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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000079_pilon:506714..525176+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11078.1.p1 ID=MSTRG.11078.1.p1|Name=MSTRG.11078.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18463bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:506714..525176+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ttttggtaattttttaaaagaatgacATAAAAATCATGATGTgaagattg
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GGTTTATCAAGATTTTTTACCTCGTAATGCTCGTTTGAATGCCAATGAGA
ACAACAAAGGTTCCTGGTGTGCTCCTGGTGATTCTACTGAATCGTGGCTC
ATGGTTGATCTTGGTAATGTTTCAACCATATCTGCAGTAGGTTCCCAAGG
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GGAGTACAGATAATGTGACCTGGCATTATTTGGAAGACTCTGGTTCACCA
AACATTTTCCCAGGCAATGAAGACGGAGATACGATTGTTTACAACTTCAT
TGTTCCGCATTTGAAAGCGCGTTATTTGAAGTTTATACCGATTGAATACA
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ATAGTAAGTCAATTATATTTTAATTAAAACACATGGGATTAAAAATTCGG
ACAAAAATCGTCCCTGATGAGAATTACTACGATAGTATAAAACTTACCGG
ATTTCTGTGCTAAAAATAAGGAAGTTGAAATTCTCACTCAATTAAATGAC
AAGAGGTTTTCCTTCCCTATttgcttttagaaaaatcagtTATCAAAATA
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AAAACACTGGCGTAAATCTTaaagtttcactttttcactttttcttgcct
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GCACATGTCCAGTTGGTTATCACGATGCTTTGTACAACGGTTTCTTTTGT
GTGCAAATCAACGAGTGTATCGAAAGAAGACCTAGTTATAAACATAATTG
TAGCCATCTTGCAACCTGTACTGATTATGATGGTGGCTTCAATTGTGACT
GCAATCCAGGTTTGTATTTTACCTTTcgtttatatttttcataaatttga
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taattttaaagCTTTCAGGGTGTTTGAGTACAAGACTcagtatacttttt
tttctcagaaagtcATGCTCTATCCTATTTTCcagttttgtaaaaaaaga
taattctaaattgaaaattttgcataTATGATGAGAATAACTGGAAGTAT
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AGAGAACTCCATTGTTATTAGAATTTGTCAATAATTTCCGCATTATCCGT
TCAGGTTTTCGTGGTGATGGTTATTACTGCGAAGATGCTATTGAATGTGA
GATGACACCACCTGCAAATCCTGGGTATTGGTGCAAACCACTTGCTGATT
GTATCAACACTTTTGGCAGTTACGAATGCAGATGCAAACTTGGATACGAC
GGTCAGTAGTTTGTGCAGTTTGTCAACATCGAGAATCGGCATGACTGaca
ctgaaatttttttcaattacgAACTGATTTTAGAGGGGCTTAAAAGGGTT
AAAACCCGTACGTCTTTCACGCTTTTATCTCTCATTGTTACCAAACTAAT
TTCTCTGGATAACTGTTTCTTCTAGTTAGGATGAACGAAGCAAGGAAAGG
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tagagcttagctagatagctttaataagtgggttaacagatgtaagagat
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ttccacggtttctcaattttaaaattcggatcagtccacacgaattccct
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attttggcgagaacttattttggcaaaccaacgttgttttttttattttg
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CATTATTTACCTCTTGCTTCCGTAGGCAATCCGGATGATTGCCAGGACGT
CAACGAATGTAAGAAGATCAACAACTGTTCGCCAGAAGCCAAATGTGAAA
ACACCATTGGTAGTTATGTTTGTAATTGCCGTACTGGATATGCTGGTGAG
TCTATTCATTACAATAATATTCTAGATCATGATCTGTTAGTTTCCTCTAG
AAGAAGGGAGAAAGTTATCAGTAATAAGATGCCGGGCATGatgtaggctg
cacgcatcccctctgatatgatttgatataggggatgcgtatcgtctaaa
ATATGTCTGTCCAAACTTACCCCcatctttccttttttcttttttgatta
tgcggcatagcaatacaatgacttctttttttactttgttcaatgaatga
aaattgataattatgaaaacaCCAGCACAatgacttaatttttttctttc
tttgattggatgtgaagaaataatttaaatttatgcaaaatttaccccaa
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TGCTGTGGTGATAGAACACCAAAAGAATTGAGCTCACCTTTCATTCAACA
ATCATATTGCGAAATATTTGTATTTGGTATCAATTTCAGGTAGTGGTTTC
TATTGTTCGGACATTGATGAATGCGAGAATGACCCATGTCATGAACAAGC
AGTTTGTGGAAATACGCCGGGAAGTTACTCCTGTATTTGCAAGACCGGGT
TTAGAGGTAGTGGAAGATGGTGCGAAGATATCAATGAATGCGCTGAAAGC
AATAATTGTAAAACTGGTAAGTTGTTTTGCTTCTTTTATTAAATTACTCG
CTCGATAGACCTTACCAGATCTAGAGAACTCGACACCGTGTGCTCTAGGC
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GTAAAccaataccttaagggaacttattttggcgaatgacagcgtaaatc
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ttaggcaaggaaacaaaaaatctaattctggcgggaacttattttggtga
gtgagcaaaatatttaattttgacgGGAACTAATTAAACTTAATTAGAAA
GAAAATATTAGGTACTCGAACTAGTCATTCGGAATGTATATTGTCGTGTT
TTTTACGTTTGTAGGTGAGCGTTGTGTGAATTATGACGGGGGTTACAATT
GCATTTGTCCAAAAATCATGCCTGCACAACGTCCTTATCTTGGAACGGAG
AGAGATATCTTGGACAAGGTTATCATGAATTTGCGTAATGGATCCAGTGA
AGATTGGAGACATCCGTTGGACTATCACGCGCACATTGTGCGGACCATTT
ATCAGCTGGTCAATCGCACTTACACCTACCATTTTAAAGAAGTGACACAC
TCTTTTTTCTATACGTTCACTGCTGGAAATCATACTTCAATCGAGCTATA
CGACATTCGATGCAGCGATTTGGCCAATGTATCTTTCCCCAATATGTGTC
ACAACATGTATGAGAAAACAGTGTTCAAACAATTCACCGATGTCGTTGAT
ATGTGGCTCATTGAAAAAGCAGAAGAACCCTTTGAAAATTGGGCAACTCC
GCCACCGCCCACCCCGCCCCAGGCTGAAGAGGCTGACCCAACCAGCACAT
CCACCACCACCACTTCAACGCCCATTCCCACCGGTATTTGGAACATCAAT
GGTACAAATGTTACTTACGATATCACTACAACTCTTCCACCACCATATCG
CCAATGCGGTGGCTATTTTAATGATACGAACGGCGGCACTATCGTTTCAC
CAGGTAATGATTAATCTCCTCTTTTTTCAACAGTACTTTTTATTGCTCTA
TTACAAAGTGTTGCAGTaaaaaaaTTTTATCGGTTCGCTATGGCCTAGAG
AATTTGTAACGGAAGGTAAATAAGGTACGTCGCTGATCAAAGCATCTCGA
CGGCAGCTACGCGTTTTCAACGTGACAcaacttaaatattttttgtttgc
aggTTATTTCACTCAGAGAAAGTATCCAGCGAACGCATATTGCGTTTGGA
TCTTAGAAGCACCAGAAGATCACAGTGTTTATGTCAAGTTCGAACATTTC
GAAATGGAAGAATCTAAGAAATGTTTCTATGATAATGTAGAGATCAGGGA
TGAATCAGAGACAGGAGAATTCAAAGCAAGGTATGTAGTTGTTTCTATCT
CATAGAACTCTTTGGAGCCTACAATACTGGCCAAAAGTAATGGAACTCCT
CACTTTTTTGGTATGAATTCACAAGTTCCCCCTATACCCCTCTTATACAA
TGTTGAATTTCAGTCCAACTTGACTCAGCAACATTGTAGAGAGGGGGAGG
GGAAGAGGAGCCATAAAAACAGTAGAATAGGTGGAATTCCATTTACATTT
CGCCAGGATTGTATATCAGGGGGGATCGGGTTCAATAATCCGAAATGATA
agccgtcgtcgaacatagaggtcgtcgtcgccgcgcatagaggctgtggt
cggacatagaggtcgtcaccggacatagaggtcgtggtcggacatagaag
tcgtcgtcgttcatagaggtctcagcccaatttttttcggtctttatttt
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ATCGTATTTGTGTATAGCAAAGTCACGGCAGAACGTCATCTTCTTCgata
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tggccggacatagaggtcttggccggacataaaggtcgtcgtcgaacata
gaggtcttggccggacatagaggtcgtcgtcgaacatagaatTCGCCGGG
GCGGTTCGCATCAACGAAGGCGGTTTATCTGGCGGGGTGGTTCTTGCTCA
GGGtggtttttgcgaagcgaatatacatgagcgaagcagttttgctatcg
tgtgcatgtacctttaaattctatataccagGGGAGCGCCAAGGAAAACT
TGATGTGCGTTTTCTACGGTACCGAAAACATCATTTCGATCCCTCAGGCG
GCACTTTCTCATACATTTCTATCCGTCGCTTCCGTAAATTTGGAACAATT
GGTTTTTAGTGTAGAGGATGTATACCAGATCTAAATAGTTACGGAGATAA
TCTTCGGGCGAGTTTCTGTTATGATTATCTCTCTAATGTTTAAATTAAGA
AATTTAAagaagagatcggaaaatcagcgcgggctggaagcgtCCAAGAA
GCGTTCAAACGCTATAAATTTATAAGCcaatcgccaaaattaattctcgc
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ttttcatcatttttcagctaaaatattgaacaaataATATGCAGCTCGCC
GAAATTGATTTTCGCCAAACTTAGAAATCttattaaatcgccaaaatgaa
ttccgccaaattgcacctaaattcattcgccaaaatttcttctcttaagg
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GAAGAAATTGTTTTACTGTTTTAgacatcaaatttttgtccAATTCATCA
TCATTTGCATGTGTATTTTACAAACTGGTCCTAATTTGCTTAGCCTTAGA
TTTTACGTCTCAGGACTGAAAATTACTTTTGACttattaaaattaaaact
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TACTAAATACCACCTAGAACCGTTTTTCGGTATATTTTgccttaatttaa
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GGTGGCTgaactaaaattttgtaaatcaactTATTGGCAAGCCCAGGAAA
AACAGCGGATTGATCTAGAAAAATACTTgcggtacacattttttataagc
aaccgggctgctaagggctcaggcctcaaaatggcccaaaaaaaataagt
aatttgcttatcaggggggatcgggttcaataatccgaaatgataagccg
tcgtcgaacatagaggtcgtcgtcgccgcgcatagaggccgtggtcggac
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gtcgttcatagaggtctcagcccaatttttttcggtctttattttataag
ttctggtctggaaatttgacaacacagtcttcaaaataacacCTTATCGT
ATTTGTGTATAGCAAAGTCACGGCAGAACGTCGTCTTCTTCGATAACATA
GAGTCTTGGCCGGAAGAGGTCGTCGTAAAACATAGAGGCcgggacataga
ggtcgtcgtagaggttcttggccggacatagaggtcttggccggccATAG
AGGTTTGGGCCTCGaggtcgtcgaacatagaggtcttggccggacataga
ggtcttggccggacatagaggtcgtcgtcgaacatagaggtcttggccgg
acatagaggccgtcgtcgaacatagaggtcttggccggacatagaagTCA
CCGTCGAACAACGGGATCATTAGCCTGGAGGTCACTtagagctttttgat
agactggatgacgcaGATAAGTGGCCATTCTGATTTTTATTCTGCCCAGC
CAGACTCTAAAGTCGTCTGGAAGATTTCAGATGTTTTGGAAATTAATCAA
TGATCAATGAATGgggtgatgatttttttttcaatataagtCATTGTAGG
CATTTCTGTTGGTTCTTCGCTTCGTTTTTAGCCAAACAAGCTCGACGCTC
GCTAATGCTTCTTACTCGATGTCTTGAAATTGCCATCGAGCGCGAAATAA
GAAGCAAGCGAGCGTCGAGCTTGCTTGGCTACTTcgttttcaactctaaa
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ATCATTTTTCGCTAAGgatttttcgaaatccaggagggcaaaagattttc
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ATGCTAGTTTGGATTTGAGGCGTCAGGATTGCTAAGCAAattgcttaatt
tttttgggccattttgaggcctgagcccttagcaacccggttgcttataa
aaaatgtgtaccgcAAGTATTTTTCTAGATCAATCCGCTGTTTTTCCTGG
GCTTACCAATaagttgatttaaaaatttcagtTCAGCCACCTATTTCCTA
TTTGTTGAAATAGGAAAGCACCCTGGAAATTcagtttaaatttaaattaa
ggcAAAATATACCGAAAAACGGTTCTAGGTGATATTTAGTACTAAACGGA
CcagtttgtaaaattttccgaaaCTATTGTACCTTTTAataagttttaat
tttcaaaagtaattttCAGTCCTGAGACGTAAAATCTAAGGCTAAGCAAA
TTAGGACCAGTTTGTAAAATACACATGCAAATGATGATGAATTggacaaa
aatttgatgtcTAAAACAGTAAAACAATTTCTTCTTGTGACATAACAGTA
ACTAACATAAGAAAAGGTTTACACTtgctaaaaataaagtttaaacgtaa
aaaactttgaaaggttGAGAACATATCTAAAGGCtttaacaaaacttttt
gacgttcttaaataaagataccttaagagaagaaattttggcgaatgaat
ttaggtgcaatttggcggaattcattttggcgatttaataaGATTTCTAA
GTTTGGCGAAAATCAATTTCGGCGAGCTGCATATtatttgttcaatattt
tagctgaaaaatgatgaaatagcGTACCGTACCGTAGAAAACGCACATCA
AGTTTTCCTTGGCACTCCCCtggctcatgtatattcgcttcgcaaaaacc
aCCCTGAGCAAGAACCACCCCGCCAGATAAACCGCCTTCGTTGATGCGAA
CCGCCCCGGCGAATTCTATGTTCGACGATGACCTCTATGTcactatgtcc
ggccaagacctctatgttcggccaagacctctatgtccggccaagacctc
tatgtccggccaagacctctatgttcgacgacgacctctatgtccggcca
agacctctatgtccgGccAAgacctctatgtccggccaagacctctatgt
NttttttCTATACGTTCACTGCTGGAAATCATACTTCAATCGAGCTATAC
GACATTCGATGCAGCGATATCGCCAATGTATCTTTCCCCAATATGTGTCA
CAACATGTATGAGAAAACAGTGTTCAAACAATTCACCGATGTCGTTGATA
TGTGGCTCATTGAAAAAGCAGAAGAACCCTTTGAAAATTGGGCAACTCCG
CCACCGCCCACCCCGCCCCAGGCTGAAGAGGCTGGCCCAACCAGCACATC
CACCACCACCACTTCAACGCCCATTCCCACCGGTATTTGGAACATCAATG
GTACAAATGTTACTTTCGATATCACTACAACTCTTCCACCACCATATCGC
CAATGCGGTGGCTATTTTAATGATACGAACGGTGGCACTATCGTTTCACC
AGGTAATATTTAATAATCTCCTCTTATTTCAACAGTACTTTTTATTGCTC
TATTAAAAAGTGTTGCAGTAAAAAGTTATCATCGATTTGTTATGGCCTAG
AGAATTCCCAAAAAGGTCCTTTACCCCTTTTTCTAACGGAAGGTAAACAA
GGTACGGCGCTGATCAAAGCGACTCGACGGTAGCTACGCGTTTTCAACGT
GACAcaacttaaaataatttttgtttgcaGGTTATTTCACTCAGAGAAAG
TATCCAGCAAACGCGTATTGCGTTTGGATCTTAGAAGCACCAGAAGATCA
CAGTGTTTATGTCAAGTTCGAACATTTCGAAATGGAAGAATCTAAGAAAT
GTTTCTATGATAATGTAGAGATCAGGGATGAATCAGAGACAGGAGAATTC
AAAGCAAGGTATGTAGTTGTTTCTATCTCATAGAACTCTTTGGAGCCTAC
AATACTGGCCAAAAGTAATGGAACTCCTCACTTTTTGGTATGAATTCACA
AGTTCCCCCCTATACCCCTCTTATACAATGTTGAATTTCAGTCCAACTTG
ACTCAGCAACATTGTAGAGAGGGGGAGGGGAAGAGGAGCCATAAAAACAG
TAGAATAGGTGGAATTCCATTTACATTTCGCCAGGATTGTAGTATCTTTT
ATTAATCATAGGAAAATCATgggaaaaatttaaatataatagctgcattc
ttttttttacaaattcgtGATTTTCTTTAGATATTGTGGCGATGGAGTAG
TCTACAAGCCTGCAGTTCGTTCAGGTCGCCGTAAACTAGCTATCATCTTT
TTCTCTGATATGCAAACCGAAAAGCGTGGTTTCAGAGCTATTTGGAGGAC
ACTTAAACCGCGCGTCTCCTTAGCTTGTGTGACGTACAATCAGATGAGTA
CCATGCCACATGCAAAAGCAATCAAATGgcaagaagaaattgaagaagag
aAAGATAAATCACAATATGTACCCATCTCTCGCCTCTTGGCTTGTAAACA
ATATCCAAAGTGTAATCATGAACGGCCAGGTGACGTCATTTTCACGTTCG
AACACATCCGAACTGATCGCAACGTCAAGAAATGTGTTCATTGGATGTTA
GAAAAGATCGGGACTTCGTATGCTGAACGACCTTGTGATATCATTAAAAC
TAATAAAACTCATACTATCTGTTCGTGTTATTCATGGGGCATCGTTGCTG
TGCTTGGTAAATTCGCAAGATGGAGTCCAGATGCTGTAACCACCTTATTC
GAACTTGGCGCTAATTCGTTCCTGTCTGTTCTCTTCGTTATCTTGGCACT
GCTTTTCACGCTTGTGTTTTTGTTCTTGAAAGATCAATGGGGTGCAGTCA
TCATGGAAGTTTTCACTATGAAAGAATATGATTCTGGTCGCATTATTCAA
ATGCACATCGTTTTCAACAATTTACTGACCGAGATTTGTTTCTCAATCAT
TACTTTCAATGTTACTCCTGGTCCAATCTCATGTTTTGTACTGGCTTTCC
TCTTCTATTACCTTCTACAGACTGTTTTCTTCTGGCTCTTCATTTACACC
TTGTTCCTGCAAGCTCGTGTTAGTGAAATCTTCGACAGCGAAAAATACAA
TTCGTACAAATTGTATATGTTCGTTGGATACGGGTTACCTTTCTTTGTTA
CTTTGACTTTGTCTGGATTGAATTTCACCACAGATGTTGAGGAGAAGGTC
TGTTGGTTGTTGTTCAGTGGAAGTACTGTATGGGGATTCTCCGGTGTCAT
CGTCACTCTTGGTGTTGGCTCATTGACTATCCTCCTCATGACTATCTACC
AAGCAAGAAACATGGAGAACGGAATCTTGTTACAAGAGAAATGCATACGT
ACACTCTTCACGCAATTTTTCGTGCTTCTAACCTCTGTCTTTGGTGCAAT
CGCGCTGCAAGATCGAAGCTTTTTAGCTGAATATTGTTTCTCGTTATGTA
ATCTGTTACAAGGTTTCTCAATCGCCATTATGTATTGCGTGTTGAGACGT
GAGGATCCGATTATCAAGGCGAACCAGATCGGACCGTTACCAGATTGGGG
TCAAGGAAATGATCAGAAATTTGAGGATTATCGTGCTGAGTTTAAAGATA
TGGGGAGCGATGCAGAGAGtagtgaagatgaagatgaagagaaggataac
gaaggagtgaatgaggaggagaacgaagaacagaaTGGAGATGAGAAGGA
GCAaccaaagaagaagaaatataaACACGTTCGTGATGGAAGTGTCATCT
TCTTGCAATTGAGAGATCCAGATGCGGATGAAGATGAAGGTAGGTCGATG
AAGTGTTCTCGTGTCACTCCTTTGTTGTTTTCATGCTATAAATTTCGACT
TGAATGCTTACCAAAGTACTGTATTTACCATAGGGCTATAGGAATCTATA
AGATATTAAGTTTTATAACAGTAAAGAGACACCGTGTATTGTGATGGAGC
ATTATGGTATTTGTCAAAAACCAGTTTGAAATTTAAGAATTATTTCATAA
TAAGCTTATAAATGTACTAACAATATTTCTACAGGTGATGATTATGAACG
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000079_pilon | genome | sc0000079_pilon:506714..525176 + |
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