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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000080_pilon:636912..644275+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11175.3.p1 ID=MSTRG.11175.3.p1|Name=MSTRG.11175.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7364bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:636912..644275+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTATTTGGATTCGTGAGTTttgataaaaacatgaaatatatCTCCTTTAC
CTAATTTGATAGCTTTAAAGTTATACTTCTTaacaaaataaatcagaaaC
AGACTAGATTGGAtagttgttttgaaaaatgaattccTTTATATTGGTTG
TTTTGATGACAATATGTGTACATTGCTCCATCAGCCTCAAATTCACAGCT
CAGGGTAAGATCATAACTACAcccccaacctcgttccctgcgcattatca
gcttttttatgcttactgatagcgctagatgaTACCCTGacattggctgg
ttttcgaacgcgcaagattacgtaattcaaaaacaaaacgtcagatttca
ttcgttcctgggtttgaaaccattgcattgcagtgtaactttgtaacgtc
agatttttttatgacgtattgttttgagaagttccccctctgagaggggg
aactcgcatcagccaacaccagggtattctctggcttcaatcagtaacgt
aaataaagcctgggatacacggggacgaggttgctaCACCCCCTGTTTAT
CAAATCAAGCAATGTTCCATTTATAATAAATTTGGCCTAGAATACCCGTT
TTACCAGACATATTCTAAGATCAACACaacatttttagaaattgtTGTAA
AACTGTTCGAAAAAGTAGGAGTTTTTCGATCAGAAATAGAGATTTTGAGa
gattttgagccaaaaaagtgttcccgtttcatatcagacacatatttcac
cAGGCCAGTGCCTGtctattgttatgttatgctgatataagcaagtaatg
tttttttctttctgaccaatcctgttccacacccgtgtcaatccaatgtg
aaaaagcttgtgaattaaaattgatgagtaagcaaacgatatcactctta
tttaaaagcaaaacctttaataatTCTTCAAACGAATTCTTTCTTTTAGA
TATCCAATCTTTAGGATGTTTTAAAGATAGTATGCTTCTTGAAATATCTG
CTGAAAAGTTGGGAATTGAAAATCGAGAGTTTCAAATGCACTTTAATGGA
TATTTTGATGACCAAAAATGCTCTATCGAATCTGGATCAAACATCAATGA
CTTTGATTATTATTTCCTTGCTAATTTTTACAAAGATTGTGGTATTCAAG
AATCTGTAATGGATACTAAAACTGTTTATAATCAAACTGTATGTATAACA
TTTGACAGAGATCTTAAATCACAGATTGCCTTTGATTTTGAATGTGTTTT
GAAGAAGAGATTGTAACTTCCATTAAACTAACTTTTCAGCAATTCCTGTA
TTATataataacacgcatgcgtaatttgtcgttcttttaaaccacatgta
gttactTCCCTtgataaacaaagagaaatGAATGAATCCCGAGTTTAttg
ttctacatctgcaatttgagcttttactaagctcatttgacgtcaatcga
tacttcgattatcagccggattgagaGAGAGTGATATAcaagtgaaggta
gagagtctattaTCATATTTCCTTAACACCCTGTCTGGTAGTGCTTGGGT
Tttgaacacagtccattgcggtgcaagtctgtgatcgaaaccttcacact
accaatcggtAGAaagtttcgatcacagacttggaCTGCAATGGACTGTG
CTCGAATTCCAAGCACTGCCAGGCAGgatgttagggaaatatggtgatag
actctctaccttcactcttATAAAGAGAAATTAATCGCtaagggtggtac
agtcacttttggCAGGTGTTGTGGACggcaaaatatgaaatatgtcgttc
ttttttgtcattttttatgaaatttgtcgttctttttgtctatttttagt
aatgaaGGAATTGTAAGATAGAGCCTCTCTTTTGTgcattttttagtttc
tttATGTCAATTTTATGAATATTATCATCAGATATAGAGCTATCCCATTC
AAATTTATGCTAGACTGTCTATATGCGTTCCATTCTTCGTCTCTCGAATG
AAGTGTTATATATACTAGCTAAGAAGAAAATTGGTGGTTAGATTCTTAAA
GTAGCCTGGGAGGGACTCAGATAAGCACTTAGTTTCAATGTACTTGAAAA
TTTAGACCACTTTTTTACTGTCTGATCTActtttctacttttattttgaa
GCGTTGTTTGAATGTACACCCAACGTCACTATCCTTACAGTGAGCACCAC
AGTTTAGATTTATCTGAAATCCAACCTGTGGCGATGGAATGAGAATTTTA
TCGCACATGTCTCGATATCTTCGTATCGAAGAAAAAGAGCTATCCTCATG
TTAAGCTGAGGCAAATCATATTATTACATCTATAGTTTTCTCCTATTTTT
TGAGACTTTTGAAATATCTGTGGAATGAATTTCCTCGTAAGAAAGTCACT
GAAGAAATCACTGAATTTCCTCCAAAAGAAATCTGCCCGAGTGCATAACA
TTAGTTACCCCGCAATTGACAAATCTTCAATCCTTTAACGTTAGTTTGAG
TATGTTTTCCTTGAGATGGCTCTCTTTAATCTTTTCCTCCATTTGTTGTT
TATGTGAATTGATTGGTACGGCTTCATCCAGAATCCTATATGATTGCCAT
GGCTACTTTTGTATTGGTCGATATTGCGCGTTTAGGAAAAGGATCATGAT
TTGTCAACACAGTGTATGTTATATACATCCATGTgtcccagacccgctgg
gaccccagccccattGGAGAATTTGGCAAAACGAACTTAGTCCTCTGTGG
GAAAATaacctggaatttcagccctactgggaaatttactttgatttcat
ccccattcgaaatttaatgtttacaaattgcactccaaaactatccccac
tggattttttaaccttaaaacaatagaatttctatcccaattcgactttc
aatagaaatttttatatccccactgaggaaaacagttccactggggctgt
gaaacaggggtgttgaTATTCATACACTGTTATTCTTGCGGTAGCAATGC
CAAGAAGTTCAAACTGTGGTGTAATAGTTTGTTTAACATTCAAATGAAAG
AATTTTCGCTAATAACGTAAATTCCCGAATACTTTGAGAGATGAACCATA
AGCTAGCCACGTATAAAAAGTCTGAGAAGTCTCACAAATGATATGTGTCA
TCttaggttttgttttgtttttcaaagagGCATGCAATAGCACCTACCGA
ACTCTGGTCCTTTTTGCGCGCGtttgaaaacagaaaattaAGCGAACTTT
TGGAATATTTAACTAGCCTTGTTAACGTCTCGACGTGTTTAGCAGTCAGT
AAGTGAGAAGGTGCGAGCACGTCGGAAACTCTGCACCCCTGTCATCAAGA
GAGACACTCTGGTTTAAAAGTTTACTGAAATGTACCGAACCTATCCGAAA
CTATCATAATCATAAAATAAAACTCAAGATAAAACCGCAAATAGTTTTGA
ACGTGAGATCATATATGAACAcgtgggttaagcaaaatgttATGTAAAGG
CGTGTTTGTTTGCACCAATACAGCCATAGCCATAAAGGGATACTTTGGAT
AACTAGCTAGCACACTGgaagtttcaagaaaattgtATATAACATTATGA
AGATTAGTTTCTATCTAATCCTCCTGGTTTTTGGAACCACGTCTTGTTTT
GATTTATCAGCTGAAGGTAAAGTAGCTTTTATTCAAAATCTCTCTGACGT
TCAGAGTAAGTTTCtttcaggcccggcggaagcggagAGGCTgaggagac
ttcagcctccccactttttttgcaaatatataatttttttatttaaagtt
ttttttatttagtaatTAGCTAAGGCTAGGGTTTTATATGCAGTACTCCT
ATAAATTTGATTCAATTTTAGCCAATCTATCTAGGgcccatttttaaaaa
ttctcttCCCCGTTGTTGGTGCCAACCGGCAGCGCTCCCTAAAACACTAA
TTTTCagtctcttcactttcaaatTCGTTCGGCCGGGCCTGTCTTTATAA
GTAAatccatttgaaaaatttaagatAACTCATTTGTTACTTTTGCAACA
TTAAAATTCCCCTCGACCACTGAGGTTCCACCCCAGTAAATGAAAGCTCT
AAATTATTTTTGGCAATTGAATAACAGCATCAAAATCGAGGACAATTTCC
CCGAGAGCATTTCCTCTTAGAAAATTCCTTTCTCAGTTAAGAAACTTACT
TCCATTTAACTAATCTATTTTAGATGGAAGGCTGGTATGTGGCCCTAATA
TGATGAAGATAAGTCTCAATGTCGACAAATTCAACCAACATAATCGACCA
TATAGAGCTTACTTCGAAGGTTATGATAAACATCCAATCTGTTCTGTGAA
ACACGGAAACACTGGTGATCCATTGGAGCTGAATTCTAAATTCAATGAAT
GTGGCGTTCAATTGATACAACACCAAGGGCAGATTATCTATACTCAAATC
GTTTTGGTGATTTATGGTTATAACCCGAAATCGAGTTTGGTTTATCGTGA
AGAAGCTATTCGGTTTAAAGTGGAATGCGTTCTCCAAACGGATTTGTCAG
TTGGATTAGCTGATCCTGGATATCTTAATGTGTCGAAAGCAGAAGTAGAT
GGCCGTATGaataaattttatatgatttttttaatcccTTGATTATCTTG
AGGCTTGAGAGCTTTAAATGGGTTAACATAATTGTtcccaaaaagaaaaa
caaccctgtgtcacagactcgTTGAAAAATGTGCCCAAAATTCCCAGTGG
AAAAAATATACTCTTCGATTtaagccccactgggaaattgagaGAATCAT
CATTTGAGCTGAGAAACAATAAAATTgagattttaaaactttcaccGGGG
CtgggagacaggggtgtagaaaACTTTCGATTGAGTTACAGGGATCAAAA
TGTATTATTGGTcaatttcttatttaaaaagtcTATGACCAAGCAAAGGT
GCCTGTCCCTTTCCATTTTAACAGTCTATTTGAGACATCATATGCCTGAG
AGGGTGTGGTTTAGTTTACACtacttttaaaaacatcatcaaatactctg
aaaatatttacatcgattttcatttatagtcaAAGAAGAAATCAGAGCAG
ATGCAGAATTCGACATCAAATTGGTCAGAACCACCGACGGTTCTTTCAAC
TCTGAAGATTCATCCTCACAAATGCGATTGGGAGATCAAATGTATTTCAA
ACTTGAATTGAACACCATCCGTGATGACTTGAAAATCTCACCACAAACTT
GTTATGCAAGCAGTACGAAAGATTCAAGCGAAAGATATTTGTTGATCGAG
GATGGAGGGTAAGATACATACAAAACATTATTTCAATGCTTTCCTCTCTC
TTGGACGAATACATAAAGATTTTTATCCACGCTTcattagattttgagaa
actgtttttacgatcaataatcacttttaacaaaaggaATCTAAATAGAC
GATAGAGCAGCCAAAGTACGATCTTATTTCATCTGATAGCAGTTCACTGA
ATAAAGCCTCTGTAGTTTGTATCAATCTATAATTGACAAAATATGACCCG
CAAAGTTTGCTTTGGTGAAAGAAATGCGAAAGTTTCCGAAgggcaaatca
ctaaaataaatctcgtacacaattttataaatcaaaaataaatcataaat
aaaaaataaaccaaaagtaaatcataaatcaaaaataaatcagaaataaa
tcaataaatcaaaattaatcaaaaataaatcatgaataaatgaaaaatcg
ttcgaaaaaaaattcattttttagttttttttaattttttgacaatGATT
TTGATTATCAGTTCGTTATactataatttgaaaaaaattttccataaaat
tactcctattcataaattagagataaatcaaaaataattcaaaaataaat
cataaataaaccataaatcaaaaataaatcaaaaataaatcagaaataaa
aaataaatcagaaataaatcataacataattcaaaaataaatagaaaatc
aaaaataaataaaaaataaatcacaaatcaaaaataaatcaaaaataaat
tataaataaaaaataaatcataaatctcgccgtacaccatttttcgagtg
atttgcgCCTCGAAAGTTTCAACCACCTCTTTTTGTACGTACAATGTACT
TAACGCTAAAAGAGTGATCGTGGGCGAAATATTGAAGGGGTTAATAGGGA
TAGAAAATCTCTTACTTTTAACCTTTTCTAGtgataatttttgatattca
tgacgtaatcttttatacggaagcacacaaaaAACATCGGGCGTTCGCCA
CcagtttcattgtttaaattcaaaactggtgACAAACGCCATGTTGTTTT
TCGGGtgttccgtataaaagattacgtcatgaatatcaagaatagaaTTC
AGTTTAGTTGTCCAAAGAAGATGAAATTTCAGGTATTTTTTATGCAACAT
TTCGATCAACTATTACAGGATGTTAAATAggatttatttgatttttgacg
CGAAAAAATTAGGCAAAAAGCAACCTAAGTCCCTTCGTactatcagcttt
ttgatgaattgggcttttccagaaaaaaaaattatccccactgttgagga
tattgatttttcaaagtatcgaatcctactttattagtaaataCCCCCta
gatatccactcttaaaaataagctcaaccccctggatatcctctcttaga
agtatgcttacccctggatatcgtattttttacttgaaaagacactttac
ccttGGATATccactcccttgtagatatttaaccctcTGGGTATCCACTT
TTGAATAAAACTGGCAGGAGGgagcacggactatttctggaaaagccctt
tACCAATTGCGCTATATAATTCTCTAGCGTTCATAAGTAACGTCTGGAAC
ACAGGAGTGCGGTTTTTGAAGCATCTATCTTTATAAAAGCTGTTTTATAT
TTCAGGTGCCCAAACATGGCCGATGGAACGATCAGCATTCCCTATGAAAA
CGATCAAAAGCTATTCAAATGGGAAAATGAAGCTTTCCGATTTTTCGGCG
ATTCTGACGCCGTTTACATAACGTGTAACGTGAATGTTTGTAACAGTAAT
GACTATGGAGATGATTGCTTGAGATGTAACTCGATCAAAAGACGACGACG
CCGACGTCGTGCCGTGTTTCATTTCAACGAAGAGAAAATAAACACTAAAC
AGCAAAGAGTGATTGTATCAACTCAAGTTTACAAattaatttgatgaaaa
tttgtagttgatgatttttttttgatttttcaagtatAAAAGTTAATTGT
GTGATTATCTAAAAGATTTCTTGGTGTTCTTATCTATATGATAATAGCCG
TAAGGTAAGTGGCC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:636912..644275+ >MSTRG.11175.3.p1 ID=MSTRG.11175.3.p1|Name=MSTRG.11175.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3900bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:636912..644275+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaattccTTTATATTGGTTGTTTTGATGACAATATGTGTACATTGCTC
CATCAGCCTCAAATTCACAGCTCAGGATGGAAGGCTGGTATGTGGCCCTA
ATATGATGAAGATAAGTCTCAATGTCGACAAATTCAACCAACATAATCGA
CCATATAGAGCTTACTTCGAAGGTTATGATAAACATCCAATCTGTTCTGT
GAAACACGGAAACACTGGTGATCCATTGGAGCTGAATTCTAAATTCAATG
AATGTGGCGTTCAATTGATACAACACCAAGGGCAGATTATCTATACTCAA
ATCGTTTTGGTGATTTATGGTTATAACCCGAAATCGAGTTTGGTTTATCG
TGAAGAAGCTATTCGGTTTAAAGTGGAATGCGTTCTCCAAACGGATTTGT
CAGTTGGATTAGCTGATCCTGGATATCTTAATGTGTCGAAAGCAGAAGTA
GATGGCCtcaAAGAAGAAATCAGAGCAGATGCAGAATTCGACATCAAATT
GGTCAGAACCACCGACGGTTCTTTCAACTCTGAAGATTCATCCTCACAAA
TGCGATTGGGAGATCAAATGTATTTCAAACTTGAATTGAACACCATCCGT
GATGACTTGAAAATCTCACCACAAACTTGTTATGCAAGCAGTACGAAAGA
TTCAAGCGAAAGATATTTGTTGATCGAGGATGGAGGGTGCCCAAACATGG
CCGATGGAACGATCAGCATTCCCTATGAAAACGATCAAAAGCTATTCAAA
TGGGAAAATGAAGCTTTCCGATTTTTCGGCGATTCTGACGCCGTTTACAT
AACGTGTAACGTGAATGTTTGTAACAGTAATGACTATGGAGATGATTGCT
TGAGATGTAACTCGATCAAAAGACGACGACGCCGACGTCGTGCCGTGTTT
CATTTCAACGAAGAGAAAATAAACACTAAACAGCAAAGAGTGATTGTATC
AACTCAAGTTTACAAattaatttgaatgaattccTTTATATTGGTTGTTT
TGATGACAATATGTGTACATTGCTCCATCAGCCTCAAATTCACAGCTCAG
GATGGAAGGCTGGTATGTGGCCCTAATATGATGAAGATAAGTCTCAATGT
CGACAAATTCAACCAACATAATCGACCATATAGAGCTTACTTCGAAGGTT
ATGATAAACATCCAATCTGTTCTGTGAAACACGGAAACACTGGTGATCCA
TTGGAGCTGAATTCTAAATTCAATGAATGTGGCGTTCAATTGATACAACA
CCAAGGGCAGATTATCTATACTCAAATCGTTTTGGTGATTTATGGTTATA
ACCCGAAATCGAGTTTGGTTTATCGTGAAGAAGCTATTCGGTTTAAAGTG
GAATGCGTTCTCCAAACGGATTTGTCAGTTGGATTAGCTGATCCTGGATA
TCTTAATGTGTCGAAAGCAGAAGTAGATGGCCtcaAAGAAGAAATCAGAG
CAGATGCAGAATTCGACATCAAATTGGTCAGAACCACCGACGGTTCTTTC
AACTCTGAAGATTCATCCTCACAAATGCGATTGGGAGATCAAATGTATTT
CAAACTTGAATTGAACACCATCCGTGATGACTTGAAAATCTCACCACAAA
CTTGTTATGCAAGCAGTACGAAAGATTCAAGCGAAAGATATTTGTTGATC
GAGGATGGAGGGTGCCCAAACATGGCCGATGGAACGATCAGCATTCCCTA
TGAAAACGATCAAAAGCTATTCAAATGGGAAAATGAAGCTTTCCGATTTT
TCGGCGATTCTGACGCCGTTTACATAACGTGTAACGTGAATGTTTGTAAC
AGTAATGACTATGGAGATGATTGCTTGAGATGTAACTCGATCAAAAGACG
ACGACGCCGACGTCGTGCCGTGTTTCATTTCAACGAAGAGAAAATAAACA
CTAAACAGCAAAGAGTGATTGTATCAACTCAAGTTTACAAattaatttga
atgaattccTTTATATTGGTTGTTTTGATGACAATATGTGTACATTGCTC
CATCAGCCTCAAATTCACAGCTCAGGATGGAAGGCTGGTATGTGGCCCTA
ATATGATGAAGATAAGTCTCAATGTCGACAAATTCAACCAACATAATCGA
CCATATAGAGCTTACTTCGAAGGTTATGATAAACATCCAATCTGTTCTGT
GAAACACGGAAACACTGGTGATCCATTGGAGCTGAATTCTAAATTCAATG
AATGTGGCGTTCAATTGATACAACACCAAGGGCAGATTATCTATACTCAA
ATCGTTTTGGTGATTTATGGTTATAACCCGAAATCGAGTTTGGTTTATCG
TGAAGAAGCTATTCGGTTTAAAGTGGAATGCGTTCTCCAAACGGATTTGT
CAGTTGGATTAGCTGATCCTGGATATCTTAATGTGTCGAAAGCAGAAGTA
GATGGCCtcaAAGAAGAAATCAGAGCAGATGCAGAATTCGACATCAAATT
GGTCAGAACCACCGACGGTTCTTTCAACTCTGAAGATTCATCCTCACAAA
TGCGATTGGGAGATCAAATGTATTTCAAACTTGAATTGAACACCATCCGT
GATGACTTGAAAATCTCACCACAAACTTGTTATGCAAGCAGTACGAAAGA
TTCAAGCGAAAGATATTTGTTGATCGAGGATGGAGGGTGCCCAAACATGG
CCGATGGAACGATCAGCATTCCCTATGAAAACGATCAAAAGCTATTCAAA
TGGGAAAATGAAGCTTTCCGATTTTTCGGCGATTCTGACGCCGTTTACAT
AACGTGTAACGTGAATGTTTGTAACAGTAATGACTATGGAGATGATTGCT
TGAGATGTAACTCGATCAAAAGACGACGACGCCGACGTCGTGCCGTGTTT
CATTTCAACGAAGAGAAAATAAACACTAAACAGCAAAGAGTGATTGTATC
AACTCAAGTTTACAAattaatttgaatgaattccTTTATATTGGTTGTTT
TGATGACAATATGTGTACATTGCTCCATCAGCCTCAAATTCACAGCTCAG
GATGGAAGGCTGGTATGTGGCCCTAATATGATGAAGATAAGTCTCAATGT
CGACAAATTCAACCAACATAATCGACCATATAGAGCTTACTTCGAAGGTT
ATGATAAACATCCAATCTGTTCTGTGAAACACGGAAACACTGGTGATCCA
TTGGAGCTGAATTCTAAATTCAATGAATGTGGCGTTCAATTGATACAACA
CCAAGGGCAGATTATCTATACTCAAATCGTTTTGGTGATTTATGGTTATA
ACCCGAAATCGAGTTTGGTTTATCGTGAAGAAGCTATTCGGTTTAAAGTG
GAATGCGTTCTCCAAACGGATTTGTCAGTTGGATTAGCTGATCCTGGATA
TCTTAATGTGTCGAAAGCAGAAGTAGATGGCCtcaAAGAAGAAATCAGAG
CAGATGCAGAATTCGACATCAAATTGGTCAGAACCACCGACGGTTCTTTC
AACTCTGAAGATTCATCCTCACAAATGCGATTGGGAGATCAAATGTATTT
CAAACTTGAATTGAACACCATCCGTGATGACTTGAAAATCTCACCACAAA
CTTGTTATGCAAGCAGTACGAAAGATTCAAGCGAAAGATATTTGTTGATC
GAGGATGGAGGGTGCCCAAACATGGCCGATGGAACGATCAGCATTCCCTA
TGAAAACGATCAAAAGCTATTCAAATGGGAAAATGAAGCTTTCCGATTTT
TCGGCGATTCTGACGCCGTTTACATAACGTGTAACGTGAATGTTTGTAAC
AGTAATGACTATGGAGATGATTGCTTGAGATGTAACTCGATCAAAAGACG
ACGACGCCGACGTCGTGCCGTGTTTCATTTCAACGAAGAGAAAATAAACA
CTAAACAGCAAAGAGTGATTGTATCAACTCAAGTTTACAAattaatttga
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:636912..644275 + |
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