MSTRG.11166.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11166.2.p1
Unique NameMSTRG.11166.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000080_pilon:551454..581539-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11166.2.p1 ID=MSTRG.11166.2.p1|Name=MSTRG.11166.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=30086bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:551454..581539- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTCAAACAGTTAAACAACATCATAACACGGATAGATAAAGTTCAATCAAC ATGATTTCTTTTCATCTCAAGTTTTTACTCTACGTAACAACCTTCTTGGA TCTACTGTTATTTTACAAGTGCCAGCAAACATGTGATCAATATGCAGAAG CTGCTGGTAACACCCAAGTCCCGAACCCAATTCAATGTACTGGTAAGGTT TATCTATTATTAATTATTTTCTGTATTTCATCTCCACGATTCTTTTAGTG CACCTCCCTAAATTATAAGTAAAGGGGTAAAAATGCCATTTTAAGGTGTT TACTGTAAGTCTTCATTTCAACAACAGCTAATGCAACCTAAAAAAAATTT ACGTTAAGGGACATCAACTCATTCGGCCATTGGGGAGAAGTGCCTTAGGA ACCCCGAGTGAGAGTTTTTGATTACTTTTAGCAGGGACAAAAAAATGGAT TATAATTTTCCACTGGGGAATAGTAATGCCTAATTACAATATTTCTTCTC AGGCTCAGACCAGCCTGGCATTTGTAATTGCTTGCAGTATTCTTTTAAAT TCTATTGTTCCGCGCAATTGTTCGGTTTGTCAAACGCCTAATGATGACAG CGTGTTGGCATTTCGTTGGCATTTGAAATGCCATTTGGAGCAAAGGAATC CCCTTTTCTGGCATTTCAAATCAAACAAAGGAACCAAAACAAAGAGAAAA AATGATATTTTTGATTTTTTAAAGTATTTGCACGTTTTTTATTCAGTTCT TTCTATAGATTGTAAAATTTGCAAGATTTGCCATAGCCTAGCCCTACGGC AAAAAGTTTCAGTCTTAATGACTGCAGTTTTTGAGAAATTCCATGCTTTT CATTGTTTGATCTGTCAAAGTTGAACTTGAAGGAATCACCTTTTCAGTAA TGACTCTAAAAAGACGATTCCTTAAATGCCATGACAGAAAATACAATGGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:551454..581539-

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GGTTTATGTTTGGAGTTTTCTCAAACTACTGAAATCCCAGCGCAGCTAGT
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TTTATGTTTGGAGTTTTCTCAAACTACTGAAATCCCAGCGCAGCTAGTGT
TTTCCACATGTGAAATACCTAGGTTTACTATATGTGAACCATCATTCCAC
TTCAGTGTATTATTTCACACCACTGGAGGAGTCTTTTGAAGATGCAAGAA
AAACATGTCAAGACCTTCCACCGTTTAATGGAGTGCAATTTGATCTTGTT
GTTATTGAGTCTCAAGAAGAATTGGATGTAATCGTTACCTTGCCACTAAG
ACTATGATTTCTTTTCATCTCAAGTTTTTACTCTACGTAACAACCTTCTT
GGATCTACTGTTATTTTACAAGTGCCAGCAAACATGTGATCAATATGCAG
AAGCTGCTGGTAACACCCAAGTCCCGAACCCAATTCAATGTACTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11166MSTRG.11166Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11166.2.p1MSTRG.11166.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11166.2.p1.exon5MSTRG.11166.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11166.2.p1.exon4MSTRG.11166.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11166.2.p1.exon3MSTRG.11166.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11166.2.p1.exon2MSTRG.11166.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11166.2.p1.exon1MSTRG.11166.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000080_pilongenomesc0000080_pilon:551454..581539 -