MSTRG.11082.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11082.1.p1
Unique NameMSTRG.11082.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000079_pilon:574364..599994-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11082.1.p1 ID=MSTRG.11082.1.p1|Name=MSTRG.11082.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=25631bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:574364..599994- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TATATTTGATAACGATTTTGGCCAAAAATATCCTGCAACCGCCAAATTAA ATTCCCTTCAAATTTAGTTTTTCCAGCCATCCACTAAATTAAATTCCCTC TGAAAAAACTTTTTCGGCCATCCGCCAAATTAAATTTCCGTCAAAATTTT TTTCTTTTAAAGTATTTTCAATATTCAGAAGACGGGAAAAAAGTACAATA TTTTGCAGTGAGGGGTTGTTTATTTGATTATTATCTGTAGGGACAATAAT CGAAGAATAAATTTCCACCGGGGACGATATTTTTACCAAGGGAGTGTAAA TTTAGAGGAAAATTTCCCCAATTTGTATAGAACTTTTTTTTACCACTGGC GGACTGTACTGAATAACTAAGTCTACCCTAATGATGATATAATTTCTTTC TTATCATGTTAGACTCCTCTCTTGCAAGCTTTGGGTTGTGTTCTACAAGA CGAAACAATTTGGCCACAACCAAAAAGGTGCGTTTATTAATTTATTGTTG CTTTTTTGAACTGGCAAAATTTATTCCCAGTATTGCAGAACAAAGTTTTA AGTTTTCTTTATGCAATTCAATAAATGGAATAACAATTAATGGATATTTT CCTTAAAAATTGGCTGACTTTTGTTGACTTTTGGTGCAATCTTCTTTCTT TTGAAAGAGGGGGTTGAGTTGAAATTTAAGGGGTGGTTTTATAAAAAAAG AAATTTGCTTATTCGAATCCCCTTAATCCATCTAAAGCCTTCTTATAATA GCAATATTATAAAAGAATCTACCAATGTAACTGATTTTCTCAAGGTTTGA TCCCGATCGATTTGGCCCAGACGCTCCAAAACGACATCCTCTGGCGTTTC AGCCATTCGGTTTTGCCGGTAAACGAAAATGCCCTGGATATCGATTCGCA TATTACGAAGCGATCATATTTCTTGTAGCCATTGTCAGAAATTTCAAGGT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000079_pilon:574364..599994-

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TGAGGCAATTGATAACAAATATAGGATCATCAGATTACCTTGCACTTGCT
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GGCACCGTATGCTGCAAGATATTCGGAATATGACATGGTCATTGGTGGGC
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GTCATCTCGTATATCGTTGGAGGTTTTCACACTACTGGAAATCCGTTGAA
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GTGGGAGTGTACAGCATTCAATACATGAACACACCTGTCGGACAGAAACA
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GCAATTCTTCTTCTCATTTTCACCCTTGTTTACCTTTGGTGGGTTTGATC
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GCACCGTATGCTGCAAGATATTCGGAATATGACATGGTCATTGGTGGGCA
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TGGTTGAGTAAGAAAGTGTCACAGATTGTGAACCATCGCAAAGCGAATAA
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TCTATACTTCAGATCAACAGTGCTGGGAAGAAATGGAGCGACGTTTGGAT
GGAAATATGCCGGAACCAGACAGTGATCGCCAGAAGAATTACGACGATTA
TTGCAAATGAGCTCGTTACCAGGTGGTCCAAGGTACCAAAGGACGAGATG
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TGGGAGTGTACAGCATTCAATACATGAACACACCTGTCGGACAGAAACAT
CGTAAAATACTTGATCGACATTTCTCGTTTACTGCCATCGGATTATATTT
CCAAACATTCACCACTATATGGGAATTTAAAACAAATCACCAAAGATGGC
GGCTTGCATCAATTTTTATTGGATCATCACAAAAAGTTTGGACCCATGTT
TTCATTTTATTGGGGAAAGGAATTGGTTGTGAGTTTGGCATCGCCCTATG
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ATTGATAACAAATATAGGATCATCAGATTACCTTGCACTTGCTACTACAG
CAATTCTTCTTCTCATTTTCACCCTTGTTTACCTTTGGTGGGTTTGATCC
CGATCGATTTGGCCCAGACGCTCCAAAACGACATCCTCTGGCGTTTCAGC
CATTCGGTTTTGCCGGTAAACGAAAATGCCCTGGATATCGATTCGCATAT
TACGAAGCGATCATATTTCTTGTAGCCATTGTCAGAAATTTCAAGGTTTC
TTTAGTGCCCGACATGAAAGTAGAGGCTGTTCATAGACTAGTAACCTCAC
CCAAAGAAGAAATCTATATCAATATTGAGAAACGATAAACTCCTCTCTTG
CAAGCTTTGGGTTGTGTTCTACAAGACGAAACAATTTGGCCACAACCAAA
AAGATACGCGCGACAAGTGGTGGACGAAACAATGAGATGCTCCGTGTTGG
CACCGTATGCTGCAAGATATTCGGAATATGACATGGTCATTGGTGGGCAC
GTCATACCAAAACATTGTTGACATGGGCAGTGTATTATCTTTGCAACGAT
TCGAAAGTGGTGGACAAAATGTTGACTGAAATAAACGAAGTACTGGGTGA
TGGTGAAATCACTATGGACAACTTTGATAAGTTAATATTTTTGACATGGT
CATCTCGTATATCGTTGGAGGTTTTCACACTACTGGAAATCCGTTGAATT
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GAGAAGAAAGACAACAATGCACTGGACATCATGATTGATGCTGAAGACCT
CTATACTTCAGATCAACAGTGCTGGGAAGAAATGGAGCGACGTTTGGATG
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TGCCCCTGCGTCAACACATGTTAGCTGTGGCTATCAAGTCCATCATCAGA
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AGAAGCTGCTTACGATGTACGAACCAGTTTGAATTGTTCAAACCTTTGGT
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CAAACATTCACCACTATATGGGAATTTAAAACAAATCACCAAAGATGGCG
GCTTGCATCAATTTTTATTGGATCATCACAAAAAGTTTGGACCCATGTTT
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AATTCTTCTTCTCATTTTCACCCTTGTTTACCTTTGGTGGGTTTGATCCC
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ATTCTTCTTCTCATTTTCACCCTTGTTTACCTTTGGTGGGTTTGATCCCG
ATCGATTTGGCCCAGACGCTCCAAAACGACATCCTCTGGCGTTTCAGCCA
TTCGGTTTTGCCGGTAAACGAAAATGCCCTGGATATCGATTCGCATATTA
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CCGTATGCTGCAAGATATTCGGAATATGACATGGTCATTGGTGGGCACGT
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TCTCGTATATCGTTGGAGGTTTTCACACTACTGGAAATCCGTTGAATTGG
TTGAGTAAGAAAGTGTCACAGATTGTGAACCATCGCAAAGCGAATAAAGA
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AATATGCCGGAACCAGACAGTGATCGCCAGAAGAATTACGACGATTATTG
CAAATGAGCTCGTTACCAGGTGGTCCAAGGTACCAAAGGACGAGATGGTG
CCCCTGCGTCAACACATGTTAGCTGTGGCTATCAAGTCCATCATCAGAAC
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AAAATACTTGATCGACATTTCTCGTTTACTGCCATCGGATTATATTTCCA
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GATAACAAATATAGGATCATCAGATTACCTTGCACTTGCTACTACAGCAA
TTCTTCTTCTCATTTTCACCCTTGTTTACCTTTGGTGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11082MSTRG.11082Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11082.1.p1.exon12MSTRG.11082.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.11082.1.p1.exon8MSTRG.11082.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11082.1.p1.exon7MSTRG.11082.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11082.1.p1.exon6MSTRG.11082.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11082.1.p1.exon5MSTRG.11082.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11082.1.p1.exon4MSTRG.11082.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11082.1.p1.exon3MSTRG.11082.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11082.1.p1.exon2MSTRG.11082.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11082.1.p1.exon1MSTRG.11082.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11082.1.p1MSTRG.11082.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000079_pilongenomesc0000079_pilon:574364..599994 -