MSTRG.11154.1.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.11154.1.p1
Unique Name	MSTRG.11154.1.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000080_pilon:336154..358658+
coding sequence from alignment at sc0000080_pilon:336154..358658+

mRNA from alignment at sc0000080_pilon:336154..358658+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.11154.1.p1 ID=MSTRG.11154.1.p1|Name=MSTRG.11154.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=22505bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:336154..358658+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
cgaaatttttgcctcgattgccTAAGATAATTTGAACTCCTCTTGTAATA
ACTTACTGAACAATCGAGCTCATCCACGTCCATCCAAAACAACGCCATCT
TTTTTGATCTTCGGTCaaatttttgttggaaaatcaaaacaaaacaccaA
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CCTTTTTATCAAGACTTTGCAAAATTTCGCTATATTTTAATGCCATTTAt
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ATTGGGCCAtccccagaaaatttttgttaccccccgtcggacgacatgca
ttctttttattttttttattttttatagcctcggaaataatttttctttt
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catcgcatcggaaattccactcttttttgccttttttaattcaattgcgt
tggaaattcatacattttcttctctcaccttggaaatttcgaattttggt
gaaaacttttgacctcggaaatcctgtgtcgtccgcccccctgttacaga
caaattctggaatggcccaattcgTTTGGACCAAATTTCGCTTCTTATAG
GCAGCTAATgacatcaaaaaaattgaaataagtgAAAATTGAGGGACAAA
TATTGACTACTTATTTTGAAATCCTTATAGTTTagagagtcagaaaaatt
tactcgGCGTTAATTtataaattgatgacgtcacaagcaaaagtgaaaaa
ttaatgttgcaaaatttcaaagttttatataCCAATCGAAGCGTTTTCTG
ATGTAGATTTtaaatcacatcagtctcaataagtaaaaatttgaatatga
aaagttaTGGCACTgccagtgtagacctaactcttcatacaaaatacggg
aaacgcatatttggactttgtaccctatgctgctgcactcaagcacttgg
gccaaaatcccgcaaaggcgggacaaaaatcagttttttgaagtttgcaa
aaaaaacgccacatagaagatctttcaaattcagtatgtgaatagagcag
taaaaaatacaacttttctatttttcattttttttgcaaaagttatagga
atgaaaataaagggataatgataattgaatactatcatagctgtcaactt
cgcctcacaaaaatgcgggagagctccaagtcgaaaaaattttccccgat
aatccgatttttcaaaatcgggaaatcggggaaatttactcgtaaaatcc
gattttattggaaatttttttcgggaaattggggaatttttcgttccgat
ctttcaaaatccagaaatttcgccatttggtttttccaaaatcggaaaat
ttttggaaatgcgagagatgcgggagaaaatcccaaaaatgcgggagatt
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CGCtcaatgcgggagagttgacagctatgtacTATCCATAGATGATCCGC
GGCAATAtcataaagctagaatcgctttgcgtactcttcgcttgagaaaa
tgattgacagattgaagtttttcatccccgcggtgcgcgccgcgcgggag
ctcgggcgctcgagagttctcggctcaatcctcggaccgcgctaaaatgg
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aaggctcttgacagaatattgtttgttttattgtcaatgatgacagtgcc
gttataaattttgttagatctgacaaattgatgtttgtaagtgcacttta
tagttttgattcccattgaagaatcatattctggttttcatgttattaga
tgctgttttagagctttagagctacactggcTGCTGTTATGGTGTCCATT
CCAGGCCAAgccatattttatcattctacagaaatccccgcttgaaaaat
ctaaatattgATACGTGGTCTAGTTTACTAAACTTTGCCGAATTAAAACG
CGCGAAAATATCATATGGCGTATGACCACGGCTTCCGTTCACTCCGATCA
CGATTCTGATCACGTGATATAAGGCCGCACTAAAGGCCTTTCTAGATTAC
cgcgcaaaaaaaaaacaggggtcaacatgaactttaaagtctgctgcggg
aaagggaaatggttttgaagaaccaagTATAGGcaaaaaggttttaatat
tattcaaatatcacaaaaacaagcagttagggaaaccatccaggatcctg
ccattctataaaccagcaaaaactaaatgacacttgtaaacttaagtttc
ttaccatttcccatcgaaaacaaccaaaaacattgctacttcccaaagcc
ggacaccaaaacaaatcatcttccaagattatggcgcccttttggatcta
ttgttaagaccatctaaaatggtggaaaaagTTCCGGAAAGACAGAGGCG
CCTGCTGCTTCAATGGGTGGTAACgtcaaaacgcccaatatgatcttcca
atagaaggcgagttagttgccgcgcgagttacgtcacaCACTCCACCTCA
GCGCACAAAGAacggtgtttcagtgaatatcaataattataagaatatct
tatgtgcttaacttcagtaaacctcgagtgcttcaatgaagatgaagaag
gtaagaagataaaaaatgcgctggataattttcattataatagtttggtc
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cagccaattaaaagcacagtgtgcttatacttactttgtttgctacattg
tctaggctaaaaaaagtgagaaaagacacgaacgccttattttaatgagt
gttgttttgattttgattgtggccgcgtacaggaactcgccaaatgttcc
taactgacaagtgacatttacatggttgatctttataaactttgatctga
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ttttggatttgtgagaagacaaatgttattgtaaagaAAAGTCATTTGGA
AGTGTAATCATACCCTTTCCAGGGAAGTGGACCAACCAACTGGTTGTTGT
Aggtctggtggaaaatggatttatttgtgacttcccaagcgatttaaagt
acctgaaaatcagacCGGTCTTAGTCCGGTATTACGAGCGGTCTAGTAgc
ggtcaaatttttgttttagatcggCCTCCAGACCTTCTAGAAATGTGATC
TCTAACGGTCGTGGCCGCTTCTAGACGCTCGTGGCCGAGCGTTATTACAG
GTCTAGGCCGCTCACTAGACCGGTCCTGACCGCTCGTTGGACCGGTCCGA
GCCGTTCGTTAGACCGGTCTAGGCCGCTAGTTAGTGATTTTTAGTAACAA
TTACATCAAGAAATTGTTGTAAAAGGATGTCAACCGAGCGATCGGGGCCG
GTCCCCTAAACTCGTAGCGgccttttggtaaatttttactGGTCATTTAC
CGGCCCTTAAAAGACCGTCTAAAGACCGGTcccattttcaggtactttaa
atcgcttgaGGAGTCACATTTCTGAATATAAACATTACTGCAGctataat
attttctttattttgacaaacaaaaggttcaaggtttgtttactttttat
tttactgcatttctctgtcttattctgctgtagtaggcaattgaaaactc
ctgattttttgtttttgtcagtgctcgctcggcagccattttgaatttct
ttttttcgccgtctgtactcggcaatttcgtGACCTCTACAGAATCGACG
ATTTTGCCTGAGGGGAACAGCAGTGATGGAGGTctatcagttagtcacac
taggaaatctagctttcagaaaaaaacaacatcagtcatctacaggatgt
atttgcacaacaaggatgagagctacctgaatcaagttcgcaagacaatt
aattaaaacttgaaagtttgaaacaaaataaaacgtgcagcagccaaaat
caaccaaccaaaatttgtcattcaattcccgagacaacGCTTCGATTTTT
ATGGCctggtttatacgctaaagtaaaaataattccgcatatgtaaatgg
gtcattatttgaggtccggcaaaatttccgggaaacagcctatccggtgg
tgcgcggatctaggtgggttccgactcccctgtagatctttttcttggga
agttgatcttcaaattagttttcaaggttggcttggctcaaattttttca
tctatggctcaaattttcggcaatttctcaaagtttttgaaaatgttaat
ttcattaaaaagcgcctggttattttttcatgaatcccttcaGAAGTTTT
GCGccacatttttttgtttaagagtcaagtaaacgatatagtgctttcgc
agcattaatctttgatacgcattttggcgggacgctagtgtgactaactg
tctatGGCTCTTCTATgacttcatttttgaaaaaatgccttaGGCGTTCA
TCgcaaaaatgctctgttcgcgtcgcaacgggtgttaaaaatgcatgcga
gcggacgggcggtcaaaaacattcccgggctttttttaatcacgccagta
actcaggggcgggtggcaacgcaagcaaaacaatttttcgatggtcgtca
gagcaattgagaaaaaagctatactttaaaagaacaaattgcttttccca
gatttttttccgcatctctgCACCTctgcaccggaaaatcagcggaaaat
ttgatgcgggcttgtgacgcgaatagaacaatttttcgatgaccgcctta
ttttataaggaattacgatctcaattttctcgagttaggttgaGAAATTA
AATATACCCGTTGAAATGTCTTGTATATAGTTTTTgacgagctttcgaat
ggtataaattgtttttcgttttgatgacgttgaaatttgacattttcaag
GGGTCAAAGGCCCATGATTAAGACCAAAATCACATGTCAAATtttaagtc
ataacttttgaaatctagatttttacttattgagactgatgtgatttGGA
ATCTACATaaaaaaaCGCGTCGAATGGtataataatatcattactatgtg
ttgaaatcaaattttgacttttggtggtgacgtcatcagttgACAAATTA
CTACCAGACGTATCCGTTAAACAAATTTTCGGACGCcaagtaaaattttt
aggatcaATAGATATATGGGAAAAGAAAAGCCAACTCGGCGTTTGTCCAA
AAGTCATCCAGATTTTAGATGtcatcagctgcctgtctattaATGCTCAG
AGTAGGATGAGCGAtttttttCCTCAATAATTTTTCCTATCCATCATTCA
GTgattcagggggtattgggtcattaccagttagggttagggttggagct
cgagagtcataACATAGCTCTAGGAGCACTGGTACTACCTAGTAGTGTCT
ACCGGTAGGGTTGGAAGCTTCAACTATATATAGAGATTTGTCAGTTTTGT
CTAATTTATTACAAATTGCGGAATCTGCTATGCGCGGATGGCTCAtccgt
aaaccaataaataaaaaagtatttgccttATCCCTATTTGAATGGGTGCT
GCTACTGCTAAGCATGCAATTGCTTGCTTAATCAACAGTCTAAACTTaga
ctcctatatcaggattagaaactaggctagtcttacctcttaaTTATCTT
TTCCTCTAcatcaatacaatgctgacaagttgacacaacaccatgtgtac
attgacaagtaatccctgagagaagtttatattgaaatctgcaacaaaaa
cgaaagtggtctcttctactgattgcttcccagcgctcctttgcagctgt
ttatcaaatttccaccaatgaggttgccgcatttcaaacgaCCCTTCTTT
TGGCTTTGCACGacaggcggctgtaaaatcccaccctatATTTGGTTCAA
TTcgtgatccgtggcttaggttttttctcatcttcaatttactgaagaaa
gcgggaatttaatGTGAGATTTAgaaattgtcaacaaagtgctgtaaaaa
tcgttgaataaaagaagaattacttaaaaatcttaaatattttcattttg
aagaataggtgaaaaatagaaaagtttcatttttcattgctttaatcaaa
atgggggatttggaaaattttctatgttaagttttttgcacaaacccctg
taactatgggcgagcaccctgttgctaagatgttagcttgaaatcgaaaa
tgaaaccactcaaataaaagtaaaatcattAAGTTTATACTGACTGtcta
tcatttaaaaaaactttatttgcttCTGATTGCTTTGTTGAAATCGGAAA
GCCTTATCTTTCTCAAAACCTATATTGTAGAAAATGATTGTGTTAAAAAC
TTTTGCCGTGGTTGGCAGatgatatcatccaccaggatgcaagtgaaatt
tttcaatctgctgaCCTAGatgggggttcggttattatcagttagggtta
agGTTGGAGCTTTAGAGTCACAATgtcgaaggccttcttaggggcattcg
tTCCCTGAAACCCTGAGGGTCACCAGGTAGGGTTaggagctttcttaatt
aaaaaggtctgtaaattattttGTAAATGACAGCTTTCTGTCGTGTCTCA
TTGGCGCAAGCAtttaggcattgggtttgtaaaccaaggttgcttgcatt
tggttgTTCAGGCCAGGGTCGGAGACCTATTTCACTGGTACAGGCAAATt
taagaaaacttaaaaaataattaggAACACTTGAGagagtcagaaaatca
ggatagaagaaaggaaagtagaaaataggggggaataagagaggatgcat
cctggtggatgatagcGTTTGCCAACCTGTTTAAGACCATCATGtccagt
ttgcagagtgtggcACGTTTGCTAGAGATCTTGAGTGCACAACTCGAAAA
AAGTAGAGTGAATGTGCAAAATTcgaggttttcaggtgcaagtgcAGATG
GTTTTTTAACCCCAAGTGCAGAGCTCTGCTATTTTCTCCTCAAGTCcagc
taattttagcaattttttgcctttttgggccAAATTCCAAGGTATAGGTG
CACCTTTTCaggaccaaaatttatcaggtgcgCTTTTCCAGTGTGGAACT
tggttttttcctttttattttcctcgagtgcagccttgccatactctgca
aactgggaCCATGTATtcaccatattttgaaaaatctgaatcCTCTAATC
TGCTCAAGCAATCTCAACCGGGGCAGGATCAAAAGCATGCAATTGCACAT
TGTGCGTAAATTTTAACTATGTAATTGAGTGCTTAAGCCTTGGGAGTCAA
GCGTGCAATTAAGAGGATTTCTCAGACTGACATCCAGAAGTAATTAATCC
AACCAAAATTACTTAACTAATTGAACTTTGTCGTAGTTAATTGAATGATA
AAAGTATGACTAAATTCTTAATTGGCTTAGATTGTGAGTATTCAATTTCA
ACCTTTCCACCccattgttttttatatttttacgcTGTCCCCTCGcaaca
tttttttacaaaatggaCATGTTCGGTTATTTtgtcataactcaagaact
agaaatcttttgataaaaaattatctatccctgaaaagctaattaaattc
tCCAGCTTATAGGTTGGgtaccaatccaaataaaatacTCTAACTAAAAT
GGTAGCTCCACATTTACCAAgttttttgctcatttttcGGTAATGTCACA
TCTCATctgcaaaaaaaagtgggggaagTTTGattattaaatctttcttt
atctttatctttattttatcattatatatcAATGAAAAGCTTAGACTCGC
tacttcctttttcttttttttaacgaATAACAAGTAAGCCAATAAAAGAT
ATGGCGTAGgatgctaatcaaaaattaacccctgttttgtgacattttta
caGTCAGCCACAACTTTGCTCATAGAGTGAAACCATTTTGTGGCTTACAT
TTGTAAATGCATCTGTTGTTAAGCTGAATAGTTCAGCTTTCCGttgcaaa
aataatgaaattttgtggcTGACTCAAAATTGATCTATAGCTGTCTAAAG
TGTGAGTAAATTCTGTGGCTGACATGCCGAGTGGCTTACCCTACCTGCAA
TCTTTGAGAAGCTATTTCTCAGCAATGGAATTAGATATGACATTAGTTCC
TTCTGCAAGTTCTCAGAAAAGGTTTGGATTTCTCATATTCAAtccaaaaa
tgtggcttacaTATTGTTAAATGAGAGAAAATGTGGCTTAAATCATAAAA
GTGctgtgatttttttgcttcaatattttctttcactttgaTTAGGAAAA
CCATCAATTTATGGCTGAATATCaaggaaaaaagtaaaatatagtTGTTA
AAAGTACATTTTGGTGGCTTACGGACTCGATAAGAAGCTCTATTAAAATG
GATATAAATGCATTATAGATCTTTGACAAAGATGTTTTATTAAGATTATc
caagtactttaggcgtagaaactttcgcgaacagaaactttcgcgatttt
cgcgaattttggcccttttcgcgaaagtaaatgtctttaaaaattctagg
aagggccattcgcgaaagtttatgctcgcgaaaaattcttgacaaaatag
aaaatctgtaaaacttcaaactttgaataaaatgtaacttttatgccACT
TTTTACCCTgttaaaagactaataagtcaaaggacaaatgtttcaagcca
acccaagaagtatttgtgtctctaagccattttttcatgtgaaaattctc
aattttacgtcttgattcgcgaaattttatgctcgcgaaaaatatttttc
cgttaaattcgcgaaagtaaatgtcgtgaatttcgcgattttatGTCCTC
GCGAAAGtatctgctcgcgaaagtttgtacgcctaaagtaatggATAGCC
gaatgtttatttatttattgacaCATTACATTTTGTATTAAATCGTGGCT
TACTGCCCTTCTGTGAGTAAAAAATGTGGCTTACAGCGGGGGAGATAATC
AGAAATTATACAGGCTGGAAGTCCATTGACTATCAAGCCTTAAACTATTT
CTTTGattatttatcaaatataaagagAATAGCCTTATATTTTGTAATTA
TAAATGCACATTATTGTGGCTTACAGATCCAAAAACATGACTGTAAAGCA
TTTATCAAACAATGTGATTCAAATCGATTTCAGTGATGGTTTATGAAGCT
AGAACAGTACCTAGTGTAACTTAATTTTGTCTGTCAGCCACAAAAATTGC
TCATCTAATCATGAAAAGACTACTATTGAtggtttcctttcaaatttgat
ataaaataCCAACCCTTCATTCTTAATGTATCAATTATCTGTATTGTCAT
GTTAACGGTATTATCTTGCATTTACCTCCAAGTAAGCCACATTTTGTGCT
CAAATTACGACTTCAcaacattttgaaagtattctggtGATTTTAAATTG
GATTTTAGATCATTTTGAGTAGCTACAAATGTTTTAGAAGTGTATGGAGC
AGGTTAAACGCttaatttctgacaaaaatatcCCTTTAATGTAAGCCACA
AAATAGAACGTTTAACAGTGGAATACCATGTACATTTAATGCTTTTCGta
aaattcaatctttctaCCGTCAAGAGCTGAAGGTTTCTTTTTTGTATCAT
CTCTAGTTTTGATGTGGCTTACATTCTaaaaaaaTCGACATTTTTTGATT
TGCAGCCACAATTTTGGCTcaattaacaaatttttttttttcaatcatat
cCTCGTCTTGAGTTCTATAAGCCTCTGAGATTTGAAGGCTAGATTCAAAA
TACCTGGGGAgttatttcaaaaagttgtttttggccattttttccaatgt
cacactatttttgattagcatcGTAAGAAAGACGTGTCTATCAAATTGCG
TAAATGTATGGCATTGATTCGGAACGTATCAAAGACGTACATATGTACAG
CTTTCGGGGTCAAAAGATTAatgcagttagtcacactaggaaatcaacat
catctacaggatgtatttgcaacaacaaggatgagagttacctgaatcaa
gttcaagatcccaagataattaattaaaacttgaacacttgaaatgagac
aaaatgaatGATTGCTAAATATGCATCAGCCagaatcaaccaaccaaatt
atGTCactcaattcccgagacagcactTTGATTTGTTACTCGttaggcct
tgtttatacgccaaagtaaaaataattccgcaacATGTAAATGGGTTGGT
GTTTGAGGTCTGCTCTGACAACATTTCTGGTAAATAGCGTATCCGGTGGT
GTGCGAGTCTAGGTGGTTCTGAAAAGAGCAATACCAATAGTCTGCAATAA
TTGCTgtttttcttaaatacttcactAATGGACAAAAGTTTTAAACACAA
TTGTTTTCTACAacagtgttgcaacttttccgtcTGTAGACGGATATCCG
TCCAGTTGTgatacaaatatatcatttctgtcttgccagtaagagggttt
ttggttcaaatgacCATCTAATCCTAAGTAAGGTTTCCGTCAATATTCAC
AAAACCTAGTTGCAATACTGCTACAATAATAAACAACTCTAGattatata
tttattatatatttttattcggaatattttaCTACTAATAGTTTGTTCCT
ACATTTCCTGAGTATGTGAAAGGATCAGAAAGCAACATCAGAACAATAAT
TTACTGTACAGAACAGATAATTGGCAGACGTGGATGTTTTAAACAAATCG
ATTATGCTGATTTCTTAAAAGCATCTTTCTTCCTATGATGATATTCTAAT
ATAATGCTATATTTTAGCCTTTGAGACTTGATGTCAAGAGGACATTATCA
GCACGGTCTGATCGTGCAAAAGCGGTTGATCTTCACCCAACAGAGCCATG
GATGTTGGTTTGTTTATACAACGGCAACTGCCATGTTTGGGATCACCAAC
GGCAAACTCTTATCAAATCCTTCGAAGTGACAGACCTCCCAGGTAAATGA
TTCAGTTTATAGAAAATTCATCATCTACcgaaatttctgaaattcttttt
caaccTTTCAAGCACTAGACAAAAAATATGCAACCAAAAGAATaagatta
attttttaaacattttttttcagtgaggaCTGGTTGTTTCGTTGCCAGAA
AGAATTGGGTAGTGACTGGTTCTGATGACATGATGATCAGAATTTTCAAC
TATAATACACTTGAAAAAGTAAGTTTCAAGTTTGTTTTCAATGGAtagat
gttttcaaaaataatttttataaaccAAATTATTTAAAAGACAAGTTTGC
AGAatgcttttttttcaaaatgtcttcTTAAAAAACACAATACATTATTA
ACTGAAACTACTTATTAATAGAAGACTATTTTTCCTACAAAACATTCTCG
GTTGGTTAcctcttttttttgtaaaaaaaattgagtttgattttggcaaa
aaaaatttcaacaatattgaTCTCATTCTTTTCGTTGTAACTTTTTCTAT
GTTGATCTCAGGTCCATGGATTTGAGGCCCATTCAGATTACTTACGTTGT
TTACAAGTTCATCCAACACAGCCGTACTTAGTATCAAGCAGTGGTAAGCC
TCTTTTTCacccaatatttttcattttcgtagGGGTTCTAAATTTTTGTG
AGGACTAATTTTTACGAAAATGTGACCTTCCATGGGAAAaggatcacttt
cgttttcaaaaataccaGTTAGGTATTCAAATGAAAACATATTATTTTCT
TGAACTTGAATGAATGTCTTCTTGAAAGTATCTGTATCTTATCTAATTAA
GTGTCATACTTGACAAACTAAACTGTACTTTGACTTTCTTCTTTAGATGA
TATGTCAATCAAGCTTTGGGATTGGGATAAGAAGTGGCAATGTGTACAGG
TTTGAAACTATGACTTGTTTTTGATTCGCcagtaaaataaagatgaaCTA
GAATTGATGattgctttttttttggtactCAATTCATCATAATTTCTTCA
TAATGtggaattttaacatttttgttttagacATTTGAAGGTCATACTCA
TTACGTCATGCAGATTTGCATCAACCCCAAGGATAATAACCAATTTGCAA
GTGCTTCTCTTGATCGAACAATTAAGGTGAGTCTGCTCTACATGAATATG
AATGGACAATGAAAAAGTATTTCTAAGATAACGGAGATCCTCCAAGAATT
TACTTatctaaaattgagtttttgagattttctctaTAAGTCTATGCACC
CCTATGTTTTTGACTTAAAGCTTGgctaaatgtttaaaatttatgACAAA
CCATTTTGAATCAAGTGTAGAAAATCTGTTTTATACACAAGTGTAGAAAA
TCTGTTTTATACAGttgaaaatagtttaaaatacTGTCAGTAACTGATAA
CTGAAGAAGAAATACGAGGGTAGTTTCAAACTTGAGTGTAAATATCTTCA
TCTCTCTAGTTTAGAAttgtaaaatcaaattttatataataaaaatatgT
CTTAATTTTACTCTAATCTTAGGTTTGGCAACTGGGTTCACAGCACCCTA
ATTTCACTTTAGAAGGTCACGATAAGGTTTGTATTTCTGCCTGCCTTtca
ttacttttatttatattactGTTAATAAGAACTCATTCCTCTAGTTTAAA
TTCTACAACATATTTAGACATGTCCAAGACACTGCATATGCAAAAGACAT
AAATAAATATATAATTCATGTAATTTTTCGCTTTGTCTGCCTTCTCCCAT
TTTCAAGTTTGCACTACATGATTGAAGTAGTTACTTGTGGGATAAAGATG
ATAAAGTATTTAGAAATAACAATAAATTAACCAACATTGAATTCTACCAA
TTTTCTTCACACTCATAAAGCTTATTGTTTATGTGTTCAGGGTGTCAATT
GCGTTGATTATTTCCATGGAGGAGAGAAACCATACTTAGTTTCCGGAGCC
GACGATCGATTGGTCAAAATATGGGATTACCAGGTTCGGAGCCTAACttt
ttttCCAACTTAGAAGAACGACTAAACAGTCTAAGGGCGAAAATCATCCT
TATAATTATAATGTGCTACTAGATTGTTAAAATAATCCTGTAGAGCTGTC
TCCAGCATGCGTTTTTCTTTTGTCCTAAAATATCCACACAGCCACTCAAA
CATGAATTAATGGCATCCCCCTACCTTCGCTTTTAGAACAAGACATGTGT
CAAAACTTTGGACGGGCATGCACAAAATGTATCATCCGTTCTTTTCCATC
CGGAACTCCCAATCATTCTGTCCGGTTCTGAAGATGGAACAGTGCGCATT
TGGCACGCAAACACACATCGATTGGAGAGCACATTGAACTATGGTATGGA
GCGTGTTTGGTGTATGTCAGCTCTCAAAGGGAGCAATAATATTGGTATCG
GTTATGATGAGGGTAGCATTATGGTCAAGGTGAGtacatatttttacaat
ttgatGTTCTAGAGCTGCCAAAATTGGAGGACGCTCACACTCATTTACAA
ACTCaaatcttggatttttttttacttttcgttTTAGAGACGGCTTTATT
AGGGCCATTTGTATTGTGTTTTATTTCATCACTAGCAATATCGTGATGAG
TTGTACCCATAGTACGAGATTTTACTTTCCTAAAATGAGAAATTCGCTCG
CAGTTTTTTAGCCAGACATTCATTATTATCGTTTATTAGTTTGGACGTGA
AGAGCCTGCCATGTCAATGGATAGCAGTGGTAAAATTATCTTTGCCAAAC
ACAGTGAGATCTTGCAAGCTAATTTAAAGAATCTGGGAGACACAGAGTAT
AAGGATGGTGAAAGGTTGCCAGTAGCTGTCAAAGAAATGGGTTCGTGTGA
AATCTACCCACAAACGTTATCACACAACCCTAACGGACGGTAAGTCATAA
TGCTTCAGAGCCgaagctttcaaaaaaattgggcAGCTGTGATTTAGCAA
TAAATTTGActatttttatttgttattcTGAGGTAACCCTGaatttattt
catcattttaGAACAATTTgactgttccattaaaaatccatacagggggc
TAGATGAAACCcttggaaaatttattttcatacctAAAAAGTCTGTAAAC
GTGACGGTGAACAAACTAAAATCGGTCTTTTACCccgtagaaattttaga
ataacttttagaATAATCCCCTGGAAAATTGAAAGAACACTCCTtaagac
cccctggaaatgttcgtccacctcCCTGTAtcgatataaaatggaatggc
ccaatataaGATCGGAAAATTAAGTTGCTAGGTGTGTCCTTGAAATCATT
TTACCTATAGCACTGACATAACCCCGAGACTGAAcagtgaaattattttt
tcagtttcGTCGTTGTGTGCGGTGATGGGGAGTACATCATTTACACTGCA
ATGGCTTTACGTAACAAGAGTTTTGGATCTGCACAAGAGTTCGTATGGGC
TGCTGATTCTTCGGAGTACGCTGTCCGTGACGGAagcaaagtcaaaattt
tcaagaatttcaaagaaaagaaatcttTCAAGCCTGATTACGGAGCGGAA
GGTATGGAGATTGCTTGATgtttatacaccttttcgaccgtagtcgctcg
gtcatttttttgtctgctttatcccactaaaaccgtcccagtcctttttt
cgcaccaatagatagacaaaagaaaaatgcgtcaaaaaaggattgggacg
gttttagtgggataaagcggacaaaaaaatgaccgcgcgactacggtcga
aaaggtgtattcgggagaaatttattttcttaataAGGCtcgggggtact
taggcaagtggAGAGGGAACGGGTATGTGCTGCCCTTAAGGGTCTCTTTT
TTGGACCttcaaagtcccgctaagggtcacGAAAGAAGTGAAACTACCAA
TATTTACTACGAAAAAGGCCAAATTTCGGGAAAAAAGTCCCCCTAAGGTT
cccaaaatttacaaaatttcgattttttttcttcgatgttagaccctaaa
attttcaaaaatcgggtgGCACCACCCCGTCATCTGGCAAACCTAGTACC
TGCCCGGGTAATAAGGTCATCTTAGAAAGCTGTCATACGTGTATCAAAAT
ACTGTTGCAACTTCACATGGCCGTTTTCGCACAGAAATCACTTGCTTGCT
CAGGcttgcttcttttttttaaatgcactTTTCGGAGTTAACGGAAAACC
CCATATGCACTGTTTTAATCTGTGCCGTTTAAATTTATGTCTTGATTGTT
GCAATTTAGCTAATGAATTATATTTTAATTTAGGTATTTTTGGTGGCGCA
CTTCTCGGTGTCAAATCAAACAGCGGTCTCTGCTTCTTCGATTGGGAAAC
GCAAGAACTAATTCGACGTATCGATATTCAACCCAAGAACGTCTTCTGGT
CGGAGAACGGTGAAATGTGTTGTATCACAACTGACGAGTCGTACTTCATA
CTGAAGTACGTCCCCGATAACGTCACGGCTGCAttagaaaacaaagaaga
aatgATCACTGAGGACGGTATCGAGGATGCTTTCGACGTTTTGGGTGAGA
TCGAAGAGATTATCAAAACTGGTGTCTGGGTTGGTGATTGCTTCATTTAT
ACTAATTCTGGTGAGTCTATCTGTTTATATGTTGTAGACATGTTTTACAC
ATCGGTTACtttttttAACGCTTGTCAAATCGATAATTTTGAcactttga
aaaattctagGCCTTTGAAGATCAAATTTGGGGGGTTTACTATTTCACCA
TGttatttttgttgatattttttttgttctttatttgCAGTGAACCGATT
GAATTATTACGTTGGTGGTGAAATCGTCACCGTTTCACACCTTGATAAGT
AAGTAGAGCTCCTTTAACAATGACGTATTGCCTGCTAgtatgtttgtttg
tttgcttgttttacATTACATACATAATATACCTTTATTGGGGTTTAAGA
ATAACGAATAACGAATAAAATTGAATAACGTCATTTTATAACCCGCCAAT
AAAATCAGATcgcaaaatttgatgaagacaGATGCAAAACATACTTTATC
ACATTCGCTTTGCTTTGTCAAACGATTTCAGGGCTTCCGTCTTTTCGAAG
AAACTTTTCATGATCAGCAAAACGAATTGTTCTTTtcgtttctgattttt
tttactaaatCTGCAACCCATGTTTCTCAGGAGCTTGCACCTGCTTAGTT
TACGAATCCCATTGTTCGAAGCCTCTCTCTTTATTAGCGGACGCATaatc
agccaaaattttcttttctgattttcacaaatttcactGATTTTCTAATC
TTTCAGGAGCATGTACCTGCTTGGTTACATTCCCAAAGATAATCACTTGT
ACTTGACAGACAAGGATCTCAATGTTGTCAGCTATCACTTACTCTTATCC
GTACTCGAATACCAAACAGCTGTTATGCGTAAAGACTTTGACACCGCTAA
AGCTGTTCTACCAACTATTCCCAAAGAGCAGCGTAACCGTGTGGCCCACT
TCTTAGAGAAACAAGGCTTCAAGCAACAGGCCCTCCACGTGTCATGTGAC
CCAGAACATAAGTGAGTTGGTGTTCTAATTTGTCAGCTACTTTTATCTGA
CTCTTAAACTTTATGGCGTCGTAGAGACTGCAAATTAATGGTCAGGCTTT
GCACATTATGGTATTCTTTTGATTTCTCTctaataagtaagtaagtttgc
gactgcagtcggaggcaacccgaaggctcctgtttcgatagttatctacc
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TGTTTCCACTAAAGGGTTTAGGAATTTATCTGTCTTTGAAGTATCGTatt
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TCAAATAAACTTTAAAGCTTTTCTGGGGAAAGATTTTACCGAAGTTTGAA
CTGAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:336154..358658+

>MSTRG.11154.1.p1 ID=MSTRG.11154.1.p1|Name=MSTRG.11154.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=63558bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:336154..358658+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCTTTGAGACTTGATGTCAAGAGGACATTATCAGCACGGTCTGATCG
TGCAAAAGCGGTTGATCTTCACCCAACAGAGCCATGGATGTTGGTTTGTT
TATACAACGGCAACTGCCATGTTTGGGATCACCAACGGCAAACTCTTATC
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CAGAAAGAATTGGGTAGTGACTGGTTCTGATGACATGATGATCAGAATTT
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CAGTGATGATATGTCAATCAAGCTTTGGGATTGGGATAAGAAGTGGCAAT
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TACTTAGTTTCCGGAGCCGACGATCGATTGGTCAAAATATGGGATTACCA
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GAACTATGGTATGGAGCGTGTTTGGTGTATGTCAGCTCTCAAAGGGAGCA
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CGTTGTGTGCGGTGATGGGGAGTACATCATTTACACTGCAATGGCTTTAC
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GTGGCGCACTTCTCGGTGTCAAATCAAACAGCGGTCTCTGCTTCTTCGAT
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CGATGCTGCAAAGAATGGGAAATACAATGTCGCTTTCCTTGCTTTCTTCT
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AGCCTCACCACCATCATCACCCCCTCCATCAACACCTCAACAATCGATTC
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GTCAATTGCGTTGATTATTTCCATGGAGGAGAGAAACCATACTTAGTTTC
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TGGAGCGTGTTTGGTGTATGTCAGCTCTCAAAGGGAGCAATAATATTGGT
ATCGGTTATGATGAGGGTAGCATTATGGTCAAGTTTGGACGTGAAGAGCC
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AACGGCAAACTCTTATCAAATCCTTCGAAGTGACAGACCTCCCAGtgagg
aCTGGTTGTTTCGTTGCCAGAAAGAATTGGGTAGTGACTGGTTCTGATGA
CATGATGATCAGAATTTTCAACTATAATACACTTGAAAAAGTCCATGGAT
TTGAGGCCCATTCAGATTACTTACGTTGTTTACAAGTTCATCCAACACAG
CCGTACTTAGTATCAAGCAGTGATGATATGTCAATCAAGCTTTGGGATTG
GGATAAGAAGTGGCAATGTGTACAGacATTTGAAGGTCATACTCATTACG
TCATGCAGATTTGCATCAACCCCAAGGATAATAACCAATTTGCAAGTGCT
TCTCTTGATCGAACAATTAAGGTTTGGCAACTGGGTTCACAGCACCCTAA
TTTCACTTTAGAAGGTCACGATAAGGGTGTCAATTGCGTTGATTATTTCC
ATGGAGGAGAGAAACCATACTTAGTTTCCGGAGCCGACGATCGATTGGTC
AAAATATGGGATTACCAGAACAAGACATGTGTCAAAACTTTGGACGGGCA
TGCACAAAATGTATCATCCGTTCTTTTCCATCCGGAACTCCCAATCATTC
TGTCCGGTTCTGAAGATGGAACAGTGCGCATTTGGCACGCAAACACACAT
CGATTGGAGAGCACATTGAACTATGGTATGGAGCGTGTTTGGTGTATGTC
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TTATGGTCAAGTTTGGACGTGAAGAGCCTGCCATGTCAATGGATAGCAGT
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CCTAACGGACGtttcGTCGTTGTGTGCGGTGATGGGGAGTACATCATTTA
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TATGGGCTGCTGATTCTTCGGAGTACGCTGTCCGTGACGGAagcaaagtc
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AGCGGAAGGTATTTTTGGTGGCGCACTTCTCGGTGTCAAATCAAACAGCG
GTCTCTGCTTCTTCGATTGGGAAACGCAAGAACTAATTCGACGTATCGAT
ATTCAACCCAAGAACGTCTTCTGGTCGGAGAACGGTGAAATGTGTTGTAT
CACAACTGACGAGTCGTACTTCATACTGAAGTACGTCCCCGATAACGTCA
CGGCTGCAttagaaaacaaagaagaaatgATCACTGAGGACGGTATCGAG
GATGCTTTCGACGTTTTGGGTGAGATCGAAGAGATTATCAAAACTGGTGT
CTGGGTTGGTGATTGCTTCATTTATACTAATTCTGTGAACCGATTGAATT
ATTACGTTGGTGGTGAAATCGTCACCGTTTCACACCTTGATAAGAGCATG
TACCTGCTTGGTTACATTCCCAAAGATAATCACTTGTACTTGACAGACAA
GGATCTCAATGTTGTCAGCTATCACTTACTCTTATCCGTACTCGAATACC
AAACAGCTGTTATGCGTAAAGACTTTGACACCGCTAAAGCTGTTCTACCA
ACTATTCCCAAAGAGCAGCGTAACCGTGTGGCCCACTTCTTAGAGAAACA
AGGCTTCAAGCAACAGGCCCTCCACGTGTCATGTGACCCAGAACATAAat
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GTAGAGGCCGAGTCGGAACAAAAATGGAAACACTTGGCTGAGCTGGCTAT
CCAGAAATGTGAATTTGCGTTAGCTCAAGAATGTTTATACCGGGCACAAG
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TTTCCTTGCTTTCTTCTCCTTGGGAAGACTTGAAGAATGTCTCGAATTAC
TCTGCAAATCGAACCGTCTCCCAGAAGCAGCTTTCTTAGCTAGAACTTAC
TTACCAAGCCAGGTACCACGTATCGTCAAACTATGGAAAGAAGACTTGGC
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CGACCAGAACGAATGGCTTTGAGGCCGGCTGCTGATTACAGTGCTCTATC
GAGCAATTTGGAACGAAACGTTTTGGAAGAGTTAGCAGGCAAATCAGATG
AAGAAGTCACAGCTTTAATGGCTCAGACAGAacaaatgaatttaaaagaC
ACTGCTCCACAACCTCGAGCCTCACCACCATCATCACCCCCTCCATCAAC
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TGGGGATCAAGACGTTGACGATCTAGACCTTGATGATTTGGATGATGACC
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Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.11154	MSTRG.11154	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.11154.1.p1	MSTRG.11154.1.p1-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.11154.1.p1.exon1	MSTRG.11154.1.p1.exon1	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon2	MSTRG.11154.1.p1.exon2	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon3	MSTRG.11154.1.p1.exon3	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon4	MSTRG.11154.1.p1.exon4	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon5	MSTRG.11154.1.p1.exon5	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon6	MSTRG.11154.1.p1.exon6	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon7	MSTRG.11154.1.p1.exon7	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon8	MSTRG.11154.1.p1.exon8	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon9	MSTRG.11154.1.p1.exon9	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon10	MSTRG.11154.1.p1.exon10	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon11	MSTRG.11154.1.p1.exon11	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon12	MSTRG.11154.1.p1.exon12	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon13	MSTRG.11154.1.p1.exon13	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon14	MSTRG.11154.1.p1.exon14	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon15	MSTRG.11154.1.p1.exon15	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon16	MSTRG.11154.1.p1.exon16	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon17	MSTRG.11154.1.p1.exon17	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon18	MSTRG.11154.1.p1.exon18	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon19	MSTRG.11154.1.p1.exon19	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon20	MSTRG.11154.1.p1.exon20	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon21	MSTRG.11154.1.p1.exon21	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.11154.1.p1.exon22	MSTRG.11154.1.p1.exon22	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000080_pilon	genome	sc0000080_pilon:336154..358658 +

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MSTRG.11154.1.p1 (mRNA) -