|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000080_pilon:158880..163787- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11143.8.p1 ID=MSTRG.11143.8.p1|Name=MSTRG.11143.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4908bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:158880..163787- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTCAAATATTCGATTAGAAATCCCCCTGATGTGTTTTATCTCACACGTGT
TTACACAAGCAGTCTGGGTACTAGCTACTTAACACGTTATATATACAGAG
GATTTGCAAGACAGACATTCACATTGTTGTTGGTATTTGTCGTCGTAGCA
TCTCATATTTTCGCAGAGCTCTTTATTCATCATGAATAAGTTTATAATCA
TCGCTTTGGTAAGTTGACTTTGAATATGGCATAGGGGATAGAGGATATAA
CATTTTTTGGAAATTTACCCCGCGGACAAGCATTCCTAGACATTAGCCTC
AAACAGAGCAAAATTACCCCAAACAGAGCAAGTTCACCCACCGCAAGTGA
ACTTTCAAAATCTGCAGCAAGTTTGATGAAATATTTGAGATAAAAATCTC
ATTTGCTCAAAAGTGGGGAGGCTCAAGTCTCTCCAGTCTCCCCGCTTCCT
TCCACCGGGCCTGAGAATGATCTAAAATTGGATCTTCATTTTTTTTTAGA
GTTTTATCCTTTCATTAAATGCAACTTTTCTTTTTATAATCAGGTTGGTT
TGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAGTAAGTAGAATTGAAAATTT
GATTTCATGTCGCTTACAAACACCCCTTTAGTGTAGTGGCTTGGCTTGAA
AAAATTCATTTTTTCATTTTTTATATTTTCATCTTAATTGCCATCATAAA
ATACAACTTTGGGCCAAATATATTTTGAATTTCCGGTTATGACATCATCA
CTAAAATGGCCTAAAAAAGAGTATTCCACCGATGAAAATTTAGGGGAATT
TTTTTATGTGGTTAAAGGATACTATAAGGAGGTGCAAAATTTTAAGCCGG
GTTATTTTGAATTTCCTACAAAGAGTGCTTTTTTAGCTGGCACGACCATA
CTACCTTTATGAGTGACCAAAAGAATTTTGATTCCCCAGGTTGTCTATGC
ATGAAAGGTTAGGATGTGTGCCGCCCTTAAAAATACCTTTTTGGACCTGG
AAGTCGTTGCAAGGATTGAAAGTTTCAAGTTTTTAATTTTTGAAAGATTG
AAATTTTGTTAAATTAGTCCCAACAACAGTCGTAAAAATTCACAAAATTT
TGCAACATTATTTTTCATAAAAACACGCTATACATTATTTTTCAGAATGT
AGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGC
AAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTAAGATCATTGATTTCAAAC
TCCGAATAGGCAAGACCCGAGACTCTTGGATGGGAAATGAATCCACTTAT
TTCTCATCCAAAATGCGTGACCCCGTGATTTTTACATAAACGCCAGAAAA
GTTTTCACGCACCTGCCCACGTGAGTACGTTCGAAAAGGTTTATTGAGGG
GCATTACGCTAAGGTTTGTAACAACATCTGCATGGATACGAGCGCTTACT
AAACTTGCCTTTATTTATAGAATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTTCT
GCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAATGC
AACGGTAAGGGAATAACTATTTAGAATTGATATTTATTTAATGGATGCAC
ATCCTGTTTTATGGGAAATACGAACTTTAATATACCTGAGCTTTGATTGG
ATTTAATTTCGCGAGCCAAAAAATCACGAAATTTTCTGGATTTATTTTGA
CGAATTGGCGTTTTCAAATATTTCACGTTGTATTTTTGTAAAAACGCAAA
TAATTTTATCTGATTTAAAGTATGTCTCAGTAAAAGATTTCAGCCTATGC
TGAACTAAATGTCATCACTGTAATACTTATGTAAACAGCGTTAGTGCGTT
GATTCGGTAAGCGGCAAATTGTCATCTTCTTCTCATTCTTCGTTCTAGAA
TGTCCAATGCAAAGGTGTCGTATGAGATGTGAATATGGCTTCAAGAAGGA
TGAAGAAGGCTGTGAAATCTGTGAATGCAATGGTACTAAAAAGATCGATT
TTTTAACAATTGTACCTAACTTCTGTATTTCTGCATATGATTTTTATGTG
ATCTTAATAGTTCCAGGGAGGGGAGAGAAAAAAAATATTTTGGGTTCCAA
ATGTCCTCTTATGCAGTTTTACAGCGTAGGAAAAATTGAATTTATAATGT
TTTTAAGGGAGGTATCTTATTCTTAAGTAACTGGTGGAATGGTCGGTGGT
GACTAACATATCCCTTCAACAATATTGCAAATAAAGGAAAGGATTCACAG
TTCATGTCCTAAATATCAATTTCTTTTTGTATTTCACAGAATGCCCACAA
AGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAGCAGACAAATTCTTT
TGATGCAAAATTGCATTAAGGATGGATCAGTTCATAAATATCAATTTGAT
TTCATTTGAAATATTCAAGGAGATCTGACAAATGCAAAAAAATGGCAAGG
TCAGAAAAATAAGAAAATGGCCCTTCATGGTGTTAAAAATATGTTAAAAA
TATTTCATAAACAAATTCAAAACTTTGCAAAATCAAAAGATTTCTGAATT
CAAGATAACTGTTTTTCTCCAATTTTATTTCAGAAGTCGCCCCAATGATG
GACGAAAAATGTCCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGATT
CCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAATGTAACAGTATGCAAC
TATATCAATTATTTTAGTTTAATATTTGTTAGATTTGTGAAACTTGTAAG
CCATTGGCACTCTCTAACACTCTGCTACTTCATTCAATTCAAATGATCTT
CAAAACTTAAATAATGCAAATCTGACACTTTTTACCGAAAGAAAATCACT
TTTCACTAAAACTAAATTTTTCATCCTGACAGAATGCCCACAAAGACAAT
GCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAA
ATCTGTCAATGCAAAGGTTAGAAAAAAGTTTTTAAAAAATATTGTTCAAT
TTCTATGAGAAAAGCGTTCACAGTATTTTTTCAGGTTATCTAACGGTAAG
AAAGCAACCCAAATTTGATTTAGGTCCCATAATCTGACTTATGTTTTATA
TTACATAAACAGGCAACCGAACTCTCAATTATATTTTAGAAGTTGCTCCA
ATGATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGCAAGAA
CGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAGTGCAATGGTA
TACAACTATTAAACACGCCTAATTCCAGATAGCAATAGTATTTTGGAGAG
AGGCTGAATGACATAATTCAAAGTCAGGGGAGAATTTCCACGCCTGACAA
ATAATACTTGATACAGCTCAAAGCTTCAAACAATTTTGAATTTTGAATTA
CCATCTAGCCTAAACTAGCTGTTTGTAAACCCGGGGTCTTCGAAACACAA
AAATGAAAAGTGAGAAAAAGTTGACACCCTGGGTATTCAGTGTACTGTTT
CTATATCATTTAATTTATCCATGTCAGTGTACCAACCCCTTTCCACAGAC
CCATTGGGATCCCTTCCCACTGAAGGGAAAGTCCAAAAAGTCGTCCCGGT
GAAAATTATTCTCCAATTTTTATCCCCACTGAAAATAATCAATTAAACCA
ATCCTCACTGCAAAATGTTATGCTATTTTTTCCATCCCCACTGAAATTTC
TGACTTGAAAACAAAAGAATTGAAAGCCCAAGTCATAAAAAATACGGGAA
TATCAATCCCAATCGAGTTTCAATCTGTTATTTTTATCCCCACTGGCTGA
AAAAATCCTACCGGGTCTGTGAGCAGGGGGTGTAGTGTACTGTTTCTAAG
AGGCTATTATTATCAGTGCTTGGGCAATGTTAATATATCTATATTGCATG
TTTTTTAGAATGTCCACAACAACAATGTCGTATGTTCTGCAAAAATGGAT
TCCAAAAGAACGCCAACGGCTGTGAGATCTGCAAATGCAACGGTAAGGGA
ACTGTTTAGTTGATTCAACTTGCCTGTATCACTAACCAAATAAAAGGGAG
TAATCGAAAGTGCTAAATCAGGAATAATGGAATATATCTTGCATGTTGTC
CAAGAATAGGACAATCCTAATGCTGAAAGCTCAGGCGACTCTTATATGAA
AGCTTAATCTAAATACTGTAGGACAGTTAAACTTTCTCGTTCCCAGGGAA
GTTTTCCTATAGCCACTATAGCGGAAAAAGGCCAACACGCGGGGAATGTA
AAAGTGATTTAAATTTGTTAGGTGTTGTGTATTATCTACGTGTTTGTACG
CAGCAAAAAAGCAGGTATACCCTTAAAAACACCGGAAAGATCTTGGAAAT
GCCACCAAAAATGTTTCCTCTGGATTGGAGAGAGTTTAGCTGTCCTACGG
TACCTTGGGAGGTGTAACTTGTTCTCTGCAACAAAATTACTTATAAATAT
TCTCTACAGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGTCCAAATGGA
TTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGCCAATGCAAAGGTTAGAA
AAGACATTTGATTTGGTTAAATATTTTCTAAATATTCTGTGGTCTGAATC
TAGCCTAGAGTTAAGGAGATCTTTGTAAGTTAAAAAGCTGAGATTTTCTT
TTACTTCCATCTCATTCCCCTCTAAAATTTACCGTTTCGTTGAGATGATT
AAAGGAAAATTCAATCTCTTTTCTCTTTTTCAGAAGTCGCACCAATGTTT
TAAGAAGTGGACGAACTTGCGGAGTTATATAGATTTTGGCTATAGTTTTT
TTATACATTTTAGCAAATTTTGAGATATGACAAAATATAATAATATTCGA
AATAATATTAAAATTTTAATCTTTATCTTCGAAGAATTAGACTTCTTGTG
TATCTTGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:158880..163787- >MSTRG.11143.8.p1 ID=MSTRG.11143.8.p1|Name=MSTRG.11143.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5481bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:158880..163787- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGTCGCACCAATGTTTTAAAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGAT
GTCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGCCAATGC
AAAGAATGTCCACAACAACAATGTCGTATGTTCTGCAAAAATGGATTCCA
AAAGAACGCCAACGGCTGTGAGATCTGCAAATGCAACGTTGCTCCAATGA
TGGACGAAAAATGCCCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGA
TTCCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAGTGCAATGAATGCCC
ACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAA
ATGGTTGCCAAATCTGTCAATGCAAAGAATGTCCACAACAGCAATGCCGT
ATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCTG
CAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATG
GATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTTGG
TTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAATAAGTTTATAATC
ATCGCTTTGAAGTCGCACCAATGTTTTAAAATGCCCACAAAGACAATGCA
GAATGCGATGTCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATC
TGCCAATGCAAAGAATGTCCACAACAACAATGTCGTATGTTCTGCAAAAA
TGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGCTGTGAGATCTGCAAATGCAACGTTG
CTCCAATGATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGC
AAGAACGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAGTGCAA
TGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAAC
AAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGTCAATGCAAAGAATGTCCACAACAG
CAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATG
TGAGATCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTT
GCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGC
AATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAATAAG
TTTATAATCATCGCTTTGAAGTCGCACCAATGTTTTAAAATGCCCACAAA
GACAATGCAGAATGCGATGTCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGT
TGCCAAATCTGCCAATGCAAAGAATGTCCACAACAACAATGTCGTATGTT
CTGCAAAAATGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGCTGTGAGATCTGCAAAT
GCAACGTTGCTCCAATGATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGACAATGCCGT
ATGTTCTGCAAGAACGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTG
CAAGTGCAATGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATG
GATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGTCAATGCAAAGAATGT
CCACAACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGT
CAATGGATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCA
AAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTC
TGCAAATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCA
ATGAATAAGTTTATAATCATCGCTTTGAAGTCGCACCAATGTTTTAAAAT
GCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGTCCAAATGGATTTGAACAAGAC
AAAAATGGTTGCCAAATCTGCCAATGCAAAGAATGTCCACAACAACAATG
TCGTATGTTCTGCAAAAATGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGCTGTGAGA
TCTGCAAATGCAACGTTGCTCCAATGATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGA
CAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGATG
TGAAATCTGCAAGTGCAATGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGAT
GCCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGTCAATGC
AAAGAATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAA
AAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAG
TTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGT
TGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAG
AGGCTAGCAATGAATAAGTTTATAATCATCGCTTTGAAGTCGCACCAATG
TTTTAAAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGTCCAAATGGATTT
GAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGCCAATGCAAAGAATGTCCACA
ACAACAATGTCGTATGTTCTGCAAAAATGGATTCCAAAAGAACGCCAACG
GCTGTGAGATCTGCAAATGCAACGTTGCTCCAATGATGGACGAAAAATGC
CCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGATTCCAAAAGAACGC
CAACGGATGTGAAATCTGCAAGTGCAATGAATGCCCACAAAGACAATGCA
GAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATC
TGTCAATGCAAAGAATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGAA
CGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAAT
GTAGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGAT
GCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGG
CTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAATAAGTTTATAATCATCGCTTTGAAGTC
GCACCAATGTTTTAAAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGTCCA
AATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGCCAATGCAAAGA
ATGTCCACAACAACAATGTCGTATGTTCTGCAAAAATGGATTCCAAAAGA
ACGCCAACGGCTGTGAGATCTGCAAATGCAACGTTGCTCCAATGATGGAC
GAAAAATGCCCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGATTCCA
AAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAGTGCAATGAATGCCCACAAA
GACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGT
TGCCAAATCTGTCAATGCAAAGAATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTT
CTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAAT
GCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTC
CAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTTGGTTTGG
CCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAATAAGTTTATAATCATCGC
TTTGAAGTCGCACCAATGTTTTAAAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATG
CGATGTCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGCCA
ATGCAAAGAATGTCCACAACAACAATGTCGTATGTTCTGCAAAAATGGAT
TCCAAAAGAACGCCAACGGCTGTGAGATCTGCAAATGCAACGTTGCTCCA
ATGATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGCAAGAA
CGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAGTGCAATGAAT
GCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAACAAGAC
AAAAATGGTTGCCAAATCTGTCAATGCAAAGAATGTCCACAACAGCAATG
CCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGA
TCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAA
AATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCG
TTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAATAAGTTTAT
AATCATCGCTTTGAAGTCGCACCAATGTTTTAAAATGCCCACAAAGACAA
TGCAGAATGCGATGTCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCA
AATCTGCCAATGCAAAGAATGTCCACAACAACAATGTCGTATGTTCTGCA
AAAATGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGCTGTGAGATCTGCAAATGCAAC
GTTGCTCCAATGATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGACAATGCCGTATGTT
CTGCAAGAACGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAGT
GCAATGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTT
GAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGTCAATGCAAAGAATGTCCACA
ACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATG
GATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATG
TTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAA
ATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAA
TAAGTTTATAATCATCGCTTTGAAGTCGCACCAATGTTTTAAAATGCCCA
CAAAGACAATGCAGAATGCGATGTCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAA
TGGTTGCCAAATCTGCCAATGCAAAGAATGTCCACAACAACAATGTCGTA
TGTTCTGCAAAAATGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGCTGTGAGATCTGC
AAATGCAACGTTGCTCCAATGATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGACAATG
CCGTATGTTCTGCAAGAACGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAA
TCTGCAAGTGCAATGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCA
AATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGTCAATGCAAAGA
ATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAG
ATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATG
TGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGA
AGTCTGCAAATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCT
AGCAATGAATAAGTTTATAATCATCGCTTTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:158880..163787 - |
|
