MSTRG.11236.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11236.1.p1
Unique NameMSTRG.11236.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000080_pilon:1372580..1386397+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11236.1.p1 ID=MSTRG.11236.1.p1|Name=MSTRG.11236.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13818bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:1372580..1386397+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gataatttcaagAGCATTCTCAAGTGGATACAATCGTTGGTTGAATATAA AAGATTGCATTgcatattttttaacaaaattcttGGATTAACTGTCTCCA CAAAAGACTTTCATATTTATATCAAGATGAGGAACCTTAACAATTTAGCT TTGTAAGTATTTCTAATTTCATGCTCATTTATTTTAGTTTTCGCTAAGGA TTTCCCTTGGAATTAAATTCTCTTTTAAACATTAGCGTGGGATTTGCATA TTATTTAAGCCCTAAATTTTAACATTATTTTTTATCCGTATCATGAATAG AGATAAAGCTCCTCACGTATTCATATAGTGATGAAGTGCTATAATGGTTC CTTTACgtgtgtgtatgtgtgtgacttcaaaaaataaaatgatgatTTAT ATCTTGCATGATTTCAATAAAAGGGCCGAATTTCTTATTCAAAGAAGATT GTCTGAACTGACCAATAAACGTCGACGCAGGGGTGTATTTGTAGAGGAGA TTTCTGACGCAAAAATCCAGTGATGGTGATGGTTTTAgagttcaattttt aaacattgaattttaagtggggatgaaatcaaagacGATCTCCCGGTGGG GTCGAAATTCCAgaatattttcccaccggggacaaattttttgctgaatt ttccagtgggctgggttcccagcgggtctgtgacacaggggtgtatttgt AGAGGAGATTCCTGACGCAAAAATCGAACATTTGCTGCCATTAATACATC CAGCGGTCTAAAACAAATATAGAAGGCATGACCTTTTTATGAGCTTCCGA ACTTTATGTAAGCAGTTACAAACAGGGTGAAAATGCTGAAAAGGTGAAAG TCTGTTTCTTTATCTGGGTTCATTATATAACGGTCAAACGTTTAAGTTAA CGACGcgttgaaaaaaaatgtgttaAAAGAGTATTATAAAGTACGAAAAT GAGGGGGAGATATGCTCGCTCGCATTTCACGTTTTGTAAAACTTTACAAA GCAGTGAGTTAAACATTTTTGGACTTGGTATTGAAAACACTTGAGCTTTT GAAGTGGTTGAAAAACAAGGTTGTGTTGATTTTGGTGGCTTTGCTTTTCG TCAGTAGCCCACTAGGTTATGGAATGGACGTTAATTGAATGTTCTATGAA TGGATACATCTTTCTAATGACATTGAATGAATATTCTGTATTTTGAAGTA AAGAATTTCGAATCTGAATCTATGTTGAAacctttttcaagatttcaaga gGCTGTCACGAGCGTAAATATGGCGGACTAAGAGGTGCTTTAATATTCAC GATGAAGAGATTTTTATTTTGCCACTTACCAAATTTGACATTTCTCATGC TTCATTTGAGATTCCCGCTTTAGATATCCCTGAAAAAGGTTTCTTCATCG CAGAGAGGAAATGAGACCTGTCATTTTTATATAAACTAACGACCTTCAAA CAGGATATCCGCTACCACGGAGTGCACTAGGTTTGCTTCTGTTAATATTG CCTACTCATTACATaaaaaaaaTCGatgactttttttcttctaatgTAAT GTTTGATTCGGCCGGCTCCTTGAAGGGGTAATTTTTCTTATTATAAGGAC GTGGGTTGTAACaaaaaaaaTCTAGTTAAAAAGTTTGTTGTTTTGGATTT TCGCGAGATTGTTTGGATCTTGGTATTTATTCTTCTTTTCAAATGAAGAT GAATACGTTGGACGTCTTCAACCCGTaagttaaatttcatttcataaacT TAGTATCCTGATATTGGTCaagaagattttcaatttttttgccgaGAACT TCAATATACCTATCTATGTAAGGATTATCTTTCGAATTTTCAAAGGTTAA ACCGACGGACTCAGCTGTCATCCTCGTGTATTTTGGATAACTTAATACGC GGAAAACTTTTCCACTAAGTGGAAAATAAGACATTAACTACTGTTGAGAT CTAATAAGGGGTGACGAGGTGAGGTAAAAGTCGGTTTAGGAACAAAATAC AGATCTTGAAATCGTCATAGTACCAGCAATCAGAAGAATTTGCTTTAAAG TTAGCTTAATAACTTAAAGATATTACgtaaaaattcttataaatataATC ACGTTTTAATTTGACGCAACGACTTAAGAATATCAGTATTTTGCTAACTG GTCAAATGGGTTCATCATAGCTCAAGAATGTTCATCGTCATTTTTCCCTT GTAGGTGACACTAAAAACCTTAATAAGCAAGCAGGGTAAAAAATACTTTC CTAGCCTcccccccccGatgatttaaaataatttattcgAACAATACAAA GAGCTGGTTAAACAATGATTTGATTATCTCGAATAAAAAATATCTCGTTT TGGTTATatttaaataaagtttttttcaaatttcggaATTCTACCGAGAT ATTATACCTGGTTGAAGCGCCCCCCTGATTTAAGATGCATATTATCTTTC ACATTCTGAACTCATTGGCTTTCCCTGGAAATATTTGACAGTTAAATCTT AAATTACTTCTTAGTCTCCTTTTTAATGCCCTTTATGCTTCATATCCGTT AGCTGATGGAAATAAACTATGTTTACTTTTGTCGATTCAATCAATTGTAA AAAGGATTTGATTTCAATTTCCTGATTAGCTAAAACAGGCAAGCAGCCTG TATTTATGTTCAGGTCCGATTGGCGGAAAAACTTCGGCCGCCATAAGGAT TAGGCGGTCGCTTAGTGATGCAGATAGAATGTCGTCTACGTGCAATAATA GTTCCCTTTGAATGTACTTTGAAGATCTAGATAACATACCTTTTGAATGT CAGCGTTGTCTGATATTTTTAAGCCATAATCTTTTATAATTATACTGTCT GATTTGATTTCATATTAGTCGTTCAAATTAGCTTTACCCAAGTCTAGTTT gtaaattatcaaaacaaactatCTTTTAGCCTATAGACTTGTAGCcttaa atttaagaaaaaatatacGAACAGTTGCACCAAATCTGGTTGCATCTAAT CAAGAAAGGAAATACGATGGGCTATTTAATTATTGAAGGGTCGTCTCGAT TATTACATCCTGAGAAAgcttcatttattttcaaaacgaaCTAAACAACA TTGGTTACTTCATTTAACTGCGGTGATACCATGTTAATATGGATAGTTTG CAGACATCGCTATTTCACTAACCCTGTGGTaatatattttggccaattgg AAAAAATGACGGAGTTTAACGATGAGAATGTCTTATAAGGTTTGgggttt tgttatttttgtttaaaagagctaaaaagtttttttccaaataataTATA TGGGATCAGTGCATTCTTTCAGTTAAAGCAATCCAGGGCATTTTTCTCAC CGGGAAAACTTATTCGACCAATTTTTCCACCCAGATACGGGGATGTTTCT AGATGCATGTCATTTCTCTAAGCAACAAGGTGCCTTCATAGAGTATGAAA TTATCCGTTATGTCTAAGGAATGCATATTTTTGTCTTGCAAATCTCAAAA TCTTGTTAAAAGATTGCAATTGCAAAATCACAGCATAAAAGTTTCGTAAA CACAATCAAGATCAAACAAATTAGTGGTCTATTAAGTATTATCAAAGAGG ACCTCCGTCCGAACACCTATCTTGTTTTTAAGCCTATGATAAATTGATTT CTTATAAGATACAATGCATTGAGAGTAagctttcccagctggcacacaac gttttttcgacgtttatctaacgttcataacatccatataacgttagatg aacgttgaaacaacgttgtgtgccagctgggttctgGCCTGGTCAGACAA CCTCAAATTTAGAAATGTAGAGAATTCTTCCATAGTTTTCTCTTGCTCTG AATCACTATAACGGTCCATTAGCTTAACCTTCGCCTACCCTTTGCAATCT TCACTAATGATACCCCAAAGCTCgtatttgaaagaaagaaataatgCCCC CACTGCACTTTTTTagtcttatttttcttataaaagaaatagaTAAAAAA GCGTGATTTTGTCTCTGAGAGTCTTCAAATGCCATGAAAAGGATTACAAA CAAATAAATAtctgaagacattgcattggtCTTGGTTTGACGTCAAAGGT TAGGATGACCCATTTGTTTTTCTTACGTTGATACCCACCTTTACGACAAT ACGACTTAGCGCATTCCAAATGCGAGTGGGTATTCTATTCTAAAAATACC ATTAgcgattttttttatgaaaaagagCTCACTTCACGACTATCTCGTTT CATCATCTGGATTGCATGtttgtataatttttcaaatgcgTATGGACTTT ATGTGACGAAAATTTGCATTTAATTTGTTTGACATTGGATTCGTGACTCA CagtcaatattttttgacttttttgagtTCGAAGAAAGATATCTTATGTA TCTTAGTGAGAGAGGAGAGTGGATGATTCAAGAATACATTTGCTAGAGAC ATCGAGAAGCATAGTCGATCAGAAAATTTGTATGTTGTTGTGGTGTTTTA GATTCTTGGTTATTTACAACTTTAGTGAACACAAGATAAAATACTAATTG AGAAATAATGGTTGCGGCTGTTCGAAAAAGTGCAATTGTTCCACCACCCC AAACCGGGTTTGTTTCTATTTTAAGTCTATTTGTATCGAATGAGATTGGA CAACATTTTCTCTTTAACATAGACTCCGGAAAGCCAAAGAAAACCCCAAA TGCCTTGTTTACAGAAGGTCACTGTAGCTCAGTACTACATGAGACAGGGG TGATAGATGAAGAAATCTCAACATATTCTCCCAGTTCTCCTAGTTCTCGC TACCcgcacttttttttaaattgttctttaaaCCAAATAGATATTATGTT TGTTGCAACTCCTTGCTTTggaaattaaatcaaaatcaatttaaaattca AGTTGCGTAATTAACAACATTATGGCCGCCATTCAAAAATTGCGTGTGTG GCCATaatctttttccttttcttcaaTATGCAGACATACTTTAAACCCAT AATTGTTTCTGATCGTGACAAGGAATTggattgaaaagaaaaagcaatGA GTTTGCAAATGCCTTCTCAAAATGAATTGACAGGAAAAAATACAGAAATG GGGAGAAGAAAACTAATTATAAATAGCCCATTAATTATCATTAATGATAC ACCGTCAAAACACCCGGTTTTCTATTATAATCATCATTTGATTGACAATG CCAATCTTCAGGAAAGAGCTACCTTGTTTGAAAATACTATATATTCTATA AAGTTGGTAATTTTGACGATGCTCTTTTTTATACTTGGTCAGTTGAACTA AGGATTgctttttgcaacattttgaagattttgacttGTAACtttttttA CCGAGGGGAAAAagattgattgaaattttaattaCTACATCAGTATGTGG GTTCTAAAGTAAGgtgatttttagttttattggAAGTAAAATGTTGATGA AGAAAGTCTACTACACCTATAAGAACCAGCAAGCTTTTTATGAaactcgg ctgttcttatttaaCAGCCCTAAGTaagagcctcaaattgttcttttcAT GGTTTTATTTCTTGTGATAAATTGGAGTGGTCAGAATTTTCGCAtttaaa ttacttgaaattcaGCCTTTTGTTGAGTTTGAGCCccaatattcttataa aattgttcttataatttttttattttaattaaaaGCACTAAAGACTAAAT AGTTCCAGAAACTAATATTTCTTGTTCTACATCCGGAAATCAAATTTTGG AATCTTCAAGACTTTATAAAATATCTTCTCTCCGTGACGTCAAAAGCATT CAAGATTTTAGCACTTTAATGCTACAATATTGAAAAATCTCTTCAAACTA TTCATAAATCTAAAAGCTCGTAAATTTAGTTGCCCTTTCTTTTATCCGTG TTGCTATTTACACCTCTCAAATACTgttaaaatttgatttcatttttttc atgccctttttcTTGTTTGCTTGGTATTAATTTTCATGGAGATTTTAAAA CGATTTATTGCAATGTATACTTTTGAGAGAGAGTTATCTTTCTTAAATTT TGTTCtcgaattttgaatttgataacTATTTTCATAATATTGTCTATCAT TGCTGTGAGTTTTTCAtcatctgtctgtctgtgtctCAAATTTTCTTGAA CGAATGGATCTTTTCAAAGGTATGACAGATCGATAAAAATAGGCTGGAAT TTGAACTTTGTTGcaattgttttaaagtttgaaaCTTTAGAATAATAAAT CTATTATTTGGAAGGAGTGAGAATATTGCTTTTTGGTTTCACCAACTCTA ACTTCAACAAAAAGATATCCTAGACATAGACAGGATCATTATTTTGctaa aacacttttaaaagCAAGAACATTTATTTCTGTATGAAGAGTTTGACGCA ATGGCGTatttaagcccgaagggctaatagcgaatctccttggtagaaTT TGAaaccaacaaatcctaccaaagctgCGTGGCTTAGAGCGGCCCGCCTG ATTTTAACACATATGGcagattgaaacaaaaatttaccactgaatttcga aaaaaatatcactcggAAACAAAGGAATTGAAAGATTCAATCCGTCGACA ATAACACGTGGCATATCTTAGGGCTTccctttttcttgcctgagaaaggt tagagatttgcttctagccctttgggcttatacttcattgcttTGACGGG CGGCAATGCTTGTTAAAGTTTACCATACATATATTTTGAAGACCTTATTG GACAGTTTGCTAATTAcgtttatattttcttttaattttaggCAAGGGGA GGGAATGACAGGCCCATATTTCCAACACAACATATACAATATGAGCAGCG AGCCACATTTCCGGTCTGAAAGTCCAATTCCTCGTAGTCCACGATTCGGT AGTTTACGACGACGAAAACGCATCGACCGAGAATATTTTGATGATACGAG TGAAGGCTCGGATGGGAGGACGAGTTCCGACGAATATGAATCTTCATCAA ATCAAACATCGaaaaaaaTGGACGATAATAACAACACAAATCAAAAGAAT CGAAAAAACAGTCATTTTGCTTTTAGTAATGTTaagaaaaagattacgtc aacTTTTCAGCGTCGGCATTCTGTGTCAATGCACCCTCCCTCAGCGACAG TTCAAGGTAAACAATTACCGATTCGACGATCGTCAACGACCGGAAATCAA TCACCAAGACTTTTACGTCAATCTTCGTTTGATGAGAGCCATACCGCCGT ACATAAACGTAAAACGTCGCTACGACGACAAGTTACCATGGCAGCTGTAC GTTTACACGAACAAAGTCAAGTCAGCGGTAGTAACCCAATGTTAGacaga attttacaaaaaagccAATTTCAACTTGAATCAAGTTCCTCTACACCGGA TATTAAATCACATTTATCTTTGAAAAAGAcacatttaaaaacatttaaaa ttcatATACTTGGAAGCAAGTCCGTCGGAAAAACAGGTTGGTATCGCCTT CTTATGTTCTTTGGAAGTAACACTCgctaatttatcaatttttctgattt tacgGTTCCACACGAAGCTTAGAAATGATGTAGCAGCACATTCCTCATTT TATTGGATTTGCTTGATTAATTTTTGCCAATcgcataaaataaattttag tcatttttaatcaattatagaaatatttcatgtttttcagcTCTGACGGT GCGTTTTCTAACGGGAAGATACATTCACGAATATAAATCAGCAGCAGGTA AGCAACGACGTCATTAAGACGTTATTGAGTGTTTAGCAAAGGACCTAAGT AAAATACTTGATAAGACTCTCATGGATCGGTCCACTCCAAATCTAATATT TGAGTCATAAAAAGGATCACGCCATTACACCAAAAAATAGGCCCACTCAC ACTATCGCGCAAGCGACTGAGGAGGCGTGGTAATAAAAGGCTAAGATTAA GATCATAGTCATGATGTCTCTCTTTAACTTTAATCCCTGCTAGCTAGAGG ACTATGAGCTGGTAAGATTCGATAAACTGAGGTTAAAGGTGAACTTTGCA ATAATCTATATTTTTCCGACGTTTTATTTTGTAGAAGAAACATACACACG TGTGATGAAatatgaagatgaagaagtcaATGTTAAAATACTCATCAATG ATATTGAATCTATGGTGAGTTAAATAtggtttttatgaaattttttgaac aGCAGGATGTAAACAATACCTCTTGTCTTATAAATCCTTTGGTACAAATG CATTTTCAACAAATGCTAGGATTCGtatcttattttttgacaaaaattag cACTTTGGTTGACGCTACAATGCATTCTAAAACGGATCGAAAtcaacttt tgtttttattttcatatgactttttcttgttcaagctttttctgaacact tttaacaatacctttttctcacagacccggtggggtTTTACCAgctagtg gggataaaattaacggaccaaaactcgatgagATTGacattcccatgttt tttatggctggggatttgaattcctttgttttccaGCCAGAAAAGGGGAT GACATTCTAGgtaatttttccagtgagaagggttcccagtgggtctgtga gaagagggtgtttgACAATGTCATGTAAATTTACAAATGTAATAAAATTG GGTAAATTGTATGATTCAGATACAGATGGGTAGaagatttaaaacaaaaa tacgaaaaaaaatactctaaaaCTCTTGGacaaatatttcatcctgtTCT GGAGGAGTCACAGAAAGTGAGCCACAAGTCAAAAATACACATGAATTGAA ATGATAAAGGATGATATCAATATTTTAGTGGCAATGCTCTTTGTTATACG TTTTAGAGAATTAAATTGATGCTAAgtagattaaaaataatttgaagata atttCTTGCATGTAATAATGCTGCGGGAGTCAATCGGAAATAATAAAGTA TGTCTTCCAAATCAGATAGACAATGGATTTAATGTTTCCTAATCAGCGGA AGTGAGAATTACAAAGAAATCGTCAGCCAACACCAAACCAAACCAAACGC CCACGATTCATTCTGctcttcaaaaaaccttttcgTGTGTCTCTACAATA AGAGTCTGGTAATTGCTACCAAATTCAGTTGTTTTGTAGACTTTAGAGAC AAGTGCGTAACGTTTGTGAGGTTCATGTAACGATAAAAAATACAACACAA TATTTCAAGATTATGCGATACTTTCCGGCACCCGAGACCAGGGCTAAAAC TCatcaaataaaatataaataaaaatatccttGATGTTCACCCTGGGAAC GAAGGTGGCTACACAGTACAGCGTATTTGATTAGCATCTATGGCAAATCT TTACCGCGATGTATTTTCGATAAAATAGAGTGCATTTTAGTTTGTGAACT GCGCAGCAGGACGGCTCTGTGGAAAATATATGTAAACAAAGTGTAAGGAG GTTTAAGCATTGAACATATAACTTTGTACTTCAAGAAGAGGCAAAAAACG AGCCTTGAAAGTAAGAAATTAGAAACCTGTCGGTAAATTATTAAAACCTC GTATTTTATGTTAAGTGTATGGTTAGTAAAATCAACAAATAACTTTCAGG TACGGAAATACCAAAgtaacctcaaatcaaaacaaaacattaggTAATTT TACTCACGACCATCACAAAAGTCCTTTAGGGGAttacaatgtttttattt tttggtgtATTTTGTATTCTCTCGTGTTTTCATTGCAACATCTCTACATT CCAGGAGTATCAAATTAAATCTTGGCGTCAAGACTTATCTTTAGGAGCCA TAGAGCCTCTCACATCAGTACTGTTACTGCATAGTCTAGCATACTAGAGA CGAAGGGAAAAATTGTAGTCTATTCAAACTGATATTATTCCGTTAcgatt atcgtattatcatctaacacccatattactgtattacataGATTGTGAAT GACTCCAGTCTATTACTTCAAAGAAAACAATCTACATGGGGTTGCAACCG TTTCTTAAACCTCGAATCAAGTCTCAAaacacccctatctcacagcccct gtgtaactttttttctcagtggggataaaaattcttattgaaatcataac ggggatagaaattcctttgttctaaggttaaaaaattcagtggcaaTGGA TTTGAAGCgcagtttttaaatattgaatttcgaatgtggatgaaataaaa gttaatttccaaGTGGAACTGAAACTCTAAGGTATTTTCCAACCgggaaa aactttttgtcaatctttccagtggggctgggctcccagcgggtctgtga cagaGGGATACCTCAAAGgaatttaaaaagatttcaaagttaaAAATACA TCATTTTCGAGTTTCAAAAATGAGTAATTCTGGGAATCTTAGTCATCATC atttaattgactttaaaatatcactttttgCGGTTATTTTCAATATCCTG TTATTATTTCTCATAAATTACATAGAGAGGTACAATCTCATTTgaagtgt ttttcaaaataaaagccaTACCTAACGACCATAACACTGACTCAATTTGT ATTACGTAGTGCTTAGTCTTTTATTgggcttattatatgcttaattTAGA AAGTAAAGTTTGATTTACTCAAATCTCTCTGAGCATCTGATAATAATTCA AGAAGATCAACAATAAAAAGACTTCACCAAGGTTTTGGTGTTGGTAAACT AAATTGTTTCAAACTTCTCATTTATTGctttatggacgttgtgaatgtta ggCGGACGTTCAAACAACATATCATCTGTCAGCTATGTGACCAGTATTGA TGACAAATTAAAAGCATGAGTTTTGAAAAGCCGGTCACATAGATTCTAGA TATGAATTCTTTTACCACGTTCGAGCGTGGGTTGAACTTCCTGATGTGAT CtacaatttcttaattcaatatgtcatttataaaaatattcataaattGT AATAGATTTGCGGCAGGCAAAATCCTATCGGGAAATGTtctttgatagat ttccttaaaatataaatatttgatACTTTAATCTTGGAATGACGAAATTC GGTTGATGTTTACTTTAAGTAAATACGCCTACTCCTTATCTCATTCGTTA TATCCGAACATATTGCCCTATCGAATTATCAAACTTCCAAATTACATTAT TTTTGACATGTTTTCAATAAACTTCACTCTGCCCTAAAACGGCTTAAAGt atgtccagatataattggcagtggagacaagaatgcctgtaacttttgat agtcaaatataattatgaaaatttttttttgcttgttttagagaatcaaa agcgctatattcgaatgtatttttggttgaaaaattcgcgatttttagtg gttaaatttgcgattgcaaaaattgagctttttttctacttatgctataa cgttcatttttacatcagttgtagttcaaccttaggttaaaaagtttctt aaatttcaaggcaaacagaaaagtccttcggaagatatgggacccgaaat accccttggtagcacttttctgtgaaatatcaaatctccaatttattact aaaaacgggggttatgttatcttttttgaacagtgcaagtaaaagttgga aagtgtcggtttattggtattattggtatcattgattatttcgaaacgaa gtgaaatcacagtataattgcttttattgaaaagataagcatgaacttat attgcctttgttatttttaagtcattaaagaactttgctaattcccaaaa cactaaacacagtggtcgtgttcagaccaaggtttaaagcaattaggtct acatgtttcttttatattccttttgtatctaacggcacgctcctcattag ttaaaccaaagtttaaaaaggaatcaccctctagtttaaaaagtgaaaag catgctccttttgtaaatgaagaaaaaagaacgtgaaatttatgacttag agacggtcggagcatctctagcagtaatggcttcaacgaccacgaattag tgttttgcagagggattccctgaaatcttttttgtttcaaagtatctcaa gagagaagatgacatgatttcaagttaggaaaggagattcctcgagatcg ccaatcgatgatgacaaaagaaaagtgattataattaaattcccatatca acaaagtactacttggaccttaaacttaaactttcaggtctgaacacgac cagtttggctatgaggtcattaaaaagatcgtaaaatgtgttatgatcga aaaactgttttatcaatcatatcactacccccgtttttagtaataaattg gagatttgatatttcacagaagagtgctaccaaggggtatttcgggtccc atatcttccgaaggacttttctgtttgccttgaaatttaaaaaacttctt aacctaaggtcgAACTatcactggtgtaaaaatgaatgttatagcataag tggaaaaaagctcaatttttgcaatcgtaaatttaaccgctaaaagttgc gaatttttcaaccaaaaatacattcaaatatagcgcttttgattctctaa aacaaccaaaaaaaaattccataattatatttgactatcaaaagttacag gcattcttgtttccactgccaattatatctggacagactttagttataTT CTTCAGTTTCCATTCTTGTTTTTTACCCAACGCCCTTCATTTTATATCGG ATAGTTATTTACACATTGAGCTCCAGGATCTGAGACAGGGTTGTTCATCT CACAGTTTTGAACATAAAGCCTGGACAAATGTagagttatcgtccgttac agtgatagtaaaggcggcaAAGTATGGCGGTagggcgttatggcggtata cagAAAAAATCGgtgggagagtttcgaagaaacgactGGCAAACTCTAAT GGCTATAAACTCTTTTCagcccgtttgcgaattttcttcggctttgttct tattttttagataGTGACTTGTcatagactatagcatagtctaggaCAAT TGGTATTGGTATAAGTTATAGTCTCAGAACAAGTTGAAAATGCTATTATA TCCAAtgtaaaatctaaaatatttcattaacTTCCTTTCTTCGTTTTTAG GAAAATGACATTGAACTTGGTCAAAATTCTGGCATCATGATTTTATACTC CATCGTTGACCGCACCTCATATGATTATgcgaaatttgttttaaattatT TATCAGAGAACAATATAACTGGTTACTACCCTGTCATGCTAATGGGTACT AAACGAGATCTATCACGCATGCGTCAGGTGGACCGCAAGGAATCATTCAA GGTTGCTACACAATACAATTGTACACCTTTTGACGTTTCGTCGGCAAGTA ATCGACGTGTGACGGAAAGTTTTCATGCAATGTTCCGACAAATTGAAATT CGAAATTTATTGAATCAAAATGAAGGTATTGACGCACCTACCATCGTTAA TCCACCTATTGTTGCAAGGTCAGGTAAACTCCGGTATGGAACTGCATAGG AAAATTCAATCACAAAATAAGAGTCGAATGAATTTTAACATAACACGGAT TTTTAAATGAAGCCGCTGGATTAGAGACAAGATAAGAGAGAATAACAAAT TTATTGAATTATTAATATTATATTGTAACTCTCTCCTCAAAATCGGCTGT CACAATAATAATTCgatatcatttttattttaaacttgTCGATATGTATA TATAAGATTTGTAATttcatttcgaaaaataaagctGTGCTTTCTAATGA AACGAACCAAAAGAAGTGACATAGAAGTGATAAAAACCCATACTCTAAAA CCCCATTGGGGCTTAGAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:1372580..1386397+

>MSTRG.11236.1.p1 ID=MSTRG.11236.1.p1|Name=MSTRG.11236.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4728bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:1372580..1386397+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGCAGCGAGCCACATTTCCGGTCTGAAAGTCCAATTCCTCGTAGTCC
ACGATTCGGTAGTTTACGACGACGAAAACGCATCGACCGAGAATATTTTG
ATGATACGAGTGAAGGCTCGGATGGGAGGACGAGTTCCGACGAATATGAA
TCTTCATCAAATCAAACATCGaaaaaaaTGGACGATAATAACAACACAAA
TCAAAAGAATCGAAAAAACAGTCATTTTGCTTTTAGTAATGTTaagaaaa
agattacgtcaacTTTTCAGCGTCGGCATTCTGTGTCAATGCACCCTCCC
TCAGCGACAGTTCAAGGTAAACAATTACCGATTCGACGATCGTCAACGAC
CGGAAATCAATCACCAAGACTTTTACGTCAATCTTCGTTTGATGAGAGCC
ATACCGCCGTACATAAACGTAAAACGTCGCTACGACGACAAGTTACCATG
GCAGCTGTACGTTTACACGAACAAAGTCAAGTCAGCGGTAGTAACCCAAT
GTTAGacagaattttacaaaaaagccAATTTCAACTTGAATCAAGTTCCT
CTACACCGGATATTAAATCACATTTATCTTTGAAAAAGAcacatttaaaa
acatttaaaattcatATACTTGGAAGCAAGTCCGTCGGAAAAACAGcTCT
GACGGTGCGTTTTCTAACGGGAAGATACATTCACGAATATAAATCAGCAG
CAGAAGAAACATACACACGTGTGATGAAatatgaagatgaagaagtcaAT
GTTAAAATACTCATCAATGATATTGAATCTATGGAAAATGACATTGAACT
TGGTCAAAATTCTGGCATCATGATTTTATACTCCATCGTTGACCGCACCT
CATATGATTATgcgaaatttgttttaaattatTTATCAGAGAACAATATA
ACTGGTTACTACCCTGTCATGCTAATGGGTACTAAACGAGATCTATCACG
CATGCGTCAGGTGGACCGCAAGGAATCATTCAAGGTTGCTACACAATACA
ATTGTACACCTTTTGACGTTTCGTCGGCAAGTAATCGACGTGTGACGGAA
AGTTTTCATGCAATGTTCCGACAAATTGAAATTCGAAATTTATTGAATCA
AAATGAAGGTATTGACGCACCTACCATCGTTAATCCACCTATTGTTGCAA
GGTCAGGTAAACTCCGGTATGGAACTGCATAGATGAGCAGCGAGCCACAT
TTCCGGTCTGAAAGTCCAATTCCTCGTAGTCCACGATTCGGTAGTTTACG
ACGACGAAAACGCATCGACCGAGAATATTTTGATGATACGAGTGAAGGCT
CGGATGGGAGGACGAGTTCCGACGAATATGAATCTTCATCAAATCAAACA
TCGaaaaaaaTGGACGATAATAACAACACAAATCAAAAGAATCGAAAAAA
CAGTCATTTTGCTTTTAGTAATGTTaagaaaaagattacgtcaacTTTTC
AGCGTCGGCATTCTGTGTCAATGCACCCTCCCTCAGCGACAGTTCAAGGT
AAACAATTACCGATTCGACGATCGTCAACGACCGGAAATCAATCACCAAG
ACTTTTACGTCAATCTTCGTTTGATGAGAGCCATACCGCCGTACATAAAC
GTAAAACGTCGCTACGACGACAAGTTACCATGGCAGCTGTACGTTTACAC
GAACAAAGTCAAGTCAGCGGTAGTAACCCAATGTTAGacagaattttaca
aaaaagccAATTTCAACTTGAATCAAGTTCCTCTACACCGGATATTAAAT
CACATTTATCTTTGAAAAAGAcacatttaaaaacatttaaaattcatATA
CTTGGAAGCAAGTCCGTCGGAAAAACAGcTCTGACGGTGCGTTTTCTAAC
GGGAAGATACATTCACGAATATAAATCAGCAGCAGAAGAAACATACACAC
GTGTGATGAAatatgaagatgaagaagtcaATGTTAAAATACTCATCAAT
GATATTGAATCTATGGAAAATGACATTGAACTTGGTCAAAATTCTGGCAT
CATGATTTTATACTCCATCGTTGACCGCACCTCATATGATTATgcgaaat
ttgttttaaattatTTATCAGAGAACAATATAACTGGTTACTACCCTGTC
ATGCTAATGGGTACTAAACGAGATCTATCACGCATGCGTCAGGTGGACCG
CAAGGAATCATTCAAGGTTGCTACACAATACAATTGTACACCTTTTGACG
TTTCGTCGGCAAGTAATCGACGTGTGACGGAAAGTTTTCATGCAATGTTC
CGACAAATTGAAATTCGAAATTTATTGAATCAAAATGAAGGTATTGACGC
ACCTACCATCGTTAATCCACCTATTGTTGCAAGGTCAGGTAAACTCCGGT
ATGGAACTGCATAGATGAGCAGCGAGCCACATTTCCGGTCTGAAAGTCCA
ATTCCTCGTAGTCCACGATTCGGTAGTTTACGACGACGAAAACGCATCGA
CCGAGAATATTTTGATGATACGAGTGAAGGCTCGGATGGGAGGACGAGTT
CCGACGAATATGAATCTTCATCAAATCAAACATCGaaaaaaaTGGACGAT
AATAACAACACAAATCAAAAGAATCGAAAAAACAGTCATTTTGCTTTTAG
TAATGTTaagaaaaagattacgtcaacTTTTCAGCGTCGGCATTCTGTGT
CAATGCACCCTCCCTCAGCGACAGTTCAAGGTAAACAATTACCGATTCGA
CGATCGTCAACGACCGGAAATCAATCACCAAGACTTTTACGTCAATCTTC
GTTTGATGAGAGCCATACCGCCGTACATAAACGTAAAACGTCGCTACGAC
GACAAGTTACCATGGCAGCTGTACGTTTACACGAACAAAGTCAAGTCAGC
GGTAGTAACCCAATGTTAGacagaattttacaaaaaagccAATTTCAACT
TGAATCAAGTTCCTCTACACCGGATATTAAATCACATTTATCTTTGAAAA
AGAcacatttaaaaacatttaaaattcatATACTTGGAAGCAAGTCCGTC
GGAAAAACAGcTCTGACGGTGCGTTTTCTAACGGGAAGATACATTCACGA
ATATAAATCAGCAGCAGAAGAAACATACACACGTGTGATGAAatatgaag
atgaagaagtcaATGTTAAAATACTCATCAATGATATTGAATCTATGGAA
AATGACATTGAACTTGGTCAAAATTCTGGCATCATGATTTTATACTCCAT
CGTTGACCGCACCTCATATGATTATgcgaaatttgttttaaattatTTAT
CAGAGAACAATATAACTGGTTACTACCCTGTCATGCTAATGGGTACTAAA
CGAGATCTATCACGCATGCGTCAGGTGGACCGCAAGGAATCATTCAAGGT
TGCTACACAATACAATTGTACACCTTTTGACGTTTCGTCGGCAAGTAATC
GACGTGTGACGGAAAGTTTTCATGCAATGTTCCGACAAATTGAAATTCGA
AATTTATTGAATCAAAATGAAGGTATTGACGCACCTACCATCGTTAATCC
ACCTATTGTTGCAAGGTCAGGTAAACTCCGGTATGGAACTGCATAGATGA
GCAGCGAGCCACATTTCCGGTCTGAAAGTCCAATTCCTCGTAGTCCACGA
TTCGGTAGTTTACGACGACGAAAACGCATCGACCGAGAATATTTTGATGA
TACGAGTGAAGGCTCGGATGGGAGGACGAGTTCCGACGAATATGAATCTT
CATCAAATCAAACATCGaaaaaaaTGGACGATAATAACAACACAAATCAA
AAGAATCGAAAAAACAGTCATTTTGCTTTTAGTAATGTTaagaaaaagat
tacgtcaacTTTTCAGCGTCGGCATTCTGTGTCAATGCACCCTCCCTCAG
CGACAGTTCAAGGTAAACAATTACCGATTCGACGATCGTCAACGACCGGA
AATCAATCACCAAGACTTTTACGTCAATCTTCGTTTGATGAGAGCCATAC
CGCCGTACATAAACGTAAAACGTCGCTACGACGACAAGTTACCATGGCAG
CTGTACGTTTACACGAACAAAGTCAAGTCAGCGGTAGTAACCCAATGTTA
GacagaattttacaaaaaagccAATTTCAACTTGAATCAAGTTCCTCTAC
ACCGGATATTAAATCACATTTATCTTTGAAAAAGAcacatttaaaaacat
ttaaaattcatATACTTGGAAGCAAGTCCGTCGGAAAAACAGcTCTGACG
GTGCGTTTTCTAACGGGAAGATACATTCACGAATATAAATCAGCAGCAGA
AGAAACATACACACGTGTGATGAAatatgaagatgaagaagtcaATGTTA
AAATACTCATCAATGATATTGAATCTATGGAAAATGACATTGAACTTGGT
CAAAATTCTGGCATCATGATTTTATACTCCATCGTTGACCGCACCTCATA
TGATTATgcgaaatttgttttaaattatTTATCAGAGAACAATATAACTG
GTTACTACCCTGTCATGCTAATGGGTACTAAACGAGATCTATCACGCATG
CGTCAGGTGGACCGCAAGGAATCATTCAAGGTTGCTACACAATACAATTG
TACACCTTTTGACGTTTCGTCGGCAAGTAATCGACGTGTGACGGAAAGTT
TTCATGCAATGTTCCGACAAATTGAAATTCGAAATTTATTGAATCAAAAT
GAAGGTATTGACGCACCTACCATCGTTAATCCACCTATTGTTGCAAGGTC
AGGTAAACTCCGGTATGGAACTGCATAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11236MSTRG.11236Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11236.1.p1MSTRG.11236.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11236.1.p1.exon1MSTRG.11236.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11236.1.p1.exon2MSTRG.11236.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11236.1.p1.exon3MSTRG.11236.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11236.1.p1.exon4MSTRG.11236.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11236.1.p1.exon5MSTRG.11236.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000080_pilongenomesc0000080_pilon:1372580..1386397 +