MSTRG.11135.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11135.3.p1
Unique NameMSTRG.11135.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000080_pilon:68265..89113-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11135.3.p1 ID=MSTRG.11135.3.p1|Name=MSTRG.11135.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20849bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:68265..89113- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTTAGTTTATAAAAGTACAAAAAAAACACGAAATAAAATCAAAATGAGT GTTGATGAAGATACAGAACTACGTGATTTGGTTGCACAAACACTTGAAAC AAATGGCGTTCTCAACAAAATAAGGGTAAGGCTTTTTTGACATTCATCAC TTAAAGATTATTGGATCTTAATTTATCATTCAATCATTGTTCAGGTAATA TTAATCTAGCTGCTCTAAGATAATCATGGGATCCTCCCCCCAGGAAGATG GAGGGAATCAACTTTCTTGAAGGGGGAATTTTATGGGAAGTGGGGGTAGA AAATGCAAAAATTAGGTATGATATTTCAAATAGATGATTAAGTGTCTATA TTTCCAGCATTTGTGTGTTCATTTCAGGAAATTGTAATTTTTGTTAAGTT ATTATGCAAAATATAGCGAATCGGTTGGTCACAAAAATATTTTTCCAATG GGGGAATCCCAGAAAAAGAGAGTTGGGGAGACCAAATGGGGGTTTTAGGT CCCAGATAGGGGGATCTGAAAACCTGGTGTCCCATGACAATGATAACACT TTACGGATTCTCTTTGTACCCAAATTAAATGGAATCCTTTGTTTGTTAAA ATGATGTTTCAATGTCACTTAATAAACCAATAGAAAAGTATTCTTTCTTA TTAAATTTAAACCAGGGCATATATTATGTGGTCTAGAAAAATATGGTATT TGTTTCTGTTACAAACCTTTTTTCTTCCACCTGACTTGGCAATGTTGGAT TTTCTAAACGTTAATTCATAAAATAATATTTTTCTTTGTGATTGCTTTTA GGCAGAATTGCGAGCAAATGTATTTCTTGCGTTAGAAGAGCAGGACGCGT TAAAGGTATTCATTCTAGACTTTCTTTTATTCTTCTTTTTTAAAAATTCT CCAGCTGGTTTTATAGAAAGAAGTTAGCTTCAGAACTAAAATGTTTGACA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:68265..89113-

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AGAATGCGACCGGGGCCGCCGGCGTGGGTGGAGCCGCAAGTAAAAAATCA
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AACAACCTTTACTTGTGGAGCTTCTGAAGAAAAAAGAATGCTTGCATTTA
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ATCATTCTTAGAAACTAAAGAAGGCAGAATTGCGAGCAAATGTATTTCTT
GCGTTAGAAGAGCAGGACGCGTTAAAGATGAGTGTTGATGAAGATACAGA
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TAAGAATGCGACCGGGGCCGCCGGCGTGGGTGGAGCCGCAAGTAAAAAAT
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ATCACCAGAGTGGGATGAGTTGATCAATATTGATAAGAAAATTAACGAAC
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TTTGGGCGAACCGGCAATAGTAAGAGGGTAACCAGCCCTGAAATCGATGA
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TAAACAACCTTTACTTGTGGAGCTTCTGAAGAAAAAAGAATGCTTGCATT
TAATGCAGTGTATGAATTTTTGGAATTCTTCAATTTGGATTTCACACTGG
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AATAAGAATGCGACCGGGGCCGCCGGCGTGGGTGGAGCCGCAAGTAAAAA
ATCACAACAAGATGAATACAATTATGATGATGACGATTTTAACAGACGTT
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GATCATTGAAAGGCGCACCGCCCTTAACGGGTGGTGGATTCAACAAGAAA
CCTTTGGGCGAACCGGCAATAGTAAGAGGGTAACCAGCCCTGAAATCGAT
GACGACAACGACTTACTCAAAGAGCTTGGTGTGTCTCCTATCAACTTTAA
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CCTAAACAACCTTTACTTGTGGAGCTTCTGAAGAAAAAAGAATGCTTGCA
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GGCTGTACTGAAACCCGAAAGTAATAAGAAGACTCTATCCAACAAAACAT
TGAAATCATTCTTAGAAACTAAAGAAGGCAGAATTGCGAGCAAATGTATT
TCTTGCGTTAGAAGAGCAGGACGCGTTAAAGATGAGTGTTGATGAAGATA
CAGAACTACGTGATTTGGTTGCACAAACACTTGAAACAAATGGCGTTCTC
AACAAAATAAGGAATGAAGATTTGATGACGTCAGACCACACCGTATCACA
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TTTATCAATCGGATCTTTCGGTGGTAGTAAGAAATACCAGCGGAGGATAG
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GTTGATGGTAAACCAATATTATCGCCACCTTCCTCGCCAAAGGTCTCAAA
GCTCAGTCCCCGTGAGAAGTTGATCAATGATTTCAATATGCAAACGGTTG
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CATACGCGGAGTAATAAGAATGCGACCGGGGCCGCCGGCGTGGGTGGAGC
CGCAAGTAAAAAATCACAACAAGATGAATACAATTATGATGATGACGATT
TTAACAGACGTTTTATCACCAGAGTGGGATGAGTTGATCAATATTGATAA
GAAAATTAACGAACTTGGATTCGTTGGTTGACGGGTGACATTTCGACGAA
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TATCAACTTTAACAAACCAAGCGAAAATACAGCAAAGTCCAAACCAAGGT
ATCAAAGATCCCTCAACGTGTAGATAAGAAGCCAACCACAGCAGCTTCAG
ATAGTAAAGAGTTGATGGTAAACCAATATTATCGCCACCTTCCTCGCCAA
AGGTCTCAAAGCTCAGTCCCCGTGAGAAGTTGATCAATGATTTCAATATG
CAAACGGTTGACCCTAAACAACCTTTACTTGTGGAGCTTCTGAAGAAAAA
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GGATTTCACACTGGCTGTACTGAAACCCGAAAGTAATAAGAAGACTCTAT
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CCTATCAACTTTAACAAACCAAGCGAAAATACAGCAAAGTCCAAACCAAG
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TGTTGATGAAGATACAGAACTACGTGATTTGGTTGCACAAACACTTGAAA
CAAATGGCGTTCTCAACAAAATAAGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11135MSTRG.11135Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11135.3.p1MSTRG.11135.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11135.3.p1.exon13MSTRG.11135.3.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.3.p1.exon12MSTRG.11135.3.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.3.p1.exon11MSTRG.11135.3.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.3.p1.exon10MSTRG.11135.3.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.3.p1.exon9MSTRG.11135.3.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.3.p1.exon8MSTRG.11135.3.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.3.p1.exon7MSTRG.11135.3.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.3.p1.exon6MSTRG.11135.3.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.3.p1.exon5MSTRG.11135.3.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.3.p1.exon4MSTRG.11135.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.3.p1.exon3MSTRG.11135.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.3.p1.exon2MSTRG.11135.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.3.p1.exon1MSTRG.11135.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000080_pilongenomesc0000080_pilon:68265..89113 -