MSTRG.11265.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11265.1.p1
Unique NameMSTRG.11265.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000081_pilon:361953..380237-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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>MSTRG.11265.1.p1 ID=MSTRG.11265.1.p1|Name=MSTRG.11265.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18285bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:361953..380237- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CATTAGAATAGTCACCTATGACGCTGAAGCTTGTCTCGCGCCCGCTACGT TTGCTTAGCATAGTTAGATTTTTTTTCTCGATTATTATTTTTATCATCAT TATTATCGACTAATTTCCCCCATTTGTGATTACGAAATGAATGTCCTACA ATCTATCAAATACCTTGAGGGTCCCCTCAAGGAATAAGACTTCAACAACA ATAAATCTGATCAGCTCCCGCCTTAAATTTTTTCT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000081_pilon:361953..380237-

>MSTRG.11265.1.p1 ID=MSTRG.11265.1.p1|Name=MSTRG.11265.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4248bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:361953..380237- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTACCTGAATTAATGAAATCTGCATTGGGCATTCTGTTGTCTCCAACATC
GGAACCTTCAGACATTAAGAATTTTCTTCCTGTGAGACTTATGGCAATCA
AGCAAGTTTCAGATGATGCCAAGGTTAAATGTGAAGAGGTCGTGAAAGAA
TTTACGCATGTCATTGAAGTCACTGACGAAGTTTTTATGGGGTTGGTTGT
CCAACAGAATGATGTAAAATCTGCTCTAGAGCAACTAGAACTCAATATTG
CTAATACTAAGAGAGAAATCAAAAGATCGGATCAGGTTACAAAAGCAAAC
GAAAAGGCATTAAAAGAAATGGAAGAGCAAGTCAAGAGTGCAAAGGAAGA
TTGGAAAGATGCAATGGCTTCTATGCCAAGTGCTCAAGATTTGATGATGG
CATCTGTGACTGAAAGCTTGACAAGCATCGTTAACACTGGAGCAAATGCT
GCCATTCAAATGGGAACCCAATATGTAAACATGATGACAATGAGCGCCAT
GGGCGGAATGGATGATATGCCTCCTCAACAAATGGGTGGTATGCAAAATC
CTCAGCAAGCACCAAATCAAAATGTGCAGTATCCAGCACAAGGCACACAT
GTAGAAAATCCTAAGGTTGATTTCTTGCGAGATAAATACATGGTAAAGAA
CAGCCAAATCAACCTCTTCGCTAATCTATTGCTGAATTATTTTGACGACA
GTGATGGTGATATCAAACTAAGAGAAAAAGTGGTTGAAAAAGGAGACAAA
GATATACAAGTTGGTAAAATCCTTGAAGCTGAAACCTTTTTTAATATGAT
GCAAAAGAATATTAAAGGTATGGACGCTGGAGATCACAAAACAACCAAAA
ACCAACTACTGAGATTGATTGACAATGCCCTCAAAACAATTGAAGGAATC
CAGAAGCTTCCTGAAAGCGTTGCAACGATTCAAAAACTCTTCGATCAAGC
AGAAAAAATCATTTCACAATCAGACACGATCGAATCAAGTTTAAAAGTCA
AAGCAGGAATCTCTCAATTTTATAATCCAAATCCAACTCTACCACGATCA
CAGGCACCATCAGGCAGCTATGGCGATCTCTCTCAAACCATGAATGATAA
TGCTCACAAAAAGGTTGAAGCCTATCGCTCACAATTGGATTCTCTTCGAA
TTCGCGCTGAAGAAGAAAAACAGCGGTTTAATGCATCACAGCAAGTTTTA
TCTGGAGAGATGAGGAAGTTAGAAAATTTCAAAAGTAGAGATGCAACGAG
TTTTCATATGATCAAAGTCTTAATGCAAGAAAAGATTGCACTTACTCTAG
TCAAAGAAAGCTGGGCTGACCTTGTTCAATTTTTTACCTCAATGTCCAAC
TTAATCAATTCAACACTGAATATGTTTGTTGCTGACTCAGAGAGAGTCGC
TAAATCCAAATCAGTCAAGAACATGGCAACAGAGGTCGTATTTCAAACAG
CTTATCAAGTAGTCAAAGTCAACCATGTTGTCAACAATCTTGCTGGCTCG
TATAAAGAAATTTCACAGAAATATCTCATGCCGTTGTGTTCAAAGTTGGA
TGAAATCCTATTCTTAAAGCATGGAAAGCTCGAAAAATGGAGATTGGAAT
TATGTGAAGAATGCAGAAAAGCTCATGAAGACATCGAGAGAATAGTAGAC
AAGCACCACGAGGAGTTTCTTGCAAACTGCCACAAGAAAACATCAGCAAT
CGATACAGAGATGAGGGCAATCGCACCTATTACAGAAGAGAAGAGGAAAC
AGATCCAAGCAGATGCAGAAAAAATGGTAGAAGGAAAAGAACTTGATTTT
GGATTTTAAATGGCACAGGTTGACAAAGCCGTGACTGGTATTGTCTCGCA
GCAAGATGAATTTTTAACCATGATGCAACCCTTTGATCAAATGTCAGCAA
AACTATCAGGTGCTCCAATGGCTATCAATATTCTTGGTCAACTGTGTTAT
ATCGCGACAGGAGTTGAAGTGGATTTGAGAGTTGAAGGAGTTAATGAGAA
ATACAAGCATTTAACTAATACAAATTCATTGCGTGCTTGTCTTATGCAAG
TCTCGCAAGCTGGGCAAAGAGCCTTTCGAACAGCCGATGGAAATATGGAA
TACATATCAATGAGCTGCGAAAGGGTACCTGAATTAATGAAATCTGCATT
GGGCATTCTGTTGTCTCCAACATCGGAACCTTCAGACATTAAGAATTTTC
TTCCTGTGAGACTTATGGCAATCAAGCAAGTTTCAGATGATGCCAAGGTT
AAATGTGAAGAGGTCGTGAAAGAATTTACGCATGTCATTGAAGTCACTGA
CGAAGTTTTTATGGGGTTGGTTGTCCAACAGAATGATGTAAAATCTGCTC
TAGAGCAACTAGAACTCAATATTGCTAATACTAAGAGAGAAATCAAAAGA
TCGGATCAGGTTACAAAAGCAAACGAAAAGGCATTAAAAGAAATGGAAGA
GCAAGTCAAGAGTGCAAAGGAAGATTGGAAAGATGCAATGGCTTCTATGC
CAAGTGCTCAAGATTTGATGATGGCATCTGTGACTGAAAGCTTGACAAGC
ATCGTTAACACTGGAGCAAATGCTGCCATTCAAATGGGAACCCAATATGT
AAACATGATGACAATGAGCGCCATGGGCGGAATGGATGATATGCCTCCTC
AACAAATGGGTGGTATGCAAAATCCTCAGCAAGCACCAAATCAAAATGTG
CAGTATCCAGCACAAGGCACACATGTAGAAAATCCTAAGGTTGATTTCTT
GCGAGATAAATACATGGTAAAGAACAGCCAAATCAACCTCTTCGCTAATC
TATTGCTGAATTATTTTGACGACAGTGATGGTGATATCAAACTAAGAGAA
AAAGTGGTTGAAAAAGGAGACAAAGATATACAAGTTGGTAAAATCCTTGA
AGCTGAAACCTTTTTTAATATGATGCAAAAGAATATTAAAGGTATGGACG
CTGGAGATCACAAAACAACCAAAAACCAACTACTGAGATTGATTGACAAT
GCCCTCAAAACAATTGAAGGAATCCAGAAGCTTCCTGAAAGCGTTGCAAC
GATTCAAAAACTCTTCGATCAAGCAGAAAAAATCATTTCACAATCAGACA
CGATCGAATCAAGTTTAAAAGTCAAAGCAGGAATCTCTCAATTTTATAAT
CCAAATCCAACTCTACCACGATCACAGGCACCATCAGGCAGCTATGGCGA
TCTCTCTCAAACCATGAATGATAATGCTCACAAAAAGGTTGAAGCCTATC
GCTCACAATTGGATTCTCTTCGAATTCGCGCTGAAGAAGAAAAACAGCGG
TTTAATGCATCACAGCAAGTTTTATCTGGAGAGATGAGGAAGTTAGAAAA
TTTCAAAAGTAGAGATGCAACGAGTTTTCATATGATCAAAGTCTTAATGC
AAGAAAAGATTGCACTTACTCTAGTCAAAGAAAGCTGGGCTGACCTTGTT
CAATTTTTTACCTCAATGTCCAACTTAATCAATTCAACACTGAATATGTT
TGTTGCTGACTCAGAGAGAGTCGCTAAATCCAAATCAGTCAAGAACATGG
CAACAGAGGTCGTATTTCAAACAGCTTATCAAGTAGTCAAAGTCAACCAT
GTTGTCAACAATCTTGCTGGCTCGTATAAAGAAATTTCACAGAAATATCT
CATGCCGTTGTGTTCAAAGTTGGATGAAATCCTATTCTTAAAGCATGGAA
AGCTCGAAAAATGGAGATTGGAATTATGTGAAGAATGCAGAAAAGCTCAT
GAAGACATCGAGAGAATAGTAGACAAGCACCACGAGGAGTTTCTTGCAAA
CTGCCACAAGAAAACATCAGCAATCGATACAGAGATGAGGGCAATCGCAC
CTATTACAGAAGAGAAGAGGAAACAGATCCAAGCAGATGCAGAAAAAATG
GTAGAAGGAAAAGAACTTGATTTTGGATTTTAAATGGCACAGGTTGACAA
AGCCGTGACTGGTATTGTCTCGCAGCAAGATGAATTTTTAACCATGATGC
AACCCTTTGATCAAATGTCAGCAAAACTATCAGGTGCTCCAATGGCTATC
AATATTCTTGGTCAACTGTGTTATATCGCGACAGGAGTTGAAGTGGATTT
GAGAGTTGAAGGAGTTAATGAGAAATACAAGCATTTAACTAATACAAATT
CATTGCGTGCTTGTCTTATGCAAGTCTCGCAAGCTGGGCAAAGAGCCTTT
CGAACAGCCGATGGAAATATGGAATACATATCAATGAGCTGCGAAAGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11265MSTRG.11265Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11265.1.p1MSTRG.11265.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11265.1.p1.exon3MSTRG.11265.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11265.1.p1.exon2MSTRG.11265.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11265.1.p1.exon1MSTRG.11265.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000081_pilongenomesc0000081_pilon:361953..380237 -