MSTRG.11121.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11121.2.p1
Unique NameMSTRG.11121.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000079_pilon:1271551..1301953-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11121.2.p1 ID=MSTRG.11121.2.p1|Name=MSTRG.11121.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=30403bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:1271551..1301953- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATTCAATAGCTTTAATTGCATTCTTAAATAATTGTCCCCGGTAATTTACG TACTAATTTTCCCAAACGATGAGGTCAGGCGTACAGGAAATCAACTAAAA TATCTTTAGGGAGAAATTATAACATATTTAGATGCCTTCGACAAATATTT GTCGACTAATTATGAGAATATGCACAAGGCATTTTATGTTAATGACCCTA TTATGATTTAAAGGCGAAACAGGGTCACATGTTAATGATTTTGTTAAAGT GGTTTCATAATAATATGCTTATAAATTCAATGGAAGGTATTCAAAAATAT TTCCATGTGCAGTCAGATAAGTGTTACGCGTGGGCCTCATTGAACCGATC TAGCCTTATTAAAAATCATTAATGTGATACCTTAATTCCATACCTCAATT AAGATTTTCTTTCTGCCACAGATATTTTTTATACCACTGAAAGATTTTCG TCAATAAAAATGATGAAGATCGCATAGTCATTAGTGGTTGATACTTTGTT ATTTCTGTTTTCAATATTTTGAAGTTTTGCCAAGTTTTGCTCCATTATTC AAATGCTTAGATTAGAGCTTTTTGCCTCCATGAGACAGGTAAGTAAAGAT TTGAGAAGCCCCATGCTCCAATGCTTTTCTTATTTTCGCCATAATGAGCC CGAAACCCTTCGAATGACCATCGAGGCTCAATATTTTTTGATGGCCATCT TGATGGTTTTTATTGAAAAGTTTTAGTCGTCAAGGGAGAAAAAATTCAAT CATCAGCTTTAGGGTTTTAACGCAAGCTAATCGTATACATGATTTAATCG CGTACATGATTTAAAATTCTATCACTTTTAACATACAGAAGGAGAAAAAT TGTTAAGTATTATAAGACTCGTTGACAGCTTAATGCTTTCTGAAAGGTGT TTGAAAGTTTTTCATTGCATCTCGTTATTTAAAGGTTTTTAATCGTGTGA AAAAATTTTAAACGAAGTCATTTGAAGAAGGTAGATTTGAAAGATGGCTT TAAGATAACCGCATGTGTGTCTGATTGTATAAGATTGAGGAATCTAGGAG GTGTGTGAAGGCTTTGGAATCGATTTGCTAAATTTCAAGATAAAAAAATC AAAATTATCAAAATTATTAAAATGGGTCTGTTAAAAAGAGAATGTTACTG TTCTCGATCATCTTGGCTTTCAAATCTTAGACATTTTACAAACATTTTTT AGAAATCCCGTTCAAATTCTCAACTTTGTAGATACGTCCAACTTACATCC ATTTAACATCCATACCGATAACGATAACGTCTGTTTAGTCGAAAAATTCA GACATTCGGAAAACAAGATCATCAAAATACCATCCACTAATGATATTACA ATTTAACAAACAAAGATATATTATTTTCGAGTTAAAAAAATCATAGGGAA TTTTCTTTGATCATTTAAGCATGCTTTAAATTATACGTAAGCAATTTAAA GGGTATATGGAACAACATGCCACTAGCATTCAAAAGACGTCCCGAGGATT TTTATACGTATTTGGAATCAACTTAGTCATTTTCACAGCACATAGTTCTG TTTTATCATTTTTTATAAATCTGAGTATTTGAAATCTTGAAGCTGTAAAA ATACACAAATTCAGTACACTTCTTGGTAAATTTTAAAATACAAGGTTTTC AATGTGTTCTTAAATTTTGATCGAATTTCAGCCTCATGTTCTTATAAATA AAAAATAATTTTCGCCACGTGCACCTATTCCATAAAGAATTCTCCTTGCC AGAACGTTTTCCTTAGTTGACAGCACTTTGAGATAAGTTTCAAGAATGCT TTTGATTGGCTGCCTCTTAAAAATTAGCCAATCAAAGTGCAGCTTTCCTA GAAGGTTTTGAACAAAATTAAGGAAGAAAGTCCAATATTGGGTTGTTTAC 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TATAAACACTAGAAACATGGGTTTCGGAGAAAACATTATAAACCCTACAG AAATCAATATTAACCAATGTGTTGGGTCATGCCCAGCTAGAATTAAAGAA GACTTTTTAAACAATCGCCATACTTCACACGCTATTTTTCAAGCTATCGT GGCTGATTCCAGTAGACCAGGCGCAACTCACGACCAACCGGCGCTGCCTT GTTGTTCGCCGTCCGAATTTAAAGATGAGGTGATGATAATTAGCGGACGG AAGGGCTCACAAGAACTAATACAGTTGGTGAAGTTTGAGAAATTGATTGC CACCAAATGTGCTTGTTTGTAGAGCAATGGTAGCTGAATTCGGGACAATC TTATCCCATTGACACTCGCACGCTAGTACAATAAAGTCCATTAAAAGACT CGACAGGCACAATTGGCCAAATAACTTTCTTTAGTTTGTCTGTAGTTATG TTGATGCAATCGTAGAACCATTTCTTCTCCCGATAATTTATCCTGGAAAT TGCCCTTTAATTTTCCCTTTTTGTATAAATTTTATATATAATATGTAGTA TAGCTTTTATGGTAACTTTTTTTTGTTCAAGTTGCTCATCAGAAAAATTT GCGAACAGCGTCCTACTTACTCAAAGATGTTTCGGGTTTAACAGGAATGG AAAATCGGAATTACTTATCGGATTTCCCTGTATAAAATAGGAAAAAAAAA ACCCGGCAGTCAACCGTGACGCTTTTGACAAATATTTTTGACCGTTTTAC TTTCGTTTAGAGAGAGAAAGAATATTTATATAGTCAACCCCCTTTTCGTT TTTTTACAAAATGAAGAGAAATTCCTTAATTTATATAATGTGAATAATAT TATATAGTCATAAATTCTTACAGATATTTAAAATTTTAAAGAAAAAGAAA TATTTTATACATACAGAGATTTGCTTATAGAAAATAGTAGAGAATTAGAG AGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000079_pilon:1271551..1301953-

>MSTRG.11121.2.p1 ID=MSTRG.11121.2.p1|Name=MSTRG.11121.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1866bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:1271551..1301953- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTACTGAAGAGAACGAGAATAAACAACACAAATATCAATTCAATGTTAAC
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AGATCGATATTATAAACATGCACAACGAGCGTGTAATCAGCTCGCGTATC
GTCAGCGTTCATGTACACGGATGGTTACGTTTTCCCGTCACGAAAATAGT
TAAACGTTGGGTACGCAAACGTAAGAATAATAAAGGTTTACAAGTTCGCA
TCCGTAATATTGGAGATGATAAAAACAATGTAAAATTCGGAACCAAAAAC
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AAGTAGCCTTGCTGCTCTGCTGAACGGTAATGGACTCAATATTTTACAGA
ATAACGAGAAAAAGAAACGAGTTAAGCGGACCATAGTCACTATGAATGAT
GACAAACCAAATAATCATATAGAGCATCATCACAAAGATGGGCATTTAGA
ATGCCAGTTAAAACCATTGCGTATAAACACTAGAAACATGGGTTTCGGAG
AAAACATTATAAACCCTACAGAAATCAATATTAACCAATGTGTTGGGTCA
TGCCCAGCTAGAATTAAAGAAGACTTTTTAAACAATCGCCATACTTCACA
CGCTATTTTTCAAGCTATCGTGGCTGATTCCAGTAGACCAGGCGCAACTC
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GAAGTTTGAGAAATTGATTGCCACCAAATGTGCTTGTTTGTAGATGCACC
ACAGTGACTCCGTCAGAAGTTACTTCGATGAAGGTACTGAAGAGAACGAG
AATAAACAACACAAATATCAATTCAATGTTAACGATATCAACCGTAAAGA
AGAAAAGATACAAAATGCAGAACTGCATCTCTTCAAACAATATCAACCGA
ACGGCCAGGGTCGGCCTCGTAGCGCCATGATCCAGATCGATATTATAAAC
ATGCACAACGAGCGTGTAATCAGCTCGCGTATCGTCAGCGTTCATGTACA
CGGATGGTTACGTTTTCCCGTCACGAAAATAGTTAAACGTTGGGTACGCA
AACGTAAGAATAATAAAGGTTTACAAGTTCGCATCCGTAATATTGGAGAT
GATAAAAACAATGTAAAATTCGGAACCAAAAACACTTTACGGCGTGAACC
TATGCTGGTCGTATTCACGAAGCGCGTGAAAGGAAGTAGCCTTGCTGCTC
TGCTGAACGGTAATGGACTCAATATTTTACAGAATAACGAGAAAAAGAAA
CGAGTTAAGCGGACCATAGTCACTATGAATGATGACAAACCAAATAATCA
TATAGAGCATCATCACAAAGATGGGCATTTAGAATGCCAGTTAAAACCAT
TGCGTATAAACACTAGAAACATGGGTTTCGGAGAAAACATTATAAACCCT
ACAGAAATCAATATTAACCAATGTGTTGGGTCATGCCCAGCTAGAATTAA
AGAAGACTTTTTAAACAATCGCCATACTTCACACGCTATTTTTCAAGCTA
TCGTGGCTGATTCCAGTAGACCAGGCGCAACTCACGACCAACCGGCGCTG
CCTTGTTGTTCGCCGTCCGAATTTAAAGATGAGGTGATGATAATTAGCGG
ACGGAAGGGCTCACAAGAACTAATACAGTTGGTGAAGTTTGAGAAATTGA
TTGCCACCAAATGTGCTTGTTTGTAGATGCACCACAGTGACTCCGTCAGA
AGTTACTTCGATGAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11121MSTRG.11121Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11121.2.p1MSTRG.11121.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11121.2.p1.exon4MSTRG.11121.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11121.2.p1.exon3MSTRG.11121.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11121.2.p1.exon2MSTRG.11121.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11121.2.p1.exon1MSTRG.11121.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000079_pilongenomesc0000079_pilon:1271551..1301953 -