MSTRG.11118.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11118.1.p1
Unique NameMSTRG.11118.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000079_pilon:1165347..1195112-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11118.1.p1 ID=MSTRG.11118.1.p1|Name=MSTRG.11118.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=29766bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:1165347..1195112- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000079_pilon:1165347..1195112-

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GCACGTATGATGTCGGTTATGGAAAGCGGTTCTACTGTGATGAGGACTCC
CCTCTTTATGGACCCCACACTGACTTTGAAACACAACTTCCACGTACATG
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GGTGGTCATTACAATCCAAACTCCGTCGATGTTGGGGTACAATACGTCTT
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GCGCAAACATTATCCCTCATCAAGGTGTTAAAATTGAATCATGGACCAAT
TTCACGAAACAAAGCGATCTGTTTGACGGTTATGTTCAATTGGACTTGAC
GAGAGAGCCAAAGGATACCATGTCCATAAATTTCCAATCTCCGATTCATC
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TCAACGTTCGTAGCTGATAAAAATAGTGGAGTTTCAGGGACAGTCGAGTT
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AAAACATGGTACCTTGGATGTGGGTGTAGCTGGCGATAAAAAATTGACCG
TTATTGATTCGAATCTTCCTCTTTTCGGTGAAGGCGATAATAATGTCAAG
CAGCATGTGTTCGTAATTTTGGAGCAGGGTTCGAATGATAAAGTTCTTGG
TTGTGGCATCATTAAACCAAAAGTTCTGTTCTGTCTATGCCAAGCACGTG
ATGGTGATGATGTGGTTGCATATATTAGCGAAGGTGATATCAAGGGGAGT
TTCCATTTTGAGCAGTTCAACTCGACCATTGTCAAGATCACAATCAAACT
AAGCTATGATGGTGTGGATAATAAATTGTATCGCATTCATCAACATCCAT
CTAACTACCAACAAAAATGTAAACATCTTGGCGAAAAAGTTTTCGATATG
GACTCCATAAAAGGGCATTTGGGTAAAGAAGAAACATTGTATGTTGATGC
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GCGTTGCCTTATCATCGAACACAAGCAAGATTTTAGCCTGCGGTACTTTA
GTCTCCAAAGGCACTGAGAACAGCTATGCAGTGGCATCGATTTCTAACTC
GAAGATTGCTGGTAAATTTGAATTTGTCCAACAAGGTTTGAATGGAGATA
CCATGATCACCGGAGAAATTTCACATTCAGACAGGTCCACAGTGGCAACT
GATAATCATAAATGATGCTCGCCACAATGACCTGTCAAAAGTTGTTTTCC
TTATGCATTACGCTAACCGCTGAAAATGAGGACAGCGGATCGATCAGTAC
GCAATCTTCAATCTTTTTGTCAATTCTATGCGTGTTATCAACACTGATAT
TATGGAGATAAAGGCAAATAAACAAACCGAAGCGACGAAAAAGATCAAAG
AAGCATTTGAAGCAAACAAATCGTCTTACCGGCCATGTCAGGTGCATCAA
TGGTAGACATCTTGTTAGAGAAATTCGGTTTACCTCAAAGTGAAGATTGG
AGATTCGGTTATCCACGATTGGAAGATGGTTCAAATAATAAAGAATGTTA
CTCCTTCTCTTTCTACATGCTTGATATTTTGGGCCGTTCCATTGTTTTCC
ACGCCAAAGAAATGGGTGCGCCACGGCTCGCTTGCGCCGACGTCGTTCCT
GTTGAAGGGTCCATGGTCAAGAAACACACTGTTGAAGGTTCAAAGAAAAT
AGTTGATTCTAATAGAACGATGTTTACAAGGAGCAGTGCGATCAAGACCA
TCCCTACAGATGTGAAGTTGGAGATACCAGTGCTAAAGTTGGCACGTATG
ATGTCGGTTATGGAAAGCGGTTCTACTGTGATGAGGACTCCCCTCTTTAT
GGACCCCACACTGACTTTGAAACACAACTTCCACGTACATGTCAAACCAT
TGGGAAATGACACGCAAGCCAATGGTACTTGCATGAGTGTTGGTGGTCAT
TACAATCCAAACTCCGTCGATGTTGGGGTACAATACGTCTTACCAAATGG
AATTGTCACTCCCACAATGTACATTATCGACGTTGTATATCAAGATAACC
CAACCTCTCGAAAGGTCCTATGGATAAATACGAAGCTGGAGATTTGAGCG
GAAAATTCGGTAATCTTGCCAACAAAACAGACTACGAGCTCAAAATATAT
GATGAGAATTTGCCGATGTTTGGCCACCATGCATTGGTTGGACGTTCTAT
TGTTATCCACAATAATGATGCTTCAAATTCACGAATGACATGCGCAAACA
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CAAAGCGATCTGTTTGACGGTTATGTTCAATTGGACTTGACGAGAGAGCC
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ATAACTCACCAAAACCTGGCACAGGTCCATTCAAAGCTATATCAACGTTC
GTAGCTGATAAAAATAGTGGAGTTTCAGGGACAGTCGAGTTCGAACAAAT
TTCACCATATCATCGAACTTACTTTGTCGTTAATTTAAAAGGTATATTTT
GGGCTCAACAGAACCAGAAGAATGGGTTGCAAATTGTCAAACTCATATGA
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TCGACGGACGCGAAAACGTGCGCAATTGGAGATTTAACCGGAAAACATGG
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CGAATCTTCCTCTTTTCGGTGAAGGCGATAATAATGTCAAGCAGCATGTG
TTCGTAATTTTGGAGCAGGGTTCGAATGATAAAGTTCTTGGTTGTGGCAT
CATTAAACCAAAAGTTCTGTTCTGTCTATGCCAAGCACGTGATGGTGATG
ATGTGGTTGCATATATTAGCGAAGGTGATATCAAGGGGAGTTTCCATTTT
GAGCAGTTCAACTCGACCATTGTCAAGATCACAATCAAACTAAGCTATGA
TGGTGTGGATAATAAATTGTATCGCATTCATCAACATCCATCTAACTACC
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AAAGGGCATTTGGGTAAAGAAGAAACATTGTATGTTGATGCAAACAAAAT
ACCTTTACATGGTAAAAACTCAATCCAGGGACGATCGATTAGCGTTGCCT
TATCATCGAACACAAGCAAGATTTTAGCCTGCGGTACTTTAGTCTCCAAA
GGCACTGAGAACAGCTATGCAGTGGCATCGATTTCTAACTCGAAGATTGC
TGGTAAATTTGAATTTGTCCAACAAGGTTTGAATGGAGATACCATGATCA
CCGGAGAAATTTCACATTCAGACAGGTCCACAGTGGCAACTGATAATCAT
AAATGATGCTCGCCACAATGACCTGTCAAAAGTTGTTTTCCTTATGCATT
ACGCTAACCGCTGAAAATGAGGACAGCGGATCGATCAGTACGCAATCTTC
AATCTTTTTGTCAATTCTATGCGTGTTATCAACACTGATATTATGGAGAT
AAAGGCAAATAAACAAACCGAAGCGACGAAAAAGATCAAAGAAGCATTTG
AAGCAAACAAATCGTCTTACCGGCCATGTCAGGTGCATCAATGGTAGACA
TCTTGTTAGAGAAATTCGGTTTACCTCAAAGTGAAGATTGGAGATTCGGT
TATCCACGATTGGAAGATGGTTCAAATAATAAAGAATGTTACTCCTTCTC
TTTCTACATGCTTGATATTTTGGGCCGTTCCATTGTTTTCCACGCCAAAG
AAATGGGTGCGCCACGGCTCGCTTGCGCCGACGTCGTTCCTGTTGAAGGG
TCCATGGTCAAGAAACACACTGTTGAAGGTTCAAAGAAAATAGTTGATTC
TAATAGAACGATGTTTACAAGGAGCAGTGCGATCAAGACCATCCCTACAG
ATGTGAAGTTGGAGATACCAGTGCTAAAGTTGGCACGTATGATGTCGGTT
ATGGAAAGCGGTTCTACTGTGATGAGGACTCCCCTCTTTATGGACCCCAC
ACTGACTTTGAAACACAACTTCCACGTACATGTCAAACCATTGGGAAATG
ACACGCAAGCCAATGGTACTTGCATGAGTGTTGGTGGTCATTACAATCCA
AACTCCGTCGATGTTGGGGTACAATACGTCTTACCAAATGGAATTGTCAC
TCCCACAATGTACATTATCGACGTTGTATATCAAGATAACCCAACCTCTC
GAAAGGTCCTATGGATAAATACGAAGCTGGAGATTTGAGCGGAAAATTCG
GTAATCTTGCCAACAAAACAGACTACGAGCTCAAAATATATGATGAGAAT
TTGCCGATGTTTGGCCACCATGCATTGGTTGGACGTTCTATTGTTATCCA
CAATAATGATGCTTCAAATTCACGAATGACATGCGCAAACATTATCCCTC
ATCAAGGTGTTAAAATTGAATCATGGACCAATTTCACGAAACAAAGCGAT
CTGTTTGACGGTTATGTTCAATTGGACTTGACGAGAGAGCCAAAGGATAC
CATGTCCATAAATTTCCAATCTCCGATTCATCCAATCCCTGTTCTGCTGC
CAGTGTTGGTGGACATCTCAATCCATGGGGAATCAACCCTAATAACTCAC
CAAAACCTGGCACAGGTCCATTCAAAGCTATATCAACGTTCGTAGCTGAT
AAAAATAGTGGAGTTTCAGGGACAGTCGAGTTCGAACAAATTTCACCATA
TCATCGAACTTACTTTGTCGTTAATTTAAAAGGTATATTTTGGGCTCAAC
AGAACCAGAAGAATGGGTTGCAAATTGTCAAACTCATATGAACTGGACAC
AAGTCTTCGATTCTGATCGAATGAGCCAATCAGGATGCAATTCGACGGAC
GCGAAAACGTGCGCAATTGGAGATTTAACCGGAAAACATGGTACCTTGGA
TGTGGGTGTAGCTGGCGATAAAAAATTGACCGTTATTGATTCGAATCTTC
CTCTTTTCGGTGAAGGCGATAATAATGTCAAGCAGCATGTGTTCGTAATT
TTGGAGCAGGGTTCGAATGATAAAGTTCTTGGTTGTGGCATCATTAAACC
AAAAGTTCTGTTCTGTCTATGCCAAGCACGTGATGGTGATGATGTGGTTG
CATATATTAGCGAAGGTGATATCAAGGGGAGTTTCCATTTTGAGCAGTTC
AACTCGACCATTGTCAAGATCACAATCAAACTAAGCTATGATGGTGTGGA
TAATAAATTGTATCGCATTCATCAACATCCATCTAACTACCAACAAAAAT
GTAAACATCTTGGCGAAAAAGTTTTCGATATGGACTCCATAAAAGGGCAT
TTGGGTAAAGAAGAAACATTGTATGTTGATGCAAACAAAATACCTTTACA
TGGTAAAAACTCAATCCAGGGACGATCGATTAGCGTTGCCTTATCATCGA
ACACAAGCAAGATTTTAGCCTGCGGTACTTTAGTCTCCAAAGGCACTGAG
AACAGCTATGCAGTGGCATCGATTTCTAACTCGAAGATTGCTGGTAAATT
TGAATTTGTCCAACAAGGTTTGAATGGAGATACCATGATCACCGGAGAAA
TTTCACATTCAGACAGGTCCACAGTGGCAACTGATAATCATAAATGATGC
TCGCCACAATGACCTGTCAAAAGTTGTTTTCCTTATGCATTACGCTAACC
GCTGAAAATGAGGACAGCGGATCGATCAGTACGCAATCTTCAATCTTTTT
GTCAATTCTATGCGTGTTATCAACACTGATATTATGGAGATAAAGGCAAA
TAAACAAACCGAAGCGACGAAAAAGATCAAAGAAGCATTTGAAGCAAACA
AATCGTCTTACCGGCCATGTCAGGTGCATCAATGGTAGACATCTTGTTAG
AGAAATTCGGTTTACCTCAAAGTGAAGATTGGAGATTCGGTTATCCACGA
TTGGAAGATGGTTCAAATAATAAAGAATGTTACTCCTTCTCTTTCTACAT
GCTTGATATTTTGGGCCGTTCCATTGTTTTCCACGCCAAAGAAATGGGTG
CGCCACGGCTCGCTTGCGCCGACGTCGTTCCTGTTGAAGGGTCCATGGTC
AAGAAACACACTGTTGAAGGTTCAAAGAAAATAGTTGATTCTAATAGAAC
GATGTTTACAAGGAGCAGTGCGATCAAGACCATCCCTACAGATGTGAAGT
TGGAGATACCAGTGCTAAAGTTGGCACGTATGATGTCGGTTATGGAAAGC
GGTTCTACTGTGATGAGGACTCCCCTCTTTATGGACCCCACACTGACTTT
GAAACACAACTTCCACGTACATGTCAAACCATTGGGAAATGACACGCAAG
CCAATGGTACTTGCATGAGTGTTGGTGGTCATTACAATCCAAACTCCGTC
GATGTTGGGGTACAATACGTCTTACCAAATGGAATTGTCACTCCCACAAT
GTACATTATCGACGTTGTATATCAAGATAACCCAACCTCTCGAAAGGTCC
TATGGATAAATACGAAGCTGGAGATTTGAGCGGAAAATTCGGTAATCTTG
CCAACAAAACAGACTACGAGCTCAAAATATATGATGAGAATTTGCCGATG
TTTGGCCACCATGCATTGGTTGGACGTTCTATTGTTATCCACAATAATGA
TGCTTCAAATTCACGAATGACATGCGCAAACATTATCCCTCATCAAGGTG
TTAAAATTGAATCATGGACCAATTTCACGAAACAAAGCGATCTGTTTGAC
GGTTATGTTCAATTGGACTTGACGAGAGAGCCAAAGGATACCATGTCCAT
AAATTTCCAATCTCCGATTCATCCAATCCCTGTTCTGCTGCCAGTGTTGG
TGGACATCTCAATCCATGGGGAATCAACCCTAATAACTCACCAAAACCTG
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GGAGTTTCAGGGACAGTCGAGTTCGAACAAATTTCACCATATCATCGAAC
TTACTTTGTCGTTAATTTAAAAGGTATATTTTGGGCTCAACAGAACCAGA
AGAATGGGTTGCAAATTGTCAAACTCATATGAACTGGACACAAGTCTTCG
ATTCTGATCGAATGAGCCAATCAGGATGCAATTCGACGGACGCGAAAACG
TGCGCAATTGGAGATTTAACCGGAAAACATGGTACCTTGGATGTGGGTGT
AGCTGGCGATAAAAAATTGACCGTTATTGATTCGAATCTTCCTCTTTTCG
GTGAAGGCGATAATAATGTCAAGCAGCATGTGTTCGTAATTTTGGAGCAG
GGTTCGAATGATAAAGTTCTTGGTTGTGGCATCATTAAACCAAAAGTTCT
GTTCTGTCTATGCCAAGCACGTGATGGTGATGATGTGGTTGCATATATTA
GCGAAGGTGATATCAAGGGGAGTTTCCATTTTGAGCAGTTCAACTCGACC
ATTGTCAAGATCACAATCAAACTAAGCTATGATGGTGTGGATAATAAATT
GTATCGCATTCATCAACATCCATCTAACTACCAACAAAAATGTAAACATC
TTGGCGAAAAAGTTTTCGATATGGACTCCATAAAAGGGCATTTGGGTAAA
GAAGAAACATTGTATGTTGATGCAAACAAAATACCTTTACATGGTAAAAA
CTCAATCCAGGGACGATCGATTAGCGTTGCCTTATCATCGAACACAAGCA
AGATTTTAGCCTGCGGTACTTTAGTCTCCAAAGGCACTGAGAACAGCTAT
GCAGTGGCATCGATTTCTAACTCGAAGATTGCTGGTAAATTTGAATTTGT
CCAACAAGGTTTGAATGGAGATACCATGATCACCGGAGAAATTTCACATT
CAGACAGGTCCACAGTGGCAACTGATAATCATAAATGATGCTCGCCACAA
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GAGGACAGCGGATCGATCAGTACGCAATCTTCAATCTTTTTGTCAATTCT
ATGCGTGTTATCAACACTGATATTATGGAGATAAAGGCAAATAAACAAAC
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AAGGAGCAGTGCGATCAAGACCATCCCTACAGATGTGAAGTTGGAGATAC
CAGTGCTAAAGTTGGCACGTATGATGTCGGTTATGGAAAGCGGTTCTACT
GTGATGAGGACTCCCCTCTTTATGGACCCCACACTGACTTTGAAACACAA
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CAGACTACGAGCTCAAAATATATGATGAGAATTTGCCGATGTTTGGCCAC
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CGTTAATTTAAAAGGTATATTTTGGGCTCAACAGAACCAGAAGAATGGGT
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TAAAAAATTGACCGTTATTGATTCGAATCTTCCTCTTTTCGGTGAAGGCG
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ATATCAAGGGGAGTTTCCATTTTGAGCAGTTCAACTCGACCATTGTCAAG
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CCTGCGGTACTTTAGTCTCCAAAGGCACTGAGAACAGCTATGCAGTGGCA
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CCACAGTGGCAACTGATAATCATAAATGATGCTCGCCACAATGACCTGTC
AAAAGTTGTTTTCCTTATGCATTACGCTAACCG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11118MSTRG.11118Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11118.1.p1MSTRG.11118.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.11118.1.p1.exon14MSTRG.11118.1.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.11118.1.p1.exon1MSTRG.11118.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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