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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000080_pilon:976369..981634+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11204.3.p1 ID=MSTRG.11204.3.p1|Name=MSTRG.11204.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5266bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:976369..981634+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGTTCAAAGAATCAAGCTCAAATGGATATCAATTTATTACCAGATGAGAT
ACTAGAAATAATCATTGCGTTCTCGGAAAAGGAAGATGCAAAAGCTTTAT
CACGAACATCAAAAAGAATGTATAATCTTACTATTGAACGAATTTGGTCA
AAACCAAGATTTTATGGGAGACGAGATCATTCCTTCTTGACAAAAATAAC
GAAATTTCCGATTAAAGAATTGCATACAAATGAGTTTAATTGTCTTTGGT
CTAATATTTGCGATATCGTTTCTGGGCTTGAGTTAATACATATTGataat
aacaacaataatgCAACCTTTGAAGACGGATTTGACGATATTTGTGAAAT
CGCAAAACCACCAATTGTTCTGCACACAAATGCTCTTAATATGAAATACA
GAGACgactttgatttgtttttgaacGAAATTCTCGGCGGTGTTTGTTCG
ATACGAAAAGTGATAATCAATCACAAGTTTAGTAGCGATGAAAGAAGAAA
CTGTGCTTGGTCACCTAAACAACTTGAAATGGTCAGTGAAAAAGTTTACA
TTGAGGAAATTTTGTTGAGTTCTTTATCGATCACTGATTTTGATGAGCTT
GTTAAAGTTTTGTGTAAACTTAAAGGAACACGTGTTAACATTTCCAAAAC
AAGGTTCAATAACCAATATCTTTTAACTGTTGAAGATTTGGATAAACTTG
CAACGAATAacataaaagttttcaaaattgattgTGTTGCCCTTGAATAT
GGTTTGTCGAGTGATGGCCTTACAAAGTTTGCTCCtgtactttcaaaatt
tcaatctttGGAAGATTTTAACATTCGTCATGCTTACTGCAAAGATCCAA
TACCTATTCAGTTATTTACCGATTTACCGATAATTACGCTTTCTACAGCA
CAGATTCGTTGGGAAGCTGGTAAGATTGCAGAGATTGTTAAAATATTATC
TGAAATCAAAACCCTGACCAATTTAGGCTTGGAGGTAAATAATCATTCAG
ATTATAAGCTTTCCCTTGCGGATTTTGAACGTTTTAAAATTTTACCAGTA
GTAATGTTTTTAGACTTGGAAGCTTTAGATTTGACAAAGGAAAACGTTCC
AGAATTTCGTAAAATCATGCTTGagatgaaaattgaagataTTTACTGGT
CTTCTACGGGTGAATATTcgaattttgatatttctctAAAATCACATGGA
CCAGATGATTACAAAACCATTTAAATCATTTAAAGATCAGGATACAGTAT
GCCATGCTGATAAGGACGGTATGCATAAACCTGCCACCCAAATCTTccga
gtgaatatagttggacagaagtttttatttctttaatttttattttattt
TACTGATGATTGTTGTCTGAGCACCATGTAACTCTGAGTTTGAAACATAG
ATATTGTGTCAACTCTTTATTAAATTTCTTTAAATATAGATAGCATGGAC
GAAAGCAGCCGGTGAGGCGACTTATTTCTCTCGATGTGTTCTTAGAGTAT
GTTTCAGTCAGATATTTTGATCTGTTCTGATTAAAGATTTGTAAATTATT
CAGAAATGATTATGTTTTCTAACGCGAGACACGGGTATAATCAAGGTTAT
TGAGCGCGATCTTGTTGCCTAGCAACCCAACTAAGTTTCAAAACACATCT
TTTGTGGAAAATAACGAATGTCTTGCAAGTACTCTCTGGTACCTAATAGC
TGGGGGGTTTGAAATAAGCGAAGGGTTTGGAAAATATCTCAACACTTGAT
AAGCGGGGAGGAGGGGGTGGCAATAAGAATGTCGTAGGTGGAAAATTTTC
AAAAAGGAGGCTAATATATGGATTGCCATAGCTGCTATAAGTGCCCTTTA
CGCAAGACCTCTTTTTTCAATTTCCAATGGAAGTTTGAAAGGGACTTTGC
TAAAAAATATTTTTGAACAAAACTTAAAAAGTCAAGTAACTACTTTTCAT
ATTATTACTGGTATCAAAGAAGTGCTAATaatgcttattttaaCCGATAT
GCTTAATTTGGCagtTaaaagggaaaaaatcGTTAAAATGTAATTTCTCA
ATAGTGTCATCCGTGAAATTAAGTCcccatgaaatgataaaatttcgcgg
ataagtTCAACCGCGAAGTtcaatccccgcgaaaatttatcctttTAAAG
TAACAGtctttcaaggttttcaagtcCTAACATCATAAATCTCGGGATAT
TCTTTGGATCTTAAAAATTCTAAACCTTTCCCTCATAAACTTGATTTTAT
ATGAAAACAATTTGAAAGGTATTAGAAAGACATCTGGAAAACTTTATTAG
CAAAACACTATCCTGAAGCAATTGAAAAGCTATCCAGGGAGATGGTTTAT
CGATGGTTTAGCTCAGATACCTTTCAGATTAcaaaaaaaccatttcaaag
CAATCGACTCAGATGGCTTTTGGAATATCAAGTTTGGATGCTTTATGGAT
GTGTTTTGTCTTTGAGATGTTTTTAGAAAAGCCATTCAGACCCCATCTAA
CTTTGATACTTTGATTCGAACATTCGAAATTAGAAtctctaaaaaacaaa
aacaaaacaaagtccAGTTCCAGAGAGAAGTCACAAATGCGAGGAGCTGC
TCTTAGAGAAAATAGCGAAAATAGCTGCATAAGAACAttagtttgaaaat
tatatttctttcaatgaaaaaagagaagaCAGCACTTAGTGTCACTAAGA
ACCACCAACCGCAAACAAAGTGTAAGTTACTCTAAATTTGTTTCTGAAAA
GACCTTCGGTTTTACTTTAATTCTATTTCTATTGAACACTGAAGGGAGTC
AACACTGAAAACTCAAAAGACGGGACGGTAGCCTGCTTTCAAAAatccat
attattattattatcgtattatttaACTACTGCTGAAAAGATTTGAGAAC
TCAGACCAACCTAGGCAcagatttttagaatattttttgaaaaatcatct
CATGTTGGAAACTATAGAATACTTCTAGAATTACTAGAACACTTACAATT
TATTTTTTGGTTTGCTGTATGATTTGGTGCATCTATATATCTATAGTCTA
ATATTGCGAAAAAGTATGCACTTTTTATTGAAGTTTTGTCCTGGCTGACT
GACTGACTAACCCAAACTTGTTGACTTCAAAGTTTGATGACTGTCTGCCA
TCTTTAACATGTGTCCAAAAATAAAGCATCATGGGATTAATTTGTATGGC
TTTTCgattgctttataaactttgTTATAAAGCAATTTGAAAGATATCCG
GGATAGCTTGTGGAtaccttttttgagaaacaaACATAAGGCATCAATAC
ACCATCCAGGATATTTTCCAAAAGCCATCCAATTATTGCTTTGAGATTGC
TTTCGGGATTGCTTTGAGATTGCATTCCATTTTTCGTCAGTAACGCTATC
TGAAAGCTATCAAAGAAAGCAATCTAAAAGCCATAATTGAATTGCTTTCA
AATAATCGCTGGATAGTTTGTGGATGTGGTTTTTACTCCTTCTCTAAATT
GTGTTCTGACACTTTTGAAACTGTTTACAGATGGCATCGTTTTTAAGCTA
TCTCAAAGGTATCTCTGCTCACCAGGGTTCTCTGTTTTCTTAACTAGATA
AACAACAAAAGAATTACTTAAACAAAAGACCAATTGTGTTCAAAGAATCA
AGCTCAAATGGATATCAATTTATTACCAGATGAGATACTAGAAATAATCA
TTGCGTTCTCGGAAAAGGAAGATGCAAAAGCTTTATCACGAACATCAAAA
AGAATGTATAATCTTACTATTGAACGAATTTGGTCAAAACCAAGATTTTA
CGGGAGACGAGATCATTCCTTCTTGACAAAAATAACGAAATTTCCGATTA
AAGAATTGCATACAAATGAGTTTAATTGTCTTTGGTCTAATATTTGTGAT
ATCATTTCTGGGCTTGACTTATTACATATAGATAATGACGACGATGATGA
AACTTTTGAAGACAGATTAGACGATATTTGTGAAATTGCAAAACCACCAA
TTGTTCTGCACACAAATGCCCTTAATATGAAATACAGAGACgactttgat
ttgtttttgaacGAAATTCTCGGTGGTGCTTGTTCGATACGAAAGTTGAT
AATCAATCACAAGTTTAGTAGCGATGAAAGAAGAAACTGTGCTTGGTCAC
CTAAACAACTTGAAATGGTCagtgaaaaagttttcattgaGGAAATTTTG
TTGAGTTGTTTATCGATCACCGATTTTGATGAGcttgttaaaattttgtg
tAAACTTAAAGGAACACGTGTCAATATTTTGAAACGTTCAATAACCAATA
TCTTTTAAATGTTGAAGATTTGGATAAACTTGCATCGAATAACATAAAAG
TTTTCAAGATTGATTGTGACGCTCTTGAATATGGTTTGTCGAGTGATGGC
CTTACAAAGTTTGTTCCCGTACTTTCAAAATTTCAATATTTGGAAGATTT
TAACATTCATCATGCTAAGTGCAAAGATCCGATTCCTCTTCAGTTATTTA
GTGATTTACCGATAATTACGCTTTCTACAGCACAGATTCGTTGGGAAGCT
GGTAAGATTGCTGAGATTGTTAAATTATTATCTGGAATCAAAACCCTGAC
TGATTTAGACTTGGTGGAAAATAATCATTCAGATTATAAACTTTCCCTTg
cggattttgaatttttcaaaactttaccAGTTGTCATGTTTTTGGACTTG
GATGCTTTGGATTTGACAAAGGAAAACGTTCCAGAATTTCGTAAAATCAT
GCTTGAGATGAAAATTGAAGACATTTTCTGGTGTTCTACGGGTGAATATT
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AACataaatttgacacctaaaaattttcacaccttgaacATAacgacatt
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ttttatgtcaaatatatcgtttaaaccgtaatttattgaatatttgggat
aaaataagcattttagactcAAGGAACCTTTTTCTAAAGCTCTTCATAGA
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ttaggcatgatgagtgacgtcatcaaaataaaatttgtcaaaaattactA
TATATGACAAGGAtgttgtgtgccaaatttcatccaaaaaacccactaga
tcaaaagttaagtgGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:976369..981634+ >MSTRG.11204.3.p1 ID=MSTRG.11204.3.p1|Name=MSTRG.11204.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1344bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:976369..981634+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGTTCAAAGAATCAAGCTCAAATGGATATCAATTTATTACCAGATGAGAT
ACTAGAAATAATCATTGCGTTCTCGGAAAAGGAAGATGCAAAAGCTTTAT
CACGAACATCAAAAAGAATGTATAATCTTACTATTGAACGAATTTGGTCA
AAACCAAGATTTTATGGGAGACGAGATCATTCCTTCTTGACAAAAATAAC
GAAATTTCCGATTAAAGAATTGCATACAAATGAGTTTAATTGTCTTTGGT
CTAATATTTGCGATATCGTTTCTGGGCTTGAGTTAATACATATTGataat
aacaacaataatgCAACCTTTGAAGACGGATTTGACGATATTTGTGAAAT
CGCAAAACCACCAATTGTTCTGCACACAAATGCTCTTAATATGAAATACA
GAGACgactttgatttgtttttgaacGAAATTCTCGGCGGTGTTTGTTCG
ATACGAAAATTGATAATCAATCACAAGTTTAGTAGCGATGAAAGAAGAAA
CTGTGCTTGGTCACCTAAACAACTTGAAATGGTCagtgaaaaagttttca
ttgaGGAAATTTTGTTGAGTTGTTTATCGATCACCGATTTTGATGAGctt
gttaaaattttgtgtAAACTTAAAGGAACACGTGTCAATATTTTGAAACG
TTCAATAACCAATATCTTTTAATGTTCAAAGAATCAAGCTCAAATGGATA
TCAATTTATTACCAGATGAGATACTAGAAATAATCATTGCGTTCTCGGAA
AAGGAAGATGCAAAAGCTTTATCACGAACATCAAAAAGAATGTATAATCT
TACTATTGAACGAATTTGGTCAAAACCAAGATTTTATGGGAGACGAGATC
ATTCCTTCTTGACAAAAATAACGAAATTTCCGATTAAAGAATTGCATACA
AATGAGTTTAATTGTCTTTGGTCTAATATTTGCGATATCGTTTCTGGGCT
TGAGTTAATACATATTGataataacaacaataatgCAACCTTTGAAGACG
GATTTGACGATATTTGTGAAATCGCAAAACCACCAATTGTTCTGCACACA
AATGCTCTTAATATGAAATACAGAGACgactttgatttgtttttgaacGA
AATTCTCGGCGGTGTTTGTTCGATACGAAAATTGATAATCAATCACAAGT
TTAGTAGCGATGAAAGAAGAAACTGTGCTTGGTCACCTAAACAACTTGAA
ATGGTCagtgaaaaagttttcattgaGGAAATTTTGTTGAGTTGTTTATC
GATCACCGATTTTGATGAGcttgttaaaattttgtgtAAACTTAAAGGAA
CACGTGTCAATATTTTGAAACGTTCAATAACCAATATCTTTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:976369..981634 + |
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