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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000080_pilon:280191..287542- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11151.2.p1 ID=MSTRG.11151.2.p1|Name=MSTRG.11151.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7352bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:280191..287542- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTCAAAACTGGTAGAAATTCAGATTTACACATTTTGATATATATTTCAA
GCAATAAATAGTAACGCCCTTTAACAACGCCCAATTTGCCAATTTGAATC
TAGCAAAATAACCAAAACCAACACAAACAGCAATTTCAGAGATGAGAAGA
AACATTCGCACGAGAAAAGTTCAAGATGGCGGACGAAGAAGATGTTGGAG
ATGGCATGGGAGGGTAATTTTACTTTAATTCTTTTCGATTTCTTTCACAT
TGAATCCTTCCTTCAAAGGCAGAAGAATTCAATTTGTTATTTTAACCCTT
TTGATACTCTTCCTTGTACGATAAAGGGCTTTTGTGGCCTAAATCAGTCA
GGGAAATCCTCTTAAAATTGCGTGCTCATAATTTTTCTCTAAAAAGTTAT
TTTTTTAAGTTTTAGTTTTATAATTTTCATATTTTTTTTCTAAAAAGTAT
ATTGGTTTGATGGCTAACTGTGCCCAAAATAAAGTGAGCTTTTAACAAAT
TATTTTGTCATTGTAAAGAGGAAAGGCAGACTTAAAATTTGGTGTATGTT
ACCAGACAGTTGGCAGATGATATCATACTCCAGGATGCAAGTGAAATTTT
TCAATCCACGGACACACCCCCGTGGTACGGTTATTATCAGTTAGGGTTAG
GGTTGGAGCTCGAGAGTCGCAATATAAGGCCGAAGGCCTTCTTAGGGGCA
TTCGTACCGGTAGCGTAGGGTTGGGAGCTTTCTTAATTAAGGTCTGTAAA
TTACACGCTATAAGTATTTGTGAATGACAGCTTTCTGTCGTGTCTCATTG
ACGTAAGCGGTTAGGCGTTGGGGTTGTAAACCAAGGTTGCTTGCATTTGG
TGGTTCGAGCCAGAAAAATACTTAGAAAACAGTTAGAAACACTTGAGAAA
GACAGAAAATCAGGATAGTAGATAGGAAATTAGAAAATAGGGGGAAAATA
AGAGACGGTGCATCCAGGAGTATGATATTGTTTGCCAACCCAGATCCAGT
ATGGGGCGGATTTCGTGTAACTAACGCCGAAGATCTTCGGCGTACAACTG
AAACGTTTTTGGCGCATTGGCGTAAGGGTACTTACAAAGATTGTTTGATT
TTCAGTTGGCGTAAAGTAATAATTCCAGCTCGGCATGAATGACTCCATAA
TCCATCGATTTTTAGCTTTCATTTGGCTAAATTTATTGCTTTCGCTTGCT
TATAGTTATGCTCGCGTCAATTTATTAATTATGTCAGTGAGGCTGGAACA
TCGATTTTTGAGGATTACGATTTTACCAGCTTTTTAGCGATTTTTGCCTC
GCTAACCCAAATCTCGCAACCTCTTTATCTTAAAGGATGATCGAAATTAG
AGTTTTTCAGCGTTCCGAAAAAAACGCAAAGCAGAAATTTTTTCATCTTC
ACAGGATCGATTGTCAACAACAAAATACATCTTTTGGTCTTTGGGTTTGT
TTCTGACGTTTTTCCTTCAAAGAATATCGATCACTTTCCTTTTCCCCTTG
AGCGCGCGAGAAAAAAATGATTAGCTCGCATTCTCGCGCGGGCGAATAAA
GATGAGGCGGCAATCTTGCACTGAGGGTGGTACTTAGTTTCCGCCCTATT
TTGCGCCCACCATAGAATGGTCCAAATACGGGGGTATTCCAAATGATAAA
CGATGTCGTTCTGAGTGTTTTATTTTCTGCTAGATACAAATAGTATATTG
AATACTATTAACTTATTTATTTAAGTATTTTTGAGCCCAAATTTAAATAT
CTGGTTAAATAAAAAACAAATGACATCAGTTCTGTTTTTCCCTCAAACCC
CCGGGAAAAGTTTTTTTGCCGACTTAGCTATTTTACAAATTTCGGAAAAG
AACTCCCATAGGAATTCCGATTCATAACCCGATTGGTTCATTTCAGAACG
GCTTCAAGAAAGTCATAATGGCAGATAAATTTTAAAAGTTTCTCTGAGTA
AATGTGTGTAATTTATTGATGTTGATAGCTTGTTGATTCTTTAAAGAAGA
AAGATAACAGGTATAGCTTTTTCTAATCCTGGAATATCGAGGTTCCAGCT
ACACTGTATGTTGGCGCATGCGCCTCTTTTCCCATCTTGCACCCTTATTG
AAAAATTGAATGTTGGTACAAAAGAAATTTTGCTTGGCGTGAGGCTTGCT
GTACGGAAAAATATCTTTGGCGCGATATTTCGTGGAATCCATACTGGTAA
TAGACAGTGTCAATCGAACGAATCGAACGAATACTACCTAGGATTTGCCA
TTTGATTGCTTCGATAACGTTCTATTGTATTCGATTATGTTCGATTACGT
TCGATTGATTTAGATTTTAATCGCTTTCGTACAATACTTTAGCGCTCGGC
CGCCCATGCTAAAAAGCTCTAGCTTTTTTGTAGTGTTAAATGGTAAATAG
ATACTTACTTACTTACTAACGGAGTGATCCAATTTAATTTAATCGCAATC
AAACTCGTCGAACGTTATCGTAATCGAACAAAATTGAATATTAAATTGAA
TGTAATTGACAATCAATCGAACCAATGGAACATAGTCAACTATTAATCGA
ACCAATCTAACCTTACTCGAACGCAATCGAACACAATAGAATATTACCCA
GGAATTGACCGAGATTCGATTACGTTCGACAATGGAATTCGCAATTATTC
GATCGAGTTCGATTACGTTCGATTGGTTCGATTGCGATTTTTGTTCAAAG
TTGTTCGATTGACACCGTCTGGATGTTACCGGGCAAGGCATGAGATTGGG
TAACATGCATCAGCGGAGGCTAACATGCATAGCCCTCAAATGAATGACCT
GGCTGGTCATTAAAATACAAAGTTGAATCAAAACAAAAATAGTAGAGTAG
AGCTGCTAGTTCATTTGTTTTGAAATTTTGCTGCTTTGATTGCTGGTCAG
TCATTTGATGGCAATACAAGTTTCCCTCCACTGATGCAAGTTACCCAACT
TCACGGTATAACTTTTTTAATTTGTCAAGTTATAAGCTTTTAAAGTCAAA
ATTTGCTTTTGAAAAAGTCCAAAAACATGTCAAACTTTTACAGAAACCCT
CAAAATTTCACTTTGTTAATGACTTTTACAACTTAATTAATGATCCCAGC
TGATTTTGTTCAATTATCCCAACAAAAGCTATAATAATAATAGGCAAATA
ATAGGAAAACAGTAATTCTGAATGATTCTTAAAAAAAAATTAGTGAAAAA
TGTTTAAAAAAACTGATTTGATTTGATACTCCTTTCTAAGTGTTTTTGGA
CTTTTTCAAAAGTGAATTTTATTTTAGAACCACACTGTACCAATTTTAAA
AAGCTATCTGCCAACTTTCAAGTTTGTCTTTCCCCTTGACAATTTAAAAA
GAATATATTATATATACCAGGCGGTGTCAATCGAACTGTTCGATTATCGA
ACTTAATCGAACCCTATCGAACGATAGCTGTTCGATTACCGAACCCAATC
GAACACCTATCAAACCGGGAAAACATTTGTAAAGTTTGATGACTGTTCGA
TTATACGATTAAAGTTCGATCGCAGTTCGCTGAATACGATTGAGGTTCGA
TCAGTTCGATTAAGATCGATGAAGTTCGATTGGTTTGCTTAAATCGATTT
ATACCTTGCCGCCAAATTTTTTATTTATGTTCCGAGGGCGTATTGGCGGC
CGCCCACGGGCCATTCTCGCGGGCCATCCTATATCTATCCCATCGAATGG
GACAAGCTGGAGCTTTTACAAGCTCTTTGGTCGTTAATTTGTAAAAAAAA
GATTTTTATTTTTATTACTTTCTTTAAAGAAAGTATCATCTCTATTATTT
CAAATGAGCAATAATGAGTGAAGCATACGGTGCCTGTGTTTTGATTAAAC
AACCTCGTAATTTTCTGAAAGGTAAAGAAAAGTAGAATCAATCCGACACA
ATCATTGAACCACATCGAACTTTCATCGAACAACATCGAACTTAAATCGA
ACTCATCGAACATCAATCGAACTTCATCGAACAAAGAACACTCATCGAAC
TAAATCGAACTTATCAAGAATTTTTCGTAAAGTTTGATAGCTGTTCGATC
GGGTTCGGTAATCGAACAGCTATCGTTTGATTTTGTTCAATAAAGTTCGA
TGGTTCGATAACGAAAATCGGTTTGATAATGTTTGGTTGACACCGCCTGG
TATATATAGTAAAAATTCACATTATTTTGGACACAGTTATCCATCAAACC
TTTATACTTTTTTCTGGGTCACCCGGTACAATAGATTTTGAGTAAGATAG
TCAAAGGTCAATATCCCTTCTTCCTTGTCTTATTTTGGTACCCTTCTTAT
TGTTAGGATTAAAAAAGGTCAGAATCACTGATTGAAAAAAAAATGTTTTC
CTCTCTGACTGTTTATTAGCAATCAGTGATTCCGATTTTTTTTTGTTTTA
TTCTGGAATGCGTCTATTGACATTCTCTAATGAATGATTTTTTTAAAAGT
AAAAACCCAATTTTTTCTTTATTGGTACAACAACGACCCTTCCAGCGCAC
CAGACTATCTGGTGATTAACACCAGACTATTTTCATTTTATTGCGCGCAT
GACACACAGGACTTATTACAACCTGTTCAGTGTTTGTATTGTCTGGTGCT
AAAAAGTTTTCTCATTTGACACCTTCAAGTTCAGTGCGTTGGCAGGGTGT
TGTGTACTATGGAAATATAAGACTAGTGCTGATTGAACAGTTTTTTTATC
TCATATAGATTTGATGATGACATGGACAATGCTGGGGATGATGACTTTGA
GGAACCTGATGAGAATTTGGTAAGCAATAATTTGTATGATAAAATATTTT
GTATAAAATAGAATAGCTTTTCTAAGATATTTTGAACTTAATCAAATCTC
TTGCAAAGTCAGACAATGTTATTAAAGATCACAAATTTCTGAGAAAAATA
AGTTTTTCAAAGCATAACCTTTTACAAACTATGGTTTCAGATAACATTCA
ACGTATCGCAGCCCATTGCATGAAAATTTTAAAAGCATGCAGAAAATTAA
GCCTTAATAAGCAGTTTCTCTTTGTTTATACAGGGTGACGACATGCCTCA
AGTAGATGTGCTCCCTGCAACAGGTAACAAAGTGCATAGCTCTTGATAAT
TTTCACAATCAACAGAGACTTTATTTGGATAAAGCTTAAGAAGATATAAT
TTTATCGATATTTGATTTTTTAAATGGTAAAATAGGTTTTCCTAAATAGA
CTTAAATGTATATGTAATATGTAATTTATGTAATTTTTTTGTAGATGATA
ACCAACCACAAGCTCCAAAGAAAAAAGTGACAACTCCATACATGACAAAA
TATGAAAGAGCAAGAGTTCTTGGTACAAGGGCTTTACAAATCAGGTAATT
GTGGAGTGATTTATTAAAAAGGGATAGTTTATTTTATGTCCTCAATGCTA
TGTATGTACAGTATGCAATTAGGGGTCATGACAACCCCTATTTATGTAGC
TTTCCCCTTATCATGCATCCAATTTGTTTTTTTAGTTTCCAATTAGGAGT
TTACCAATTGAAATACGCAAAAAGCTTAAAATTTCTGTAGTAAAGTGTAA
ATGTAAAATGGTCGCACAAGTAAAAATTTTGCCATTTACATTGATCCAAT
TATTTAGGTGTTATGATATGATATTACAGTATGATACATAATTTGATCAA
AATATTGTTAACCCTCTACCCTAAAAGCTTTAAAACCCCTATCGTATTTG
GAAGAAGTCTTACACGTCAAAGCTTTTTTTTTTAATATGAAAAGTTGGAC
TTGTGTGGAAAAGTTGGACTTACACTCTCTGTGCAGATTCTGGCATTATG
CCAAGCAACAGTTGTGATGTTGTTTGGAGGGCGTTGTGATTTCTGTTAGA
TTACCTTTGTCCGCTTTGCCCATTGTGGATTCTGTTATCAACAACTTAGT
TTCTGTATTCAGCTTACTGAGGATTAAAGAATTTTTATGCTTAAAAAAGA
AGAATATAGTATAAAGCAACGAAATTGCTAAGCATGTAAATAAGTTTTAT
CTAAGAATATTAGAGAGGTATAATAAGTAAGTGTATTATAATGATTATGC
TGGCATTATGCCAAGGTTTTTTCATAAGTTCGATTTCTTCAGTTAAATGA
ATGACAAAAGTGAAAGAAGTAAAATATATTTGAATTATGTTTTTCATAAT
TTTACATTTTATACTCAAAGTAAACACATATCACTTATATATTCCTGATA
ATTTGGGAAAGTCAAGCTAAATGTGATATACTGACATGTAACAAATAGGT
TCTGAAGTTCTAACCTCCATTTTCCCTGCAGCGAATAGGTTGATCCTTAA
AAAAACAACTTGGTAGTTAAAGGGTTAAAAAAGGGTCCAAGCTGTAGAAT
GTTTTCAGACTGAATCATTGTCAATCAAACATTTTGATTATTTGTTTTGT
TTTTAGTATGAATGCTCCTGTGATGGTTGAGCTGGAAGGTGAAACAGACC
CTCTACAAATTGCCATGAAAGAATTAAAGTAAATCATTACATTATTTGTG
CTTTTCAAAATGAAGTTTTTTTTTTTAATCTTTATAGTATAATTTCTTTC
AATGCAGCTTTAGTTTTATAGCTGCAAAATCCAATACTCTACGGTCCTAA
CTCTTTGTCCTCGCTCTTTGTCCTCATCTTACATTGTCTGTTAAGCTACC
AGAGTATTGGCCATCATTTATCTAAAGAAAATTGTAACAACAAGCATTTG
TAAAAAAGATAGGTTCTTAGAGGCCCACGGCGCACCTTGAACCTCAATCC
TGAATAATATAATCAATGTTGCAACTTTTTCGTCTGTAAACCAAAATCTG
TCCAATTGAGATTTCAAACTAGGAGTTTCGTCCTGGTAGCTTTGAAGCAA
TGATGTTAAATTGGTGTATAGTTTTGAACTTTTCGCCCAGCTTCACCCAG
CTTCACCAAAGGCAGTTGCAACACTGGGGCATAATCGAAGGTCATTTGCC
CGTTGAAATACTCATACTCTCTTTCTCTCTTTCAGAGCCAGAAAAATCCC
TATCATTATTCGACGATACCTACCAGATGGAAGTTTTGAAGATTGGGCAA
TTGATGAGCTGATTATTGATTAAAAACTTTTGGATTGTAGTACTAGCACA
TAGTTTATTTATAAGAACTTTTTTATTGTAAATATTGGTGGTCAAACTCA
ATTCTTTTCAGTGGTGCTAAATCAAATTTACTTCAGAGAAGACAGAGGAA
GAAACATTTAAGGAACAAAACTTTTTTACCCTGTGAAACGGACACACAAA
GCAATATACTATGAACAATAAAAATGACATCATCATTTTGTAATGAACAG
CACGGCATTTATTTTGTATTCTGAAATACATCATTTTATATTTGTTTTAC
TA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:280191..287542- >MSTRG.11151.2.p1 ID=MSTRG.11151.2.p1|Name=MSTRG.11151.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2394bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:280191..287542- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGCCAGAAAAATCCCTATCATTATTCGACGATACCTACCAGATGGAAGTT
TTGAAGATTGGGCAATTGATGAGCTGATTATTGATTAATATGAATGCTCC
TGTGATGGTTGAGCTGGAAGGTGAAACAGACCCTCTACAAATTGCCATGA
AAGAATTAAAATGATAACCAACCACAAGCTCCAAAGAAAAAAGTGACAAC
TCCATACATGACAAAATATGAAAGAGCAAGAGTTCTTGGTACAAGGGCTT
TACAAATCAGGGTGACGACATGCCTCAAGTAGATGTGCTCCCTGCAACAG
ATTTGATGATGACATGGACAATGCTGGGGATGATGACTTTGAGGAACCTG
ATGAGAATTTGATGGCGGACGAAGAAGATGTTGGAGATGGCATGGGAGGA
GCCAGAAAAATCCCTATCATTATTCGACGATACCTACCAGATGGAAGTTT
TGAAGATTGGGCAATTGATGAGCTGATTATTGATTAATATGAATGCTCCT
GTGATGGTTGAGCTGGAAGGTGAAACAGACCCTCTACAAATTGCCATGAA
AGAATTAAAATGATAACCAACCACAAGCTCCAAAGAAAAAAGTGACAACT
CCATACATGACAAAATATGAAAGAGCAAGAGTTCTTGGTACAAGGGCTTT
ACAAATCAGGGTGACGACATGCCTCAAGTAGATGTGCTCCCTGCAACAGA
TTTGATGATGACATGGACAATGCTGGGGATGATGACTTTGAGGAACCTGA
TGAGAATTTGATGGCGGACGAAGAAGATGTTGGAGATGGCATGGGAGGAG
CCAGAAAAATCCCTATCATTATTCGACGATACCTACCAGATGGAAGTTTT
GAAGATTGGGCAATTGATGAGCTGATTATTGATTAATATGAATGCTCCTG
TGATGGTTGAGCTGGAAGGTGAAACAGACCCTCTACAAATTGCCATGAAA
GAATTAAAATGATAACCAACCACAAGCTCCAAAGAAAAAAGTGACAACTC
CATACATGACAAAATATGAAAGAGCAAGAGTTCTTGGTACAAGGGCTTTA
CAAATCAGGGTGACGACATGCCTCAAGTAGATGTGCTCCCTGCAACAGAT
TTGATGATGACATGGACAATGCTGGGGATGATGACTTTGAGGAACCTGAT
GAGAATTTGATGGCGGACGAAGAAGATGTTGGAGATGGCATGGGAGGAGC
CAGAAAAATCCCTATCATTATTCGACGATACCTACCAGATGGAAGTTTTG
AAGATTGGGCAATTGATGAGCTGATTATTGATTAATATGAATGCTCCTGT
GATGGTTGAGCTGGAAGGTGAAACAGACCCTCTACAAATTGCCATGAAAG
AATTAAAATGATAACCAACCACAAGCTCCAAAGAAAAAAGTGACAACTCC
ATACATGACAAAATATGAAAGAGCAAGAGTTCTTGGTACAAGGGCTTTAC
AAATCAGGGTGACGACATGCCTCAAGTAGATGTGCTCCCTGCAACAGATT
TGATGATGACATGGACAATGCTGGGGATGATGACTTTGAGGAACCTGATG
AGAATTTGATGGCGGACGAAGAAGATGTTGGAGATGGCATGGGAGGAGCC
AGAAAAATCCCTATCATTATTCGACGATACCTACCAGATGGAAGTTTTGA
AGATTGGGCAATTGATGAGCTGATTATTGATTAATATGAATGCTCCTGTG
ATGGTTGAGCTGGAAGGTGAAACAGACCCTCTACAAATTGCCATGAAAGA
ATTAAAATGATAACCAACCACAAGCTCCAAAGAAAAAAGTGACAACTCCA
TACATGACAAAATATGAAAGAGCAAGAGTTCTTGGTACAAGGGCTTTACA
AATCAGGGTGACGACATGCCTCAAGTAGATGTGCTCCCTGCAACAGATTT
GATGATGACATGGACAATGCTGGGGATGATGACTTTGAGGAACCTGATGA
GAATTTGATGGCGGACGAAGAAGATGTTGGAGATGGCATGGGAGGAGCCA
GAAAAATCCCTATCATTATTCGACGATACCTACCAGATGGAAGTTTTGAA
GATTGGGCAATTGATGAGCTGATTATTGATTAATATGAATGCTCCTGTGA
TGGTTGAGCTGGAAGGTGAAACAGACCCTCTACAAATTGCCATGAAAGAA
TTAAAATGATAACCAACCACAAGCTCCAAAGAAAAAAGTGACAACTCCAT
ACATGACAAAATATGAAAGAGCAAGAGTTCTTGGTACAAGGGCTTTACAA
ATCAGGGTGACGACATGCCTCAAGTAGATGTGCTCCCTGCAACAGATTTG
ATGATGACATGGACAATGCTGGGGATGATGACTTTGAGGAACCTGATGAG
AATTTGATGGCGGACGAAGAAGATGTTGGAGATGGCATGGGAGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:280191..287542 - |
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