTTAATGCCATTC
TTCAAACTTGAAAGATCTAAAGCTTTGAAACATTCGATATGTACATACCT
TCAACCTAGAGCATGGACTATATTCATGTTAACCGTAAACGCATTAATTC
CTTACGTATTTATAGTTATCGGTTACGTTTATGTACGcgttaaattgaaa
aaattatcggCGTATTTCGCAGCTGCGGAAGTAACGAAAGACGGGGACCA
ACGTGAACGTAAGAAACGTGAAAGACGTACGAAGAAGTTTAAGAAACGTA
GTAAAATCACTAAATTGACATTCCTTATAGTTTTCACGTATGGTGTAACA
TGGGCTCCATCTATCATTTACTATCTGGTACAACACATATGCACCAGTTG
TATTCCCGATAAATATTACCAGAGTGAATTAAAAGACATTCTATCGTTCT
TGATGAAGTATATCAATTTCTTTGATGCAATGATCGCACCAGTGTTATAT
TGTTATTTTCATGATGAATTTCGACATGAATTTAAGAGGATTATATTACG
GAAGGAGAAGACGATATCAACAAGTAGCTTTATATCAGACTCCAATGCTG
TAAGCACAATGTCGACCAATACATTCGCTTTGAAGGAAACGACGAGTATA
AGATCTAATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000081_pilon | genome | sc0000081_pilon:399166..407046 + |
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