|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000080_pilon:161443..163787- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11143.14.p1 ID=MSTRG.11143.14.p1|Name=MSTRG.11143.14.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2345bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:161443..163787- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTCAAATATTCGATTAGAAATCCCCCTGATGTGTTTTATCTCACACGTGT
TTACACAAGCAGTCTGGGTACTAGCTACTTAACACGTTATATATACAGAG
GATTTGCAAGACAGACATTCACATTGTTGTTGGTATTTGTCGTCGTAGCA
TCTCATATTTTCGCAGAGCTCTTTATTCATCATGAATAAGTTTATAATCA
TCGCTTTGGTAAGTTGACTTTGAATATGGCATAGGGGATAGAGGATATAA
CATTTTTTGGAAATTTACCCCGCGGACAAGCATTCCTAGACATTAGCCTC
AAACAGAGCAAAATTACCCCAAACAGAGCAAGTTCACCCACCGCAAGTGA
ACTTTCAAAATCTGCAGCAAGTTTGATGAAATATTTGAGATAAAAATCTC
ATTTGCTCAAAAGTGGGGAGGCTCAAGTCTCTCCAGTCTCCCCGCTTCCT
TCCACCGGGCCTGAGAATGATCTAAAATTGGATCTTCATTTTTTTTTAGA
GTTTTATCCTTTCATTAAATGCAACTTTTCTTTTTATAATCAGGTTGGTT
TGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAGTAAGTAGAATTGAAAATTT
GATTTCATGTCGCTTACAAACACCCCTTTAGTGTAGTGGCTTGGCTTGAA
AAAATTCATTTTTTCATTTTTTATATTTTCATCTTAATTGCCATCATAAA
ATACAACTTTGGGCCAAATATATTTTGAATTTCCGGTTATGACATCATCA
CTAAAATGGCCTAAAAAAGAGTATTCCACCGATGAAAATTTAGGGGAATT
TTTTTATGTGGTTAAAGGATACTATAAGGAGGTGCAAAATTTTAAGCCGG
GTTATTTTGAATTTCCTACAAAGAGTGCTTTTTTAGCTGGCACGACCATA
CTACCTTTATGAGTGACCAAAAGAATTTTGATTCCCCAGGTTGTCTATGC
ATGAAAGGTTAGGATGTGTGCCGCCCTTAAAAATACCTTTTTGGACCTGG
AAGTCGTTGCAAGGATTGAAAGTTTCAAGTTTTTAATTTTTGAAAGATTG
AAATTTTGTTAAATTAGTCCCAACAACAGTCGTAAAAATTCACAAAATTT
TGCAACATTATTTTTCATAAAAACACGCTATACATTATTTTTCAGAATGT
AGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGC
AAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTAAGATCATTGATTTCAAAC
TCCGAATAGGCAAGACCCGAGACTCTTGGATGGGAAATGAATCCACTTAT
TTCTCATCCAAAATGCGTGACCCCGTGATTTTTACATAAACGCCAGAAAA
GTTTTCACGCACCTGCCCACGTGAGTACGTTCGAAAAGGTTTATTGAGGG
GCATTACGCTAAGGTTTGTAACAACATCTGCATGGATACGAGCGCTTACT
AAACTTGCCTTTATTTATAGAATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTTCT
GCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAATGC
AACGGTAAGGGAATAACTATTTAGAATTGATATTTATTTAATGGATGCAC
ATCCTGTTTTATGGGAAATACGAACTTTAATATACCTGAGCTTTGATTGG
ATTTAATTTCGCGAGCCAAAAAATCACGAAATTTTCTGGATTTATTTTGA
CGAATTGGCGTTTTCAAATATTTCACGTTGTATTTTTGTAAAAACGCAAA
TAATTTTATCTGATTTAAAGTATGTCTCAGTAAAAGATTTCAGCCTATGC
TGAACTAAATGTCATCACTGTAATACTTATGTAAACAGCGTTAGTGCGTT
GATTCGGTAAGCGGCAAATTGTCATCTTCTTCTCATTCTTCGTTCTAGAA
TGTCCAATGCAAAGGTGTCGTATGAGATGTGAATATGGCTTCAAGAAGGA
TGAAGAAGGCTGTGAAATCTGTGAATGCAATGGTACTAAAAAGATCGATT
TTTTAACAATTGTACCTAACTTCTGTATTTCTGCATATGATTTTTATGTG
ATCTTAATAGTTCCAGGGAGGGGAGAGAAAAAAAATATTTTGGGTTCCAA
ATGTCCTCTTATGCAGTTTTACAGCGTAGGAAAAATTGAATTTATAATGT
TTTTAAGGGAGGTATCTTATTCTTAAGTAACTGGTGGAATGGTCGGTGGT
GACTAACATATCCCTTCAACAATATTGCAAATAAAGGAAAGGATTCACAG
TTCATGTCCTAAATATCAATTTCTTTTTGTATTTCACAGAATGCCCACAA
AGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAGCAGACAAAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:161443..163787- >MSTRG.11143.14.p1 ID=MSTRG.11143.14.p1|Name=MSTRG.11143.14.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2232bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:161443..163787- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAGCAG
ACAAATAATGTCCAATGCAAAGGTGTCGTATGAGATGTGAATATGGCTTC
AAGAAGGATGAAGAAGGCTGTGAAATCTGTGAATGCAATGAATGTCCACA
ACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATG
GATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATG
TTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAA
ATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAA
TAAGTTTATAATCATCGCTTTGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCG
ATGCCCAAATGGATTTGAGCAGACAAATAATGTCCAATGCAAAGGTGTCG
TATGAGATGTGAATATGGCTTCAAGAAGGATGAAGAAGGCTGTGAAATCT
GTGAATGCAATGAATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGAAC
GGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAATG
TAGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATG
CAAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGC
TTTGTCAGAGGCTAGCAATGAATAAGTTTATAATCATCGCTTTGAATGCC
CACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAGCAGACAAAT
AATGTCCAATGCAAAGGTGTCGTATGAGATGTGAATATGGCTTCAAGAAG
GATGAAGAAGGCTGTGAAATCTGTGAATGCAATGAATGTCCACAACAGCA
ATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTG
AGATCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGC
AAAAATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAA
TCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAATAAGTT
TATAATCATCGCTTTGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCC
AAATGGATTTGAGCAGACAAATAATGTCCAATGCAAAGGTGTCGTATGAG
ATGTGAATATGGCTTCAAGAAGGATGAAGAAGGCTGTGAAATCTGTGAAT
GCAATGAATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTC
AAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCC
AGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGCAAATG
GTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTC
AGAGGCTAGCAATGAATAAGTTTATAATCATCGCTTTGAATGCCCACAAA
GACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAGCAGACAAATAATGTC
CAATGCAAAGGTGTCGTATGAGATGTGAATATGGCTTCAAGAAGGATGAA
GAAGGCTGTGAAATCTGTGAATGCAATGAATGTCCACAACAGCAATGCCG
TATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCT
GCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAAT
GGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTTG
GTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAATAAGTTTATAAT
CATCGCTTTGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGG
ATTTGAGCAGACAAATAATGTCCAATGCAAAGGTGTCGTATGAGATGTGA
ATATGGCTTCAAGAAGGATGAAGAAGGCTGTGAAATCTGTGAATGCAATG
AATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAA
GATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTAT
GTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTG
AAGTCTGCAAATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGC
TAGCAATGAATAAGTTTATAATCATCGCTTTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:161443..163787 - |
|
