MSTRG.11220.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11220.1.p1
Unique NameMSTRG.11220.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000080_pilon:1149815..1162211-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11220.1.p1 ID=MSTRG.11220.1.p1|Name=MSTRG.11220.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12397bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:1149815..1162211- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTAGGTGAGTCAGTCATGTGATGTGCACAGAACATGTCATTGATTGTCA TCTGACACGGGACTTTTTTATTCAGTGTTTATTGGGCACTAGAGGTACCA AATCGATTTGGGACCTTTCAACACTTTTTTATGAAAAATAGAAAACTTGT GGATATTTGAGTTCCCTAGACATTGTATATAGAATTATTTAGAAAAAAGA AAGAATTCTAAACCTTTGAATCAACAGGGAGGTTGGTACTAAAATCTCAG ATTTGTACTTAAAGGGTCTTTGAAAAATTTTAACATACCACCTAACCATT TTTAAGAAGTGCTATACTAGTACCTATGTACTCAAGGTATTTTTCAAACA CTTTATTATCACTGTTATTCAGTGGCAAAAACTAAATTTCAAATTGGGTT AATAAACTCAATTTTGTGAAAAATTTGAAAGTTGAATGATACAAAGTAGA GAAATCATGGTACAAAAACTAATAATAAAATAACTTTTAAAAAGTAGCAG CTTTGTTTTATTATCAAGAAGATTTTTTTGTCACCCAGCCATGGCAGGTG ATATTTAAGTCAGTAATGGGGATAGCAATTTCCAAAAGGGTTCGTGTCAA TGTTTTTTTAGTTTTTTGTGAAGGGCAAACAGTGGTAGAAGCTCTACTGG TTGGGTTCAAAATTGAAACTTTTTAACAAGAAGATGACAAATAGATAATA AGTTTTGAAGTAGAAATAAAGTTTTTGCTCTAAAAACTTTTCATGTGACA TAACATTAACAAATTTTTGTATGCTACAAATTTCAGACTGAAATAATCTG CTTGGTTTTTGTATTTGGTTTGGTTTGTATATCCGAAAGTTAGACATAAT TTTCAAGTTTCATTATTTTTGATTTTTACAAAATTGACTTATCATAAAAC TTTGGCTTTACCTTATGTCAAGCAACTTCAAATTGATATGGAGTAATTAC TCATATTTTTATTGATATATGTGCTGTGATCTTGTCATGTGGTTTTTCTT TTTAATTGCTTGAGCTCTTAATTATGCCACTTTCCATTATAGCATGAGAA TTAGTTTTCCGTTTGTTATGAAGAGACAGACATTTTTGTCTTAATTGCGT CAAAAGGTGTTCTTTATCACTTCTACCAATGTTAATAAGCTAGATGATAA AATTATATTTATGATTTTTTTGAAAACTGATTGTGTTTGGTCGTTCTCTT TGTAGAAAAAAACTTTAAATTTTAAGAATAAAGTTAAAAAACAATATGGC AGCTTCCTCTTGTTCCAAGGAATTTGTTGTTGGTGGCAGATATAAATTGA TCCGCAAAATTGGAAGTGGATCTTTTGGTGACATTTATCTTGCACTTAAT CTCACCAATGGCGAGGTATAACTTTGTTGTTTTGTTTAAAATAATCATGA CTTTTGAAATACCTGAAATGGAAATTATATGATAAAATGGAAATTATGTG ATAAAATGAATCTTAACAAAATCAAACATAGCATTTCTTGACAATTAATT AGAATCATTATGTTGAGCACTGTTAGTGACTACATCGATTCCACCATGCA CTGTGGATTAGGAGAAGAGTGGGCTAATTGTTGACATAGAAATTAAACTC AGTCAATACAAGTTGGCGGGTAGTATAAACCAAATAGTATTAGACAGTTC TATGAGTACTCGTCTACCGCTACAAAAAGGGTCATACTCATCTTTATCAA AGTTGCATTGTTTTCACTTGTAAACAATCTCTTATTATTTTGTTTAATCC ATTTTATAGGAGGTTGCTGTAAAACTTGAATCAACACGAGCCAGACATCC ACAATTACTTTATGAATCTAAAGTATATCGTCTATTACAAGGAGGTGTTG GTATACCCCATGTCAGGTGCGACTATGATGTTAAATTTATCATAATTAAT GTGGATTTTGTAAAGATATAACAAAATATGGTATAAGGCTCAATTTCATT TAATTAAAGATTCTAACGAATATCTCTAGAAATCTAGAGATTTTGATCCA CTAGGATAAAGCATTTTTAATGGCTCGAATGGGATGGGTTATATAATGAT GTCATAAGGGGGAAATGCGTGAAATATTAATTTTAGGAAGATCTACTCTT TGATTTATCTGAAATGTTCTATCTATCAGGTGGTTTGGACAAGAAAAAGA TTACAATGTCCTAGTGCTTGATTTACTGGGGCCAAGTTTGGAAGATCTTT TCAACTTCTGCTCAAGGAGGTTTACTATGAAGACAGTTCTCATGTTAGCA GATCAGGTAAGAATATTTTTAGTCTTATGTGTTTTTTTTGAAAAGTTACA GATTATAGATTTCAATTAAATTCTTATCGCTTTTAGGAATGTACACTATG GTATATAGTTTAGTTGAAGTCTTCAAGCTCAATTCCATATAAACTGCCAG TTTATTCTCTATTTCCATATTATTCTATATCACGTTCCCAGACATGATTT TGTTTTTTTTCTCTTTATAGATGATTGGTCGGATAGAATACGTACAGAAT AAGAATTTCATACACAGAGATATAAAGCCAGACAATTTCCTGATGGGCAT TGGAAGGCACTGTAACAAAGTAAGTGGAACAGAATCCCTTGAAGAACTTA TCCCTTTATTCGTTGATGGCAAAAGGTTTTTGTTAAACTAGTGTATATGT ATAAGAATTGCGAAGCGATCCAGGCAAGTCACTCGATTCGCAAGTTGCAA GCAAAATATTTATAGGGTTACACACTAGAAATTGCAAGTTAAAATAGATT CATAATCAATTCGTAAATGTAAACCCTGCGAAACCCCGACAACTGCTCAG GTTCAGGAAGACCGAGCCTCTTTAGAGATACACTCAAACACTTCAGGTGT ACAAACTTACGACGTTTACTTCTACGAATTTGAGGAAAATGATATGGTTT TTTCATGAATCGTTGTGAAAAGTTCAATAATCATTTGTCCGCCCTGAGCC TTGCGAGTATTTTTATTTCTTTCGTCCTGGGAGGGAAAATACCTCTCTAG CCTCGTCAAAAGGTCTTCCTTGCAAAGAGCCCAGAGAATCAAAAAAAGTT AAACAAATTAAACATCGCTCGGTTTATTGAGACAGAGATGTGAAATACAG AGGATTTCAAGACTAAAATTTAATACAAATAAGTTGTCTTATGTAGTTTC AAAATTCAATAACCATATTAATTAGAAATATTGTATCATTACATTGCATC GTAAATTCTAAAAAATTTAACAAAGTTCTAAAATTATAACTAAACTACTA GCGCTGTAAAATCCTGAGATAAAAATAAAGAAAAACCAGATAAAAAAAAA CTATTCTTCAACGATTCTACTAAGTAAAACCTCTAAATTTTACTGGCTGT GATTTTTTTCAAAGTTGGGAAACTCTTAGCTTAAGTTTGCTGTGGAGGCA AGTACTTGACAGTCTTTTACCCTCTTACTCAAGTTGTTGACAAACAGGAG CAAACTCTTCACATAAAAAGTAAAAAATCTGTGACTTTTTTCTCGGCTTC AGCACAGAAATTTAAAACAGTTAAAATGCATCCATAAACATAATGTCATG TTTTGTCGTTGTATTTCGACATTTTACAAGTCATTACCATTAATTACCAT TACCAACAATAAAATCTTTTAAAATACAATCACATGTCAATGTTCTATTT CTCTGATCACCAATGCGTATTCATAAACAACAAACAACAACCAAAGATCC CACATCATTGAGGGTCAGTCAAGCCAAAATTTCATAAACAACGACAAACA AACATTTCTCCTTCTACTGAATAAGGGAGGAATAAATTCTTCCAGGTTAG CCATACCCAAAAGCGCAAAATATTTTTGTTCCCATCAAATCAAAATAGAT AGTCCAGCACTTCAACATACTACCAAGATTCAATCTAAACCAAAAGCCAA AAGGAATGGCTTTCCCACCATATGTATAGAGTTCATTTCTTCAGCTTAGA TCCTCTTCTTGCAATGTCCATGAAAGAATAAAAGTTCCATCTTCTTTCTT CTCATTCCGCAAGTTCAGCTGCTTCCTTCGTTTCTTTTCATCAAGCACCA TCTCTTTTCAAAACACCAATTTTTCTTTTCAAAACAATGTTGTTTTTAGT CAACATTCGAATTTGGAAAAGTTTGAAAGCCATTCGAAAGTCTTTGCTCG AGTCAATGCAATGACTTCTTGAAAAAAGAGCGCCATTGGAACGCTTCTTG AACGCTTCCAGTCCGCGCTGATTTTCCGACCTTTTCTTTAGATTTCCTAA TTTAAACCTTAAGGAGATAAAAACAAGGCTTATCTAGTACCGGTAACCCC GTGTATTATCTCCGTAGCTTTTAAGAATTGGTATATCTAAACGCACGAGG CGACACTTTTTGAAAAAAACGAATTTAACCATCCGTAATTCCAGGTCTCT CCGCCGCGATTCTAGGTTTGATCTAAGGAAGGGCGGACGGCTTTCTCAAT CATTTCTGCGTTTGAAAGATTGGATATATATAGTAATTTTTCATTTGCGC TCCCCAGCGTAGGTGAGATTTAAAGGTACATATACACGATAGCAAAACTG CTTCGCTCATGTATATTCGCTTCGCAATAAGCATAGTTTTAAAATATCAA TAATTTCCAACCTGAATGTGTGTATGTTTAAAAACTAGAATGGATTTAGA AATATGTACTATATAACCAAAACTACCTTCATTATTATCTTAATAGGTCT ACCTGATTGATTTTGGTCTAGCCAAGAAATACAGAGAGAATCACACCAAA CAACACATCCCATACAGGGAGGACAAGAATCTGACAGGAACAGCGCGCTA TGCCAGTATAAATGCACATCTGGGAATAGAACAAGCGTAAGTTATAACTG TTATTGAAAGTTGGCCCAGAAGGGTACAGTTGCAGTGTACTGACCCATAG CTAGGTGGTTGTGTCTAATTTTGAATCTTTAAAAATGTTAGTACTTAGTA TTAGATTTCGGGGTGGGGACGGGTATATCTCTCATTTGAAGCTAGTACCA TGTACTTAATTGGTTTTTTTGGTGGGTAAAATGGGTAATGATTTCCCAAT TTCGGCAAATCAGAACGGAATTTTTTTTGAAAGAAATTTCTGAAAATAAT CAGATTTCATTAAACAGGAAAATATTTTTTCATTTTCTGATTACGAAAAA AAAAATTATTGAAGAAAACCCAGGAAAACCTGTCAGCTTTCCCACATTTG GTAAGGTGAAATTGTAAATAGGGAGGGGGGTCCCTTTTTTCCTCAACAAA AGGTAGTACCATATACTAAACTAGAAGTTGATATGTAATTCCTTTAGGCG GAGAGACGATATGGAGTCCCTTGGATATGTATTAATGTATTTCAACCGAT CAAGTCTTCCTTGGCAAGGTCTTAGGGTAAGTTTTCGTTTTTGAAATTTC GGATTTGGATCGATTCTATTCCTGAAGCCAAAGAGTAAAAGCGTTCGATG CATATTATGTGATTTATTTTCTCGAATTGTAGTATTCGATGGCTTGAGGT GTAACAAACACTTTTCTCCCTCTTATGGACTTCAGAAGAAACTGGAAGAA ATTGTTGTATTTTGGGTGCAAACTATAATTATGGTGCGAACTTTATTATG TTTCATAAAAAAGCCTCAAACTAAATATTCTATAAATTCTCTATTTTAAA ATGTCATTAGGCTGCAACGAAAAAGCAAAAGTACGAGAAAATTAGCGAAA AGAAAATGTCGACACCTATTGAAGCTTTATGCAAGGTAAGATAAATCTTT GTTTATTGGGTAAAATATCCAGTGGACCTGTGCTTGGCTATGTCTGTCAG CTCGAGGTTTAGAAGGGTTTAACTAGTGTCTCCAGGGGACCTTGAAAAGT TTATAAACCTTGAACACTTTGTATTTTCTGAAAACCTTGAGTATGATTTT CATAGCAGTTACGTTAATCGAATGTTCATAAGATTTGGGACTGTTTTTAT TTGCAAATATTTTTCGCTCGCAGTCGATCAAGGTTTTGTAAGTTTGAGTT TTTGAAAACCTCGAAAACCTTGGAGCCAAAGAAATGAATTCCGTAGACAC AAATAAAGTCGCCAGCTTTAAAAACTTGGCTGTAATTAATCGTTTTCCAG AAGATTGAGTTCAAGAACTTGGTTTCTTTTTTTATGACTAGGGCTTCCCG GCCGAGTTTGCCATGTATTTGAATTATTGTCGTGGTTTACGATTCGAAGA AATGCCCGACTACATGTACCTCCGACAACTTTTCCGTATCCTTTTCCGAA CATTAAACCACCAATATGATTACGTCTTTGATTGGAGTATGCTGAAACAG AAAGCTGCTGCCAACACTATGCAATTCAACTCTACCGCTCCCAACGTTTC AATGGCAAAAGGGCCAGAGGAAAGAATGAAGAGGAAAGGTACAAAGGGTC ATTGACTAGACGCAGCCAATAACAAACGGTAAGCTTTAACAATTTATTCC ACCTTGCTTGGGCTACTTTACATTGTATTATATTATATGTAAGACGTTTA AAAACTTAATCTTAAAAATTTTCAGAAAGTCACCTCGCAAGAGAAAGTCA ACTTTACGTTATAGCCTATACTAGACGTAACCCGCGTTTTTTTCTACGTA ATTAACGTCTGGTCCACTCTGCGACTTTTTCGAATGTTTGGAGCCCAGGT TCTCGAGCTCCAAACATTCGATTTTTTGACGTCACTTTTAACTTCCGAAG CTCCTGCAGTAGCGAAAAAATCGAATTTGCGTCAAAGCACTTGAAGGGCT TCTATTTTTCAAAAATCGTCAAAGTGGAACTCACTAAGAAACTGAATGAA AAATCCCGGTTTTTGGTAAGGGGCTCGCTAATTCTACGTTTGCCCTCAAC ATCAGTCGACACTTATAAGTTTCTAAGATAAAAGTACTGATTGGAAGAAA AAAAACGTTCTCAAACATAACTTCGATGTGTTCGATGCACTTGGCTGTCT TTTGCAAGGTGACTTTACCATTATAAGTTAAAACTTGTTGTGGTTTTCCA GAATTACCCCGAAATTGGAAAGCCTCGCAAAGAAATGTTGATGGAACATT ACCTGCTGTTAGCGTCTGGATTGGTTGAAACATTTGATAACCTTTGTTTT TATAAAATTTTCAATCAATAGACCTTTTCATAAACTACGTCACGAAAATC ACTTGCCTCGTTTTGAAATTATTGCCATGGTGATTGACTACCAGCGGATT TTATTAAAACTACTTTCTATTCATAAAAAATCATTTAATGTCTCAAGGGA TATGATCCCCATGGAAATTGTTTGAATGCGAGGCATGTGATGTTTTGTCT ATTGGTTGAAACATTTGATAACCTTTGTTTTTATGCAAACTTTCAATCGA TTAGTATTTTATTCTTTCGAAATAATTTTTTTTCCCGCAAACAACTGCAA ACAAGAGCATTAATTTAGTATTTTTTTCTTGTTTAGAACAAAGCCAGATG ATAAAGATGTCTGAATTTAAAACCACGTTGGATCAAAGAAACAATTAAAA CGAAGTATTTTTTTCATAAAAATACGGTTATTTGAATGGATGGAAATTCC TGAAGAATTATTTTTATTGGCTCATTTGTTTTTGGTTGTTATGTGGTGGA GTTTTGATAGAGAAGACGGAGAAATTTTAGTTAGAAGTTCGGCCAGAGTG GCTTCATGATTTGTGATCGTGACAGAAGTATAAAAAAATTTGGAAAAATA CGTAATTGTGTGTTTTGCCATGACATCTATTGGAGAAATTATAAACCCAT GTTTTCATTTTCTTACTTGATAAAAAAATTAATTTTAATTTGCTGCTAAC GTTGTTGGAGAAACAGATGTTCGAAAAAATCGCATTATATCCAAGTTTTC ATCTCTTTTTTGGTTTGATCATAGACCGAGATTGATGTTGGATGATAATA CAGAAAAGTATGGATTAAATATGGGTTGATGACTCAAAATGTATTTAAAT ATGTGTTAAAATATTCAAAAATATGAAATTTTCAAAATATGTATCTTTTC TCATTAAAAACAGTCAGGTGTAAGACGCTGCCGACTGAAAAAAAAAAGGA GTTAAGTAATTGCCAAAAAGCTTTTCTTCGGGTAAAAATTAAGTATCCCT TTTTCCAGATTTACTCTACTTTCTTAATTCGTTGAATTGAATGGATACCA AAAGTGTATTAATGTTGATATCACGGTTACCATTCTCCATCCTTCCTTCC TTCCTCCCTCGACTTTCTGAGTAAACAATATGGTTCAGAGTGCTTATACT TTTAAGATTTTTTATAACATCAAATTTTTTAATCTTTTAAGTGTTCACTC ACCATTTTTAACAAATAAAATATAGTAATTTTATTTTAAAGTTTAGTTCT ACTTCAGAAAATTTAAAGGAAACCATAAATGACGAGAGTCACAACATATC CTTTTTTTGTTATTACCAATTTATATTATCGTAATTTATGAGAGTTTTTT TTTTGGAATGAAATATCTCTTTACTGACCTTATTTGTAAAAAAACTGTTC CCTATGTTAGATTGTATAAGTTGACCAATATACTTTTTTTATAAAAAAGG AATAAGAATTGTTGTTGTTTTTATACGTGTCGAAACCATTGAAAAAT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:1149815..1162211-

>MSTRG.11220.1.p1 ID=MSTRG.11220.1.p1|Name=MSTRG.11220.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=8088bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:1149815..1162211- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGCTTCCCGGCCGAGTTTGCCATGTATTTGAATTATTGTCGTGGTTTACG
ATTCGAAGAAATGCCCGACTACATGTACCTCCGACAACTTTTCCGTATCC
TTTTCCGAACATTAAACCACCAATATGATTACGTCTTTGATTGGAGTATG
CTGAAACAGAAAGCTGCTGCCAACACTATGCAATTCAACTCTACCGCTCC
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CAAAGGGTCATTGAGCTGCAACGAAAAAGCAAAAGTACGAGAAAATTAGC
GAAAAGAAAATGTCGACACCTATTGAAGCTTTATGCAAGGCGGAGAGACG
ATATGGAGTCCCTTGGATATGTATTAATGTATTTCAACCGATCAAGTCTT
CCTTGGCAAGGTCTTAGGGTCTACCTGATTGATTTTGGTCTAGCCAAGAA
ATACAGAGAGAATCACACCAAACAACACATCCCATACAGGGAGGACAAGA
ATCTGACAGGAACAGCGCGCTATGCCAGTATAAATGCACATCTGGGAATA
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TTACTGGGGCCAAGTTTGGAAGATCTTTTCAACTTCTGCTCAAGGAGGTT
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TTGAATCAACACGAGCCAGACATCCACAATTACTTTATGAATCTAAAGTA
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CAAAATTGGAAGTGGATCTTTTGGTGACATTTATCTTGCACTTAATCTCA
CCAATGGCGAGGGCTTCCCGGCCGAGTTTGCCATGTATTTGAATTATTGT
CGTGGTTTACGATTCGAAGAAATGCCCGACTACATGTACCTCCGACAACT
TTTCCGTATCCTTTTCCGAACATTAAACCACCAATATGATTACGTCTTTG
ATTGGAGTATGCTGAAACAGAAAGCTGCTGCCAACACTATGCAATTCAAC
TCTACCGCTCCCAACGTTTCAATGGCAAAAGGGCCAGAGGAAAGAATGAA
GAGGAAAGGTACAAAGGGTCATTGAGCTGCAACGAAAAAGCAAAAGTACG
AGAAAATTAGCGAAAAGAAAATGTCGACACCTATTGAAGCTTTATGCAAG
GCGGAGAGACGATATGGAGTCCCTTGGATATGTATTAATGTATTTCAACC
GATCAAGTCTTCCTTGGCAAGGTCTTAGGGTCTACCTGATTGATTTTGGT
CTAGCCAAGAAATACAGAGAGAATCACACCAAACAACACATCCCATACAG
GGAGGACAAGAATCTGACAGGAACAGCGCGCTATGCCAGTATAAATGCAC
ATCTGGGAATAGAACAAGCATGATTGGTCGGATAGAATACGTACAGAATA
AGAATTTCATACACAGAGATATAAAGCCAGACAATTTCCTGATGGGCATT
GGAAGGCACTGTAACAAAGTGGTTTGGACAAGAAAAAGATTACAATGTCC
TAGTGCTTGATTTACTGGGGCCAAGTTTGGAAGATCTTTTCAACTTCTGC
TCAAGGAGGTTTACTATGAAGACAGTTCTCATGTTAGCAGATCAGGAGGT
TGCTGTAAAACTTGAATCAACACGAGCCAGACATCCACAATTACTTTATG
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AGATGGCAGCTTCCTCTTGTTCCAAGGAATTTGTTGTTGGTGGCAGATAT
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TGAATTATTGTCGTGGTTTACGATTCGAAGAAATGCCCGACTACATGTAC
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TTACGTCTTTGATTGGAGTATGCTGAAACAGAAAGCTGCTGCCAACACTA
TGCAATTCAACTCTACCGCTCCCAACGTTTCAATGGCAAAAGGGCCAGAG
GAAAGAATGAAGAGGAAAGGTACAAAGGGTCATTGAGCTGCAACGAAAAA
GCAAAAGTACGAGAAAATTAGCGAAAAGAAAATGTCGACACCTATTGAAG
CTTTATGCAAGGCGGAGAGACGATATGGAGTCCCTTGGATATGTATTAAT
GTATTTCAACCGATCAAGTCTTCCTTGGCAAGGTCTTAGGGTCTACCTGA
TTGATTTTGGTCTAGCCAAGAAATACAGAGAGAATCACACCAAACAACAC
ATCCCATACAGGGAGGACAAGAATCTGACAGGAACAGCGCGCTATGCCAG
TATAAATGCACATCTGGGAATAGAACAAGCATGATTGGTCGGATAGAATA
CGTACAGAATAAGAATTTCATACACAGAGATATAAAGCCAGACAATTTCC
TGATGGGCATTGGAAGGCACTGTAACAAAGTGGTTTGGACAAGAAAAAGA
TTACAATGTCCTAGTGCTTGATTTACTGGGGCCAAGTTTGGAAGATCTTT
TCAACTTCTGCTCAAGGAGGTTTACTATGAAGACAGTTCTCATGTTAGCA
GATCAGGAGGTTGCTGTAAAACTTGAATCAACACGAGCCAGACATCCACA
ATTACTTTATGAATCTAAAGTATATCGTCTATTACAAGGAGGTGTTGGTA
TACCCCATGTCAGATGGCAGCTTCCTCTTGTTCCAAGGAATTTGTTGTTG
GTGGCAGATATAAATTGATCCGCAAAATTGGAAGTGGATCTTTTGGTGAC
ATTTATCTTGCACTTAATCTCACCAATGGCGAGGGCTTCCCGGCCGAGTT
TGCCATGTATTTGAATTATTGTCGTGGTTTACGATTCGAAGAAATGCCCG
ACTACATGTACCTCCGACAACTTTTCCGTATCCTTTTCCGAACATTAAAC
CACCAATATGATTACGTCTTTGATTGGAGTATGCTGAAACAGAAAGCTGC
TGCCAACACTATGCAATTCAACTCTACCGCTCCCAACGTTTCAATGGCAA
AAGGGCCAGAGGAAAGAATGAAGAGGAAAGGTACAAAGGGTCATTGAGCT
GCAACGAAAAAGCAAAAGTACGAGAAAATTAGCGAAAAGAAAATGTCGAC
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TATGTATTAATGTATTTCAACCGATCAAGTCTTCCTTGGCAAGGTCTTAG
GGTCTACCTGATTGATTTTGGTCTAGCCAAGAAATACAGAGAGAATCACA
CCAAACAACACATCCCATACAGGGAGGACAAGAATCTGACAGGAACAGCG
CGCTATGCCAGTATAAATGCACATCTGGGAATAGAACAAGCATGATTGGT
CGGATAGAATACGTACAGAATAAGAATTTCATACACAGAGATATAAAGCC
AGACAATTTCCTGATGGGCATTGGAAGGCACTGTAACAAAGTGGTTTGGA
CAAGAAAAAGATTACAATGTCCTAGTGCTTGATTTACTGGGGCCAAGTTT
GGAAGATCTTTTCAACTTCTGCTCAAGGAGGTTTACTATGAAGACAGTTC
TCATGTTAGCAGATCAGGAGGTTGCTGTAAAACTTGAATCAACACGAGCC
AGACATCCACAATTACTTTATGAATCTAAAGTATATCGTCTATTACAAGG
AGGTGTTGGTATACCCCATGTCAGATGGCAGCTTCCTCTTGTTCCAAGGA
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CTTTTGGTGACATTTATCTTGCACTTAATCTCACCAATGGCGAGGGCTTC
CCGGCCGAGTTTGCCATGTATTTGAATTATTGTCGTGGTTTACGATTCGA
AGAAATGCCCGACTACATGTACCTCCGACAACTTTTCCGTATCCTTTTCC
GAACATTAAACCACCAATATGATTACGTCTTTGATTGGAGTATGCTGAAA
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TTCAATGGCAAAAGGGCCAGAGGAAAGAATGAAGAGGAAAGGTACAAAGG
GTCATTGAGCTGCAACGAAAAAGCAAAAGTACGAGAAAATTAGCGAAAAG
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TGTTCCAAGGAATTTGTTGTTGGTGGCAGATATAAATTGATCCGCAAAAT
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GCGAGGGCTTCCCGGCCGAGTTTGCCATGTATTTGAATTATTGTCGTGGT
TTACGATTCGAAGAAATGCCCGACTACATGTACCTCCGACAACTTTTCCG
TATCCTTTTCCGAACATTAAACCACCAATATGATTACGTCTTTGATTGGA
GTATGCTGAAACAGAAAGCTGCTGCCAACACTATGCAATTCAACTCTACC
GCTCCCAACGTTTCAATGGCAAAAGGGCCAGAGGAAAGAATGAAGAGGAA
AGGTACAAAGGGTCATTGAGCTGCAACGAAAAAGCAAAAGTACGAGAAAA
TTAGCGAAAAGAAAATGTCGACACCTATTGAAGCTTTATGCAAGGCGGAG
AGACGATATGGAGTCCCTTGGATATGTATTAATGTATTTCAACCGATCAA
GTCTTCCTTGGCAAGGTCTTAGGGTCTACCTGATTGATTTTGGTCTAGCC
AAGAAATACAGAGAGAATCACACCAAACAACACATCCCATACAGGGAGGA
CAAGAATCTGACAGGAACAGCGCGCTATGCCAGTATAAATGCACATCTGG
GAATAGAACAAGCATGATTGGTCGGATAGAATACGTACAGAATAAGAATT
TCATACACAGAGATATAAAGCCAGACAATTTCCTGATGGGCATTGGAAGG
CACTGTAACAAAGTGGTTTGGACAAGAAAAAGATTACAATGTCCTAGTGC
TTGATTTACTGGGGCCAAGTTTGGAAGATCTTTTCAACTTCTGCTCAAGG
AGGTTTACTATGAAGACAGTTCTCATGTTAGCAGATCAGGAGGTTGCTGT
AAAACTTGAATCAACACGAGCCAGACATCCACAATTACTTTATGAATCTA
AAGTATATCGTCTATTACAAGGAGGTGTTGGTATACCCCATGTCAGATGG
CAGCTTCCTCTTGTTCCAAGGAATTTGTTGTTGGTGGCAGATATAAATTG
ATCCGCAAAATTGGAAGTGGATCTTTTGGTGACATTTATCTTGCACTTAA
TCTCACCAATGGCGAGGGCTTCCCGGCCGAGTTTGCCATGTATTTGAATT
ATTGTCGTGGTTTACGATTCGAAGAAATGCCCGACTACATGTACCTCCGA
CAACTTTTCCGTATCCTTTTCCGAACATTAAACCACCAATATGATTACGT
CTTTGATTGGAGTATGCTGAAACAGAAAGCTGCTGCCAACACTATGCAAT
TCAACTCTACCGCTCCCAACGTTTCAATGGCAAAAGGGCCAGAGGAAAGA
ATGAAGAGGAAAGGTACAAAGGGTCATTGAGCTGCAACGAAAAAGCAAAA
GTACGAGAAAATTAGCGAAAAGAAAATGTCGACACCTATTGAAGCTTTAT
GCAAGGCGGAGAGACGATATGGAGTCCCTTGGATATGTATTAATGTATTT
CAACCGATCAAGTCTTCCTTGGCAAGGTCTTAGGGTCTACCTGATTGATT
TTGGTCTAGCCAAGAAATACAGAGAGAATCACACCAAACAACACATCCCA
TACAGGGAGGACAAGAATCTGACAGGAACAGCGCGCTATGCCAGTATAAA
TGCACATCTGGGAATAGAACAAGCATGATTGGTCGGATAGAATACGTACA
GAATAAGAATTTCATACACAGAGATATAAAGCCAGACAATTTCCTGATGG
GCATTGGAAGGCACTGTAACAAAGTGGTTTGGACAAGAAAAAGATTACAA
TGTCCTAGTGCTTGATTTACTGGGGCCAAGTTTGGAAGATCTTTTCAACT
TCTGCTCAAGGAGGTTTACTATGAAGACAGTTCTCATGTTAGCAGATCAG
GAGGTTGCTGTAAAACTTGAATCAACACGAGCCAGACATCCACAATTACT
TTATGAATCTAAAGTATATCGTCTATTACAAGGAGGTGTTGGTATACCCC
ATGTCAGATGGCAGCTTCCTCTTGTTCCAAGGAATTTGTTGTTGGTGGCA
GATATAAATTGATCCGCAAAATTGGAAGTGGATCTTTTGGTGACATTTAT
CTTGCACTTAATCTCACCAATGGCGAGGGCTTCCCGGCCGAGTTTGCCAT
GTATTTGAATTATTGTCGTGGTTTACGATTCGAAGAAATGCCCGACTACA
TGTACCTCCGACAACTTTTCCGTATCCTTTTCCGAACATTAAACCACCAA
TATGATTACGTCTTTGATTGGAGTATGCTGAAACAGAAAGCTGCTGCCAA
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CAGAGGAAAGAATGAAGAGGAAAGGTACAAAGGGTCATTGAGCTGCAACG
AAAAAGCAAAAGTACGAGAAAATTAGCGAAAAGAAAATGTCGACACCTAT
TGAAGCTTTATGCAAGGCGGAGAGACGATATGGAGTCCCTTGGATATGTA
TTAATGTATTTCAACCGATCAAGTCTTCCTTGGCAAGGTCTTAGGGTCTA
CCTGATTGATTTTGGTCTAGCCAAGAAATACAGAGAGAATCACACCAAAC
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GCCAGTATAAATGCACATCTGGGAATAGAACAAGCATGATTGGTCGGATA
GAATACGTACAGAATAAGAATTTCATACACAGAGATATAAAGCCAGACAA
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TGTTGGTGGCAGATATAAATTGATCCGCAAAATTGGAAGTGGATCTTTTG
GTGACATTTATCTTGCACTTAATCTCACCAATGGCGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11220MSTRG.11220Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11220.1.p1.exon10MSTRG.11220.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11220.1.p1.exon9MSTRG.11220.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11220.1.p1.exon8MSTRG.11220.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11220.1.p1.exon7MSTRG.11220.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11220.1.p1.exon6MSTRG.11220.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11220.1.p1.exon5MSTRG.11220.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11220.1.p1.exon4MSTRG.11220.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11220.1.p1.exon3MSTRG.11220.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11220.1.p1.exon2MSTRG.11220.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11220.1.p1.exon1MSTRG.11220.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11220.1.p1MSTRG.11220.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000080_pilongenomesc0000080_pilon:1149815..1162211 -