MSTRG.11135.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11135.2.p1
Unique NameMSTRG.11135.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000080_pilon:43726..89113-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11135.2.p1 ID=MSTRG.11135.2.p1|Name=MSTRG.11135.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=45388bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:43726..89113- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTTAGTTTATAAAAGTACAAAAAAAACACGAAATAAAATCAAAATGAGT GTTGATGAAGATACAGAACTACGTGATTTGGTTGCACAAACACTTGAAAC AAATGGCGTTCTCAACAAAATAAGGGTAAGGCTTTTTTGACATTCATCAC TTAAAGATTATTGGATCTTAATTTATCATTCAATCATTGTTCAGGTAATA TTAATCTAGCTGCTCTAAGATAATCATGGGATCCTCCCCCCAGGAAGATG GAGGGAATCAACTTTCTTGAAGGGGGAATTTTATGGGAAGTGGGGGTAGA AAATGCAAAAATTAGGTATGATATTTCAAATAGATGATTAAGTGTCTATA TTTCCAGCATTTGTGTGTTCATTTCAGGAAATTGTAATTTTTGTTAAGTT ATTATGCAAAATATAGCGAATCGGTTGGTCACAAAAATATTTTTCCAATG GGGGAATCCCAGAAAAAGAGAGTTGGGGAGACCAAATGGGGGTTTTAGGT CCCAGATAGGGGGATCTGAAAACCTGGTGTCCCATGACAATGATAACACT TTACGGATTCTCTTTGTACCCAAATTAAATGGAATCCTTTGTTTGTTAAA ATGATGTTTCAATGTCACTTAATAAACCAATAGAAAAGTATTCTTTCTTA TTAAATTTAAACCAGGGCATATATTATGTGGTCTAGAAAAATATGGTATT TGTTTCTGTTACAAACCTTTTTTCTTCCACCTGACTTGGCAATGTTGGAT TTTCTAAACGTTAATTCATAAAATAATATTTTTCTTTGTGATTGCTTTTA GGCAGAATTGCGAGCAAATGTATTTCTTGCGTTAGAAGAGCAGGACGCGT TAAAGGTATTCATTCTAGACTTTCTTTTATTCTTCTTTTTTAAAAATTCT CCAGCTGGTTTTATAGAAAGAAGTTAGCTTCAGAACTAAAATGTTTGACA 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TTAAACTGAATAATGAAATTTTTCATGACTGTTAATAGATTTTCCTAAAA ATTGTTGTGAGAATATATTTTCCGCGAATGAACAAAGTTCCAATCCAACA AATTTAATCTTTTTAAAATTTTGAAACTCAAATTGAAAAGAATAATGCGA TGTTAAAAAATTGTCGATATTTCGATAACCTTACCGCATCATTATTATCA TTACGATATTGTGGGAATAACTTTTGCGAACTCAACCTAAAATTTGTGAA AAGTTCTCTCAACAGAAATTTCTACCCTGAGACTAATTCCGGGAAAAGCT AACAGCTAGTTCTCTTTTAATTTAAGAACCCAATGATTAATTCGCATTAT TCCGTTCCCAGGACAACACCGACCAAAACAAATGCTGTCCAAAAGCCCAA CTACCTTTCAGACCTCTCCATATCAGATGACGAAACAAAACTCCAATCAT CTCATACGCGGAGACTCTCCCCAGTCCTTCATGAAATACTTTCTACCCAA ACGCACGACGACCAATCGAACGTCTGTGGAGAAGTGTCTACCAAAACAAC ACGAATCAGCTCTCCTGCACGCGTGGTGTGTCACTCTCCTTCGTCACACC GTCACGGTAGTGTTAAAAGAGAAGATCGAAATAAAATGAAAGAACATACG ACTCCTTCACAACAAGAAACCAAATCCAGCAGGAGTCTGTCTTTCGATAA ATCGATAGAAAAGAAGGGCTCTTTGTCCGCAAAGAAAAATGTATCCACTG ATAATAACACTTCTAAAGGTTTGTACACCATTGTGTTTTCTTCCTAAAAT ATTGAGTGATGAGTGGTCATGTGCCTCAAACTCTCAAACTAGTGGTCGGT GGTTCCAATCCCCGCTCCTTCCAATGTTCTGTTCAGTTCAAAGATATCCG AGCCACCTGGAATTTGACTCCGTGAAAACAATTGAAAGGCTGTCTAAAAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:43726..89113-

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CGGTGGGGGAGGCGACAATGATGGCTCCATCTTGGATCAAACTCGTTTTC
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AACCAATTTGCTGATTCGTTGGCTGATATTACCAATTATTTGAACATCGA
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TAAATCGATAGAAAAGAAGGGCTCTTTGTCCGCAAAGAAAAATGTATCCA
CTGATAATAACACTTCTAAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11135MSTRG.11135Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.11135.2.p1.exon24MSTRG.11135.2.p1.exon24Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon23MSTRG.11135.2.p1.exon23Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon22MSTRG.11135.2.p1.exon22Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon21MSTRG.11135.2.p1.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon20MSTRG.11135.2.p1.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon19MSTRG.11135.2.p1.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon18MSTRG.11135.2.p1.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon17MSTRG.11135.2.p1.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon16MSTRG.11135.2.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon15MSTRG.11135.2.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon14MSTRG.11135.2.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon13MSTRG.11135.2.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon12MSTRG.11135.2.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon11MSTRG.11135.2.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.11135.2.p1.exon9MSTRG.11135.2.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon8MSTRG.11135.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.11135.2.p1.exon6MSTRG.11135.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon5MSTRG.11135.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon4MSTRG.11135.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11135.2.p1.exon3MSTRG.11135.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.11135.2.p1.exon1MSTRG.11135.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11135.2.p1MSTRG.11135.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000080_pilongenomesc0000080_pilon:43726..89113 -