MSTRG.11235.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11235.1.p1
Unique NameMSTRG.11235.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000080_pilon:1327630..1364687-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11235.1.p1 ID=MSTRG.11235.1.p1|Name=MSTRG.11235.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=37058bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:1327630..1364687- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGGTAATTATCGTCTTCAAATGTCGGCTGCCGTGTTTGTAAATAACCTTT CCCGCCAAAACGAAAGGTCTCTGAATAGCGTAGAAATCGAAGAAGAGCCG ACCACACCACGTGCACGTGCAGAAATTGTTGTCGAAATGGAAATTTGCAT CGACTCTGTTTCATCTGCCATTAATGCAGAAAAGGCAGGTTAGTTTTTGT TTCTGTTTCTAGTGTTATTTAGGTTTGGCTAACCTTATCAGCAGCTTTTT TCACCAGCTAGGAAGTATGAAATATCTGTTCTTGACTTTTGAGGTCCCTT TCGGCTTTCTCCTGGAAAAAACTTTATCTGTTCTGTATCTGGGCTCTCCT GGATTATATCATCTGTTCTGGGTAAAAATGGGACTCTTCCCTTGGAAAAT GTATATCTGTTCTCTAGAAATATTATGAAGCTCCCTAAAATCTGTCTGGC ATCCGGGGGGGGGGTGGTACTAGGGCAAGATGGGTTACGGGGATGCTCCG CTGGTCAGGGTACCTTTTTTAACCTCTATGAGTCCCAGGTAGGGTCGCAA AAACACCAAAATAGAAAAATCAGTCCCTCGTAGGGTGCCTATTTTTGGAA AATTTGGGGAAAAGTAGAAAATTTGAGAAATTTTTGGAATTTCAGTCCCA TTCACCAGACGGTCAGTGTAGACCTAAAGCTCTAAAACAGCATCTAATAA CATGAAAACCAGAATATGATTCTTCAATGGGAATCAAAACTATAAAGTGC ACTTACAAACATCAATTTGTCAGATCTAACAAAATTAATAACCGCACTGT CATCATTGACAATAAAACAAACGATTTTCTGTCAAGAGCCTTGTAAACAT TCCAACAACTTCCATCGAAATGATCTATCACAGCTCAGTCTACCATTTTT AGCGCGGTCCGAGGATTGAGCCGAGAACGCTCCGCAAACTCCTGCGCGGG 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TTGTCTGAAATGAATTAGTGAAATGATGCTTAATAAGGTTTAGAGCCACT CGATTCCTCATATTATACTCAGAGAGGTACCTGGGGAATATATAAGGGCT AAGTGTGTCTGGTCAGCACTTTATAAGTATGATTTACGGTAAGACATGAT CCCGAAAACGGTGAAATTTCCAAATAATTAATGAAAAATTCTCTCATTGC ATCTCAACATCAAACCTTCTGTTCTTAAGATTGACTAATGCAAAGAATTA TGAATAATGTAAATTGTTACAGTGTGTATTTTACAGACAGGATTTAAGTG CTTCTAGGAGCTTGTCTTGTTCTAAAACGCCTTAGATTACTACAGAAATA CCCGAACTTGAGAATTTACTGAGTTAATCCGTCAAAATTCGCCAATTCCT TAATCTTTATTGTTCATGCATGAAACGAGATTTAGTGGGCTTAGAATCTG TGTTGTCTGTAGGACCAAAAAACGTCGGCATAATATGGCTTCGAGAGGCG ATAATCCTAGGCGATTGTATGAAGCCTAGTGATGGAGCCATATTTGTGAA CCTGCTTGGATCTATTCTGGTTACTGTTACAATTATAAGAGGCGTATAAT GGTCCAATGCATCATTGTATATCCGCTTTAACTACATGAATGCAACACAA AGCCTTCAGCTAGTTGAAGAAGTCAGACTGTAGGAATTTTAACTTAAAGC GCTTTAAAGAAGTTATTGCCATATGAAATAATGGTTTAAGCTACATGTCC AAAATATCCCCGTTTTCTTACAAAAATCTAAGTATAATATTAAGAAATCT TGATTTTAAAATTCTTATTTGTTTTGGACATGGCTTGCTGATGGTGATCC CATTTTCCCTTCCCCTCATGAGGTTTTAAAGTTTTAGAATAATCTGGTCT CTGTGGCTTTGTCAGAACATTAACAAACGACTGGACATCCTTCTCCTTCG TAAGCACTGCTAGCTTCGTTGCCGCCTCGTTAAAACATAAAATGAAACAA TAGGTTTTGATGATCTACCTTGGGAATACCTTGCTAACAACTTCACAACC TACACAAAGTCCATGTTGTTCTACTCTTCTCCAGTCTTTTATCTATATCA TAACAAAGATAACAGATGCGAAATCATCGTCATTTTTCAAAACTCCGATG AAATAATATCGAGTATATAGGATCGAGAGTATAGGATTCAAATTATGATA TTCTTATGACACAGGCTCACAACTTTGGCATACTTTTTTTTGTCAAGTCA ATAAAAAAACTAATAGCGCGTTGTCGTGCAAACGTCACGATTATTACTTC TCTCATTTGAGATGCCTTGGAGTTTTTACAAGATACTTCACTAATTGGTC ATTTAAAGTGATAGAGATGACGCTTTCTTCTTTAAAAGTAATAAGATTCT TTTATTACATCTTAACGAACAACCAAATCAAATATGAGCTTGTAAAAACT CCAGCTTGTCCCTCTCATTTGACCGAAATTCAATCCCACAATCCTTTTTA GTTTTAATTCAAGAGTCGTGAAGTTTATTACTTTTTCTTTGTAATTGAGT GTAATTAGCTTGCAAGCATAATTGACGCAAAGGTTGACGGGATTGAATTT CGGTCAAACAGAAAAATCAATGTCTATTTTTAGATTCGCTACGGTATGCT GATGGAATGACAAAAGTGATTCAAAAGTATACACGCAGTTGAAATTCTCC ATTTCAGTGTATAAAAAAAATTGAAAATAATTATTTTGTGACTTGAGAGT AACTAGCTGTATGCGCAGCGTCGCACGCTGCGTGTCCCAATCCAGCAAAT CACTATACATCTAAAAAAAACCAACGGAAGAAACATAGCTGCTGATCGAT GATAAGATTTTGATTTTATAAAAGAAAGGAGAAAAAATTTCAACGCCATG AAGAGGAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:1327630..1364687-

>MSTRG.11235.1.p1 ID=MSTRG.11235.1.p1|Name=MSTRG.11235.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1800bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:1327630..1364687- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTCGCTACGGTATGCTGATGGAATGACTTTTGATGTGACGGTAGATGGT
AATCAAGCACTTGAACACATAATTGAAATGGGATTCGATAGAATATTAAC
AAGTGGTATGGAAGCTACAGTACTAGAAGGTTTACCATTTCTGAAACAAT
TGGTTGATCAGACTTATGCCGTCCTTCGAAAGTAACCTTCCATCGAGTGA
TGGCACTGTAGATAAGAAGAGAAACAAAGAACTATTAGATGGTTCGTCCT
CGAGGAGGTGACTTTCTTTACAGCGACACAGAGTTTGATGTCATGAGAAA
AGAAATTGAAATTTTCAAAGAACACAAAGCTGATGGATTCGTCTTTGGCA
TCCTAAACAGATTCGCTACGGTATGCTGATGGAATGACTTTTGATGTGAC
GGTAGATGGTAATCAAGCACTTGAACACATAATTGAAATGGGATTCGATA
GAATATTAACAAGTGGTATGGAAGCTACAGTACTAGAAGGTTTACCATTT
CTGAAACAATTGGTTGATCAGACTTATGCCGTCCTTCGAAAGTAACCTTC
CATCGAGTGATGGCACTGTAGATAAGAAGAGAAACAAAGAACTATTAGAT
GGTTCGTCCTCGAGGAGGTGACTTTCTTTACAGCGACACAGAGTTTGATG
TCATGAGAAAAGAAATTGAAATTTTCAAAGAACACAAAGCTGATGGATTC
GTCTTTGGCATCCTAAACAGATTCGCTACGGTATGCTGATGGAATGACTT
TTGATGTGACGGTAGATGGTAATCAAGCACTTGAACACATAATTGAAATG
GGATTCGATAGAATATTAACAAGTGGTATGGAAGCTACAGTACTAGAAGG
TTTACCATTTCTGAAACAATTGGTTGATCAGACTTATGCCGTCCTTCGAA
AGTAACCTTCCATCGAGTGATGGCACTGTAGATAAGAAGAGAAACAAAGA
ACTATTAGATGGTTCGTCCTCGAGGAGGTGACTTTCTTTACAGCGACACA
GAGTTTGATGTCATGAGAAAAGAAATTGAAATTTTCAAAGAACACAAAGC
TGATGGATTCGTCTTTGGCATCCTAAACAGATTCGCTACGGTATGCTGAT
GGAATGACTTTTGATGTGACGGTAGATGGTAATCAAGCACTTGAACACAT
AATTGAAATGGGATTCGATAGAATATTAACAAGTGGTATGGAAGCTACAG
TACTAGAAGGTTTACCATTTCTGAAACAATTGGTTGATCAGACTTATGCC
GTCCTTCGAAAGTAACCTTCCATCGAGTGATGGCACTGTAGATAAGAAGA
GAAACAAAGAACTATTAGATGGTTCGTCCTCGAGGAGGTGACTTTCTTTA
CAGCGACACAGAGTTTGATGTCATGAGAAAAGAAATTGAAATTTTCAAAG
AACACAAAGCTGATGGATTCGTCTTTGGCATCCTAAACAGATTCGCTACG
GTATGCTGATGGAATGACTTTTGATGTGACGGTAGATGGTAATCAAGCAC
TTGAACACATAATTGAAATGGGATTCGATAGAATATTAACAAGTGGTATG
GAAGCTACAGTACTAGAAGGTTTACCATTTCTGAAACAATTGGTTGATCA
GACTTATGCCGTCCTTCGAAAGTAACCTTCCATCGAGTGATGGCACTGTA
GATAAGAAGAGAAACAAAGAACTATTAGATGGTTCGTCCTCGAGGAGGTG
ACTTTCTTTACAGCGACACAGAGTTTGATGTCATGAGAAAAGAAATTGAA
ATTTTCAAAGAACACAAAGCTGATGGATTCGTCTTTGGCATCCTAAACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11235MSTRG.11235Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11235.1.p1MSTRG.11235.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11235.1.p1.exon7MSTRG.11235.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11235.1.p1.exon6MSTRG.11235.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11235.1.p1.exon5MSTRG.11235.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11235.1.p1.exon4MSTRG.11235.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11235.1.p1.exon3MSTRG.11235.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11235.1.p1.exon2MSTRG.11235.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11235.1.p1.exon1MSTRG.11235.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000080_pilongenomesc0000080_pilon:1327630..1364687 -