MSTRG.11140.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11140.1.p1
Unique NameMSTRG.11140.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000080_pilon:121668..143597-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11140.1.p1 ID=MSTRG.11140.1.p1|Name=MSTRG.11140.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21930bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:121668..143597- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:121668..143597-

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AAGGTAGTTTTGAGGTCGGTGGCACCATCTACCCTGTCGCTATTAAGGAT
GCGTGAGCACGTGGAAGACCCAAATAAAAATCCCATCCTTATTTTTCCTG
AAGATTGGTCAAATGCAAGGTGGAATTATGGGTATGATGCAGAAAGCCTT
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GGATGTTGGTGGTTAGAAGGGAAAATATGGCTCAAGGTGGTGGATTGTGC
GTTGCTAATCATACTTCACCTCTGGATGCTATTCTATTGGCATGTGACAG
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GGATTTCGTATTCTAGCACGTGGAATTTCTGCAGTGGTTCGATTTCATAA
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GCACTTGGATTTTTTGTTCGATACTTCATTTTCTTACCTGTTAGAACTCC
CTTCCTGGAATCTACTAACAAGAACAAATGTACATTATCAATTCATTAGG
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GAATGAAAACGCGATAATGTTTGCTAATCGAGTGAAAAGTGATATTGCGA
AGAAAGGCGGCTTAGTCGATCTTGTTTGTATGACGCAACTTTTGGTAATG
CGTTTTGGAACTCCATGAAAGAACCCATGTTAACCTATTTGATCAACATG
ATGACCAGTTGGGCCATCGTATGTGATGTATGGTACATGCCGCCAACTGA
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TAGTTTTGAGGTCGGTGGCACCATCTACCCTGTCGCTATTAAGGATGCGT
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AAAGCACAAGATCACATCTTTTTTGAACGTGGTGAAATGAAAGATAGGAT
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TTCGTATTCTAGCACGTGGAATTTCTGCAGTGGTTCGATTTCATAATCGG
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GGCTCCTCATATTTCCAATGAGGCCTTACGTCTTACAATCATTTGGGCAC
TTGGATTTTTTGTTCGATACTTCATTTTCTTACCTGTTAGAACTCCCTTC
CTGGAATCTACTAACAAGAACAAATGTACATTATCAATTCATTAGGTCAT
AATGGAAGATGAAGTAACAAAACGTTTTTCAGCGGCTGGTATCATAGACC
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TTTAGAACATTAGAAAAACAATTTCATCTGGGAGATATTTGTGAAATATG
CAAAGATGGAATGGAGTTTGGTTATGATAGGATGAAGAAAAACAATAACC
TGAATGAGGCAGCTAGTGATGGAGCCTATTACTTTGTTGTACTGGGCAAT
GTTGTATTTAATTGGCATCTTTTTTACGGTAGTCATACCTGCAGCTTTCA
ACATATCACTTGGATTGAGAGACAAATATATTCAATTGCTTTACAAGGTG
TTTGAGGGATGGGGGTTTGAAACGAGCAAGTGTACCGACCAAGTTAAAAG
AACAAGAACAAAAGAAATATGCCAAGAATATCAAAACGGAATGAGAGAAT
GAAAACGCGATAATGTTTGCTAATCGAGTGAAAAGTGATATTGCGAAGAA
AGGCGGCTTAGTCGATCTTGTTTGTATGACGCAACTTTTGGTAATGCGTT
TTGGAACTCCATGAAAGAACCCATGTTAACCTATTTGATCAACATGATGA
CCAGTTGGGCCATCGTATGTGATGTATGGTACATGCCGCCAACTGAAATC
CTAGAACTTGTATCAATAATACCTCTGTTATGATGTTTAAGAAAGGTAGT
TTTGAGGTCGGTGGCACCATCTACCCTGTCGCTATTAAGGATGCGTGAGC
ACGTGGAAGACCCAAATAAAAATCCCATCCTTATTTTTCCTGAAGATTGG
TCAAATGCAAGGTGGAATTATGGGTATGATGCAGAAAGCCTTACTGAAAG
CACAAGATCACATCTTTTTTGAACGTGGTGAAATGAAAGATAGGATGTTG
GTGGTTAGAAGGGAAAATATGGCTCAAGGTGGTGGATTGTGCGTTGCTAA
TCATACTTCACCTCTGGATGCTATTCTATTGGCATGTGACAGAAACTATG
CATTGGACTCGCAAGACGATTTCGAATTGGGGTACACTCCTTGGATTTCG
TATTCTAGCACGTGGAATTTCTGCAGTGGTTCGATTTCATAATCGGTTAT
CTCTCGTTGTATTGGGCTTTCTCATTATTTTCATATCGATGGCCCTGGCT
CCTCATATTTCCAATGAGGCCTTACGTCTTACAATCATTTGGGCACTTGG
ATTTTTTGTTCGATACTTCATTTTCTTACCTGTTAGAACTCCCTTCCTGG
AATCTACTAACAAGAACAAATGTACATTATCAATTCATTAGGTCATAATG
GAAGATGAAGTAACAAAACGTTTTTCAGCGGCTGGTATCATAGACCATAA
TCCTGGAACACCTGGAAAATCACCAGCCATTCCAAAGAATTTCTCTTTTA
GAACATTAGAAAAACAATTTCATCTGGGAGATATTTGTGAAATATGCAAA
GATGGAATGGAGTTTGGTTATGATAGGATGAAGAAAAACAATAACCTGAA
TGAGGCAGCTAGTGATGGAGCCTATTACTTTGTTGTACTGGGCAATGTTG
TATTTAATTGGCATCTTTTTTACGGTAGTCATACCTGCAGCTTTCAACAT
ATCACTTGGATTGAGAGACAAATATATTCAATTGCTTTACAAGGTGTTTG
AGGGATGGGGGTTTGAAACGAGCAAGTGTACCGACCAAGTTAAAAGAACA
AGAACAAAAGAAATATGCCAAGAATATCAAAACGGAATGAGAGAATGAAA
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GGCTTAGTCGATCTTGTTTGTATGACGCAACTTTTGGTAATGCGTTTTGG
AACTCCATGAAAGAACCCATGTTAACCTATTTGATCAACATGATGACCAG
TTGGGCCATCGTATGTGATGTATGGTACATGCCGCCAACTGAAATCCTAG
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AGGTCGGTGGCACCATCTACCCTGTCGCTATTAAGGATGCGTGAGCACGT
GGAAGACCCAAATAAAAATCCCATCCTTATTTTTCCTGAAGATTGGTCAA
ATGCAAGGTGGAATTATGGGTATGATGCAGAAAGCCTTACTGAAAGCACA
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TTAGAAGGGAAAATATGGCTCAAGGTGGTGGATTGTGCGTTGCTAATCAT
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GGACTCGCAAGACGATTTCGAATTGGGGTACACTCCTTGGATTTCGTATT
CTAGCACGTGGAATTTCTGCAGTGGTTCGATTTCATAATCGGTTATCTCT
CGTTGTATTGGGCTTTCTCATTATTTTCATATCGATGGCCCTGGCTCCTC
ATATTTCCAATGAGGCCTTACGTCTTACAATCATTTGGGCACTTGGATTT
TTTGTTCGATACTTCATTTTCTTACCTGTTAGAACTCCCTTCCTGGAATC
TACTAACAAGAACAAATGTACATTATCAATTCATTAGGTCATAATGGAAG
ATGAAGTAACAAAACGTTTTTCAGCGGCTGGTATCATAGACCATAATCCT
GGAACACCTGGAAAATCACCAGCCATTCCAAAGAATTTCTCTTTTAGAAC
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GAATGGAGTTTGGTTATGATAGGATGAAGAAAAACAATAACCTGAATGAG
GCAGCTAGTGATGGAGCCTATTACTTTGTTGTACTGGGCAATGTTGTATT
TAATTGGCATCTTTTTTACGGTAGTCATACCTGCAGCTTTCAACATATCA
CTTGGATTGAGAGACAAATATATTCAATTGCTTTACAAGGTGTTTGAGGG
ATGGGGGTTTGAAACGAGCAAGTGTACCGACCAAGTTAAAAGAACAAGAA
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GATAATGTTTGCTAATCGAGTGAAAAGTGATATTGCGAAGAAAGGCGGCT
TAGTCGATCTTGTTTGTATGACGCAACTTTTGGTAATGCGTTTTGGAACT
CCATGAAAGAACCCATGTTAACCTATTTGATCAACATGATGACCAGTTGG
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CGGTGGCACCATCTACCCTGTCGCTATTAAGGATGCGTGAGCACGTGGAA
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AAGGGAAAATATGGCTCAAGGTGGTGGATTGTGCGTTGCTAATCATACTT
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AACAAGAACAAATGTACATTATCAATTCATTAGGTCATAATGGAAGATGA
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GGCACCATCTACCCTGTCGCTATTAAGGATGCGTGAGCACGTGGAAGACC
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TCTTTTTTGAACGTGGTGAAATGAAAGATAGGATGTTGGTGGTTAGAAGG
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AAGACGATTTCGAATTGGGGTACACTCCTTGGATTTCGTATTCTAGCACG
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AATGAGGCCTTACGTCTTACAATCATTTGGGCACTTGGATTTTTTGTTCG
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ATCTTTTTTACGGTAGTCATACCTGCAGCTTTCAACATATCACTTGGATT
GAGAGACAAATATATTCAATTGCTTTACAAGGTGTTTGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11140MSTRG.11140Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11140.1.p1MSTRG.11140.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.11140.1.p1.exon10MSTRG.11140.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11140.1.p1.exon9MSTRG.11140.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11140.1.p1.exon8MSTRG.11140.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.11140.1.p1.exon3MSTRG.11140.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.11140.1.p1.exon1MSTRG.11140.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000080_pilongenomesc0000080_pilon:121668..143597 -